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Sequence
The following sequences are available for this feature:
mRNA from alignment at sc0000100_pilon:1152460..1158705- Legend: polypeptideCDS Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >XLOC_036636 ID=XLOC_036636|Name=XLOC_036636|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=6246bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000100_pilon:1152460..1158705- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ATGGCGTCGATAAATTGGTGGGGATTGGCTGGTATTATATTATTTTATGT
CGTCATTCTTGTGATTGGTTTGTTGGCTGCCCGATATCGGAACAAACGAA
AGCAGGCGGCGGGCAGTGAAGGGCGTGGGGAAGAAGAAGTCATGTTGGCG
GGAAGAAGTATCGGCTTGTTTGTGGGCGGATTTACAATGACTGGTAAGGA
AATTTTCTTTAAAATATTTTTTTCTTTTGGTTTGGAGAAAGAAACAGAGA
GTGGGGTTAAATTTTTGGGGATTTTGGGGATTTTGAAGATTTAGTTGAGA
TATCAAGGATAATTCTAGGATTTCGAGAGTTAGGAAAAGGGTTTCAAGGA
GCCCAGTATCTTTTCGATCGATTAACATTAACCAAACACCAGTTTGCATA
TTTGGAACAATATCATGAGTAGAAGGGGACTTTTGAAGGCCAAGAATTCT
TCAGTGACCGTTTTTTAAAACTAAAATATTTGGAAATAAATTAAAATTTA
TCACATCCTCTCAATGTTGAAATAAACGAGACAAAACATTTCCTTATATG
GTCTAAAGGACGTCAATATGCCTCAGGCACATTAATTGAAAAAAAGAGCT
AAAAAAGAATTTTTAATGTCATCTTCATTCTAGTAAATAATTCAAAGAAA
CTAAGGAAGATGACAAAAAAACTTATAAAAACAACTTATTTTACACCTTA
TATCGCACCCTCATCATGTATTTAGTTCCATAGAATTTGATGAATATACT
ATTTTAGGTCCTTTATGTTTTTTAAGTCGTATATTAAGGATGCTTTTAAA
TAATAAAAATGTAAGGAAGTTTTTGAATATTTTAAAATCATCACTATTTT
CTTGGAAAATGGAACCCTTGTATAAAATTTGAATGACCCTGAAAATTTCT
AGTCTGAATAGCAGACTTCTATAGAAATATTTCCTATATAGAAACCATTC
CGCTGGATGAAAAGCAGAAGCCTAGGATAAATTTCTGGAACAACAAATAA
CTCTAAGACCATGTTCACATGTTACCGTTCCGTATCGTTCCGGTATGATT
TTCGTTACGGATCGAGTGTGTTCATATTGGTTTCGGAACGTTTCAGAGCA
AGAAAACGGAGCAGTTTCGTTCCGACGAAAAAAAGTGGAGCGAAACCGTT
TCGATCTGTTTTGCTGTGTAACGTCTTCTTTTTTGAAGTTTCGAATTTCG
ACATTCACACTTGTTTCGAAACCCTTTCGGAACGGAACGGAACCGCGAAG
TCTGAACATGGTCTAAAGAGACAAGTTACTGAAATCTTCGTGTCGAAACC
TGTACTAGACCTTATCTCTCCCTTCTCCAGTTTTCTTCTCGTAGTAAAGC
AAGTGAAAAATCTGTTTTTGGTGAGGTACTGGCTAGTACTTATTTGCCAT
TTGTTGTCATTTCTTAGGAGTCATAACAATTTTTTGGTTACCTCTTAATT
TCATTATCCAAAGCTTTCGGAATTTCACTTTGAAGCCTAAACAAAACGAT
CTTTGTGACGCCTTATGAAAGTCGTTCCTAGACCTCATTCAAAACCAGAC
TTCAGCTCAGCTGGCAGCTTGGAGTACCAGTCTCAGTGAAACTTTTTGAT
AAAAATTTCCCTTTTTTAACGCAAAAATGAATCGAATACCCTAAGAAAAG
AAAAAAAGGAATGCCAAGATGCATTTAGTCGGAATCGCTTTCCCAACCTA
TAGAAATCTCTAAAAGAATCTGCTGAAAAACTTTGACATAAAAAACATTT
AACTTGGCTAAAGATATCCAAAAGAAAGACCTTTGTAACTAGACCATAAA
AGAGCTTCGATTAATAAAAGTATCATAACGCCCTCTCCTTCTTAAGCTTT
TTTCACATGCACGTAAAATTCGTTCGTGTCTTATGGGAATTTCTCCGACA
TTATGTAGAGTTTTTGTTGATTAAGAGGGTCTTACGTGACTTTTCCTTCC
ATTCAAAACTTTCTGAACGTAAGCAAACTCTACATATGGTCTTAAAACAC
TACGTAAGCTTAGGGAAATTCCCCACCCTTCAGGGTCTTCAGTAAAATTC
TACGTACATGTGAAAAAAGCTTTACAGATGGTTCTAACTTTATATTATTT
TTTCTGAGTAGATTCAGACATTTCTTTGAATGGAGTGGCAAAATTCGACG
AAATTCGACGGAAATTCTGAAATAGGTCCACTGAAGGAGAAGCAAATTCT
GGAAAAATTGAATTCAGTATATCTTGGTCGAGATTTCCAGAATTGTTTTA
CGAAAAATTTGAATTTCAAAGCAATTTTCGGCTTAGCTGGTGTGACGGGT
TTTTTGAAAGAATTAACGGAATGACGGAAACAGACATGCCCTTAAGGTAG
AATATTCAAGAAAACCAATCTTGAATTAAGAAGACGTGTTCATTAATCAG
AGAATTTTGAAATGTATTTGACATTATCTTTCTAGCAACATGGGTAGGAG
GAGGCTACATCAATGGAACATCAGAAGCAGTCAACCAACAGGGTCTCCTT
TGGGCCCAATCTCCATGGGGATACGCCCTCAGTTTAATTATAGGTGAGTG
ATATTTACTGCTTGAAATTTGCTCTACAGTGCTTAATTTCTCAAGTGAAT
CTCAACACGGTTCTATACTAAGAGATGACCATCTATACAATCAAGGATGA
ATTTTCGAGTTTTTTCCAATTTAACCTTTTTACTTAACATCGACCCGGTA
TATCATACGAATAAAAAACTCCACATGTATTCCATTAGGCGTGAAGTACC
AATTAACAGGTGGAGAATTTGGTCTATGACCGCAACGATGTCTCTAATTT
TAGCTATTTACAATTCCTGTGTTTTCTTTTGCCCTATTATTCAAATGGAA
AACTTAACTTCAATTTAAATAGGTTTCTGTGCTACCCCTTCCGTCATTTC
ATTCAAATGAAAAACTTCACTTCCATTTCACTAGGTGGTGTAATGTTTGC
GAAGATCATGCGAAAACGAGGCTACATCACGCTCCTTGATCCTTTCCAAG
AGCGATACGGTAAACGTGTGGGCGGGATTATGTATTTCCCCGCCTTCATT
GGTGAATTACTGTGGAGTGGCGCCACCTTGAAAAGTTTGGGCGCAACCAT
CAGTGTGGTGATGGACCTACCAATGAGCATCTCTGTCATCATTTCTGCTT
TCATTGCACTTGTGTACACGTTTTTTGGTGGTTTGTGGTCAGTCGCGTTC
ACAGATGTTGCCCAATTAATTTGTATGTTTATAGGAATGGTAAGTGAGGC
CGTGGCGGAAATAAATAAAATGATAACATTATTTCCAAACTTGTTGATTA
GCCTTAAAATTGATCGAAAATTCATTCATTTATAAGTAGAAGATTGTAAC
ACTAGTAAACGTCCAAAACGTCTAAAATTCCAATTTTAGGTCAATTTTTT
TAACAACTGGTATAATGACCAAAGCAAGAGTTTTTAAGAGCTCCATTGGT
GCAAAACCATTCGGGAGAATTTATATCATATCAATTCTTCAACACAATCA
CAACTCCAGATTTAGACAGACTACAACCTCGCTCCCTGCGTCTTTTCGGC
TTTTTAACGCTTACTTGATGGCGCCAGATAATACTCTCTGGCGTCCATCA
TCAGTAACGTAAATAAAGCCTTGAATACACGAGGACGAGATTGAACGGAG
CATTTCACTTGTTTCATTTATAGTGGTTGACCATTCCGTTCGCTATGTCC
AACGATGCCGTTCATTCCATTTCCTTGAACTCTACAAGTTGGACAGGTTC
TTGGGATACTGAGACTTTCTCAACTGGCAAATGGATTGATTTCGCTTTAC
TGTTGGTAAGTCAGTGTATTTATTTTTACGGTTGAAATGAATTTTGGAAT
TTCAGTCTCATTTAGGGTCACTTTTTTTCGCAAATAGTAAAATTTGAAAT
GAGTTCCACGTAGGGTCCATATTTCAAACCTCAGCGGAACACCCCCGTCG
GTCGGTAAAGATAGTCTCCCTCTCCCCGGGCTAAATGAATCATGGGTAAT
CAACACAAAGGCTAATAGAGTTATTGGTTAGAAGAGGGGTTTTGTGATCG
ACTCCTCTCTACTTCATGATTTCATGACATTTCATGACTCAGACTTTATA
TACAATGTGATTGTTTTAAGATTTTTGGAGGTATTCCATGGCAAGTATAT
TTCCAACGCGTTCTGTCATCCAAATCACACCATCGAGCACAATTGTTATC
TTATTTTGCTGCTTTTGGATGCATGTTAATGGCTGTTCCTTCAGTTCTAA
TTGGTGCTATCGGACATTCGACAAGTAAGACTTTCGCTTTTTTTGTCTGC
GTAACACTATGCCCAATTTTTTTACTAGCTGGTTGATGACCTCAAACTTT
CAGGCTAGGTGATATTGACTGCAACATCATTCCGTTATCCTCATTCCATT
GTCTATGAGAACACTTGCTCAGGACCTTTATCATTTGTTTGCCCTGTTTC
AAAACAGTCTTCAAAATTATTTTTTTTGGTGAATTGGCTGATTAAATTAT
AGTCAAAAAGTGTTGTCTCATTTACGTTTGGGTAGCGATAATCTGTGACC
TTAGGCAGCTCAAACAAAGTGAACAAGCCTTCATATTATACGTGCAAAAT
TATTCTTTAAAATCAACCCTAACATTCTCGCAGATTGGACAATGACAGAC
TACGGACCTTTACCGGAAGATGACAAAGATGCGATGCGCGATTACTACTC
AATGACCATGCCGTTAGTTTTACAATATTTGACGCCATTACCCGTCTCTT
TTGTCGGACTTGGTGCCGTATCAGCCGCTGTCATGTCGTCAGTAGATTCA
AGTGTATTGTCAGCGAGCTCCATGTTTGCACATAACATATATAGGACAAT
CTTCCGACAAACTGTAAGCTTCTTTGTTTAAAACTCCATACTTCGTAATA
ATTTAAAGACTAACTAAATGAATAATATTCCAGTCGCTTTTTTAGGCTAG
TCAAATTCAACCTTTATATGATGGTCTAGCAGCAACGAATTCATACATAG
TAGAAAGTTACCAAATGGTTTATAAAAAGAGATGTTATCCCGTAACAATT
ATCTATTATTATATAACACTCGTATAACACGACTCATGAACGAGTCCAAT
CTAACTTTAGGGTTAAAAGAATATTCTTTTGTAGCTATCACATGACCTGA
GAGAATAACCCGAGAGAGTGTAGTGTGTCTTCTTTATAATTGTTTTCTAG
AGAAAAGAATTGGGTTACGTCAGATTCTTACTTTTCATCTTTTCAGGCAA
GCGAGAAAGAGATGGTTTGGGTGATTCGAATTTCCATTTGGGTTGTTGGA
GCCATAGCAACCACAATTGCTCTAACTGTCAACACTATTTATGGATTATC
GTACCTGTGTTCAGATCTCATTTATGTCATCTTGTTTCCGCAGTTGATCT
GCGTTCTGTATTTCCGCTATTCGAACGCTTATGGAGCAGTCATCTCATTT
TTTGTTGGTTTGATTTTAAGAATATTAGGTGGAGAACCAATGATAGGTGA
GTGATGAATCTTTTGTTTTGGTGTTAGATGTAGTGTTAAAATCATTTAGA
GTCTTTTTTGCGAGGTCTTTATGTACGTGTTACAATCTCATAAATACGGA
GTTTATAAAAGCATATAATTACATATCTCTTAAACTTATACCCATTTGAT
ATAGTAGCAAGATCCAGGGTCTTTAACTCTTAAGCTATTTGATTCCCCTA
TTTGATACGCTAGTATCTTGAAATATCCAGGGCCTCTCCTTAACTATCAT
ATTTTTTAATTCATACCTAAATAAATAATTTCACTGCTTCCTCTATCCCT
CCATTCTCTATCACTACCTTGTAATATTATTTCCCACAGGTCTACCAGCA
GCTATAGAATATCCTGGTTTCGATGGTACGCAAAATTTCCCTTTTCGCAC
TTTCTCAATGCTGGTGACTATATTCATTCTATGGTCCACATCCATCGGAT
TTCATCTGCTGTTTGAGAAAGGCGTACTACGCCCTGAGCACGACGTCTTT
GATTCCTTCAACGGACGAGAGATCCATCCGTTTAGTTTCTCTGATATGAT
GGTAATTGGAGGTGTAAAAGTTGATGAAGGTTTGGTAGATGGAGCTACCG
AGATTGATGGTCAGAACAGCTCTTGTGAAGAGAAGGAGGAGAAGAATGAG
AAATGGTTGAACGGAGCGAACGGAAAGCACGAAGAAGTTGAGCTACTGAA
TAAGAATAATAATAATGGTCAATCTTCGGCACCGGTTATTTTGTAG Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000100_pilon:1152460..1158705- >XLOC_036636 ID=XLOC_036636|Name=XLOC_036636|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=3558bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000100_pilon:1152460..1158705- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ATGGCGTCGATAAATTGGTGGGGATTGGCTGGTATTATATTATTTTATGT
CGTCATTCTTGTGATTGGTTTGTTGGCTGCCCGATATCGGAACAAACGAA
AGCAGGCGGCGGGCAGTGAAGGGCGTGGGGAAGAAGAAGTCATGTTGGCG
GGAAGAAGTATCGGCTTGTTTGTGGGCGGATTTACAATGACTGATGGCGT
CGATAAATTGGTGGGGATTGGCTGGTATTATATTATTTTATGTCGTCATT
CTTGTGATTGGTTTGTTGGCTGCCCGATATCGGAACAAACGAAAGCAGGC
GGCGGGCAGTGAAGGGCGTGGGGAAGAAGAAGTCATGTTGGCGGGAAGAA
GTATCGGCTTGTTTGTGGGCGGATTTACAATGACTGCAACATGGGTAGGA
GGAGGCTACATCAATGGAACATCAGAAGCAGTCAACCAACAGGGTCTCCT
TTGGGCCCAATCTCCATGGGGATACGCCCTCAGTTTAATTATAGCAACAT
GGGTAGGAGGAGGCTACATCAATGGAACATCAGAAGCAGTCAACCAACAG
GGTCTCCTTTGGGCCCAATCTCCATGGGGATACGCCCTCAGTTTAATTAT
AGGTGGTGTAATGTTTGCGAAGATCATGCGAAAACGAGGCTACATCACGC
TCCTTGATCCTTTCCAAGAGCGATACGGTAAACGTGTGGGCGGGATTATG
TATTTCCCCGCCTTCATTGGTGAATTACTGTGGAGTGGCGCCACCTTGAA
AAGTTTGGGCGCAACCATCAGTGTGGTGATGGACCTACCAATGAGCATCT
CTGTCATCATTTCTGCTTTCATTGCACTTGTGTACACGTTTTTTGGTGGT
TTGTGGTCAGTCGCGTTCACAGATGTTGCCCAATTAATTTGTATGTTTAT
AGGAATGGTGGTGTAATGTTTGCGAAGATCATGCGAAAACGAGGCTACAT
CACGCTCCTTGATCCTTTCCAAGAGCGATACGGTAAACGTGTGGGCGGGA
TTATGTATTTCCCCGCCTTCATTGGTGAATTACTGTGGAGTGGCGCCACC
TTGAAAAGTTTGGGCGCAACCATCAGTGTGGTGATGGACCTACCAATGAG
CATCTCTGTCATCATTTCTGCTTTCATTGCACTTGTGTACACGTTTTTTG
GTGGTTTGTGGTCAGTCGCGTTCACAGATGTTGCCCAATTAATTTGTATG
TTTATAGGAATGTGGTTGACCATTCCGTTCGCTATGTCCAACGATGCCGT
TCATTCCATTTCCTTGAACTCTACAAGTTGGACAGGTTCTTGGGATACTG
AGACTTTCTCAACTGGCAAATGGATTGATTTCGCTTTACTGTTGTGGTTG
ACCATTCCGTTCGCTATGTCCAACGATGCCGTTCATTCCATTTCCTTGAA
CTCTACAAGTTGGACAGGTTCTTGGGATACTGAGACTTTCTCAACTGGCA
AATGGATTGATTTCGCTTTACTGTTGATTTTTGGAGGTATTCCATGGCAA
GTATATTTCCAACGCGTTCTGTCATCCAAATCACACCATCGAGCACAATT
GTTATCTTATTTTGCTGCTTTTGGATGCATGTTAATGGCTGTTCCTTCAG
TTCTAATTGGTGCTATCGGACATTCGACAAATTTTTGGAGGTATTCCATG
GCAAGTATATTTCCAACGCGTTCTGTCATCCAAATCACACCATCGAGCAC
AATTGTTATCTTATTTTGCTGCTTTTGGATGCATGTTAATGGCTGTTCCT
TCAGTTCTAATTGGTGCTATCGGACATTCGACAAATTGGACAATGACAGA
CTACGGACCTTTACCGGAAGATGACAAAGATGCGATGCGCGATTACTACT
CAATGACCATGCCGTTAGTTTTACAATATTTGACGCCATTACCCGTCTCT
TTTGTCGGACTTGGTGCCGTATCAGCCGCTGTCATGTCGTCAGTAGATTC
AAGTGTATTGTCAGCGAGCTCCATGTTTGCACATAACATATATAGGACAA
TCTTCCGACAAACTATTGGACAATGACAGACTACGGACCTTTACCGGAAG
ATGACAAAGATGCGATGCGCGATTACTACTCAATGACCATGCCGTTAGTT
TTACAATATTTGACGCCATTACCCGTCTCTTTTGTCGGACTTGGTGCCGT
ATCAGCCGCTGTCATGTCGTCAGTAGATTCAAGTGTATTGTCAGCGAGCT
CCATGTTTGCACATAACATATATAGGACAATCTTCCGACAAACTGCAAGC
GAGAAAGAGATGGTTTGGGTGATTCGAATTTCCATTTGGGTTGTTGGAGC
CATAGCAACCACAATTGCTCTAACTGTCAACACTATTTATGGATTATCGT
ACCTGTGTTCAGATCTCATTTATGTCATCTTGTTTCCGCAGTTGATCTGC
GTTCTGTATTTCCGCTATTCGAACGCTTATGGAGCAGTCATCTCATTTTT
TGTTGGTTTGATTTTAAGAATATTAGGTGGAGAACCAATGATAGGCAAGC
GAGAAAGAGATGGTTTGGGTGATTCGAATTTCCATTTGGGTTGTTGGAGC
CATAGCAACCACAATTGCTCTAACTGTCAACACTATTTATGGATTATCGT
ACCTGTGTTCAGATCTCATTTATGTCATCTTGTTTCCGCAGTTGATCTGC
GTTCTGTATTTCCGCTATTCGAACGCTTATGGAGCAGTCATCTCATTTTT
TGTTGGTTTGATTTTAAGAATATTAGGTGGAGAACCAATGATAGGTCTAC
CAGCAGCTATAGAATATCCTGGTTTCGATGGTACGCAAAATTTCCCTTTT
CGCACTTTCTCAATGCTGGTGACTATATTCATTCTATGGTCCACATCCAT
CGGATTTCATCTGCTGTTTGAGAAAGGCGTACTACGCCCTGAGCACGACG
TCTTTGATTCCTTCAACGGACGAGAGATCCATCCGTTTAGTTTCTCTGAT
ATGATGGTAATTGGAGGTGTAAAAGTTGATGAAGGTTTGGTAGATGGAGC
TACCGAGATTGATGGTCAGAACAGCTCTTGTGAAGAGAAGGAGGAGAAGA
ATGAGAAATGGTTGAACGGAGCGAACGGAAAGCACGAAGAAGTTGAGCTA
CTGAATAAGAATAATAATAATGGTCAATCTTCGGCACCGGTTATTTTGTA
GGTCTACCAGCAGCTATAGAATATCCTGGTTTCGATGGTACGCAAAATTT
CCCTTTTCGCACTTTCTCAATGCTGGTGACTATATTCATTCTATGGTCCA
CATCCATCGGATTTCATCTGCTGTTTGAGAAAGGCGTACTACGCCCTGAG
CACGACGTCTTTGATTCCTTCAACGGACGAGAGATCCATCCGTTTAGTTT
CTCTGATATGATGGTAATTGGAGGTGTAAAAGTTGATGAAGGTTTGGTAG
ATGGAGCTACCGAGATTGATGGTCAGAACAGCTCTTGTGAAGAGAAGGAG
GAGAAGAATGAGAAATGGTTGAACGGAGCGAACGGAAAGCACGAAGAAGT
TGAGCTACTGAATAAGAATAATAATAATGGTCAATCTTCGGCACCGGTTA
TTTTGTAG
Gene-mRNA-Prot
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Position
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
|---|
| sc0000100_pilon | genome | sc0000100_pilon:1152460..1158705 - |
Properties
| Property Name | Value |
|---|
| Aaloc | 1375-1779:406 |
| Aaloc | 1123-1371:1001 |
| Aaloc | 895-1122:1612 |
| Aaloc | 739-891:2127 |
| Aaloc | 607-738:2574 |
| Aaloc | 304-606:3311 |
| Aaloc | 196-300:3810 |
| Aaloc | 1-192:6247 |
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