XLOC_036502 (mRNA) -

Overview
NameXLOC_036502
Unique NameXLOC_036502
TypemRNA
OrganismClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon (Jellyfish)

Sequence
The following sequences are available for this feature:

mRNA from alignment at sc0000060_pilon:555764..569374-

Legend: polypeptideCDS
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>XLOC_036502 ID=XLOC_036502|Name=XLOC_036502|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=13611bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000060_pilon:555764..569374- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
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GCATACTGCCAGCAATCTCAAAAGTTTTTGAACGTGTGCTTTTCAATCAA CTTAACACATTTATCGAACCTAAGTTTAGCAAACTTCTCTGTGGTTTTCG GAGAGGTCACAGCACACAACATGCTATGTTACGCCTTCTCAAAAGATGGC AAGCATGTTTAGATAAAAATGAGATTGTAGGCACTGTCCTTATGGATCTG TCAAAAGCTTATGATTGTCTGAACCATGAGTTACTTATTGCAAAGTTACA AGCCTATGGAATCGGGGGTCCAGCTTTGCTTCTTATCTATAATTACCTAA AAAAACGAAAGCAAAGGGTTAAAATTGGATCAATTTTCAGCGAATGGCTT GAGATACTTTCAGGAGTACCACAGGGTTCAATCTTAGGTCCTTTACTATT CAATATTTTTATTAATGATATAATTAAATTTGTAGAGCAATGCGACATTT GCAATTTTGCTGATGACAACACTATCGATAGTTGTGGAACCACTGAAAAT ATCGTCTTGAAAAAATTGCAAAACGATTTAACTATTTTAATATCTTGGTT CGAATCCAACTATCTTGTTGCAAACCCAGGAAAATTCCAAATGATGCTAT TAGGAAAAAATATTGATAACTCTAATATTTCAATCAAGTATAAGAATGTT ACTATAAAAGCAAAAAATTCAGTTTTGCTACTAGGAATTATTTTTGATGA GAAACTGAATTTTAACCAACATGTAGACAAAATATGTTCTACTGTAAGTA GGAATACTACAGCTCTTCAGAGGATAAGGAAATATTTGAATCCCGAAAAA GCCCTCACACTCTGTAACTCATACATCCTTTGTCATCTTAAATATTGCCC CCTCATTTGGATGTTTTCCTCAAGAGCATCCAACGATGAAATAAACAGAG TGCACAAACGGGCTTTACGTGTGGTACATTCAAACTTTTCTTTAGACTAT 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Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000060_pilon:555764..569374-

>XLOC_036502 ID=XLOC_036502|Name=XLOC_036502|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=3930bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000060_pilon:555764..569374- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
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CAAAGAGGCTGAGTTGCCTGAGTCTGCTGATTTCAGATGTTACGTTAGAG
GTAAGGAGGTTAAATGTAATTCGTTTATACTAGAACTGGACATTCTACTG
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GACTGATGCACTCTCTATTATTAATAATGAACGATATGCTCATTTTATTT
TCAGAAAAAATGAATATTACAATTAAGTACTCAAAAAATCTGGAACCTTT
GACAATTTCAAATGATGATGTGAAATCATTGGATGAATTGAAGCTTAGAA
TTGAAGAAACAATTCAGCTGCCAGGACATCTCCAACACTTTGCTTTAGAA
GAGACATCTATATTTGTGACATCCAACAATTTTCATGAACTTTTCTTCAA
AAAAGAGAAGATTGTTTTGAAATTATTTTGTGCTGGCACAGAAGACTCAA
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GTAAAGCAAGTTTGTTTTATCCGTCTAATTATCTTGATCTTGCGCTGCCC
ATACTTCCTCTTTCAGATGATCAATTCCTAGTGGATTTGTTCTTTCAAAG
AGATGAATTCCAAAGTGATTATTATTTGATTCAATTGGAAAAATTTATGG
GAGGCAATTGCATGGGAGAAATACGAAATATTGTTATACGCTCATACATT
AATGAGGATAGAGTCTTTGAGTTGCACCTAAATGAAAAGGTTATCATTGA
TACTGTTGCTGTCAAGGAACGTATCATGGAAGAGATTGGTATACCAGTGC
ACCTACAAGCCTATTGTTTTGAAGCAGATAGCAACTTTTTGAAAGATATT
TGCTTGGTCAGTGAATTTTATATTCATCGTGAATGGGAAGGTTATGATCC
TGCAAATATAGATCTTCGTTTGTTTGTGCTACCCACAAAGGATGAAAAGA
TAATCCAAATTTGCGAAGATCATAACATTTTCATGTTCCATCCAGTTGCT
TTGTTTAATAACAAAAATAAGATTGTAGAGTACAATTTTGACAAACATTC
TATTACCTTTGCAGATGCTTTGAGTATCATGATCAAAGAGGCTGAGTTGC
CTGAGTCTGCTGATTTCAGATGTTACGTTAGAGGTAAGGAGGTTAAATGT
AATTCGTTTATACTAGATCATTACATTTATTGGGTTGGTAGGGATGATTA
TGAAGAATATGGGGAGATGATTGTTGAAAAGCAACTTCAAGTACTTGTCA
GTGTTGCAGAGTCACCAAATGAAGAAAACAACAAAGTATGTACAGAGAAA
GGATTTGGTGTAATGAAGACTGTCACAGTTTTGCTTCATGATCATTCCAC
TGTTGTTCAAAAGTATTCTCTTAATGATGTGCCTACCTTAGACGAATTAT
CGGAGAGGCTTCACGAAATTTTTCCTGGATTTTCCTTTGAATTGTTTCAT
GACAACAAACTCTTACGATGCCAGGAACTGTTTCATTGGTTGTATAAGCT
TTCTGATTTATTCTTTGACAAAGAAGCAAACTCTACAATTGAGAATGTTA
ACATTATCTTGACATTCAAAACCAATTGTATTTTTTTGGATGAAAAAGAT
CTCAAAGTTATAGATGAATACTGTAAATCACAACAAGTTGCTCGCTGCAA
AAAGATCAAAATCAATTTCCAAAATGGAAGAAGTAAATTCATTTGTGATG
ATGATAAATATAATAGCATGGATTTGTTCAGAGATGTGTATCCTAGAGCA
TGCTTGTCTTGGGAGACTGACAAGTTACTATTTAATGGAAGAGAAGTTCC
CCCAGATAAATTTCTTTTAGAACTCTTTGTAGAACAAGCAGACCCAACTA
CTGATTTTATTACCTTCACTCACGAGAAGATTAACCCAAAGCCCGAAAGT
CAACAAATTCAAGATGAATCCCTGGATAGCCCGTGTCTGCTGTTATAAAT
CATTACATTTATTGGGTTGGTAGGGATGATTATGAAGAATATGGGGAGAT
GATTGTTGAAAAGCAACTTCAAGTACTTGTCAGTGTTGCAGAGTCACCAA
ATGAAGAAAACAACAAAGTATGTACAGAGAAAGGATTTGGTGTAATGAAG
ACTGTCACAGTTTTGCTTCATGATCATTCCACTGTTGTTCAAAAGTATTC
TCTTAATGATGTGCCTACCTTAGACGAATTATCGGAGAGGCTTCACGAAA
TTTTTCCTGGATTTTCCTTTGAATTGTTTCATGACAACAAACTCTTACGA
TGCCAGGAACTGTTTCATTGGTTGTATAAGCTTTCTGATTTATTCTTTGA
CAAAGAAGCAAACTCTACAATTGAGAATGTTAACATTATCTTGACATTCA
AAACCAATTGTATTTTTTTGGATGAAAAAGATCTCAAAGTTATAGATGAA
TACTGTAAATCACAACAAGTTGCTCGCTGCAAAAAGATCAAAATCAATTT
CCAAAATGGAAGAAGTAAATTCATTTGTGATGATGATAAATATAATAGCA
TGGATTTGTTCAGAGATGTGTATCCTAGAGCATGCTTGTCTTGGGAGACT
GACAAGTTACTATTTAATGGAAGAGAAGTTCCCCCAGATAAATTTCTTTT
AGAACTCTTTGTAGAACAAGCAGACCCAACTACTGATTTTATTACCTTCA
CTCACGAGAAGATTAACCCAAAGCCCGAAAGTCAACAAATTCAAGATGAA
TCCCTGGATAGCCCGTGTCTGCTGTTATAA
Gene-mRNA-Prot
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
XLOC_036502XLOC_036502-proteinClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonpolypeptide
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
sc0000060_pilongenomesc0000060_pilon:555764..569374 -
Properties
Property NameValue
Aaloc1186-1965:781
Aaloc1-1182:13612