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Sequence
The following sequences are available for this feature:
mRNA from alignment at sc0000071_pilon:1318666..1325976+ Legend: CDSpolypeptide Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >XLOC_035962 ID=XLOC_035962|Name=XLOC_035962|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=7311bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000071_pilon:1318666..1325976+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ATGGAGCGCCCAATTTTGATCTACGCTGGTAAGGTTGGTTCTTCATGCCG
ATTacaaaagttaagaattttGATCTCTACAACAATATAGCCTTTTGTCG
CGAGTCTTTCCTTGGAAATTTGGATTATGATGTACTCTaaactttatgaa
aaaaataaatatacccGCGCAGAGATGTTTGCCATGGGTTTTCTAAGGGT
CTGTTTCAGGAGGTCCCATCAGAACATACCCGTCATTGGCCAACCCTGGT
GCCGCaaaaaaaTTGCTAAACTTAGGTGATAATGGAGTGACGCTGTATCG
GTCGATTATTCGTTGATTTGATTTGGTCTCAGGCGATGTAACCCATACGG
TACAAAACGTCTTTCTAGCGTTCGTAACATCTATGTGATGTTAGGTAAAT
GGTTAAAAATGTATGCAAGCTGGGAATCTAATCAAGCTCTTTAAGTAGAA
TGTCGAAgaaataagaaccaataacGGTATCATTATTATTTATTGACAGT
ATATATATTTCGAGCAAATCTTGATCATCTTCaggtctaaaatcaaaata
aaagcaagaattaaaattcgtaaaaatcaaaaaatgtattCACATATCTA
CAGTATCttgcttttattttgattttagacctGAAGATGATCAAGAATTG
ATCGAAATATATATATTATCAATAAATAATAACGATACCGTGTTTGGTTC
TCATTTCTTCGACATTCATCACTTGCCACAATGTTTTCATCAAATCGTTT
CTTTAAGTAGAATTTTCCTTTAATCAATactcattttgttttcaagCGAT
ATGTTGCTGGATATGTATCATCTCATCACACACTGTTTTAGAAGAATTCT
ATTGCAAAGATTCGAATGTTGAGTATGGTCGTTCTTTGAAAGGTGGTAAT
GCTGCTGGATTCTTCGATAATTATggcaaaactaaaaatattcagGTTTG
TATTATGTAATGATTGAAAAAGGCTTCCGTGATTTGACAATTCAGTGATT
TTAAGGCCGATGTCCACTTTTGTGCGAAATATGCGACAGTTTTTTACTCA
ACCGTTATTGCCTGAAGAAAttacttcataaaaagtttcgcgcaaacaaa
gttcaacttttttcaacacttacgtcaattttgaccaatggaattgcttc
ttttttcaaccgaccaatgaccttacagaAACGTTAAAAAGTTCTTCTCA
TTTCGCGTAAAAGTGGAGACCGTCCTTTATACTTATTCTGTTAATCCGTT
GCAGGAAGGGGAAAATTTATGTATCGTCGCTTGCAAGTGTCTGAATGTAA
AACTAGATACTAAGGCTtgggaaagaaaaagccttgttaaaaagttattt
tcccTTTTCATTCGCGTTTCACTGACTATACATTAGTTAGTTAATTAGCC
CTACTAGTCTGTACCCTGaacaagaatttttaaagatataATAGTTACTG
GCTTTGTGATAAAGTTTCCTGTTTCCTTAGGAATGTACATTGAAATGTTG
TGACGCAAAGAAATGCAACGTAGCAGTAATGGATGGCCGAACCAAAATAT
GCATGGGTGTCCGTTGTTTCAACGAAACGTCCTGCTCAACAGTTCCCGCT
ACGAAGGGAGAGGAAGAACTACAGATTGCACATCTGACTGGTAGATCGCT
TGATAAAAATGTCACTATAGGTGAGTAGAATTTCTAAAAGAAATCTCACA
CCGAATCtttttttCATACCGGCCCGTTTGGGTTGTTCTAGGGTTGGAAA
ATCTGGGATGTGCGGTCCGAACCTcagaaaaccgacccttattagttttt
gtgaaaaagttgaCTCTAGTAAGGCAATTACCCTAAAAGAGATCAAAAAG
GGGGAAACTCCAACCCTAAGTGAAACTATTTTaattgtttattgtttttg
taACCATTAGAGTTACTTAGAAAGgtaaaaaaaccgacccttatctTTCG
AAAATAGCTTTTTTGCCAGAGAACCCACCCGTGCTATGATATGTAAAGAC
TTTAGTATAAAAAAGTTATCGTTCTTGATTTTTCTTAGTATTTGAATTCT
ATATATTGGTAGTCAGATAAAAATATGAATTCGCAAATATCTTCCAAAGC
AGAACAAAGTATAGACACATTCAAATCTCTATTCAAAATGTCGAAGGTAG
TTCAAATGTAGGTTCCCCGGTcttcccccgggggggggggggggtactag
gattgacgggtgtcgggtatgtgcgtgccagacctctggacccttaccct
tagagagactgaattttggtgaaaaggtgacccttagagagactcagtgt
agaaaaacccaacccttagagagactttttcacaaaaaaattctataatg
ggccaaagaaattagatttttaaaagaatttctcaaattttcgaaaaatt
tctctaatttttgaaaaatgttctcacttttttgaaaaattttctcactt
ttttgacttttgacttttctttgacccgagtttgtgaaaaaaccgaccct
tagagagactgattttgacttttgttttggtaacccttagagagactttg
ggagggtgaaaaaccctacccttaaggcacgcacatacccagcacccatt
tttgcctaagtacccccccccccgggggtctTCCTCATCTAATCATTTAT
CTAATTCGTTAAAAATTTCGATCTCTGCAACAATATGAGTCTTTCCTTGG
AAATTTGGATTATGATGTACTCTAAAACtttatgaataaaaatatatcCG
CGCGGAGAGATGTTTGCCATGGGTgttctctaagggtcggttttagGATG
TCCCACCCGCAGATACCCGTCATTGGCCAACCCTAGTGCCCCAAGAAAAA
TTTAGATGAAAATGGAGTCACGCGGTATCGGTCGATTATTTGTTGTATTG
CTTTGGAATcgctagcctatactagacgtcgccgcatttttttctacgca
atcaACATCTATTCTGCTTtgcaactttttcgaatgtGTGGACTTTTTAA
TTCCTTTTAGACAAAAAGACGGCTAAATTAAAATCCAACTTTACTGAAGA
CAGATGTCCGACAAATGAAATCATGTATAACATGAAATTGTCCGGTGGCT
TACATGCCGGACGCTTCACTGATATAGGACGTGTCCGTAGTATTAAGACG
TGTGTCCGGTATTGTTGCGGTGATGCTACGGAATGCGATTTAGCCTTTAT
GCTTGGTAAAAGgtgtgatttctttttttttaatttgaaaactcTTTAGG
TCGAATCCATTTTATCATACAACCAAAAACACTGGGTCCCTTAGCTTGAA
GCTTATTGACACCCCCTtcttcacagacccactgggaccccttcccactg
gaaaaccTGGCCGAAacatcgtccccagtggaaaattgtaCTCCAttttt
tttCCCCGCTGAACttaatcaaataaatcaatccccactgcaaaatatta
taacAATATGGGactatcaatccccatcgagtttcagtccgttattttac
CCCCTCCCcttactggctgaaaaaatcccaccgggtctgtgagaaggggg
tgtgtaaAGGTCTGACATGGATTTCTTATCGCGGATATGCTATTCTGCAA
ACAACTTTagtttacttttgtttttgaatcTCTCTTACTAGAACAATTTC
TTATCAAGGTACCACAAAATTCTTCATTGACATTCAAACCATAGGATCAT
TTTGAGGAACATTGCTAGGTCTAAcaaatagtttttgaaaataaattaat
aaaaatgttttcaattttagatGTTATTTAGTGAAATGCTACAACGAAGA
GAAGTGTTCGCCTCTTCCAGCATCCGATTATTCGTTTGAACAAAAGATGG
CGTTTGTTTCACCTTGGCTCTTTGACAAGCGAAAGAAAATTAGTACGTTT
TTGCTTGACTGGATATCTTTACAGAATTTTACTAACCTATCATTACTGGC
TGCCTAGAGACagtctacaatcatggtcgtaatatttgagaaaaaaaggg
aagTTCCTACGAAATCTTAAAAACACAAACGATTAAAATGATCCAATCGG
Gcttagaatatagcctggaagtctataagcctctcccgaattgaaatact
taAATCAATtcatcaattagcccaaaagcgactttctcgcccgaaaaacg
tggaaataagctaaattctcaatagatttcgaccatgattgtagtccTAT
TTGATTTCTGATATGACTTTTATTTTCATCGGTAAGCTCctacttttcaa
cttttttgcaGTGATGATTTTTCAGTAATTCATTAAAAACTTACCGACCT
TCCAGTATACCCTTGGAGCCCCCACCCCTCAACTAGTGAATCAAGGCTAA
TACTCAAAGATATTGTCGTGTGTGTTTTGACGTTTACTGCTATGTTCTAG
AAAAATTAATATccaaacttttattttcagtgAAAGTCCCTTCAGGGCTC
CAGCAACATCATCTGCAATGTACTCAATCAAAAGTTTATGAGAAATCAAA
GCTATTTGGAGGAAATGATGCCGGTAAATTTACACATGTTGGGAAAGTCG
GCAAAATGCATATCTGCTCTAAAATGTGTTGTGAAAATCATGATTGTGAC
TTAGCGTAAGTTATGTCCTAGTTAAGTATGAGTTTTTAGGTGGTCTACCT
ATTCACCTATGTCAGATTTCAATTGATGCTTTTAGCTTgattatttttaa
agttttaaagaaattcaaaataaatttttttaatgttccGAGACTTCTTC
TAGAGTAGACAATCCTATcctctacacaagatcactaaaaaagggaatag
tttaggagaggcgtgataagtTCGGGTGGTAAGTAAGTaatggcggagat
gtttacagtgttccaaaactctatcgccacttttttcccgtaaaccgccc
tgacgccctaactctttcccgcgtttactgacctctaaacggacgatagc
atcgtctacttCTAGAGTTGTTTAAAACTGTTTGTTTGAaagtatgaaaa
atgaaaatgtatcgAGGGGGTTGTACGGGGAGGCTAATGCACACCGAAAT
ACAGacacatatattttttggatcaccgacaacaccgacagaaaaaattg
ctaaaatgtttGTCCCGGTgtgaaaataccctggaatttcagcccaattG
TGAAATTGGCTTTTTCACCTcgattcgaaattcaatgtttaaagattcca
ctccaaaaccatccccattgggatttcactagaaatttttatccccactt
aaaaaaatggttccactggggctgtgtaACAGAGGTGTtaaaatcattat
tttgtcaCTACAAGGCGTGTCGGCTATAAAAAGGATATACACATTTAAat
ctatttcatcatggatattcttaccTTCTTTGGGAAAATtagcctaaaat
attcttacagcatattcttaggttaggattcTAACTcaagactagattta
acatttagtacatacgtctcaagcataaaacgACATTTCTGGgggtaatt
gataatttataattgaaaatggtctaaaagtggcattcttagcttgactt
gAGCAGCAAAATTCCataatggtgatattcttagcattattcttaatttt
ttggccattttcatcatggacaatcttttaaagtgtattcttataaaaaa
agcgtgtactatCACGTTTTTTACTTCAAACGCCGAAGTACCGACATAAA
TGAGCGCTAATACTGTCCCATCGTCAAACCCATACGCCCTATGTATTGAA
TCTTTGaaattgttcaattttttaGCTACATGTTTGGTAAAGATTGCTTC
TTGGTCAAATGTTACTCTGAGAAAGGATGTCGTGTGGTACCTGATGAAGA
TTTAAGGAAATCAACTGACTCCTCGCTTGACAAACAGATACAATACGTCA
TCAAACGAAAATTTGGTGTCAAAGTTGGAGAAGGTAAGGTTTtggtaaaa
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ATTTCCATAAGATTGGTTGCTTGGTTTTAAATTGAAAACTAGAGCTTCCC
GCCGTAGAAGCTCTCCAACCTAAAGACCTGAACTATGAAAGTAATATGCT
TTCTAAAactttgtaaaatatttctcaacaGATGGAAAAATCCAAGACGG
TAAAGAGACATGTGGTATTGATGGCAATGTGAGGAATAAAACAATTCTTG
TCAAAGGCATGCTTGCTGGTTCTTTGAAACGTCAACGCAATGTAAAAGAA
ATGAACCATTGTCTCGAAAAATGCTGCAgtgaaaaaaggtaaaatccatt
gagtttcaagcccgaagggcatagaggcgagactcctggatgggaaatga
aaccacctatttcccatccaggacgCCCGCGTGTAGTTTTTGCACAAAGg
gcggattgaaactaaaatctatcgctagatttcaaaaaatatagtcctcc
aaaacaaaggaaccactagatacaatccgtcgtcatgattacggcgcgtt
ctatgtaggttttggatgggaaagaagtagcttcaatttctcttgcctta
aaagggttaaagtttcgcctctagcccttcgggctttaaactctaTGGTA
AAAGCCAAATCTCAGAAGAAGATATAGTCTGAATCTTAGAAATCTACGAA
AACGCAGGAAGTATAAAAATAATCGGTTTGTGAATGCCAGTAGCCTAAAG
AAGATCCAGATAACCCGCTCACACACTTGCTCTTATTTACTTTTGCAAGC
AAAAGGCAATGcgattttttgaatgttttgagcTGTTTGGGATCATCACA
TTCACCACAATCCTTTAAAAGAAAAGTCTGATTCTAGCTCTAGCAGAATG
GGTGATCTGTTATAGATTTAATATTTTTCCTATCATGCGCGAGTTTAAAA
TATGTATTGAATGAATAATACAAAGATTTAGGGTGTAGCATGAATACTGC
TATGAGATCGATTCTTGGCTTCTACAAATTATGTCAATTTAATATGTCTA
TCCAAGGACCTGCCTGTGTCAGTAGAGCGTTTAACAAGGGTGTACCAAAT
ATAGTATATATTTTAAACAACTGGATATCGAAATGCTATAATGCGAATAT
AAAAAGGTTCTCAATCTCGCCCTAATTGTCCTAGCTTTTTTAACAATATA
AATTCATTGTATCTAGGTGCCACGTGGCAATGACGATGGGACCTATCTGT
TATTCAATGGAATGCGCAAACAAGGATGGTTGTAAACCAAAAGCGGCACC
AAAATCCATGATGAATCAGAATCCAACGATAGCTTACGTCAAACGTGGAT
CCATTTCCATG Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000071_pilon:1318666..1325976+ >XLOC_035962 ID=XLOC_035962|Name=XLOC_035962|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=2652bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000071_pilon:1318666..1325976+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ATGGAGCGCCCAATTTTGATCTACGCTGATGGAGCGCCCAATTTTGATCT
ACGCTGCGATATGTTGCTGGATATGTATCATCTCATCACACACTGTTTTA
GAAGAATTCTATTGCAAAGATTCGAATGTTGAGTATGGTCGTTCTTTGAA
AGGTGGTAATGCTGCTGGATTCTTCGATAATTATggcaaaactaaaaata
ttcagCGATATGTTGCTGGATATGTATCATCTCATCACACACTGTTTTAG
AAGAATTCTATTGCAAAGATTCGAATGTTGAGTATGGTCGTTCTTTGAAA
GGTGGTAATGCTGCTGGATTCTTCGATAATTATggcaaaactaaaaatat
tcagGAATGTACATTGAAATGTTGTGACGCAAAGAAATGCAACGTAGCAG
TAATGGATGGCCGAACCAAAATATGCATGGGTGTCCGTTGTTTCAACGAA
ACGTCCTGCTCAACAGTTCCCGCTACGAAGGGAGAGGAAGAACTACAGAT
TGCACATCTGACTGGTAGATCGCTTGATAAAAATGTCACTATAGGAATGT
ACATTGAAATGTTGTGACGCAAAGAAATGCAACGTAGCAGTAATGGATGG
CCGAACCAAAATATGCATGGGTGTCCGTTGTTTCAACGAAACGTCCTGCT
CAACAGTTCCCGCTACGAAGGGAGAGGAAGAACTACAGATTGCACATCTG
ACTGGTAGATCGCTTGATAAAAATGTCACTATAGACAAAAAGACGGCTAA
ATTAAAATCCAACTTTACTGAAGACAGATGTCCGACAAATGAAATCATGT
ATAACATGAAATTGTCCGGTGGCTTACATGCCGGACGCTTCACTGATATA
GGACGTGTCCGTAGTATTAAGACGTGTGTCCGGTATTGTTGCGGTGATGC
TACGGAATGCGATTTAGCCTTTATGCTTGGTAAAAGACAAAAAGACGGCT
AAATTAAAATCCAACTTTACTGAAGACAGATGTCCGACAAATGAAATCAT
GTATAACATGAAATTGTCCGGTGGCTTACATGCCGGACGCTTCACTGATA
TAGGACGTGTCCGTAGTATTAAGACGTGTGTCCGGTATTGTTGCGGTGAT
GCTACGGAATGCGATTTAGCCTTTATGCTTGGTAAAAGatGTTATTTAGT
GAAATGCTACAACGAAGAGAAGTGTTCGCCTCTTCCAGCATCCGATTATT
CGTTTGAACAAAAGATGGCGTTTGTTTCACCTTGGCTCTTTGACAAGCGA
AAGAAAATTAatGTTATTTAGTGAAATGCTACAACGAAGAGAAGTGTTCG
CCTCTTCCAGCATCCGATTATTCGTTTGAACAAAAGATGGCGTTTGTTTC
ACCTTGGCTCTTTGACAAGCGAAAGAAAATTAtgAAAGTCCCTTCAGGGC
TCCAGCAACATCATCTGCAATGTACTCAATCAAAAGTTTATGAGAAATCA
AAGCTATTTGGAGGAAATGATGCCGGTAAATTTACACATGTTGGGAAAGT
CGGCAAAATGCATATCTGCTCTAAAATGTGTTGTGAAAATCATGATTGTG
ACTTAGCtgAAAGTCCCTTCAGGGCTCCAGCAACATCATCTGCAATGTAC
TCAATCAAAAGTTTATGAGAAATCAAAGCTATTTGGAGGAAATGATGCCG
GTAAATTTACACATGTTGGGAAAGTCGGCAAAATGCATATCTGCTCTAAA
ATGTGTTGTGAAAATCATGATTGTGACTTAGCCTACATGTTTGGTAAAGA
TTGCTTCTTGGTCAAATGTTACTCTGAGAAAGGATGTCGTGTGGTACCTG
ATGAAGATTTAAGGAAATCAACTGACTCCTCGCTTGACAAACAGATACAA
TACGTCATCAAACGAAAATTTGGTGTCAAAGTTGGAGAAGCTACATGTTT
GGTAAAGATTGCTTCTTGGTCAAATGTTACTCTGAGAAAGGATGTCGTGT
GGTACCTGATGAAGATTTAAGGAAATCAACTGACTCCTCGCTTGACAAAC
AGATACAATACGTCATCAAACGAAAATTTGGTGTCAAAGTTGGAGAAGAT
GGAAAAATCCAAGACGGTAAAGAGACATGTGGTATTGATGGCAATGTGAG
GAATAAAACAATTCTTGTCAAAGGCATGCTTGCTGGTTCTTTGAAACGTC
AACGCAATGTAAAAGAAATGAACCATTGTCTCGAAAAATGCTGCAgtgaa
aaaagATGGAAAAATCCAAGACGGTAAAGAGACATGTGGTATTGATGGCA
ATGTGAGGAATAAAACAATTCTTGTCAAAGGCATGCTTGCTGGTTCTTTG
AAACGTCAACGCAATGTAAAAGAAATGAACCATTGTCTCGAAAAATGCTG
CAgtgaaaaaagGTGCCACGTGGCAATGACGATGGGACCTATCTGTTATT
CAATGGAATGCGCAAACAAGGATGGTTGTAAACCAAAAGCGGCACCAAAA
TCCATGATGAATCAGAATCCAACGATAGCTTACGTCAAACGTGGATCCAT
TTCCATGGTGCCACGTGGCAATGACGATGGGACCTATCTGTTATTCAATG
GAATGCGCAAACAAGGATGGTTGTAAACCAAAAGCGGCACCAAAATCCAT
GATGAATCAGAATCCAACGATAGCTTACGTCAAACGTGGATCCATTTCCA
TG
Gene-mRNA-Prot
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Position
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
|---|
| sc0000071_pilon | genome | sc0000071_pilon:1318666..1325976 + |
Properties
| Property Name | Value |
|---|
| Aaloc | 1183-1326:7168 |
| Aaloc | 1027-1179:6134 |
| Aaloc | 868-1023:5777 |
| Aaloc | 694-864:4433 |
| Aaloc | 571-690:3772 |
| Aaloc | 370-567:3013 |
| Aaloc | 178-366:1481 |
| Aaloc | 31-177:799 |
| Aaloc | 1-27:1 |
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