XLOC_036580 (mRNA) -

Overview
NameXLOC_036580
Unique NameXLOC_036580
TypemRNA
OrganismClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon (Jellyfish)

Sequence
The following sequences are available for this feature:

mRNA from alignment at sc0000356_pilon:285155..293277+

Legend: CDSpolypeptide
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>XLOC_036580 ID=XLOC_036580|Name=XLOC_036580|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=8123bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000356_pilon:285155..293277+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
CAAAATCTAACGCAACCAAAACTGTTTGGTTTCTCAGAAAAAGAAGCCGA GAGTTTTCCAAGTAGAATTAGTGAAATTATCATACCTTTTACTGGAGAAT GTGACTCAACGAAATTAAGCAAATATACAGGAAAGCTGATCGAAGTgtca gatattttgaaaaagaacacaTGTAATGGTCAGCATCCAACCATACCAGC AAGGACAATAGCGAGGCGTGAAGCAGTCATGAGCTCGCCTATTCAGAATG CAGATGGTAGCGTTACAACGGTGAggaattgtttcatcaagggtACATTG ACAAGGAACAACAATTTGAGATTGTGCAGTGAATGTCAAGCAGTGACTCG ATTACCTGATAATGTGTAAGTTAATTTCTTTGGTGTTTTTAGTAGCTGAT GAGGATGATatgggtcctactccttacgaagtaggaattccttctttttc atattgggacgcttagcgctgtccagacatcactggttctgtgcacgcga GACACGGATACCATGATGCATGGTGGTGACACTGGTGTTTTTATTAGCTA ATGAGATTAAATTCATCTATGACAAGTTTTCAGTGTTGCAATTCTCCATC TAAAAAGACTTACAAATACTTGATTAGATTTTTCGGAGAACTAAAAGTTT ATAGAGTGGactcttcaaaacttttttcaaaccaaTTTTTCGAATGTCTG CTTGATTACAaaattccataactcgaacaaatttttgttctccgtacctg ttcgagttatagaggctcCATTGTATAAGCCAGTGAGATATATGTCCCTC GCATCAATGGCTAATCTGAGGGGGTTACAATATTTATGACAGAGAGACTT AATTTGCTTATAAGGACTTTGTCTAAAACACTCTCGGTATAACTGTAACA TAGGTAAttgaccttatcggagtttttgatttttctaaaaaagcgatgca 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CTGGGGATTTGGATTCCATTATTTTAAACAAGAAAATTCAGTGAAGATGG GAAAAAtagcatgaaattttgcagtgaggatttgtttatttgattgtttt cagtggggacaaaaattgaaaaataattctccACAGGAGTCGATACTTTG GCAAATCTTTCCAGTAGGAAAGGGTCCCAgtggtttctggggaattcgtc aaTAGCAAACAGGTTTATTGATACAGTCAGCTATATATTGATATGGTAAT TTTTGCTCTTCATCTTTGGTATTTTATACAATGATTAGATTGACACATGT GCGATAAAATTTATATTATTGGTCGTCAGAGGTTGGTATGTTCTTTGAAA ACTCAACCTCTGAACTCAAGGTAATGATGTTTAAATTGCATAAGAATTGC GTAATATAATTGGTCCAGTGCGCAGCAGAATGGACCTTTAAAAAGCaact gatcgaaaagattttgtctttgtcggggcctgtgcgcgcaataaattaac aagtccaggctaaaccaaccgccgatctagaatttttgccccgcctaccc gcgcgatatttgacctatgttttggattgaattgatagtagagtcaaatt tcacagttagattaaagggttgtttcaggtagggttagggctagggttgg ggctagggttggggatgggagttaacccctggttagggttttagcccccg ggtagagtttggagtaaataccatgtttataagcaactttgacctcctta atgcagttgtgacttgatggccgagtggttaaagTGCTGGCGCTCTAatc ataggtgctttgtatatagtgggtttaaatcccatcagcggcaaaagttt cgaaatttcgggaaaggcatcaaaaactttcaaaacttagcagtacaaag aaagtgtcaaagaatagaagctcagagtggaggatgggaaggaaattttt 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Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000356_pilon:285155..293277+

>XLOC_036580 ID=XLOC_036580|Name=XLOC_036580|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=1218bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000356_pilon:285155..293277+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
CAAAATCTAACGCAACCAAAACTGTTTGGTTTCTCAGAAAAAGAAGCCGA
GAGTTTTCCAAGTAGAATTAGTGAAATTATCATACCTTTTACTGGAGAAT
GTGACTCAACGAAATTAAGCAAATATACAGGAAAGCTGATCGAAGTgtca
gatattttgaaaaagaacacaTGTAATGGTCAGCATCCAACCATACCAGC
AAGGACAATAGCGAGGCGTGAAGCAGTCATGAGCTCGCCTATTCAGAATG
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CTGATCGAAGTgtcagatattttgaaaaagaacacaTGTAATGGTCAGCA
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CGCCTATTCAGAATGCAGATGGTAGCGTTACAACGGTGAggaattgtttc
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TCAAGCAGTGACTCGATTACCTGATAATGTatttCCCAGGTTTATCAATG
AAGTCATTTGTCAACCTTTGGATCAACCAACAACGAATGCAAAACAAGAA
TGTCTAACAGGCTCTGGAAATTGTGTGGAGAAAATTCTGAACATTCCATT
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CTTTTAACCAACCTATTCGTGCAGCTTGTAATTGTGAAATTCACCAGGAT
TCACCCTTCGCTATTTTCGTGTGAatttCCCAGGTTTATCAATGAAGTCA
TTTGTCAACCTTTGGATCAACCAACAACGAATGCAAAACAAGAATGTCTA
ACAGGCTCTGGAAATTGTGTGGAGAAAATTCTGAACATTCCATTTCGTAA
AGACACTGAAAATCTTGGTGTTGATAGACTATTTGAATGGACAACTTTTA
ACCAACCTATTCGTGCAGCTTGTAATTGTGAAATTCACCAGGATTCACCC
TTCGCTATTTTCGTGTGA
Gene-mRNA-Prot
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
XLOC_036580XLOC_036580-proteinClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonpolypeptide
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
sc0000356_pilongenomesc0000356_pilon:285155..293277 +
Properties
Property NameValue
Aaloc367-609:7881
Aaloc1-363:1