XLOC_036253 (mRNA) -

Overview
NameXLOC_036253
Unique NameXLOC_036253
TypemRNA
OrganismClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon (Jellyfish)

Sequence
The following sequences are available for this feature:

mRNA from alignment at sc0000055_pilon:1163472..1184531+

Legend: CDSpolypeptide
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>XLOC_036253 ID=XLOC_036253|Name=XLOC_036253|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=21060bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000055_pilon:1163472..1184531+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
atgcaagttacccgacttcacggtatatttTTCGGTTCCGTAGTTTTAAC CTTCTGTGTCCGAGTTCAAAATTGCAGCCAAAGCAGTGTTGATACTAAAC TGTCATCTTTTTGGCTCTTTGGAGAGAGATTTTTCTTGAACATGTTGCCT TCAAGAGGACAAAAGCTAGCATCAGCCCTTGCAAGATCTCTCAAAAGCTC CACTGTAAGTAAACTCATCGAATTATTATATTTTGTGCTCTAATTTTCAG CCCTCCCCACTAGATACATGCAATCTATAACTTTTTCCAATCAAAAACAa gaattgaaatattgttgTTGAACACCATTTAAAAGATGCTTGGTAACTTT GTcagtctagacttaaactcaaatatcaggattagaaactaggctagtct tacctatAGTAGCTttcccagacggtgtcaattgaACAACTTCGtcttcg aacaaaaattgcaatcaaaccaatcgaaaaCGTATTCGAACGTGatcaaa taattgcaattcgattgtcgaacgtaatcgaatctcaatcgaatgtccga ttcctgggtaatattcgattgtgtttgaattgcgttcgagtaaggttaga ttggttcgattatgatgttgactatgttcgattggttcaattgattgtca attacactGGATTAATCTTcaatttcgttcgattacgattatgttcaatG AGATTGATTGGTCGTGTGGGCGGCCGAGTGCTTGAAGTAGAGTCAGTTcg ccagtgcacgaacggccccagtgcacgaacgagcgtctttgaacttgaaa aaaacaaccaaaaacaaacttatatagaacttcctttgtgcagcagaatc ctcaaactattccttgcaatctctccaaaaattaaaataaacggagcatc agaacaacaccaaaccgattttgaacgaggccaagtaaaaaaatcacgaa attcgggatttttgtaaatatggctgatcgcgagagagaatgttttttat aagaaaatttgcgcaagaagagttctgaaaatgactttcctcttttaaaa accttttatcctccatcacacaaaatttcattgaaacatgttagctcgtt aattcaaaatcaataaaaacatatcaccagtagttgatataaaaaaagGT TCCAGTCTGCGAACGATCcgaacaccatattcaaaatgaagacattgcaa cgtcaaaacattcgaaagcgctggcgatctcaattaaaaaaagaagacac tacattgccgcgcttttcgatgagcaaaacttgaaaagaaaaacaaaaaa atggacgacaagaaaatatttacaaaaataaacaggttagtaaaacacta aagttcttataaaaaagacgcttttttagtgaaaaagcgcgtggttttga aaagttcaaatacccctgtatcatctcggaagagagttaaagtattacct gcgagcagagctctaatttttctttcaaaagatcgttcgCGAACTGGTTC CTCGTTCGTGGACTGGGTTCGAATAGCGCTcgctttaaagggacataaca gtacttgcgaaatttgtaaacaaactgtatgcagcggatacaaaatcaaa acaaatgtcacatgtcaaaataaaaaatcaaaccaaatatggctaatttt gattgttcaattgttttacaagtttgttttggacacgtgattttaattgt tctttttaatgacacgtggttcgcgcaatgtttacattttactactgtaa tgtccctttaacgacttattattccaagaagaagctttcaaataaagtga aaacaaactgaaagaaggacttcaagtttgtttacgagatggtcaaaaag gatttatgtaaaaactaaaagtaagtgagaaaagtaaaaaataagtttgc cgttcgtgcactgggcacCCCCCTCTACCATagacgaccctgcctatgcc ccggacagcccggggtttttttgatgcgtgcccggggtccgtattatttg tttttgagagactaccccggacgccccagacagccgGCGCagtcgctttt tatagaatagaccttttttcaaagaggccaccctgttgaataattatgta gtccagcagaaaaacaatgataaaaccatgcataattattacattACCGT AAGACGGGGTGATTCGGATAGATTTCGActgttttccaaaaatttgttct tccaaaatgaGTCTACCTCTAAATGAAGTCGTTTTATTTTACCACTGGGG TCTAATTCGCGAgtgtagaaaatttcattttcaaaagtttcttctaCGAG GAACAATCTTCAATCGAATACAAGAAAATCGAGTCACTCGTTTCGGGGTG AAGTGGATAGAAATTGACGGGGCGCCATTCGGAACATAAACAAACACTCT CTATATTCTGTGGTGGAGCAATACCATTTGTCAAAAATTACGTTTTGCCG AAGTTATAATTTGAATTCATGCAATTCTCACAAATTAATTATTCATTAGA TGgagcgtcataaaaatgtaatacTTAAGGGATATATATTTGGGTAGTAC GTTTAGTATcattgataataaaattttgattagtaTGCGCTATGAAAAGT GTTGGTTGAATGCACGATAGAAAGTGCAATGTAAGAAAATGAAACGTCTC TGAAAGGTCTGACTACATTAGCTAAatccaagtttgtttttttatctaac GTTTGCGTTTCGTTCCAGATAAAATGAAAAGGGAGAAGTaaataaatgat taaaaaagaagggcattgggctcttccaaaaaaaatctgttcatgggggg tggaggatgaattgtccagggtattgaaaaaaatgccaaaaaattgcaat gtccagggggtaaattctaatgtccaggggtaattttttgtgtccacggg gttgatttgatgtttgtccaggggtataacccgtgtccaggggatcaaaa atcaaaatgtccaggggtaaatcatgaaaaaaataatatatcctccaccc cccatgaacggattttttctggaagagcccattagaGAAACTGGACAACT TacgaaaatattaaatttacaTCGAAGCATCGACCGATAGAGTCAACACA AACACATGGTCGTTATATTCCGCGGTTACGATAGATAGCATTGAATTTAA AAGCAGAAAAATATCATACCCAGCAGGTGCGTATTTCTTTTAATCCCAGA AGAGTCTAGCATACCCACACCTCTGTTTCACATTCACTGGCTAGGTTAGG TTAATAGAAAATTCGCCCGATAAAAACCAGTGTACATATCCCGTTGTTTT ACGGACGTTATAAAagaacgttgttttgacgtttagcGTCCATAGAATAC CCTTGTCTCAAGTATCCACTGAACTTCTACTAATGCCCCATGAAAAGCTA ACTTTTTCGAGTTTCGCAGCGATACTGGGTGTGATATAGCTGGGCCGATA AAAAGAGTAGAGAAATTTACCTGATCatcgtatatttttgtttttccgtT ATTTCAGGTGGTACTGAACAATCTTAGATACTTGAGAGAGGAGGAAGATT ATCAATAACGCTCTGGTTGACTCTAAGATTTGTCGACAAAATGATAAGAG AAAACGTatgatacacccctgtatcagtgacccggtcacAGATCCCGTCT CGATGGAAACcggtgaaaaaaatacaaagaataacctAACTCTAACACGT TCACTGTCAaaccattttcagaaatttgacttcattgaatttcatcgaaa gtttgactttcaaaGGCTCCGGTTGCCTTGGTTCTGCTTTAAGTGCGTAC CGATCGACGCAGAATTTAAGGAAgattccaaaaatacaaaaacgaaGCAA GCAAAAGTATCTGTATCGAAGGTTACGGCCCTTGGAGAACTGTCGGTATT TTGACACCTCTACTGCAACAAGGTCAACccggtcaaaatcgaaaaaaatt attaatgaatTCTAGGAATAATGCTTGAAAGTGAATTTTTCCATACTCCA GCGAGAATTGAGAGATTACAAATACAGACCCGGTGTGTGTGACGTTTTAC TTGTTTCATAACTTCTCCGCTGgtcgatttcaaattttcactgagttact gagacaggggtgttacagTGGCACTTAAAGAATTCAGAACCAGCGTGGAA TCGCCATGAACACAAAGATAGGAGACAGTATTAATTCTATATGGTATTCA ATGCTCAGATGCATAGTATACTCGTAGTTGGCAGCAAACTTTTTAAGCtc ttatttggaaaatatgtactttttattcttttcttagCGAAAGAAATTAC TTTATAACATTGTCTCTCTCAGTGCCGGGTGAGAACTTTTATACCCTTTG GGAAAATGAAGGATAAAAAACGGTAAGgaatatagaaaataaaaatttct cgtGTTCTTGAATATCTGGGGCATATTTTCTCACCGGGCCGATTATTTAT TGCCAATTGTTCCACTAGGAAGGGGCTCCACCGTGTCATACTTTTTTGCC CCTTTTTCCAATTTCCGCTTGCAGAAatatttacacccctgtctcagagt CAGAGATGATTTAAGCCAGGGGATGCGAGACCTCCGAGAGAATGAACAGC ATATGAACGAACGGAAAATTATGTCTTGCTTCATACTGTACCATGTCTCA TTATCAAGCCTTTAGAAATAATCCCTTTCGTCAAAGATATTTCCTAGGAA GGACGAGAGATCGAGGCGTCCATTTCTTTACTAACGTTCTTATCCTGGTG CTGTAAAGTGTCTGTAGCCTTACCCTTCCCACTATCTTCTTCTGGAAAAT AATACATAACACATAAACTCCTAAATTATCActatacaaaatatacaaag acATTGTATTCATATGAACAACAATGAACAATGAGTGACTATTAACATTT GAACATTTATTCCTAGCTACTCTGAACACTAACAAGCCTCTTGGGATAGT GTGGcagtaattaaaaatgacatgatgacggcatttgatattttttaatt attcaataattaaCTCCTTTCCATTTCTCGGTTCCGTATCACTTAACTAC GCCTTCAACTTGGGGCGCAAATGGGCGATTCGCGTTTTAACGCGAACAAT TTTCCGCCCTAACTTTAGAATGAAAATACGAAGAATAGACATCGTTTTTC GTTTAGTGAACCAAAGATTGTATACAACTGGCTTTCGTAGAACACGATGC CAAAGGAATCTCCAATCACGGTCGcttcattatttcttattcggcatttc aaaaaagggtccgaaaatcagaaggttttcttcttcaatttccgaAGAAC ATGTTCCAAATCTTCGAAGCCATATTTTTCCGATAGCTTGATCAATCAGT GAACGGGATCTGAAAACAGAATGGAAAAAGACATCGTCAGTGAAGTATGA GAGGCGATTAAACAAAGTATCCGATTCACCCCGGGTATCCGATTCACCCC GTCTTACGGTATGCATGATACAtgattatgcatggctctatcattgtttt tatggctggactacataattatagaccttttttcaaagaggacgtcctgt tgaataattatgtactccagccataaaaacaatgatagagccatgcataa ttaatgtatcatgcatattgtaataattatgcatggttttatcattgttt ttctgctggactacataattattcaacagggtggcctctttgaaaaaagg tctattcaacaggacgtcctctttgaaaaaaggtctatcgctgaccgcgc gggcttttttctaattcattgaaatattcttccgtggacaaacgccgtct tccaaaagatcttgtaatgtcctgattttggcgtttcgtgtgtgaggcct gtatttgaaccttaaatctcaagcgtggtttgttcagcaatcaaattcta aaatctaactgaaagctgaaaaatggatcCTGATCAGACAGAGAAAGGTA AGTAAAGTTAGTTTAGGAGTtatctaaaaagttaaaaaattattgtcAAT CGACTTATAATTCTAactttttatatataaaagaGTATATATACTTATAT TTACCCCGGCgatatacgtccggggtaaatttatggcgcaaaaattggag ccccggacgtaggtccggggaaaaagttatttttttcagaccccagacat ttgccccggactgtccggggcataggcagggtcaaATCAGATAAattcta atacaattgaatcaatcaaacgtaatcgaatacaattgaacgtaatccaa tacaatcgaacgtaatcaaagcaatcaaacagcaaatcctgggtaatatt caattgattgcaattatttgattgcgttcaattgcattcaattgattgct ttccaaaaaaagaagggtcgtaaaagcagctaaatccaatttcttgacta tTAAAAAGTCAGGCCAATCTCAAAGccggaactttggatttttataagca cttggTTGCTTATATaagatgtgcctcctcttcGGCGAGAGATGTGcctt ttttttgactcgttgtcggacaaagtTGTTGTTGGACAAAGTTGTTGttg gaatactgacgcatttgTCAAATCTAACGTCAGGCATTTTTACTTTctga ctagaaagtgtcggactactgagaTGACTTCCCATTTGTGTAGGGggtct tcaaaattaaaaatacctatACCaagtgatagagctcttcaaactgagca aaaaaatatattatagtATATGAAAttctcaacttttctagatcaaaaat tatAGACAATTAtgtggtcaaaaattgattgaaaatagggaatttcccca caatctacaatataatttatgcaaaattatagcactGTTTCACTGCACGC GAGAAAAAGTTGATTAGCTCGCGTTCTCGCGCTGGCAAATATACTTAGTT TcagttgctaagaccttatgttatTACGAAATTGGTTACtacaaaaaatg ctaaaaaataagcGATTTTTGTAATAActcaaaatttgataatttgacTC TAACTGATATTAAAATTTATAATCGATAGAGATAATCAATATTGAGATAA AGAAATTGTGAATATTGATTAGCAATCAATTACCCAATGATTGATATCGA CCAGCAATTGattatttttgatgagatatttaaaatattgattACCTTGA GGTATCAACTATTATTGATTATTGATCAATTATCTATTGATGAGCCCTCA ATTATTATCAACAACTATCATCAATATTGATTACCTTATAGTATCCACAG TTTAGACtaaaacttgtatatcaagattacgggattttgaGTACAGGCCA attctactttcgttttcagtggttaCATTATCGATCGCAAGCCAAAATCT TAGCAACGgagtgctcgcccatagttacaagagtttgtgcaaaaaaacaa acatagaaagttttccaaatcccctttcgattgaaccaataaaagatgaa actttttcatgtttcacttttttgcaccaattcttcaaaatttaaagttc ttcttttattcaatgattttttacgatactttgttgacaatctaaatCTT GCATcgaattcccgctttcttcagtaaattaaAGATGAGAAAGGGGTAAG CTTGAAACCTAAGCCTTGATCACGAATTGAAACAAAATATAtcaagggtg ggattttacagccgcccgtcaTGCAAGGCACTGACAGGCCACGGGTGCAA AAAAGAATGGCCGTTTGAAATGCAGcaattggtggaaatttgataaataa CTGCAAAGGAGCGCCAAGTAGCAATCAAGTAGAACAGATCACTAtaattt ttgttgcagattttgatataaacttctTTCAAAgagattacttgtcaatg tgttgtgtcaacttgtcagcattgtattgttgtaaagggaaagataaaga ggtaagactagcctagtttctaagcCTGATATATgggagtttaagcttag actgaTTGATATTATCAATTTTAATGGAGTATTATCAATTAGATTTTTCT TATTATATATAAAGGGTATTATTACAGTGATCTGCAAAACTTGATGAgtc aagaaatttttaaattcccATGAAAACAATTTGACCGCATGACTGAAAAG TTAAATTCCGGCAAAATTTTCTTCCCTTGAGATATTCTGTAAAATGTTTC GCAGAGTGGCAAAGAGCCTTTCTTAAGATAAAGGAAAAAGCCAGTCGGAA AATTGCGTTCATTTCATTAGAAGGGATGTCTAAATCTACCACAGCGCTTT CCAGGAATTGCggtattctcaacttcagttgagctacaatctgacaatgt ctgtgtgtctatgtgtgtgtgtgtctgtgtgtgtgtctgtctgtcacaaa aactttagggcagcctggagacttcaaaaatgcttggatttggctggaat ttggcacacttgttccttgggtgaatatctgggggtgtttttttcatttt tcaaaaattttgatttttggggcctggggacgagttttttgccaaaacga ggctaaagctttgaagcagcctacagccctccaaaatggtcggatttggt tgaaatttggcacacttgttcattgggtaaatatctgggggtctacaatt gggcctatgaataatttgaagccactgaagttgagcccagtgcgttgcgc acgttcgactatggACAGATAGGTgtcttcagcaaaaaaaattggattct AAATCTATGGTATCAATTGATAATCAATACAAAATATTGATCAATTAATA ATCTATGACATTGATAATTAATTGATTACATCGATTAGATCAATAGCAAT CATTACCCAATAGCTAATTAAGGTTaaaaaaaTGTGAATATCGATTGACT ATCAATAATTATAGATTCTAAGATAGATAACTGATCGATCAATTAATATC CATTATCTATCAATTTGAATTGATGattgattttatcaattacGACCGCC TGATATATttaaagacaataaaaaaatgGCCATGAGGGCCATTTTAGCAG GTTATATACAAGGTTCTTCTGTATCAGGCAGATTTCTGTCCAGCGAGGTA CAAAAAGATGCGTTTCCTGGCTTTTTCTGTCTCCAAATTCAACACaattc tgcaaaatttgaaaaatcttgccTAATGATCATAAAATCACATGacagtt taaaatttaaaattgatgaggTGTATGAAGACTTTTCgaattttacaaaa taatcaatttttcaCTACTGTAATGGCAAATCCTAGCAAAATGAAAGTTC ATACTATAAATCTATAAATCTACCTTAACTTTGTGTAATGCAGgcatacc ttgtctaattcgGTTAAAGCAACTATCTGTTCTGCAAAGTATTTAGAATG ATTTTTTAACAGTTTACTGagaaagttttatttataaacatgTATTTGCT TTGACAGAATTAGGCAAGGTATGTTGACATTACACAAAGTTACAGTATCT TTAGGTTGAAATAATTCTGAAAAAGCACTTCTTTTCTGCAGGgcagttct ttttttttcctttttgaaattctgaaaaatttaaatgatgCCTGATACAG GTTTTAtgcattatttttatttagtaacTTATAGATAGTTTTTCTAAGAT GATAATATAATTCTCTTTTTGCTTTCAGAAAAACTACTCGGCTGCAGCAG TTCCATTAACAGAATCACTTGAGGAGGACACTATATCCAGAAAAAGTCCT GTGGTAAACTCTGAATTGAAGGTAATTTGGTTGTCAAAGTTAAAACAATT TGATAAAATGTTAGTGACAACTAAACCATTTAACATTTAGAGTTGAAAGT CAAGgttgttattttactaatggtTCTGAAAAGTATATGACGGGTTGTTC ATTAAagtacatttttattccaaagttgttttttaaaagtttctagTCAT TTTTGAAACTATACCacttttcttttcattctttAAAGGTAACAAAACTA AGCAATGGAATCTGCGTGGCCAGTGTGGATACTGGAGCTACTGTAAGCCG TCTTAGCATTTCTTCCAATGTTGGTAGCCGACATGAAACAGCAGCAAATC TTGGCATTAATCATTTACTtaagaacgcgtcatttctgGTGAGtttgttt tataaaattttgcttCTATCTATCATTACTTCCATTCATCTATTAAGTAA ATCCATTTGAGCTCTTAAGGTTAAACTACGTTCCCAAACTATATATCGAG GCTGACCAAAGACAAGGAAACTCCAAAGTTGCAATCAAGTTTTTTGACAC TGTCAACAAAATTGAAAGATAAAGTCAGATAGTCTTAGATATATCACCTC TAGTTTTCTTCAAAGGTTGCATCAGAACTTCAAAATCTCTTCGCTTAAAA TCTTTTGCTTGTAGATTCTTTCTATTGTTGAGCAAAACCTCCAAATGTTT CCGTTTAAGTCTTTTCCAAAGTCAATATATGGCAATTTAAAATCTCTAAA GGTGGATTCTTCAAAGCAGTTAAAGGAATCTActcaaacaaaaaaaagga aataactTTGCTCAGGACCATCTAAGGAATCTTCAAGCAAAAGATCTCAA GCCGTTTGACTTTATGTGTCATTGTGTCACCATTGTGTCTGGTACTCTCA TCATAAGTTCTTTATTGTTGCAGGATTTCGTAGTGGATATTGTTTTGTAA ATGAGAAGTGTAATAACTGGTCATATTAAACATTTAAATACTTTTGCCAT CTTTCAGGATAATGGAGAAAGGACCAGCTTGAGAACTGTCCGTGAGGTTC AAGAAGTTGGAGGATCACTGGAGTGAGTAGATTTTTCCAGCTTTCTGTTA AGACTCTAGAGAACTGAAAACTTCTATTACTTCAgtgattttgtattttc aataaaaaaatggtACTTTGTAAGCCTTTTTTAATAGAGTTTCTGATTCC ATtccaaatgatttttttcttgagaTGGAtgaatcaaacaaaatttgtga AATAAATCCTAGATTGGGGACTTGATTCATCTCCAGTTCATTAGCTTTTA TTGTGGATTAATTCGAGGGCTCAATATTCATGGAAATTATATTAGTTCTT GAACAGGATGTGACCAACAATTTTGTATTTCTCTTATATTAATAATATAT TTCGAGATTTGATTCTAATCTTCAGATTaatatctaaaaagaaaaatata aaaacagttttaaaaaaacagtaaaaaatccaaaacatgtacatcttcct aaaaaacCTCCTCATACAACACTCGTCTCATAATAAATATATTAGTTCTG ATTTTGATATCTCCTTTCCTATGACTACCCAATTATGTAACTTGTGTTAA CATTCTGTTAAAATTTCTTTAGGGTTAACAGTTCCAGGGAGGTCAGCTCA AGGACTGCAGCTTTTCTACGCAACAAACTGTAAGGGTTTTGTTTCATGCA gtttcatgtattttttattGAAGCTGTCGAGATGAaattgttttcttaaa aaaaatccaacttcTAAGAGCCCCTCCGCCAAGTGGTTGACATCATGGCA TGATTCTGTAAAAGTGTGAAGGAGGTGATAGTATGAAAAGGAGTTGACAG CTTGATTGGGAAAACAGAACTTTTACAATAATAGTGtgaatttaaagttt gtgaTCATGAAAATAACAATCATTAGCTGACTTTTATGCCTGGTCTGATC AGGTGAAATTTTGATGTCAATGGATAAAGCCAGATATTTCTAATTATTCC AGATCTTTTGAAAGcctcaaaccagcttaaaatagtgCCACTTGATGCAA ATTAAAAGAGTCaacattgaaattttcacagtctGTAAAAACCATGGTCG TGGCCTCCTAGCTCTTGCATTTTATTCCCTTCAAACTACAGCCCATGCCT TGATTTACTAAAACACCATGCATGAAATTATATTCATGCTACTCTCGAGt tcctaataaacgtacagtaacGAATAAACATACAGGGTTGAAAATAGAGG CGTAAAAACCTAATTGAAGGGTCTTTTCCGGTTCGGTTAGGGGGTAAATA ATGGTTATTTTTGCTTTCATTTGACGAATAGATAAAACCTCCATATTCAA AGAAGGGTATTAGCCTTAGAAACACAAGTAGGCTCttgaaattgagaaaa tatttgttgaaattaataaacgtacatgtacgtttattaggcacccgaga gtatttTCGTTcgcaaaaataaagtttttaacaTGCAAGAAGGTGGCCTG GGATTGATcatgaaaatccaatttttctgTCGTAACATTAAATCTGGAAA AAATTGGTGTTTTGGTTTGAATTTTGGGTCCTCCAGTAAGGCTTCTATTA TTCTAAGAACCCTTAACTTAGTTTCTAATAGGATGTAAGAAAGTGAAGTG ctttaaaaatgattattttcattaatagacgatatcggcttcatatgaaa actcagatttgacccccgagaattccccacaatgctttgtgcgatgaaaa tttcaccacaaacttttttccgcgcaaagcattgtggacAATTTTCGAGG GTCAAATATGAGTTTTCACATGAAGACGATATCGCCTATTGTGCCAGATT GTGCATCAAAATGAAGCTCAATGTGCTTGACAAAGACATTGTAAGCATCA TTTTTCGGCTTTATGTTTcacattttataattttagtCCTGAAGTAATGG AAAACATTGCACCTGGAATTACCAAACCACTTTACCAAGCATGGGAGGTA ATTACTGAGTCTTCAATCAAAACTAAGTCTTTTGGTTTCTTAATTCTTGA CCTCCTCTACCTCTCAAGTCAGTCGTGCCATCTAATAGCTTTATCATGAG CTCATTTTTTATTATCTGTATTCTTTCTTTCAATATATTAAATTATAGAT AACAGATGCTAGGAACTTTAGCAATCAACAGAACATTACAGTCAAGGGCG ATGATTCTGCCGGTATGTGGGTCAATTATTAATGATATCAATTGTAATGT TAACTTAATTCAGAATTTCATTCATTGTTACCTTAAATTTCTCATCTTGT GACAATCAGGCTCAACTTCATAGACTTTCTCTTTAAGGAGTTCTGaactc attattttttcaaaatttcaagcttcAGAAGTCCATGCATCaaaaaaaCT GAATATAAACAAAAGGACTTTCGCTCCAAACATAAagtttatttgaattt ttctttattttcagtgAATATTGAAAACTTACACAAAGCTGCTTACAGGT ATTAAGAGTAATTTCAGACTTATACCCTTTTGTATTTCTTTCCATTATTA GTCTGGGGACAAGTCAGTCAAAAGCATTGTTAGTTCAATTATGCTCAGAA CTaaggattcaaaattttttctgaaaacttttctCCGCGCGAAAATTAAC AAAAGGGCATCTTTTCAAATTGTAAGttctttttcaattcatttggCTGA GGTTATAGTTCCTCTTTAATAAAATTGTTATAGAACTGGTCTGGGAAACT CATTGTATTGCGATGATCTTTCCTTGGGTGTCTACTCATCAACTGAGGTA AGCATAACATTCATTGCATAATTCATAGAATTTTCAAACATTCCTCTTGA GAAGGAAATATTAACTTGTAAGAAAGGTAATTTTGAGTGGTTCgatgaaa gttttttaaaaaacaaaaaatagagaAAGACGAATATGGAGAGAGAAAGT TTGTTGATATCTTTCAAATTGACGATAAACCAGTGTTATCAcactttaac tcgaacaatattggatatattttggtcagagttttctatattttgaaTAT AGTATGACAAAAattctgaactcgaaaaatatatcccatattgtactctg tACCGTGTGATAACTATTACTATAGTGtttattactttctttttagtaaa ttaaTCGCCAACTTTTCGCtcatatatttttatatacGTTCATCTAGCTG TTTCCCTTAAATTTTAGATAGCAGAATACGCACAAAGTAATtttgttgga aataagatgactATTGTAGGAACAGGTAAACATCAGTTTATTTGTCATTA TTTCATTTCGTTTCATTCTTAATTACTGTTAATTAATtggttttgattgt ttcattCACTATTATAGTTTAAGGTAGAATGTGTGCGGGTTGTGCATTGT ACATTTCACACAGTTGATATCCTCGTCTTTTTAGCCTGTCACTTTTCCAT TTTGAAACTTCAAACATTCACATTTTTATAGGGTTATATGGAATATCTTT tatgttaaaatttttgaatgttgaaaaaaacaaactttcgaACTTTCATG TCTTGCTTCTTCTGACAGACTATGTTTTCATTGAACTTTCAACTCAAACT GATGATGTATCTTCTTTGCTTTAATTTCAGATGTCAGCCATGATGAACTT GTCCGATACGCTAATGATCTATTCGGCTCTATCCAAGCAGGCGATAAACA AGTGACCCCACAACAGAAATATTACGGTGGAGATTCCAGGGCACACACTA GTAATGAGTTTACTTACGCCTCGTTGGTCGGGGAAGGTGTTGGGTAAGTG AGCAAAGTGTGAATTCTCAAATAATAAATGAGCCTAGAAGTTCGATTTAT GAGTGGTTTTATACTCAAAAGCCATTGAAAGAACTGAAAGGTTATAATTC AATGTGTTTAATATAACCATGCGGTATTAGAAGATCTTCATTTGATAAAC TATAAATTATGATCTAGAAAATAGGCTCGGGTAATCCTCGGGTAATCAAC CCGTCCGTCTAAGTGTAATAGTGTATGAAATAGTTGTATTAGAAAACGAT GGTGACTTTCTTAAACTCTGTTTTAGGCCATTTACAACACcattttgtct ctttttatattttgtagaaTGTTTAATGGTGATCTTGCCACTTACTTGGT TTTACAGGTATGAACCTAAGTCAATTATCTTTGGCCCTAATAGTTAAATA AACTGTCTTTCTCAGAGTGATGAGGTTTAGTAGGAGGGGATCGGGAGGTC TTAAGAATTTTCAAGAACTTTGAACGGAAGTTAAAAGCCATGAAAGAGGG TATCGATTCTGTCTTTACTCTTaataatctttttcaaaaaaacccgTTGA ATCATCAAAGATTTTTCtaattatttagaaaaaaagaaccTCCCTTAGGG ATAAACATAGTTTTACAAAGTCTTCACGGTCAGAGTTGGACCTCTCCAAG GAGCTGCTCacagttatcttttcaaaagataatgatCAACTTAAGCCGGA AGGTCATGtttttttCCGCGGCACACAGCATTTTTATACTACCTCTTTAA CAAACTACCataattcccgcaaaaatttagAATAAGAGAGAAGAATTCCT TAGTCCCTTTTTAAAATGCAAACTATGTTTAGCATTGAAGTAACCTGTAA CTAAATCGATGTTACTGAATCACTTCAATGCAAGTGTATTTTTTCACGAG AACGCTCCTAGGATTGTGTTTTCGATACGGTAGTCAAATGTTATTGAAGT AAGAAACAGAAAATGATGAGAGGATATATGGTATACATATGCACATCACG TTGATATTTCGTTTATTTCTTTTATAGAGAATCTTAGGAGTAGGCCCATA CACCAAATGGGGAGATAACACTCAATCATCAAGGTATGTTTGTGTCTGGt ttataccgtaagttggtctaatatcgacatccctcgtctaattccgacac ccttctttagagacaggaataatatgaaagtttaaatcactgattgaaaa aggattgtTCCTCTCTGActactaagcaaagaaaaacagtttcaaccttt ctatcaatttcagctgataaaaagggtgtcggaattagagaagggatgtc gaaattagaagttACGGTAGTGCATAACAATCATGCTGTATTCttccttt cctttttcttcAGAAGAGAAACTAATTTTTGAGCTCTTTCATACTTAGGT TGAGAGTACCTACCTACACTATAGGGTACACTACCATATTTTTTCCTTCA ATTATTAAAATTAGAGAAATCTTTTGAAACGCACTGAACAACttatttta ttgattctttCTTACAGATTAGCCAAAGCTGCCCAAGCTGCTGTCAGTGG ACCTCTTTCCGTAAGTTGTTCTTCTCTCAacccaatcaatcaatcaatca atcaaccatgaTTAATTTTTCTCGTTCTCTTCTTAGTGGCCCTccgtgga aataattttttagctGCCTAAAAGCTAATAAATTTTTTGGGGCATGCCAC TTCAAACATATTATATTATTATCGGTGATCCAagaaatatctgcaatctg attggttaaaaagagtacaatatatcttgtattttacatgtacaaaatat aaattgacgaaaagatgttgttgcattgtagcggtattAGCAATCTAACA TCACTTTACTACAAAAAgcacaaaagtgccctgcgctttttttccaacac aaaaaagtgcattttttgggtcaccgataaaccagttatcagacatttcc tcgtacaatatggaaatatcgcctgaaggctcggaaaatattgtacggga aaatctcggaactcgtaaaatatttctaatattgTACTTGCAACtttccg ataactattacttattattattattgttattaaaaTCTCTCTTTGATTTA CTACTTTCACAAATAATGTCTCTTTGTctttaaagtaatttttgatTATC AGTCCTCCTTACCAATTTTGATCACTTCTAAAATCTATTGTATTCAAACC TATCTTTTCTTTCAACGTAGATCAACGCTTTAAATGTCAGTTATTCAGAC AGTGGATTGTTTGGTTTCAACGCTATCACCAGTCCTCAAAATATTGGTGC TGTAAGTTGACAGTATTGTACTAAAGCCCCTTTCCACACCCCTGTTTCAC CAGTGACCCGTTGAGAATCTTTAGAGCAATGCCAATATTCTCAGGTATCA CCTCTATCAAGGCTACAAAAAATTGGTTATTTTAGGGCGAAATGCCTAAA ATAACCAATTTTAATTTAGAGGTGATTTTTTGTACCCTGAGAATACTGCC AATATTCTCagttatcggcgatccaaaaaatatctgcaatctgattggtt aaaaagagtacaatatatcttgtattttacatgtaaaaatataaattgac gaaaagatgttattgcattgtagcggtagcagcaatctaacgtcactttg ctacaaaagtgccctgcgcttttttccaacacaaaaagtgcattttttgg gtcaccgataaaccagttatcagacatttgctcgtacaatatggaaatat tttactcgttccgtattttccgtatattttcctcgcctaaaggctcggaa aatattgtacggaaaaatctcggaactcgtaaaatatttctcatattgta ctcgcaactgtccgataactattacgtatCACCTCTAAAATTGGTTATTT TAGGGCGAAATGCCTAAAATAACCAATTTTAATTTAGAGGTGATTTTTTG TACCAATATTCTCAGGTATCACCTCTAAAATTGGTTATTTTAGGGCGAAA TGCCTAAAATAACCAATTTTAATTTAGAGGTGATTTTTTGTACCCTGAGA ATACTGCCAATATTCTCAGGTATCACCTCTAAAATTGGTTATTTTAGGGC GAAATGCCTAAAATAACCAATTTTAATTTAGAGGTGATTTTTTGTACCCT GAGAATACTGATGCGAGTATGCCAATATTCTCAGGTATCACCTCTAAAAT TGGTTATTTTAGGGCGAAATGCCTAAAATAACCAATTTTAATTTAGAGGT GATTTTTTGTACCCTGAGAATACTGATGCGAAAAATTCTTCCAGTAAGGA TAGTAAAAGGTGGCCACGTTTGGTGTTGATCCGGAGACTCCTTCCTATTT AGATAGTAGAAAGAAGGGAAGGCACTACTCTTTCTTCCTGGATTGCTCTA CTTAACATCGACCCTTCCCTTTTATTACTTACTTTATATATGCTGAGCAT TGTAGTTTTAAGCCAGAGAGACGTTTTGTCCTTAATCTGTTGAGATTAGG GCTCTGTGAGATGAATTTACGAGTCAAGCAGGGTTCTCACTGCATCAATT CGttaatgtatttattttttttacggGCTTACAAAACTGCCATTTTCTAG AATGCCTTTTTACGAAAACACTATTTCGAGAACATCGTGCTTATTGCATA GTATGGCTTGAAATTTGGGTTACTGAGGATCTTTCCGTCAAACGGATTTT GTTTTACTTAAAGAGTGAATTACTTAAATGTTATGCCGATTCCTCTGTTG ATTTATGGATCTTGGTAGTTGTTGCTCCTATTTCACTTTCATATCGATAT TCCTATTTTTATTCTGATTAGGTTATGAAAAGTGCTGTGACTGAGATTGG GAATATCTCTAAAGGACAACTGTCCACTGAAGAGCTTGAACGTGCTAAGT ATGTTATTGTTTATACGCAACCCTCTCGTTTTTTATGTAACATTCGGATC TTGATAAATCTGCTATTCAAGATATGCATTACTGCAACACCTTTGACATT ACATCATAGACCGAACAGCTGATTGATTGTAAGTGATTTGAAATCAGTCA AATCGGCTGTTGGTACATGATGCAAAGTCAGAAAACAATTTACTTGTGCA TATCATTTACTCAACGAATGCTAACTGTTGTGAAATTCGATCCTTAGAGT CGAACAATTCACTAAGCTCTTCGATTCTAATTAAACCCTTTCCGCTACAA CTGTGCATGGTTTCTGCCTACTTTTTCAgcccccccttaaaatgcaattt tgcccttaaagaaaactcccccttaaatcaaacaaaaattaccggtaccc cttgttagaatgtccctccttaaaatgaaaaaaaagaggaatccccctca gatttttatttttagactttgacaataacaaagtaCAACGATTGGTTTGA TATCAATACCATCAACATTATATTAGGTACATAACGATATCCaactaaat aaaattcaataaaaagaaatcattgaaaataaactggatcctataatcaa acgataaaaataaaactttttatgaataaaacaaaacaaaagatgcAGTA CCTGGTATAACAGTTGTGTTTTGTTCATATCTTAAGCCTTGTAAATTATC TTTATCATTAAATTTGAACTGGGAATGTTTTCTGATTGTAGTCCTAGTTT AAGTTAGGTCGAGTAAGTGGTCTTCCCAAGTAGAGAATTTAGGCAGTAAA ACACAAGTAAGATTTCATGCTTATGACATTGATTTTGGATGTGACAGAGC TTAAAATgtcaaagatcattgatgtcgaccaaatatttcaagaaaatctt tgtacccttcagcaaacaattttgtcaatagagagagagagaagagagTA TGCAGATTCATGGGCCCCGACGAGCCAtttgagtggggggggggggcaag atttagggaaaaaatgtcgcccaccatggttgggcgacgaagaaaatttt tcactttttacaccctcaaaacagctTAAAGCGGTATCTAATTGGGGAGa taatagtttttatggtttgatttggtctgttaAAGGTCATTCTAATGTAC ATAACTTTCAATATagcatggtctgcaaaatagtGGGCATGAGATTGTGA GCACAAAAACGggaaagaagatattattagacaaagaaaattattgtcaa taaaaccaaatattttagtccccccttttttcttattttgatagattctt gcagcccttgataaagaatcccccttatttaaaaaaaatgacaaaaatcc ccccttttttaaaaggcaatttttgacccccccccccccttattttaagg ggggcAGAAACCATGCTGTGATAGTTGACTCCCGGACAATCACTAGGTGT GACTTATTTGAAACAAATTGTTTGATTGTTTAGTTCAAAGcttatttaca tttttcattaTCTTCATATTCTTAGGACTCAAGCCAAAGCCACTATTTTG ATGCTAGGGGAGAGCAAAGACGATCTACTCGACGACCTCGTTAAACAGGT TAGACAATGTATTTGAAACTAATGCTCGTTATTGAGGAGCTTGGAGTATA ATCATTCTTTTCATGTCCAACATTTTAACATTAAAGAAAAGCAGCATGTT ATTGAAGGAATCTCATGAATTTATAATCCATTTCAATGGTTTCGGTTCTC CACCCTAACAAAGGGCTGACTGAAACTTTTGCTTAAATTTTTAAGGAGGC AAACTTTTAGGATTTTCAGAAACTAGACTAgaattcttggaaaattttat cTATTGCTGGACCAATATCAATCAACCACTTATCTCCTATTTTCTCATGG TTTAGCATTAATCGAATTCCCTTGCAACCTTTTTTATATACCTTTTAGAT CACGTTCAACGGAAGTTATGTTTCGCCTTCTCAAGCTGTTTCATCTGTCG ATAAAGTCTCTGTTGACAATATCGCACAAGTACGTTTGCTCAATCCATTT CTTGTGTAGGGTCTCTGTTAAGTATGAACGTATGCTTCTACTCCCTATGA AGGTTTTAGTTTTCTACTTCGGGGCCAGCAAAACTATAACCATTTTGGAT TGGGATTTCGCGAAACATTGTACATAATAGAGGTCAAACAGGTCTGAGCT TTGAATACATATTTCAATTATTGGGTATGAATCGTGGGTTTGGAATACTT ATCATTGTTAAAATAAATATGGAATCATCCCGCCAGTGCGAGTGACATTG GCTCTATCTCTTGGGGTGGCTATTACATATTCTAGGATAAGGAAACAGCG CTTGCCAGACACCGTCGACCCTGTGTCGTGGCGTGTATCGGCTACATTAC TCAAATAAGCGTGTGAGAAGTCCACATCGGGGGTCAATTAAACTAATTGT GGAGAGGTTATGCTTCGAATCAAGGAAAACCGTTGAGATGTCATGACAAG CGGGCAATCTAATAATATCAATCCTTTTGGACCGcttgttcttttcttta ttgATACATTTGGTTCTTTATAGGCTGCCAAAAAACTGTTCGCCGGAAAG TCCACCATGTCCGTCACAGGAAACATAGCCACTGCCCCATATGCTGACGA ACTCATGTAA

Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000055_pilon:1163472..1184531+

>XLOC_036253 ID=XLOC_036253|Name=XLOC_036253|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=3102bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000055_pilon:1163472..1184531+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
atgcaagttacccgacttcacggtatatttTTCGGTTCCGTAGTTTTAAC
CTTCTGTGTCCGAGTTCAAAATTGCAGCCAAAGCAGTGTTGATACTAAAC
TGTCATCTTTTTGGCTCTTTGGAGAGAGATTTTTCTTGAACATGTTGCCT
TCAAGAGGACAAAAGCTAGCATCAGCCCTTGCAAGATCTCTCAAAAGCTC
CACTatgcaagttacccgacttcacggtatatttTTCGGTTCCGTAGTTT
TAACCTTCTGTGTCCGAGTTCAAAATTGCAGCCAAAGCAGTGTTGATACT
AAACTGTCATCTTTTTGGCTCTTTGGAGAGAGATTTTTCTTGAACATGTT
GCCTTCAAGAGGACAAAAGCTAGCATCAGCCCTTGCAAGATCTCTCAAAA
GCTCCACTAAAAACTACTCGGCTGCAGCAGTTCCATTAACAGAATCACTT
GAGGAGGACACTATATCCAGAAAAAGTCCTGTGGTAAACTCTGAATTGAA
GAAAAACTACTCGGCTGCAGCAGTTCCATTAACAGAATCACTTGAGGAGG
ACACTATATCCAGAAAAAGTCCTGTGGTAAACTCTGAATTGAAGGTAACA
AAACTAAGCAATGGAATCTGCGTGGCCAGTGTGGATACTGGAGCTACTGT
AAGCCGTCTTAGCATTTCTTCCAATGTTGGTAGCCGACATGAAACAGCAG
CAAATCTTGGCATTAATCATTTACTtaagaacgcgtcatttctgGTAACA
AAACTAAGCAATGGAATCTGCGTGGCCAGTGTGGATACTGGAGCTACTGT
AAGCCGTCTTAGCATTTCTTCCAATGTTGGTAGCCGACATGAAACAGCAG
CAAATCTTGGCATTAATCATTTACTtaagaacgcgtcatttctgGATAAT
GGAGAAAGGACCAGCTTGAGAACTGTCCGTGAGGTTCAAGAAGTTGGAGG
ATCACTGGAGATAATGGAGAAAGGACCAGCTTGAGAACTGTCCGTGAGGT
TCAAGAAGTTGGAGGATCACTGGAGGTTAACAGTTCCAGGGAGGTCAGCT
CAAGGACTGCAGCTTTTCTACGCAACAAACTGGTTAACAGTTCCAGGGAG
GTCAGCTCAAGGACTGCAGCTTTTCTACGCAACAAACTtCCTGAAGTAAT
GGAAAACATTGCACCTGGAATTACCAAACCACTTTACCAAGCATGGGAGt
CCTGAAGTAATGGAAAACATTGCACCTGGAATTACCAAACCACTTTACCA
AGCATGGGAGATAACAGATGCTAGGAACTTTAGCAATCAACAGAACATTA
CAGTCAAGGGCGATGATTCTGCCGATAACAGATGCTAGGAACTTTAGCAA
TCAACAGAACATTACAGTCAAGGGCGATGATTCTGCCGtgAATATTGAAA
ACTTACACAAAGCTGCTTACAGtgAATATTGAAAACTTACACAAAGCTGC
TTACAGAACTGGTCTGGGAAACTCATTGTATTGCGATGATCTTTCCTTGG
GTGTCTACTCATCAACTGAGAACTGGTCTGGGAAACTCATTGTATTGCGA
TGATCTTTCCTTGGGTGTCTACTCATCAACTGAGATAGCAGAATACGCAC
AAAGTAATtttgttggaaataagatgactATTGTAGGAACAGATAGCAGA
ATACGCACAAAGTAATtttgttggaaataagatgactATTGTAGGAACAG
ATGTCAGCCATGATGAACTTGTCCGATACGCTAATGATCTATTCGGCTCT
ATCCAAGCAGGCGATAAACAAGTGACCCCACAACAGAAATATTACGGTGG
AGATTCCAGGGCACACACTAGTAATGAGTTTACTTACGCCTCGTTGGTCG
GGGAAGGTGTTGGATGTCAGCCATGATGAACTTGTCCGATACGCTAATGA
TCTATTCGGCTCTATCCAAGCAGGCGATAAACAAGTGACCCCACAACAGA
AATATTACGGTGGAGATTCCAGGGCACACACTAGTAATGAGTTTACTTAC
GCCTCGTTGGTCGGGGAAGGTGTTGGaaTGTTTAATGGTGATCTTGCCAC
TTACTTGGTTTTACAGaaTGTTTAATGGTGATCTTGCCACTTACTTGGTT
TTACAGAGAATCTTAGGAGTAGGCCCATACACCAAATGGGGAGATAACAC
TCAATCATCAAGAGAATCTTAGGAGTAGGCCCATACACCAAATGGGGAGA
TAACACTCAATCATCAAGATTAGCCAAAGCTGCCCAAGCTGCTGTCAGTG
GACCTCTTTCCATTAGCCAAAGCTGCCCAAGCTGCTGTCAGTGGACCTCT
TTCCATCAACGCTTTAAATGTCAGTTATTCAGACAGTGGATTGTTTGGTT
TCAACGCTATCACCAGTCCTCAAAATATTGGTGCTATCAACGCTTTAAAT
GTCAGTTATTCAGACAGTGGATTGTTTGGTTTCAACGCTATCACCAGTCC
TCAAAATATTGGTGCTGTTATGAAAAGTGCTGTGACTGAGATTGGGAATA
TCTCTAAAGGACAACTGTCCACTGAAGAGCTTGAACGTGCTAAGTTATGA
AAAGTGCTGTGACTGAGATTGGGAATATCTCTAAAGGACAACTGTCCACT
GAAGAGCTTGAACGTGCTAAGACTCAAGCCAAAGCCACTATTTTGATGCT
AGGGGAGAGCAAAGACGATCTACTCGACGACCTCGTTAAACAGGACTCAA
GCCAAAGCCACTATTTTGATGCTAGGGGAGAGCAAAGACGATCTACTCGA
CGACCTCGTTAAACAGATCACGTTCAACGGAAGTTATGTTTCGCCTTCTC
AAGCTGTTTCATCTGTCGATAAAGTCTCTGTTGACAATATCGCACAAATC
ACGTTCAACGGAAGTTATGTTTCGCCTTCTCAAGCTGTTTCATCTGTCGA
TAAAGTCTCTGTTGACAATATCGCACAAGCTGCCAAAAAACTGTTCGCCG
GAAAGTCCACCATGTCCGTCACAGGAAACATAGCCACTGCCCCATATGCT
GACGAACTCATGTAAGCTGCCAAAAAACTGTTCGCCGGAAAGTCCACCAT
GTCCGTCACAGGAAACATAGCCACTGCCCCATATGCTGACGAACTCATGT
AA
Gene-mRNA-Prot
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
XLOC_036253XLOC_036253-proteinClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonpolypeptide
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
sc0000055_pilongenomesc0000055_pilon:1163472..1184531 +
Properties
Property NameValue
Aaloc1465-1551:20974
Aaloc1384-1464:20349
Aaloc1312-1383:19927
Aaloc1234-1308:18322
Aaloc1153-1233:16721
Aaloc1111-1152:16019
Aaloc1054-1107:15528
Aaloc1015-1053:14819
Aaloc853-1011:14333
Aaloc793-849:13918
Aaloc730-792:13435
Aaloc697-726:13167
Aaloc631-693:12849
Aaloc571-630:12638
Aaloc514-567:11324
Aaloc448-510:10708
Aaloc298-447:9939
Aaloc205-297:9629
Aaloc1-204:1