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Sequence
The following sequences are available for this feature:
mRNA from alignment at sc0000026_pilon:577298..586270- Legend: polypeptideCDS Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >XLOC_036850 ID=XLOC_036850|Name=XLOC_036850|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=8973bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000026_pilon:577298..586270- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon) ATGGCAGATAGTTGTAGTAATTCGTCTGTTGGCTCGCCGTACGCAAGTAG
TACTGACCTTCGCGGTGAGGATAGTGAAGAAATTATGGAGCGTGGACGAC
GCCGATCACGCAATCTTGGCTCCACAAGCAGCCGCAGAGCGGTCGGTGGA
CTGGACCTAGAGGATGTCGAAAATACAGTTCGTGGAATGCAACAAGATTA
TAATGACATGAAAACAGAATTTGTAAGTTATACCAATTATTTTATTTTCA
AATGTCATTTCCGGATTGAGATTTTTTGGTCTTACAGTCAACTCTCTCTA
ATTCGAATATCTCTGCTATTCCAATCATTCTGTGATTCGAACTAAAATAT
TGGTCCTCTCACCTGAAAAGTGGTTTAAATTACTCTCTGTAATTCGAACA
TTTCTCTAAGTCGAATAAAATATTTGGTCCCTTGAAGATCGAATTAGAGA
GAGTCAACTGTAGGTTTGTTTTTTGTAAGTCATCCATTTTGCCTCGCTGA
GCTGGTAAGAAGATCTTGGATCTTTAAACATTTCGAATGAAGTTAAGGAG
ACAAATACCAATGTGGATAGAGAATCCTTTGAATAGTTTAGGATTCAGTA
CACCTAGGAAATAAAGTACAAATGGCAAATTTCCCTCAACAGAAACTTGA
AAATTAGATTAATCGTGAATTAGTATATGTAATCACATGATAACGAGTGC
AATTCGAATATAATTTTCCGAGTCCGAAAGGACGAGGAAAATTTGAAACA
AAAAAATCACGAGTGCAATTTTCGAATTGTACGAGTTATTATGTGATTAC
GATGTTATGTGATTACGATGTAATCGCACAATGACTGTCACTACTTTTTC
CCAGTTAGGAAAGTAAATTACAGAAATTACACTGAGAGTTTATCTTTTTC
TCTTCTCTTTATGTCTTTCTTTTAGTGTTGTTTTGATTTTCTTTCTCACA
AAATAAATTTCGAATGCAATTAAAACGTTCGATGCAAAAAAAATGTAAGA
AAAACATTAAAATCAATTTTGTAAACATTGGCGACGCATTGGAGAGTGTG
ATTAACGATTAATTGCTCTCTACAGGATGCAATTAGCGATTAATTGCTCT
CTTTGAGGGCGTGCCAAATAAGAAAAAATAACCCATCGTGCGATTATATT
TCAAAGTTTTTCTCCTAATGTTTGTATCCCATGTCAAACTCAAATTAGCA
GTCTCAACTCAAGTGGAGACTTTCGAAAACAAAAATTTTTGTCTATATTA
AATTTAACCAACCACGGTGCTTTCTTTCGCTGCTGTAAAATTGGACTGAA
CTCTTCATGACCAAAACAAGAAACGCTTGGTTTTTTTTTATTTGAATAGC
TAATTCTTTGTGGATTTTATAAAGTATCGTTCGTGATTCTCCTTTGAGAA
TCCCTGTCTCAGTCATCATTACGTTTATCAGCAAATAGGTTTCACATTAA
GACTTTTTATCGTTCTTTCCCATTGCAACTTCTTAGTAAGATTAATATTC
AATTAGAGTCAATCATCCAAGTTTTGATGGCTAAAGCCGATACAACCGCT
CATATTTCATCAATCTGCAAATTGATTAGTCTAATTCGCAAGTGCTTATC
TATCGAGAAATAACTTAGTCTAATTATCACTTGTGATTAGCATACAGTAA
ATAACCTTTTCTTCACTAACTTGCGACATTGCAAGCTAAATAAAACCCTC
GTCTTTTATCATTCATGACTTTAATGCCACTTTTAAAGTCGCTTAATAAA
GCAGTATTTTGTTGTGGATTCTGCTACTCGGCTCTTCATCTTTCTTCAGT
ACGGTAAATTTCGAGGCTAGCTTATTATTTTTTACCCTTATTACTACCGC
CGTTTTTGGGTAAAATTCCATTTCTCGCACTAATATTCCACTTTCCACTC
CGTAGCTTAAAAAGAATTTATGGGCAGTTATTGAAAAACGGATGAACATG
GTCTTAGTGAAATCCTAATCCGGGAAGTGGAATCTTGTGTTCTAAGCGAA
AAGTCTTTCATTGTATATAAAAATGTTGTCCAAGGCTGATCCAAAGAATG
GTCAAAAAAAGTTATACTTTACTTTGATATTGTACCAAAAACAGAAAATA
TTTGTCTGTCTGAGAAAATACTATCTTATCATGATCAAAAGTGGTTGCAC
TTATGAAATGAAAAAATCATATCAAAATTCCATGCATTCTTTTCTCCTCC
TTCGTAATAATAATACATCGCCTCATAACAATCACCCTATAATTTCTGTT
GGTTTCACTCTCTTACCAACCCAACATATTTCATTGCGGCTAATATAGAA
AACTATTTTCTGAACAAATTACGGCTATCTTCTCTACTGTCTGCCTATTC
TCTTTGATTATCTCCTAGTTCTAGGCCATATTGTCCTCTACAAGAAGGGG
TCACTAATATGTGCTCATTCTGACCAAAAATGAATTTTCCATTCTTCTTT
GTTTCATTCCTATTTAGTTAAATGCCTGCCTTAATTTATTTGTGTTACTT
CCCAGATCAGCCTAGATAATCTTTTTCCCTGACTAATGATGCTTTTGTCT
TAGCATTTTTGTGATTAACTACTTCATCAACAGTATCGGGTGATTAAAAA
ATACCCCTTTCGGTTTTGAGGTTATTTCCTAAAATTTCAGAGATAACTTC
CCCATTAAAAGTAATTCTGAGTTGAAGAAAGATTTTGTTTGGTGTCAGTA
AGTAAGAGGTTTTCAAAATGCCCAAAACTTTTTTTTGAGTCAGTCAATAG
ACTTTGTGTGATTCATCTTATCATAGTCTGTTCTTCATCATTGCTGATAA
TCTGTTACCATAACAACAGATAATCCTAAGCTTTTAAGTAATGCTGGTTT
CCATTCAGTGATTCTAGATAATTATGACGTTCTGATATCGTTTGTTGTGT
CTGTCAAAGGGTTAAAGTTGTTGCATAAAAAATCAGAAGCTATTGGTTAG
GACATTCATTTGGTTTTCAATATCCTATAAGAACTTATAAGGCTTTTTAT
ATACGGTACTTTATAGGCCCTCTAAGCTAGATCTTGTCCAAACGAACATA
AAGACTTTGCTAAATTTCAATGTATTTTTTTTTTACTGTTTGACTCTTCC
CCATGTGATTTAAATAACAGTACTCTTCCCAGATTTTTTGTGATATTTAG
GGTTGGCGTTAAGTGCATACTGAAGGCTCTATGTAATCGGAAAAAAACAA
GGCTTCGTTTTTTCGATTACTCCATTGGCTGATGTTATGATGCACCATGA
GCTTAGCCTAGTTAATGTTCATAGCTTTACTGTGTCATCAGATACCTAGT
CTTGTCAAAGGAAAGACTAGACTAAGATGTTATTATTTTCTTTTGTGAAA
AACAAGGCTCGTTTTTTCAATTACTCCATTGGCTAGTGTTATAGCGGTAT
CATAGCTTTACTGTGTCATCAGGCTCATATTCTCGATGAAGGAGAGACTA
GACTATAAGATGTTACTAGTTTTTCTCTATTTCTCTTAGTCCTGCTAATA
CAATTAACCAATACAGTCGGTAAACATATCGATGCTTCAGCAAATACAAG
GATACTACTAAATCAACATTTGAGCAAGAAAGATCGCTCTCCTAATAAAG
ATCCGAGTCATTGTTTTGTGTCGAATAACCTTATTTGTACTTGTTACCAA
ACATTTTGCAATGATTGACCAATAATTTTGGTCATCTAACATAAATTTGT
TTGAATTTTGGGTTCAATTTCAATCAATCCATAGATTTTTACGGATTTAC
ACTTTGAGACGATAGTCAGTGTCACGAAGTCAATTGATGACCAAAGACTA
AATTTATAAGAACATCAAGGATATAGAAGCTCGGGACAAGAAAAAGACCT
GTTTTTTTCTTAGTAGAGTAACTGTCTAATAATTTACATCTAGAGACAAA
GTGAAATCGTTTTTCCCTACTTTATTTTGATTTATATGAAAAAAATTTGG
AAACCAGGGGCTAATTCAAGTGCCTACAAAAAGAGCTGTGATATTCATGT
TGTCCATACAGACACTAATGTTTTAAGTGACGAAAGACTCGTAGTAAAGA
CGAAAATGATTTATCATATGTGACTAGAGACACCACCTTATATGGTCAAA
ATTTTCAAATCTCTTAATGATAGAAACCAGTCCATTTACCATAATGTAAT
ATGCATTCTTTATCATAAGAGCTAATTATACGTCAAGAAAAATAGTTCTT
TCCCACACGTAACACCAACAAACAGAATTTTTTAAAAATACAAAAGACAT
TTATATAATCTACGTATAAACAATCTATTCATTGGATTGGTTCGTATAGT
AAGTCGAGGAGGAGGTATTTCAATCGATCGTTTTACAGTAATAGTACTAA
ACCCTTTTTGAAACCACTTGCGGTGGAGTGAGAGATATTCCTCCTTGTAC
GTCTATTCGTCTTATCATTTTTGTTGGTTGATTTATTTTGTGACTTTTTA
CCCAGAAAAAAGTTTTTATTTTACATTGGAAAGAGGAATTCATAATGGCA
GTTGTTCAAGCACCGCTCGCTTTGCTGCAATACAATCGCGATGACGAGCA
GTCAATACTGGTAAATAATCGAGTTTTGTTTTTTGGATCCTTTTCTTTAG
TTTCAGTTTATGTGCTTTCTTATTTGGTCATTGGATAATGGACCAGCTTC
TGAAAGACGAGGGTCTAAAGTTAAGAATGTATCCGAAAATAGCATTGTAT
ACAAAGCTCTCCTTTTGCATTTTCTTTGCCAGACATCCTCCTTATACTGG
CGTTGGGGATATTATTTTACTGAATTTCTCTATGATACATAGTTTTTGGT
TCAGCCATTGATTATGCATTTAGTGCAATTTGTATAAATTTTTTCTTAAT
GAAAGTCAAATCCAGTTCACTTGTTAAAATAATATCAACCTAGAATGTTT
TCAAGTTGGGAGGAGGGAAGAGAAATAAATTGACTGTAGCCTATAATCAA
AATAATTGTCATATATCCCTCATTCGTTTTAATTGAACTCAATATCCAAT
CGTCCAAAATGGTACCTTTGAAACGCGACAGCACTTATTACCAAAACCCT
TTAATTAACCTATGATTGGTCCAAGTTTACTTTTGATGCTTCACTTTGTA
GTCTTGTTATATCCAAACAAAGTCTTCATTCGTAATATTCATACTGCAAT
ATTTTCTACTGAAAACACCCGATTTCTGCAAGTAGTTGCAAATTTAAGCT
AGAGATAAGCTGTTTAAAGTTTATCATTTCTGGCAAAAACCGGAGTCTTT
CCATAGAAAACTTTTCGTAATGAATATCATGAATTCAATCTGTGTTCAAG
TAGTTCAAGTACCTCATTTTTAAGGACTGACACACCCCTGAGCACAGGTC
GGAGGAGTAATTCTGATACTAATAATTCGGCGAATTGAAAATGCTTTAAA
GATTAACATTTTTTCAATAGAATGTTGAGGTTACTTTTTGGACCTACCGG
GAGGTCCTTTAATTTGACCGTTGTCCGTTCGTCTGTTACAAGCTTTTCTC
GGGATTGGCTCATTAGTTTTTTTTTAATTTTTTGCACAATGATACAAAAT
GGCAATGCCTGAAAAGATTTTTGAAAAAAATTTTTGGGGGGCAAATTTGG
GCCAAAAACTACCTAAAAATAAGGTTTTTTGGACTTTGTGCAAAATTGCT
TCATTAGTTTTTCCTGATTTTTGGCAGAAAGATAGAGTGCAAGGTACCCT
AAAATGTGGCTGAAGTAATTTTTCTCGGAAAATTTTTTTTTCGTCGTCAA
ATACGGATTTTGGGCCAAAAACTACCTAAAAATAAGGTTTTTTGGACTTT
GTGCAAAATTGCTTCATCAGTTTTTCCTGATTTTTGGCAGAAAGATAGAG
TGCAAGGCACCCTAAAATGTGGCTGAAGTAATTTTTCTCGGAAAATTTTT
TTTCGTCGTCAAATACGGATTTTCGCTTTTTTGGGGAAATTCCCTTTTAC
CATTTTCCTGTTAGCAGCTTTTCTCGGGATTGGCTCATTATTTTTTTTTT
TTTTTTGCACAATGATACAAAATAGCAAGGCCTGAAAAGTGACGGAGCCC
GATTTTTGAAAAAAAATTTTTGGGGGCAAATTTGGGCCAAAAACTACCTA
AAATAAGGTTTTTGTTTTTTGGACTTTGTGCAAAATTGCTTCATTAGTTT
TTCCTGATTTTTGGCAGAAAGATAGAGTGCAAGGCATCCTAAAATGTGGC
TGAAGTAATTTTTTTCGGAAAATTTTTTTTCGTCGTCAAATACGGATTTT
CGCAAATTTGGGCCAAAAACTACCTAAAAATAAGGTCTTTTTTTGGACTT
GGTGCAAAATTGCTTCATTAGTTTTTCCTGATTTTTGGCAGAAAGATGGA
GTGCAGGGTACCCTAAAATTTGGCTTAAGTAATTTTTCTCGGAAAATATT
TTTTGTCGTAAAATACGAATTTTCTTTTTGGGGGGAAATTCTGTTTTACC
ATTTTCCTGTTAGCAGCTTTTCTCGGGATCGGCTTTTTATTTTATTTTTT
TTTCATTTTTTGCACAATGATACAAAAAAGCAATGCCTATAAGTGACGGA
GCCCGATTTTGAAAAAAAAATTTGGGGTATATTTGGGCCAAAAACTACCT
AAAAATAAGGTTTTTTGGACTTGGTGCAAAATTGCTTCATTAGTTTTTCC
TGATTTTTGTCAGAAAGATAGAGTGCTAGGTACCTTAAAATGTGGCTGAA
GTAATTTTTCTAAGGAAAATTTTTTTTTGTCATAAAATTTTCAAAAAAAG
ACGACCAAGTTACACAATGATAAAAGAAAATAAATCAGACGTTTTTGCAT
TGTTCTAAAACTTATTGTGTTTGCTCAATACCAATAGTAAAATATGTAGA
ATACCTACTTTTATCTGATATTGATCAAGGTAGGTCCATTCAGCATGTTG
CTTGTTTCTTTTCGCGTGATTCTGCAATACCACTATCTTGCATCGAACAA
AAATGACAAAAATGTTTTCCTTGGCTGACATTAACTGTGTATATAACAGG
GTTGTGTAATGGGCGAAAAGAAAACGCGAACATTTTGAAAGTATACTAAC
TAATGGTTGTATTTGAATAATTTTTTTTTCTGCCGACTTCCTTTTTAACG
GCGCCAAGTCTGTTGTATCAGTAGAATGAAACCATGCAAGCTCCTACATA
CTCTCTTTTTTATATACAAGCATACCTTTTATAAGCATACTTTGGCTCAA
ATTCGGTAAAAAATAAGCATAAATGCTAAGCATACCTTTTCTAAAACGCT
GACTTTTTTAGGGTTACTTTTAAAGCTATTTGAGCTTTCTTAGACCAAGT
CTACGCATATAAATAAGCATAAATTTAGGCTGAAAATGAAATTTTGCTAA
GCATATTGAGCCTCGACCCGATTTTTCCGTATGCTTATAAATAAAAAAGA
GTGTATTTTATTGCCTTCAATAGAGAGTTAGATAAAAAGAGATTTCCTTC
TCAACTCAAATTTGTTGTGTTTTATGGTTCCTTCTTAAGATTTAGTTTTT
CCATCTACCTTATTATCCAGTTATCATCTGTGTGGATTAAATTATCATAC
CCGAATTTATTTTTGCTTCCTTTGTTTATCTATAACCGATCTATTACATT
CCTTCTCCTTAATCCTTTTAATGATTTTTGAGGATTTCTGAAAGAATTTC
TTTGCAAGTTAAAAAGATTTTATTACAAAATATATTAAAAGAATGCTAAA
ACGTAAGTCTACGACCGCAAACGGAGGCCACCCGAAGGCTCCTCTTTCAA
TAGCCAAGGCGTGGGTGCCACCTTTTCTCACTGGATTGATCCCTTAACCC
TTTAAGTACCGCGGTCATTTTTTTCTAAGCTTTTTGAAGAAAATCGCTAG
TTCAAACTTTAAAGGCTTATATCTCCGGATCTAGAAGGACCTGCTGCGCA
GACCTGCCTGAATGATAGAAAGGTGCCCAGTAGTAAAACTTCAATTAATT
AGCTAGAGGACAGAATCAAGTAAAGCAGGGCTAATTTTGGAAGTTTTTGG
ATCACACGGGGGCGACGTTGAGAGGATACCGTTTAGTTTTGTTTATCCGT
GAGACCGATTGAACGCCTATATTTTCAATTAAACTTGCTCTTGGATTTCT
ACAAACTTATTTTAATATTTTATTAAGGGAAAGAGGGTGCAGCATATTGT
CTCAAAAGCAGAGTGATTTAGCCTGGAATTGTCGGAATTGTCACATCAAC
GGTTGCGTCTCTTTCTTGCTCTTCTTTGCTATGTATGGCCTCTCTTAACG
ATTTTAGTACTAGAGTGTATGAATGATGGAAAAGCTTAAACTGACTAAAG
ACAAGACTAAAAAAGATACAATTTTTATAGTTTGACTTGCTAATGCTTGA
GCTAAGTGCCTGAATTTTAAAATTGTCTCTGCCCCGATAAAAATAGAGTT
AAAAGTTCAAACACCGGTGAGTTATCAAAATCAAAGTCGGTTAAGTTTTA
TTTTATTCATAGTCATCCGGTAGATTTTAAAAACTCCACAGAGTCATTGG
GACCATGGGATGGATTGAGATGAGTTGGGTTACAAGGTGATCAATAATAT
GATAGTTATGTCTTAACTTTATGACGGTTGAAACAGAAAAAACAAATTAG
ATTAAATGTTTTTTATTTACATCTTCAGACTGGTATTCGTAATCAATCGC
AATCACAAAAACGTCGCATTCTCGATCTTGAAAACCAATTCGAAGATGCT
CGAGTACGAATCGATAAACTTTTACAACGAAAATCGATTCGTCGAAACAC
ATACGATTCGGTATCGAATTCTTCATCGTTCGTAACTCCTTCAGCTTCGT
TTACATCGGAACGATCTTCGCATTCATCAAAAATGAACATCGATAGAAGC
GATTCAATGGATTCGACGTCATCAACAGAATTACACAAAACTCAAATCAA
CATCAATCCAGCGAATAATACTAAACAAACTTTCGGTACTGTTACTCTTA
CAGTAAAAGTTGATGAAGATTAA Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000026_pilon:577298..586270- >XLOC_036850 ID=XLOC_036850|Name=XLOC_036850|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=1134bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000026_pilon:577298..586270- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon) ATGGCAGATAGTTGTAGTAATTCGTCTGTTGGCTCGCCGTACGCAAGTAG TACTGACCTTCGCGGTGAGGATAGTGAAGAAATTATGGAGCGTGGACGAC GCCGATCACGCAATCTTGGCTCCACAAGCAGCCGCAGAGCGGTCGGTGGA CTGGACCTAGAGGATGTCGAAAATACAGTTCGTGGAATGCAACAAGATTA TAATGACATGAAAACAGAATTTATGGCAGATAGTTGTAGTAATTCGTCTG TTGGCTCGCCGTACGCAAGTAGTACTGACCTTCGCGGTGAGGATAGTGAA GAAATTATGGAGCGTGGACGACGCCGATCACGCAATCTTGGCTCCACAAG CAGCCGCAGAGCGGTCGGTGGACTGGACCTAGAGGATGTCGAAAATACAG TTCGTGGAATGCAACAAGATTATAATGACATGAAAACAGAATTTACTGGT ATTCGTAATCAATCGCAATCACAAAAACGTCGCATTCTCGATCTTGAAAA CCAATTCGAAGATGCTCGAGTACGAATCGATAAACTTTTACAACGAAAAT CGATTCGTCGAAACACATACGATTCGGTATCGAATTCTTCATCGTTCGTA ACTCCTTCAGCTTCGTTTACATCGGAACGATCTTCGCATTCATCAAAAAT GAACATCGATAGAAGCGATTCAATGGATTCGACGTCATCAACAGAATTAC ACAAAACTCAAATCAACATCAATCCAGCGAATAATACTAAACAAACTTTC GGTACTGTTACTCTTACAGTAAAAGTTGATGAAGATTAAACTGGTATTCG TAATCAATCGCAATCACAAAAACGTCGCATTCTCGATCTTGAAAACCAAT TCGAAGATGCTCGAGTACGAATCGATAAACTTTTACAACGAAAATCGATT CGTCGAAACACATACGATTCGGTATCGAATTCTTCATCGTTCGTAACTCC TTCAGCTTCGTTTACATCGGAACGATCTTCGCATTCATCAAAAATGAACA TCGATAGAAGCGATTCAATGGATTCGACGTCATCAACAGAATTACACAAA ACTCAAATCAACATCAATCCAGCGAATAATACTAAACAAACTTTCGGTAC TGTTACTCTTACAGTAAAAGTTGATGAAGATTAA
Gene-mRNA-Prot
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Position
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
| sc0000026_pilon | genome | sc0000026_pilon:577298..586270 - |
Properties
| Property Name | Value |
| Aaloc | 223-567:346 |
| Aaloc | 1-222:8974 |
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