XLOC_036850 (mRNA) -

Overview
NameXLOC_036850
Unique NameXLOC_036850
TypemRNA
OrganismClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon (Jellyfish)

Sequence
The following sequences are available for this feature:

mRNA from alignment at sc0000026_pilon:577298..586270-

Legend: polypeptideCDS
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>XLOC_036850 ID=XLOC_036850|Name=XLOC_036850|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=8973bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000026_pilon:577298..586270- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ATGGCAGATAGTTGTAGTAATTCGTCTGTTGGCTCGCCGTACGCAAGTAG TACTGACCTTCGCGGTGAGGATAGTGAAGAAATTATGGAGCGTGGACGAC GCCGATCACGCAATCTTGGCTCCACAAGCAGCCGCAGAGCGGTCGGTGGA CTGGACCTAGAGGATGTCGAAAATACAGTTCGTGGAATGCAACAAGATTA TAATGACATGAAAACAGAATTTGTAAGTTATACCAATTATTTTATTTTCA AATGTCATTTCCGGATTGAGATTTTTTGGTCTTACAGTCAACTCTCTCTA ATTCGAATATCTCTGCTATTCCAATCATTCTGTGATTCGAACTAAAATAT TGGTCCTCTCACCTGAAAAGTGGTTTAAATTACTCTCTGTAATTCGAACA TTTCTCTAAGTCGAATAAAATATTTGGTCCCTTGAAGATCGAATTAGAGA GAGTCAACTGTAGGTTTGTTTTTTGTAAGTCATCCATTTTGCCTCGCTGA GCTGGTAAGAAGATCTTGGATCTTTAAACATTTCGAATGAAGTTAAGGAG ACAAATACCAATGTGGATAGAGAATCCTTTGAATAGTTTAGGATTCAGTA CACCTAGGAAATAAAGTACAAATGGCAAATTTCCCTCAACAGAAACTTGA AAATTAGATTAATCGTGAATTAGTATATGTAATCACATGATAACGAGTGC AATTCGAATATAATTTTCCGAGTCCGAAAGGACGAGGAAAATTTGAAACA AAAAAATCACGAGTGCAATTTTCGAATTGTACGAGTTATTATGTGATTAC GATGTTATGTGATTACGATGTAATCGCACAATGACTGTCACTACTTTTTC CCAGTTAGGAAAGTAAATTACAGAAATTACACTGAGAGTTTATCTTTTTC TCTTCTCTTTATGTCTTTCTTTTAGTGTTGTTTTGATTTTCTTTCTCACA AAATAAATTTCGAATGCAATTAAAACGTTCGATGCAAAAAAAATGTAAGA AAAACATTAAAATCAATTTTGTAAACATTGGCGACGCATTGGAGAGTGTG ATTAACGATTAATTGCTCTCTACAGGATGCAATTAGCGATTAATTGCTCT CTTTGAGGGCGTGCCAAATAAGAAAAAATAACCCATCGTGCGATTATATT TCAAAGTTTTTCTCCTAATGTTTGTATCCCATGTCAAACTCAAATTAGCA GTCTCAACTCAAGTGGAGACTTTCGAAAACAAAAATTTTTGTCTATATTA AATTTAACCAACCACGGTGCTTTCTTTCGCTGCTGTAAAATTGGACTGAA CTCTTCATGACCAAAACAAGAAACGCTTGGTTTTTTTTTATTTGAATAGC TAATTCTTTGTGGATTTTATAAAGTATCGTTCGTGATTCTCCTTTGAGAA TCCCTGTCTCAGTCATCATTACGTTTATCAGCAAATAGGTTTCACATTAA GACTTTTTATCGTTCTTTCCCATTGCAACTTCTTAGTAAGATTAATATTC AATTAGAGTCAATCATCCAAGTTTTGATGGCTAAAGCCGATACAACCGCT CATATTTCATCAATCTGCAAATTGATTAGTCTAATTCGCAAGTGCTTATC TATCGAGAAATAACTTAGTCTAATTATCACTTGTGATTAGCATACAGTAA ATAACCTTTTCTTCACTAACTTGCGACATTGCAAGCTAAATAAAACCCTC GTCTTTTATCATTCATGACTTTAATGCCACTTTTAAAGTCGCTTAATAAA GCAGTATTTTGTTGTGGATTCTGCTACTCGGCTCTTCATCTTTCTTCAGT ACGGTAAATTTCGAGGCTAGCTTATTATTTTTTACCCTTATTACTACCGC CGTTTTTGGGTAAAATTCCATTTCTCGCACTAATATTCCACTTTCCACTC CGTAGCTTAAAAAGAATTTATGGGCAGTTATTGAAAAACGGATGAACATG GTCTTAGTGAAATCCTAATCCGGGAAGTGGAATCTTGTGTTCTAAGCGAA AAGTCTTTCATTGTATATAAAAATGTTGTCCAAGGCTGATCCAAAGAATG GTCAAAAAAAGTTATACTTTACTTTGATATTGTACCAAAAACAGAAAATA TTTGTCTGTCTGAGAAAATACTATCTTATCATGATCAAAAGTGGTTGCAC TTATGAAATGAAAAAATCATATCAAAATTCCATGCATTCTTTTCTCCTCC TTCGTAATAATAATACATCGCCTCATAACAATCACCCTATAATTTCTGTT GGTTTCACTCTCTTACCAACCCAACATATTTCATTGCGGCTAATATAGAA AACTATTTTCTGAACAAATTACGGCTATCTTCTCTACTGTCTGCCTATTC TCTTTGATTATCTCCTAGTTCTAGGCCATATTGTCCTCTACAAGAAGGGG TCACTAATATGTGCTCATTCTGACCAAAAATGAATTTTCCATTCTTCTTT GTTTCATTCCTATTTAGTTAAATGCCTGCCTTAATTTATTTGTGTTACTT CCCAGATCAGCCTAGATAATCTTTTTCCCTGACTAATGATGCTTTTGTCT TAGCATTTTTGTGATTAACTACTTCATCAACAGTATCGGGTGATTAAAAA ATACCCCTTTCGGTTTTGAGGTTATTTCCTAAAATTTCAGAGATAACTTC CCCATTAAAAGTAATTCTGAGTTGAAGAAAGATTTTGTTTGGTGTCAGTA AGTAAGAGGTTTTCAAAATGCCCAAAACTTTTTTTTGAGTCAGTCAATAG ACTTTGTGTGATTCATCTTATCATAGTCTGTTCTTCATCATTGCTGATAA TCTGTTACCATAACAACAGATAATCCTAAGCTTTTAAGTAATGCTGGTTT CCATTCAGTGATTCTAGATAATTATGACGTTCTGATATCGTTTGTTGTGT CTGTCAAAGGGTTAAAGTTGTTGCATAAAAAATCAGAAGCTATTGGTTAG GACATTCATTTGGTTTTCAATATCCTATAAGAACTTATAAGGCTTTTTAT ATACGGTACTTTATAGGCCCTCTAAGCTAGATCTTGTCCAAACGAACATA AAGACTTTGCTAAATTTCAATGTATTTTTTTTTTACTGTTTGACTCTTCC CCATGTGATTTAAATAACAGTACTCTTCCCAGATTTTTTGTGATATTTAG GGTTGGCGTTAAGTGCATACTGAAGGCTCTATGTAATCGGAAAAAAACAA GGCTTCGTTTTTTCGATTACTCCATTGGCTGATGTTATGATGCACCATGA GCTTAGCCTAGTTAATGTTCATAGCTTTACTGTGTCATCAGATACCTAGT CTTGTCAAAGGAAAGACTAGACTAAGATGTTATTATTTTCTTTTGTGAAA AACAAGGCTCGTTTTTTCAATTACTCCATTGGCTAGTGTTATAGCGGTAT CATAGCTTTACTGTGTCATCAGGCTCATATTCTCGATGAAGGAGAGACTA GACTATAAGATGTTACTAGTTTTTCTCTATTTCTCTTAGTCCTGCTAATA CAATTAACCAATACAGTCGGTAAACATATCGATGCTTCAGCAAATACAAG GATACTACTAAATCAACATTTGAGCAAGAAAGATCGCTCTCCTAATAAAG ATCCGAGTCATTGTTTTGTGTCGAATAACCTTATTTGTACTTGTTACCAA ACATTTTGCAATGATTGACCAATAATTTTGGTCATCTAACATAAATTTGT TTGAATTTTGGGTTCAATTTCAATCAATCCATAGATTTTTACGGATTTAC ACTTTGAGACGATAGTCAGTGTCACGAAGTCAATTGATGACCAAAGACTA AATTTATAAGAACATCAAGGATATAGAAGCTCGGGACAAGAAAAAGACCT GTTTTTTTCTTAGTAGAGTAACTGTCTAATAATTTACATCTAGAGACAAA GTGAAATCGTTTTTCCCTACTTTATTTTGATTTATATGAAAAAAATTTGG AAACCAGGGGCTAATTCAAGTGCCTACAAAAAGAGCTGTGATATTCATGT TGTCCATACAGACACTAATGTTTTAAGTGACGAAAGACTCGTAGTAAAGA CGAAAATGATTTATCATATGTGACTAGAGACACCACCTTATATGGTCAAA ATTTTCAAATCTCTTAATGATAGAAACCAGTCCATTTACCATAATGTAAT ATGCATTCTTTATCATAAGAGCTAATTATACGTCAAGAAAAATAGTTCTT TCCCACACGTAACACCAACAAACAGAATTTTTTAAAAATACAAAAGACAT TTATATAATCTACGTATAAACAATCTATTCATTGGATTGGTTCGTATAGT AAGTCGAGGAGGAGGTATTTCAATCGATCGTTTTACAGTAATAGTACTAA ACCCTTTTTGAAACCACTTGCGGTGGAGTGAGAGATATTCCTCCTTGTAC GTCTATTCGTCTTATCATTTTTGTTGGTTGATTTATTTTGTGACTTTTTA CCCAGAAAAAAGTTTTTATTTTACATTGGAAAGAGGAATTCATAATGGCA GTTGTTCAAGCACCGCTCGCTTTGCTGCAATACAATCGCGATGACGAGCA GTCAATACTGGTAAATAATCGAGTTTTGTTTTTTGGATCCTTTTCTTTAG TTTCAGTTTATGTGCTTTCTTATTTGGTCATTGGATAATGGACCAGCTTC TGAAAGACGAGGGTCTAAAGTTAAGAATGTATCCGAAAATAGCATTGTAT ACAAAGCTCTCCTTTTGCATTTTCTTTGCCAGACATCCTCCTTATACTGG CGTTGGGGATATTATTTTACTGAATTTCTCTATGATACATAGTTTTTGGT TCAGCCATTGATTATGCATTTAGTGCAATTTGTATAAATTTTTTCTTAAT GAAAGTCAAATCCAGTTCACTTGTTAAAATAATATCAACCTAGAATGTTT TCAAGTTGGGAGGAGGGAAGAGAAATAAATTGACTGTAGCCTATAATCAA AATAATTGTCATATATCCCTCATTCGTTTTAATTGAACTCAATATCCAAT CGTCCAAAATGGTACCTTTGAAACGCGACAGCACTTATTACCAAAACCCT TTAATTAACCTATGATTGGTCCAAGTTTACTTTTGATGCTTCACTTTGTA GTCTTGTTATATCCAAACAAAGTCTTCATTCGTAATATTCATACTGCAAT ATTTTCTACTGAAAACACCCGATTTCTGCAAGTAGTTGCAAATTTAAGCT AGAGATAAGCTGTTTAAAGTTTATCATTTCTGGCAAAAACCGGAGTCTTT CCATAGAAAACTTTTCGTAATGAATATCATGAATTCAATCTGTGTTCAAG TAGTTCAAGTACCTCATTTTTAAGGACTGACACACCCCTGAGCACAGGTC GGAGGAGTAATTCTGATACTAATAATTCGGCGAATTGAAAATGCTTTAAA GATTAACATTTTTTCAATAGAATGTTGAGGTTACTTTTTGGACCTACCGG GAGGTCCTTTAATTTGACCGTTGTCCGTTCGTCTGTTACAAGCTTTTCTC GGGATTGGCTCATTAGTTTTTTTTTAATTTTTTGCACAATGATACAAAAT GGCAATGCCTGAAAAGATTTTTGAAAAAAATTTTTGGGGGGCAAATTTGG GCCAAAAACTACCTAAAAATAAGGTTTTTTGGACTTTGTGCAAAATTGCT TCATTAGTTTTTCCTGATTTTTGGCAGAAAGATAGAGTGCAAGGTACCCT AAAATGTGGCTGAAGTAATTTTTCTCGGAAAATTTTTTTTTCGTCGTCAA ATACGGATTTTGGGCCAAAAACTACCTAAAAATAAGGTTTTTTGGACTTT GTGCAAAATTGCTTCATCAGTTTTTCCTGATTTTTGGCAGAAAGATAGAG TGCAAGGCACCCTAAAATGTGGCTGAAGTAATTTTTCTCGGAAAATTTTT TTTCGTCGTCAAATACGGATTTTCGCTTTTTTGGGGAAATTCCCTTTTAC CATTTTCCTGTTAGCAGCTTTTCTCGGGATTGGCTCATTATTTTTTTTTT TTTTTTGCACAATGATACAAAATAGCAAGGCCTGAAAAGTGACGGAGCCC GATTTTTGAAAAAAAATTTTTGGGGGCAAATTTGGGCCAAAAACTACCTA AAATAAGGTTTTTGTTTTTTGGACTTTGTGCAAAATTGCTTCATTAGTTT TTCCTGATTTTTGGCAGAAAGATAGAGTGCAAGGCATCCTAAAATGTGGC TGAAGTAATTTTTTTCGGAAAATTTTTTTTCGTCGTCAAATACGGATTTT CGCAAATTTGGGCCAAAAACTACCTAAAAATAAGGTCTTTTTTTGGACTT GGTGCAAAATTGCTTCATTAGTTTTTCCTGATTTTTGGCAGAAAGATGGA GTGCAGGGTACCCTAAAATTTGGCTTAAGTAATTTTTCTCGGAAAATATT TTTTGTCGTAAAATACGAATTTTCTTTTTGGGGGGAAATTCTGTTTTACC ATTTTCCTGTTAGCAGCTTTTCTCGGGATCGGCTTTTTATTTTATTTTTT TTTCATTTTTTGCACAATGATACAAAAAAGCAATGCCTATAAGTGACGGA GCCCGATTTTGAAAAAAAAATTTGGGGTATATTTGGGCCAAAAACTACCT AAAAATAAGGTTTTTTGGACTTGGTGCAAAATTGCTTCATTAGTTTTTCC TGATTTTTGTCAGAAAGATAGAGTGCTAGGTACCTTAAAATGTGGCTGAA GTAATTTTTCTAAGGAAAATTTTTTTTTGTCATAAAATTTTCAAAAAAAG ACGACCAAGTTACACAATGATAAAAGAAAATAAATCAGACGTTTTTGCAT TGTTCTAAAACTTATTGTGTTTGCTCAATACCAATAGTAAAATATGTAGA ATACCTACTTTTATCTGATATTGATCAAGGTAGGTCCATTCAGCATGTTG CTTGTTTCTTTTCGCGTGATTCTGCAATACCACTATCTTGCATCGAACAA AAATGACAAAAATGTTTTCCTTGGCTGACATTAACTGTGTATATAACAGG GTTGTGTAATGGGCGAAAAGAAAACGCGAACATTTTGAAAGTATACTAAC TAATGGTTGTATTTGAATAATTTTTTTTTCTGCCGACTTCCTTTTTAACG GCGCCAAGTCTGTTGTATCAGTAGAATGAAACCATGCAAGCTCCTACATA CTCTCTTTTTTATATACAAGCATACCTTTTATAAGCATACTTTGGCTCAA ATTCGGTAAAAAATAAGCATAAATGCTAAGCATACCTTTTCTAAAACGCT GACTTTTTTAGGGTTACTTTTAAAGCTATTTGAGCTTTCTTAGACCAAGT CTACGCATATAAATAAGCATAAATTTAGGCTGAAAATGAAATTTTGCTAA GCATATTGAGCCTCGACCCGATTTTTCCGTATGCTTATAAATAAAAAAGA GTGTATTTTATTGCCTTCAATAGAGAGTTAGATAAAAAGAGATTTCCTTC TCAACTCAAATTTGTTGTGTTTTATGGTTCCTTCTTAAGATTTAGTTTTT CCATCTACCTTATTATCCAGTTATCATCTGTGTGGATTAAATTATCATAC CCGAATTTATTTTTGCTTCCTTTGTTTATCTATAACCGATCTATTACATT CCTTCTCCTTAATCCTTTTAATGATTTTTGAGGATTTCTGAAAGAATTTC TTTGCAAGTTAAAAAGATTTTATTACAAAATATATTAAAAGAATGCTAAA ACGTAAGTCTACGACCGCAAACGGAGGCCACCCGAAGGCTCCTCTTTCAA TAGCCAAGGCGTGGGTGCCACCTTTTCTCACTGGATTGATCCCTTAACCC TTTAAGTACCGCGGTCATTTTTTTCTAAGCTTTTTGAAGAAAATCGCTAG TTCAAACTTTAAAGGCTTATATCTCCGGATCTAGAAGGACCTGCTGCGCA GACCTGCCTGAATGATAGAAAGGTGCCCAGTAGTAAAACTTCAATTAATT AGCTAGAGGACAGAATCAAGTAAAGCAGGGCTAATTTTGGAAGTTTTTGG ATCACACGGGGGCGACGTTGAGAGGATACCGTTTAGTTTTGTTTATCCGT GAGACCGATTGAACGCCTATATTTTCAATTAAACTTGCTCTTGGATTTCT ACAAACTTATTTTAATATTTTATTAAGGGAAAGAGGGTGCAGCATATTGT CTCAAAAGCAGAGTGATTTAGCCTGGAATTGTCGGAATTGTCACATCAAC GGTTGCGTCTCTTTCTTGCTCTTCTTTGCTATGTATGGCCTCTCTTAACG ATTTTAGTACTAGAGTGTATGAATGATGGAAAAGCTTAAACTGACTAAAG ACAAGACTAAAAAAGATACAATTTTTATAGTTTGACTTGCTAATGCTTGA GCTAAGTGCCTGAATTTTAAAATTGTCTCTGCCCCGATAAAAATAGAGTT AAAAGTTCAAACACCGGTGAGTTATCAAAATCAAAGTCGGTTAAGTTTTA TTTTATTCATAGTCATCCGGTAGATTTTAAAAACTCCACAGAGTCATTGG GACCATGGGATGGATTGAGATGAGTTGGGTTACAAGGTGATCAATAATAT GATAGTTATGTCTTAACTTTATGACGGTTGAAACAGAAAAAACAAATTAG ATTAAATGTTTTTTATTTACATCTTCAGACTGGTATTCGTAATCAATCGC AATCACAAAAACGTCGCATTCTCGATCTTGAAAACCAATTCGAAGATGCT CGAGTACGAATCGATAAACTTTTACAACGAAAATCGATTCGTCGAAACAC ATACGATTCGGTATCGAATTCTTCATCGTTCGTAACTCCTTCAGCTTCGT TTACATCGGAACGATCTTCGCATTCATCAAAAATGAACATCGATAGAAGC GATTCAATGGATTCGACGTCATCAACAGAATTACACAAAACTCAAATCAA CATCAATCCAGCGAATAATACTAAACAAACTTTCGGTACTGTTACTCTTA CAGTAAAAGTTGATGAAGATTAA

Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000026_pilon:577298..586270-

>XLOC_036850 ID=XLOC_036850|Name=XLOC_036850|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=1134bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000026_pilon:577298..586270- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ATGGCAGATAGTTGTAGTAATTCGTCTGTTGGCTCGCCGTACGCAAGTAG
TACTGACCTTCGCGGTGAGGATAGTGAAGAAATTATGGAGCGTGGACGAC
GCCGATCACGCAATCTTGGCTCCACAAGCAGCCGCAGAGCGGTCGGTGGA
CTGGACCTAGAGGATGTCGAAAATACAGTTCGTGGAATGCAACAAGATTA
TAATGACATGAAAACAGAATTTATGGCAGATAGTTGTAGTAATTCGTCTG
TTGGCTCGCCGTACGCAAGTAGTACTGACCTTCGCGGTGAGGATAGTGAA
GAAATTATGGAGCGTGGACGACGCCGATCACGCAATCTTGGCTCCACAAG
CAGCCGCAGAGCGGTCGGTGGACTGGACCTAGAGGATGTCGAAAATACAG
TTCGTGGAATGCAACAAGATTATAATGACATGAAAACAGAATTTACTGGT
ATTCGTAATCAATCGCAATCACAAAAACGTCGCATTCTCGATCTTGAAAA
CCAATTCGAAGATGCTCGAGTACGAATCGATAAACTTTTACAACGAAAAT
CGATTCGTCGAAACACATACGATTCGGTATCGAATTCTTCATCGTTCGTA
ACTCCTTCAGCTTCGTTTACATCGGAACGATCTTCGCATTCATCAAAAAT
GAACATCGATAGAAGCGATTCAATGGATTCGACGTCATCAACAGAATTAC
ACAAAACTCAAATCAACATCAATCCAGCGAATAATACTAAACAAACTTTC
GGTACTGTTACTCTTACAGTAAAAGTTGATGAAGATTAAACTGGTATTCG
TAATCAATCGCAATCACAAAAACGTCGCATTCTCGATCTTGAAAACCAAT
TCGAAGATGCTCGAGTACGAATCGATAAACTTTTACAACGAAAATCGATT
CGTCGAAACACATACGATTCGGTATCGAATTCTTCATCGTTCGTAACTCC
TTCAGCTTCGTTTACATCGGAACGATCTTCGCATTCATCAAAAATGAACA
TCGATAGAAGCGATTCAATGGATTCGACGTCATCAACAGAATTACACAAA
ACTCAAATCAACATCAATCCAGCGAATAATACTAAACAAACTTTCGGTAC
TGTTACTCTTACAGTAAAAGTTGATGAAGATTAA
Gene-mRNA-Prot
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
XLOC_036850XLOC_036850-proteinClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonpolypeptide
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
sc0000026_pilongenomesc0000026_pilon:577298..586270 -
Properties
Property NameValue
Aaloc223-567:346
Aaloc1-222:8974