XLOC_036867 (mRNA) -

Overview
NameXLOC_036867
Unique NameXLOC_036867
TypemRNA
OrganismClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon (Jellyfish)

Sequence
The following sequences are available for this feature:

mRNA from alignment at sc0000154_pilon:742693..757506-

Legend: polypeptideCDS
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>XLOC_036867 ID=XLOC_036867|Name=XLOC_036867|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=14814bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000154_pilon:742693..757506- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
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ATATTTTATACTAATTTCTAGCTGAGGGGACAAAATATTTTAGTTCGAGT TATAAAAAGATTCGAATAGTAGAGGTTCGAATTAGAGAGAGTTGACTGTA TTGCGAACCGTGGTGCAATGGTAGAGCATCCGACTACGGTTCGCAAGGTT ATGGGTTCAACCCCAGCTCGGTCATACCAAAGATTTTCAAAATGGTACTT GATGGCTCTCTGCTTGATGCTCAGCAAGTAAGGGAAGGATCAAATACTAA GAGTTTGCAAACCTATTTCTTGAATCTGATTCGAAGCATCAAAACAAGAA CAAGCTGCAAGGAGAGTTGTTTGCAATTAAGTTCTAAACTATTGAGTATC CTATTAAAGACCCCTCTATTGTACTCTGTACCATAGCGTATCTCATATTT ATCGCTTCGTAGTACGTTCTGTGCGCATTGTCTGTTTGATGAAAAAAATT CACGTACGGAGACCTCTGCGATGAAGTATGATTTATAAATAGCAACATTT CTCTTGTCATCTCCTTTCTCTCATCAACACTCCATCGCAGCGCCGGTCGG TTTGAAAAATCTCAAATGAGAAAAGACAATGACAACAGACCCTCTACGGC AGTGAATTTTGAAATTAGCCGTAGTTACTGGGTTGGTGTATAGACAATCT ATTGCTGACCCGTTTCGGTTCCTCCAACATCTCGAAAATTTAAATATATA GTTTTTACTATAGAATTCTTACCAGGTCAATAAAACAGTGGCTAACCCTT CCATTGATATTGAGTTTGAAGTTGAAGACTTGTGGGTAATCTTTAAGCTT TCCCAAGCAAGAAAAAGTGAAAACTTTTTTTCTTATTCTTGTCTTATTTC GGATGACGGATTTAATCTATTCTAAGGCTTTTTCATGTTTCCTTACTCCA ATGTCGGAATGGCAAATCTTCTTTTTTTTACCATAGACTCTATAAAACTT TGAAGAAAATTTAATTTTTATTTAATTGCTTTATCTAGGAGGTCCAACCT AGCCTAGAGTGGTCAAGTTATGGATAAAATTGCAAATCATTTTCATTTGT CAGTATTCCTTGTCAAAACACAGCTTGTAGCACATGCCATTCTTAAGATA CAAGTCCCCTCGATATACAGTAATCAATCAGCGTTTGACAAAATGGGAAA ATGGTCAAAGGGTTAAAAGGACCTGTCAGTATGCTTTTAGCCAACTTTGA AATCAGACAGAATCAGAACACCTTCCCGGTGGGATTTTATCGGCCAGTGG TGGAAAAAATAGTGGATCAAAATTCGATGGGGATTGATATTCCCATATCT TTTTTTATGGCTGAGGGTTTGAGTTCCATTGTTTTCTAGCCAAAAAAGTT CAGTGGGGATGGAAAAAATAGCACAGCATTTTGCTGTGAGGATTTACTTA CCTGATTATTTTTAGTGGGGACAAAAATTTGACTATAATTTTCTACTGGG GACGATATTTTGGCCAATTTTTCCAGTGGGAAGGGGGTGTATCAGAGGCA AGGACTGATCTCAAAGACTCTAGAGCAAAGTGTCTTTGAAAGTAAGGTAA ATGACGTCTCGATATCTTGGGAATCATATTTTGGAAACGAGGCCCACCAT GATTTTGTGCATTATCATTTCGGCGTCCATACCGTCTTTACAACAACGTT TAAAGGTTTTGTTTTTAAACTTAATATCGTTTGCTTACTCATCAATTTTA ATTTGGAAGCTTTTTAACATTGGATTGACACGAGTAAGATGATCAGAAAG AGGGAAAGAGAAACATTTTTTGTTTATATCAGCATAATATAACAATAGGC AGACACTGCCCTGATATAAAATATGTGTCTGATATGAAACGGGAACACTT ATGTAAAAATAAAACCTTTAACATGGTAGACGACATTATAAACGACTTCA ATCTATACTTTCCTTTCTTACTCTTTCATTTTCAGATCGTAAATGCAACA AAACAACCATAACATATCGTTCTGAAAAGATAGAAAGATGTTTAGGTGTC ACACCTCAAGATAACTCTGAAACCTCTGAAGAAACTTTGAAACCCGATCC AAGTTATATACCACCAAAGGCGACGCAGATACCAAACGTCGACTCGACCG ACCCAGTTATTCCAAAGATAGAAGCAGAAACTGTACCGCCAAAAATTGCC CGTAAGTACTTATTTTCGTTTTGTAATTTCAATGCACGGGTTGCAAAATT ATATCAATGCAGTCAAAACATGTGATTACTCAAAAAAGTTCAACTTACAG CTGATAACTTTGTCAGTGTCAATAAATTTAAACCAATCAGAAATAAATGT CATGTAACAAGCACATAAAAAATTTCGAGTAAAAGCGTGGTTTGTCTTCA GACTTTAATTTTGCAACCTGTGATTTATGGATCTGTCTTAAAACGGCTAG CCTGGAGATCCATGCTATGATTTCTTATATTTAAAGCAAATAAATGGTTT GGGCTATGAGTTTGAATTTCCCACCGTCAAATGTCAGTTGATAACACAAC CAAACAAATTTTGTTATTCTTTCACTGGTTACACATCCTTAGAAAAAAAA CATAACTTCCCAAACTTTTTTATCTTAGTAAGTAAGTCCAAAATATGCCT CACAGGTCGAACCCATTGAGTTTCAAGCCCGAAGGGCTAGATGTCAATCT CTAACCTTTCTCAGGCAAGAAAAATTGAAGCCTTAAAATATGCGCCGTAT TTTTGATGACGGATTGAATCTAGCAATTCCTTTGTTTTCGAGTCATATAT TTTTCGAAATTAAGCGGAAAATTTAGTTTCAATCCGTCATTTGTGTAAAA ACCAGGCGGGTCGCTCAAGGCCGCGCAACTTTGGTAGGATTTGTTGGCTT CAAATCCTACCAAGGAGATTGACCTCTAGCCCTTCGGGCTTGAAACTCAA TGGTCGAACCTGTCTTGTCCTAGCAAAGCAGGTAAACTCTCTTGTCTATA AAAAGGGACGAGCAAGATAGTCAATAGGCCGTAGCATAAACGTAGAACAT TTAGCTGCAGTACGAAAAGTTTAAAGGTCAGCAAATAAAGAAAAAGACCA AGTGGTTCCAAAAATGAGGAGTCTATGGAGAACAATAACACCATCCCAGC TGGCACACAACGTTGTTTTAACGTTTATCTAACATTCACAACGTCTATAT AACTTTAGATGGACGTTGAAACAACGTTGTGTGCCAAGTGGGATTCCTCG GCCCTATGGTAGACAGCTATAGGGAAGAAAAGTCTTCATTTTGGCCTCGA ATGTAGTCATAAACTTAGTTATTACTCACCAGAAAGTTTGAAAGCCATTA TTTGGCTTCCACGTATCGTGAGCTCACAAACTAATAACTACAAATACTAA ACACAAAGGTTTTTATAACATCAGTCAAGTAAAATATTCATCATTCAAGG CAAACTTTAGCTAGTTTACTGTATATAGTAATACCCCCTTCTCACAGACC CGGTAGGAATTTTTCAGCCAGTAGTGGGGACAAAAATAACGGACTGAAAC TCACTTTTTTGAAACTATTTTTTATGGCTGGGGATTTCAATTCAAGAAAT CCAGTGGGGATGGGAAAAAGGTCGTCATGTTTTGCAGTGAGGATTATTTC ATTTGATTATTTTCAGTGGGGTCAAAAATTGACCACCGGGGATGATATTT TGGGAATGGGCCCCAGTGGGTCTGTGAGAAGGGGGTGTATAGTATATAGT ATATATGCGATGTTAGTATTTGCGATGTTAGCTTTTTTAGGCTTATGCAA ATAAATTGATAGAAATAGAAACCAAAATTTTTAGAAATTGGGGATGAAAG 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Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000154_pilon:742693..757506-

>XLOC_036867 ID=XLOC_036867|Name=XLOC_036867|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=2922bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000154_pilon:742693..757506- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ACAACAACGGCAGCTCCAGTGCAGACGACGACTACAACAACGGCAGCTCC
AGTAACGACGACGACGACAACTACAACAACGACAGCTCCCGTGCCGACGA
CAACTACAACAACGGTAGCTCCAGTGACGACGACAACTACAACAACGGTA
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GACAACTACAACAACGACAGTTCCCGTGCCGACGACGACTACAACAACGG
CGGCTCCAGTGCCGACGATGACACCCCAACCGACAGTGCCGGTGATTGCA
ATGACCACTCAAGAATCAACCACTGAACAAGCGACAACAACGGCAGCTCC
AGTGCAGACGACGACTACAACAACGGCAGCTCCAGTAACGACGACGACGA
CAACTACAACAACGACAGCTCCCGTGCCGACGACAACTACAACAACGGTA
GCTCCAGTGACGACGACAACTACAACAACGGTAGCTCCAGTGCAGACGAC
GACTACAACAACGGCAGCTCCAGTGACAACGACGACAACTACAACAACGA
CAGTTCCCGTGCCGACGACGACTACAACAACGGCGGCTCCAGTGCCGACG
ATGACACCCCAACCGACAGTGCCGGTGATTGCAATGACCACTCAAGAATC
AACCACTGAACAAGCGGTGACCAACCCGCCAGCAGTCACCACCCACCCTC
CGCCCACCATCAACAATGAGAAACCATTGATATCCAAATCAGAAGGTGAC
CAACCCGCCAGCAGTCACCACCCACCCTCCGCCCACCATCAACAATGAGA
AACCATTGATATCCAAATCAGAAGACTACAAATGTCAATTCTCGAAGAAG
ACTCGATCATCAGGAGGTCACCGTCTCAATGTCGGCAAATTCCCTGATGG
ACAATCATGCTTTCAAAAGTGTGCAAAGATGAAAGAAGACGGTGACCAGA
GTATTAATCAGACTACAAATGTCAATTCTCGAAGAAGACTCGATCATCAG
GAGGTCACCGTCTCAATGTCGGCAAATTCCCTGATGGACAATCATGCTTT
CAAAAGTGTGCAAAGATGAAAGAAGACGGTGACCAGAGTATTAATCAGGT
GACATATCGAAAGTGGTCAACAGAATGTTTCTGCTACCAAAACTCACCTG
ACTTGAAGACTGCTAATTATGCCAAAACCGAGGCCTGTGATTTGGTGGAA
AATATCTCTGGAATTGAACGTGACATATCGAAAGTGGTCAACAGAATGTT
TCTGCTACCAAAACTCACCTGACTTGAAGACTGCTAATTATGCCAAAACC
GAGGCCTGTGATTTGGTGGAAAATATCTCTGGAATTGAACCTGTTTGGTT
CAAATGTGTATTCAAGAAAGAAACCAACATATTAGATGGCCCGGACGTCT
TCCTGATTGGAACACAGTCTACTCGCCTCCATTGTAAATTGGCTTGTCTT
GAACGAAGCTGTTTGGTTCAAATGTGTATTCAAGAAAGAAACCAACATAT
TAGATGGCCCGGACGTCTTCCTGATTGGAACACAGTCTACTCGCCTCCAT
TGTAAATTGGCTTGTCTTGAACGAAGGCACAGCTTTTACAAAACTAAGAA
ACTGTCAGGTGTAAAATACGTTTGGGGAAGTAAGAAATGCTTTTGCGTGA
TTGGTCAATATCCATCTGTTGTTCATAAAGTCGGCATTCAAACGTGTCAG
TTCGACATGGAAAACCCTATCGGCACAGCTTTTACAAAACTAAGAAACTG
TCAGGTGTAAAATACGTTTGGGGAAGTAAGAAATGCTTTTGCGTGATTGG
TCAATATCCATCTGTTGTTCATAAAGTCGGCATTCAAACGTGTCAGTTCG
ACATGGAAAACCCTATCGATCGTAAATGCAACAAAACAACCATAACATAT
CGTTCTGAAAAGATAGAAAGATGTTTAGGTGTCACACCTCAAGATAACTC
TGAAACCTCTGAAGAAACTTTGAAACCCGATCCAAGTTATATACCACCAA
AGGCGACGCAGATACCAAACGTCGACTCGACCGACCCAGTTATTCCAAAG
ATAGAAGCAGAAACTGTACCGCCAAAAATTGCCCATCGTAAATGCAACAA
AACAACCATAACATATCGTTCTGAAAAGATAGAAAGATGTTTAGGTGTCA
CACCTCAAGATAACTCTGAAACCTCTGAAGAAACTTTGAAACCCGATCCA
AGTTATATACCACCAAAGGCGACGCAGATACCAAACGTCGACTCGACCGA
CCCAGTTATTCCAAAGATAGAAGCAGAAACTGTACCGCCAAAAATTGCCC
AACAAAGTAACAACGAGACGGGAAACAGCACAGCTACGCCCTTCGCTAAA
TCAGCTGGTGGAATCACTCTCTTCAGTTTATTGGGCGTCAGTGGTTTCTC
AGGCTTATTACTGGTTGCAAAGAAGCTTCTCATGGGTGAAGGACTTGGTC
TGAATTGCGGCGAGGGGATTGAGACTACACTTGAGTGCGGCAAGTGTTGT
TCGTGTTGTTGTGGCGACAAGGAGGAGAATGAGGAGGATAGCGAAACAAT
TCGATTGACTGAAACCAATGGAAAAAATGATGACACAGAAACAAGCCACA
AAGACAGCTAGAACAAAGTAACAACGAGACGGGAAACAGCACAGCTACGC
CCTTCGCTAAATCAGCTGGTGGAATCACTCTCTTCAGTTTATTGGGCGTC
AGTGGTTTCTCAGGCTTATTACTGGTTGCAAAGAAGCTTCTCATGGGTGA
AGGACTTGGTCTGAATTGCGGCGAGGGGATTGAGACTACACTTGAGTGCG
GCAAGTGTTGTTCGTGTTGTTGTGGCGACAAGGAGGAGAATGAGGAGGAT
AGCGAAACAATTCGATTGACTGAAACCAATGGAAAAAATGATGACACAGA
AACAAGCCACAAAGACAGCTAG
Gene-mRNA-Prot
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
XLOC_036867XLOC_036867-proteinClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonpolypeptide
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
sc0000154_pilongenomesc0000154_pilon:742693..757506 -
Properties
Property NameValue
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