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Sequence
The following sequences are available for this feature:
mRNA from alignment at sc0000026_pilon:523150..530471- Legend: polypeptideCDS Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >XLOC_036852 ID=XLOC_036852|Name=XLOC_036852|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=7322bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000026_pilon:523150..530471- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ATGACAGAGGTATCAACTTCATCAATAAGTTCTGCAGAGGTTCAAATTTT
AAATAGGTTTCCAGAGGAGTCGTTTAATGAATTTATTCAACTTGTATTTG
ATTTTCTGTTAAATCCGAAAGACGCATCCAAACTTTTGGATGATTTGCAT
ATATTTTGTGAGAATGCTGGGGCATCAGCTGGAGCTGTTAAGAATCTAGT
AAAATTACTGATCTCATATTTGAGGGAAAAACTGAAGAAAAATGTTTCAA
GTAACTCTATCAATGATCAACTTGAAAAGCTAGGTAAGATTTTGTATCAT
CATTAGCGGCAATCGCAAATATTTTCATTTCGCGTCCTCGTTGGGTCTAA
AAAGTGAGTCGGTCGGTCGTAAAAAATTTCGGGTTTCTATTTTTCCATCC
ATGTTTGGAGTGCATTCTTGGAGGAAAATGCCATCCAGCCAGCAGCCAAA
ACAACCGCGTGTAATGGCAGTTAGTCACACTAGGAAATCAAGCTTTCAAA
AAAAAACAACAACATCAGTCATCTACAGGATGTATTTGCAAAACAAGGAT
GAGAGTTACCTGAATCAAGTTTGCAAGAGAATTATAATAATTAAAATTTG
AAAGTTTGAAACAAAATGAAACGTGCAGCAGCCAAAATCACCCAATCAAA
ATTTGTCATTCAATTCCCAAGACAGCGCTTCGATTTTTAAGGCCTTGTTT
ATATACCCTAAAGTAAAAACAATTCCGCACATGTAAATGGGTCAGTGTTT
GAGGTCCGGCAAAATTTTTGGGAAATAGCCTATCCGGTAGTGCGCGTATC
TAGGTGGATTCCGTCTCCCCTGTAGATCTTTTTCTTGGGAAGTTGATCTT
CAAATTAGTTCTCAAGATTGGCTAGGCTCAAATTTTTTATCTATGACTCA
AACTTTAGCAGTGCGTCACAAACAGCCACATAAACAAAACTCAACATTCT
CACAAAAGTTGTCTTTTTGATTTCCAAAACATTTGTCTAAAGCGTTCACT
TCCACAATAATTTATGTAATTGCAATTTCGGTCAGTCCACAGTCGGCTTC
AACATATACACGTGTTTTTATTTACGTGACCGAAGTGCCTACTAAAACAA
TCCGGGGGTAAGTGGCAAAGAAACACAGCAGATTATTCGTAAAGTAAAGA
AATATCTTTTGGCATTGACAATCAAATATAATATATTATATTATATTTCC
TTAATTAAAAAATCAAAAATTCATTTTTCATTTGCACAAAAATAAAAATA
AAAGAATAATGAATTAATATTACATACTAAGACGCCCCCGTCTTTTACTC
TCTTTTAATTTCCGATCTCGGAACGTGCAATAATACGCCCGTCTGCCCAA
TATCCACCCAATCAGCTTAAATTCACTTTAATTGTCCTTTGACTTTCAAA
AAATAGTACAGTATTTAAAAATTATGAATTTTAATAATTACAAAAAACAA
AAAGTTTGATACTTCATTAGTCTGCATTAGTGAAATATTCAATAAATTCC
TAATTTCAATTTTCAGTGGGCGTTTTTCTAGGGCTTCGTTTATCACGCAA
TTTTTGCGTCACGCAAACTTTCTCAGCCGGTCGTAATAATTATGCATTGC
CAAATTTGGTTCTCCATTGTCAAGTCAGGATCGATGGTGACAAAAGAAAT
GATTTTGTCGGTTTTATGCATATATTAATTTGCAAGGTATTTTATTTGCT
GCGCAAGCGCACTTTTCGTAGACTAGTCGGAATACTTTCTTTTACTCGCT
GGATTGATGGTAACTTTTCATCTTCGTTATTTTTAAAATGAAGCATAACC
GAAAAAAAACAAAACTTCAGGAAGTTGCGTATTTCCAGTGAGTAAACGAT
TCTGACAATTAACAAAATTGATGATGATTATTTTTTTTCGGTCAGGCAAA
TGTCTCGTATTGGGGGTTCTAGTCTTGACCCCTAAGCCTACGCAAGATTG
AAGCGTTTGGGTAAACAAGACAAAACTCCAAAAAAGCTGGTGTTTTTGAA
GCGCTTCCGTGCGATCGAAATATCGCTGTTTGTGACGCACTGTTTAGGCA
ATTTCTCATAGTTTTTGAGAATGTTAATTTCATTAAAAAGCGCCAGGTTA
TTTTTTCATGAATCCCTTTAGATGTTTTGCCAGGGGGGGGGGGTCTTGCA
GTTACTCCTTGACACTATGTGGAGTAACTGCAATTTTGGACATTTTCTAC
AGACACCACCACCCTTGCAGTTGTTCCAAAGTGTACTAACTGATTTTACC
CTCAAAATAGGTGTATACCACCCCCAAAAATGGCAATTTTTTCACTGAAT
TCCTCATTTTTGATACCATTTTACTGGGTACGTCTTATTAACGACCGTTC
AAGAGTTAAGAGCCATTTTTTTTAAGAGTCTTCAGGGTGTGATACCTCAC
CCTCTTGGATTTTGCTGAAATTTAGACCAAATGATCTATAACACAAGAAA
ATAAGACCCTGAAAATTTCACCTTGATATCTCAAGTAGTTTTGAAGATAC
AGCGTCTCAAAGATAGGCTACTAAGCAAAAATTGACCCCTAAAAATCATG
AACTCTGGTGGGGAGCAGATTTTGAAAGCCAATGAATTTTTATTCAAGTA
CATTAGACAGCTGATTTACAGTGGATTTCAAGAACTTTTTGTAGGGAATC
AGAAAAAATCAAATTGAGTCTCCAAAATTTTCCCCGAAAATCTCTAGCAC
ATCCTGTAGAGGGCTTCAAACTTTGCGTAATCTGGGTTTGGAAGCACTTT
TAGCTGGCTGCTGATGGTCCTTGGGACTTTTTTGAAGTAAACTTTTGACC
TGGAGTGGTTTACTGGTGGGTTTTGGCCACATAAATAACATTTTCAGGAT
TTCCATCTTTGCGTAACTGTCAAAAATGGCCGAAAAAATTGCTATTTTGG
CAGACCTGGAGCAAAATTCAAGATGGCGTATCTTTTTAAGGCAACACCAA
AATTTTTTGAAATTTTCAGCAAGGCTTCCTTAGTAGGTCTAGTTTATAGC
CTCAAAAAAATCTCAATGGACTTTTGAAGTCTCTTAAAGATATGATCGAT
TGAAAATTTGCTTAACTTCGTTGTTTTCTCCCTCTTAAAATGCTAAATCA
GGCCCACTTAAGGGCTCTAACAGGATAATTTTTGTCAAAATATTGGTTGA
TCTTCTCTAGCCAACTAATCATTGGCATTAGGGGAACAACTGAAAAAGAT
TTCAGGTCATTTCCTTCAACAGATGACATTTTATGACAGTTTCTTTATTT
TTAAGTACAGAATATGTAAAAAAATGAGACTGCCATCTGGCGTTTCCTAC
CATTCCAGGGCCTATATTTCCAGAAGAAAACTCAACCTTTCACAGTTTGG
TGAATAATAATCTTAAATATAAGCAGGCTACTTCAACTAAATGGGTTTAA
CAGTACTTAATTCCTATTCAAAAACTTTTTAGACTCATTCAGAAATCCTA
CTTTGACAATAATTTGCGCTTTACCGCAAAATTTCTAAGTCCAAGTGTCA
TGATTAGCTTTTAGACTGTCCAATATCTCTATAATAGTGTACACTAACAG
TCTTACTTGTTTATTCTTAAATAACTAAGCAACATTACTAGGGTGATAAT
TTATGAGATACTGCAAACAATGCAGTTTAAATCTTCTGGACAAGAAATAT
TGGACAGTCTAAAGCTAATCACAACACTTGGACTTAGAAATTTTGCGGTA
CAGCGCAAATTATTGTCAAAGTAGGATTTCTGAATGAGTCTAAAAAATTT
TTGAATAGGAATTAAGTACTGTTAAACCCATTTAGTTGAAGTAGCCTGCT
TATATTTAAGATTATTATTCACCAAACTGTGAAAGGTTGAGTTTTCTTCT
GGAAATATAGGCCCTGGAATGGTAGGAAACGCCAGATGGCAGTCTCATTT
TTTTACATATTCTGTACTTAAAAATAAAGAAACTGTCATAAAATGTCATC
TGTTGAAGGAAATGACCTGAAATCTTTTTCAGTTGTTCCCCTAATGCCAA
TGATTAGTTGGCTAGAGAAGATCAACCAATATTTTGACAAAAATTATCCT
GTTAGAGCCCTTAAGTGGGCCTGATTTAGCATTTTAAGAGGGAGAAAACA
ACGAAGTTAAGCAAATTTTCAATCGATCATATCTTTAAGAGACTTCAAAA
GCCCATTGAGATTTTTTTGAGGCTATAAACTAGACCTACTAAGGAAGCCT
TGCTGAAAATTTCAAAAAATTTTGGTGTTGCCTTAAAAAGATACGCCATC
TTGAATTTTGCTCCAGGTCTGCCAAAATAGCAATTTTTTCGGCCATTTTT
GACAGTTACGCAAAGATTGAAATCCTGAAAATGTTATTTTTGTGGCCAAA
ACCCACCAGTAAACCACTCCAGGTCTAAAGTTTACTTCAAAAAAGTCCCA
AGGACCATCAGCAGCCAGCTAAAAGTGCTTCCAAACCCAGATTACGCAAA
GTTTGAAGCCCTCTACAGGAGGTGCTAGAAATTTTCGGGGAAAATTTTGG
AGACTCAATTTGATTTTTTCTGATTCCCTACAAAAAGTTCTTGAAATCCA
CTGTAAATCAGCTTTCTAATGTACTTGAATAAAAATTCATTGGCTTTCAA
AATCTGCTCCCCACCAGAGTTCATGATATTTAGGGGTCAATTTTTGCTTA
GTAGCCTATCTTTGAGACGCTGTATCTTCAAAACTACTTGAGATATCAAG
GTGAAATTTTCAGAGTCTCATTTTCTTGTGTGATAGATCATTTGGTCAAA
ATTTCATCAAAATCTAAGAGGGCGAGGTATCAGACTTTCTTTATTCTGAA
GATTTTTAAAAAAAATGGCTCTTAAATATCTCAATCATTTTCCAAGTTTG
TTAAAATATCTTTCATGCCTTGATTGAAGAAAAAATTTGTGATTTTTTTT
TGACTTTTGAAAAAAATGTTTTGAATTTTTTTGCTTCCGGATTTTTTAAA
AACCTAAAATTTTAAGTGAAAAATTGAAAAATGTGCTCACTTAGTACACC
ATATCCTACCAAAATCGACAATTTTGGGCTTAGGCACCACCCATGTTGCA
GTTAGTCCACTGGTGGAGTAACTGTTTTCCCAAATTTTGGTTTATATACC
ACCACGGTAGTAATTGTCATAGTGTTTATATAATAACTGCATGACCCCCC
CCCTGGTTTTGCAGCACATTTTTTTGCTTGAGAGTCAGGTAAACGATATA
GCACTTTCCCAGCATTAATCTTTGATACGCATTTCGGTGGAACGCTAGTG
TGACTAACTGAATGGGTGGTTTAAAATTATGGACTTTGAACACTGTGACC
TCCGACCCAAAAATGGCGCATGTAATGATAAACAAAGTCAAAATTCTGTG
AATGCACTAGAAATTGGCAATAATAAAATTTTTGAACGAAGGAAAGTTAA
CTGACAGAAAAAGTCCGACAAATTTATCGACTCACCGACTCAATTCTACT
CAATTTTCGAGAGTCGGTCGGGCGACACGAAACAAAGATATTTGTGATTG
CCTTATTATTATTATTGGCTGTTATGAAATTCCTTATAAAAAGAAGTTCT
TCTACAAAAAGACGCTTAAAAAAACGACATGGAAAAAGTTGTTCAAAATT
AAATCATTTTATTTTAACAATTTCATAAACTACGTCACAACCGCGGAGCG
CTGACTTTTTTATCACTTTTTCTCAGTCATTTCCATTTGGTTTCCGTAAT
AAAAAGAAAGACGTTAATTGTGAACTTAAAACATGCTTAAAGTCAAGGTA
CTTCTACTAACTGTCTTTATGTGGGAAAGTTGCAAGATCACCAAAGATCA
TCTCAAAAAAAAGATCACCCAGCTTATTTCTAGAAATAAGAATTTTTTTG
GCCCTGGTTTCACAATGAGGCCCTGGTACCAACAATACGTCTACATTAGC
ACGACAAAATAGCAAGCCATTTATTTTCAATTTCCGATAGATTTGATCTC
TGCCAAATTTTGAAAATCCATTTTTCAAGCTTTTTTCACTGAACAACCAA
CCAACTCATATTTTTTACCCAAAAATGATGCCAACACCTGCCAGCACAAG
TTTTTTGTGATCGCAACCTTAACAAAATTTATGCTAGAAGTAATTAGTTA
TTCAAGAGACTGTTGTCAGTATAGCCCTAACTCTTCATACAAAATTTATG
GGAAAGGTATATTAGATTTTGTACCAAATGCTGCACACAAGCACTTAGGC
TAAAGTCCTAGAATAGCAGGACAAAAATTAGTCTTTTGAAGTTTTCATTA
AATTTCCACGTATATATAAGATCTTTCGAATTCAGTATGTGAATAGAGCA
GTAAAAAATGCAACTTTTCTATGTTTCCTTTTTTTTGCAAAAGTACCAGT
GATGAAAAGAAAGGGTAAATTAAATAATTGAATATAATAAATAATAAAAT
GATAATTGAATACTGATGATCCACAGCACTATGGCGAAGCTAGAATTGCT
TTGTGTACTCTTTGCTTGAGAAAATAAAATGATTGACAGATTAATTTTTT
CACCCGTGAGGGAGTTTGCAGGTGTTCTGGGGGCATGGCTTTTTTCAACT
TGCCCAAATTCTTGAACTGTGGCAGGTTGTTACATCTGACAAATTAATGC
TTGTTTTATACTTTTATTTCCATTGAAGAATCATACTCTGGCTTTTATTT
TACTAAGTGCCCTTTATAGTTTTAGAGTATATTTGTTTTGTTCTCCCAAA
CCACTATTGACAAACTTTCTCAGGCAGTCTGAACCATATTTTTCTAGATC
TTTACCTTATCACAATATCACTTTGACTCCAAAAATTTGCTTTTAGTAAA
TGACTCCAAAAAGAATTTAAGGCTTCAATGGAAAAAAGATTGAGAACAAG
TTGAGAATATTTTAAGGCTTTGGGGACCTTAAACCATCTATTTTATTAGG
AAGACAGACAATACTCACTAAATGTTGAAAATAAAAACATGTTAAGAACT
TTTTAGACTTAAAACTAAAATTAAGAACATAATTAATTGTTAAATAAAAT
TGTTTTTTATTAAGGCTTATCTGCTTCTAAATTGGAGATTATCCTTGAGA
AATGGAAGCAATATAATAATGTTCTCACACGATCAATGGCAAATCAAGTT
TTCAATATCAATCAACTTGTGGATATGGATTGGAAATTTGGAGTAACTGC
CGCAACATCAGATGAAGGTCAAGTCGGACACTCTTTCATTCAATTAAAAC
TTGTGATTGACAAAGGAAACAAAGAAAATGAAAACGTTTGTTTAGAACTG
ACTCTACCACAATTTTATGAATTTCTCCATGAAATGCAAAAGGCAAAAAA
TAGTTTAGAGTTACTTGGTTAA Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000026_pilon:523150..530471- >XLOC_036852 ID=XLOC_036852|Name=XLOC_036852|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=1182bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000026_pilon:523150..530471- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ATGACAGAGGTATCAACTTCATCAATAAGTTCTGCAGAGGTTCAAATTTT
AAATAGGTTTCCAGAGGAGTCGTTTAATGAATTTATTCAACTTGTATTTG
ATTTTCTGTTAAATCCGAAAGACGCATCCAAACTTTTGGATGATTTGCAT
ATATTTTGTGAGAATGCTGGGGCATCAGCTGGAGCTGTTAAGAATCTAGT
AAAATTACTGATCTCATATTTGAGGGAAAAACTGAAGAAAAATGTTTCAA
GTAACTCTATCAATGATCAACTTGAAAAGCTAGATGACAGAGGTATCAAC
TTCATCAATAAGTTCTGCAGAGGTTCAAATTTTAAATAGGTTTCCAGAGG
AGTCGTTTAATGAATTTATTCAACTTGTATTTGATTTTCTGTTAAATCCG
AAAGACGCATCCAAACTTTTGGATGATTTGCATATATTTTGTGAGAATGC
TGGGGCATCAGCTGGAGCTGTTAAGAATCTAGTAAAATTACTGATCTCAT
ATTTGAGGGAAAAACTGAAGAAAAATGTTTCAAGTAACTCTATCAATGAT
CAACTTGAAAAGCTAGGCTTATCTGCTTCTAAATTGGAGATTATCCTTGA
GAAATGGAAGCAATATAATAATGTTCTCACACGATCAATGGCAAATCAAG
TTTTCAATATCAATCAACTTGTGGATATGGATTGGAAATTTGGAGTAACT
GCCGCAACATCAGATGAAGGTCAAGTCGGACACTCTTTCATTCAATTAAA
ACTTGTGATTGACAAAGGAAACAAAGAAAATGAAAACGTTTGTTTAGAAC
TGACTCTACCACAATTTTATGAATTTCTCCATGAAATGCAAAAGGCAAAA
AATAGTTTAGAGTTACTTGGTTAAGCTTATCTGCTTCTAAATTGGAGATT
ATCCTTGAGAAATGGAAGCAATATAATAATGTTCTCACACGATCAATGGC
AAATCAAGTTTTCAATATCAATCAACTTGTGGATATGGATTGGAAATTTG
GAGTAACTGCCGCAACATCAGATGAAGGTCAAGTCGGACACTCTTTCATT
CAATTAAAACTTGTGATTGACAAAGGAAACAAAGAAAATGAAAACGTTTG
TTTAGAACTGACTCTACCACAATTTTATGAATTTCTCCATGAAATGCAAA
AGGCAAAAAATAGTTTAGAGTTACTTGGTTAA
Gene-mRNA-Prot
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Position
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
|---|
| sc0000026_pilon | genome | sc0000026_pilon:523150..530471 - |
Properties
| Property Name | Value |
|---|
| Aaloc | 286-591:307 |
| Aaloc | 1-282:7323 |
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