XLOC_036578 (mRNA) -

Overview
NameXLOC_036578
Unique NameXLOC_036578
TypemRNA
OrganismClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon (Jellyfish)

Sequence
The following sequences are available for this feature:

mRNA from alignment at sc0000257_pilon:365216..378086-

Legend: polypeptideCDS
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>XLOC_036578 ID=XLOC_036578|Name=XLOC_036578|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=12871bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000257_pilon:365216..378086- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
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GATAAGAGGTTTGTTTTTTTTGTTTATGTTTTTGCTTATTTTGATTCGAT TGACCATAAAGTTTACCAGAAAAAGACTTTTTTTGTTTTGATTACATTCA AATCTCACGGTCGGCACGCAACGTTGTTTTACCGTCCATCTATTATTCAT TTTATCAAAGAAAGTGGACTCCTGGGGAAAGAGGGGGCACTTAGGCAAAA TTGGGTAGGGGGACGCGCCGCTGGTCAGAGTCCCTTCTTTAAACTTCGAA GATCTTTGACATGGTCTCGAATTCACCAATTTTCAAGATGTGTATCTGAT AGGGTCAACTTTTGGTAATTTTTTGACTATTTTCAGTGTTGAAATTAGAA AGATTCTCAATTTTTCGTCTACTTTTAGTCATTTAGGCCACTTTTCAGGG TGATCGATTTTTCTTTCTAACAATGTCCCAAATTTGCCATATAGTCATAT CTGACAATTCAAGCTCCAGCGGTACGTCCCCGTCGGCTATCAAGGTCAGT GACCCCCCGCCCCCCATATCCCGGTTTGGAAGGTTTTTATCTTTCCCTCT AATATAACAGAGTGCTCAATAATTTAATAATAATTTATAGTCACCATTCT CATTATAAGTTATAGGATCAAAATGACTTGTCTAATTTTCCTTAACCCAG AAACCATGCGAAAAAAAACAGTTTGCTGATTCCGACGAAATTTGGTGAAT CCAAGCTTTCTTTTCCATTTCTTTTGTTTTATTGATTAGTTTAAAAGCCT CGAAAATACAAATATTTTACGCATAATGACTTGAAATGGCTACATTTTCT ATCGTTTTCAGCTTTCAGTCTTCTTCTACACGTCCCCCGCGTCCCTGCCT GTTTGTAACGTTTATAATCTGCTGTTAAATAGCATTTAAGATCTGTATGT AGGATGCTAATTCAATTTATAGGTCATTTTGATCTTATAATGATTTCATC 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TATTAAAATTCTCATTTACATTAAGTAGTATCTACAAAAATACCCGGCTA CTCTATTATTTCCATATCATTATTCGTTTTAACTAAATGTTATACTTGGA AATCACACGAACAGAGTAGACGGGTCTCCCAGCTAACTCTGCAATTAACT TCTCATTTTGCGAATGTGTGAGGATGAATCAATTTCTGTTGAGATACACG TTCTTTTCATAAGAACAAACTACATAAGGCTTCGATGGTCATAATGTTAA GAACAAGTTAAGAACATTTTAAGGCTCTGTCGACCTATTTCTTAGAAAAA TGGTCAAAAATATTCACAAAATGGTCAAAATAAAAACGTGTTAAGAACAT TTTTAGGCTTAAAACTCAAAAAGTTTAGAACATCCCAAGCTCAAGAATTG TGGATATTCTTATAAAAAAGCGTGTACACCTAGCTAGTAGCGTAGACAAG TGTGAAGGAACATTTGCTTAGGAGAGCAGATTTAAATGACACAGTAATTA TGTTTTTATTCATGATATGCACCACTGGGGAGTCTTCTGAGAACTCTTAA AATTTTCCACCCAATACGTCACTTAAACAATAGAAAAGTGACATACTGGT TGGTACAAAAACAGAAAAGCTGCATAATTTCGTGAAGTCAGTGATGCATA TCATGAATACGAATAGGTAAGTGTTTTTTCGTAAAAAATCTGCTCTCCTA CGCAGATCAGTCTTCACCCCTGTCTACGCTACTGTACAATAGCGTTTTTT TTATTTAAATGGACTTCCATTTAGCAGAGGGTCTATGTATCTTTTAAGAA CAACTAAATCACTGAAGCAATTTGGAACAACATGCAGTTCTGTCCCGCAA AAAAACATTATTAAACCTTCTCTAAAGGTTTGGGGACACGAGAAGTCTTT TTCGTGTTGGTGCAATGCAACATGCTCCATCCCACCAACACAAGAAAAAA 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CTATATTCGAATCTTTCTATTATTCGAACTTATTCCCAGTCAAGGAGAAA CCCTCTTAATATACTTTCTATAATTTGAAACTCTCTATAATATATTGTAT TCAATTACATGCTGAATAAACAAACAATTATTTTTTTCTCTTTTTGACCA ACCTTGCTACACATCCGTGTCAATCCAATATTAAAAAGCTTGTTAATTAG AATTGACGATCAATCTAATTTAAAGGTTTTGTTTCGTTTGCTTACTCATC ATTTTAATTCACAAGATTTTGGATTGACACGAATGTAGAGCAAGATTGGT CAGAAAGAGGAAAAAGATGATTATTTTGCTTATATCAGCATAATATTAAA ATATTTTAGCTGTCCTGCTATGAAATATGTGTCTGATATGAAACGGGGGG GTATGTAAAAACATGGACTGATGGCATGGCAAAACATGGCAAAAATAAAA CCTTTAAAAGGACATAAAAGTACTAACGAAATTTGTAAACAAACCATATG CAGCGGGATACAAAATCAAAACAAATGAGGTCACATGTCAAAATAAAAAA TCAAACCAAATATGGCTGACTTTGATTGTTTCAATTGTTTTACAAGTTTG TTTTGGACACTTGGTTTTAATTTTTCTCTTTAATGACACGTGGTTCGCGC AATGTTTTACTACTTTATGTCCCTCTAAAAACAAAACCTTTACCTTTCCA GCAAACCGGTCAACAACCGTTTATCACGAAGAGTTTCCATGAGTAACCAT GATCTGAAGAGGAGGACTGCTTGCTACAAAAATCTTGTTGAACAACAAAA GTAAGTCAATCTTTTCTTTTAACAGCTTAATATATTGCGCTCACAAGGGT GCCAAATAACTTCTTTATAACTGGCCCAGTGAACGGCGAACTTCGCCGGT CCAAGGAACGGAAAAAATTACCAATAGTAGGTTTCAAAACTCCACTCGCT GCAGTCACTGACCTTTATATACCCTGGACCAAGCTTCTCAATCCCAGTCA AGCAGAACCTTTGATCGGAGTTTTTTGAAAATTGGTACCCTAATGGCGAC ACTACTCGATAGCGGTGTAAATGCTAGGTCTACTGTTCCTCAAATTCTTT TGATGATGTAGCGACTTTAGACGTTAATTTTTAACATTGCAATGGCTTCT TCTCGGGTACCAATTCCAAAAAAAACTCCAATCAAAGATGGCGGATAGTG CTTGGTCCAGGGATATATAAAGGTCAGTGGTTGCAGTACATATTCACGCT AATTAAAATCTGGTCTAGGTAAGAATTCACTGCCTTAGAATGTAGAATTT GCAGGTGTTATTTTTTATTCGTCAGCCTATCAAAAACAAAGGAAAACCCC TGCTCATAATAACGGTTATTTTAAGAATTTACAAGGCATCAATGGTTTAC TTTGAAACGCCACCGGGGTAGTGAAACAGGGGTACTATACGCTTTTTTAT AAGAATAAACACAACAGCCCTTTTATTGAGTTTTAGTCCCTAATCTAAGA GGCCTGGGATCCAATCCGATAAATTTTTCTTTTCTTTTTAAAGACCATCA GTTGAACAAATTCAGAAATGGTCCGTCAGCTTTGAAGATTTACTGTTCAA TGAACGTAAGAATAACTTTCCATCATTTTTTTTACATAAAAACAGTAAGT ATCGATATATTATTAACCCGGGGGTACTAGGGTTGGCAGATGAGGGGTAT GTGAGGATGGGACCTCCAAAAAACTACCCTTAGAGAGACTGATTTTCGCT GAAAAGATTGCCCATAGAGAGACTTTTTTGAAAAATCTTTTTCGATTTTT AAAAATTCGCTACCTTTAAAAAGTCAGTCAGAAAGAAAAAGCTACCCTTA GAAAGACTTTTTTATAATTTTTTCACTCTAAATCAAAAAGATTTCTTAAA AATCGTGAATTTTCCGACCCTTAGAGAGACTAATCTAAATTTTTTTGATT TTTGTGACCCTTAGAGAGACATCCATTTTTGCCTTCCCCCGGATTATTAA CGACGACGGAAAAACTTCATCATTCATCGTTCACGCCACGGAATTTTTCT ATGCCGAAAGCACGGCAGCCTTTACTACGCAAGAAATTGAGTTTGCTTCT AGAACGAATTTCCGCTTGATTGTTTATTCTAGATGCAAAGAGGATATACT CTGCGGGGTAATTCTATCTTGCTTTTCCTGCTTGGCTTGTAGAAAAGTTC CGTGTATCATGAACGCAGGCTAGAGAAGATTTGTCCGAGATCGTGCATTA TCTATCAATACTTAACTTCACTAATGTCTATTTTAAAGGCAAAGACCCCT TAAAATACACCTTTTGGACCGTAGACGCCAATTTCTGCGTTTTAACACTC TAAAACCGTCCCAGTCTTTCTTTGCACTCAAAGACAATAGAAAAAAGTGT AAAAATAGGATTGGATTGAGTTTAGGGTGGTAATTCAAATAATAAAGTGA AACGCGTCTGACCGCGCGAGTACGGTCGAAAAGGTGTATTGATTACGGTG ATGGTAATTTTGTAAATCTTTTTTCTAGTCGGACGCAAATTGTTCTATCT ATTTTTGCAACAAGAACATAGCGAAGAGAATCTTCAATTTTGGAGTGAAG TCAATGGTTTAAAAGATATCAGTGATTGCAAAGAAAAGGTTTCCAGAATG CGTTCCATTTATAAGGAATTTATCAAACCTATGGCTTTAAAAGAGGTACA GTTTTACCTAAGTATCATTATTCATGATATTCATATATATTCATATATTC GAAGGCGCTGTGGTATAGTGGTCATTGACCTTGGTTGCTGCACAGGCGAC TGAGGTTTGATTCCCACTCGCAGTGGTTCACTTGGCAAGTGAATGAACCT TCGCCCGGGTCAACCCATGCCATGTGAGGCGAATTGGGTATTCAGTCTAA GGTGCTGATGGGGCGCTTATTGAAAGCGTCCATAGTTGCAAAATTAGGCC TCAAAGCCTCCTGCAACTCAACCAAATAGAAATAGAAACCATACGTAATG TTTTCTATGGACACCAGTTTTTGCCAGTAGTGGTGAATTTTATACAACTT TTGTCTAGCTCAAATTTGCCACTACTGGCTAAAGCCGGGGTATTTCCGTA GAAGGCATTACATCACGAATATCATGAATCATAGTGTATTAAAAAATTTT GCAACCCATTGTAATGAGGAGGGAAGGATTAAATGGTTTTTTTGAAGAAA TCCTTAAGCACAAAAGTTATTCAATATTAATATTCAGAAATTTGCTACAA CCTTGTAAAGCTGCTGTAAAGCTGCTACTTTTATACCAAGAACATGAGTT GGCGAAACAGGGGATGGCGACAGTATTAAAGTCTGTCTCAAAAGTATGTA AACACTTCAGCTTTTGAGAATTTTCTCAGCATCCATTTATGCTATATTAA AAAACTATACACCGTTGGAAAGATATTTCCAAGGAGAATAATCTAAAGGA TAAAAGATTTTTGAAAAATTGAAAAATGAAGATATCTTTCTAAGGGTGTA TAACTATAGACTCTAAAACACAATAAAATTGAAATATTTTTTATGTTCTA ATAAAACATCCCCTTCTCACAGACCCACTTGAAAAATTGGCAAAAATATT GTCCCCAGTGGAAAATTACATACTCTAATTTTTGTCTCCGCTGAAATCTG CACTGCAAAATATTGTGCTATTTTCCCCATCCCCACAAGAAAACAATGGA ATTCAAATCCCATAGCCATAAAATAACATAGGAATAACAATCCCCATCGG GCTTTGGTACGTTATTTTTACCCCCAGTGGCTGATAAAATCCCACCAGGT 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TGATGCATCGCCAGAGCTATCCACGTTTCTTGCAATCTGAGATGTTCCAT TCCATTCTACAAACAACATACGCTTACAATCCAAATTCACCAAAACCACC TTTAACTATCTCCAACACAACACCAAGAAGTATTGGTGAAAATGACACTA CAGAAAACGCAATCGAAGATCAACCGCAAAGTGGTTCTACCCATCTCCGG AAATCATCACCAAGTAGTGACTTAACTCTCACCAACCCACATCCATCAAC AACAAACACCAAACAACGTCCAAAGCTTGACAACCAATCAGCAGATAATC GAAATAGCCGATCTTTCGTTTCTCCCAACCAGCTCTCGCCAGCCTCCCTC CATGAAAATCCGACCGCGCGGGCAGAAGAGGATGATAAAGGGGTTGAGGA CTCGCGAAACACACAGCTAGACAGACACCATTCGATGCCATCAAGTCAAA AAGGCCAACAACAAAAGCAGAAATTGAAATTTGACAATAAACTTGGCCCA AGAAATTCCAGCAACACTTGA

Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000257_pilon:365216..378086-

>XLOC_036578 ID=XLOC_036578|Name=XLOC_036578|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=2502bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000257_pilon:365216..378086- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ATGTCAGGGCGAAGATCATTTTATTTGGACAGTAATTCTGTTTGTTCAGC
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AGGCGAACCAGTCTCCTTTATGTGCTTACCGTGTTCCATCTCTGCAAGTT
GCGTCTCTTCAAACAACTACACAACGGCGTCCTTAACATTCTCAAAGGTC
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ACAAAAGAAAATACAAAAGAATAAACATCGATCGTTATGTTTTTGTTGGT
GTTGTGTATGCACGTGCTTGTGGACTTACAACAGGCGAACCAGTCTCCTT
TATGTGCTTACCGTGTTCCATCTCTGCAAGTTGCGTCTCTTCAAACAACT
ACACAACGGCGTCCTTAACATTCTCAAAGGTCGTTCTAACGGCCGAAGAA
ACACGTGTCTATCAAATCCCATGGGAGAAGCAACAAAAGAAAATACAAAA
GAATAAACATCGATCGTTATGTTTTTGTTGGTGTTGTGTATGCACGTGCT
TGTGCAAACCGGTCAACAACCGTTTATCACGAAGAGTTTCCATGAGTAAC
CATGATCTGAAGAGGAGGACTGCTTGCTACAAAAATCTTGTTGAACAACA
AAACAAACCGGTCAACAACCGTTTATCACGAAGAGTTTCCATGAGTAACC
ATGATCTGAAGAGGAGGACTGCTTGCTACAAAAATCTTGTTGAACAACAA
AAACCATCAGTTGAACAAATTCAGAAATGGTCCGTCAGCTTTGAAGATTT
ACTGTTCAATGAACACCATCAGTTGAACAAATTCAGAAATGGTCCGTCAG
CTTTGAAGATTTACTGTTCAATGAACTCGGACGCAAATTGTTCTATCTAT
TTTTGCAACAAGAACATAGCGAAGAGAATCTTCAATTTTGGAGTGAAGTC
AATGGTTTAAAAGATATCAGTGATTGCAAAGAAAAGGTTTCCAGAATGCG
TTCCATTTATAAGGAATTTATCAAACCTATGGCTTTAAAAGAGTCGGACG
CAAATTGTTCTATCTATTTTTGCAACAAGAACATAGCGAAGAGAATCTTC
AATTTTGGAGTGAAGTCAATGGTTTAAAAGATATCAGTGATTGCAAAGAA
AAGGTTTCCAGAATGCGTTCCATTTATAAGGAATTTATCAAACCTATGGC
TTTAAAAGAGGTGAACATTGCTGGCAATACACGACGTCAAATTGAAGACC
TGATGGAGACAAAACCAAACGAAAAAATGTTCGACTCTGCACAACATCAG
GTGAACATTGCTGGCAATACACGACGTCAAATTGAAGACCTGATGGAGAC
AAAACCAAACGAAAAAATGTTCGACTCTGCACAACATCAGGTATTTTTGA
TGATGCATCGCCAGAGCTATCCACGTTTCTTGCAATCTGAGATGTTCCAT
TCCATTCTACAAACAACATACGCTTACAATCCAAATTCACCAAAACCACC
TTTAACTATCTCCAACACAACACCAAGAAGTATTGGTGAAAATGACACTA
CAGAAAACGCAATCGAAGATCAACCGCAAAGTGGTTCTACCCATCTCCGG
AAATCATCACCAAGTAGTGACTTAACTCTCACCAACCCACATCCATCAAC
AACAAACACCAAACAACGTCCAAAGCTTGACAACCAATCAGCAGATAATC
GAAATAGCCGATCTTTCGTTTCTCCCAACCAGCTCTCGCCAGCCTCCCTC
CATGAAAATCCGACCGCGCGGGCAGAAGAGGATGATAAAGGGGTTGAGGA
CTCGCGAAACACACAGCTAGACAGACACCATTCGATGCCATCAAGTCAAA
AAGGCCAACAACAAAAGCAGAAATTGAAATTTGACAATAAACTTGGCCCA
AGAAATTCCAGCAACACTTGAGTATTTTTGATGATGCATCGCCAGAGCTA
TCCACGTTTCTTGCAATCTGAGATGTTCCATTCCATTCTACAAACAACAT
ACGCTTACAATCCAAATTCACCAAAACCACCTTTAACTATCTCCAACACA
ACACCAAGAAGTATTGGTGAAAATGACACTACAGAAAACGCAATCGAAGA
TCAACCGCAAAGTGGTTCTACCCATCTCCGGAAATCATCACCAAGTAGTG
ACTTAACTCTCACCAACCCACATCCATCAACAACAAACACCAAACAACGT
CCAAAGCTTGACAACCAATCAGCAGATAATCGAAATAGCCGATCTTTCGT
TTCTCCCAACCAGCTCTCGCCAGCCTCCCTCCATGAAAATCCGACCGCGC
GGGCAGAAGAGGATGATAAAGGGGTTGAGGACTCGCGAAACACACAGCTA
GACAGACACCATTCGATGCCATCAAGTCAAAAAGGCCAACAACAAAAGCA
GAAATTGAAATTTGACAATAAACTTGGCCCAAGAAATTCCAGCAACACTT
GA
Gene-mRNA-Prot
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
XLOC_036578XLOC_036578-proteinClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonpolypeptide
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
sc0000257_pilongenomesc0000257_pilon:365216..378086 -
Properties
Property NameValue
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