XLOC_036143 (mRNA) -

Overview
NameXLOC_036143
Unique NameXLOC_036143
TypemRNA
OrganismClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon (Jellyfish)

Sequence
The following sequences are available for this feature:

mRNA from alignment at sc0000102_pilon:448117..463597-

Legend: polypeptideCDS
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>XLOC_036143 ID=XLOC_036143|Name=XLOC_036143|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=15481bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000102_pilon:448117..463597- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
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Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000102_pilon:448117..463597-

>XLOC_036143 ID=XLOC_036143|Name=XLOC_036143|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=2598bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000102_pilon:448117..463597- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ATGGACCCGTGTTGTCCTTTCATCAAGAAATACGCAGATGCGATGGAGAG
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ATCCTCTTTACAATTGTTAGCTGAAAATTCTTCAAAAGAGATGGACCCGT
GTTGTCCTTTCATCAAGAAATACGCAGATGCGATGGAGAGTGATGATGAA
GGAGCACCCTCCTCCTCTGGCATTCCAAATGTACCAGTCCGGTATCACTT
CTTCTATCAAATACTGGACGGTGACGACCTCGGGCAAGCGCCTTTCAGAG
ATGATGGATCACCCAATGAGAATTTCAACTACTCTTCAAAATCCTCTTTA
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AGTTCGATCACTGGTTCGCTACAAATGGAACACGTATGCCCGTAACGTAA
CTTAGAAGCTATAAAACACCCGGTAGTTCGATCACTGGTTCGCTACAAAT
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AAATTGGTGCACTCTTTTTCACCCTTGTCTACTTCATTGCTGAACTCCAT
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GGCGTTGGCGTTATTCACGCAACCCATTTACCGTCCGCCCACTACTTACG
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TTCACCCTTGTCTACTTCATTGCTGAACTCCATCAGCTCTATGTGGAGCG
ATTACGTTATTTCTACGACTTCTTCAATTATATGGACATCCTTGGGATGT
TCTGTATAATCTGTATCGTCCCTCTTCGCTACACAGAACAACATCAAGCT
GAACTCATCCTTTCTGGTGCCGGTTTCTTCGTCAACTTTCTAAGGATCGT
TAAATTTTTCCCTGCTTCCGAGGAGCGATTACGTTATTTCTACGACTTCT
TCAATTATATGGACATCCTTGGGATGTTCTGTATAATCTGTATCGTCCCT
CTTCGCTACACAGAACAACATCAAGCTGAACTCATCCTTTCTGGTGCCGG
TTTCTTCGTCAACTTTCTAAGGATCGTTAAATTTTTCCCTGCTTCCGAAA
CTTTGGGTGTTTACTCGAAGACCATAGCACGCATCATATATTATGACGTC
AGCAAATTTATGGTCATCTTTTTGATTGTCATGTTTTCGTTTACTGGCAT
GGTGTATCTGTTTCTATTGGCAACCAACAGTCTCGCAACGGTCGATGGAA
CTTTGGGTGTTTACTCGAAGACCATAGCACGCATCATATATTATGACGTC
AGCAAATTTATGGTCATCTTTTTGATTGTCATGTTTTCGTTTACTGGCAT
GGTGTATCTGTTTCTATTGGCAACCAACAGTCTCGCAACGGTCGATGGTG
GTTTCTGGAGTGTTTTTTTGAAAGAAACACAGACGTTAGCAGAAGCATCT
CCATTTTCTGAAGATTATTCTGTTTACAATGGTTTCTGGAGTGTTTTTTT
GAAAGAAACACAGACGTTAGCAGAAGCATCTCCATTTTCTGAAGATTATT
CTGTTTACAAGAATTGGGTGATTGTCATCTTGATGTTAAACATGCTTTCA
ATCCTGGTCATTCTTTTGAACATTCTGATTGGTCAAATCAGTTACCGGTA
CGAAGAAGCTCTGGGAAACGCTTCTATTTCTTACGATATCGACCGATGTA
TACTCGTCGCAAAGTCTGAACATACTTCTTTCAAAAATTTCATGGAATTG
GGTGATTGTCATCTTGATGTTAAACATGCTTTCAATCCTGGTCATTCTTT
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AACGCTTCTATTTCTTACGATATCGACCGATGTATACTCGTCGCAAAGTC
TGAACATACTTCTTTCAAAAATTTCATGAATTACCGAGTGAAGTATTTCA
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GAAGTATTTCAAGAAAGCAGACTTTGTTTCTGATGAAGAAGTTGCTGAAG
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AAAGGGATCAAAAAACGTTCGATGAAAAACAATCCAACAAGCGTCTCATT
GGTCGCTCCTGATTAAAATGTTCAGTGGCCGTAAAGGGATCAAAAAACGT
TCGATGAAAAACAATCCAACAAGCGTCTCATTGGTCGCTCCTGATTAA
Gene-mRNA-Prot
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
XLOC_036143XLOC_036143-proteinClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonpolypeptide
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
sc0000102_pilongenomesc0000102_pilon:448117..463597 -
Properties
Property NameValue
Aaloc1219-1299:82
Aaloc1153-1215:1104
Aaloc1090-1149:1708
Aaloc907-1089:2677
Aaloc826-903:10528
Aaloc676-822:10908
Aaloc499-672:12933
Aaloc316-495:14105
Aaloc241-312:14615
Aaloc1-240:15482