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Sequence
The following sequences are available for this feature:
mRNA from alignment at sc0000154_pilon:395488..398322- Legend: polypeptideCDS Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >XLOC_036861 ID=XLOC_036861|Name=XLOC_036861|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=2835bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000154_pilon:395488..398322- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ATGAGGTGGCACCCTTTGATTATAAGATGGTGTATTGGGATCTACCTTAA
AAGTCCAGGGACATACAAAGGACAATTACAGCAATTTTTGAATCTGCCAT
CAAAGAACACCTTACTAAAATACATTAACTATACTGATCCTGGGTGTGGT
TTCAATCCTGACACTATTGCAAATATTGCCAGACAATTTGACGCCCTTGA
AAAACCTCATCAAAGTTTTGTTTCCTTGGTTGTTGATGAAATGAAGATCA
AGAGTGGGCTTTGTTTCAGCACCTCTACTGGGAAAATTGTTGGTTTGTGT
GAAGAAGGGTCTATAAATGATCTTCTGTCCGAATTTGAGCTTAAATACAG
TGAAGAGGAGTCTGAAAACCAACGCCCCCTTGACAGTACCGACAGGGAAC
TTGCTAGCTATGCCACAGCACTCATGGTCAGAGGAATTTCTTCAAACTTA
TTTTATGTCTTTGGACACTTTGCTTCCAGCTCTGGAATGACAAGCAGTCA
GCTGTACCATGTTATTTGGGAGGGTATCAGTTTATTGGAGTCCATTGATT
TGAAGGTGTTGGCCATAGTTGCCGATGGTGCCTCAACAAACCGAAAGTTT
TTCAAACTCCATAATTGGGAAACGAAAGAAAACTTTAGTCCAGAAAATGT
TATCTATTGGACATGGAATGAATGTTGCCCAAGTATTTTTTTAATTATAT
TATTTTTGCTCTGTATCCCACAATATTATTGTGTCTATCTTGTCCACAAA
TATCAACTAAAGGCCAAAAATCTGTAAAATGTAAAATTATTAAGGTATAT
GCCGCCAGCCATAACACAGTCATTAAAAAGGTAATGAAGAATAGAGTGAT
ACTTCATATTTTCTTGGTTTTTAATGGTTTACTTTTCATTGCAGCTCGAA
AATTGTATTTCATATGTGATCCTCCCCATCTGATGAAAACCACCAGAAAC
AACTTGGAGAAGTCAAGCTCAAAGTCTACTTCTAGAAATCTAATGGTATG
TAATTCAATATAAACTAATTACCACAATCAAAGAGGAGACTTCTATGTTG
TTGTGATATTTTAAAACTCATTTCAATAACTTAACTTTTTTTTTTTCTGT
TTTTAGTGTGATGGTCAAAGTTTATCCTGGGGTCAAATAATAAATCTTTA
TGAATGGGATTTAGGGATGGAGAGAGATGCCATTGGTCTGACAATGGGTC
ACCATTTGACTGAGGAGCATATCAATTTGAATCCGAGATCACGCATGAGA
GTTTACTTAGCAGTGCAAGTAAGTGAATCAAGATTGATTTTTTAGCTTTT
CATCTCTTAAAAATTATTTGATAAAAATTGATTTGAATGATGTTATTTTA
ATGTTACTTTTACCATTGAATTTTATGCATATTATTTTGTATAAAAAACA
TGAAATTTGATTTTCAGAGGCTCCAATTTCTTTAACTTTTTTTTGCACTG
TAAGCCTCAAATTATTTATTTCCTATTCTAGAAGTGTTTTAGTCAATTTT
AGCTTTAGTCTGATTTTATTTTGACATTTCTGACAAGAATTAAAAACAGT
TCAAGAACAAGCCTAAAGACTAGAATGTGTAATTATTTGGCCATTGGCTC
ATTGTTCTTATAAAACTGTTCGTATAAAAAGAGTGTATGTAAATGCATTT
GTATTAATTAGCCATTAAAAATTACACAGATTATGTACATTTTTTTTAGG
TTCTCAGTGCTACTGTAGTCAACATGTTGGATGAGCAGGATCTCCATACC
ACAAAATCTTTGAGGACATTTATTTCCCACATGAACAGATTCTTCGATTG
TTTAAACGTCTCCAAGTCTGATGAAAAATCTAACAACCTAGATAAGCACA
AGTACAGGGGAGCAGACGACGAACGCTTTGGGGTAAGTATTAACTTTGGC
TCATGTTTTCTTATCATTCTTTTTTAAATCCATCCCCCCCGAAGAAAAAA
AATCCTGTAGTTCCCCCTCCTTGAGAAGCACTTTGCCCCCCCCCGTAGCA
GTTTTCTGTAGAAAAAACAAGGGGTCACTATGTAAAGGAGATATTTTTTT
AGGTTCATGGTAAACTTCTGACAATAATCGAACATATTTTTTACTTATTC
TTTCTACAGTGGTTGGTCACAACATTTTTGAAGTACCTTAATGATTGGGA
GGCGCACTGCTACAGCATCCCAAATTTGACGAAAATTGAACAATCAAAAT
TATGTCTCAGTCACCAAACACTGGAAGGACTTCGAATAACAGGTAAATTC
TATTGCAAACTCAATTTAATTTAGAAAATTGTATAACGAAATCGCAATAT
CTTAACCAATAGATGAAAAATCTTCCAAGAGCTAATAATAAGCTCATGGA
CATGATAGCCTTAGTCTGATGTTTGAACCCAGGACCCAGACCTTGACGAC
CAACGCTTGAGTTTTGAAATAATTGTACCCTTTCAGATACAAAAACTTAT
ACCTTTTTCCGAATTTTACCTAAAGAGTAACCCTCACGGGTGTTAAGAAT
TTGTTTTGAATACATGTCATTTTTGTATTTTGATTATAGTTCGTTCATTC
ATCGAAGTATCAAAAGTGATGTTCAACGAAGGTGCCAAATATATTCTATC
AGAGAAATTAAGTCAGGATCCACTTGAGGAATATTTTGGGAAGCAGAGAA
TGCGACTCGGATGTAATGAGAATCCAACGCTTAGTCAGTTTAATTTTAAT
GCTCTCGCAATCGGAGTTGCTGGCGATTTATTGGTTCGACCTGAAGGGAA
CAGTCGGGGTAAACATAACGAGCAGAAAATCATCGACGTTAACGATATGT
CACTTCCCCCCAAAAAGAAGACAAAACCTTCTTAA Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000154_pilon:395488..398322- >XLOC_036861 ID=XLOC_036861|Name=XLOC_036861|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=3114bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000154_pilon:395488..398322- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ATGAGGTGGCACCCTTTGATTATAAGATGGTGTATTGGGATCTACCTTAA
AAGTCCAGGGACATACAAAGGACAATTACAGCAATTTTTGAATCTGCCAT
CAAAGAACACCTTACTAAAATACATTAACTATACTGATCCTGGGTGTGGT
TTCAATCCTGACACTATTGCAAATATTGCCAGACAATTTGACGCCCTTGA
AAAACCTCATCAAAGTTTTGTTTCCTTGGTTGTTGATGAAATGAAGATCA
AGAGTGGGCTTTGTTTCAGCACCTCTACTGGGAAAATTGTTGGTTTGTGT
GAAGAAGGGTCTATAAATGATCTTCTGTCCGAATTTGAGCTTAAATACAG
TGAAGAGGAGTCTGAAAACCAACGCCCCCTTGACAGTACCGACAGGGAAC
TTGCTAGCTATGCCACAGCACTCATGGTCAGAGGAATTTCTTCAAACTTA
TTTTATGTCTTTGGACACTTTGCTTCCAGCTCTGGAATGACAAGCAGTCA
GCTGTACCATGTTATTTGGGAGGGTATCAGTTTATTGGAGTCCATTGATT
TGAAGGTGTTGGCCATAGTTGCCGATGGTGCCTCAACAAACCGAAAGTTT
TTCAAACTCCATAATTGGGAAACGAAAGAAAACTTTAGTCCAGAAAATGT
TATCTATTGGACATGGAATGAATGTTGCCCAAATGAGGTGGCACCCTTTG
ATTATAAGATGGTGTATTGGGATCTACCTTAAAAGTCCAGGGACATACAA
AGGACAATTACAGCAATTTTTGAATCTGCCATCAAAGAACACCTTACTAA
AATACATTAACTATACTGATCCTGGGTGTGGTTTCAATCCTGACACTATT
GCAAATATTGCCAGACAATTTGACGCCCTTGAAAAACCTCATCAAAGTTT
TGTTTCCTTGGTTGTTGATGAAATGAAGATCAAGAGTGGGCTTTGTTTCA
GCACCTCTACTGGGAAAATTGTTGGTTTGTGTGAAGAAGGGTCTATAAAT
GATCTTCTGTCCGAATTTGAGCTTAAATACAGTGAAGAGGAGTCTGAAAA
CCAACGCCCCCTTGACAGTACCGACAGGGAACTTGCTAGCTATGCCACAG
CACTCATGGTCAGAGGAATTTCTTCAAACTTATTTTATGTCTTTGGACAC
TTTGCTTCCAGCTCTGGAATGACAAGCAGTCAGCTGTACCATGTTATTTG
GGAGGGTATCAGTTTATTGGAGTCCATTGATTTGAAGGTGTTGGCCATAG
TTGCCGATGGTGCCTCAACAAACCGAAAGTTTTTCAAACTCCATAATTGG
GAAACGAAAGAAAACTTTAGTCCAGAAAATGTTATCTATTGGACATGGAA
TGAATGTTGCCCAACTCGAAAATTGTATTTCATATGTGATCCTCCCCATC
TGATGAAAACCACCAGAAACAACTTGGAGAAGTCAAGCTCAAAGTCTACT
TCTAGAAATCTAATGCTCGAAAATTGTATTTCATATGTGATCCTCCCCAT
CTGATGAAAACCACCAGAAACAACTTGGAGAAGTCAAGCTCAAAGTCTAC
TTCTAGAAATCTAATGTGTGATGGTCAAAGTTTATCCTGGGGTCAAATAA
TAAATCTTTATGAATGGGATTTAGGGATGGAGAGAGATGCCATTGGTCTG
ACAATGGGTCACCATTTGACTGAGGAGCATATCAATTTGAATCCGAGATC
ACGCATGAGAGTTTACTTAGCAGTGCAATGTGATGGTCAAAGTTTATCCT
GGGGTCAAATAATAAATCTTTATGAATGGGATTTAGGGATGGAGAGAGAT
GCCATTGGTCTGACAATGGGTCACCATTTGACTGAGGAGCATATCAATTT
GAATCCGAGATCACGCATGAGAGTTTACTTAGCAGTGCAAGTTCTCAGTG
CTACTGTAGTCAACATGTTGGATGAGCAGGATCTCCATACCACAAAATCT
TTGAGGACATTTATTTCCCACATGAACAGATTCTTCGATTGTTTAAACGT
CTCCAAGTCTGATGAAAAATCTAACAACCTAGATAAGCACAAGTACAGGG
GAGCAGACGACGAACGCTTTGGGGTTCTCAGTGCTACTGTAGTCAACATG
TTGGATGAGCAGGATCTCCATACCACAAAATCTTTGAGGACATTTATTTC
CCACATGAACAGATTCTTCGATTGTTTAAACGTCTCCAAGTCTGATGAAA
AATCTAACAACCTAGATAAGCACAAGTACAGGGGAGCAGACGACGAACGC
TTTGGGTGGTTGGTCACAACATTTTTGAAGTACCTTAATGATTGGGAGGC
GCACTGCTACAGCATCCCAAATTTGACGAAAATTGAACAATCAAAATTAT
GTCTCAGTCACCAAACACTGGAAGGACTTCGAATAACAGTGGTTGGTCAC
AACATTTTTGAAGTACCTTAATGATTGGGAGGCGCACTGCTACAGCATCC
CAAATTTGACGAAAATTGAACAATCAAAATTATGTCTCAGTCACCAAACA
CTGGAAGGACTTCGAATAACAGTTCGTTCATTCATCGAAGTATCAAAAGT
GATGTTCAACGAAGGTGCCAAATATATTCTATCAGAGAAATTAAGTCAGG
ATCCACTTGAGGAATATTTTGGGAAGCAGAGAATGCGACTCGGATGTAAT
GAGAATCCAACGCTTAGTCAGTTTAATTTTAATGCTCTCGCAATCGGAGT
TGCTGGCGATTTATTGGTTCGACCTGAAGGGAACAGTCGGGGTAAACATA
ACGAGCAGAAAATCATCGACGTTAACGATATGTCACTTCCCCCCAAAAAG
AAGACAAAACCTTCTTAATTCGTTCATTCATCGAAGTATCAAAAGTGATG
TTCAACGAAGGTGCCAAATATATTCTATCAGAGAAATTAAGTCAGGATCC
ACTTGAGGAATATTTTGGGAAGCAGAGAATGCGACTCGGATGTAATGAGA
ATCCAACGCTTAGTCAGTTTAATTTTAATGCTCTCGCAATCGGAGTTGCT
GGCGATTTATTGGTTCGACCTGAAGGGAACAGTCGGGGTAAACATAACGA
GCAGAAAATCATCGACGTTAACGATATGTCACTTCCCCCCAAAAAGAAGA
CAAAACCTTCTTAA
Gene-mRNA-Prot
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Position
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
|---|
| sc0000154_pilon | genome | sc0000154_pilon:395488..398322 - |
Properties
| Property Name | Value |
|---|
| Aaloc | 1264-1557:295 |
| Aaloc | 1129-1260:727 |
| Aaloc | 946-1128:1137 |
| Aaloc | 784-945:1730 |
| Aaloc | 685-783:1940 |
| Aaloc | 1-681:2836 |
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