XLOC_036568 (mRNA) -

Overview
NameXLOC_036568
Unique NameXLOC_036568
TypemRNA
OrganismClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon (Jellyfish)

Sequence
The following sequences are available for this feature:

mRNA from alignment at sc0000336_pilon:190063..200576-

Legend: polypeptideCDS
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>XLOC_036568 ID=XLOC_036568|Name=XLOC_036568|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=10514bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000336_pilon:190063..200576- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ATGGAATTTGAAGAAGTCTCTAAGAAGAGCACGAAAAAGGTTGGTAAGAA TGAGCATTTAAAAACCATAACAGGAAAAATTTATTTGATTTAGGCTACAG CTACCATGCTACCATCCAAATTTCCCTGCTGACTGAATATAGGTTGGCAA ACGATATCATCCACCAGGATGCATCCTCTCTTATTTTCCCCCTATTTTCT ACTTTCCTATCTTCTATCCTGATTTTCTGACTTTCTCTAGTGTTTCTAAC CGTTTTCTAAGTATTTTTCTGAAATTTGACCGTACCGGTGAAATTGGTCT CCGACCCCGGCTCGAACCACCAAATGCCGAGTAACCTTGGTTTACAAACC CAACGCTTAACCGCTTGCGCCAACGAGACACGGCAGAAAGTTGTCACTCA CAAATACTTATAGCGTGTAATTTACAGACCTTTATTAAGAAAGCTCCCAA CCCTACCGGTGCCCCCCTACAAGGATCCCTCTACGGGATCCTAAGTTAGG GTACAGGGTACGGATGCCCCTAAGAAGGCCTTCGGCCTTATATTGTGACT CTCGAGCTCCAACCCTAACCCTAACTGATAATAACCGAACCCCCGTCTAG GTCCGCAGATTGAAAAATTTCACTTGCATCCTGGTGGATGATATTGTCTG CCGACCGGACTGAATAGACCTTTTTTCAAAGAGGACGTCCTGTTGAATAA TTATGTAGTCCAGCCATAAAAACAATGATAGAGCCATGCATAATTACTGT ATCATGCATATTGTAATAATTATGCATGGTTTTATCATTGTTTTTCTGCT GGACTACATACCGTGAGATTGGGTAACTTGCATCAGTGGAGGCTAACATG CATAGCTCCCAGTAATCCAGTATGGATTTCGTGTAACTAACGCCGAAGAT CTTCGGCGTACAACTGAAACGTTTTTTGCGCATTGGCGTAAGGGTACTTA 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ATACAAAGTTAAATCAAAACAAAAATGGTCGATTAAAGCTACGAGCGGAG CTGCGTAGATGTATTTTAATAGACCTTTTTTCAAAGAGGACGTCATGTTG AATAATTATGTAGTCCAGCCATAAAAACAATGATAGAGCCATGCATGATT ACTATATCGTGCATATTGTAATAATTATGCATGGTTTTATCATTGTTTTT CTGCTGGACTACATAATTATTCAACAGGGTGGCCTCTTTGAAAAAAGTTC TATGACCAGCCAGGTCATTCATTTGAGGGCTACCGTGAGTGGTCCTAAAT CCGATAGCCCTACCTAAATCCAATGGGGTCTTTCGAAGATACAAACTAAA ATAAAAAACAAATCTTTCGCTGTGACGCAATGAAGATACCAAAGTGTAAA CTAAACTGAGAGATTTGATACACTGAACCAATTGAACCAATACATTAAAA ATTACTTCTTATAATATAATTTTTTATTACAAAATTGTTAACGTTTTAAA CGCAAGCAACAGATTCAGAATAGTAGAGGCAATTATTTTTACAACTCACA CTATTTTTATCACCTTAATTGACATCATGACATTTTAGTCATCTTATTAG ACGTTTTGTTTCGAGAGTTCTTGCAATATAGTTTATTACTCAACTTGGAG AGGGAATGTTTGTAAACACAGAAATTTTTTCATAGCAGGTCGGATTTAGG CAGGGGTGTCGGATTTAGGACCACTCACGGTATGCATGTTAGCAGAGGAC CCTGTCGACGCAACTGACTTAAGGAACACCGGACACGCGAAAGTCGGTGT GAAATGACAATTTTTTTACCACCGGACATTCTCTACACCGACTTAAGGAA GTCGGATGTCCGGTGTCGGAGAAGGATATTTTTTTCCGCCAGACAATCAA AACACCGGACATGACCAGTCCAGTGCGTCCTGTGTTTCTTAATTTTTTGT TTCATAAATGTCCAGCGTCCAAAATTCCCTGTATGCAACACCGGACTGAC GCCGGTGTAGCAAAAGGATACTTTTTGCCACCAGGCAAATACACCGGACA GTCCGGTGCGTTGGCAGGGTCTTGTTAGCGGCCTCCACTGATGCAAGTTA CCCAACCTCACGGTATTGGGGAAAGTTTTTCAACTTTGCTTGGTTTGGAG CTCTCTCGCTTTTTAATGAGGTGAAGTTAACAGCTACCATCAACTGCTTT AACTTGGGACTATCTGTCAAAACATGGGAAGGCAATTCGGCCACCATTTA ACCTCCAAAGTTAGGCCGACTCTAAAAAAAAAAGTTTCCGGTCCACCGGC CGGGTGAAATTTTTTTTCGTTGTCACCCGACCGCATTTTTTTTCATAAGA ACCAAATAGATAACAGAGGAAACTTTCTTCTTAAAAACCTTTACTCATTT AAACTCCCAGCTGGCACACAACGTTGTTTCGACGTTTATATAACGTTAAA AAGACGTTATGAAAATTAGATGGACGTTGAAACAATGTTGTGTGCCAGCT GGGCTGTTTCATCGTTCTCGTTGCTATAAAACACTTAAAAAAGTTTGTTT GTTTAGCATGACAGCATGCTTTCTGGACATTATGGATCAAATAAATAGTG TTATGCATTTTAAAATGAGCAAAGAAAATCTTTCTTTGTCTAGGATAGGA GGATTTCTGAACGTTAAAGATCAAATAGATAGTGTTATGCATATTAAATG GGTGAAGAAAATCTTTGTTTGTCTAGGAGGCTTTCTGAATGATAAAGATC AAATAAATAGTGTTATGCATATTAAATGAGTGAAAAAAAAGAACTTTTTT CTAAAAAATGACGCTTTTTGAAGATGATTTTTTACAAATTTTCTTCATGT CTTTTGAATACGTGAAGCAAATTTAAAGAATTATAGCTCAAAATTTAAGT TGGCCTTTCTTCTTTTTAACGGTGAAAATATTTTTGTAACAGTTTGTAAC ATTTTTAGTTTTCTCACAATTTCAATCCAAACCTGTATATACACTTTTTT TTTGAAACACCCGGTTCTTTCTTTAACACTAACACCCAGAGAGATGATTT TTTTTCTTTCTAATTTTTTTGACTAGAAATCTTGAAAAGGACTTAAAAAA TTTTCCCGGCCGCCCGCATGACTTTTTTTTTCGTCACCCGGTTTTTAGGG TCGGCCTTATTGATTTCACTTAAGGAACGGCGTATTTAAAAATACACGAT TTCTCTTTCAATTTTACAGTAAGTGAAAATACAGACCAGATATGCAACAG TCCCATGTTTCGACCAATCGTCCCAAGTTCAGTCAGGGCCTCCTTAGTAT TTTATAACATTAGTTCGGATAGAATAAAAACATACCTGATCAATACAACC AAACCGTTTACTCTTTCCTTCGCAACAACTTTCGTTTTTGCTTATGTAGG TTCAGGTAGGTTTTAAAACCCACAAGTAATGAACCTATTATAGCTTTATC TTAATAAATCTGGTTGAAAGCCTTCTGTTGGGTTTCATTCCGTACGTTTT TAATCCACGTGGTATACCAGGTTCTTTCCAGTGGGCACGATTGGGGGTAC CGCCATTGCAAAATATTTTTCATGAAAATTTACCGTATTCTAACGCTATT ATAGTCTAGATAGGAAACTAATATTAAATTTGATCCTTTTTTTGTTTGTA TTTTTAAATTTCATGATAAAAAGAACTATTTACAAATTATTTTCTTTAGC GGGTGTTGAATCGACATTGACATATTTAATGATGTCATAATCAATGCCGT GCATATTTTGTCAGCGCCGTGCATTTCTTGTCAAAATCCTTTTCATTGGA TAAATACCACTAAAAATATACAAGATAAATACACATAAATTTATCGTCTG CGCACAACATACCGGGTGTGCCACAAAAAAGTTTCTTTCTTTAAAACTAA TTTTCTCGAAATCTAAAAATTTTAAAAGAACCATTCCTACTCCATTGGAA CGAAGAAGGATAGACTTAAATTTTGATGGGTCATTTAATGAATTCGGTAC ATTAGATCGAAAGTTATGCTCAATTGAATAAAAAAGTTACTTTCTGAAAG TGCTTAAAAACGTTAAAAATTGACCTATCAAATTAAACAGAAGCATAATT ACACGATGCACCAGTTTTTTTGCTTCAGCCATCAAAAATGATAATTAGCT GTCTAAATGACCTTTTGTTGTATAAAGGAAGGTTGAATTACATTAAAAGG AAGAAAATTCGTCGAAAAAAGCCAAAAAATCTGGTAAAATTCATAAAAAT ACATCAAATATAATCCAGTCTAGAACCAAAAATCTGTGAAAAATTTGGGT AAAAAGTAAATTAAAATGATTTTGATGAAGATTTAAAACCCTTTCGACCC ATCAGTTTCAAAATTTATGTGTTTAATTACTGAAAAATGCTCTTGATCGT GTAAAGGCTATTGCGATTGCCAAATTTAAAATAGAAATTTGATAGGTCGA TTTGTAACGTTTTCGGGCACTTTCTGAAAGTAACTTTTTTATTCAATTGA GCATAACTTTTGATCTAAAGAACTGAATCAGATAAATGACCCATCAAAAT TTAAGTTTATATTTCTTCTTTCCAATGGAATAGGCAAAATTTTATATTTC AAGCAAATCAGTTTCAAAGAGAGAAACTTTTTTGTGGCGCATCCGGTAGC TAAGCGCACCTCTCTTATTCATTATCTAAGAATTGAAGCGACAAAAGTTA TTTGAAGATATATTCAGTTATAATCCAAGGTAGAACAATCTAAACATAGA AAGGGGGTATTTTTTAGTGCTCTTTACGATGATCGGTAGTTTTTTTGGAT TCTATGTTTAGATTTTTCTACCCAGCCCCGTTGCTATGTACGCGCGCCCT GTTGCTAAGACCTATGCTTGAAATCGAAAGCGAAACCAAGATAATTTAGC GCACACTGCCGTTTTGCGTAATATCGATAAAGTGAAAGGAGGTCCTGACT GAAGTTTGAGCAGTTGACGCTATGTATGTATCCTTCATAGGGACTATCTT GGGACTATCTGCCCTGGTTCTGCAAAGTACCGTAAGTTGGGGTCTGATAT CAACATCCCTCGTCTAAATTCAGACACCTTTCTTTAGAGAAAGGAATATA TAATATGAAAGGTTGAATCAATGATTGAAACAGGATTATTCCTCTCACTG ACCACTAAGCAAGAGGATGTCGGAATTAGAGGAGGGGTGTTGAAATTAGA CCAAGTTAGGGTAGGTAGAGTGATTTTTTAAACAGCTTTACTCAGAAGGT TTTATCTTTAAAACATTTAAAAGACTAGATAGTTGCTATGACAAACAGTT TTAGTCACATTAGGAAATCAAGGTTTCAGAAATAACAACATCAGTCATCT ACAGAATGTATTTGAAACAAGGGTGAGAATTACCTGAATCAAGTTGAAGA TCCCAAGACAATTAATAAAAATCGAAAGCTTGAAACAAAACATAATGTCC AATTAGACCACTCACAAATAAGTTGTGTTCGCATCCTCCAACCGACTCAC TTTCCTCATCTTAAAAATCCTACCCTTTTCTAGTTGGAAAGTCGGAAAAT TTGTGAGATCTTTTAGCAATATTATTCAAAGAATTTAGTAGATTCAGTGT AACCAGTGTTTTGATTATCGATTATATATTGTTTTTAAGATTTCTATCCG CAATTTTCAAAGATTTTTGCGCTACGCAACTGCTTTTTGCGCAGTTGCGA TATGCAAAATAATCACATTGCAGCTCACGCGCTCTATAATTCTTGTCGCC TGAACAAACCTTTTCCAATGATTTTAGCACCACCTGACACTACTAGATCT AAAAACATCAATTGTGGACACTGTTGATGTTTTTTATCCACAGTAGATCA TTTTTATGGACAGTTTTTCCTTTTTCTTGACAGTTGATGTCTGGAAATAG ACAGCCAATACTTTTAATGAACTGTCAAGATTATTTAATTGACTGTCAAT ATCTGATATTGACTGTTGATGTCTGATATATTGACTGTCGATATCTGATA TTGACTGTCGATAGCTTTTATCTTGACTGTTGATGTCTGCGATCTTTTAT ATCAATCGACAGTCAATTAAATAATCTTGGCAGTTCATTAAAAGTATTGG CTGTCTATTTCAAGACATCAACAGTCAAGAAAAAGAAAAAACTGTCCATA AAAATGATAGACTGTGGATAAAAAACATCAACCGTGTTCACAATTGATGT TTTCAGACCTAGCAGTGTGACTGCCTATATTCAGAGCGCATTTTTCCGAT GATTTAAGAAACCAACCAACCGACTCATATTTTGGGGCTGTCAGTCAGGG AAATCCCTCAATTGCAGTAGTAATTTTTTACTGCAATTGCGGTATAAACA TCACTTTTACATTTTTCATATATACCACAATTGCAGTATATTCAAGAAAC AGAATTCAAGATTGAAGTTTTCTAAAAAAAATTCCTTTATCTGACAGATC AAATTGGGTCGGGAGAATAAAAATTGATTTCATTGATTTCAATTTATTAT CATTTAATTTTTGCAATTTATTTTTGTCAGCAAATCTGTAAACCAGAAAA TAAAAAAGTAATTTCCCAATGAAACACTTAAAATTTAGGAAGCAAGTCCT TTAAGAGATCGCACTAACATTTTTGTTTGGCGTTAACTCCAGCTCTTTTT GCCGTCAATTTTTATTGTCACAACTGAATTCCTTTGAAGTAAACAAAAGA AAAAAACAACTGGAGTAAAGGTCTATTGGAATGGTGGTGCAATCTCATAA AGGACTACTTGAGTTCGATTAGTTTGTTCAGTACAAACTGTGATAAGTTA ATTTCCAATCACCTCTTCCTTCACTTGCAAAAATTTAAAACCACAGACAT TGTCCATGAAAAGTTACCATTTTGACATTATCCAAACTTAAGGTTTCCTG GAATATTTATTTATCCACGGTCATATTACAAATCTAGATTTCAGAAGTTT CTTATTTATCCCCTATCCCTATTAATTTCAGTACAAAAATCAGATGTCAA AAGACCAGCCAATCCACCTGTCAACAAGGAACTTCAAAACGCCATCCATC TCTCCTGAAGTTGATCTCACATGGTTTCTTCTACTTGGTGTGGCATCTGC TGTGCGTTTATACAAGTTATCAAAGCCAAATGCTGTTGTGTAAGATGATA TTATTACTGTCATCATTATTTTGTAATTTGTCAGAAATGAAGATTCAAAT AATCATATTCCCCCAAAGGACTAAACAAACTTGTGTTATGACTTTGAGAA TCTAAAAAGGAGAGTGATCATACAGTAATTCTTATCTTATAGATTTGACG AGCTACATTATGGAAAGTTCACATCATATTTTGTGCAAGAGCGGTTTTTC TTTGATGTGCATCCTCCACTTGGAAAATTGCTCTTTGCAGCTGCAGGTAT GACACCTTTTAAAAGTGCCAACTAGCTAGCTTGTTTTTTGATTGCCTGTC ATAGATAGAGTCAATATTTTACATGGATAGCTCAGTAATCTAGGACTTTT AGACAGTCTTTCGATTGTTTTCATGGGGTCCAAGGCCAGCTGGCTCGGCT ATCTATGAACTGAACGGAATATTGAAAGGAGCGGGGATTCGAACTTCGAA TTCCTTGACCGCTTGGCCATCGCTCCTCAAATGTTCATGAGTTCATCAGT CAATGAACAAAAATACCTAAGCATTGATGATTCCAAAGAGTCGTTATTGG TGTATATTGCTTTTTTCAAGCTTTTTAAACCTATCTAAACAATTGTAGAG AAATGGGCTACATTAGTTACCTGACCAAAACTTCCTTATTGAATCCTTTC ATTGATCAGATTTATTACTTTTAAGATAGGATTCTGATTTTCTTTGCCAG GCTTCAGGGGAAGTGTTAAGTAACAGCCTTTTTAACGTCTTTTTGCTCTA ATATTCCACCATTTGCCATCAGAATTATAAGTTTACTTTGTATTATTTAA TTTTTGCTTTTAGGATACTTAACTGGTTTTGACGGATCTTTTAACTTTCC AAAGATTGGTGAAGGTAAAAGACTTTCTGTACCATTAATTATTTAAGTTT TTTGCAGAAAATGAATGAAAAGGGCAAAACTGTGAAAGTTAGATTCTGAA ATGCAATTTTGTATATTGTAAATCATATTTTTTTGGTCTTATCCTGACAG CCTTCTTGAAGATTTCCAGAGTACTTTTATTTTTATATTCTAGAGGTGCC AGACTCTCAAGTGCAAAGTGTTATGTATTTGCGAATGGTGACAAGCTTCT TCAGTATTTTTCTGGTGCCATTGATTTACGAGGTTTGTTAACTAAAACTA TTGTTATATTTTGAAACCACTTAAGTGTCATTGATATTTTGATAGAAGTG AACTATTTTGAATCATTTGATAGACCCTCGGATACATTTTTTTGTAATGA TACAGCTTTGATAAAGTTTCAATGCCCTTAAGAACAAACCAAGTGCAAAA CAGAGAAAATTAAATAATAATAGCTGCATTCTTTTTCAGTGTTCAATATA AACTAATGTAAATACTTCTCTTGCACTAATGATTTACATTTCTTATGTTT CAGATTGTATTGGAACTTTCGAGTAGTTACTGGTTTGCTGTAGTTGGTGC CCTACTTGTTTGTTTTGGTAGGAAAAATTTGATAATTTGCCTTGGTGATA CATTTTTCCTTTAA

Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000336_pilon:190063..200576-

>XLOC_036568 ID=XLOC_036568|Name=XLOC_036568|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=1104bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000336_pilon:190063..200576- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ATGGAATTTGAAGAAGTCTCTAAGAAGAGCACGAAAAAGATGGAATTTGA
AGAAGTCTCTAAGAAGAGCACGAAAAAGTACAAAAATCAGATGTCAAAAG
ACCAGCCAATCCACCTGTCAACAAGGAACTTCAAAACGCCATCCATCTCT
CCTGAAGTTGATCTCACATGGTTTCTTCTACTTGGTGTGGCATCTGCTGT
GCGTTTATACAAGTTATCAAAGCCAAATGCTGTTGTTACAAAAATCAGAT
GTCAAAAGACCAGCCAATCCACCTGTCAACAAGGAACTTCAAAACGCCAT
CCATCTCTCCTGAAGTTGATCTCACATGGTTTCTTCTACTTGGTGTGGCA
TCTGCTGTGCGTTTATACAAGTTATCAAAGCCAAATGCTGTTGTATTTGA
CGAGCTACATTATGGAAAGTTCACATCATATTTTGTGCAAGAGCGGTTTT
TCTTTGATGTGCATCCTCCACTTGGAAAATTGCTCTTTGCAGCTGCAGAT
TTGACGAGCTACATTATGGAAAGTTCACATCATATTTTGTGCAAGAGCGG
TTTTTCTTTGATGTGCATCCTCCACTTGGAAAATTGCTCTTTGCAGCTGC
AGGATACTTAACTGGTTTTGACGGATCTTTTAACTTTCCAAAGATTGGTG
AAGGATACTTAACTGGTTTTGACGGATCTTTTAACTTTCCAAAGATTGGT
GAAGAGGTGCCAGACTCTCAAGTGCAAAGTGTTATGTATTTGCGAATGGT
GACAAGCTTCTTCAGTATTTTTCTGGTGCCATTGATTTACGAGAGGTGCC
AGACTCTCAAGTGCAAAGTGTTATGTATTTGCGAATGGTGACAAGCTTCT
TCAGTATTTTTCTGGTGCCATTGATTTACGAGATTGTATTGGAACTTTCG
AGTAGTTACTGGTTTGCTGTAGTTGGTGCCCTACTTGTTTGTTTTGGTAG
GAAAAATTTGATAATTTGCCTTGGTGATACATTTTTCCTTTAAATTGTAT
TGGAACTTTCGAGTAGTTACTGGTTTGCTGTAGTTGGTGCCCTACTTGTT
TGTTTTGGTAGGAAAAATTTGATAATTTGCCTTGGTGATACATTTTTCCT
TTAA
Gene-mRNA-Prot
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
XLOC_036568XLOC_036568-proteinClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonpolypeptide
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
sc0000336_pilongenomesc0000336_pilon:190063..200576 -
Properties
Property NameValue
Aaloc442-552:112
Aaloc355-441:470
Aaloc304-351:700
Aaloc199-300:1372
Aaloc40-195:1684
Aaloc1-39:10515