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Sequence
The following sequences are available for this feature:
mRNA from alignment at sc0000102_pilon:342170..349380- Legend: polypeptideCDS Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >XLOC_036142 ID=XLOC_036142|Name=XLOC_036142|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=7211bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000102_pilon:342170..349380- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ATGTCTGATCATCAAGGTATACTTCAATTTCTCGTTTTGCTTTTTTAAAC
TGCGATCCTAGCTGTTTTATATGCCTATCCGTCGTTAAAACAGCCTAGAC
TAATGTTAATTTTTCTTTCAGAAAAAAGACTATAATTTGTTTACCTTTAT
TCCTGCAGCTTCCCAACATCCAAGCTCTCAAACATCACAAGTCGAATGAA
ATTACTTTCGATTTCCCGTAGAAATTATGCGATGAAAAATCCGGGGGTCG
AAAAATGAAGACTTTTTATTTCCGAACAAGTTATCTTTGCTTATAACGAA
ACTTTTCAATATATTTGCTAAATATAATGTTTGATTACAGAAATACTTTA
CACTGTATTTACACTGTATTGAAAAAGTTGATTCTACTATTCTACTTAGC
TCTTTGTTTTCATGTCTAGCCCCCGTCTCAAAAGAAGTCCCAGAATCCCG
AGATTTTTGCAGTCGGGCGTTCAAAACAAAGGCGTTTTTATTTTTCCGCC
CACTTACGAATTTTTCTTTATAATAGGCATTTAAAATATAAAATTTAAAA
ATAATAGTATAAAACCTTATTTTCTACCGTATAGTATTTCTTCTAAAACG
AAAAAACAAAATACACTAGAAAAATAAAGAATTTACGAGTGTTATCAAGC
CACCCAAAATTCGTCGCGCGTCATCGAATTGTTGTATACATCACGATCAA
TTGTCAACCATTGTCCAATCCCGTAAGCGATTGAAGTGCCGTCAGTAATA
ATCTGAGAAGAGAACAATAACATTATGACATCACACAAATAAATTACGCT
GGGAAAGTCCACGAGGACAACACGCGGTCTTAACTTTTTTCCCTCGTAAG
TTTGGGGGGAAAACGAAAGTACTCTATATTTTACGTATGGGGAAGTGTAA
GAAAGATTTACAAAATATAAAAGTTTCGTTTTGGGGTAAAGAATCAGTAT
TGTGAATTTAAGCGAGTTTCTATTTTGCAATTTTTCTACAGAGCCAAATA
AAGATTTTTTCTATTGTTCTTGCTCGATTGCCTCTAACGATAAGTTGCGT
AGTTATGAGGTTATCGAGACAAAATGTGACGAATTTGCGCGGAAACGAAA
TTTAACATTAGTCTAGGCTGTAAAATACAGTTAGGTGCAGGTACCGTCCA
AGAAATTGCCTCCTCGGGGTACCTAGGCACTTCCCAATGGTTACCATGAG
GTTTCACCCCTTTAACGTAAATGTTTTCTCGTTTGTTTTTTTTGAAGCAT
TTTGATTTAGAAAATGAGATGGGGCATGCAGTTTAAGGGAGTCTTCCAAA
CTCAGACACGACCCTGCCTGCCTATGCCCCGGACAGTCCGGGGCAAATGT
CTGGGGTCTGAAAAAAATAACTTTTTCCCCGGACCTACGTCCGGGGCTCC
AATTTTTGCGCCATAAATTTACCCCGGACGTATATCGCCGAGCACACTTT
AAACCCCCGGATTTTTTTATAAACTAGGCAAGGTTAATAAATTAATTAAA
AATTAAAAAACTAACTTTACTTGTACCTTTCTCTGTCTGATCAGGATCCA
TTTTTCAGCTTTCGGATTTAGCTTCAGCTTAGATTTTAGAATTTGATTGC
TGAACAAACCACGCTTGAGATTTAAGGTTCAAATACAGGCCTCACACACG
AAACGCCAAAATCAGGACATTACAAGATCTTTTGGAAGACGGCGTTTGTC
CACGGAAGAATATTTCAATGAATTAGAAAAAAACCCGCACGGTCACCGAT
TCTATAAAAAGCGACCGCGCGGGCTGTCTGGGGCGTCCGGGGCAGTCTCT
CAAAAACAAATAATACGGACCCCGGGCACGCATCAAAAAAACCCGGACTG
TCCGGGGCATAGGCAGGGTCGTACTCAGACTTGCCATGGAAAACGTCAAA
TGGGCGTTTTGATTTCCAACCCCTCTAGTGTCTAGAGTCAAGAGTGCGAA
CGGCCCCAGTGCACGAACGAACGTCTTTGAACTTGAAAAAACAACCAAAA
ACAAACTTCTATAGAATTTCCTTTGTGCAGCAGAATCCTCAAACTGTCCC
TTGCAATCTCTCCAAAAATTAAAATAAACGGAGCACAAGAACAACACCAA
AGTACCAAACCGATTTTGAACGAGGCCAAGTAAAAAAAAATCACGAAATT
CGGGATTTTTGTAAACATGGCTGCTTGCAAGAGGAAATGTTTTTATGAGA
AGATTTGCGCAAGAAGAGTTCTGAAAATGACTTTCCTCTTTTAAAAACCT
GTTATCTTCCATCACACAAGATTTCATTGAAACATGTTAGCTCATTTAAT
TCAAAATCAAAAGAAACATATCACCAGTAGTTGATATAAAAAAGGGTCCA
GTCCGTGAATGATCCAAACACCATATTCAAAATGAAGACATTGCAACGTC
AAAACATTCCAAAGCCGGCGATCTCAATTAAAAAAGAAGACACTACATTG
CCGCCATTTTCGATGAGCAAAACTTGAAAAAGAAAACAAAAAGTGGATGA
CAAGAAAATATTTACAAAATTAACAAGTTAGTAAAACCCTAAAGACGCTT
TTTTAGTGAAAAAGCATGTGGTTTTGAAAAGTTCAAATACCCATACACAT
ATCATTACGGGGGGGGGGGGGTTCAAGTATTACTAGCCTGGGAATTCAGG
CGTTTAACTTTGTTCACAGTCTAGTTTATAATATTTTTGCTGCTTGTTTA
AACTCGCCAGCTTCGGTATGATTTGCTAGCTTTCGGCGTATTACTTAAAA
GTACTTTGCGCGCATTTTGATAATTTCGATGCGCGCGCATAATTTATAAA
AAAAGCAGACTCTGCAGAAAAAAGGAAAACAAATGAAAATGAAAACATAG
ATTCATTTACAAACAAAATGGCTGTTAACAGGAAGTCTAAATACATGTGG
CTGATGTTTTGATGTGGTTTTTAGTAGTTTTGAAAATCTTTAGAGCTTGT
AAAAGAGTTTTTATGGAAAGTTAATTATGTGTGTTTGCCTGGGTTTACAA
AGTTCAAAAAGTCTGTCATCAAGGGTTCACACACAGAGTGTTCATAACAT
TCTGTGTCAGACTAATCTACCTGCACCAAGCTCTATAATCTTAAAACTTT
GTGAGGTAAGGTATTTTTTGTTTTTTCTAAGATTATGAGCTTGGATTCCC
AGGCTAAAGTATTACTTGCAAGTGGAGCTCTAATTTTTTCTTTTGAAAGA
TCGTTCGTACACTGGTTCCTCGTTCGCAGACTGGGTCTAAATAACGCTCG
CTTTAACAACTTATTATAGTAGGGGGAAATTTGTAAAATCGCTCGATTTT
TTTAGTCAAAGCACTTGTTATACATTTTTGGAAAGCTAAGGGGTAGGGGA
ATCAAAATAACTTGGGTGCCAATTTTCTTTCGGACACTTTGGTGTGGTTT
TCGGACAAATACGACGGTCTCAGGCAAAAATCATAGGGTGAAAAATTAAT
GAAAATTTCAGCTTGAGAAAACGAAGACCTGTTGTATATTTTTGGAAAGC
TCTCAAAAAATTAAGATTAGTGATATATTGCGAGTATAGGTGATTTCTTT
ACCTAACTCGAGATATTAATCCTTAAAAACAGTGTTTTTCAGTGTTTTTC
AGCCAGAAACAGCTGTTTTGTCCAGTTTTTGCGCTTTCGGAAGCTCAATA
TCTCGAGTTAGGTACTGAAATCACCTATACTCGCAATATATCACTAATCT
TAATTTTTTGAGAGCTTTCCAAAAATATACAACAGGTCTCCGTTTTCTCA
AGCTAAAATTTTCATTAATTTTTCACCCTATGATTTTTGCCTGAGACCGT
CGTATTTGTCCGAAAATCACACCAAAGTGTCCGAAAAAAAATTGGCACCC
AAGTTATTTTGATTCCCCTACCCCTTAGCTTTCCAAAAATGTATAACAAG
TGCTTTGACTAAAAAAGTCGAGCGACCTCAAAAAAACGAACAAATTTCCC
CCTACTATTATTCCATGAAGAAGCTTTCAAATAAAATGAAAACAAACTGA
AAGAAGGACTTCAAGCTAATCTACGAGATGGTCTAAAAGGATTTATGTAA
AAACAAAAAGTAAGTGAGAAAAGTGAAAAATGAGTTTGGCGTTTGTGCAC
TGGGCACCCCCCTCTACCCCTAGGGCTAGGCCGTGGCCAGTGGATGATTA
AAATGTTCAAAAATAAAGAAAAAAATCAAAATGTCTGTGACCAAGCTTTG
GCAATTGGTTTTGGTCAATTTGAGGGTGCTGAATCCGAATTTGAATGTTA
ATGTTTTAGCATAATTTGTGATTTTTTTGCGTTTCCAGGCAAATTTAGGT
AATTTTCCCTGTTTCATTTGGGAGAATGTAACGGTCTTTTGAATAACAAA
TTACTCCAGCCAGTACAAACAGGATGAATTTTCTTGTACCTTACTAACAG
CTGTGTTGTAAAAGACAAATCAATTAAATGACGTTATCATTATAAAAATT
TCTGCTGGAGTTCATTAGTTCATCTAAGCCTACTCCCCAACCCTGTGTAA
TATTTGGTTAATACTTGTTAATAATTATTTGTTTATGATCGCAGAGAGCT
GTTTCATTTTTTTCATCTGGTAAACTAAAGTTTGTGAGTGAATTTTATGC
CAAAATAAAAAGTAGGTTTGTTTTGGGAAATGTAGACAAGAAAAACATAT
TGTCACTCATGCTAAAATTGCTGTATTCTTAAATCTTAATTGAACTAGTT
TTAAGTCACTTTACAAGTTTTATTTTTCATTTTTAGGTGGAAAGGCTTTT
GGCCAACTCAAAAAACAACAAGAATTGAGTTTAGATGAAATTAACAAGGT
AAACCATTAATAGTATTCTGATCTATACCTTCTAGTAATTCAATTTTAAT
CTTTCACAGAACTTTTCATATTGATTACCCTAATTTGGATTAAAGTAGCT
CTATTTTTAAATCCTATTTCAAAGGAGGACATGATCCATTCAGAAGCAAT
TCAAAGATTATTTGAAGTCCTTTGAAATGAAAACTGTTTTTAAAGCCTAT
TTAGTATTACGAGCCTATTTCTATTAAGGATTTCCTTTCCATTAAGCACA
ATTTTTAAGTATTTGTAACCCATTTATATATTTTTTTATTTGGACATATA
TTCTTTACTCCATCTTCTAACTACCGTTTTTTATTAAAACACATTACTTT
TCACTCATTAAAAGAACACCTTGGATTGCGATTTATTTGGTCTATAACAA
GCCTTACAGTATGATTGATTTCTACGTTTATTCAGTTTTTTTAGAAGGTT
TTATTCAAACCTTCCGTGACAGCAATTAAAATATGATAAATGAAAGTAAA
ATAGTTTTTTCTTCTTAACAGACTTATTTAGGCGATGAAGATTATCAAGA
TGAAGAAGAATATCCAGATCTTCAAGGATCTTTGGTTACCTATAAAAGTA
AGTCACCATTCTTCATATGCTGCCTTTCAGAGAATAGGAGGTGATCTTGT
ATTTCCTTGATTGGCTTTTGAAAGAAAAAGCTTTTGCAGAACTATATTTT
AGGGAAAATCATATTTTTTCTCCTTAGAAAAAGTTTTGATACTACAATGC
AAATGCTAACATTTAGGATTTGTAAAGAAAAACGTAATTCCTCTCAAGTG
GATCAAAAGTCTAAGGCTTCAAAAAGAGAATAATTCCAGCTTTTTTCATG
TTTGGGTGTCTGCTTTGGTTAAGATTAACAATGACTGGGTCCTAATGAAA
AGAAAAATATTTTAATTTTCAGAACAATTTATGGAGTTTGATTTGGACAA
CTCTGGTGATATTGGTAAGTTCATTCATTACTCAGTGTTTGATTGCTGGT
TTAAATTCGCTATTAGAAGTAACAACTGACTCCGATACTGAAAGATCTTA
CCCCTATCTTTTATAGCTTCTGTAGTATCGTCTAAGCTTATTTCTTTTTT
CCGATAAGTTCGATTTTAGTTCTATTCCTATCAATGTTTTTTTTGTTTAG
ACTTGATGGAGTTGAAGATGATGATGGAGAAATTAGGCCAAGCTAAAACT
CATTTAGAATTAAAGAAAATGATTGCTGAAGTCGATCGGGAGAATAGAGG
TATTTTTCATTGAAAACTTTCATTGATTATTTACCCTTAAGACTATTTAT
TTCACGCTGATGAAATCATCGAGACGAAAAAATGGAAAATTAAAATAAAC
GATTTACTCGTATCGTTTAATCTTTTAGAACAAATTCTAAAGGAATAGAT
GTGTCGTTTTTTTAATTTTAAATCAAAGAAGATAAAAAGCATTTCAAAAT
GACACATTTCCATGTTTTTAGCATGTTGCTTCATAGACTTCGTATTATTT
CATGTTTTCTTGACATTCAATGCGTCATCGTTCAACATTTTGATGTGTTT
GATCTAACAAATTTACTTTGTTTACATTCCGCAGGTGCAATTTCGTACAA
TGATTTCTTGTTCATGATGTTAGGAAAGAAAAGCTCCGTCCTTAAGCTGT
AAGTTTTCACAAAGTTATTTCACGTTGTAAGGAATACGTTACGTACAAGA
CTGAATTGGCTATTAAATGAATTTAAAAATCTCCTGATCTTCGAGTCTTA
GAAATTTCTTTGAAAAAGTTTATACTGAACAAAAATTCTAGCTCGAAGTT
TCTACCGGAAGAACCGTAAATTTGCGGTTATGCTTACAAGCCAACTCTTA
TGCCAATGGTTTATAATAAACTGAAGAATATTCATACTGAGAATGTCGAA
TCAGACTACGCTATGCACTTTTCCAAGGTTCAGAGAGAAGGAGTAATCAA
TGTTTCGTTTACTAATCCAAGATAATCCTAACTTTGAGGATTAAATTTCA
CGTTTGAAACTGTTTCGTTGTTCAGACGTGAAATACAGTATTTGCTTAGT
TCAAAATAATGTCAATTTTTCTCGACCTTTTAAAAACGGGAAATGGTTTA
TTTACGTATAGCTAGTTTCTTGCAAATCAAACATTTCAAATCGCATACAT
ACCTTAGCATCAAATGTCTGTCACTTTGCAACAACACGCAACTAAAATTA
TTTTCCAGCTAATTACGAAATCACACTTCAGTTTAGCAAATAAAGAGAGA
TTCAAATCATCCTTCAGTCACAGTCTGACGCGGAGTAAGATAAAAATTTT
ATGAACTTAAAACTTTTTTTCTACAGAATTTTGAAGTTCGAAAAAGCGAT
GGCTGGACCTGAAAAGAAAACAGGTGTCGCTCCGAAACGAGACCTTTCAT
CACTCCCTTGA Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000102_pilon:342170..349380- >XLOC_036142 ID=XLOC_036142|Name=XLOC_036142|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=888bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000102_pilon:342170..349380- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ATGTCTGATCATCAAGATGTCTGATCATCAAGGTGGAAAGGCTTTTGGCC
AACTCAAAAAACAACAAGAATTGAGTTTAGATGAAATTAACAAGGTGGAA
AGGCTTTTGGCCAACTCAAAAAACAACAAGAATTGAGTTTAGATGAAATT
AACAAGACTTATTTAGGCGATGAAGATTATCAAGATGAAGAAGAATATCC
AGATCTTCAAGGATCTTTGGTTACCTATAAAAACTTATTTAGGCGATGAA
GATTATCAAGATGAAGAAGAATATCCAGATCTTCAAGGATCTTTGGTTAC
CTATAAAAAACAATTTATGGAGTTTGATTTGGACAACTCTGGTGATATTG
AACAATTTATGGAGTTTGATTTGGACAACTCTGGTGATATTGACTTGATG
GAGTTGAAGATGATGATGGAGAAATTAGGCCAAGCTAAAACTCATTTAGA
ATTAAAGAAAATGATTGCTGAAGTCGATCGGGAGAATAGAGACTTGATGG
AGTTGAAGATGATGATGGAGAAATTAGGCCAAGCTAAAACTCATTTAGAA
TTAAAGAAAATGATTGCTGAAGTCGATCGGGAGAATAGAGGTGCAATTTC
GTACAATGATTTCTTGTTCATGATGTTAGGAAAGAAAAGCTCCGTCCTTA
AGCTGTGCAATTTCGTACAATGATTTCTTGTTCATGATGTTAGGAAAGAA
AAGCTCCGTCCTTAAGCTAATTTTGAAGTTCGAAAAAGCGATGGCTGGAC
CTGAAAAGAAAACAGGTGTCGCTCCGAAACGAGACCTTTCATCACTCCCT
TGAAATTTTGAAGTTCGAAAAAGCGATGGCTGGACCTGAAAAGAAAACAG
GTGTCGCTCCGAAACGAGACCTTTCATCACTCCCTTGA
Gene-mRNA-Prot
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Position
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
|---|
| sc0000102_pilon | genome | sc0000102_pilon:342170..349380 - |
Properties
| Property Name | Value |
|---|
| Aaloc | 361-444:85 |
| Aaloc | 298-357:826 |
| Aaloc | 199-294:1260 |
| Aaloc | 157-195:1488 |
| Aaloc | 79-153:1891 |
| Aaloc | 19-78:2474 |
| Aaloc | 1-15:7212 |
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