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Sequence
The following sequences are available for this feature:
mRNA from alignment at sc0000094_pilon:310181..318759- Legend: polypeptideCDS Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >XLOC_036455 ID=XLOC_036455|Name=XLOC_036455|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=8579bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000094_pilon:310181..318759- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ATGGCAACTTCTACACGAAAACAAAAAATATGCACCATGTATTGTTAAAA
CGAATTTCTAACATGACTGATATACGCTATTGCTCGTTGCCCCCATTGAG
TTTAAAGCCCGAAGGGCTAGAGGTCAATCTCTAACCTTTCTCAGGCAAGA
AAAAGTGAAGCCTTAAAAAATACGCCGCATTTTTGACGACAGATTGAATC
TAACAATTCCTTTGTTTATGATTGATATGTTTTTTGAAATTTAGCGGTAA
ATTTTAGTTTCAATCTGTCATTTGTGTAAAAACCAGGCGAGCCGCTCAAG
GCCGCGCAACTTTGGTAGGATTTGTTGGCTTCAAATCCTGCCAAGGAGAT
TGACTTCTAGCCCTTCGGGCTTATACTTCATTGGTTGCCCCCCCCCCTGC
ATAAATTTTGAGCTATTCATTGAATGGTCATAAAATTTTACACACAAGTA
GGCGATAATAAAAGGAACAAAATCGTGAAAAAATATTTTCCAAAATGGCT
GCCATTTTTTGATGACTTCATCATATATGTGCAAAAATGTAATCTTTTGA
CGAAAAAACTGAATTTCTTAAAATTACAATCCCGAGTTATCTAAATGAGC
TTTTTCTATTCTGTTTTGATTTTTTGAAAGATAATACAGCCACCACCACC
CCCCAGTTCGAAAAGGGTTAAATAGTGGTTTTGATAGGATAAGTCTACTA
ATACATAGCATATTACATAAAGAATCTTACTTAACAAACAGAACACACCT
CGATTCGTATTAGATATAGTTAATCTCAAATATGTTGCATAAAACAGCTT
ACACTTCTATATATCTTTCAAGCTAGCATTTTCTTACGTACTTACCGACT
TTCCTACTAACAAAGTGACCTAATGAAATTTTTCCATCTTTTATTATCTT
TCTTCAAATTTACCAAGTGCTTTTAGTAAAGTCACTTTTCCTTTTGGCAC
CTGTCGGCTTCCCTGAAGGTTTATGCTATGATTTTAGCCAAAAGTGTGTT
AGGGCCCCTTCACCTAGATTTAATCTGTGACCACTGGGGGCTCTTGCGCA
ATAAATTTGGATGTTCCAATCAACATTTAATGTGAAGAGGAAGAGGATAA
AAAAAGCAACCCTTTTTAAAGGATTTTCTGCAGTTAATGTTTTGATCACA
ATTAAAATTCTTAATGCCTCTGATGATTTAACAGGAATATTGAAAAATCA
GGGAGGAACTAATGATGACTTAAATTTTCCTGTTTACGCTTTAATACAAA
TGTGTACTGAAGCGGAACAAAGCTAGAACTAATGATGACTTGAATTTTCC
TGTTTCTGCTTTAATACAAATGTGTACTGAAGCGGAACAAAGCTAGAACT
AATGATGACTTAAATTTTCATGTTTCTGCTTTAATACAAATGTGTACTGA
AGCGGAACAAAGCTAGAACTAATGATGACTTAAATTTTCCTGTTTCCGCT
TTAATACAAATGTGTACTGAAGCGGAACAAAGCTAGAACTAATGATGATT
AAATTAAATATCTACAAATGTACATGTTTACAGTAAACAACTTCTCACAT
CAGACCACATAGAGCTCAGACCAAAAAATAGAAAAAACGTAAACAAAAAA
ACATCTAAAACTATAAATGAGAAGAATGCACGTTCACAATAAAAGTATAA
TTGCTTTTAGCAATTATAATTTTATTGTAAGTGTGCGACTACGATACTCG
TCTTTTGTATTTAATGACGGTTTTAATGCTTTAATGGCTAAAGCTTCGAG
AGTTAAGGGCTCTGTAACCAATTTTAAAACGAAAGTTCGAATTTTGTTAA
AATATATTTTGACAGATGATACTGTTACATCTAACTAAGTGAGCTGTGAA
ATTCTTTTGAAAAAAAATCAGTTCTTCACCCTCACTGCCGAAACAGAGTT
GAGAAACACATCATTCTTTAATCAACAAAATGATTTGTACGTGTAAGTGT
AAATATTCACACGAAACATCGGCGTATTAAACAGAATTTCTGGAAAGGTT
TATTGCTTTCAATCCCGGGGGGGGGGGCACTTAGGCAAAAATGGATGATG
GGTATGTGCGGACGGTATATTTTTTTCACCTTTCAAAGTCTCTCTAAGGG
TCGGAAAAATCAGAAAAGTTTTCAATTAGTCTCTCTAAGGGTCGGAAAAT
TCAGGATTTTTAGGAAATTTTTTGATTTCCAGAGAAAAAAAATTGTAAAA
AAGTCTCTCTAAGGGTATGACTTTTTTCAAAAATCGAAAAAAGAATTTCA
AAAAGTCTCTCTAAGGGTCACCTTTTCAGCAAAAATTAGTCTCTCTAAGG
GTCGGTTTTCGGAGGTCACGTCCACACATACCCCTCATTCGCCAACCCTA
GTACCCCCCCGGGCTTTCAATATAGCATTTTCTTTTATGCTATTTGCACA
GTGCCGTAGCAACTGGGGGGGGGGGGGCAAGGGGGCTATGCCCCCCAATA
TTTTTTTCAAAAATGGTTATTTTGCAAAATGCAAAGTTTTTCTTCTTTTT
TTCTTGAAAGCATTTTGTTTTGAATGCGTTTTCAAGCAATCTATTATTAT
TATACAGAATACGGTTTCAGGCCCGTTCAGGTCCTCTCTAAACAAATCTT
GTTTTACAAAATATCTTTTTTAAATATAGTCCTCCTTGAGGACTTCCTCG
CACTCTCCATTTGTAATCGCTCTGCGGCATTGCTCGATTTCTCTCGTTTG
CTTTACTTCTCCATTCTTTTACTTGGTCTCTTTCAATTATTGTTAAATCG
TCTGTGATGCTCATACTGGCGTACTTATCGTACTGCTTCAATTCTCTTAA
GTTTCTCATAAATTTGTATTTTACATGCCCGTCATTAAATACAACTTTGA
TTGGTCGTGTACGATTTGATTCTTCACCAATACGGGAGATCTATTGTGAC
AAAACCGACTCTATTTTTAATTGTCCAAGCAGCTTCATTATAAAAAGTAA
TCTATTAAATATATTTGACAGACTACTAATGGTCACCTCTATTAAAAGAA
AACCACAAAAACAACCTGGAAAAAATAAAAATTTTCCTGTTCTAAGCTTG
CACCGTTTTGGAATGTTTTGGAATGTTAGCTCCTAATTAATTTCAAACGT
CAATGACTGATCCAAGATAGAGAAGATAAATAAACTTTTTGGTACAACAT
AACAACTAGACATCAAGTCAAGGTCTTAACTAAAAATAACTTAAATAAAC
CTGTTGATATAATTAGGAAAGACAGTGACAAATTCTTTGGTCTTATGTAG
TTTTCCTTTTGCGTCTAAAAAAGTCCCCGACTGTGGTAAAAGTACATAAT
TAATACCCTTAGTGACGCTGTAACACAGACAGGAAGCCTATTCACTGAAA
AGTACTAAAGCAGAGTTATTATTTTTTTTGGTAGAGGGCGAATGAAAAAT
TACTTTCATGCGAGATTCATCCTAGATTCTAGGCCGGCGAATTCTTATTT
TAGAAAGTCTAGTGTGTTGATTAGCGGAAATTTTTATCGTGAAAAGCATA
GGTCGAAATCATATATCGACGCTGTGCTGACGAATCGAGATTCTATTCAG
CGCGCAATCAACGAAGACAAAAGTAACCATGACGATCATCCAAGATCTTG
GATGAAGTTCAAAGTTGGTATTTTTATTACCGTCGTTGAAAGCACAACTT
AAAAAAGTCATTTGTAAAAAGAGTCAGTGATTACTGTTATTATTACTGTT
TAGTAATTACTGTTGTCACGAGTTTTTGCCAAAACGAGGCTAAAACTTTG
GGGCAGGCTGGAGACTTCAAAAATGATCAGATTTGGCCGAAATTTTGCAC
ACTTGATACTTGGGTGAATCCCTGGGGGCGGTTTTTCATTTTTTCAAAAT
TTCCATTTTCAAGGGCGTGGTCACAAGTTTTCGCCAAAACGAGGCTAAAA
CTTTTAGGCAGGCTGGAGACTTCAAGGACGAATCCCTGTGGGTGGTTTTC
ATTATTTCATAATTTCCATTTTAAGGGGGTGGTCATGAGTTTTTAGTTGA
AATTAGTTACATTTTACAATTGGGCCTGCAAATGATTTAAAATCACTGAA
GTTGAGCCCAGTGCGGTTAGCACGTTCGACACTTATTACTGCATGTTTAG
TAATTACTGTTACATTTGGGGATCATGTAAAAGATTTCTTTTGAAATAAA
CTCATTTCAATTACACTTGGAGGTTTCTGGGGAATTCGTAAATAGTATAC
TGCATACTGATACAGTCTGCTAGACATTAATATGGTAATATTTGCTCTTC
ATCTTTGATTTTTTCTACAGTGATTAGATTGACACATGTACGATAAAATT
TCTATTATTGGTCTTCAGAGGTTAATATATTTTTTGAAAACTTAACCTCT
GATACTCAGGGTAGGAGATGTAAGTTGGCTCTGTGTTTATTATTTAAAGT
CGTTTAGGAGTTGTCATCTCTTTTACCATTACTCCATGGATGATGATGTT
AGCTTCCCTTGATTGATTTCTCTGTTCTTCCATTTGTTCTTCGACTTTTT
AGCTGCGAAGTATTTGTTTCATGCTGATATATTTAACTCGTTGCCGGTTT
TCGTGATTTCGGCAAAACTTTTCTTTGAATGTGTTTTCGTTTTGTTATCT
ATAGGTTTTGCATTCATTGCCTCTTCGATTGTAGCTGTCAGTTTAGTTTC
CAGCGCTCTAATTTAGAGCTTAAATTTTCAAAATTTCCCCCTCGGGCTAA
ACGATGGTTGCCCCCCCTCATTAAGAAAATGCTTCCTACGGCACTGAAAG
GTATTATATATGAATCTTACTCTTAGGTGCCAAATAAACAGGGGGTTCGA
ATGAACGGGGGGGTTGAAAAATTTTCGAAATTTTAATGAACGGGGGGACC
TAATTGCCGGGGGGGTTGGAAATTGTACTTCTGAAAACCCCAAAATAAGG
TAAATACAGGCTTTTTGGAGCAAAATAAGGGGACTTTTTTTTGCCGTCTG
AAAATATTCTTAAAATTAATAAACAGGGGGTCCTAATAAGGTCCGGGGGG
ATGGAAAATTTTAACAAGAGAAAAATTAACAAGCGGGGAGGGGGCGTTTA
TTTGGCACCTAAGAGTAAATGAACAATATTGCATAAGTACGGCAATTTTT
TTAGGCTTCCTAAATTCCAACTTCAGCATCGAGTCTTTAAGAGTAATTCT
CTTAAAAAATAAAAACTGACCGATGGTCTATGCCAAGTTCAACCTTAATT
TTCAACATTCAAATTAGGTTCAGTTTAGGACGGCAGTTATTTGTTCTCAT
TAAGAAACAATATTGCATAAGTACGGCCATTCTTTTCACTCCCTAAATTC
CAACTTCAGCATGGAGTCTTTAAGAGTAATCCTCTTAAAAATAATAAAAG
CTGATCGATGCTCTATGCCAAGTTCAACCTTAATTGTCAACATCCAAATT
AGGTTCAGTTTAGAACGAAATTAAGACTAATCTAAATACATAGGCAAGAC
ATTTCATTCTGTGAAGGTATTTAATGTAACTGAACACAAAAGGCATGGTT
TGCCCTCGCGGTGTCATTAAACTTCAGCCCCCCCCCAATAAGAAAATGCT
GCCTACGGCACTGTATTTAATGATAACTAGAAGCTGTCCAGATGTTTCAT
GGATAATGAATTCAAACAAAAGTTTCCTAATGAGCTATTTTTCTATTTGA
CTTTGAAATTATCACTTAGTTAATGAACGACTGACATTGCTAAACCATTA
ATTGTGTTTAGAGGGTTAAGTGTCACACCCTAATAAAGCATTGTGATTTT
AACAAAGAACAACCCTGGGTCTTCATCTTTTGAAATGTATAAAAGGAAAA
GAATCGAGGCATTTAGTATCAGTTCAAAGCAGAAGCTGAAACGGTTGAAG
ATTTAATTTCATACAAAGGAACGAAAAAGGTAGAATACATGATTTATTTA
TGTTATACGAAATAATTTTATCATGCGTTAATAAAAAGTTTTAACTACAC
ATTCACAATTCGTATAGCATATCTTTAAGGTATGTGTAAGGGCTGCGGGA
AGGGCTGTAAGGGCTGGAGAAAAGTTTCCATGCTTATTCAAAAGCTAACT
GGGGAGCTCCGAAATAGTCCAGCCTTAATAGGGCTAATGCAATGAATGCA
ATTTTATATTTTAGAAAAAGCAACAAAATGAAGATTGCTGTGTTGTTAGT
TTTGGCCATTGCTGTTGTATGCGAGGGACAGGAAGGGGATTTATTGATTT
ATGGAGTAAGTAAAACAAGCTTTATAATTTTTGAAAAGTAATGGAAATGA
ATGAAATTAAATTCTTACTTTAACCCTATTTCAACAAGAGGTGGCGGGGG
GGGGAGGAGGGGGTGGGGACCAATTCGCCCCCCCCCCTACCAAACTTTTG
TTTATAACTTTTTATTGGCAGGGCCCTGAAACGTTTTGAGTTTTCCTAAA
ATTTATTTTTTGGAAAATTTCTAAAAAAATATTTTGTGACGTGACTAGTC
CTCGTGCTATTGTCAATCCATCAGCAGGTGGTATGACACAAATTTTGACA
ATAAAATTTCTTTCATACATCAATCGAAAGATAATTTGATTGTGATTTCA
AATATATAATTATTTTTCCTGTCACGTGACATGTCCCCTTGTTATTGAGA
AAATACTATTGATGTCAAGAGATGCAGAATATGATAAGGTGCCATCATAA
CTAATTTTGATATAATAGCATTTACCAATAAAAAGTTATGATGGGGGGGG
CGAATCGACCCCCTAGTTTTGAGGAGCCCCAAAAAGCCTAGTTGAAATAG
GGCTAAAGTTAAAGCAGTTAAGTTCAGCTATGAAAAATCCAATTCAATAC
GTTTAAAACAATGCAAAATATGTTTGTCATACACCTTAAGTAATTCGAGC
TATTAAAGGTTTTTTAATCTTTTACATGGGTCTAAGATTGACATTCTGCC
ATAGATACTAAAATTTATTAGAACCTAGATATCACGTGATAAGTGCTGTT
ATTCCTGCAGGGAACAAAGCAATTCAAAAAATCAATTTGACCGTTCAAAA
AAGAATTTCTGAATTTGTTGTTACATTTTCATTATTTAGTGCCCAAGTGG
ATATTCTTTAAAAGGGACGTATTCTGGCTCGACCACAGCTGTTGTATATA
CAGCTGCCGTGAAATCTACTTGTTGTCCAGATAGTGCATCAGGTGAGAGC
ATTTTTTTTTTCAACGGAAAAGGGGGAAGCGTTGCGCTATGATAGCTATC
CGATATGAAACTCACAACGATAAATTCATTTGCAAGTGTGAACAGGAGCC
CTACTTGATGTATTTTTTGTTTCGTTAAGACATCCAGTATAATGTGAACA
TAGTTTTAGATTTGTGTACGGGACGAAACTGAACTTGAAAATATTGACGG
GTGGGGCGGGGGGGGGGTGTTACTATCTTTCTACAAAAATCAAGATTTAT
AAGATGATTTGTTTATGAACCTTATATTATTTGGTTGGGAATCGTCACGT
TACTATTTTATTCCTTTGATTGAATTTAAGTACAAAATCATCTCTCATAA
AAATCTGATATCATTAACTGACCTCCTGAAAAGCTTGCCATAACGAACTT
TACACGTTCAAATCGATTATCTGTTTTAATGAGAAACATGTGTTAATTTG
TTTTAAGGGTGTGACAAGCATGTGCGAGTAAGGAAAAATAGACATATCTT
AGCAATCAAACCTATAGAATTATAAAATTAAATGGTGTATTAAATTAAAT
ATTAAAATATTTTTACTTTTAAAATAATTCTGCTGCTACATTAGTATCCT
TTCATTCATACTACTAATCCTTTTCATAGACTTTCATGATCTGGGAAGCG
GAAGAATCTTTTGTTGCCCCAGTGGATCAGGTGCTTCTTGTTCAGGTAAG
TATGCTATAAATATATTCTCCATGTATTTGTTTTATCCTTGACTCTGTTT
ACCTGGGCTTCTTTATGTACGTTAAATACAACTTTTATACTTCATACAAT
TATATTATAACCTCATCACAGAAAGGCTCATTTTCTAATTGCTGCCATCA
CTATTTAGCAAAACTACGCGTCTTATTTTTAAAGTCTTATCTAGCTTTTA
AAACCATTGCCGTATATAAAGTTTTAAAGGAAATAGTTTGCACGTTACAA
AATTTGACAATTGTTTGCAAAATCAGATAATATTTCTACTGACATCAACA
CTTTATAAGCACCTTTTAGCCGAAATCTCATAAATGATACCTGACATTAT
GACGCTAGATAGGGACTGAATTTCCAAATGTATTTCTCTTCTCTTTTCAA
CCACTGGTATAAACTGATTCCATCGTTGAAATATCCTTGACCTGTTATTT
ATAGAATAATAAATTTGATTGTAAATTGATCATACATGATCTGGAAACCA
TGTCAAGTGAGGGAATGTAACATCGTGTGATACGATAGTAACGAAATGTT
ATTTAGATCATTGCCTTTAACTTGTTTTGTTCTTTATAGGTACTCAATGT
GATTGCAAAAATGGCGGAGCAATAAGAGCTGGCAAACAACCTCAAGCCAA
ACGTGTCCCCTCCTCTCGTAAAGATACAATGGAGAGGGAGTTGAGAATCG
AAAAAATTGAGAAGGCATTATCCCTCTAA Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000094_pilon:310181..318759- >XLOC_036455 ID=XLOC_036455|Name=XLOC_036455|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=876bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000094_pilon:310181..318759- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ATGGCAACTTCTACACGAAAACAAAAAATATGCACCATATGGCAACTTCT
ACACGAAAACAAAAAATATGCACCATAAAAAGCAACAAAATGAAGATTGC
TGTGTTGTTAGTTTTGGCCATTGCTGTTGTATGCGAGGGACAGGAAGGGG
ATTTATTGATTTATGGAAAAAAGCAACAAAATGAAGATTGCTGTGTTGTT
AGTTTTGGCCATTGCTGTTGTATGCGAGGGACAGGAAGGGGATTTATTGA
TTTATGGATGCCCAAGTGGATATTCTTTAAAAGGGACGTATTCTGGCTCG
ACCACAGCTGTTGTATATACAGCTGCCGTGAAATCTACTTGTTGTCCAGA
TAGTGCATCAGTGCCCAAGTGGATATTCTTTAAAAGGGACGTATTCTGGC
TCGACCACAGCTGTTGTATATACAGCTGCCGTGAAATCTACTTGTTGTCC
AGATAGTGCATCAGACTTTCATGATCTGGGAAGCGGAAGAATCTTTTGTT
GCCCCAGTGGATCAGGTGCTTCTTGTTCAGACTTTCATGATCTGGGAAGC
GGAAGAATCTTTTGTTGCCCCAGTGGATCAGGTGCTTCTTGTTCAGGTAC
TCAATGTGATTGCAAAAATGGCGGAGCAATAAGAGCTGGCAAACAACCTC
AAGCCAAACGTGTCCCCTCCTCTCGTAAAGATACAATGGAGAGGGAGTTG
AGAATCGAAAAAATTGAGAAGGCATTATCCCTCTAAGTACTCAATGTGAT
TGCAAAAATGGCGGAGCAATAAGAGCTGGCAAACAACCTCAAGCCAAACG
TGTCCCCTCCTCTCGTAAAGATACAATGGAGAGGGAGTTGAGAATCGAAA
AAATTGAGAAGGCATTATCCCTCTAA
Gene-mRNA-Prot
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Position
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
|---|
| sc0000094_pilon | genome | sc0000094_pilon:310181..318759 - |
Properties
| Property Name | Value |
|---|
| Aaloc | 301-438:139 |
| Aaloc | 235-297:799 |
| Aaloc | 130-231:1541 |
| Aaloc | 40-129:2465 |
| Aaloc | 1-36:8580 |
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