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Sequence
The following sequences are available for this feature:
mRNA from alignment at sc0000154_pilon:671928..680929+ Legend: polypeptideCDS Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >XLOC_036822 ID=XLOC_036822|Name=XLOC_036822|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=9002bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000154_pilon:671928..680929+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
AAGAAAATTTTATTTCTTCTTTTGATGCATTTCGCTCTTTTTGAAGCAGC
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tttcacccggccggtttccggaaacactacattttttttaattttcgcct
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TGTGACTAGATTATGGAcgaatttattttcattagagATGACcaccagat
gacgtcatcaaattttgacatttccAAAATGGGAACCCCTCTAATTatct
tttaacttatttttttttcggcaaagtAGCTTTCAACCAAACGTAttttt
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TGATGTTCGACTAAGTTcggttgtcgaactttaatcgaataGTCATTCTT
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atcgaacttaatcgaacttaataAAACTTGATCGAGTTTAATAAAACAAT
AATTTGAGAAAATCCTTCGAACTTTTCTTATTGTCAAACTTTGTCGAACg
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GggacttttgaaaagttcgattaaataaTTTAAGATATagattaagtttg
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ATGTTCTTCAAACAATACCATCTGTAATCTGGGTATCTGTTTACCAAATT
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AATTGTGAAACCCAAATCATTACATGTGAGTTACTCAATACACAGGCTGC
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aaatttaagaaaaaacaaaatttacctcaacatacaaagttcttaaatta
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caacccagggcagcaaaacagaaattaataaaaagcagtcttacaagatc
taaaactattaaaaacatccaaagattacaccaaagtccataaaaaagtt
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ctgttttcttctttttcatgttttcgtgtaacagaaagccctatcttcac
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TGCTATTCTATTGCCAAACTATGCCATGTTGAAATATGCATTATCAGCGC
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TACTTCATCAGTGGACTACTCTTagaggtgccaaataaacgggccccctg
cttgttaatttttcgaaaattttctgaCCCACCCGAACCTTCTTAggacc
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CCTTATTTGGCTCCAAAAAGTCTGATTTCaacctatatttaccttatttt
ttggttttcagaagtacaacaTCCAACCCTCCCCCGACAATTAGGTCcct
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ccccccgtttattcgggATCTAAGATTACATGCAATATGAGTGGTGCTCT
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catgttttatcaTTATTATGGGCTATTTCTCTTCAAGCGACATCAGCAGC
GACGTCGGAACCTGCAACTACGACGCCGAAACCTGTAACTACGACATCGA
CGTTCGTTTTAACAACACCTGCAGAGCCTTTAGGTATAAATGCTTAatat
ttctttctatttttgtgGATATATCAAATCGGTTACAAGGTTTTGAGCag
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GATGCAAAAGTTTGTACAGTAAAACATCCAATTAACAGAGACTCTAAAAA
GCGGACGCCTCTGATTAGTGGACCAATTCAATTTTCCCCAACCATTTTCT
AGTGGaatcctcataaaaaatgtCCCTCCAATGCTCCAATTAGCAGACCC
TCCAACTAGTGGACGCAGACCTTAAAAAATAGACAAGATTGATTTGTCCA
AACTATTTATTTCTTAAACACTTCAAAGTGTCATTGAGAAAATTGCTTAT
AGACGTTTGGAGCGCTCCCTTCATTCAGTCGGTGAATTTTACAGGGACCT
CAAGACTACTATGATTCATGAAATAAAGATTTTAGCATTTAAATAATCAT
TCTCTTGTTCTTTCATACCCCTTTTGTATAATAGTGCCTTCTTTACCAAA
ATTAGAGCACATAATTGAAAAGTTTCCAAATGGCGGACACTTCTACTTAG
CAGACATGATTCCGTTTTCCCGATgatgcccagctggcacacgacgttgt
ttaaacgttaatataacgttatatggacgtagtgaacgttagatagacgt
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ATTACCAAAATCCAAAAGCTACCTAAAATTGAGACCCTCATTTAATAGTA
AAATTTCAATAGAATCTAAATAATGctaaaattttattagaacTACTCTT
AGCTTCCAAATAAACATCCCCCtgcttcataatttttcaaaaattttcta
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atAAGAATACAAAGCTTGATTTTAGCCTACTATATACTCCCCAGGCAAAT
AGGTCCACTCcctcgtttattaaaatttttattaattaccagctcccccc
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TACTGctatagcctgggaatccaagcgttaaactttgttcacagtctagt
ttatgatattttcgcTGCTTCTAtattccccgggggggggggggggtact
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aaatttgattttctgatttttccgacccttagcgggactttggaagtcca
aaaaaggtgcccttaagggcggcacataccgtaccctccatttgcctaag
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ttttttccaagattataagcttggattcccaggctagtaCGGCTATTATT
ATATAGATAACTGCCTCATAAATTTCCATCAACACGACACTTTAAATAGA
ATTTATGTATTCCATAGGGGCTTTTGCGCGAGAAAATTCAATTCCAGCCT
TCACCTATGCCAACATACCAGATGATTGGCAGTTATCAATTGGGCTGGAG
ATTAAAGGTCAAACTATGGTAAACAGTGGTGAACCCATAAGTATCATCCA
CCTGGTGTACGGTGACAACCCGTCCAATAAAcatgttttatttactttgg
ttTATAACAAACATTTTGAGGTAATAGCGCATCACAGTGTGAAAATGAAG
CCCATGCCGAATTGTTATTTGTTTATACTGAGGTCTacaccaaaaaaagt
ttcaattgtGGAATtttacgggggggggggggaccgaAATTGGAGGGGTT
TTGGGGGAGGCtgaaagccccccccccaaAcgTGTCCAGGGAAAGCCCTG
GAATATTTGATCTTCTCCCGCCTCAAAGATGCCCAAAATTTGCTATATTT
TCTagttttaagatgaaaaaaaaacttttactctAATTTAATATATAAcc
aattttcaacctttttcttCAGCTTCACTACAATGGAAATGAGCACCCGA
TCCAAAGCCAAGGACCACCTCTGTTTCCTTCAGGACCTTTTGAACCATCC
CGATCTTACACTTacaatgtgatttttgaattcacTAAGTCGTTAAACAA
ACTCAGTTGCACTATCAAATTCACTAACGGTCCGTTGAGCACATTCACCG
TTGCGTCTGCTAAAGATCTTGATATCAGTCCAGTTTATGACCTTACAAAT
GTTGAACTCTATGTTGGTTACCCTGATCACAGCAAATATACTGGAGAGTA
CAATGTCCATGATGTTGTGGTGACAACAGTTGGAATATCCAACTTGGTTT
AA Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000154_pilon:671928..680929+ >XLOC_036822 ID=XLOC_036822|Name=XLOC_036822|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=2208bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000154_pilon:671928..680929+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
AAGAAAATTTTATTTCTTCTTTTGATGCATTTCGCTCTTTTTGAAGCAGC
GAAAATCGAAGAATCGAACACAACAGTTGGGGATACTGTTTATCATGTCA
AGAAAGTTGCGTTCAGAAGATATGACAATGTGATGCCGACTTCTGATGCC
AACACACACCAAAGTATTAGAGAAATCACCAATGCCACTTCACAAAGAAA
ATTTTATTTCTTCTTTTGATGCATTTCGCTCTTTTTGAAGCAGCGAAAAT
CGAAGAATCGAACACAACAGTTGGGGATACTGTTTATCATGTCAAGAAAG
TTGCGTTCAGAAGATATGACAATGTGATGCCGACTTCTGATGCCAACACA
CACCAAAGTATTAGAGAAATCACCAATGCCACTTCACAggTTTGTGGTAC
TGAATGTTATCGTGCAACGTCTTGCTGGAGCTTTTTGCTTTTTCGCCACA
AAACACCACCGACTTGCACTCTTATTGATGGACCAATCGATCGAAGATAT
ATGATCAAAAATTCAACCGTCGACTATTATGAAGTCTGGggTTTGTGGTA
CTGAATGTTATCGTGCAACGTCTTGCTGGAGCTTTTTGCTTTTTCGCCAC
AAAACACCACCGACTTGCACTCTTATTGATGGACCAATCGATCGAAGATA
TATGATCAAAAATTCAACCGTCGACTATTATGAAGTCTGGAATCAATGTT
CTTCAAACAATACCATCTGTAATCTGGGTATCTGTTTACCAAATTATGTG
ACAGATTCTTACACTTGTCATTGCCCATCCAGATACACTGGTGCAAATTG
TGAAACCCAAATCATTACATAATCAATGTTCTTCAAACAATACCATCTGT
AATCTGGGTATCTGTTTACCAAATTATGTGACAGATTCTTACACTTGTCA
TTGCCCATCCAGATACACTGGTGCAAATTGTGAAACCCAAATCATTACAT
CGACATCAGCAGCGACGTCGGAACCTGCAACTACGACGCCGAAACCTGTA
ACTACGACATCGACGTTCGTTTTAACAACACCTGCAGAGCCTTTAGCGAC
ATCAGCAGCGACGTCGGAACCTGCAACTACGACGCCGAAACCTGTAACTA
CGACATCGACGTTCGTTTTAACAACACCTGCAGAGCCTTTAGGGGCTTTT
GCGCGAGAAAATTCAATTCCAGCCTTCACCTATGCCAACATACCAGATGA
TTGGCAGTTATCAATTGGGCTGGAGATTAAAGGTCAAACTATGGTAAACA
GTGGTGAACCCATAAGTATCATCCACCTGGTGTACGGTGACAACCCGTCC
AATAAAcatgttttatttactttggttTATAACAAACATTTTGAGGGGCT
TTTGCGCGAGAAAATTCAATTCCAGCCTTCACCTATGCCAACATACCAGA
TGATTGGCAGTTATCAATTGGGCTGGAGATTAAAGGTCAAACTATGGTAA
ACAGTGGTGAACCCATAAGTATCATCCACCTGGTGTACGGTGACAACCCG
TCCAATAAAcatgttttatttactttggttTATAACAAACATTTTGAGCT
TCACTACAATGGAAATGAGCACCCGATCCAAAGCCAAGGACCACCTCTGT
TTCCTTCAGGACCTTTTGAACCATCCCGATCTTACACTTacaatgtgatt
tttgaattcacTAAGTCGTTAAACAAACTCAGTTGCACTATCAAATTCAC
TAACGGTCCGTTGAGCACATTCACCGTTGCGTCTGCTAAAGATCTTGATA
TCAGTCCAGTTTATGACCTTACAAATGTTGAACTCTATGTTGGTTACCCT
GATCACAGCAAATATACTGGAGAGTACAATGTCCATGATGTTGTGGTGAC
AACAGTTGGAATATCCAACTTGGTTTAACTTCACTACAATGGAAATGAGC
ACCCGATCCAAAGCCAAGGACCACCTCTGTTTCCTTCAGGACCTTTTGAA
CCATCCCGATCTTACACTTacaatgtgatttttgaattcacTAAGTCGTT
AAACAAACTCAGTTGCACTATCAAATTCACTAACGGTCCGTTGAGCACAT
TCACCGTTGCGTCTGCTAAAGATCTTGATATCAGTCCAGTTTATGACCTT
ACAAATGTTGAACTCTATGTTGGTTACCCTGATCACAGCAAATATACTGG
AGAGTACAATGTCCATGATGTTGTGGTGACAACAGTTGGAATATCCAACT
TGGTTTAA
Gene-mRNA-Prot
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Position
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
|---|
| sc0000154_pilon | genome | sc0000154_pilon:671928..680929 + |
Properties
| Property Name | Value |
|---|
| Aaloc | 775-1104:8673 |
| Aaloc | 574-774:8170 |
| Aaloc | 478-570:6390 |
| Aaloc | 346-474:3746 |
| Aaloc | 196-345:989 |
| Aaloc | 1-192:1 |
|
