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Sequence
The following sequences are available for this feature:
mRNA from alignment at sc0000064_pilon:8236..12773+ Legend: polypeptideCDS Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >XLOC_036597 ID=XLOC_036597|Name=XLOC_036597|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=4538bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000064_pilon:8236..12773+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ATGGAGCTTAGATTAAAGAATGTGTTAATGTTATTAGTCCCTTCATCAAT
CTTGAGTTTCACTTACTTTTGGTGGTGGCAAAAGAAGATTAAAGCACCTG
AAAAGGAAGACAAAACCTTAAAACCAGAGGTAGTAGAAGAACCTATTGTC
ACTTTCAAAGATATATAGAAGAGGAGCTTGTGGAAGAAATTCTTGATAAT
GCAGATACTTTTGACGACTCTTTAAGTTTACATGAATTCAATCATGGTTC
TGTTAAAAGAAAAAGGGAACACAGCAGTTGTGATGCAGATAGTGCGTATG
TAGAAGACTTCAGTTCAGATAATGTCTCTATTACTGGATCAGACACAAAC
AGTAATAAAACAACAAGTAACCCAGATACAACCAATGCATGCGATGACTT
TCAACCAGATGAAGTGATTGAAGCTCCTGTTTATGAAGAAATTATAGCCC
CTGAAGTCTCAGAGAGTGTTGAAAGTGCTCCAAGCAATAACTTTAGAGAC
TGGTTCAGTCCAGCTCCTGTAATTATAACTGAAGATGAAAATCATAACAA
ACCTGCATGTGAGGATAAAATTTCTTCTGAGGTGTGTCAAAATGTTGAAA
GCGCACCTGACAATAACTTCCAGGACTGGTTTAATTCTGGATACGAGAGT
GATAAAGAAGAGAAGGATCGTATAGAAATTCATTGGGGATCTCAACCTGT
ATCAGATTTTGAAGCTgacactgaaaatcaaacagtCAAAGATTATGTTG
GAGGTGTTGCCATAGAAAACCTCAGTATCGTTCTGGAGCGAGAGTACAAC
gaaagaaaagcaaagaacttaaagaaaactgaaaaggttaaatctactcc
caaaaagtctccacgatctccaaaaaagtctccaagaactcccaaaactc
caaaaTCTTCAGACTCTCGTTTCCCTCCAAAATCACCGAAACATAAGAAA
ACACCCAAACGTAAAGATCGGGAAATGGAAAAACCTTGGAGAAATGAACC
TGAAAAGGTAGAATCTCCAGAAGATGGATCGGATTCTGAAGTTTTTCCTC
TCTATCCTAATGACTTCGTTGTAATGGAATATACTGTAGCTGAAGATTTA
TGCGGTAAAATTATTGGCAAACATGGAAAAGCAGTAAAGGACATTAATGA
GAAAACTGGTGCATTTGTTTGTATTGAAGCTGAAAAAGTTGGACCCAAAt
gtgttttgagcattgctggTCTTTATTGCCAAGTTCAAGATGCTGAAAAG
GCTTTAatgacaaaacacaaaaatgctttgaaaagaCATGTTTCACAATG
GCCAGCCAACAATGAAGTTCAAAATTCTATTTTGCCATCTGATGATTATG
TTAGTGTTATTGTTACTGCTGTGATTAATGCTGGGAATTTATTTGTTCAA
GTTTTTAATAGTGATGTTGATAGTAACCttattcaacttcaaaaagattt
ggaTATTGCTTACAACCAACCACCACAAAGGCTCATGTACCATGAATCAC
GAAAACCAACTATTGGTGAAATTTGTATCTCGTTTATTGATAATATGTGG
TGTCGAGTGAGAGTTGTGGAACATTCAAGTGAGTCACAAGTTGTTGTTGT
GTTTGTCGATTATGGTGGCAGCGTTGTTATTGATTGGCATCTCCTCTATA
AAATCAGGTACTCGTTTTTCCTTTCTAATCATtttctaccttaagggaag
aaatatttgcggaatttaatttcgcgaatcagattttcaaaatggcaaat
tttgcggaatttaatttcgcgaatgagccgatttcaaaagtttcacggaa
ttttgattgtttgacaGTCATCATTTCAaacctaattatttttttcttta
tacagGGATCCTTTCCTTGAGCTTCCTGCACAAGCAATCCAATGTTACAT
CACTGATTCTTACCCATTGCCAAGTAAGTAGATAAACTTTCAATCGAGAA
CCAAAGTTATAGTTTGcttttaataaaaatggaatttaAGCTACCTTAAG
TGTATGTTTTTGCTGGCACTCAATTTTTGCTTGTACTTAATTTCGCTAGT
gtttaaacaaaatttcaaaatttagtactgtttaaatttttcaaaaacac
aaaatcgtgaaattttataaaaaaaaatcataataagccaaaaatcacga
aattttgatagttcaagagagaaggattttttttaatttttttgttattt
tgttacaattttgatactatttttgcactataacacgttttgtttCAAGC
AAATTCAATCTTCTTGTTTTAAACcctttttcttccaaaatatcTTTAGT
GAATCGTGAAcattaatacacgcgaaaactTGTAGAAAGTGTTATATGAA
TATgttcaaatattgaaaaattttacactcttacagtgcactttgggaag
cttagAAAAGGGCCGCACACATCGttggtcgtttaccttgactGTGTGTA
GGCCTCTGTGAAGACTCATCGCCTAATAATATTGATGGTCCATTTTCCTT
TCAGATCAAGCTGATTATTCCTATTCAGCAAATTTGACATTGAATCAAAT
GATTGAAGGAAAAGTATTACATGCCTATGTTCATGGATCGTGCAATGACA
TTCCATGTGTCGAGTTGTTTTACACTAATGAAGAGACGAATGAGGTAAAA
ATATATACTATTCTCACCTTCTGTTAAACTAGAACCTGAAAATGTCTAAG
TGGAAGTGCTGTATAGCCAACGGTGGGGGCAGTAGTTTTTAGTGATGGGT
TCTTAAAGACGACTACAGTAGATTCCCGGTTATTCAAACCTGCCcctttt
caaataatttaattaTTCAAAGTGAGCTGGCGTTTCCCCTTGGATCTGAT
TACCCAACTCAGGCAAAACAGCGACCCATGAATtccttgaaacacccttg
atttttttcctgcccttgaaaatttccttgaaacccttgaaatttcaaat
tttgtggcccttttcagccattttaacattcagaaatacaaaattttccc
CACTGTTTGGGATACAAACATCAGCGAATTAAATTAGAATACATAACCTC
TAAGATTCAAGGGGTTTACCCTTGAATTATATGAGATCGGTAAGTCTGgg
tggttgtaaaattaaactaTCCTCTGATTTGTGTTCATTTTCAGCCAATC
TGAAGAACTGAAAATCAATAATTTTCTCCGTCGAGTCCCAGCGGGCCCAA
CTATAGTTGGGCCTTCCTATACCACAACTATAAAGAAAGTTTCTGCTGAA
GAATGTTATTGAGGTTCTGTTTGATTTATTGATTCATATGTTAAAGAAAA
CGGCTTAggcagtagcggcctggcttaattttcttggtggtgcaaactat
gaaattggcgcccctggtatttttgtccttatttgcgccctccatgatta
agtgaaaatactaaactgtaagagcagtgactggttgaaagtaacgcccc
taatctttgaaatggaaattttatacctgGTAAGTCGAGTCagtctatat
ttttgctttcttaaactcttatcagaaaaattaccagataatctttaaac
ttttgcgcCGCTGGTCTTGCTCTACTCTCTATTAAATCAATGGCTGAAAT
AGGGCAACAATTCAGAAGTTGGGAGGaagggttctttgtaattctggcgc
cgcaggcaaaaaaactTGGTGTAAGAACGGTGAAAGTTAGTCagtataag
accacaaaaaccacagcgagaatcaacaagttttgatcattttggcaatc
tctcattttgggggtgagcattctctttaacccctggtggatacacaaca
cttctcttacttctgattcaatattgataaaagttttgaaaaaattcaaa
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cattgtacTCATAGTAGCGGCGCTATAAACGTGCCGAAGGGCGCCAAATT
tcccaattaaacatcaacaaaattttggcgcccccttaaaaagctctttt
ggcgcccctctcagatctttctgggtggtgcactgcacaccctgcacccc
ctgccaggccgccactgctTAGGGTATTTTATGAGGATTTAAcaacttga
gagttgaaaattcaacctTCCCTTATTGTCGGCAGATTTCCTTGAAATCC
TTGAAGAGGCCTCTCCAGCGGTTGACGTGATCAAtgtgatcgtgatagaa
aggaaatttaactcgtgataacgtgatttggatttttttgcgtgatttga
aagatgaCTGGGGGGTTGAAAATTAGCAAAGATCAACTAAGAGCCCTTGA
AACCCTGGAAAATTAGTCAATAAAAtggtttttatcaatttttatacAAT
TTGGCGTCGACCAGTTAAGCAACTTTACTTTTTCCATTTTATAGGATGTC
AGTGTAAATGGAAATTTGGTGAACTGGGGATTGGTATCAGCATATGCACC
AATCATAATCGACGATTCTCAAATGATCGAAGTAAATGCAGTTGTTCCCC
AAGAGGTTAGTCCTGCACCAGTGACTGTTGAACAATGA Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000064_pilon:8236..12773+ >XLOC_036597 ID=XLOC_036597|Name=XLOC_036597|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=4018bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000064_pilon:8236..12773+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ATGGAGCTTAGATTAAAGAATGTGTTAATGTTATTAGTCCCTTCATCAAT
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CTGAAGTCTCAGAGAGTGTTGAAAGTGCTCCAAGCAATAACTTTAGAGAC
TGGTTCAGTCCAGCTCCTGTAATTATAACTGAAGATGAAAATCATAACAA
ACCTGCATGTGAGGATAAAATTTCTTCTGAGGTGTGTCAAAATGTTGAAA
GCGCACCTGACAATAACTTCCAGGACTGGTTTAATTCTGGATACGAGAGT
GATAAAGAAGAGAAGGATCGTATAGAAATTCATTGGGGATCTCAACCTGT
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GAGGTGTTGCCATAGAAAACCTCAGTATCGTTCTGGAGCGAGAGTACAAC
gaaagaaaagcaaagaacttaaagaaaactgaaaaggttaaatctactcc
caaaaagtctccacgatctccaaaaaagtctccaagaactcccaaaactc
caaaaTCTTCAGACTCTCGTTTCCCTCCAAAATCACCGAAACATAAGAAA
ACACCCAAACGTAAAGATCGGGAAATGGAAAAACCTTGGAGAAATGAACC
TGAAAAGGTAGAATCTCCAGAAGATGGATCGGATTCTGAAGTTTTTCCTC
TCTATCCTAATGACTTCGTTGTAATGGAATATACTGTAGCTGAAGATTTA
TGCGGTAAAATTATTGGCAAACATGGAAAAGCAGTAAAGGACATTAATGA
GAAAACTGGTGCATTTGTTTGTATTGAAGCTGAAAAAGTTGGACCCAAAt
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GCTTTAatgacaaaacacaaaaatgctttgaaaagaCATGTTTCACAATG
GCCAGCCAACAATGAAGTTCAAAATTCTATTTTGCCATCTGATGATTATG
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GTTTTTAATAGTGATGTTGATAGTAACCttattcaacttcaaaaagattt
ggaTATTGCTTACAACCAACCACCACAAAGGCTCATGTACCATGAATCAC
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TGTCGAGTGAGAGTTGTGGAACATTCAAGTGAGTCACAAGTTGTTGTTGT
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GCACCTGAAAAGGAAGACAAAACCTTAAAACCAGAGGTAGTAGAAGAACC
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TGATAATGCAGATACTTTTGACGACTCTTTAAGTTTACATGAATTCAATC
ATGGTTCTGTTAAAAGAAAAAGGGAACACAGCAGTTGTGATGCAGATAGT
GCGTATGTAGAAGACTTCAGTTCAGATAATGTCTCTATTACTGGATCAGA
CACAAACAGTAATAAAACAACAAGTAACCCAGATACAACCAATGCATGCG
ATGACTTTCAACCAGATGAAGTGATTGAAGCTCCTGTTTATGAAGAAATT
ATAGCCCCTGAAGTCTCAGAGAGTGTTGAAAGTGCTCCAAGCAATAACTT
TAGAGACTGGTTCAGTCCAGCTCCTGTAATTATAACTGAAGATGAAAATC
ATAACAAACCTGCATGTGAGGATAAAATTTCTTCTGAGGTGTGTCAAAAT
GTTGAAAGCGCACCTGACAATAACTTCCAGGACTGGTTTAATTCTGGATA
CGAGAGTGATAAAGAAGAGAAGGATCGTATAGAAATTCATTGGGGATCTC
AACCTGTATCAGATTTTGAAGCTgacactgaaaatcaaacagtCAAAGAT
TATGTTGGAGGTGTTGCCATAGAAAACCTCAGTATCGTTCTGGAGCGAGA
GTACAACgaaagaaaagcaaagaacttaaagaaaactgaaaaggttaaat
ctactcccaaaaagtctccacgatctccaaaaaagtctccaagaactccc
aaaactccaaaaTCTTCAGACTCTCGTTTCCCTCCAAAATCACCGAAACA
TAAGAAAACACCCAAACGTAAAGATCGGGAAATGGAAAAACCTTGGAGAA
ATGAACCTGAAAAGGTAGAATCTCCAGAAGATGGATCGGATTCTGAAGTT
TTTCCTCTCTATCCTAATGACTTCGTTGTAATGGAATATACTGTAGCTGA
AGATTTATGCGGTAAAATTATTGGCAAACATGGAAAAGCAGTAAAGGACA
TTAATGAGAAAACTGGTGCATTTGTTTGTATTGAAGCTGAAAAAGTTGGA
CCCAAAtgtgttttgagcattgctggTCTTTATTGCCAAGTTCAAGATGC
TGAAAAGGCTTTAatgacaaaacacaaaaatgctttgaaaagaCATGTTT
CACAATGGCCAGCCAACAATGAAGTTCAAAATTCTATTTTGCCATCTGAT
GATTATGTTAGTGTTATTGTTACTGCTGTGATTAATGCTGGGAATTTATT
TGTTCAAGTTTTTAATAGTGATGTTGATAGTAACCttattcaacttcaaa
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GAATCACGAAAACCAACTATTGGTGAAATTTGTATCTCGTTTATTGATAA
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TTGTTGTGTTTGTCGATTATGGTGGCAGCGTTGTTATTGATTGGCATCTC
CTCTATAAAATCAGGGATCCTTTCCTTGAGCTTCCTGCACAAGCAATCCA
ATGTTACATCACTGATTCTTACCCATTGCCAAGGATCCTTTCCTTGAGCT
TCCTGCACAAGCAATCCAATGTTACATCACTGATTCTTACCCATTGCCAA
ATCAAGCTGATTATTCCTATTCAGCAAATTTGACATTGAATCAAATGATT
GAAGGAAAAGTATTACATGCCTATGTTCATGGATCGTGCAATGACATTCC
ATGTGTCGAGTTGTTTTACACTAATGAAGAGACGAATGAGATCAAGCTGA
TTATTCCTATTCAGCAAATTTGACATTGAATCAAATGATTGAAGGAAAAG
TATTACATGCCTATGTTCATGGATCGTGCAATGACATTCCATGTGTCGAG
TTGTTTTACACTAATGAAGAGACGAATGAGGATGTCAGTGTAAATGGAAA
TTTGGTGAACTGGGGATTGGTATCAGCATATGCACCAATCATAATCGACG
ATTCTCAAATGATCGAAGTAAATGCAGTTGTTCCCCAAGAGGTTAGTCCT
GCACCAGTGACTGTTGAACAATGAGATGTCAGTGTAAATGGAAATTTGGT
GAACTGGGGATTGGTATCAGCATATGCACCAATCATAATCGACGATTCTC
AAATGATCGAAGTAAATGCAGTTGTTCCCCAAGAGGTTAGTCCTGCACCA
GTGACTGTTGAACAATGA
Gene-mRNA-Prot
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Position
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
|---|
| sc0000064_pilon | genome | sc0000064_pilon:8236..12773 + |
Properties
| Property Name | Value |
|---|
| Aaloc | 1864-2007:4395 |
| Aaloc | 1726-1863:2507 |
| Aaloc | 1657-1722:1857 |
| Aaloc | 163-1653:165 |
| Aaloc | 1-162:1 |
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