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Sequence
The following sequences are available for this feature:
mRNA from alignment at sc0000140_pilon:444611..453884+ Legend: polypeptideCDS Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >XLOC_035971 ID=XLOC_035971|Name=XLOC_035971|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=9274bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000140_pilon:444611..453884+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ATGTCATCGGAAGATCATAATCACACGTCATCTCGTGAAGTAACGTCAAC
TACGACGACAACGGATGATGACGGTACGCTTCATACCGTCACTACCACGT
CTACGACGGAGAATGATAACGGCGACGTGACGAGTTGCTCCAAACTGTCC
AAGGAATTAGGAGATGGTAtgcttgtcaatttttttttttgttagacAAT
ATTAATAAAACAATGAACTTTGAACCCTGAACTTTGAATATTGAGAATAA
GTGAATGTCATCTGAAATTTGGCGCTTTGGAGATTCTCTTTGAATTTAGT
CTCTTTAATCTTATGTGTTCTATGGTGCTAAAAATGGAACTTTTTCAGAG
TTCTCAGCTTGCatagggtgtctacgggaccttgaaaaccttgaaaacct
tgaaattggactaagcaaccttgaaaaccttgaaagtgAATGTAATGTGA
ATGAATTccttgaaaacattgaaaatgcATGATTGTCACAGAATAGTTGT
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AAAAATTCTTTTGCTCACTTCGCTTGCAATCATTTTTATGGATCAAATGC
TGGTAATAGCCTTTCACGCGCCTCATCAAGAACGTTGATATCGTACTATT
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caaaaaaccttgaaaaatcgctaaaatattgccaaaaaaccttgaaaacc
ttgaaaatggtgaaaaaaattcCGCAAACACCCTGTTGCGTGCACGTAAT
GTccatacagttgactctctccctctctctaattcgatgttcaGGGGGCA
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TACCATTTTTCAGCTGATGGGACCGacgttttagttcgaattacagaggg
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TCGATTTAGAGAGAGCTGACTTcttgaaaatgcttgaaaataatTGAGGG
TCGATTTAGAGAGAGCTGGCTTcttgaaaatgcttgaaaacaATTGAGGG
TCGATTTAGAGAGAGCTGACTTcttgaaaatgcttgaaaacaATTGAGGG
TCGATTTAGAGAGAGCTGGCTTcttgaaaatgcttgaaaacaATTGAGGG
TCGATTTAGAGAGAGCTGGCTTcttgaaaatgcttgaaaacaattgaggg
tcgaattagagagagctgactttttgaaaatgcttgaaaacaATTGAGGG
TCGATTTAGAGAGAGctgactttttgaaaatgcttgaaaacaATTGAGGG
TCGATTTAGAGAGAGCTGACTTcttgaaaatgcttgaaaacaATTGAGGG
TCGATTTAGAGAGAGCTGACTTcttgaaaatgcttgaaaacaattgaaaa
tatttttttcttttagccaCTAACAATAACGAGACATCCACTACAACAAC
TACCACTGAAAAAACTGAATGTTCTGGACCTAATTGTGGCTCCACTGCGT
CGGCTGACGGTTTGACGTCAAGTACAATGGCTCGTACACAGATGGAGACT
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CAtgcttattttttcataagaacgtGTAAATTTGACTGAGGAAAATTGGT
CATTCCATTAATTTCCATACAGAGGGGGTTGGacctttttaagtcaaaaa
acctttcttttgaaatgtatggataccccctggaaaatggcaaaattttg
aaaaaaccccttggaaaacttttttccataccttaaagtgacggTGGGCG
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tcctggaaaaataaaaaaataccctCTTTTagaccccctgtatggatatg
aaatggaatggcccaatacaAATAAGAAATAATGTACATcatggcccccg
tcaccgggggaccccccccccaatactttgcaaagtaatttctttttact
tttaaaaaagcttatatataccgtttagaggggtgaaataaggatgaaaa
gtcgaaaattttcttcgtcgcccaaccacgGTGGgcaacatatttttttg
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CTCGTACCCAGTCCCTTAGTACGCCTTTTAATGATTCTGATAGTGCTCAT
TATTGTATCACGTCTaccagtaaaataaaaaagtggtaCACGTGGATCTG
CGTACGAGATTGCTAACAACCCTTATATACTCGACGCACAAAGAAATAAT
GCtatttaagcttttttcacatgtacataaaattttactttagaccttac
ggaaaatcgttcgtaagCCTGtctttgggaatttccccgacattatgtag
agtttttgttgattaagagggtcttacgtgacttttccttccgttcaaaa
ctttttgaacgtaagcaaactttacataaggccttaaaacactaaGTAAG
CTTAGGGGAATTCccacccttcaaggtcttaagtaaaattttacgtacat
gtgaaaaaagctttcaagTTTAAAGTACGATTGTCTAAACGATAGTGATT
CTGATCGAATTCGAAGGTTTATGTAATTGTATTTATTCGTTTAGATTGGT
GCTTTATTCAGGGCTCAAAAGAGTAAATAGAATGAGTCTAGAGAACAAag
tcatgatatgcaccattgcaacgCCTTTCACGGACACAacctgattggtt
gcaagtgacgtattgactgattttattttaagtcacgtacaaccaatcag
ctgttgggtctatggtgtaatatcagaagacattgcaatggtgcatatca
tgaatacccaAATCAAATCTTTTTCTCACAATTTCCTTTTAGGTCAGTAC
AACTGAAAAGACAATTAAGGAAGAGAcgaaaaagattgaaaacaaggtcg
aaaatattgaaaaagatgccgaaaacgttgcaaaagatgtcgaaaaaggc
gccgaaaaTGCTATAAAGAATGCTGAAAACGAAGCTGGAAAAGTTAAGAA
TGAGCTCGGAAAAGAAGTTGATCAAGCTAAAGACAAGGTATCGGAAGCTG
CGAATAATCTGGCAGGAAAACGAAACTTTGAGGCAGCTGGTAAGCCATAC
AGcactatatttctttttttagtagCGGCCAGAGCGTGATGGTAGAGCTT
CCAGCTACGGTGTGCAATATTGTAAGTTCGACCCTCAGACGGgtcatttt
taagatttcaaaatgaTGCCTCATGCCTTTCTGCttttttttCATCAACT
AAAGAGAATGATCAAGGGTTTAAGTGGTAAAATCTATATCGAAAGGAAGG
GGGTAATCCTGGGGAAAAAGAGTAGTGCCCTCCTTGTCCTTCGAAAGAAG
GAGCCTTGGGTTTCGCCTACAGATGTGGTTGCAAACATACACACTTAATT
ATGGAAAATTCATTGAAAAGTACCCGGTGAGagttctattcatgatatgc
atcattgcaatgtcttccacggacccaatagctgattggttgcaagtgac
gtattgactgattttatgtcacttacaaccaatcagctgttgggtccatg
atgtaatgtcagaagacattgcaatagtAAATTTCATGAATAGTTATTAC
AATAACAGAAACGAGCAGCCAAATGGTAATTGGGTGAATATACCTTATTC
TTAAACTTATTGGGtcgaggtaaaaaaaatttttgtggttTAGTGTAAAT
TGATATAGTTGGAGATGGAgatatttttggtcaattttcaggaCCCGGAT
TCAAAGCTCCTTTGACGATCACTCTTGGTGAAGAAGgtatattagttttt
tttgtaatttttaaaaccaacccggaaaattttaagatataCTGACTTTC
CAAATGTTATCACACAAAAAACAATCGTTTTTTCTTtcgtaattttcaaa
agcaatCATATATGAGAGCTAGTCAACGCCAggattttcgttcttttttg
AATAAGCTCTAATATAcaaaaaccagtaaattttttcatagcCTGTGCGT
Tcttttaggttccaaataaacgcccccccccccgcttgttaatttttcga
aaattttccagccccCAGTCCTTATTAAGACCAACTCCGTTTATTAATta
tcaagaatatttttagctctaaatagccttattttagcctatatttacct
tatttttgggttttcagaagtacaatttccaacccccccccccccggcaa
ttaggtccccctgtTTCCTGTTCAcccccccccagtttatttggaaccta
agaatAGTAAAATTGAGCctcttctgttcttataaaaggcCTGTAAATAA
GATTGTTTTGTACATTTTATATTTATCTCCATCTCGTAGAAGAGGCGCTG
TACGCGTTAAACAAAGTCCGCTCTTTACATGGCGTCCAACCAATAGTCTG
GGATAAAGAATTAGAAACACAAGCGAAAGACTGGGCACTCAAGCTAGGAG
AAGCTGGACAATGGGCAGCTGATCTATCAGGAACACAATCAGTTGGAGAA
ATTGTTTACGTTGCCAAGGGAACAAGTGAATGTTCAAGGATGAGCACTGC
TGTCCATGAATGGTATGTTTGTTTCATTGTAGTTCGACAATGGCTGATAT
CTTCTTTCAATATAAATAGACCTTTATTATCCTAACAATTTAAACAGAGC
CTTACTAGTTCCATTTTTGTATACTAAATTTCACAAGTTCTGCTTTTGTA
ctattaaaaaaatctaaatttaaatttatttcaagtaAAAGCTTTTCGGT
CACGCCATCGTCGGTACAAACATATAAtggtaaaaatcacaaattttcta
tcgaaaatgttgaaaaactgcctaattatctacaaataaaaaaattcatt
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ttcgtcgaaagattaagaacattgtaagaacatgcccagcctcaatttgg
aaaaaaattacaagaaactaccattttttcctcttttcaagcagttttaa
ctgaTTTAGGGacgattttctaaaatcgagagtctaatattgtccaaatt
ttacaaattttaagtgctctttattgtGCATGATATTGTTGATTTAGagt
aagaacgcatttaagaacattttaggctgataATAGCTTaaaaaaaaGCA
CATctaggctcagccaaattttaggtgttctgaTAAAAATAACGTGTATT
CTTTAGGGTTTATTCAATTATTACCATTTCTGAAAAGTTGTAATTGTTTT
ACGGGAGCTTTTAAGATAAATTGATGGGAGTGGTTTTCTTTTAAATGCTT
TTAAATGTAATTTTATGTTTATGTTCGTTCCAGGTACAAATCCATCGCCA
AGTATGATTTCAATAACACCAATATGATCCCACCTGGCGATGAATCTCAA
CCCTTCACACAACTTGTTTGGAAATCTGCAACGAAGGTTTGAATAATTTT
ATGACCTATATTTTAAATGGAATGCTCTGAAAAATTCAGATTTCTTCCAC
GAAGGGTCACTATGAACAAAATGAGAACAGGAACTGGAACAAAAACGATA
TAACTAAAATTATTGTCAAAaggattatcagatgatttttgatatttggc
ttagagataccttttatggtccAGAGAGACACCTAAATCTTTTGACCCAA
Tctttttccaaagctgagatatttgactttgaaatctctaaaaatttaca
aagtctttacgttgaatttcgattgttttcatgtcaaaagttgaatatct
cagctttggaaaataattgggtcAAAAACTTTGAAGGTGTTTCTAAGGAC
CGTAAAAGGTATCTTTtagccaaatatcaaaattcatctgataatccctt
taaagataattttctattcattgaaaaaatatgaGATTTAGCTTAGGCTT
TGAAAGTGACCAAAAACTTAGTTTGGCGAATATCAACAGGCAAATCATTC
CAGATTTTTGTGGTATTGTAAAGAAAGGTCTTTGAATCAAACTTATTTCT
TACCCTCTGTTATTAAAGGTTGGAATGTCTGCTGTCTATAGAGAAGATAC
CAAAACGTCCTATCTGGTCGTTCAATTCACACCACCAGGCAATTATGGAG
ATGTACGAAATTATTGGAAATATGTAACACCACCTCTAGCCGGAACTAGT
AAGGGCCTATTTAAATTGGTAGTATAGTAAATGCTTATTtacattgaaag
aaaatttcggCCAATGTCTTAGGGAACGGTTTTTGATAAGGCCGGACTAA
tattggtttgccgtcacccgactgACCCTTCCTCGAAACCTACCGAACCA
AAAGCTGTTATTGcaattcaaaagaattttttttcataccaAAACCTGTT
TTCTCTGTCTTGTTCTATCTTAAGCTTAAGAATCTTAAAATTCCGTTTTC
ATTCCAAAATTATCGTAAACAGAACTttccgacccacctccaaaattcca
aaatctAGCGTCGTATGACTTCAAACCAATGTTTCCAGCCTCAGCCCTGT
GAATTcaaacaaaagcaaaattttgccgacctagaggtcattttaggtcg
gcaaagccgtCCTAAGTAGCTTGTTTAGGTCAGCAAAGACAAAATAGGAA
GAAAATTAACGAACTAACAAATTCAGCTGCTCTATAATTGTGTTattaag
ttttatgttttataaagagaatggaatgaggctcgattatcatgtgttat
caaatgataacacaattagattaacctaacaaataatatttttcctcttt
aggtcggctttgccgacccaaaacatttcttttgtcggcACGCCGACCTC
GAGTGTAAATTGCGTCGGCAAATAAAAGCcgacttcagctcaagttacgt
cggctttcaagtcggcattgccgaatgccgacctggattcacagggctgc
AGCCTTATTATGAAACTTTTTCTGTTATCAAAAAACAGTGTAATTAGACA
ATATCCAACGTCTCAGATGTCTAAACACGGTTTTCTGATAGGTTTTTGGT
AtctttggaaaaattaaaaacctttAGGTGTCAGAGTTTCAGAATTAGCA
AGTTAAATCAAGACTGAATTGGTTCAACAgatgatgaaatcaaaatagtt
ttttataagaataaagtAAGTGTTAAGAATAAAGTATCATAAGATTTGCT
AGAaacttaaaatctcaaaatctcaaaatgctGAGAGTAAGAACATGTAA
GAACATCTTTAGCATTAAacccaaatcaaataagaacaCCGGAAGgccca
aaatatttttgaatttcttttaaaaaatgtatCTTTGTCAGATTGCTGAC
CCAGCCTTTTCGTTTATGATGGTTGTTTCTACCAGCAATGAATCAGATAT
TCTTTTTCATAATATAGAAAAGAGGCGCGCCTCTATTttgacaaagcaga
ataaacGAAAGGATTTCTCAAAGGTTGTGCTTGGGCGGTGCGGGAAGCGG
GAGagggttgtttttttctttttctttaaaaattctgtgtaagcaaatgg
aagGAGATAAATGATGTCCttttaacatttcaaaaatttattttcagctC
CGTTAAAAATACCGAAACCTGAAGAATTACTTTCAACGGATTCAAATCAA
GGTAAAAATcaaatcactgacctttatatacatcctggacaaagtttctc
aatcccggccaagcaaaacattatgatcggagttttttgaaaagtggtac
ccgaATGGTAGTACTGTAATGTATCAAGAGCGCTATATCTACTTTTCCTT
GAATATTTGTGATGATGTAGCGCTGTTTGTCGACTGTGACTGCGATGgct
tcttttcaataaaactcTGATTAGAGATGAccgatatagcttggtccagg
gttttTTAAAGGTCAGTGAATACAATAATGCATATTCAGAAGGGacaatt
tcaaaatgttaaatcgaaaaagaattaaaactaaaaagtttttctgtGAA
GAATCGCAGGATGTcctgaaatgaattttttctgatttcctgaatataaa
aagaaataaatttgcAAAACTTTTATGTCGAtatatttaaaagatatttc
ttaTAATTTAGAAATCGTATTtcagatttttctttttaaataaggtACAG
CTTTACCATAGATACGTTCTGGACCGCAAAATAATTTTCGATGACttcta
ttttaatttttttagcctCATCAATTTCAAACATGGGCTCAATCATTGGT
GTTCTTTGTCATTGGTGTGTTAGTAATGGTACGAGTTTGTTTTACATTAC
ATACAGTAGAGGGTGTCCCGGAAAAAATTCTTGTGTCAGAACATGATTGC
GAATAGAAAAATTCTTTCGTGGCACAGGACTTTTTCCGGGACACAttgta
gagtctctttaactcggaCCTCTACAACTTGACTCGAACAAGTTTGCTCG
ACTCTTCAATTAATAATGCCTTAAAAACCTTACTCAAATCTCGAAATTtc
cctaactcgaacaaatttgtgttccacGTGTGAGTTCGAGTTACAAACCC
AACTGCATGATCACTTGAGCTCCTTTGGAGTTGTGTGAAATCCTTGCCAT
ACAGGGGGGTGACTAGAGGAAGTTCAAGTCGCTTGATTTCCTAGAGCTGT
TTAAGCAAGCGACTTTCAAGGGCATAGCATCTTCTTCAAATTACAGGGGG
TATTCTATACCATTTTTCAGCTGGAAGGAACGACGCTTTAGCTCGAATTA
CAGAAGGATTCAAATTAGGTCGGAATTAGAGAGAACTGGCTGTAGTTGAA
tgtttttgacgcatttttttcatgccattttcttttttgaaccGCAAGGC
TACGTCTATAAATCTTTTACTTCTCTAGGTGATAAACCAGAAATCAAGAC
AGCTGCAGCACGTCCTTACATCAAAATTACCGTGACCGATGAAGATAAAC
aacaagaagaaggagaaggaaAGAAAGATCGTAGCGCAGATGCGAAGAAG
AGTGTTCCCACAACTGAACTCTAA Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000140_pilon:444611..453884+ >XLOC_035971 ID=XLOC_035971|Name=XLOC_035971|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=2796bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000140_pilon:444611..453884+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ATGTCATCGGAAGATCATAATCACACGTCATCTCGTGAAGTAACGTCAAC
TACGACGACAACGGATGATGACGGTACGCTTCATACCGTCACTACCACGT
CTACGACGGAGAATGATAACGGCGACGTGACGAGTTGCTCCAAACTGTCC
AAGGAATTAGGAGATGATGTCATCGGAAGATCATAATCACACGTCATCTC
GTGAAGTAACGTCAACTACGACGACAACGGATGATGACGGTACGCTTCAT
ACCGTCACTACCACGTCTACGACGGAGAATGATAACGGCGACGTGACGAG
TTGCTCCAAACTGTCCAAGGAATTAGGAGATGccaCTAACAATAACGAGA
CATCCACTACAACAACTACCACTGAAAAAACTGAATGTTCTGGACCTAAT
TGTGGCTCCACTGCGTCGGCTGACGGTTTGACGTCAAGTACAATGGCTCG
TACACAGATGGAGACTGTCAAAAGTTTGACACAGAATGGAGATAGTAAAA
TAGAGGAAGTCAAAACGGAGTGTTCCAAAGTTGTCAATACTGTGAACGAT
CAGccaCTAACAATAACGAGACATCCACTACAACAACTACCACTGAAAAA
ACTGAATGTTCTGGACCTAATTGTGGCTCCACTGCGTCGGCTGACGGTTT
GACGTCAAGTACAATGGCTCGTACACAGATGGAGACTGTCAAAAGTTTGA
CACAGAATGGAGATAGTAAAATAGAGGAAGTCAAAACGGAGTGTTCCAAA
GTTGTCAATACTGTGAACGATCAGGTCAGTACAACTGAAAAGACAATTAA
GGAAGAGAcgaaaaagattgaaaacaaggtcgaaaatattgaaaaagatg
ccgaaaacgttgcaaaagatgtcgaaaaaggcgccgaaaaTGCTATAAAG
AATGCTGAAAACGAAGCTGGAAAAGTTAAGAATGAGCTCGGAAAAGAAGT
TGATCAAGCTAAAGACAAGGTATCGGAAGCTGCGAATAATCTGGCAGGAA
AACGAAACTTTGAGGCAGCTGGTCAGTACAACTGAAAAGACAATTAAGGA
AGAGAcgaaaaagattgaaaacaaggtcgaaaatattgaaaaagatgccg
aaaacgttgcaaaagatgtcgaaaaaggcgccgaaaaTGCTATAAAGAAT
GCTGAAAACGAAGCTGGAAAAGTTAAGAATGAGCTCGGAAAAGAAGTTGA
TCAAGCTAAAGACAAGGTATCGGAAGCTGCGAATAATCTGGCAGGAAAAC
GAAACTTTGAGGCAGCTGgaCCCGGATTCAAAGCTCCTTTGACGATCACT
CTTGGTGAAGAAGgaCCCGGATTCAAAGCTCCTTTGACGATCACTCTTGG
TGAAGAAGAAGAGGCGCTGTACGCGTTAAACAAAGTCCGCTCTTTACATG
GCGTCCAACCAATAGTCTGGGATAAAGAATTAGAAACACAAGCGAAAGAC
TGGGCACTCAAGCTAGGAGAAGCTGGACAATGGGCAGCTGATCTATCAGG
AACACAATCAGTTGGAGAAATTGTTTACGTTGCCAAGGGAACAAGTGAAT
GTTCAAGGATGAGCACTGCTGTCCATGAATGAAGAGGCGCTGTACGCGTT
AAACAAAGTCCGCTCTTTACATGGCGTCCAACCAATAGTCTGGGATAAAG
AATTAGAAACACAAGCGAAAGACTGGGCACTCAAGCTAGGAGAAGCTGGA
CAATGGGCAGCTGATCTATCAGGAACACAATCAGTTGGAGAAATTGTTTA
CGTTGCCAAGGGAACAAGTGAATGTTCAAGGATGAGCACTGCTGTCCATG
AATGGTACAAATCCATCGCCAAGTATGATTTCAATAACACCAATATGATC
CCACCTGGCGATGAATCTCAACCCTTCACACAACTTGTTTGGAAATCTGC
AACGAAGGTACAAATCCATCGCCAAGTATGATTTCAATAACACCAATATG
ATCCCACCTGGCGATGAATCTCAACCCTTCACACAACTTGTTTGGAAATC
TGCAACGAAGGTTGGAATGTCTGCTGTCTATAGAGAAGATACCAAAACGT
CCTATCTGGTCGTTCAATTCACACCACCAGGCAATTATGGAGATGTACGA
AATTATTGGAAATATGTAACACCACCTCTAGCCGGAACTAGTTGGAATGT
CTGCTGTCTATAGAGAAGATACCAAAACGTCCTATCTGGTCGTTCAATTC
ACACCACCAGGCAATTATGGAGATGTACGAAATTATTGGAAATATGTAAC
ACCACCTCTAGCCGGAACTActCCGTTAAAAATACCGAAACCTGAAGAAT
TACTTTCAACGGATTCAAATCAAGctCCGTTAAAAATACCGAAACCTGAA
GAATTACTTTCAACGGATTCAAATCAAGcctCATCAATTTCAAACATGGG
CTCAATCATTGGTGTTCTTTGTCATTGGTGTGTTAGTAATGcctCATCAA
TTTCAAACATGGGCTCAATCATTGGTGTTCTTTGTCATTGGTGTGTTAGT
AATGGTGATAAACCAGAAATCAAGACAGCTGCAGCACGTCCTTACATCAA
AATTACCGTGACCGATGAAGATAAACaacaagaagaaggagaaggaaAGA
AAGATCGTAGCGCAGATGCGAAGAAGAGTGTTCCCACAACTGAACTCTAA
GTGATAAACCAGAAATCAAGACAGCTGCAGCACGTCCTTACATCAAAATT
ACCGTGACCGATGAAGATAAACaacaagaagaaggagaaggaaAGAAAGA
TCGTAGCGCAGATGCGAAGAAGAGTGTTCCCACAACTGAACTCTAA
Gene-mRNA-Prot
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Position
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
|---|
| sc0000140_pilon | genome | sc0000140_pilon:444611..453884 + |
Properties
| Property Name | Value |
|---|
| Aaloc | 1342-1401:9215 |
| Aaloc | 1255-1338:9131 |
| Aaloc | 1192-1251:8468 |
| Aaloc | 1138-1188:7850 |
| Aaloc | 1006-1134:6319 |
| Aaloc | 904-1005:5635 |
| Aaloc | 682-900:4592 |
| Aaloc | 637-678:3994 |
| Aaloc | 388-633:3093 |
| Aaloc | 169-387:1569 |
| Aaloc | 1-165:1 |
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