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Sequence
The following sequences are available for this feature:
mRNA from alignment at sc0000100_pilon:1017875..1025760+ Legend: CDSpolypeptide Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >XLOC_036650 ID=XLOC_036650|Name=XLOC_036650|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=7886bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000100_pilon:1017875..1025760+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
TCCTGTAAAAACTCAAAATTGGTAAGGAAATTCATCTCTATTGACTTCAT
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TCCCACGCATGCGCTCTAAAGGGGATGGATAGCTTAGCAATGATGATCGG
TTATATGAGATTAACGCTAATCTTGCCGAAACCCGTTTATTCcgtttttt
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CCCTTTTCTAGGGAAAATTCCGCCCTCTCTCTCGGACTGTTTtgttcaaa
caaaaaatatttttcgcccaaccgaccgaccgacccaatTTTTGATAGTT
GGAATGACCAAGGGATTTTTTACGGACGgccaaagtaaaaataattccgc
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CTATGGGCATGTAACACTGTTTTGCAAATAACAGAAAAGGTGTATGACAT
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TAAAATACTGTAAGttggatgtcgaaattagaagaaggGTGTTGACCTTA
gcaacatccctcttctaattttaaCATCCTTCTTTATATATAGGAATAAA
AGGAAGGTCGGACTCCTCAactgattgctaagcaaagaaaactagtttca
aaCAGTGTTCCAACTTTCctttattcctatctctaaaaaaaGGTGACAAA
ATTAGaaaagggatgtcgacattagaccaacttacggtagcgCTTTAAAT
TACACAGTGTGCACCCCCCAGAATTGTGGGGAgggggggTTGGTGTTTTA
TCTCAAAAATTTCCAGGTAAGGTGGgggttaatttctttaggtgggactt
ttgGTGGGACTTTTGGTGTTTTGGTAAAAGTTAAAGtcagttttttctta
tttccaattttattataaacaaaataaacaaaattagcATTCTCTTTTAA
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CCTACACAATGGTCCTATACTGTCATCTTTTAATGAGTAGCAACtaatta
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GGTATATAATAACTAAATATCTCCTAGgtctataaacaaaaaaaaattac
atctcAGTACCACTGTTGATTTTATATAGgatgagaaagatgcaaaaaga
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ATGTGCCGACCTTCAAAAGGCCGAGTGGCCATTGACGCGAGGTCCAAAAT
GCAAGCTGAGCGAGGGAATCGTCCTGACAGAAAGAAAAAACAGACTCAGA
GCGCGAAGGTAGAATGGAGATTCCCTGGAATATACAAACAAAGTGAAATA
TCAATCTAAATAAgatactgtaatggatagaaATGTTCTATGTTATGTAc
agttaaagtttttttctgttttcggTAGATATAATATTCCTCATAGTGTA
ATGAGATGTGGCGAGTACAAGGGTGAGACAAGGGTCAATCGAGATTAGAG
ATTAGAGGTTGTGAGGCTAAACAGACGCCAGAAAAGTAATTGAGGCTAGG
GATCTTCCGCGAGGGAATCcccggaaaaatcaaaataaactcaaaaaccc
aaaaacgtaaacaaaatgctgagttacagaaaattatcataaaattacag
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ttttatcttttgatcAGTGCTTTTGAGGTGtccaaaatatgataaaaaat
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taaaattaactttgattCTCCTTTGTTCGtctttgaaaatttcacaataa
aaagaactatttacaaatcattttttttaatgggCATGAATTGATATTGA
CATACTTAGTAATGTTATAATCAATGCCATGCATAAATTTTTCAGAgcca
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tgagaaaacataaatttattgcCTGCAAGTATGACTTAGAAGAGCGCTCC
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GGTTTTTTAGCATATCTTTAGATATAACCCATGCTACAATAAACTAAACA
CGAAaaaggggtattttttagtgcagAATATGACGATGGGGATTATTTTC
aattgtttagatttttctaccctcATTCCATTGCTAAGACTTTTAAGATC
TATAGTTTAAAACTGCTGGACGCGTGATatcaaaaaagtgaaatgaAGCC
CGGACTGACTGTAACTAATGTATGTGCCAAAAATTAACCCTGAAACTTAC
AAGACTGTAGTGAATTTATAATAAAAGTCTAAGGGTGAAAAAGTTTTGGG
CAATTGttatttattgaaacaaaagtGATCAATCAATTGATAAATGCACA
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AATGcatgaaaattcttaaaatgcTGCGTGGACGTGTAAATTGAAAGTTC
ACTTGGAAGCCTTTCTTTATTAGTCATTacaagaaaatttggaaatctTG
GCTTAATTTAGATTTACTTTTATTTGGCATTTCAGAATTTCAGTTTCAGG
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gcattacttgagcctacgaaaaatgttttttcctaattttggcttttttt
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CTGaacctgttttcggatttttgtatgcttataaaaaaacatgtattagt
TGATATTCGACAAACAAACATTTAAGTGAAACTTAttgttttatagaaaa
ataaaaaaaagtggaaaatgataaaatttattcTGCAGCACATTATAATC
AATTTCGAAAATATAGCTGGTGATTTGCACAACCAAGCTTTGGAAATTAC
AAACCTTATGACAGTTGGTTCATATTTGTTTGTTGTCATTTTGCTACCTC
TAATAGTAATAGTTTATGATGATATTTATGGTCCACTTATTGATGGTGTA
AACCTTTATGTAGTTTTCATTATCGTAATGCCTATTTTGGTGATCACACC
TGCTTTCATCTATGCTTgttttaaaaactcaaaatatggtAAAGTGGCAC
TTAATTGGCAGTTGCAATTAGCAGtaagatatttaaaaatatgtgAAACA
TCAGCTGTTTATACAAAGGCATTGCTACCTGATATTCAATTAAATGAAAG
GTCAAATATTTCTTGGTATTGTCAATTAGCAGGGAGCTCCAAAGATGGTT
TTGGATTTTTCCCGTTCTTGAGTTCCAATAAAGGTATTTTCCCAACATCA
AAACCATTGATAACACAAGACATTGATGTTAAtatttttatggaaaattt
gatcttgAACGAGAAAGAAAACTTGTTGTTTCACTCCCCTGGCTTTTGTC
ATATAAAAATTGACTCAAACTTATCATCACatgaatattttaaagattGT
ATTGTTTTTGACGGTTCAAATTACTTATTGTCTGGGCATCATATAATGAA
CAAAATGGCAGGATCATTGAGGGGAGAAATCGAATTCAATTATCCAGCAT
TGACCTATAAAACTATTCTTGATGGACCTTATGGGAAATTTAGATTTGAT
TCAGATATTGTGTTTGGTATCAAATTGTCATCATGGCCGGAAGCTGctca
aaattggtcaaagagAGTTAAGAAAATGTTACCTGTTCATGTCATAGAAA
GTGTTCATAAGAAATGCTGCTATTTGGTCCATAAACATTGCCCTTATAAC
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CATTCTTTTTCAATACCATTCAGAAAAACAAGCATTGAAGCTTGTTTacg
ttattttgaaatttgccaTTAAATTATACAGTCACGATAAGTTTTCACCT
TATGTTGCTTTGAAATCTTACCATTTAAAAACTACTTTTCTATGGGTTGC
AGAAAAAGAGAAATCATTGAAAGACTTTGATTTATACAAAATCCAAGATA
ATAAAACATTAGGTGAGTTAATGCTTCATGTTATTAAGGAATATCGACAA
TCTCTCTACCTTGGAAAATTAGATCATTATTTCATACCAGGAATTAATCT
ACTTGACATTTACTCTCAAGACGAGAGAACTGTTGCCATGCGATTGATGG
ATGAATTTTTAGAGCGACCATTGAATATTGTATCACGTTTTGATAATGCT
CACATAGTTTTATGGAAAAGAGAACAATGGCATATTGTGATAACCTTTTT
TGCAGCTGGTGCCTTATTTTTCACACAATATGCAGATCATGACTTATTTG
GACCAACTTCTATTGCTGATCAGatttttatgatcgggcgcatctttatc
attttattcattatttatatttttttggatCGATAg Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000100_pilon:1017875..1025760+ >XLOC_036650 ID=XLOC_036650|Name=XLOC_036650|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=3222bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000100_pilon:1017875..1025760+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
TCCTGTAAAAACTCAAAATTGTCCTGTAAAAACTCAAAATTGaaaaataa
aaaaaagtggaaaatgataaaatttattcTGCAGCACATTATAATCAATT
TCGAAAATATAGCTGGTGATTTGCACAACCAAGCTTTGGAAATTACAAAC
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TTTATGTAGTTTTCATTATCGTAATGCCTATTTTGGTGATCACACCTGCT
TTCATCTATGCTTgttttaaaaactcaaaatatggtAAAGTGGCACTTAA
TTGGCAGTTGCAATTAGCAGtaagatatttaaaaatatgtgAAACATCAG
CTGTTTATACAAAGGCATTGCTACCTGATATTCAATTAAATGAAAGGTCA
AATATTTCTTGGTATTGTCAATTAGCAGGGAGCTCCAAAGATGGTTTTGG
ATTTTTCCCGTTCTTGAGTTCCAATAAAGGTATTTTCCCAACATCAAAAC
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ttgAACGAGAAAGAAAACTTGTTGTTTCACTCCCCTGGCTTTTGTCATAT
AAAAATTGACTCAAACTTATCATCACatgaatattttaaagattGTATTG
TTTTTGACGGTTCAAATTACTTATTGTCTGGGCATCATATAATGAACAAA
ATGGCAGGATCATTGAGGGGAGAAATCGAATTCAATTATCCAGCATTGAC
CTATAAAACTATTCTTGATGGACCTTATGGGAAATTTAGATTTGATTCAG
ATATTGTGTTTGGTATCAAATTGTCATCATGGCCGGAAGCTGctcaaaat
tggtcaaagagAGTTAAGAAAATGTTACCTGTTCATGTCATAGAAAGTGT
TCATAAGAAATGCTGCTATTTGGTCCATAAACATTGCCCTTATAACCAGA
TTAGAAATGATTTAGATTGGAGATTATCTTTTGCAGAGGCTGAAACCATT
CTTTTTCAATACCATTCAGAAAAACAAGCATTGAAGCTTGTTTacgttat
tttgaaatttgccaTTAAATTATACAGTCACGATAAGTTTTCACCTTATG
TTGCTTTGAAATCTTACCATTTAAAAACTACTTTTCTATGGGTTGCAGAA
AAAGAGAAATCATTGAAAGACTTTGATTTATACAAAATCCAAGATAATAA
AACATTAGGTGAGTTAATGCTTCATGTTATTAAGGAATATCGACAATCTC
TCTACCTTGGAAAATTAGATCATTATTTCATACCAGGAATTAATCTACTT
GACATTTACTCTCAAGACGAGAGAACTGTTGCCATGCGATTGATGGATGA
ATTTTTAGAGCGACCATTGAATATTGTATCACGTTTTGATAATGCTCACA
TAGTTTTATGGAAAAGAGAACAATGGCATATTGTGATAACCTTTTTTGCA
GCTGGTGCCTTATTTTTCACACAATATGCAGATCATGACTTATTTGGACC
AACTTCTATTGCTGATCAGatttttatgatcgggcgcatctttatcattt
tattcattatttatatttttttggatCGATAgaaaaataaaaaaaagtgg
aaaatgataaaatttattcTGCAGCACATTATAATCAATTTCGAAAATAT
AGCTGGTGATTTGCACAACCAAGCTTTGGAAATTACAAACCTTATGACAG
TTGGTTCATATTTGTTTGTTGTCATTTTGCTACCTCTAATAGTAATAGTT
TATGATGATATTTATGGTCCACTTATTGATGGTGTAAACCTTTATGTAGT
TTTCATTATCGTAATGCCTATTTTGGTGATCACACCTGCTTTCATCTATG
CTTgttttaaaaactcaaaatatggtAAAGTGGCACTTAATTGGCAGTTG
CAATTAGCAGtaagatatttaaaaatatgtgAAACATCAGCTGTTTATAC
AAAGGCATTGCTACCTGATATTCAATTAAATGAAAGGTCAAATATTTCTT
GGTATTGTCAATTAGCAGGGAGCTCCAAAGATGGTTTTGGATTTTTCCCG
TTCTTGAGTTCCAATAAAGGTATTTTCCCAACATCAAAACCATTGATAAC
ACAAGACATTGATGTTAAtatttttatggaaaatttgatcttgAACGAGA
AAGAAAACTTGTTGTTTCACTCCCCTGGCTTTTGTCATATAAAAATTGAC
TCAAACTTATCATCACatgaatattttaaagattGTATTGTTTTTGACGG
TTCAAATTACTTATTGTCTGGGCATCATATAATGAACAAAATGGCAGGAT
CATTGAGGGGAGAAATCGAATTCAATTATCCAGCATTGACCTATAAAACT
ATTCTTGATGGACCTTATGGGAAATTTAGATTTGATTCAGATATTGTGTT
TGGTATCAAATTGTCATCATGGCCGGAAGCTGctcaaaattggtcaaaga
gAGTTAAGAAAATGTTACCTGTTCATGTCATAGAAAGTGTTCATAAGAAA
TGCTGCTATTTGGTCCATAAACATTGCCCTTATAACCAGATTAGAAATGA
TTTAGATTGGAGATTATCTTTTGCAGAGGCTGAAACCATTCTTTTTCAAT
ACCATTCAGAAAAACAAGCATTGAAGCTTGTTTacgttattttgaaattt
gccaTTAAATTATACAGTCACGATAAGTTTTCACCTTATGTTGCTTTGAA
ATCTTACCATTTAAAAACTACTTTTCTATGGGTTGCAGAAAAAGAGAAAT
CATTGAAAGACTTTGATTTATACAAAATCCAAGATAATAAAACATTAGGT
GAGTTAATGCTTCATGTTATTAAGGAATATCGACAATCTCTCTACCTTGG
AAAATTAGATCATTATTTCATACCAGGAATTAATCTACTTGACATTTACT
CTCAAGACGAGAGAACTGTTGCCATGCGATTGATGGATGAATTTTTAGAG
CGACCATTGAATATTGTATCACGTTTTGATAATGCTCACATAGTTTTATG
GAAAAGAGAACAATGGCATATTGTGATAACCTTTTTTGCAGCTGGTGCCT
TATTTTTCACACAATATGCAGATCATGACTTATTTGGACCAACTTCTATT
GCTGATCAGatttttatgatcgggcgcatctttatcattttattcattat
ttatatttttttggatCGATAg
Gene-mRNA-Prot
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Position
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
|---|
| sc0000100_pilon | genome | sc0000100_pilon:1017875..1025760 + |
Properties
| Property Name | Value |
|---|
| Aaloc | 22-1611:6297 |
| Aaloc | 1-21:1 |
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