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Sequence
The following sequences are available for this feature:
mRNA from alignment at sc0000026_pilon:609792..614784- Legend: polypeptideCDS Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >XLOC_036849 ID=XLOC_036849|Name=XLOC_036849|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=4993bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000026_pilon:609792..614784- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
AAGAATACTATTAAATTAATTTCCTCTTCTCTTTCTAGATTAGAAATGAA
TAAACAAATTTTAACTTCGATAAACAGAATAGCAAACAGACAGATTTTTT
CAAAACATTCAGCAGCTAATTCATTGCAACAAACTAAGTTCACCTCAAGA
CACATACATCATCAATTCAAAAGGGGTAAAGTTTCATTGACAAGTTTCTA
TAATAAACGTAGTGGTCTAAAGAAACGACTATTCTTTTTTAGAATCAACC
TTACAATCTAGTTTTTATATTTATAAAAACTAGATTGCTGACGTGTGAAA
AGGAATGTCGGCGTGAATGATCCTTTTGTTTCGATAATAACATCAAAGCG
GGAACTAATTTTCTTCTCGTTCTTCTTTCCTTTTTCTTTCTCATAACTTC
AAGCTTTCCCTCAGGCTCTCGCAAGCGTGGTTAGCTCAAGTGGTTAGAGT
ATCTGTCTCGAAAGTATGGGTTTCCGAGTTCGATCCCTCTGGGTGTCATA
TTTTTCAATTCTTGAAATTTCTTATTTTAATTCTCTTTCTATTAAAATGA
AGGTCAATCAAACAAGTAACTAGCATATATTACGTCCGTTTTTTTTCTTC
AATCTTTTTTTTACCACAAGCTATTATTCAAGGCTGAGATATAGAAGAAC
GGGTATAGGCGTTTGCGCCTGCGTTTGGTGACTGACAGTTTCAGTTTCAG
TTTCACTGCTTTCACTTTCACTTTCACTTTCACTTTCAGCCAGCGAGTGA
GCGAGCATGATAATTGATTTCCGGGTCAAAATGTTTGACACTTGATCCAA
TCGTTTGCTTATCTTTCTTGCGTGGTCGTCATTTGAATTTCAGTATTCAG
TGCTTATAAAATACGGTTGTTATAAGGGTATCAAACTCCTCACTAAGAGG
GAACAGATCATAGATTCGAATTGAACGCGTAATTACTAATAGCAATTAAC
ATTACATAACGCGTCGATGTCTCTTCACTCCCATGAAATGTGATTCAAAA
TTAAAGTGATGAGCTCGAAAACAAAATCAAGAATTGGAAAATTTGACACC
CAGAGGGATCGAACTCGGAAACCCGTGCTTGTGAGACAAACAATTTAACC
ATTTGAGCTAACCACACTTGGGAGATTTTGAGGGAAAGCTTGAAGTTATG
AGAAAGAAAAAGGAAAGAAAGAAACGAGAAGAAAATTAGTTCCCGCTTTG
ATGTTATTATCGAAACAAAAGGATCAGTCACGCCGACATTCCTTTCCACA
CGTCAGCAATCTAGTTTTTATAAATATAAAACTAGATTGTAAGGTTGATT
CTAAAAAAGAATAGTCGTTTCTTTAGTCCACTACGTTAATATTACTTCTT
TCAGCTTCTTTCCTCCTTGATGCCATTTGCTATTGGCCCAAAATATTTGA
ATTTCAAAAATTGATATCATAAGAAATATAACTGATTTCTGTAGTTCTTT
TCATCCTTCTTTAGGATATGTCAATACGCAAGGAAATTCTAATGGATGGA
AAATTGAATGGTTCTACATCCCTGCTGGTGTAGGATTTGGTGTCATTGCG
TTGATTCAAATCAGACATATTTGGAGGAGGAAACAACATGAGAACGGAGT
TGTTGAAATTCCATATGAAGATAAAGCCGCTGCGTTTGTATTCAAACAGT
GGCAGGTATTGGAGCTTGCAATAATTAATAGGTTGTCTTAAATTGTTTTT
TTGTAGTTTTTTTTTAATTTATAGATTTCATAATAATTCATACATGGTGT
TAGGTACAAAAGGGTTACAGTACAAGAATTTAAAAACAGAAAATAAGTAA
TAGTCTGCAATTTTCTGCTCCATTATGATATGAGCTTCAATTGCAAAAAC
TTCAAAAAGAATCCAGGGGTCTTATTGAGGCCCTGTGAACGGCAAATTTC
GTTGGTTTCAAGGCACAAAAAATTGCATATTGCTGGTCTTAAAATTTGGT
TTGCCACTTGGGCTTACTACTAAGAATTTGCCAGCCTCGAATCTATTTGC
TGGTGTTAAACTTTTATTCCCAAAGTCTGTTCCTCTTTTGACAGGTTGAT
TTGCTGCGTAAGCTTCCCACAAGAGTGTTATCAAGAGCATGGGGTTACAT
GGCTGATTGTCATCTACCAGTCTGGATGAGAAAACCATTGATCAACTCTT
ACTCTTACATGTTTGATTGTAACCTTGGCGAGGCGATGCAAAGTGATGTT
ACAAAATATGAGACATTCAATAAGTTCTTCTCCAGGAATCTTAAGCCAGG
AATGAGAGTGGCTGACAAAAAAGCTGCAGTGGTATATTATGACTAATCTG
TCACCTTTTCTGAAAAATAATATTATGTTGCTCATACCATTAAAATCAGA
AAAACTTAAGAACAAACCAAAAATTGTCACGACCGCATATTTCAGAAATT
GCTATTTACTATTACTTTATATTTATTTCAGAAAACGCTAGCTTTTATTA
GCCAGGAAGTAAAAGAATAATTTTAACTTAAAGTAATTTTACTTTGACAA
TATGATATGAGATAAGTTAAATTCTCAGTAGCAACTTTAACTGATATTTA
TCTAAAGCCGTTATTCTAGCATCACTGACCAGATGGTTATTGCTTATTAA
TCTTTATTTTTACTTTACTTTTCCTCTAGGTATCACCTGCAGACAGCTCT
GTGTTAACTTTTGGTACAATGAACACTCCGACATTTGAGATTGGTCAAGT
CAAAGGATTAACATACCCTCTTTCTACATTCGTTGGATCTAGACATCCTT
TCAATAAAAATGTCACTTCTGCTTTTTCTGGTACCCTTTTCTTTCAATTC
CACCTTAACTTGGCATAATCTTCTCAAGAAAAGGGTCTATATTTTTCATT
CCTGTCTGTTTATGCTTGCTTTACACATAAGTATGTTCTTAAAATAATCT
TTGTCAGCACTGTCTATGCTAGGAAGAAAATGCCAAATCTAGTCCTGTAG
TCTATGATACAATGGAGTCTCTATAACTAGAACACGTACAGGGAACACCA
ATTTAATTGAGTTAAGGAAATTTCCGAGTCAAGGAGTAAGATTTATAAGG
CATTAACCGGAGGGACTAGAAACCTTGTTCGATTTAAGGTCACATTCGAT
TTATAGAGCTTTGAGTTAAAGAAACTTCACCGTATTTTTAATGATATTCC
TCTTTTTTTTTCCAGGAAAAAAGCAGATATTTTCACCGGGGACATGTACA
GTGGATGAAGATGAATACAAATTATGTTATTGTACATTGTATTTGGCACC
AGGAGATTACCATTGGTTTCATTCACCCACTGAATGGACCATTGAACATA
GGAGACACATCCCGGGTACTCTTCAGGCCTCTCAAAGAGGAAATTATTTG
CTGTACTTGTATAATAAGGACTTTATCTCTATAAACGATACATGATGACA
TCATTTGTTAGCAATCTTTTTCAAAGAAGTGTACTGAAGGGCCAAACGAA
TAGACCTTATTGGAGTTTTTAATTTTTCTAAAACAGCGCTGCATTGCGGA
ATTGCTTGGGTGTATTACAATAGAATTCCCTCGAGGAATTCCTAAGAGAT
TTCTATTGTAATGCCCCTGAAACAAACCCACAATGCATCGCTTTTTTAGA
AAAATCAACTGATAGGATATATTGGTTCGTTATTTTGGTTGAGCAATGAA
AATAGTGAACTAGCGTCGTTATTTTGAAATTACCGAAGGACACATGAAAT
AAAGGTTAATGAAAATAGTTTCACAACAATCAAAAATTTGTTATAACCTT
TCTTTTTTTGCTAGGTGACTTGTTTTCAGTCAATCCACGTGCATTGAAGT
CAATCAATGGTATTTTCAATTTCAACGAACGTGTTTTGTTATCAGGGCAT
TGGGAACATGGACCCTTTTTATATGCAGCAGTTGGTGCTTATAATGTGGG
ATCTATCAAACTTGATATTCCTATGGACAGGGTAGGGATAATTTCGTTCG
GATTCAGTTATTAAGTAGTTTTCAACTAGATCTTTTAGTCTTATTCCAGA
GATTTTTCAGATTTCAGATTACACCTACCTTTCCGAAAACTCTCTTAAAT
TCGAGCCTGCCTAAATGACAAAAAAATCAGTAGTGCTGCGGTTACAGCCA
GTTTGAAATAAAACAAAACAGAGCTCTGGTACATTGAAAGTGTTTCTTAT
GTCAGGTCAAAATATTTTTATAATTTTCATTTTATGCGAAAAATAGGTCT
TAATTTAAATGTTGAGCTCCATTTTATGCGAAAAATAGGTCTTAATTTGA
ATGTTAAGTCCCATTTTATGCGAAAAATAGGTCTTAATTTGAATGCTGAG
TTCCATTTTATGCGAAAAATAGGTCTTAATTTGAGTGTCGAGCAAACTTT
TGGAAAAATAGTCGTATACGTACATTGCCTTGAATTGGGTAATTTTCGTA
ACAAGGAAAGTTGTGGTAGCATAAAGAAATTTGCGAAAAATGTTCCATGA
TTTTTTTGCTGACCAGGTTTTGTTCTTGATTTTTATTTAAAACACTTAAG
GCCCATTCGCCAATTTTGGTGCAATTTGGTGGAGTTTATTTTGGCGATTT
AATAAAATTTTTAATATTTCGCGAGAATTAAATTTGGCTAACGATCCATT
TTTGTTCAATATTTTAGCTGAAAAAAGAGGAAAAAAAGGCTTTTGAGGAG
AAATAGAAACTAAATTGAAAGAAAATTAAATTTGGCGAGAATTTATTTTG
GCGAATGACCTATAACTTTATAATTATAATTGTTTGATTATTGGTTACCA
TTTTGATTTCAGGATTTACAAACTAATAAATCTGGTTCGATTGGACCTCA
CAAAGATCGTTTATACAGCACTGGGTACTTGTCCAAACGGGGTGATAGCA
TTGGAAATTTCTTACTTGGATCGTCCATAGTTTTGATATTCAGTGCACCT
AAGAACTTTCAATTTGCAGTTGAACCTGGACAGAAAGTCCAATATGGACA
AGCTTTAGGATATATCGTTGAAGACAAGGTAGCTGGTGGCTAA Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000026_pilon:609792..614784- >XLOC_036849 ID=XLOC_036849|Name=XLOC_036849|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=2604bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000026_pilon:609792..614784- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
AAGAATACTATTAAATTAATTTCCTCTTCTCTTTCTAGATTAGAAATGAA
TAAACAAATTTTAACTTCGATAAACAGAATAGCAAACAGACAGATTTTTT
CAAAACATTCAGCAGCTAATTCATTGCAACAAACTAAGTTCACCTCAAGA
CACATACATCATCAATTCAAAAGGGAAGAATACTATTAAATTAATTTCCT
CTTCTCTTTCTAGATTAGAAATGAATAAACAAATTTTAACTTCGATAAAC
AGAATAGCAAACAGACAGATTTTTTCAAAACATTCAGCAGCTAATTCATT
GCAACAAACTAAGTTCACCTCAAGACACATACATCATCAATTCAAAAGGG
GATATGTCAATACGCAAGGAAATTCTAATGGATGGAAAATTGAATGGTTC
TACATCCCTGCTGGTGTAGGATTTGGTGTCATTGCGTTGATTCAAATCAG
ACATATTTGGAGGAGGAAACAACATGAGAACGGAGTTGTTGAAATTCCAT
ATGAAGATAAAGCCGCTGCGTTTGTATTCAAACAGTGGCAGGATATGTCA
ATACGCAAGGAAATTCTAATGGATGGAAAATTGAATGGTTCTACATCCCT
GCTGGTGTAGGATTTGGTGTCATTGCGTTGATTCAAATCAGACATATTTG
GAGGAGGAAACAACATGAGAACGGAGTTGTTGAAATTCCATATGAAGATA
AAGCCGCTGCGTTTGTATTCAAACAGTGGCAGGTTGATTTGCTGCGTAAG
CTTCCCACAAGAGTGTTATCAAGAGCATGGGGTTACATGGCTGATTGTCA
TCTACCAGTCTGGATGAGAAAACCATTGATCAACTCTTACTCTTACATGT
TTGATTGTAACCTTGGCGAGGCGATGCAAAGTGATGTTACAAAATATGAG
ACATTCAATAAGTTCTTCTCCAGGAATCTTAAGCCAGGAATGAGAGTGGC
TGACAAAAAAGCTGCAGTGGTTGATTTGCTGCGTAAGCTTCCCACAAGAG
TGTTATCAAGAGCATGGGGTTACATGGCTGATTGTCATCTACCAGTCTGG
ATGAGAAAACCATTGATCAACTCTTACTCTTACATGTTTGATTGTAACCT
TGGCGAGGCGATGCAAAGTGATGTTACAAAATATGAGACATTCAATAAGT
TCTTCTCCAGGAATCTTAAGCCAGGAATGAGAGTGGCTGACAAAAAAGCT
GCAGTGGTATCACCTGCAGACAGCTCTGTGTTAACTTTTGGTACAATGAA
CACTCCGACATTTGAGATTGGTCAAGTCAAAGGATTAACATACCCTCTTT
CTACATTCGTTGGATCTAGACATCCTTTCAATAAAAATGTCACTTCTGCT
TTTTCTGGTATCACCTGCAGACAGCTCTGTGTTAACTTTTGGTACAATGA
ACACTCCGACATTTGAGATTGGTCAAGTCAAAGGATTAACATACCCTCTT
TCTACATTCGTTGGATCTAGACATCCTTTCAATAAAAATGTCACTTCTGC
TTTTTCTGGAAAAAAGCAGATATTTTCACCGGGGACATGTACAGTGGATG
AAGATGAATACAAATTATGTTATTGTACATTGTATTTGGCACCAGGAGAT
TACCATTGGTTTCATTCACCCACTGAATGGACCATTGAACATAGGAGACA
CATCCCGGGAAAAAAGCAGATATTTTCACCGGGGACATGTACAGTGGATG
AAGATGAATACAAATTATGTTATTGTACATTGTATTTGGCACCAGGAGAT
TACCATTGGTTTCATTCACCCACTGAATGGACCATTGAACATAGGAGACA
CATCCCGGGTGACTTGTTTTCAGTCAATCCACGTGCATTGAAGTCAATCA
ATGGTATTTTCAATTTCAACGAACGTGTTTTGTTATCAGGGCATTGGGAA
CATGGACCCTTTTTATATGCAGCAGTTGGTGCTTATAATGTGGGATCTAT
CAAACTTGATATTCCTATGGACAGGGTGACTTGTTTTCAGTCAATCCACG
TGCATTGAAGTCAATCAATGGTATTTTCAATTTCAACGAACGTGTTTTGT
TATCAGGGCATTGGGAACATGGACCCTTTTTATATGCAGCAGTTGGTGCT
TATAATGTGGGATCTATCAAACTTGATATTCCTATGGACAGGGATTTACA
AACTAATAAATCTGGTTCGATTGGACCTCACAAAGATCGTTTATACAGCA
CTGGGTACTTGTCCAAACGGGGTGATAGCATTGGAAATTTCTTACTTGGA
TCGTCCATAGTTTTGATATTCAGTGCACCTAAGAACTTTCAATTTGCAGT
TGAACCTGGACAGAAAGTCCAATATGGACAAGCTTTAGGATATATCGTTG
AAGACAAGGTAGCTGGTGGCTAAGATTTACAAACTAATAAATCTGGTTCG
ATTGGACCTCACAAAGATCGTTTATACAGCACTGGGTACTTGTCCAAACG
GGGTGATAGCATTGGAAATTTCTTACTTGGATCGTCCATAGTTTTGATAT
TCAGTGCACCTAAGAACTTTCAATTTGCAGTTGAACCTGGACAGAAAGTC
CAATATGGACAAGCTTTAGGATATATCGTTGAAGACAAGGTAGCTGGTGG
CTAA
Gene-mRNA-Prot
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Position
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
|---|
| sc0000026_pilon | genome | sc0000026_pilon:609792..614784 - |
Properties
| Property Name | Value |
|---|
| Aaloc | 1087-1317:232 |
| Aaloc | 922-1086:1228 |
| Aaloc | 772-918:1827 |
| Aaloc | 619-768:2365 |
| Aaloc | 382-618:2950 |
| Aaloc | 193-381:3528 |
| Aaloc | 16-189:4994 |
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