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Sequence
The following sequences are available for this feature:
mRNA from alignment at sc0000017_pilon:1196887..1200720+ Legend: polypeptideCDS Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >XLOC_036118 ID=XLOC_036118|Name=XLOC_036118|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=3834bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000017_pilon:1196887..1200720+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
tttatttcattcctTTCAGTTaaaaaaaTGGAGAACGTGAtcagaaaatt
aattcaagaagaAATGAATAAAGATTCATTGCAAGCCTCTGAAAACTCTC
AAAGTTCATCTCAAAGTTCAACATCTCAAAATTCATCTCAAGGCACATCT
CAAGACTCTTCTCAAGGCACATCTCAAGACTCATctcgaacaaaaaaaaa
gcatAAAACCGAAGGACGATTAACTaatcttttaaacaaaattcgACGCC
AATCAGCAAATGATACTGATGAAGAAGTGAAGACGAAGGGTATCCAGATA
AAGTGGAAAAGGTTCTTTCCTGATCTCCTTCAAGACAAAATTGTACGGGC
AGACAGTGGTGGTGGGTTACGGTTGATTGAAGTACCTTATAAAGTTCCAT
ACTTGTTCAAAGATCTCTTACATGCAGCTACATTGAAATACTTCAATAAA
AACTCATTAAATTCCTTTGGGGAGGCACCACATCAATGTATTTTATTGAT
GGAAATGGCCGACGGAGATGTAATTGATTCTGAGGAAGATCTTTGGCAAT
TTATCCGTGTAAATGGACTGGTCATATCAAAAACCACTTTCATCTTTCAC
ACTAAAATAAACTCTGATGTTTTATTTGACACAACATGTGTTGTATGCCA
ACAAAGTGATTACATGACTCCCTTCGGAACATGTATGTTCTGTGAACAAG
GCTATCAACTTCCAAACATTCTAATCGGACCTGCTTTACCAGCCAACCCA
ACTGAACAACCTGCTTTACCAGCCAATTCAGATCGACCTGCTTTACCAGA
CAACTCAGCTGTACAACTTGCTTTACCAGCCAATCCAGCTCGACCTGCTT
TACCAGCCAACCCAGCTGAACAACCTGCTTTACCAGCCAATTCAGATCGA
CCTGCTTTACCAGACAACTCAGCTGTACAACCAGTTTTACCAGACAACCC
AGCTGTACAACCAGTTTTACCAGACAACCCACCTGTACAACCAGTTTTAC
CAGACAACCCACCTGTACAACCAGTTTTACCAGACAACCCACCTGTACAA
CCAGTTTTACCAGGTGATTCAGTTGAGCCTCTTGTATCATTAAGGGCTGA
AATCAACCGTGGCCGGGTGTTGGATGACATGATGCGTCTTTTCAGACATA
CACTGGTAAGTTATAATTTATGTTAACCTGTTATTTTATCTTATTACGAT
GGAGGTCTTTGGTAAACAATTTTGCACGTAGATGTCGCAtgttttttcag
cattttgattttttttctcaaatttttctatttattcaaaatcaaaaaaa
tttcgctCATAGATCTATTTTTAACTTGCACAAAATCGCTATCTTCATAT
TAATTCAGATTCTATCATTAAGTCTTTCGTTTTCACTgtatattttttca
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CCTTAAAATGTTGgctttttgttcactttttgaggggtaaattttggcaa
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tatttgcatttttgcgtttgtacaaatttttaggcattttCCCATTAGCA
ACCATCAATTTTTGGCCTTCAAACTCTTTCCTTTAAGTTTCAGAAAGtag
aaaaatctgaaaagtGTCATTTTTGGGGGGAAAACCCCCAAAAAATTTgg
gttcttaatttttggacctacctcggaggtcctttaaattaacccatgtc
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acaatttttttgaccgtaaaaatggccaaaattatGGATTAGTCTATTTT
GTGTTATATCTCATTATGGATAAGTGCCATATGCTTGGATTTTGACCAGT
GCTTTGAAAATGATCATGCGAATCAAAGTTTAATAATTTCATTCTATAAA
TTGCtttgttggtattttacagaccagaatctATAATTTgtctgtaaatt
tgaataaaatcaacttttaaagTTGTATCTCCTGATTGCAAAGTGCTAAG
AACTTGGAATTTGACCAGTGATAGAAAATGAtatgatgaaatgaatttta
ttaattttcattcGTCCATCTGATTTTTTATTCGCAGCGCCATGCCCCCT
GATTTTCTAAATGTGCATTTATTAGAGTAAATAAGGTAGTATTTTACTAT
TGTTCTGTAAATGACGAAAGTAGTTTTTGTCCTTGACGAAAATTTTAACA
GGCAAAACTAACGTTGTTATTTTGTGTTTATTTAATCAGATTGGAGAGGA
TACTGAAATAACTTTTGCGTACATTAATTACCGTGGAGAGGTGGAACCAG
GCGAAGGCATTGGTGTTACAAGAGATGTTTACACGAGCTTTTGGATCGAG
TTAGCAGATGGATTTTGCATTGGCGAAAATATGCGTGTCCCGTCCGTCCG
GCATGACTTTTTTGAAGACCACTGGTCAATCGTGGGAAAGATTTTGGTAA
AAGGTTACAGAGACACTAAGTATTTTCCAACTTATCTTGCAACTGCATTC
ATCAATTATTGTCTATTTAATAATGTCAGTAGACAATGTATGTTTCAATC
ATTCGACCAATACCTGTCGGAGAGTGACCGGGAGACTATCAAATTAGCCC
TTAGCCCAAACGCAGAAGACGAGtttttttCGTCAGATGATTTTCTCGAT
TTTCTCGATATTTTTAAATGCCGATCACGTGTAAATAAGTCCAATGTTAA
TCggattatttttgaaatcgcTCAGCAGGAGCTCATTCAGAGGCCTCATA
TAATGGCCTCAGCTTTTTCAAGAAGGTTTGCAATCTTAAAACATCTCCAA
GAATTTTCCAGCCCTGAAAACGTTGAAGCTATGATCTACGAAAAAACAAG
ACCCACAAGTAAAAAACTGATTGCATTATTAATTTACAATTGTAAAGATG
ATGTGGATCGGGAAATCATCGGTTTCCTTAAACGCTTCCTTAAAGGACTT
GATACAACACAAATCAAGAAATTTGTTAAATTTCTGTCAGGAGCGGACAT
AATCTTGTTCGAAAAAATCGAGGTATCCTTGGTTGATCAGGGAAGCGACT
TTGCCAGGCGTCCTATATCACATACTTGCGGTCCTTTGCTGGAAATTGCC
AATAGCTACAACAATTTTATGGAGCTCCGAAGTGACTTTACTCAAGTACT
ACAACCAAGTGACTGGCCAATGGACATAGTTTAA Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000017_pilon:1196887..1200720+ >XLOC_036118 ID=XLOC_036118|Name=XLOC_036118|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=4140bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000017_pilon:1196887..1200720+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
tttatttcattcctTTCAGTTaaaaaaaTGGAGAACGTGAtcagaaaatt
aattcaagaagaAATGAATAAAGATTCATTGCAAGCCTCTGAAAACTCTC
AAAGTTCATCTCAAAGTTCAACATCTCAAAATTCATCTCAAGGCACATCT
CAAGACTCTTCTCAAGGCACATCTCAAGACTCATctcgaacaaaaaaaaa
gcatAAAACCGAAGGACGATTAACTaatcttttaaacaaaattcgACGCC
AATCAGCAAATGATACTGATGAAGAAGTGAAGACGAAGGGTATCCAGATA
AAGTGGAAAAGGTTCTTTCCTGATCTCCTTCAAGACAAAATTGTACGGGC
AGACAGTGGTGGTGGGTTACGGTTGATTGAAGTACCTTATAAAGTTCCAT
ACTTGTTCAAAGATCTCTTACATGCAGCTACATTGAAATACTTCAATAAA
AACTCATTAAATTCCTTTGGGGAGGCACCACATCAATGTATTTTATTGAT
GGAAATGGCCGACGGAGATGTAATTGATTCTGAGGAAGATCTTTGGCAAT
TTATCCGTGTAAATGGACTGGTCATATCAAAAACCACTTTCATCTTTCAC
ACTAAAATAAACTCTGATGTTTTATTTGACACAACATGTGTTGTATGCCA
ACAAAGTGATTACATGACTCCCTTCGGAACATGTATGTTCTGTGAACAAG
GCTATCAACTTCCAAACATTCTAATCGGACCTGCTTTACCAGCCAACCCA
ACTGAACAACCTGCTTTACCAGCCAATTCAGATCGACCTGCTTTACCAGA
CAACTCAGCTGTACAACTTGCTTTACCAGCCAATCCAGCTCGACCTGCTT
TACCAGCCAACCCAGCTGAACAACCTGCTTTACCAGCCAATTCAGATCGA
CCTGCTTTACCAGACAACTCAGCTGTACAACCAGTTTTACCAGtttattt
cattcctTTCAGTTaaaaaaaTGGAGAACGTGAtcagaaaattaattcaa
gaagaAATGAATAAAGATTCATTGCAAGCCTCTGAAAACTCTCAAAGTTC
ATCTCAAAGTTCAACATCTCAAAATTCATCTCAAGGCACATCTCAAGACT
CTTCTCAAGGCACATCTCAAGACTCATctcgaacaaaaaaaaagcatAAA
ACCGAAGGACGATTAACTaatcttttaaacaaaattcgACGCCAATCAGC
AAATGATACTGATGAAGAAGTGAAGACGAAGGGTATCCAGATAAAGTGGA
AAAGGTTCTTTCCTGATCTCCTTCAAGACAAAATTGTACGGGCAGACAGT
GGTGGTGGGTTACGGTTGATTGAAGTACCTTATAAAGTTCCATACTTGTT
CAAAGATCTCTTACATGCAGCTACATTGAAATACTTCAATAAAAACTCAT
TAAATTCCTTTGGGGAGGCACCACATCAATGTATTTTATTGATGGAAATG
GCCGACGGAGATGTAATTGATTCTGAGGAAGATCTTTGGCAATTTATCCG
TGTAAATGGACTGGTCATATCAAAAACCACTTTCATCTTTCACACTAAAA
TAAACTCTGATGTTTTATTTGACACAACATGTGTTGTATGCCAACAAAGT
GATTACATGACTCCCTTCGGAACATGTATGTTCTGTGAACAAGGCTATCA
ACTTCCAAACATTCTAATCGGACCTGCTTTACCAGCCAACCCAACTGAAC
AACCTGCTTTACCAGCCAATTCAGATCGACCTGCTTTACCAGACAACTCA
GCTGTACAACTTGCTTTACCAGCCAATCCAGCTCGACCTGCTTTACCAGC
CAACCCAGCTGAACAACCTGCTTTACCAGCCAATTCAGATCGACCTGCTT
TACCAGACAACTCAGCTGTACAACCAGTTTTACCAGACAACCCACCTGTA
CAACCAGTTTTACCAGACAACCCACCTGTACAACCAGTTTTACCAGACAA
CCCACCTGTACAACCAGTTTTACCAGGTGATTCAGTTGAGCCTCTTGTAT
CATTAAGGGCTGAAATCAACCGTGGCCGGGTGTTGGATGACATGATGCGT
CTTTTCAGACATACACTGACAACCCACCTGTACAACCAGTTTTACCAGAC
AACCCACCTGTACAACCAGTTTTACCAGACAACCCACCTGTACAACCAGT
TTTACCAGGTGATTCAGTTGAGCCTCTTGTATCATTAAGGGCTGAAATCA
ACCGTGGCCGGGTGTTGGATGACATGATGCGTCTTTTCAGACATACACTG
ATTGGAGAGGATACTGAAATAACTTTTGCGTACATTAATTACCGTGGAGA
GGTGGAACCAGGCGAAGGCATTGGTGTTACAAGAGATGTTTACACGAGCT
TTTGGATCGAGTTAGCAGATGGATTTTGCATTGGCGAAAATATGCGTGTC
CCGTCCGTCCGGCATGACTTTTTTGAAGACCACTGGTCAATCGTGGGAAA
GATTTTGGTAAAAGGTTACAGAGACACTAAGTATTTTCCAACTTATCTTG
CAACTGCATTCATCAATTATTGTCTATTTAATAATGTCAGTAGACAATGT
ATGTTTCAATCATTCGACCAATACCTGTCGGAGAGTGACCGGGAGACTAT
CAAATTAGCCCTTAGCCCAAACGCAGAAGACGAGtttttttCGTCAGATG
ATTTTCTCGATTTTCTCGATATTTTTAAATGCCGATCACGTGTAAATAAG
TCCAATGTTAATCggattatttttgaaatcgcTCAGCAGGAGCTCATTCA
GAGGCCTCATATAATGGCCTCAGCTTTTTCAAGAAGGTTTGCAATCTTAA
AACATCTCCAAGAATTTTCCAGCCCTGAAAACGTTGAAGCTATGATCTAC
GAAAAAACAAGACCCACAAGTAAAAAACTGATTGCATTATTAATTTACAA
TTGTAAAGATGATGTGGATCGGGAAATCATCGGTTTCCTTAAACGCTTCC
TTAAAGGACTTGATACAACACAAATCAAGAAATTTGTTAAATTTCTGTCA
GGAGCGGACATAATCTTGTTCGAAAAAATCGAGGTATCCTTGGTTGATCA
GGGAAGCGACTTTGCCAGGCGTCCTATATCACATACTTGCGGTCCTTTGC
TGGAAATTGCCAATAGCTACAACAATTTTATGGAGCTCCGAAGTGACTTT
ACTCAAGTACTACAACCAAGTGACTGGCCAATGGACATAGTTTAAATTGG
AGAGGATACTGAAATAACTTTTGCGTACATTAATTACCGTGGAGAGGTGG
AACCAGGCGAAGGCATTGGTGTTACAAGAGATGTTTACACGAGCTTTTGG
ATCGAGTTAGCAGATGGATTTTGCATTGGCGAAAATATGCGTGTCCCGTC
CGTCCGGCATGACTTTTTTGAAGACCACTGGTCAATCGTGGGAAAGATTT
TGGTAAAAGGTTACAGAGACACTAAGTATTTTCCAACTTATCTTGCAACT
GCATTCATCAATTATTGTCTATTTAATAATGTCAGTAGACAATGTATGTT
TCAATCATTCGACCAATACCTGTCGGAGAGTGACCGGGAGACTATCAAAT
TAGCCCTTAGCCCAAACGCAGAAGACGAGtttttttCGTCAGATGATTTT
CTCGATTTTCTCGATATTTTTAAATGCCGATCACGTGTAAATAAGTCCAA
TGTTAATCggattatttttgaaatcgcTCAGCAGGAGCTCATTCAGAGGC
CTCATATAATGGCCTCAGCTTTTTCAAGAAGGTTTGCAATCTTAAAACAT
CTCCAAGAATTTTCCAGCCCTGAAAACGTTGAAGCTATGATCTACGAAAA
AACAAGACCCACAAGTAAAAAACTGATTGCATTATTAATTTACAATTGTA
AAGATGATGTGGATCGGGAAATCATCGGTTTCCTTAAACGCTTCCTTAAA
GGACTTGATACAACACAAATCAAGAAATTTGTTAAATTTCTGTCAGGAGC
GGACATAATCTTGTTCGAAAAAATCGAGGTATCCTTGGTTGATCAGGGAA
GCGACTTTGCCAGGCGTCCTATATCACATACTTGCGGTCCTTTGCTGGAA
ATTGCCAATAGCTACAACAATTTTATGGAGCTCCGAAGTGACTTTACTCA
AGTACTACAACCAAGTGACTGGCCAATGGACATAGTTTAA
Gene-mRNA-Prot
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Position
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
|---|
| sc0000017_pilon | genome | sc0000017_pilon:1196887..1200720 + |
Properties
| Property Name | Value |
|---|
| Aaloc | 1126-2070:2890 |
| Aaloc | 946-1125:976 |
| Aaloc | 1-942:1 |
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