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Sequence
The following sequences are available for this feature:
mRNA from alignment at sc0000034_pilon:1047491..1056078- Legend: polypeptideCDS Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >XLOC_036628 ID=XLOC_036628|Name=XLOC_036628|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=8588bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000034_pilon:1047491..1056078- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon) ATGTCAGCTCGCTGCACTAGGTTCAATCCCTCGTCCATATATTATACTAT
ACATGCTCAACAGTGCTCAAACCTTAGTAAAAAAATTTTTTTCAGTGATA
AAAATATGTCGCACAAAGAAATTGTATCTGGTATAAATAAATTTACAAAG
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TTCCGTCTGCAAACCTAAACCAATACATGTTCATTAAAAGGAAAGGTAAA
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AGTGATACTTCGTTTCAGTCTGAAACTATGCTTAGCTGTGTGCTTATCAG
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AGCCGCAAGGTTTATTCATTTTGCCACTTTTTTATCAGCTTATGATAACA
ATCCACAAGCCCATAAAAGTGACTGCTGACAATTTACCTTTGGTGAGACA
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AAGCAAAAATTGTATACAACAACTTAATGCTGGCAGTAACAGTTTTGGCA
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CTTCAGACTCTTGCTCTTTGAAAAGTAACCATTAGTACATAAATAATCAT
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ATTTGTAAGCACTAGGTAATACACAGAAAATTCCCTTTAGAAAATTAACA
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TCTGGTCAGAGAATTTCCTCCCGATTTTTACCAGTTTACTCCAAACTAAA
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GTAATCATTTAGTCACTCTGGGCATCTGACAATAATGTTGATTTTTTCCC
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TAAATGCAGGTCTTTTGAAGATGTCTTCGATAAGTTCAGGGCAAGAAGCA
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TTCCGGATTACTGTAAGGGAATAAATTAATGTGAGAATAAATTAAGGTGG
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TAATTTATTCTTGCATTAGTTTATTCCCTTAAGGTAGGCAAGTATTGCCC
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TTTTTAATTATTCCAGCAGAGATTTTTTTCTACTATGGATTTCATATTTC
TTTAGAATCAATGTTCCAGCGAAAATATTTCTCTTCTACACCACCAGTCT
TACTTCTTTCTATGGAATGGTTGTTGCAAAAGGTAAAATTTTTTTATTAA
TTTAATAGCCAAGGAGAAACTCCTCAAAATGACAGATTTAGCAGATTTAG
TGTTTTGTATTATTCAAGTCATAAAATAACCCTGTCAAAGAAAATAAAGC
TGTCAGGATTTCTGGAATTTACAACTGGGTCTCCAAATGATACTATACAT
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GGACGAATACAGAATCAAAATGGTTGTTGTGACACATCAAAATCATTCGA
ATGTGTTAGTTCAATCGAATGACCTTGTTTGGTGAGTATGTTATTTGAGA
AAATCAATGAAACATATGTATATTCATTATATACCTGTAAATAAATGACG
CTTCGCAATGTTGAATATTATTCATACCACCTTGGTTTAAAAAATCATGA
TAACCAATGCTTCTCAAATGTTTTTTCTATCCTCAAATGCGATGATGACA
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TGAAAGGAGGTCTTTCTTACCCTGGGCTAGAAACCCAAATTTAAATGAAA
AATAAAAATAAAAAAATAAATTGGCATATTTTTACATCAAAGAAATGCAG
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TGGGACTTGACATTTTGCAAAAAAACATGAAAGATTAAATTTGTGTTCTC
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TTATTATTCTTTTCTTTAGGAGAATATATGGAAACGGAAAATTGAAAATA
AAGACCAAATTTCAAGAACTTTTACATTTTGAATGTGTTACAATCGGTAA
GGGTTTACTTTTGTTCAGGGACATTATTGTGTCCTAGCAGATTTTACATT
ACACACTTTATTTTATGATAATAGGTTCTATAAGAATATAAGGTTAAAAA
TTGCCTAAATTGTAAGGATATCTTAAGAATATTCCCAGCATGAGTTTCGT
GTAAATTAAGTTTTTGTCAAACACAAAATTATGGAAATCAAAATAAGACA
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TTACAAGATGCTTAACTGATTGGTTATTTCTAAACCATAGGGACGACGCG
TTCTTTAGGAAAAGTAATAAATACGTTTGTCTCAACATTTAACGATCAAT
AGAGTCATCAAAGAGCTTGTAAAAACTCCAGCTTGACCCGAAATAACACA
ATGATACTAAAAATATATGCCTTAACATCAACATGTACATGGAAAGTTTA
AACAGAAACTTTTTTCTGATCCTGAAAGATTATAATATTTTATTTTGCTA
AATCATAAGAATACTTCACCGTCAATGAAAAACACTATTTTTATTTTATA
AAAAGTGCTTGTTTAAAGCTTACAGTGTTTCTAGAAAATACCCGAAAGTT
ATGTTCACTTTTATATATTTTTCTTTTTAGACTTGATCGTTTACAATAAA
GATTGCAAGCTTTTAATGGCAGTCGAAACTGACCTTTTGGGAAATGGGAA
GTTTTTAATGGACAGGTAATCATTTTAAATAATTTAATCGTAGAATTTTA
TATACATTTATATACATTACATTTACATAGAATATTTCAACTTCTTGTAA
AAAGAACCAATATACTTTTGGAGATCAAGAAATTAATGGTGAAAATTAAT
AAATAAATAAATAGGTCTGACAGGTGGCTATTAAACTCTTCCTTTATTAG
GTTTCTTCTGGCATCCAAGGACAATACCAGATAAAAGGAGCTATAATAGT
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TTATTCTCTTGATTTTGTCATTTAGATTACAAGAAAGAAAACAATCAATG
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AAATAACGCGATGCAGAAATTAAACATTTTGGAAGGCACACACAGAAAAT
GGGACTGAAAACAATTATTAGATTTCCAATTTCAATTTCAATTTCATCCA
GTTACATCACGTGTTAATGCTCGAACAAAATAATAATTAATCGTTTCCTT
GGGACATCTAGATTAAATCTACCATTGAAGAAAGACAAAATTTGATGAAA
TGAAATTACAATGTTCATAAAATTCTTTTCCCAACATTTTTGATGAAACT
TAGAAGAATTACCCCCATATTTTGTAACGTCAATCGTTTGAATGACAACA
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ATAAGCATATGAAAATTTGAAGGTCAGGCTCGTCGATATGCTTTGTTCTT
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TGGTTGTTGATATTTCCAGATTTATTTTTCCAGAATTTTTGATACAATGG
TATTTTAGATATTCTATTATAATATTGCTCGAGCTTTTTTAATGGTTTGT
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GCAGTAACAAGGTTCTTAGAAACAACCCTAGTTGACGTGTTTCAATAATA
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TAATCACAAACAAGTAATTCTTGAAAATTTCTGTCCGTCAAATTTACTAA
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TTAGAAGACTTAGAAGGAATCATGAAACGACACCTCGGCACTATTTATGG
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TTGACAAAAAACGGGGAAGATCTACAGACATTTCTCGCCTGCATATGCTG
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AGGTAGGTGTCCCTACATTTTTATTAGTACTAGTAAATCGCATGTTTTGA
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GACCCACATTTTGAAACTGCTTCGCCCGTAAAACAACAAATCAATTTGGA
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TTCTATTGAGTTTTGTTTCCTCTTTCACAACAAAAGAATTAAGGGGTCAA
GCCCAAACGTTAGTTCTCCTTTAAAGAAAATAGGTAAAAAATTCGAGTCT
GTGTTTGACATTTAAAGTGTAATTCTTCGGAAAGAACAATAACAGATTAA
TATTTTACTCAAAATCCTTCTCAACCAATGTGATTTGAGTAATAGTGATT
AAATTTACAATTTCAAAATCAATGGGCTGTTTCAATTTCCTTTTATTTAT
AATCACTTTCAGGTATTCTTAAAGATATTGGAATTTTGAAGAAGGGACAT
CTAGTGGAGGTTCAACGCTCCGAACTGGTGTCCCCCTACATTGGTGGTAC
AAGCCAAAAAACAAAGGCAGTGTTGAAAAAAGCAAAAGGGGGGGTTTTGT
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AAGGAAGCCGTCGAAACTTTGATGTCTGAGATGACGGAACCAGATTGCCC
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TTTTCCACGCTTTCCACCATTCAAGACTGGAGAACTGTTAAACGAATGTT
TTCGGAAGCTCTCCAAGGAGGTAATTTCTAAGCACAATGCTGCCCTGTGC
ACCGACCTGATCGACCAGATCCAAACCGCTCAGGAATCAAGGTTGCCTCA
GGACTGCTCTGACGCGGACCTTCGAAAAGTCACCGAGGATGACCTAAAGA
TCGGCATTGAAGCTTTTTTAAAATGCCACGAAGTAAAACCAACGAATGAA
AAGTTGGACTCTGGGGATGGCGATATCAATGAGCCAGAGGTGTGTTGGAG
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Gene-mRNA-Prot
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Position
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
| sc0000034_pilon | genome | sc0000034_pilon:1047491..1056078 - |
Properties
| Property Name | Value |
| Aaloc | 2002-2775:775 |
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| Aaloc | 1339-1413:4932 |
| Aaloc | 1216-1335:5518 |
| Aaloc | 1123-1212:5840 |
| Aaloc | 970-1122:6402 |
| Aaloc | 832-969:6790 |
| Aaloc | 760-828:7577 |
| Aaloc | 1-759:8589 |
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