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Sequence
The following sequences are available for this feature:
mRNA from alignment at sc0000011_pilon:1854565..1859733+ Legend: polypeptideCDS Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >XLOC_036046 ID=XLOC_036046|Name=XLOC_036046|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=5169bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000011_pilon:1854565..1859733+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ATGATGGGTAGAATTTCTATGATTGTATTCTTCTGCATTATTGCAGTGAC
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AACTATTGAGgacattttggcaaatttttcttGTGAGAAGGGTTCCAGTG
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GACAAGCCAACCAAAAACACCATCTTTGATTCACTACCATCTTAAATAAG
GCAAAGTGTCTTCAATTTGCTGGTTACTTTGCGCCTTCGTGTGTCCTTAT
AAGTCATCTCCTCCTCACCGCATTGAAAGCCAAAGTGTCTGACTCAATAA
AGATCTAGAACTTAATTTTCACTGACGTAGTGAGCAGGGAAACCTGGACA
ATATGTAGTGACCTAGAAAGTCTATACGCGACTGCGATTCTTGGCGCTTA
AGGTTGAATCCTTCATCTTGACCGCGTTGTCAAAAGACGATGTTGAGGTA
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CGTTGCGTAGTCTTGACAGGTGCTGGATGTTGGAAAGTTGAGCCTTGTAA
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AGTTCGATATCCGTGAGTCAAACCCAACCAACCATGAATTATTCACTTTA
ATTCAAGTTTTAAGATCAAACGTCAATGAAATCACTAAAGATTGTAAACA
ATGCAAAGGTGTTCAATAG Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000011_pilon:1854565..1859733+ >XLOC_036046 ID=XLOC_036046|Name=XLOC_036046|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=2004bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000011_pilon:1854565..1859733+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ATGATGGGTAGAATTTCTATGATTGTATTCTTCTGCATTATTGCAGTGAC
AATCATTGAAGCGAAGAAATCTTTGACATGTGATGAATATATTGCTGGAA
ATCCTATGCAAGTGTGTGATGATGGGTAGAATTTCTATGATTGTATTCTT
CTGCATTATTGCAGTGACAATCATTGAAGCGAAGAAATCTTTGACATGTG
ATGAATATATTGCTGGAAATCCTATGCAAGTGTGTGTTGATGGATACATC
TTTGAGCGAAATGATGAGGCAATGGTGACATGGGAGAATGCAGAAGGTGT
TTGCCAAAGAAAAGGAGGTCATTTAGCTTCCGTTACAAGTGATAATCAAG
TGATAGCTATGGAAATGCTTCTTCCTACAGGTTGATGGATACATCTTTGA
GCGAAATGATGAGGCAATGGTGACATGGGAGAATGCAGAAGGTGTTTGCC
AAAGAAAAGGAGGTCATTTAGCTTCCGTTACAAGTGATAATCAAGTGATA
GCTATGGAAATGCTTCTTCCTACAGGTGAACAAGCATGGCTTGGTACAGA
AGTAGTGATGGGAACCGGTGCCTTGAATGCTGATAATACAGAAGTACCTA
TGGACGTATCAGCACAAATACTGATGTCAGGAAACGCACTAGTTATTGCA
GATGGAAACGGGGCTATTAATGATTTAGGCGAACTTAATCCAGCTGTTAC
AGATGTCAATCATTTCTTTTGCAAATACAATTATTTCCATAacaggaaaa
tttattttggatttacagTGAACAAGCATGGCTTGGTACAGAAGTAGTGA
TGGGAACCGGTGCCTTGAATGCTGATAATACAGAAGTACCTATGGACGTA
TCAGCACAAATACTGATGTCAGGAAACGCACTAGTTATTGCAGATGGAAA
CGGGGCTATTAATGATTTAGGCGAACTTAATCCAGCTGTTACAGATGTCA
ATCATTTCTTTTGCAAATACAATTATTTCCATAacaggaaaatttatttt
ggatttacagGCATGACCCAACCTGATACTGCTACAGAATGTGGAATGCT
TGGTGAACCTAAGGATGGACGTATTATTCAAATCGATAGTGGAAAACTTC
AAAACTTCGTGGATGCAGAAGTTGATCGATTGCATGACCCAACCTGATAC
TGCTACAGAATGTGGAATGCTTGGTGAACCTAAGGATGGACGTATTATTC
AAATCGATAGTGGAAAACTTCAAAACTTCGTGGATGCAGAAGTTGATCGA
TTAGTTGAGTTGTCAGATCCTGCGGAATATTTGTTTTGGATAAACATGAA
ATACAGTGAAACGACCATGAAATACAAGTGGGGAGTTGAAGGGACTTATT
CACCTTTACGtaaatggtgtaccgAGTTGAGTTGTCAGATCCTGCGGAAT
ATTTGTTTTGGATAAACATGAAATACAGTGAAACGACCATGAAATACAAG
TGGGGAGTTGAAGGGACTTATTCACCTTTACGtaaatggtgtaccgCACA
ACCAGACGATGAAGAGATCGATGTAGCTGAGCGTTGCGTAGTCTTGACAG
GTGCTGGATGTTGGAAAGTTGAGCCTTGTAACTGCGCCGATGTACCTGAA
ATGGACGATAGTCCTTTACTTACTATGTGTGAGTTCGATATCCGTGAGTC
AAACCCAACCAACCATGAATTATTCACTTTAATTCAAGTTTTAAGATCAA
ACGTCAATGAAATCACTAAAGATTGTAAACAATGCAAAGGTGTTCAATAG
CACAACCAGACGATGAAGAGATCGATGTAGCTGAGCGTTGCGTAGTCTTG
ACAGGTGCTGGATGTTGGAAAGTTGAGCCTTGTAACTGCGCCGATGTACC
TGAAATGGACGATAGTCCTTTACTTACTATGTGTGAGTTCGATATCCGTG
AGTCAAACCCAACCAACCATGAATTATTCACTTTAATTCAAGTTTTAAGA
TCAAACGTCAATGAAATCACTAAAGATTGTAAACAATGCAAAGGTGTTCA
ATAG
Gene-mRNA-Prot
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Position
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
|---|
| sc0000011_pilon | genome | sc0000011_pilon:1854565..1859733 + |
Properties
| Property Name | Value |
|---|
| Aaloc | 751-1002:4918 |
| Aaloc | 628-747:3733 |
| Aaloc | 508-624:2745 |
| Aaloc | 265-504:1493 |
| Aaloc | 121-261:972 |
| Aaloc | 1-117:1 |
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