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Sequence
The following sequences are available for this feature:
mRNA from alignment at sc0000102_pilon:481543..487069- Legend: polypeptideCDS Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >XLOC_036145 ID=XLOC_036145|Name=XLOC_036145|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=5527bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000102_pilon:481543..487069- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ATGAAGGACTATGGAACTATAGACCCTAAGCCAGATAATGAAACTGGAAT
ACAGCTATCAATCGATTTGTCAGATCCATTTGGAGAGAAGGATATTTTTG
CCAATGAAGAATTTTGGAAAGAGGTTTGTCTTTTTTTGATATTTTACCTA
ACTCATCATTGTTCCTCTTAAAAATACAGTTGAGGATTACGTTAACTTGG
GAAAATCCTCAATCTTCCAATCCTTCTTCTGATGTTAAGTGACCAGATTT
CAGAGTGTGGCATGTTTGCTTCGAGATCTCAACTCGGAAAAAATTTAGTG
GAGTGCATGTCCAAAATTTGAGGTTTTCCCAGGTGCAAGTGCAGACGGTT
TTTTAACCCCAAGTGCAGAGTTCTGCTATTTTCTCCTCAAGTGCAGCTAA
TTTCAAATTTTAAGAATTTTTGGTAGGTATCTAGATGCACCTTGTCCGGA
CCAAAATTTATCAGGTGCATTCTTTCACAAAAGTGCGGAACTTGGTATTT
CCAAATTTTTCCTTGAGTGCGGCCTCGTCATACTCTGTAAACTGGTTAAG
TGAACTGACTGTTTTATGATTTACTCTGTCTAGACCTAGTTGGCATACAG
TCTAAGAGCTTAAACTCCTAAACTAGGCTATTCTTACCTCGTAATCCCTG
AGTAAAGTTTATATTAAAATCTGTGATTACTTCTACGATTGCTTCCCGGC
GCTCCTTCGCAGCTCGGGCAAAATTATTTTAAAGGGAACCAAAAAGTGCA
TCTGGGAGCTGAAAATTTTTTTTCAGTTAACATTTTCAAATTTATATGTA
TCATTTCTCATAGTATCTTAAACTCGTTTGCAGTTGTTTTAGAGCTACAG
CACTTCCGAAACATGATTTTGCCATTTTTTAGGCTAAAAAGCCTTTGAAA
TTAAAGCTTTTTAGCCTAAAAAACAGCCACAGCCATATCACAAAAAATCC
AATGAATGCTGCAGTTACAGCATGTTTGGCCTTCCCTGGATTGAACGGTT
GAGGATTTTATTTTCCAAAAATCTTGGTTACGGAATGACGGAAAAATTAA
AAATGCTGTAAAGTTTTAAGGAAACATTTTTAGAGTAAAATATTTGGCAA
GTTTCTACCTCTTACTGATTACTTTCAAACCAGGCATAAATTAATTGCCA
TTGGGGGAAGACTGGTTTTTAATTGAGAAATCAATTTTGGTTACGGAATG
ACGGAAAATTATCTTACTTTACTGAAATAAAAATTATGAAATTTTCACTT
AACCATATCACCTCAAACATTTTTTAAGCTGATACAGTAACTTTGTATCA
AAATCTAAGCATTTGATCTATCTTGAAAACCTTTCCATTAACCCTATATA
GGGTTCTAAAGTTAAATAAAATTTTAACAGCCGATTCTGTTTCATATCAT
GTGTACCGCATTCATGATAAATTTAAAAAATTGGTTGAGTGTTACCAAAA
ATCTTTTTGATTTTCTCAAAGTGTTATAGTTGCTATGGCTAAAAATCATG
ACTTTGATAGCATGATCATCAGTCAGTGTCAATTTATTAACCACTTTAAC
AATGCAAATTTTTGGGTGACGCTCTGTTTCATGGAAAAAATGGGCAGTTT
TTGAGCTTTAAAATGCCATAACTTTAGTTTCGCTTGTGCTACAGACTTGT
ATGAGCTCTCATTTTTCAGCATTTTTTATTGTGCATCCTCTGAAATTAAA
ATCATTCAATGACAATCTCCACTTTATGAACAGTGTCCTTTTGAAATCAA
GGTGGTCTCTGGTTCCCTTTAAAATAATTTTGCCCACTGTTTATCAAATT
TCCACAAATGAAATTGCTGTATTTCACATGGCCCTTCTTTTTGGCACGTC
CGTGTCCTCTCACAGGCGGGCGGAGCTGTAAAATCTTACCCTTCATATAT
TTGTTTCATTCTGTGATCCTAAGGCTTAGGTTTTTTCTCATCTTCAAATT
TCTGAAGAAAGCGGGAATTTATTGCGAGAGTTAGATTGTCAACAAAGTGC
CATAAAAAATCATTGAATAAAAGAAGAACTTGAAATCTTAAATATTTTTA
TTTTGAAGAATTGGTGCAAAAAAGTGAAAACAGTTTTATTTTTTGTTTGT
TCAATCGAAATAAGGGATTTGGAAAACTTTCTACAGTATGTTTGGTTTTT
TGCACAAACCCCTGTTATGGGCAAGCACCCCGTTGCGAAGATGTTGGCTT
GAAATCGAAAGTAAAACCACTGAAAACAAAAGTAAAATTGGCCCGCACTC
CAAATCCCGTAATCTTGATATAGGAGTTTTGGTCTATACTGACATAGTTG
AATTCCAAAAAACTATGTTCCTACTAACTAGTTCCGAAAACAGAACTACT
TTGCCTTGTTTTGGGATTGCTTTGGTCATTTCAATTCAATTTTAGGGAAA
GAAAGATACTTTTTTAATCTTTATAACTTCTAAACCATCAAATATTTTTC
TAAGAAATGACAGACAGAATATGTACAGGATAATAGTCGTTCGGGAGAAT
GTGACAATCTTTTGAATAACCAATACACCGTTTAGGAGTCTCGCCATTTC
ACGGTACTCCATTGCAGAGGCCCGGTAAAAATGGTAGGTAAAAATGCGCA
CTTTAGTACTGTGAAAGGTTAGAGGAATGTAAACATTGTGAATTTTTGTC
TCTCCTTTAAAGAGAATGATTTAGATATTTGAACATGATATCAATGATCA
TTTTATAAGTCTCTCCTGAAAATTTCACAAAAATTCATCAAGAGGAAAAG
AAGTTATGATTAAAAGGAGTTCTTTACCTACCGTTTTTCTGCTATGTTTC
CTTATGAGAACCAGATGTTTACCTACCGTTTTTTTACGGAGGAGAGTGAA
TTTTCCGTGATCGCTAAAATCAAAACAATGGAAAATTGGATTGGCGCGTG
CGCAGTCGACACTCCTAAACGGTGTATTACTCCAGCAGAAATTTTTTTAA
TGATAGCGTTATTGATTTGTCTTTCTCAACACAGCAGCTTTAAATCCTTT
GGGCTTAAAATATCAGATTTTTCAGGTTTTTATGACGTCATTGGACCCAA
AATGCCCAAAATTTCACGTACTCATTTTTTTAAACTTATTAAACACCCCC
TCTAGACCCTCCAAATCTCTTCTCCATAAAGTTTCCGATAAAATGGGTGG
TTAAACATCTTGCAACTCCTTTTCAATCTCGAGATATCGCATTTTTTCTA
TTTTGATGACGTCATTAACTGAAAATACCCAAAAATTCGATCTCCCATCT
CCCTTCAAACTCAAAATATTGCATTTTAAAGTTTTTCCAAAATCTGTGAC
GTCATTGGGTCCCTTTACCCCTGATGTTTTCAATGGTCAATTTGCAAATT
TTGGATTTTTTTTGGTCACGAGTTACCTTAATGCCCAAAGGGCCCCGAAA
AAACAAAAAAATGTCAATTATTTCATATTGTCAAACGCTGGGCTATAGCA
TGACATGACAGTGATCAAAATAGCGGTCCGTTATCGGTTAAAACTGACCA
GGAAAAAAATCACCGACCCGAAAATATTTGGAAAATGGAGAAATACTGTA
ACCAACCTTTTGTGACCTAAACTAATCTTGATGTTCGGTTGTTCATGGAC
TATCTACTTTATGACTTGCTCCTTAACTTTCTCCTCTTATTTGTTGGTTA
CTTCATACTATATTTCTCTGTTCTTTTCTAATTTCGTCGTTACATCGAAC
ACTATTCCATCGTGACTTTTTTCTCTCCTTTCTTCGTTACTTTAACTTAT
TCCTTCGTAACTTTCTTCTCTAATTTCTTCGTTACTTCGAATTCTATTCC
TTCGTGACATTCTTCTCTAATTTCTTCGTTACTTCGAGCACTATTCCTTC
CTAACGTTCCTCTCTAATTTGTTCGTTATTCTAAAACCTATAGAACTTTC
TTCTTTTCAAAATCTACACTTAACATGACTGATGCCAGTGCCGTAGTTGC
CAGGGGGCTAGGGGGTGCTTAGCCCCCCCAATAATTTTTTAAGAGTGATT
TTTTTCATAAGATAAAGTATTTTACCTTTAAGATTTGCCTTTATTCGAAT
TATTTTAGTTTTTTGAGTGTGTTTTTTGCCAATTTAGAGCTCTAGATTTC
AAAATTTTCCCACTCAGGCCAAACTACCATGGTTGGCCCTCACAGTGTCA
CTGAACTTTATGCCCCCCAATATCAAAATACTTCCTACAGCACTGGATCC
ACTTAAATAACCGATCAGAAAGAAAAACCTTATTTCGAACACTGCATGAA
TTTATTATAAATCCATTTAGTGTATAAAGATAGCTATGAAATACTATCAC
TGCAAAAAGAATTTAGGTCAAAATCTAAACTCATTTGGTAGGAGCTTACC
TTTAAAAATCTGTCATTTTTTTGACATAAAATTTTTTTTTGTTAGAAAAA
GAGATTTTTGAAGATGTCATTATGAATTTTGAAAAATGTGAAAAACTGAA
AATTAATGTTGCTTAAAAAGAACTCATTGAAAACTTCCATCTCTGAAAAC
TTCAAACATTAGTTTACAGTATTAGTTATGGACTTGCATAATTGACCTCT
GAAAGCATTTTTCTTCCCAAAATTGGCTTAAAATAATTTTTATTTAATTG
AACTTGATTCAGGTAACTCTCATCCTTGTTGTTGCAAATACATCCTGTAG
ATGACTGTTTTTTTTTTGTGAAACCTTGATTTTCTAGTGTGCCTAACTGA
ATGAGATTATTTAGCTTTTTCTTCATAAAACGTAGTATAACAAATGAAAA
AATAAAGATTTGCAATTATTTTGAATTATCTAGAAAGGCCTAAAATGTAG
TAGTTTTTGCTTTTAGTAAGAATCTGGACCCCCCTTCTTCAATTTTCACA
AAATCAATATAAAATCAAAATCTTTTCTAGCTCACTTTTAATTGATATTT
TTCTGAGCTATTAGTTTTTAACTGATTGCTTACAATTGCCATTTTCATGT
TCCATAAGGCTATTGAATTGAAAATTTTAAGGACTCAGGATCTAAAAGCT
CAAAAATGTTCCAATCAGGCTGAGAATAAAGCCTGGAAGCTTCTTAGCCC
CTCCTAAATCAAAAATCTAAGTGGAAGTAAAGTACTGAAATTGCCATTTT
TGCACGAGCTTTAAATTCTGGAAAACATTGAAATACCCAGAATTGTCAAT
ATTTGGCGCTAATCGTAGATCAAAATTTACTTAAGAAGGGTGGTGATACA
AGATTTAAAAAACCTGGTGTAAATAATGTTAACAAGGGTAAAGTTTTTTA
AGCTGTGAAATGAATTTTTAGACAGTTGTTTAAGAATCCTCATTTTTGTT
TTCAGTGTCGTCAATCAATCAAAGCATGTGAAGGGCGTTTAAACAATGAG
AAATGTCAGATGAAAACACGTGCACGATGGTTGCTAAGGAAACATGTCAA
AGAAGAAACGGATGTAGATTTAATTTATTATTTGTTGACAGTAGTTCACG
ACGAATATGCAGAATGTGCCTTGAAACGTCCTCAAGATGAGCTGCATTAT
CCAACATTCTTGTATGAGGTATGTTAG Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000102_pilon:481543..487069- >XLOC_036145 ID=XLOC_036145|Name=XLOC_036145|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=690bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000102_pilon:481543..487069- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ATGAAGGACTATGGAACTATAGACCCTAAGCCAGATAATGAAACTGGAAT
ACAGCTATCAATCGATTTGTCAGATCCATTTGGAGAGAAGGATATTTTTG
CCAATGAAGAATTTTGGAAAGAGATGAAGGACTATGGAACTATAGACCCT
AAGCCAGATAATGAAACTGGAATACAGCTATCAATCGATTTGTCAGATCC
ATTTGGAGAGAAGGATATTTTTGCCAATGAAGAATTTTGGAAAGAGTGTC
GTCAATCAATCAAAGCATGTGAAGGGCGTTTAAACAATGAGAAATGTCAG
ATGAAAACACGTGCACGATGGTTGCTAAGGAAACATGTCAAAGAAGAAAC
GGATGTAGATTTAATTTATTATTTGTTGACAGTAGTTCACGACGAATATG
CAGAATGTGCCTTGAAACGTCCTCAAGATGAGCTGCATTATCCAACATTC
TTGTATGAGGTATGTTAGTGTCGTCAATCAATCAAAGCATGTGAAGGGCG
TTTAAACAATGAGAAATGTCAGATGAAAACACGTGCACGATGGTTGCTAA
GGAAACATGTCAAAGAAGAAACGGATGTAGATTTAATTTATTATTTGTTG
ACAGTAGTTCACGACGAATATGCAGAATGTGCCTTGAAACGTCCTCAAGA
TGAGCTGCATTATCCAACATTCTTGTATGAGGTATGTTAG
Gene-mRNA-Prot
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Position
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
|---|
| sc0000102_pilon | genome | sc0000102_pilon:481543..487069 - |
Properties
| Property Name | Value |
|---|
| Aaloc | 124-345:223 |
| Aaloc | 1-123:5528 |
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