XLOC_036405 (mRNA) -

Overview
NameXLOC_036405
Unique NameXLOC_036405
TypemRNA
OrganismClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon (Jellyfish)

Sequence
The following sequences are available for this feature:

mRNA from alignment at sc0000017_pilon:247128..257331+

Legend: polypeptideCDS
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>XLOC_036405 ID=XLOC_036405|Name=XLOC_036405|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=10204bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000017_pilon:247128..257331+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
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Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000017_pilon:247128..257331+

>XLOC_036405 ID=XLOC_036405|Name=XLOC_036405|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=1330bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000017_pilon:247128..257331+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ATACGAGTCTGTGTTTTAttaaatagtttgtttacatatccgatttgatt
ttcaaaatggcgtcgGAAGCGCAAGTCGTCCACGAGGATTCAACGTGGTT
CAGATACGAGTCTGTGTTTTAttaaatagtttgtttacatatccgatttg
attttcaaaatggcgtcgGAAGCGCAAGTCGTCCACGAGGATTCAACGTG
GTTCAGTTTTTTAGGGAAATTGCATGGAAGCCTATTTGAcctaattgaaa
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ACGTcaaacaacgacaaatccgtcaacaacaacaacggcaacaaaaTAGC
GACGATAAGGAGACAAAGAAGGATAAATGA
Gene-mRNA-Prot
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
XLOC_036405XLOC_036405-proteinClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonpolypeptide
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
sc0000017_pilongenomesc0000017_pilon:247128..257331 +
Properties
Property NameValue
Aaloc547-663:10088
Aaloc454-546:8299
Aaloc400-450:7489
Aaloc280-396:5986
Aaloc103-279:4654
Aaloc37-99:39
Aaloc1-36:1