XLOC_036473 (mRNA) -

Overview
NameXLOC_036473
Unique NameXLOC_036473
TypemRNA
OrganismClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon (Jellyfish)

Sequence
The following sequences are available for this feature:

mRNA from alignment at sc0000100_pilon:638701..649933-

Legend: polypeptideCDS
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>XLOC_036473 ID=XLOC_036473|Name=XLOC_036473|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=11233bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000100_pilon:638701..649933- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
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TACAAAGAAGTCCTATGAAAATTCTGAACTCCACTTTGCTTTATGTGTGC ACTCTTTTTTGCTATCATGTGTCAGTCTCTAATAATTAGAATAATTCCCG TGAGAGTAGTTTCAGTATGGTAACAATAATAGTGCACATTTAAAGCGAAT CGGCTTTATGTATAAAAAAAGTAAAAGATAGGTATGTTTTCATAGTTTAG GGATTTGTCCTATTTTTCACAAAATATATATTTTAAAAACTTCTAGAAAG ATCAAGGAAGTATTCGAGTACAACTTGCACTGAAAGCACGCTCTCGAATA TTAGAAGAAAACAATATAATCAAACACGTGCGTGTTTATATTCATTTGCA TAATTAGCTTGTAAAAAGCAGTCCCCGAAAGAATCTTTTACAATTTCCCC ATAGAAACAGATATTGTACTCGGCCAAGTACCATCCCACTTTATTGCAGC GGATTCCTTTTTTCTGACAAATCCATCTTTTGGCACGCTGTTCAGCTAGA TGACTGTTGCCTTGGTATAAATCAACAGTATTGGATACCGCAATATTCGG TTGAATATTAAAATTTGTCTCACTGAAGACCATACTCCCTTGAGCAATGG GTAGAACCCATGCTCTATCAGCATTTGAGTATCGGTCATCTTTATTGTGG AGAAGATATCCCGTGCGTTTGTTTGGTTGCGTTAGTATCAAAATATCGTG GTTTTCATTCTTCTGGCATTTCTTTAGAGTTGAAACTTTCACATGAATTC CAGGGCCTCCGATGATTGGAGGATGTCTCACCAAATACGCTTGACATTGT TCTCTCAAATGCTTTACATGATCACCCGTTACCAACTCTGTTTGCAGGGT TTGAGCAGCAATGGCCTACAAATAGTATCCGATATTGGATACAGTTCGCC CATAGGAAATAGAAATAGAGTAGTAAAAAGAACTTCATATAATAGTAGGG GGCAAGCCTGGAGTTCCGTGACATATTTTTAGGACCTAGCCATTTTTAGT CTATCTGGTCTATCCCAAAGAACATTGTATTATAACATATTTTTGAGAGG GAGGATGCGGATAAGGCCCAGGAAAACTATTTAAGACCAAAATAGTGACG CAATAGGCAAAACTGCAAGGGAAAATGAATGAGGGGTAGGAAAACAGCTG AGTTTCAGAAGTCAAAATAAACGAAATTGATTAATATATTCTGGAAGAGC ATGAAATTCTGAGCAAATAAACGTATTACAACTGATCTCTTACTCAACCA CACAAAGAAATACAGCCATTTTAAAACCAGCGACCTGTCAGCCAGCTCTA CAGTACTGTGATTTGACGTCAAATCTTGTCTTGATCGAACTGACGTCGGA ATATGTTTTTAACTTCAAACTTTTTTAGTTCAGTTTGAGCTAGAATCTCA GAATGTTTGTTTATGAGTTTGTTTGTTTGTTCGCAAACTTTAGAACAGTG TAGAGAACGGTATAATTGGTTTACGGAGCTGAAATTAGGGGTAGTTTTTT TAGTGTACAACGCAGATTTTTACAAAGATGGGGAGCTCTACCGTTTGGAA ATGACAAAATCGCGATTGTCCACTTTTTGCAAGGTCAAGGATTGCTGAGT ATCGTGAAAGCCTGTCCAGGATGCAATTCTAACATGCGTTTCGAGCGACA CGACCAATGTTGTGATGGATATCGGTGGTGAGTTATACTATTACGTATAT TACACTTTTTTGTTGTTAAAAATAATTTAGTGTGTGTGATATTCAGTTTG ATATTCGAAATTCACTTTTAGCTCTACGAAGGAGGGCAGTCATCTGCTTG ATTTCTAAACCTCTAAAGATGTTAACCATCATTTCCATCAAGAATGGTCG CTTTCCATTGCAGTGGTGGTACTACTTTGATCGGATTAAATTTCGCGAGA TTAAATTTAGCAAGCCAAAAAATTCGTGAAATTTTTTGGATTTAATTTCG CGAGTCAGCAATTTGAAAAATTTCGCGTTGATTCAATTTAGCGTGTAAGG CATTTATTTCCCAAAAAAATTACACTTTTACGTACAATTTTTCACGGTTT TGAGTTAATTTATTAATTATTAATTAGTATTAATGTTTACGCACCTTAAC ACTGCGCATAATTTCGGTATTAAAGTTCACGTATTTTCGGGCCTCTGCGC GAAATTGCACGAAAATTAGTACGCGCGAAAATTAGTACCTTCTTTGTAAT TTTACTAAAAGGTTGTTGTTTGATTTACATTGAAGCTTAAAATATAGAAA GATTAGATCATAAAAGTTTTCTACAAAAAGAGTCTTCTAGAATGAGTCAT GGTCCTCACATTACAAATTTCTCTTACAGGAGATGCAATAGCCGTCCTTG TAGAGATTCAATGAGGCTGAGAGAAGGCACAATCTTTGCGAGTTGGCAAA GAGTATCTCTTCCGGACCTGTATTTTACCATCTATTTGTGGGCCAACAAA GTTTCAATGACCAAAACAACCAACATCGTCGGCATCAGAAAGGAACACAC GATCAAAATGTTCCAGTTGTTGCAGCAGGTCTGTACGAATCGTCTGCAAG CCAACCCGATAACTGTGGGTGGTGGTGGGCCAAACTTCGTGGTGCAAATT AACAAAAGTCAATTCCAACACGTTCAAAGGGTATGTTAATTATATTGGTA TTGAATAGTAATGTTGCTCAATGGCAAGCTTTCTTTCGGGGGATTAATTT TGGAATCTCTAGTTTGACCCCCACAGTTCAGCTTTATCAGAAATTCAACT GTTCCTAATCAGCCTATTTCATAGGATTCGTGTTTTCAGTACATGATTTT GGGAATAATCTGTACACGTAGACAATTTTAAGATCACTCCATCGATTCAA TCATTTGTTTTACAATTCAGTTGAAAAACTTTGGCTAAACAAATTTTCTT TCAGCTGTAGATTCTTTTTTTTATGAAATTTATTAAGGAAATAATACTCT GAAATCCGAATTTGTTGAATTCTAGCTAGATTTGATTTCCAATCATAATT TCTAGGGAAGAGTCGGAAGAAGAAGACAACCTGTTTGGGTATTTGGGTTG GTGGATACGCGTTTCACCCGAGCCAGAGGTTATATGGAGATTGTCAACCG TCGAAACCGTCCCACTTTAGTGAATGTTATCAATAATGTTCTTAACCCAA ACACTGTCGTCCACAGCGACCGGTGGCCGGCTTACCATCGGTTGCGACAG TTTGTTCCAAATTGTGTACAACACGACATTGTCAACCACACCTACCATTT TGTGGATCCTCAAACTGGTGCACACACACAAGTAAGACCATGTGCCTAGT CTAAATTTTCTTTACTAGGTTTGCGGAATGACGGGCATGTGCCGCCCGAC TTTTGCCCTTTAGAGGGAATGAAATCAAGGCTTTTTAGTGCTGGTGCTGG TGTTTTTCTAGATATATATTAAAAATAGCAATTAAAATCTAATTTCAAAA CTCATGTATTCACTTTCAGAATATCGAATCATATTGGAACATATTTAAAT TGAAGCTTAAGGCAATGGAGGGAATCCAGCTCCAATTCCTAACTAGCTAC ATGGAGGAATTTATGTGGAGGTAACTTCTTTGATTTTATTTGCATTAAAA TAGCTTTTTTCGGAACTCATATTTTAATATTAAACAGTTGTTAGCGTTTA ACAATCGAGGTTTTATGCGTTTTTGTTACATCCTTCTCTATGCAAACCTT GAACGGGTTTTCGCTGGGTTTTACGTTATGTTTCACCATAAAGTCATTAA ACTATCAAGCAGTTTTGTTAAGATTTCATCAAATAAAGTCAAAATGTTTC GAATCATTTCAAAAATTTTAACAGCAATCTTGTTAGATTCTACCCTTGGG GTAAAGAGAGTTGACGCTTCAGTAGTTGTCTAGAAAATTGTTCAAACTAA TTTTAAACGTATTCTTGTTGTTTTAAGAGATTGGTATGGATTGAATACTC CATTTTGACCACATCATCAATCGCATAAATATTGACTATCCCATAGATGA TAGAGTTGAGACAACGTTGTAAATCTTTGTATTTTTTATAACTGAAGGAT TCTTTTTTTGAATTTTTTGAACATCTTTTTCACAGAACAAAGAAAACATG CCAAGTAATTCATTGTTTTGCTTGTTATAATTTTCTCTATTTTTTGGTGT TTGTTAATTTAGAAACGGGACATTTAAAAGAGAAGGGGAATATTTTGGTC CGTAAAATTGATTTTGGCACGAAGCGGGGGGACAGTCGCTTGTATTGTCC GAGTTATACCCATGTACAAGTGGACTTCTAGGGGGTACCAAGTGTCCAGG TACCGAGTTATTTGTGTTTGGGTCTCAAGCAGACTTGTAGGGAGTACCAT GTGAACTTGTAGGGGACACCAAGTGGACTTGTAGGGTATACCTAATGGAC GTGTGTTTAGGAATTAAAAAAATTGACGTTAAGTTTTACCTTTTTTAAGC CGATCCTTATTGCACCAAAAGACAAGGGCGTGCGCAAAAAGGGTCGATTA GGATATTCAAAAGCATAGCAGTCGGCTAATAGTACACCAAAAATTACAAG CAAAATTGGTTAAAAACTTATCTCTTCGAATTTTGTTTTTTCATAAACAT TTTAATGAAAGTTCGTAAAGTAAGTTCGAAAATTCGTAATTAAAGACCAG AGACATGAAATGAAATCTTAAACAATGTTTCGTCCTTAAGTCTGGCTAAT AGCATATGTGGTTCAAGCCACATACCTTGTAACATCATTTCACTCTATCC ACTGGTTTGAGAGAAATTCGATTGTCAAGTTGTGCACTCGAGTTTTACTG ACCATAACTGATTTATTGCGGATTCTGTGGATATAAAGTATACTTGACCA GGGTACAAAGTATACTTGATCGGGGTACAAAGTATACTATTGCCGGGTAC AAAGTATACTTGATCATGGGTACAAAGTATACTTGACCATTGGTACAAAG TATAGTTGATCACGGGTACAAAGTATACTTGACCATTGGTACAAAGTATA CTTGATCACGGGTACAAAGTATACTTGATCGGGGTACAAAGTATATTAGT GACGGGTACAAAGTGTATTTGACCATGGGTACAAAGTATAATTGATCATG GGTACAAATTATACTTGATCGCGGGTGTAAAGTATATTTGATCAGGGTAC AAAGTATAGTTGATCGCGGGTGTAAAGTATATTTGATCAGGGTACAAAGT ATACTTGCTCGCGGGTGCAAAGTATACTTGATCGCGGGTGTAAAGTCTAT TTGATCAGGGTACAAAGTATAGTTGATCGCGGGTGTAAAGTATATTTGGT CAGGGTACAAAGTATACCAGTGAATTCGATCTGGTCAGTAAAATAGTTTC GGGTACAAAGTATAGTTGTAGCTTTCACAAGTATAGTTTGTACCCGTGTA CCACGCTAACCGGACCTGATCCAGATCAAGTATATAAGTGCATAATCTTT CCTTGGTGAGAAAGCTTGCCGAAGATTTCGAAACACTGGTTACAACTCGA ATTTCTGTTCTCTAGTAGCTTCTACTTACTATCTACACTAAAAATCATTC ATATGTTTTTTTCTCTCTTTGCAGAACATTCGTAACAGTTGCAAGCCATT CGATTGTTCGGCCAAGTATAATGGATTTCGGAATTACTACAACAAGGTGA CAAAACGATGCGAACCAGTATTTACATGCGCCACACCGCTTGGTGACGAT GATTTACCTGATTCGGTGAGTTATCCCAACATTTTTCACAATGTTTTATA ATTTTTCATAATTTTTGAGACGGAGGTGAAATTACCTCATTTTAACGTAT CGGCAATTTATACAATAGAAAGAACAACTTTTCTGTCTTTTCGGCGCCGC GCGATCACAAATTTTAAGAACTTGTCTTGTTCATTCTGCTTCGTCAGCAT AAGGGCGCGGCCTTTAATAGAGAAAAATGCAGGTAAAAGAAGGAGCTACG GTTGACGTGATTGTGGAAAGTGGTTTTGGTTGCGACTTTTTTCAAGTACC ATTTTAGACAAAACTGACGCATCTTGAACATACATTGACAATTTACTTTT GTGAAAAGACCAAACAATCTCGAAAATTGCGAAAACCTTCTGTTCGCGAA AGTTTGAACGCTTTAAGTTATTAAAATTCCTTTCGTTTTACTCTTCTCAG CCTTTCTGAAATTTTGCCCTCTGAGGTCTTGGGTTTTAGATTGTAGAATT TTCACAGCGTCTTCAGTATAAATCCTAACTTATTGGCTACAATGTATTTA ACAATAATATCAAGTCGATATAATATCGAATGTTGTATCTTTATTTAACC CATTTTCAAAGGCTTGCCAGGTCTTTATCGCTCTTTGATTTTGTGTGACA AGTTTTACAATTCCCTTGACAGGCATTTGATATGGATTTCAACAGTTGTA AATCGTTAGAGCCGAAAATGTCAAAAGAGGAAGAAGAAGCAGCCCAAAAT TTGATGAATAAAAGCCCGTTGCAAAAAGAAATA

Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000100_pilon:638701..649933-

>XLOC_036473 ID=XLOC_036473|Name=XLOC_036473|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=1512bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000100_pilon:638701..649933- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ATGAAGAGATATTGGGCATCGATTTTCTGGCAATTCTTGGCATACATTTT
ATGGATTTGTTTTTTTCATTTTGTGATTGGGAAATTCCACGTTGATATGA
AGAGATATTGGGCATCGATTTTCTGGCAATTCTTGGCATACATTTTATGG
ATTTGTTTTTTTCATTTTGTGATTGGGAAATTCCACGTTGATAACGCAGG
ACACTTTCCAGTTGATGAGGATGATATGGGAATACGTTTTTAACGCAGGA
CACTTTCCAGTTGATGAGGATGATATGGGAATACGTTTTTTCGTGACAGT
TACGAACAATTTGAATAAGAAAATTCTGGTGTCCACAGGTAAAGCACCAG
AGTGTTGTTGGAAGGTGGATGACGATGAAACTGATTGCGAGTCGTGACAG
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GAGTGTTGTTGGAAGGTGGATGACGATGAAACTGATTGCGAGTCGATGGT
ATTGGTCGGAGGATTTGAAAAAGAAATTGATGGCAAAACAAGCAAAAACA
TGTCTTTCATGTTCTCGAATTTGTCGATGGTATTGGTCGGAGGATTTGAA
AAAGAAATTGATGGCAAAACAAGCAAAAACATGTCTTTCATGTTCTCGAA
TTTGTACCCCCTAGATCGTGTTGGTTCGTGCAAGTTTTATTTGAAAGAAG
GGAAGGACAAGCAGTTTTTGGTGCACGAAATGAAGTTTGACACTACTCCC
ACTAATGAAGACACAAGTTCCTCTATACCCCCTAGATCGTGTTGGTTCGT
GCAAGTTTTATTTGAAAGAAGGGAAGGACAAGCAGTTTTTGGTGCACGAA
ATGAAGTTTGACACTACTCCCACTAATGAAGACACAAGTTCCTCTACTGT
GTATGGAGGAGGTGGTAACCAGTTTTACAAGGCGTGTGATACTGTTGATA
ATCTGTGTATGGAGGAGGTGGTAACCAGTTTTACAAGGCGTGTGATACTG
TTGATAATAACATTCGTAACAGTTGCAAGCCATTCGATTGTTCGGCCAAG
TATAATGGATTTCGGAATTACTACAACAAGGTGACAAAACGATGCGAACC
AGTATTTACATGCGCCACACCGCTTGGTGACGATGATTTACCTGATTCGA
ACATTCGTAACAGTTGCAAGCCATTCGATTGTTCGGCCAAGTATAATGGA
TTTCGGAATTACTACAACAAGGTGACAAAACGATGCGAACCAGTATTTAC
ATGCGCCACACCGCTTGGTGACGATGATTTACCTGATTCGGCATTTGATA
TGGATTTCAACAGTTGTAAATCGTTAGAGCCGAAAATGTCAAAAGAGGAA
GAAGAAGCAGCCCAAAATTTGATGAATAAAAGCCCGTTGCAAAAAGAAAT
AGCATTTGATATGGATTTCAACAGTTGTAAATCGTTAGAGCCGAAAATGT
CAAAAGAGGAAGAAGAAGCAGCCCAAAATTTGATGAATAAAAGCCCGTTG
CAAAAAGAAATA
Gene-mRNA-Prot
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
XLOC_036473XLOC_036473-proteinClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonpolypeptide
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
sc0000100_pilongenomesc0000100_pilon:638701..649933 -
Properties
Property NameValue
Aaloc646-756:112
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