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Sequence
The following sequences are available for this feature:
mRNA from alignment at sc0000126_pilon:381681..391116+ Legend: polypeptideCDS Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >XLOC_036701 ID=XLOC_036701|Name=XLOC_036701|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=9436bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000126_pilon:381681..391116+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon) ATGGGTCTAACTGAGTGCAGACAAAAAGGAATAGGAATCCTCCTTCATTA
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ATGTTGCACCTCAACCTTCTCCTttaagacacccccttctcacagatcaa
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CGTACTGAATGAAATACTGTATGACTCTCGTCCgatatttctattttcta
tatTGCCTGCTctttaaacacccccttctcacagacccactggaaaaatt
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TGGTCATGTTATTTTCCTATACTTCTTAGGTTGGACGATGTAAATTCGCC
GATATCTCCAGGCTATAATTTCAGGTTAGTGACTACTTACATCCAAACCC
TTTATACTCCTCCGTTGACATAGAACAGCATAGAAGTGCAAATCGATGTT
TGAtcgggctattccagaaatagtctatgccctctatgttgaggaggtgt
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ACCAAAGCTTACGGTATCAAATTCGAATTACTCGTCCATGGAAAGGTCAG
CGctattgaataattaaataatttttatttgataaatatCGTGGCTGCCA
ACGGCAACGAATCTTTTTCCCGTCCATTTTGCTGAGTTTGCAGCGGTAGG
AACCTTCTCACGACTTATAACTTAAAGCCCGTTATTCCATTCAAAACTCA
TACAGAGGGTGGACGAatcttttcaagcaaaaaaataattcttgaaaatg
tgtggtTACCTCCtcgaaaattgcaaaatttgcaaaagacccttggaaaa
aatctttcattccTTAAAGTGGAGTGTTGACGAACTTAAACCAGTCTTTT
GGCCCttgcaattttcaaaatattttttaccccctgaaaaatagaaaacc
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CCTTGTATGGATATAAAGTGGAATGGCCCATTCTGCCCTTTTCTGTATCA
TTTATGCTAACCATTCACAAGTTTCAttttgggacgagatggagttttta
caagctcttattcgatttggttggtcgttaaggctgtcatttttttaaag
aacgtgtcatttttattacttcaaatgaccaatttattaaagtatcttat
aaaaactccatctcatctgttcATTTTACCATTAGGCTGGCAAATTCAAT
GTGATTCCTCTCCTAACAAATCTTGGAGCTGGTATGGCGTTGCTGGGCAT
TGTAAGATTATTTGATCGTTTTTCGATTtccgtttttttaagaaactagt
tttaccaagcagcctcaatagttctatttatactgagacgattaatttgt
ctgaaACGAGCTATTTAGAAAATgatggaggagtgtactttccattcatg
tttcaataaataggatctcctccacagatcacattttacaaactactcgt
ctcagacgatttttccgtctcagtataaatagaactaatgtttcttaaga
aatcggccttttgagctttaaatgtttcttacatgtttctaaactttttg
acataatcagcctatttttcatggaaagaaaaaaaccattgttttgattg
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agatgtttcttagtttttaggcattctgagcctcatgtttcttaaaagtg
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CCAAATATAccttatgttttttttcagtgGTAAAATAATTGAGCTAGCAG
ATGTAGACTTTTCGCTGGGGAGAATTCCTgaattttttatcctttttatc
AAGTTGATGGTTGATGCGGGGGTGTAAGACTTTCTTTAAACTTATAAGTA
CCCTGAGAGCATTCACTTCTATTGGAAGGCAGTAGCGTTCTCAGGGATGT
CGGAAAATTTATGTAGGAGAGCACAATTTTATTATGAAGTAATTATCTTT
CAATGTTATCCTACATTGGATATCTCCTACACAAAATGATTTTTACATGG
ATCTCTCCTATTTTCTACACAAATTTTCCGACACTCCTTAGCTACTGGAA
GGTTGTTCTGACAATTCACACcactttcaattcaatttttttccaggcgA
CAGTATGGTGTGATTTCATTGTGATGTACTTGTTGAAGAAAAGAAATGTT
TATCGTGAACACAAATATCAAAGAGTTGATGATGACTCGCAAGATCCGAA
AGGAAATGTACAGGTCTTATTTCTCCTTTCatgttacacccctgtctcac
agccccggtggaactttttccccagtggggataaaaattcctcttaaaat
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gatggttttgcaCAGCAAATTTCGAACACGAAATTTCGAGTGGGATGAAA
TCacagtcaatttcccagtggggctgaaattcaagtgtattttcccaccg
aggatgaaatttttgcttaattttttcagtggggctggggtccagCGGGt
gtgtgacacaggggtgttttatttaaaaagcattttcaaaacatttattc
ATAAAGAATTGGTTTTTACATGCATTTCCACTGGAAACAATTGTTTAACC
TGTGTCTTTCGCCGTACTATTTTCATGAACCTTGACCGAATCTTAAACAA
TAAATAACCCATCGAAAATCATCGACCTTTTAAAGATATCTTCTAAGTAA
TctatatttttctttatcaggTTGATGACGACGAAAATGAGTTGGAGAGC
GATCGCCCTGAAGCAGAGCGTCTCATCAAACCATAG Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000126_pilon:381681..391116+ >XLOC_036701 ID=XLOC_036701|Name=XLOC_036701|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=2544bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000126_pilon:381681..391116+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon) ATGGGTCTAACTGAGTGCAGACAAAAAGGAATAGGAATCCTCCTTCATTA TGAAACAGTCAAAATCATAgacataaaaaacaaaaaagttggaGCTTTGT ATCGATTCATCCAGCTCATAATTATCAGTTATGTTATTGGATGGGTCTAA CTGAGTGCAGACAAAAAGGAATAGGAATCCTCCTTCATTATGAAACAGTC AAAATCATAgacataaaaaacaaaaaagttggaGCTTTGTATCGATTCAT CCAGCTCATAATTATCAGTTATGTTATTGGATATGTTATAGTGTATAAGA AGGGGTACCAAGAATTCGACGTTGCAATAAGCACGGTGACAACTAAACTC AAAGGAACCACTTATGTTGACTTTGGTAAATTTAACTCAACACTTTTCAA TGGAATTCGAATATATGATCCATCAGATTACGTCATACCTCCACAAATAT GTTATAGTGTATAAGAAGGGGTACCAAGAATTCGACGTTGCAATAAGCAC GGTGACAACTAAACTCAAAGGAACCACTTATGTTGACTTTGGTAAATTTA ACTCAACACTTTTCAATGGAATTCGAATATATGATCCATCAGATTACGTC ATACCTCCACAAGAAACAGATGCAGTCTTCGTGATGACAAACATGATCTT AACACCAAAACAATCACAAAGCAATTGTCCAGAAGATTCTAAATTTAAAG ATATACATTGTAAAAAGGACAGTGACTGCCCTAAAATGGTGCCGGTCAAG AACGGCAATGGAAACAGATGCAGTCTTCGTGATGACAAACATGATCTTAA CACCAAAACAATCACAAAGCAATTGTCCAGAAGATTCTAAATTTAAAGAT ATACATTGTAAAAAGGACAGTGACTGCCCTAAAATGGTGCCGGTCAAGAA CGGCAATGGTGTAAGGACTGGGAAATGTGTATCATCAGATCGAAATTCAT CAATGACCGTTTGTGAAATTTATGGCTGGTGTCCGACTGAAGTTGACCAA CTTCCCATGCCCAATAATAATTTCAGGTGTAAGGACTGGGAAATGTGTAT CATCAGATCGAAATTCATCAATGACCGTTTGTGAAATTTATGGCTGGTGT CCGACTGAAGTTGACCAACTTCCCATGCCCAATAATAATTTCAGTGATAC AGTACCTCTTCTTGATGGCACAAAATATTCCACCATGTTGGTAAAAAACC AAATCAGTTTTCCAAAGTTCCGCGCCATCAGTGATACAGTACCTCTTCTT GATGGCACAAAATATTCCACCATGTTGGTAAAAAACCAAATCAGTTTTCC AAAGTTCCGCGCCATCAGgaatAATATCATCCAATTCAACGACAGTACAT ATTTGAAACGATGTCATTATAATTCGGACACTGACCCTTTGTGTCCGATA TTTAACTTAGAAGACATCGTCTCTTCTTGTGGTGATAATTATACAGATGT CGCTTACCAAgaatAATATCATCCAATTCAACGACAGTACATATTTGAAA CGATGTCATTATAATTCGGACACTGACCCTTTGTGTCCGATATTTAACTT AGAAGACATCGTCTCTTCTTGTGGTGATAATTATACAGATGTCGCTTACC AAGGTGCGATATATGGCATCATTATTGAATGGGACTGCAATTTAGATCAT TCCATCGACGAATGTCTTCCAAAATATCAGTTTAAGAGGGTGCGATATAT GGCATCATTATTGAATGGGACTGCAATTTAGATCATTCCATCGACGAATG TCTTCCAAAATATCAGTTTAAGAGGTTGGACGATGTAAATTCGCCGATAT CTCCAGGCTATAATTTCAGGTTGGACGATGTAAATTCGCCGATATCTCCA GGCTATAATTTCAGATACGCAGATTATTACGTTGAAGAGGATACACGTTA TCGAGTTCTCACCAAAGCTTACGGTATCAAATTCGAATTACTCGTCCATG GAAAGATACGCAGATTATTACGTTGAAGAGGATACACGTTATCGAGTTCT CACCAAAGCTTACGGTATCAAATTCGAATTACTCGTCCATGGAAAGGCTG GCAAATTCAATGTGATTCCTCTCCTAACAAATCTTGGAGCTGGTATGGCG TTGCTGGGCATTGCTGGCAAATTCAATGTGATTCCTCTCCTAACAAATCT TGGAGCTGGTATGGCGTTGCTGGGCATTgcgACAGTATGGTGTGATTTCA TTGTGATGTACTTGTTGAAGAAAAGAAATGTTTATCGTGAACACAAATAT CAAAGAGTTGATGATGACTCGCAAGATCCGAAAGGAAATGTACAGgcgAC AGTATGGTGTGATTTCATTGTGATGTACTTGTTGAAGAAAAGAAATGTTT ATCGTGAACACAAATATCAAAGAGTTGATGATGACTCGCAAGATCCGAAA GGAAATGTACAGgTTGATGACGACGAAAATGAGTTGGAGAGCGATCGCCC TGAAGCAGAGCGTCTCATCAAACCATAGgTTGATGACGACGAAAATGAGT TGGAGAGCGATCGCCCTGAAGCAGAGCGTCTCATCAAACCATAG
Gene-mRNA-Prot
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Position
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
| sc0000126_pilon | genome | sc0000126_pilon:381681..391116 + |
Properties
| Property Name | Value |
| Aaloc | 1207-1272:9371 |
| Aaloc | 1090-1206:8747 |
| Aaloc | 1024-1089:7786 |
| Aaloc | 934-1023:7056 |
| Aaloc | 889-930:6631 |
| Aaloc | 802-885:5951 |
| Aaloc | 661-801:5058 |
| Aaloc | 574-657:4417 |
| Aaloc | 457-570:4165 |
| Aaloc | 307-453:3242 |
| Aaloc | 142-306:2057 |
| Aaloc | 1-138:1 |
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