|
|
Sequence
The following sequences are available for this feature:
mRNA from alignment at sc0000026_pilon:512040..513260- Legend: CDSpolypeptide Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >XLOC_036855 ID=XLOC_036855|Name=XLOC_036855|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=1221bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000026_pilon:512040..513260- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ATGGCTGGCAGTGATAAAATCCAAGAAGAAAATTATGTTGCAGCAATGGT
TTTGGCAGGTGTTGGTGATGCTATGGGTTACAAATGTGGACAATGGGAAT
TTGATTTCGTCGGTGAGCATATTCACAAGGAATTAAAATCACTTGGTGGT
GTCAATAAACTGAAAATCAAAACACCAGAATTCATGGTTAGTGATGATAC
TGTCTTGCTGTTATCTACGGCAGATTCTCTGGTTGATATTGGCAAAAAGT
TGAAATCTGGTAAAATTGTTGACGAAGGAGATTATTATAATAAGTTGTAT
GCGGAGTTTTCTTTTCGTTATCAAAATGATGTCAGTAAAGATATGAATGG
TAGAGCACCTGGTAATGGAACCATGGTGGCTTGCCGCCAGATGCACCCGC
TCCGCCCACACGGTTGGGAAATCCCCTTTAACTCGCGTGGTGGTGGGTGT
GGTGCCGCTATGCGAGCTATGGCTATCGGGTTGCGTTACCCAAATATGTC
AGATTCAAAATGTATTGAGAATCTTATTCGAGTCAGTGTCGAGAGTGGAC
GCATGACTCATAATTGTCCAACTGGGTATTTAGGGTCGTTTGCTACGGCC
CTGTTTGGTGCTTTTGCTGTTAGCAGAGTACCACTTATCCGATGGGGAAA
ATATTTAATCAAAGCGCTGCCCCATGTTCAACGCTATGTTGTAAAGGTAG
GTCGTGATGTAGAAGATAATCAGAAGAATTGGGCCTACTTTGGAGAACAA
TGGGCCAAATTTTTGGAAACCCGGGGCTTAACAAATGGAGATGGGTGGCC
GAAATTTCCTGAGAAATATGGTGTTGCTGAACGAGATGCATTTTATAAGT
CAGTTTCTTTCAGCGGTTGGGGTGGCGCAAGTGGCCATGACGCACCTATG
ATTGCGTACGATGCGTTGCTAGCGGCCGATAGCGGTGGTTGGGAAAAGCT
CTGTCATCATGGTATGTTACATGGAGGGGATAACGATTCGTCTGGTGTGA
TTGCCGGATTCTGTTATGGTGCAATGCATGGTTTTGAAGATGTGTCTAAA
AAGAATCATGCTGAAGTGGAGAAAAGACTTCGTCTGGTTGGTTGTGGTGA
AGATTTGTACACGTTAGCGAAACCGTATATAGAGGTAATGGGAGAAGAAT
ATTTGTTTGAGGAAGCTATTGAACAGATTTTTGGCGATGATTCTTTTATT
TATCCCATTAGAAAAGAGTAG Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000026_pilon:512040..513260- >XLOC_036855 ID=XLOC_036855|Name=XLOC_036855|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=2442bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000026_pilon:512040..513260- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ATGGCTGGCAGTGATAAAATCCAAGAAGAAAATTATGTTGCAGCAATGGT
TTTGGCAGGTGTTGGTGATGCTATGGGTTACAAATGTGGACAATGGGAAT
TTGATTTCGTCGGTGAGCATATTCACAAGGAATTAAAATCACTTGGTGGT
GTCAATAAACTGAAAATCAAAACACCAGAATTCATGGTTAGTGATGATAC
TGTCTTGCTGTTATCTACGGCAGATTCTCTGGTTGATATTGGCAAAAAGT
TGAAATCTGGTAAAATTGTTGACGAAGGAGATTATTATAATAAGTTGTAT
GCGGAGTTTTCTTTTCGTTATCAAAATGATGTCAGTAAAGATATGAATGG
TAGAGCACCTGGTAATGGAACCATGGTGGCTTGCCGCCAGATGCACCCGC
TCCGCCCACACGGTTGGGAAATCCCCTTTAACTCGCGTGGTGGTGGGTGT
GGTGCCGCTATGCGAGCTATGGCTATCGGGTTGCGTTACCCAAATATGTC
AGATTCAAAATGTATTGAGAATCTTATTCGAGTCAGTGTCGAGAGTGGAC
GCATGACTCATAATTGTCCAACTGGGTATTTAGGGTCGTTTGCTACGGCC
CTGTTTGGTGCTTTTGCTGTTAGCAGAGTACCACTTATCCGATGGGGAAA
ATATTTAATCAAAGCGCTGCCCCATGTTCAACGCTATGTTGTAAAGGTAG
GTCGTGATGTAGAAGATAATCAGAAGAATTGGGCCTACTTTGGAGAACAA
TGGGCCAAATTTTTGGAAACCCGGGGCTTAACAAATGGAGATGGGTGGCC
GAAATTTCCTGAGAAATATGGTGTTGCTGAACGAGATGCATTTTATAAGT
CAGTTTCTTTCAGCGGTTGGGGTGGCGCAAGTGGCCATGACGCACCTATG
ATTGCGTACGATGCGTTGCTAGCGGCCGATAGCGGTGGTTGGGAAAAGCT
CTGTCATCATGGTATGTTACATGGAGGGGATAACGATTCGTCTGGTGTGA
TTGCCGGATTCTGTTATGGTGCAATGCATGGTTTTGAAGATGTGTCTAAA
AAGAATCATGCTGAAGTGGAGAAAAGACTTCGTCTGGTTGGTTGTGGTGA
AGATTTGTACACGTTAGCGAAACCGTATATAGAGGTAATGGGAGAAGAAT
ATTTGTTTGAGGAAGCTATTGAACAGATTTTTGGCGATGATTCTTTTATT
TATCCCATTAGAAAAGAGTAGATGGCTGGCAGTGATAAAATCCAAGAAGA
AAATTATGTTGCAGCAATGGTTTTGGCAGGTGTTGGTGATGCTATGGGTT
ACAAATGTGGACAATGGGAATTTGATTTCGTCGGTGAGCATATTCACAAG
GAATTAAAATCACTTGGTGGTGTCAATAAACTGAAAATCAAAACACCAGA
ATTCATGGTTAGTGATGATACTGTCTTGCTGTTATCTACGGCAGATTCTC
TGGTTGATATTGGCAAAAAGTTGAAATCTGGTAAAATTGTTGACGAAGGA
GATTATTATAATAAGTTGTATGCGGAGTTTTCTTTTCGTTATCAAAATGA
TGTCAGTAAAGATATGAATGGTAGAGCACCTGGTAATGGAACCATGGTGG
CTTGCCGCCAGATGCACCCGCTCCGCCCACACGGTTGGGAAATCCCCTTT
AACTCGCGTGGTGGTGGGTGTGGTGCCGCTATGCGAGCTATGGCTATCGG
GTTGCGTTACCCAAATATGTCAGATTCAAAATGTATTGAGAATCTTATTC
GAGTCAGTGTCGAGAGTGGACGCATGACTCATAATTGTCCAACTGGGTAT
TTAGGGTCGTTTGCTACGGCCCTGTTTGGTGCTTTTGCTGTTAGCAGAGT
ACCACTTATCCGATGGGGAAAATATTTAATCAAAGCGCTGCCCCATGTTC
AACGCTATGTTGTAAAGGTAGGTCGTGATGTAGAAGATAATCAGAAGAAT
TGGGCCTACTTTGGAGAACAATGGGCCAAATTTTTGGAAACCCGGGGCTT
AACAAATGGAGATGGGTGGCCGAAATTTCCTGAGAAATATGGTGTTGCTG
AACGAGATGCATTTTATAAGTCAGTTTCTTTCAGCGGTTGGGGTGGCGCA
AGTGGCCATGACGCACCTATGATTGCGTACGATGCGTTGCTAGCGGCCGA
TAGCGGTGGTTGGGAAAAGCTCTGTCATCATGGTATGTTACATGGAGGGG
ATAACGATTCGTCTGGTGTGATTGCCGGATTCTGTTATGGTGCAATGCAT
GGTTTTGAAGATGTGTCTAAAAAGAATCATGCTGAAGTGGAGAAAAGACT
TCGTCTGGTTGGTTGTGGTGAAGATTTGTACACGTTAGCGAAACCGTATA
TAGAGGTAATGGGAGAAGAATATTTGTTTGAGGAAGCTATTGAACAGATT
TTTGGCGATGATTCTTTTATTTATCCCATTAGAAAAGAGTAG
Gene-mRNA-Prot
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Position
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
|---|
| sc0000026_pilon | genome | sc0000026_pilon:512040..513260 - |
Properties
| Property Name | Value |
|---|
| Aaloc | 1-1221:1222 |
|
