XLOC_036828 (mRNA) -

Overview
NameXLOC_036828
Unique NameXLOC_036828
TypemRNA
OrganismClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon (Jellyfish)

Sequence
The following sequences are available for this feature:

mRNA from alignment at sc0000107_pilon:52299..69016+

Legend: polypeptideCDS
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>XLOC_036828 ID=XLOC_036828|Name=XLOC_036828|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=16718bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000107_pilon:52299..69016+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ATGAATATGGATTCAGAAGTTTTGATTTTGCTGGTTGTTGGCTGCTCACT TTTGATTGGAAACTCACATGGTaagattttcctaaaaatttctGTCTGCG GTGTCACCATTCACGAGAGTTGCAGTAATTACTGTTGCAGTTTTGGCTTC TTGCAGGTGCAGCTTAAAGCTATCCCACCCCCAGAGGCAATATATACTTT TTGATGATGTGTTGTAGCTATGCCCCTGAaccttaaaactattttttgtg ttgttaaaattatgtttaaattttccttctttgtctttattttataaaat ttcccTGGTTTCACTAAGTTTAATTACGTGAAAGTGGAGTAAATTTGCAA GAGCAGGATTTCCAaaatttgatggctatgcaagtttccgtccactgatg caagtttatATCCCACTTCACAGTATATAAGCTTTTAGATTTTCTTGTAT ATTTCAAATTTgtgtatttattttcaatacaTCATTATCACCAAATTCAA AAGATCCCAAGCAAAGCTCCTAAAATCAGggtctatttttcttttattta atttttaaaggctGCCAGAAACTAAAACTGAGTGTGGATATTCACAACAA TTAAACTCtgctaattttgttttttttgttggttGGTTGGTCAGTTTGAG GGGTATCTACTCTAATCCTTACATTTTCCTTCTTTCctttcatttttgtt tgatatcaTGATATAAATCTTTCAGGTGTTTTCCCGTGTTTCCAAAGAGG GTTTATCACATTTTTCTAGAAACTTTAATTTTCCAGAGTGTGCAGCCTTT tagcgtattaaaaaatactataTACTGAAGATATGTTagtatttttttgc ttgcaaGTTGTTACATGTTGTTGGGAATTGATAGtcaatttgaaagtttt ggcTGTTTCCTGAAAACACTTTAGTGTAAAGACTTTTGATTTGATGGGAT CAAAATTTTTCTACCCTTTTGTTTGATGGGTATTTTTCGTaggatttttg ttaaaaatgtagtaaaaaaagttaagaagagtGTAAATGGCAGTCAAggc tttttttatgaaattttcattcaCAGTTCACCTGTACATAATCTCtgtta aatttttgaattgtaaATAAAGTCTTGCTGTCTATATACTGTTTCTTGtg tttaataactttttttgtcgttttataTTTGTAAAAGTCAAACCACATTA GAAGTATATATTTCACCTATGAAGCTGTGCTTTTTATGTATTATTCATGA GCTATACTTGAAAATAATAGAACTGTGTTAACTCACTGTGAGAAACTGtg cctttaaaatatttttttgataaaataaaaggTAAAGATGATATATTTCA ATGAACAGTTCAAAACTTTCACGAAGTCATAAGGCCTATTTTGTTGTGTC TTTAGCTCTCCCTAAATATGTTTAACACTAAGTCAATTATATCTTTTCTT TAGATTGATCTTactttaaagtgaattttgagacCATTCCCAAATTCTCT TTCCAGTaatattttgatagaaaaacCAAAAGTGTGAATTCATCAGGTTT CTGTAAATGAAAACTAGAAGCCCCAAAACCCACACATTTGAAATCCAATA TCCTTACATTCTTTTTGATCTTACTATTCCTGATAAGcttattctttaaa aaactttgtgTGGTTTTTGGAATTTACTTTTATAATCTCTATGTTTTTAA ATCATAGAAAGTGTCATAAAAAGATAAGACAGTGGAAATGAGATTTTTAT CATTAAAAGATTTCTTGAGATTTCTAGtttttttATGATTAACATTTATA TGTCAGTTTAACTGATTCTACATTTTGATGATgtttttacttttaataat cTCACAGGAATAATTGTCCctcaaaaaatatcatcaatcaTAAAGACATT ATTTTGAAGAGTACCCTTCTTGTTTATATACCCATTACAAATTTAAAATC CCTTTTGCACCAAAAATTCCAATCTTTGatacattttaaaaatgttaatt ttcaaaaccaaatGTAGGAGAGGGAGCTAAATTGATCTATTAACATGTCA CTTTTTTAAAGTTACCAGGAAAGTAATTTGCACAATCTTTACCAGCATAA GATTTCAAAAAGGTCTCAACAATCCTTGAAACTGACAAATCTGACAAACC ACTTAACCTTGAAACTGAATAACTCTATTGTTAATTCTTTTTGGAATTGC TGTTAACTGAGCAATGAAAATCTGTTCGAATATGTTAATTTTCAGGCCTC TCAAGTGCTTCTATATTTAGGATTTAGgattgtctttttttttgcaaaaa taaatatatataagTTTTGTGTTTATGTGACATTTGATAAACTTGAAAct gccaaaattagttttaaaggtGGTAGAGATATTCATAACTATTATCAACA GGGTGTCTCATCTCAGTCTATATTATAATAAATTTGAGTACTGTAAGTTG TTTTCTGATAGCATTTCAATAAATTGCAATTCTACCCTTTATTTAGCACT TCATTtagttttcattgtttcaaaaatacattaaaattgTATCACTTTAT TACCATAGTAGAAATTATTGAGACTCAAATTACATCTGGAaatttccaaa ttattttttccattaTGTATAATAGTTTGGAATGACTTTAAAGTAATGTT AAAACCATAGTATTAGGTCATTTTTCGATAGTAATTTGAATCTAAAAATG TTCAATTAGCATGTCGATTCAAAATGCATAAATTTAATTGAGATACTTTT ATCACCCAAATTAGTCAAGTGGTTGTATCTATTTTTAACTCAAAATATTA TCTTTATTGCCCATCAcatagttcgcaccccccccctttatgaagggggg gggggtaacgatgttcagaaaatctcagaaagggggggggtaagaatttt ttctagaaaggggAGTTTCACAAggggggggttcatctagaaaggggggg tagatgtcagtggtatgttttttttgtgttttcccaaattagaagtttta tttttaatttacaatgcaacgtcttctttattaattgtttagtatgtttg aaacattcgattcaaaatgattctatttttttcgcaatgcagtgtgttct attttcttgctttttcaccGGTAGAATTAtggtaggattttaaaattttg aggggggtagcatcaaattttaaaagggggaagaacctagggtagggggg gtagctctagggtaggggggtagtgacccccttccgaactGGGCGCATCA AAAACACTTTCTCCTTAAACCAGTTATAAATGTAGTTGTTTTATCACAAA TTTGTGTTTACTTTGTATCCTAGAGTGGTATGTTGCTATCATACACTCCT TATTGAATTGTATCtcttaaattgtgaaaaaaagacCTAGACACAGTGAG CGTATACAATTCAGCttttgatacacgtttttttaataagaacattaaaa aattttgaagcctacagaatgatgttcttataactttttggatttcaagc ctaaaaatgttcttaacatgttcttattttccccactttttatctttttt tgtccattttcctaataaattggctgttttccagtctgcgaagccttaaa atgttcttacttaacttgttctttaacattttggccatcgaagccttatg ttcttatatagtttattcttattaaaaaaaagtgtattcaaATACTGCTA GTAAtggatttcaaaaattattttttggaacTGTATCATTCTATTTACAA GTTTCATTTCATTTAGTGACGAAATCCATGGTCTATTTTTAGCCCATAGT GGTGTACTCTACTCTGTGTGCTTCCAATTTCTTGTTTTTGCACTTTGCAA TTTCCTGtcattttgtgtttgttttgataaccATCACTTTCACACCGTTA TTCCCTTTCTGTTCATACAAATTAATGCAACACTGTTTCCTTTCAAGTCT taacatgattttttttaagtGTTTGCATTGCAGAGTTGACTCCCTATATT AATCTTCTATTTGGGAATGAATCGATTTACATTGAAAGTACAAAGGATTG ACatcaaatcatttaaaaaaaaatcatttgtttttacAAGTCACTTTGTA TAATTTCCCTCTATGGTTTTCTTACATACATTGACAAACATTGACaggat tttttctgttttgtcaaTTTCTTCGAACCTCTACAGTTCTTTTTGAGCAG AATTGCTTCTTATGGGGATCGTTTGTAAAAGTGTTTTTATCCGACAGTGC CTTTTTCTAATACCCTGAGAATTTTACCAGGGCCGACCAAATCAAGCATT taactacaatcagtgacaagtAAGGAGTTGATACATTGATACTAGAGGGT TAAGGGAATTCTTGCCACAATATTTAGTCACAGATTGTAGATATTTATAT CCTATAAAAACTTTGAATCTCCTCTGCTgcttgtctttttttattttgct catCAAAGTTGATCTATGAAATTTATCACCGTAAAGAATCTAAATCTTTT GACACTAATACGCCAtttttttCTGATTCATTTTACGAGGGAATTATAAA TAAAATCGATGGATGTATAAGTATTATGTTGATAAGATTTTTATCAGCGA TCATAATTatgaaaaagcaaagaaaaatatacaTTCTATAAAAACATCAA GTTAttcgttttgattttgatcttGATTAATCATTTATATGGTTcagttt gaaaatgttattttttcttttctgaagcaatttcaaattattgGCAATAT TATGCCCCCCTtccaaaaattactttttgttCATCATAAAGGCCTAAACT TCCCTTTCAGTTATTCAATGAAGTTTTGGTGCACTTGCTTACATGAAAAC ACACAATTAGCGGATTAAAAAGGGGGATCTTGACATGAATCATTAATAAC TCCAAACTGTTTTGTTTGCTTTTATTTCGCAAAAATCATTGTTATTATTT ACCCTTTTAAAACCCAACCGAAAAATAAACCTACGATGGAGTACACTTTC CACATATTTGAAGCACTTAAAACCGTTTAAAACACTCCTACTTTGGGGGA ATTTATTGACTGTCAGATTAGACAGTTAGATCAATTTGAAATCCTCTTTT ATGATATTTACTTTCCTTCGACCTGTAGAAAGCCTTTGAAATAAGTTAGA AGGAAAGAAGCTCAATGTTTATATAACGTTGGTTAGTTCTAACCTAAGAT ATTCAAGCTATACTTCAGgagaaaatgaaggaaaaattttcccttGACAA GGCTTATCCTTAGCCAATCGAATTAAGGTCATCTTACCAAACAATATTAT CCTACCTTTTTTAACAACGTGGCCGGTACACCGTGTCGATTTGATGTCCA TTTAACGTCCATGTATAACGTTTGATGGACGTTGCAACAATGTCgtttac caaattttacaagatAACAAAATCCTGTTGAAAGATGCTTCAGGAATCGA CTTTGAAGGAGACTTAGATGTGTGATATCGCTGCCATAGAGACTAAAGGT CCAATATCAAGATTAGTGTCGAGAAAACTTAGACTTTTTTGCTTTCCTTA ATTAAAATTCTCAGATTGGCCTTTTTTCCTATCTACAAGAGaaaaaaaGG GGaattaaactcaaaattttaatttagcatagtaaaaaaacttattttga gatttgaTCTTTTGCCACAATGGCAGCGATATGTGGACATAGCTTACGGA ACCTGATGGTTACCCAAAAGAACCTCTTTATGGCAATTTGGGCACACTAA TATCATGAGGGAGCTTAATAATACGCTGATGATAATGATGGAGAGCAATT AAAATGAATCTTCAAAGGAAGATTAACTCAATTGGACCAAATCTGTTTAA ATCATCTCTACCATTTCAAACAGTTTCAAATAGTTTTGTTGTGTGAAACC TAAGAAAATCggttgttttagagtccacaaagccttgaaatgttcttagc ttgctcttgatattttgctgtttttataTAGTTCATTCTTATAAGAATCG TATAGAATGTCAGAAGTATTTTAACCTCGTTTAAACGTTTAAGGAACCCT TGTTTAAAATTTGGGAACGGAATCATCTTCGAAATGAGAGAGATTCTTAT CTTAGCTTGAATTCGAACGAGACGGttgttttgttcaaaagtgACAAACA ACTTTCGGGCTTACGTAAATTGACCTCAAAAATGTTAACAAGATGATTTT GCAGTGATTGCAACAGACTCTGTAGTAGTATACCAACATGAAGTCTTTTt gtgaacaaaatattttcattaactttttttttgtaacatTTCTTTAATTG GGTTAGACCTGTGTGAAATCGCATCATTGTCTCTTTTCAAACATCGTAAT CAATGAAAAGTTTGTAACGAGTCCAACTTACTACTTTATCCAAATTAAGG CAATTAGGCCAATGACGGGGTCTGGaaaattaaatgtttcttaaaCTTAA GAttcactttttccaaaaaaaaacaactcaaaataCTAACAGGAATTTTA ATTTCACCTCAAGCTTTCAAAAAAGGaaaggtttttctttaaaatcagTG ACAGGGCTGTAAAGTAAATTTTAACCCACGCTAATGTCATCTTTACTTAA ATTTTTGGTTTAAAAGAAAGTAGTATATAgtatatagaatttaaaataaa tactTTGAAGGTCATCACGTATGTTTGGCTTGTTATCATTCATGACGTTa cttcttttgacgtcaatcgatgcaattggactttttcctccTGATCTTTT TCCTCctgatatttttgccaattatCAATGCTCCCCTTGATTAATATAGA TGTTTAAACCTATTGTATTCTATACCTCAGAAATGAATAGTCAATAGATT TTAATCAATTTGTAGTATCCTTAAAGAAGTTTTCTATTTAGAGATCTTTT ATAATCCGTGTATGACATCGTATGATAAACAAAAGCTAATTAATTAGCTA TTGCCATTCTTGAAAAGATCTCATGATCTTTATTCTGTGCTTTTTCACAC GGGAACTATTCTCGGGGAGATATTTTCTCATAATTGCTGGCTCTTTAATT TGATATTTTCTATTCTGTCGGCCGTATTGTAGTAAAAGCCACTATTTAGA AGACACCTGAAGTCTGAATCTTTGTTGATGGTGTATCGACAAGACCGGCA TTGTAAATCGATTCTAAAGAGGTTTCTCTTCACAACTTCAAAGCTTAGAA ACGGAGAGGCCTTATACCGAACCTAATATAGttcatttttttaatattga ttACTGGGTGGCTTTCAAATGTCTCTCATTCACACAATAACATCAGTATA AGAAGAAGCCATCAGTAACAAAGCCTCTGTACTCTGTACTAATAGTTCAC CTTTTACCCAGAATCCTCTTGATCAGTTCAGGCCAGGCCACCGGTAACAA AGCCTCTGTACTCTGTACCTTTTACCCAGCATCCTCTTGAAGAAACACTT ATCACGCGAACAACCGATAAAAACAGCGTGCGTGTTGCGTGTAGGACTTT TTTGACGACGAAACTCTCATATTAAAGATTTGTTGTGATTTTCAGAAATC TTTTCTCCCATACCACAGTTATTATAACGTTTtatcttttgatacttttt attaAACTCTTAAATTCGAGAGCCCGTCATCACGCGAATATTCAATAACA ATTTTTCTCAATAAGACTTCGTGGTTTTGACGCTTAAGTTCAAATTTACA GAAACCTAGAACTTGGAAGCAAACTAAAGCACGATTCTAGTCAAAAACCT TCGAAATTTAGAACTGCTCtgtaattaatgatattcatgacgtgatgttt tctatggaaacaccccggtttttgccagtagtggcaaattttatataCAA CTTTTTGCCATTGAATATTAGTATTgagtatttccgtagaaaacattaca gtacgtcatgaatatcatgaataagaatAAGTTTGAGGTTTTACTACCGA TCTCTGAAAATCTCCAAGAAGTAGCATAGAGCGCAGGAAGGAAATTAAAA GTGCAATTCCTTTGACGGCctctattttgtattttcgcTAACAAATAACG GGGAGGAGTAGTAATACCGGAAAACTAATTACCGTTGATACTCTATACCA TCatcattttaattatttttcaactaaTTATAATGATGCGTTTCGAGCCA AGCCAGTAATTTTGATGGAATGCTAAACATTCGGGCTGGGAATTAAATGC AAAACTCGAATTTACGAAATGTTTCAATATGTTGCTATTAACAGTATTCG GTGTTAAGGAAACAGAATCCCATTGCAACAGCCAAAGTCTCACTAAGAAT ATCGTCATTTTTAACAGTTTCCTCACTTGCTCTTCAAGTAGATAGAAGGT CTAATATACACTTCTTTACTGGCCTGTCCCATTAGGGGAGATCTCGAACA CAACAAAGGGAGTCagagaaaaatgtattttaaaagACGGTGGTTAAATT TCCCCAGCGTATTATCCTTGACTGTTGTCAAAAGACTGCAACTTCAAAAC GTGAATGAGTCGTTATGACATTTTTATCTCGGTTCTTTCTCCCTAATTCT CAAGAATTTGACTTGGTAATGCACCATGACTAGAATTCATTTCCGTTTTC GCCACCACTTTCCCGCTGTGTTACACTTAACGTCTCAATCATCGTTCTGT CAATTTTGGCTAATCCCTTGTTCGAGGGATGATTAGTGTCTGTCTGTATC TATGTACCGCCTCTAAATAGTCCTCTTCCATTGATTAATGATATTCTAAG ATCtgtcatacacgtttttttatatAaacatttttcttacctttttgagt tttatgccTAGAAATATATTCTTAACATGTTCTTATTTTCCATATTTTGT GTgtatttttgacctttttctaGGAAATGGTATTTAGATTCTTTAGCTTA CAATGTCTTAACTTGTtttattttggctatcgaagtcTTATGTCTTATAC AACttgtcttataaaaaaaacgtgcatgaCAAATTCTTGAATTAAAATCA ATGTTTTGCAGAATATTCACTACCCCTCCCACTGAAAGTCCTCTTTCcac tagcctatactagacgtcacggctttttCTACACAGTAacgggatgaaaa atcccggtttttggtgaggtgctcgctatctTTCCACCTTTGGCTTCTTT CTTTTGAATCCAGTGTACAGTGGGGAGTAAGTAAGATAATCTAAATCTTT TTAACGATTATCTTCCTTCATCCTTTACAATAAAGGATTACCGGCAATAT CTCTTGCCTTTTAAATCATTGGCCTCTAGGCTTCTGGCATCCACCAACGG ACTCGTGCTCGTTATAGATATACTTATACTACTATACTACTTGCGGTTTT GTAGAAGTCTTCAGACTATCGGCCCTCATAATACTGCGATTGACTATAAC AATTACCAAGGGATTAAAATGGTGTTATGAATCTACCCCATAAGTTTACT CGTGTATAATTTTGATATAGGCAAGCGATAGTCCTGAATACTTCCTCATG ATGACAACTCGTCTACGAGACGCCTTTACCTCCATCGATTCATTCATCAA ATCGTTCACAGTCATACGAAGTAGAATATTAAAAAGAACCGCCCAACTCC TCCTATCCCGCCTCTTTTTGTAATACTTTGTAATACTGTATTGTATATTT CACAGTTATAAGATGTTATGAGATGTTTGATTTTATATTTCCTTGTCTAA CAAATGTGTTTTTAATTATGACTATTTTTTGTCGCCAATAAATTATTACG GCGAATACAGAACGAGAAATATTCCACCCGATACCATGGCATCTGTTTTC GTGATTGCGACCAAGttttttagttgctttttcgttttttaaatttttcc ttGCAAAAAGACTCGTAATTACATGGAAAGAAGGCTTTTCTAGAAAGAAA CAATCACCCAGCATTTTGAGGAGGTCATATTTTCCGTCCAGGGAGGTCCA AAAATCCAGGGCAGTTAGTGAGTTTCTTGAAAAATCCAAGGCACCTATTC AAAATAGGTAGAAATTCAGGAAAATCTCTGAACTTTAAACAAAAATGCAA GTGGATGcctaaaatattgcaaaaaaggTGGGACCTTCCATAAAATGACC TCATCAAAGGAGTTAGTTTTTTGTAATAGGACATTATGGAATGTGTAGCT CTTGTCGTTTCAACACAGAACCGTTACCTTAAAAAATGAGGCTTATAATA GCAATTATATGTGAAAGACACGCCTCCTACAAAACTGTTCTCTATTCATT ATACAGACGTTTGTACTGTTTCATTATTTCACGCGCGCGTGTCATTGTAG ATTGATAATGATCCACTTTGTTGTGTGCCAGGGGGTAAGGTCAGTTCACG TGTATCTTTATTGATGCGTCTCTGAACGGAGGCTTTTCTGCCTCCAAATC AATGAAATTCTACAAAAGTTGCATAATCTTGCTTAATTTATTTAAGTTTA AATAAAAGTTCATTTCCACCTGAGACAAAAAGCTTTTCTTTGGCCGCCGT TAATTTTGCTTTTTCAGCAACTAAAAGAAGGCGCGCCTCCTTTCTACATC atatgaaaatattaatttttcaaagaatatgcATTTCATCCACATCTTCT TATTTTCTTTGTACAGGAAAACTTACACTGAACTACTGGCCGAAAGGAGA ATCTTACAACACCGTCTTCGTTAGTGGACAAACTCTCCTCAGATGCGACG TGGATTCAGACCGCTCCTTTCAACTCAAATGGTATAAAGATGGAAAAGAA TTGGACTTTAGCACCATCAAGTTCCCTTTGTGGGGTTTCAAGTAAGTATA CCAACCATTtataaggccggtctccactttcttaactttttttgtctgaa gaaaagattacgtcatgataAAGCTTCgcgtgaacaaaaaaaaagttgaa agaagttctacttttttcatccgttacgtcaatttcgaccaatggaattg cttcatttttcaaccgaccaatgaccttacaaaaacgtcaaaaggtTTTC GCTCATTTCGCGTGAGTGGAGACCGACCTTTAGCTCGAAtctaaataagt ttgagttcgacccagtgatattcatattggaagtttatagTGTCTTGGAC CACTTtattagctctagtttagacggcgcTCTTTTCGCCCTATCAAttct aattttaaattaaaGCGTGCGAAAAGTTAGCTGTCTAACGTCAATGCAAT ACCCTCCTTTGATGTCAATGCGATgacttttcaatctttttcaagcaagg ATTTTTAGCTGCCAATTTTCGTCTCactttttgcctactctaacaattag aaagTCGGTCGTCGAAACTAGAGCTTATCTTTAATATAGTGACTAGAACT ATGCAATGAGATCGCGGTCAGAGACTCCTAACGTCCGACTTAGCATTAAG GACATGACAAAATCAACCATATAAAAACTTGATTTCAGATTGACATCTTT TGTCAGGTCTTTAGGATAGACTATTTTGAAAATGGACCTTTACTCAAATC TCTTTGTTTATGCTTATTTATTGCCCAACAGTCAAACTTTCTTACACAAG AAAAAACTCATTATATGTACAATGTCAactgaaaatcttcaatttcgATT GCTTTTCATTCTAATCAGATTCAAAGATGGTTCAGGAGGCACGCTATGGC AATGGCCGTACCACAAAGATTTCTTGAAAGATCCAGCAGTCTTTGAATGC AGGGCGACCAATGGCGTTGATCCGCCCGTCAGCAAGAAAGTCAAATTTAC TCCCTTAGATGGTAAGCAATTACTCTTTGATACTTTTCGAAGAGCGTCTT TGCAGCACACTACGCTCATCTTCCGTAGTCAATGTCACTCCTTAGCCCCT TTCCTGATATCTCTGAAAAAGAGGTCCTCCAGCTTTTCCTGCTTTTCTTG CAGAGCAACACAAAAAACCTTTATATTTGGTACTCAAGTCCATTATCATT AAATGAATATGAAATATAAATCTTGTTAGGTTTTGGTGGTTCTTGCtgta cttttgaattttatgtGATTACGTATTTCTAATTATTTCTTCATCTTGGG CGAAAGATCCGCTCCCTAAAATGTATTTACAATACAAGTTACCGGACTTC tccatttgaaattttatatttcttgtttttttcttttcagctcATAAATT GCCAGCAGATTATCCCAAGAAAGTAGACAATGCAAAGCAAGAGAAATATC CTGAGAAAGTTTTCTACGGCTCAAACCTCACCTTCTATTGCGATGCGAAG GGAGGGACGAATCTCGATTACCAATGGTTTTACAATCGCCTTCCGTTAGG CAAGATTGATGCCAAACGAAGTCGAGCGGTCCGCTTGGATTACAAATTGA GCGCCGATCGTCGAATCTTGAACATCTTTAATATTCAGGTAATGCATTGA TTTTAACTTTATTCGTCCACAGGGTTGTTTCAAAACCTTACCAataatct tcaattttttgctgagtttgctaaatgttttttttagaaaggAAGACCTG TACTGACACAAGCTATCACAAGCAAAGCCTTTTAGACTTACTTCTCGGTT TAAGAAATACCCTCGGTCTAACAGTCTAAgcccatgttcgcacgtgacgg ttccgtttcgctccgaaatgaaatgaagccattctattggttacattcaa gtgttacgtcacttctaacaaatagaatggcttcattccgtttcggagcg aaacgggaccgtcacgtgtgaacatggtctaacaGTTAGGGGATCGGATA ATACCcgatgatatatttttttatttaccaTCTTTAACAGGAAACACCTC AACAAGAAGCGATTAACTTTCAATGTATGGTCTCCAACAACGTTGGTTTA TTGAATGCTCTGATGTTCAGTGTTGCCACAATGCCCAAACCAAGTACGTT TCATAAAGCATTTAGTACCTACTTTCAGCTTACAGATAGTGCTTTTCTAG CTGTTGTTGCTTTTTGTCAATCTATTCAGTATTTTTATGGCAAGCTGAGT TTTTTCTTGGCCATTTATGCTAAGGAGGATCATTTTCCCTCTGATGTGAC ATAATAAAAAGCCTCAATGTTAAAGTATTTGTGTATAATGACTACTATCA ACTTCTCAGAATACTTCTTGGTTTACCTGGTTCGTTTCTCCTTTCTTCCA GCTCCTGCCATCCCACCAATGGTTCCTCGCCTGACGGTCCGACCCCAAAA CGTGTCTGTAGGTGGACCAGAACAATGGGTTGAGTTTGATTGCGCGGCTG TCGGCCACCCAACACCATTATATTGGTGGTACCATGATGGTCTGGTGGTG CAAGCTGGTGCCGAAACTGGAAAGGTACTGATTTACTTTCTTCCTTTGAC GTTTGTGAGGTTGGAACCCAGTTTTCCAGTCCATCACGGTTCCATTCTGT TCCGAAACCAAATGGAGCAATCCTATTGGATAGAAATGACATAATCTTGA TCGCTCGTATTATTTGACTCCTTTTCGTGACCTAATGTTCTTTGATTCTT CGGTAAAACGATGCGTCATTTAGCTGTCTTCTACACCTATCATCTTTAAA CAACAATAAAGTTACATGGAAGAGCAGGGAAGAGAAAGGTTGATGACACT CAACAGATTTTCCCATAAAATATAATTCTCTTTGATTTTAGGTATCGGTT GTAGCCATGCGTTCAGGAAGTATTATGTGTCACCCTTGGAACAAATATGG TTCAACCAACGCTACTGCTTACCTCACTGTTACTCGTAAGTAGACCGGTC TCCTTGTGACATTTTTGCAAGATACCATATCATTGGCCTATTGAAATAAC CTAAGCTTAGTAATATATTTTCCTTTTGActtgtttacatttttagttTC CTTTGTGCTCTCTTTTAGGTTCCATAATTTAATGAAGTTATTACCCATTT TGAACATCGACGTAGTttccaaattctttttgtttttctccattGAAGCT TTACCATACAGACCAAACCCTATCAAGATCGCCGGAACCAGTGTCAAACA CATCACTATCGAAATCACACCCAATTACCGGGAAGCGGAATGGCATCCGG ACATCCCCGTTAACGAGATCATTATTCAACACCGGCCGTATGTTTTTAAC CAGCCTGTTGAAACCGCCTTCAATGTTACCAAATTCAAAACGGGCGGAAA ACCTGCCCCTTGGAGATATACTTTTGACGGTTTGGAACCATGGATTTATA TCGATTTCCGAGTGAAGTTGGTTAATAAATATGGCGTTTCAAATGTGTCA GAATGGTATCATGGACAAACCGATTGGGGAGGTAAAGATCCCTTTTTCTT ACCCCTTGAGATTCAATAACATCTTAACACTTTGTCATTTAACTTTTTTG CGGCGATATCTTCACGTTTCTTTAAATATGGATTCTTTGAATAATTATCT ATGTTCTCAATGCCCCTTTTCATTTTATAAGACTTTACGCTGTGACTTTT TCCATATCTTTTTTATTCTCATCCTGCTTTTTACTCACTATACACTGTTT CTAGTTCTACCAAccaattttacaaattttctttaaaatctaTTTACTGA CAAATTATTATCTTCTTATCCAGCTATCACAGAGCCTGTTCGTAATTTGA AGGCGACACCACTGTCTCCAAAATCATTCAGAGTACAATGGGAGGATCCC CCAAAAACCAATGGACCCTTGACcaggtatttatttttttcccatGTTAT TATAAAGTATTCTGCTAACAATTTccacaaaggaaattttcacaACGGTT TCACGTAATTTCTTTAAGTAACAGCACGATGaagttttaaattcaaaaag tatgATTGCCCGTCTTCTTCCTCTTGAATTTCTGTGTACCTTTTCACCGG GGTGAACGGATGAAGCAAATCTACAGTAGCTGTACATTAGCTCAAATTTT ACATTCGTCTCTTCTCTTTTCATACtaaaagtttcaagaaaattgagatt gtaataatttttttgaaacacggGGTAAATATTTTGTGCTTTTCCAGATA CGAATTCTACTACACAACACGACCCAACGCCGACATCAAAAATTGGATCA TGCACGGTGTAGACCCTACAGACCAACATTATGCGGTAAACTGGACGGAC AACCCACGGTATACGGAAGTCGCCCCTGTCTTATACTGGAAAGTGCGATT GGTGGGTTTCGTGAATGAAGGACCTTTCTCTGAAACGAAAGCATTCAAAT GTCTCCCAGGAGGTAAACACTGATGAACTCAACAACTcaggggttttgct ttgtttttgataggaAAATTAACCCCAGTGAATTCTAGATTCTAAGCCGG CGAATTCCTAGCAATCCCAGTGCAGCgaattgtaatatttttttgtgttt taaacCGGAAAAATTCCCTAAGATACCTGAACTGTACTGGTGACTGTTGA AATGCAAGGGGGGATACTTTTCATTATGAATATTTCGAATAAGAGAGATA TAGAGAAAGTTGACTGTTAtacatataaaaaatatcgCGAAAGAATCTCT TCAATTAGAAATGTGGATGAATCTTAAAACCCGCTTAAATCACAAGATTC ACCTTCAAATAGTAGTGTCTTTACAAAACAAAACTGACACGTCCCATTAC TTCTTTAGCTCCTGGATTTGTCACCAATGTCAAATTGAAGGTGTTAACTT CTCGCACCATCGAAGTTAGCTGGACGCCTGCCGAAAACAAAGGTAGCGGA ATCACTGGACACGACATCTTATTCAACCGGGCCGATATACCGAAGATCGA ACGTCTTTGGAACATACACACGCTAAAAGACCCCAAAGAAAATAAAGTGG TTGTTTCTAATCTGTTACCAAACCGTCCGTACGAATTCAAGATTTACGCG CGGACGAAAGAATCGCAGGGTGTGCCTTCAGAGATCGTCAAGACTAAAAC AATCGAAGATGGTATAAGGGTTGTTTTCATTCTATCCACTTTAACGAATA CTTTATTTCTAATTGGAAACTTCAGATTCCTGCTTTTACCAAAACGTATC TTTGTTTTGTGCAGATTTGAGATTTCCATTTCGAAACGGGTTTTCGATTT TCATTCACCATGTTTCTCCTTGACATATAcggaaattccaaaatttactG CTCTGTTATACGTAAGTTACTTTCAGGTATGATCTACGAGAGCCTTCGTT TTGCTAGCTCATACTGAaacaatgatttcttttttactcATGAATGTTGG TAGAACATAACGTCACTCACATGACTAAAGATTAAATCTCCAATTTAGTA CCTTacgaaatttaaagttttactgtgatggtcatctttgagattgcctt tttttcatgtagaggaatagtcaatgttttcatatgacaaaaaggccaat ctcaaaggcagaacaGAATTGTAAGattccaattttccaagacactcATT TTGAGATtgattgaacctttagtcatgtaaTAAAGAACTTCTCTGTGTTA GAAAAATAGCTAGATGACTCCACCAGGAGGGTGGGAAACTAAAAGCGAAA AGACAGTAGTACAAAAAGTAACATATGATTTTGTTTGACGTTCAGCTCCC AGTGCACCACCTCAGAACGTGCGTGGAACAGCTAAACATTCACAAACACT CGTCATCTCATGGGACCCTCCACCTGTGGACCATCAAAACTCACCCATCA CCGGATACACGTTGTATTACAGCTTCCACGACCGTGATCCTTCAACAAAA GAGATCGGCAAGAACGAT

Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000107_pilon:52299..69016+

>XLOC_036828 ID=XLOC_036828|Name=XLOC_036828|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=4266bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000107_pilon:52299..69016+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ATGAATATGGATTCAGAAGTTTTGATTTTGCTGGTTGTTGGCTGCTCACT
TTTGATTGGAAACTCACATGATGAATATGGATTCAGAAGTTTTGATTTTG
CTGGTTGTTGGCTGCTCACTTTTGATTGGAAACTCACATGGAAAACTTAC
ACTGAACTACTGGCCGAAAGGAGAATCTTACAACACCGTCTTCGTTAGTG
GACAAACTCTCCTCAGATGCGACGTGGATTCAGACCGCTCCTTTCAACTC
AAATGGTATAAAGATGGAAAAGAATTGGACTTTAGCACCATCAAGTTCCC
TTTGTGGGGTTTCAAGAAAACTTACACTGAACTACTGGCCGAAAGGAGAA
TCTTACAACACCGTCTTCGTTAGTGGACAAACTCTCCTCAGATGCGACGT
GGATTCAGACCGCTCCTTTCAACTCAAATGGTATAAAGATGGAAAAGAAT
TGGACTTTAGCACCATCAAGTTCCCTTTGTGGGGTTTCAAATTCAAAGAT
GGTTCAGGAGGCACGCTATGGCAATGGCCGTACCACAAAGATTTCTTGAA
AGATCCAGCAGTCTTTGAATGCAGGGCGACCAATGGCGTTGATCCGCCCG
TCAGCAAGAAAGTCAAATTTACTCCCTTAGATGATTCAAAGATGGTTCAG
GAGGCACGCTATGGCAATGGCCGTACCACAAAGATTTCTTGAAAGATCCA
GCAGTCTTTGAATGCAGGGCGACCAATGGCGTTGATCCGCCCGTCAGCAA
GAAAGTCAAATTTACTCCCTTAGATGctcATAAATTGCCAGCAGATTATC
CCAAGAAAGTAGACAATGCAAAGCAAGAGAAATATCCTGAGAAAGTTTTC
TACGGCTCAAACCTCACCTTCTATTGCGATGCGAAGGGAGGGACGAATCT
CGATTACCAATGGTTTTACAATCGCCTTCCGTTAGGCAAGATTGATGCCA
AACGAAGTCGAGCGGTCCGCTTGGATTACAAATTGAGCGCCGATCGTCGA
ATCTTGAACATCTTTAATATTCAGctcATAAATTGCCAGCAGATTATCCC
AAGAAAGTAGACAATGCAAAGCAAGAGAAATATCCTGAGAAAGTTTTCTA
CGGCTCAAACCTCACCTTCTATTGCGATGCGAAGGGAGGGACGAATCTCG
ATTACCAATGGTTTTACAATCGCCTTCCGTTAGGCAAGATTGATGCCAAA
CGAAGTCGAGCGGTCCGCTTGGATTACAAATTGAGCGCCGATCGTCGAAT
CTTGAACATCTTTAATATTCAGGAAACACCTCAACAAGAAGCGATTAACT
TTCAATGTATGGTCTCCAACAACGTTGGTTTATTGAATGCTCTGATGTTC
AGTGTTGCCACAATGCCCAAACCAAGAAACACCTCAACAAGAAGCGATTA
ACTTTCAATGTATGGTCTCCAACAACGTTGGTTTATTGAATGCTCTGATG
TTCAGTGTTGCCACAATGCCCAAACCAACTCCTGCCATCCCACCAATGGT
TCCTCGCCTGACGGTCCGACCCCAAAACGTGTCTGTAGGTGGACCAGAAC
AATGGGTTGAGTTTGATTGCGCGGCTGTCGGCCACCCAACACCATTATAT
TGGTGGTACCATGATGGTCTGGTGGTGCAAGCTGGTGCCGAAACTGGAAA
GCTCCTGCCATCCCACCAATGGTTCCTCGCCTGACGGTCCGACCCCAAAA
CGTGTCTGTAGGTGGACCAGAACAATGGGTTGAGTTTGATTGCGCGGCTG
TCGGCCACCCAACACCATTATATTGGTGGTACCATGATGGTCTGGTGGTG
CAAGCTGGTGCCGAAACTGGAAAGGTATCGGTTGTAGCCATGCGTTCAGG
AAGTATTATGTGTCACCCTTGGAACAAATATGGTTCAACCAACGCTACTG
CTTACCTCACTGTTACTCGTATCGGTTGTAGCCATGCGTTCAGGAAGTAT
TATGTGTCACCCTTGGAACAAATATGGTTCAACCAACGCTACTGCTTACC
TCACTGTTACTCCTTTACCATACAGACCAAACCCTATCAAGATCGCCGGA
ACCAGTGTCAAACACATCACTATCGAAATCACACCCAATTACCGGGAAGC
GGAATGGCATCCGGACATCCCCGTTAACGAGATCATTATTCAACACCGGC
CGTATGTTTTTAACCAGCCTGTTGAAACCGCCTTCAATGTTACCAAATTC
AAAACGGGCGGAAAACCTGCCCCTTGGAGATATACTTTTGACGGTTTGGA
ACCATGGATTTATATCGATTTCCGAGTGAAGTTGGTTAATAAATATGGCG
TTTCAAATGTGTCAGAATGGTATCATGGACAAACCGATTGGGGAGCTTTA
CCATACAGACCAAACCCTATCAAGATCGCCGGAACCAGTGTCAAACACAT
CACTATCGAAATCACACCCAATTACCGGGAAGCGGAATGGCATCCGGACA
TCCCCGTTAACGAGATCATTATTCAACACCGGCCGTATGTTTTTAACCAG
CCTGTTGAAACCGCCTTCAATGTTACCAAATTCAAAACGGGCGGAAAACC
TGCCCCTTGGAGATATACTTTTGACGGTTTGGAACCATGGATTTATATCG
ATTTCCGAGTGAAGTTGGTTAATAAATATGGCGTTTCAAATGTGTCAGAA
TGGTATCATGGACAAACCGATTGGGGAGCTATCACAGAGCCTGTTCGTAA
TTTGAAGGCGACACCACTGTCTCCAAAATCATTCAGAGTACAATGGGAGG
ATCCCCCAAAAACCAATGGACCCTTGACcagCTATCACAGAGCCTGTTCG
TAATTTGAAGGCGACACCACTGTCTCCAAAATCATTCAGAGTACAATGGG
AGGATCCCCCAAAAACCAATGGACCCTTGACcagATACGAATTCTACTAC
ACAACACGACCCAACGCCGACATCAAAAATTGGATCATGCACGGTGTAGA
CCCTACAGACCAACATTATGCGGTAAACTGGACGGACAACCCACGGTATA
CGGAAGTCGCCCCTGTCTTATACTGGAAAGTGCGATTGGTGGGTTTCGTG
AATGAAGGACCTTTCTCTGAAACGAAAGCATTCAAATGTCTCCCAGGAGA
TACGAATTCTACTACACAACACGACCCAACGCCGACATCAAAAATTGGAT
CATGCACGGTGTAGACCCTACAGACCAACATTATGCGGTAAACTGGACGG
ACAACCCACGGTATACGGAAGTCGCCCCTGTCTTATACTGGAAAGTGCGA
TTGGTGGGTTTCGTGAATGAAGGACCTTTCTCTGAAACGAAAGCATTCAA
ATGTCTCCCAGGAGCTCCTGGATTTGTCACCAATGTCAAATTGAAGGTGT
TAACTTCTCGCACCATCGAAGTTAGCTGGACGCCTGCCGAAAACAAAGGT
AGCGGAATCACTGGACACGACATCTTATTCAACCGGGCCGATATACCGAA
GATCGAACGTCTTTGGAACATACACACGCTAAAAGACCCCAAAGAAAATA
AAGTGGTTGTTTCTAATCTGTTACCAAACCGTCCGTACGAATTCAAGATT
TACGCGCGGACGAAAGAATCGCAGGGTGTGCCTTCAGAGATCGTCAAGAC
TAAAACAATCGAAGATGCTCCTGGATTTGTCACCAATGTCAAATTGAAGG
TGTTAACTTCTCGCACCATCGAAGTTAGCTGGACGCCTGCCGAAAACAAA
GGTAGCGGAATCACTGGACACGACATCTTATTCAACCGGGCCGATATACC
GAAGATCGAACGTCTTTGGAACATACACACGCTAAAAGACCCCAAAGAAA
ATAAAGTGGTTGTTTCTAATCTGTTACCAAACCGTCCGTACGAATTCAAG
ATTTACGCGCGGACGAAAGAATCGCAGGGTGTGCCTTCAGAGATCGTCAA
GACTAAAACAATCGAAGATGCTCCCAGTGCACCACCTCAGAACGTGCGTG
GAACAGCTAAACATTCACAAACACTCGTCATCTCATGGGACCCTCCACCT
GTGGACCATCAAAACTCACCCATCACCGGATACACGTTGTATTACAGCTT
CCACGACCGTGATCCTTCAACAAAAGAGATCGGCAAGAACGATCTCCCAG
TGCACCACCTCAGAACGTGCGTGGAACAGCTAAACATTCACAAACACTCG
TCATCTCATGGGACCCTCCACCTGTGGACCATCAAAACTCACCCATCACC
GGATACACGTTGTATTACAGCTTCCACGACCGTGATCCTTCAACAAAAGA
GATCGGCAAGAACGAT
Gene-mRNA-Prot
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
XLOC_036828XLOC_036828-proteinClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonpolypeptide
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
sc0000107_pilongenomesc0000107_pilon:52299..69016 +
Properties
Property NameValue
Aaloc1963-2133:16548
Aaloc1660-1959:15611
Aaloc1444-1656:14999
Aaloc1342-1440:14576
Aaloc1009-1338:13951
Aaloc913-1005:13642
Aaloc742-912:13154
Aaloc637-738:12791
Aaloc391-636:12143
Aaloc247-387:11620
Aaloc73-243:10619
Aaloc1-69:1