XLOC_035946 (mRNA) -

Overview
NameXLOC_035946
Unique NameXLOC_035946
TypemRNA
OrganismClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon (Jellyfish)

Sequence
The following sequences are available for this feature:

mRNA from alignment at sc0000140_pilon:510749..525327-

Legend: polypeptideCDS
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>XLOC_035946 ID=XLOC_035946|Name=XLOC_035946|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=14579bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000140_pilon:510749..525327- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
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TATCCAGACTCAAAATTTCAGAAAAAAAAACTCTTACCTCAACATACAAA GTTTCTAAAATTTTAGAGTCTGGTGCAACTAAAAAAGTCTGATACAGTTT TGAATGACACAGTCTGTGAGTAAACCCTTGTTGACAGAATCTCAAAACTT TGGAAACCCAGGCAGACACACATAATTACTTACCATAAAACCTCTTTTAC AAACTCAATAAACTTTCAAAACCACTTTAAAGTACATCAAAGCATCAGCC ACATTCATAAAGGCTCCTTTCCAGCGGCCATTTTGTTTAGAAATGAACTT GTGTTTTCTTTTTCATTTGTTTATCTTTTTTTGCAAGGTCAGCTTTTTCC ATAAATTATGCGCGCGCATCGAAAAATATCAAAAACCCCGCGAAAATTCT GCTCAGTGTCTGGGCGCTTACTGACCAATTAGAGACACTCGCATATGCAG GGACAGATATCCCTGCAGACGAGTTACTTCGACCAGACCGTAAACCAGAG ACAAGATTATAAAAAAACTAGACGGTGAAATAGTTTACGGTCTGGATATC CAGGCTAAGTTTTTGATCACGTTACCAAGTACTCCTCTTGGGGTTGGTTT AAGATTCAATCACATGATCAAAAAGTGAGCAAAGCAAACTCATTTCTCAA CGCAAGTTCAAGTACGAAACAATGGAAAGTAACAAAAAGCTTCTGAACCG GTGTTTTTTATAGGGACTATATATACGCATTCATGATATACACTATATTT TATAGCGGTCATAGCTTAAAGATAGAGCATCCAGCTACGGTTCGCAAAGT CATAGGCTCAATCCCTGGCTGGGTCATACCAAAGACTTGAAGATGGTACT TGATGCCTCTTTGCTTGATGCTCAGCAAGCAAGGGAAGAATCAAGGATAA GTGGAGCAATCCAGGGAGAAAGAGTGGCTACCTCCCCTACCTTCGGGTAG 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Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000140_pilon:510749..525327-

>XLOC_035946 ID=XLOC_035946|Name=XLOC_035946|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=4524bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000140_pilon:510749..525327- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
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GAAAAGCTGAATTTATGTCACTTTGTTTGAGGTTGAAATTCAGCGTTGGT
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ATTATGGCTTGTTATAGGCTGGGCGATCGCTGATTGGAAAACTAGTCTGG
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TTGAGGTTGAAATTCAGCGTTGGTAAAATCCATCTCAATTTCAACCCTTT
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ATCACTGATAAGTGCACGTGGTTCTACATAAGCAGCCAATTGATTTGGGT
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CTACATAAGCAGCCAATTGATTTGGGTGATTGTCATTTTCTACGTTTATT
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GGGAATTTCGATTACTTTGCCATGATTTTCACCACCGGAATATGCAATGG
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ATATGGGAATTTCGATTACTTTGCCATGATTTTCACCACCGGAATATGCA
ATGGATTGTTCTATGATGGTGCTAACGCTCCCATTGTGGGATATCGAAAC
ACCACAGACAACTTGCTCATCTATCGTGGAAAGAGCAATCACATCACACA
AGCACAGAACTCTCTCAATGTGGTTCTTCTTCATTGGGGATTTCATGGAT
TCAGTGTCTACATACTTCCATGTCTTCTACTATCCGTTCTTTGTTACCGA
AAGGGAGCAATCACATCACACAAGCACAGAACTCTCTCAATGTGGTTCTT
CTTCATTGGGGATTTCATGGATTCAGTGTCTACATACTTCCATGTCTTCT
ACTATCCGTTCTTTGTTACCGAAAGGGTCTACCTTTGACCATGCGTTCAT
CACTATACCCAGTCTTCGGAAAGAAGATATTCGGACGTCTCGGAGATATC
GTCGACAGCGTGTCGTTAATTTGTATCGGTTTCGGCGTGTCCACGTCGTT
CATTCTTGGCGCCATTATGCTGGTCGTCGGTCTGCAAAGTATCGTCCCTG
AACTGGAAAACAATCGAACAACAAGGTCTACCTTTGACCATGCGTTCATC
ACTATACCCAGTCTTCGGAAAGAAGATATTCGGACGTCTCGGAGATATCG
TCGACAGCGTGTCGTTAATTTGTATCGGTTTCGGCGTGTCCACGTCGTTC
ATTCTTGGCGCCATTATGCTGGTCGTCGGTCTGCAAAGTATCGTCCCTGA
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GGTTATCCATGATTTCAGCCTTAAGTGGCATTAAAATCGGCATCAGAAGA
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GGGTTATCCATGATTTCAGCCTTAAGTGGCATTAAAATCGGCATCAGAAG
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CGTTAAGTGACAACATTTTCTACTTGTTAAATCTGGCTGTCCAATCTATC
GGTCATTATACTCAATTTTTTGTGGGAACTTCCACTTTTACTGGTGCTTT
TCTTCAACAAGGAAATTATCCTGGGAAAACAGATGTTGAGATTAACTGGA
TGCATGAAAATACGGTGTTTTACTGAGCTTTGTTTACTATCACAATAGCG
TTAAGTGACAACATTTTCTACTTGTTAAATCTGGCTGTCCAATCTATCGG
TCATTATACTCAATTTTTTGTGGGAACTTCCACTTTTACTGGTGCTTTTC
TTCAACAAGGAAATTATCCTGGGAAAACAGATGTTGAGATTAACTGGATG
CATGAAAATACGGTGTTTTACTGGGGCTGGTGGCTAGGATGGGCACCACT
GGTTGCTATATTTGCCACTAGAATCAGTAAAGGCCGAACCATCAAGAATG
TTGTTGAATTTGGATTCCTCATACCTATTCTTTGTAATTTCATTTGGTTT
GTTGTGATCGGTGGAGTGGCCATTGATATGCAGAATCAAGCGATTGATGC
GAATCTCCAGTGTGGGATGACAACGGGGCTGGTGGCTAGGATGGGCACCA
CTGGTTGCTATATTTGCCACTAGAATCAGTAAAGGCCGAACCATCAAGAA
TGTTGTTGAATTTGGATTCCTCATACCTATTCTTTGTAATTTCATTTGGT
TTGTTGTGATCGGTGGAGTGGCCATTGATATGCAGAATCAAGCGATTGAT
GCGAATCTCCAGTGTGGGATGACAACAGCTGAAAGACAAAATTTGGGAAT
TCCAACCTGGGTGCAGCGGCTTGGATGCGTAGATGAAAACCGACGTTTCT
TTCTTGTTTTGGAGAAGTACGAAGATATCAAAATCATTCTGCAGATTATC
GCTTTGTTGATCACTTTACTGTATTTCATCACAAGTTTTGATTCTGCAGC
CCTGGTGATGGGGAGTATCTCCAGCAATGAGCTGAAAGACAAAATTTGGG
AATTCCAACCTGGGTGCAGCGGCTTGGATGCGTAGATGAAAACCGACGTT
TCTTTCTTGTTTTGGAGAAGTACGAAGATATCAAAATCATTCTGCAGATT
ATCGCTTTGTTGATCACTTTACTGTATTTCATCACAAGTTTTGATTCTGC
AGCCCTGGTGATGGGGAGTATCTCCAGCAATGGCGAAGAGAAGCCTCCTC
TGATCCAACGAATATTTTGGTGCATCACTCTAGCAGCTGTGACATCAGTT
CTTCTCATTTACGAAGAAAGAGTTGGGAGGGCAGAAATCACTGGATTTAC
AATCCTAGCCGGTCTGCCATTCGCTATCTTGTTGTGTCTTTCTGCGGTCG
CATTATGGAGGCGAAGAGAAGCCTCCTCTGATCCAACGAATATTTTGGTG
CATCACTCTAGCAGCTGTGACATCAGTTCTTCTCATTTACGAAGAAAGAG
TTGGGAGGGCAGAAATCACTGGATTTACAATCCTAGCCGGTCTGCCATTC
GCTATCTTGTTGTGTCTTTCTGCGGTCGCATTATGGAGACTGTTGAAATT
GGAACCAAACTGGTCGTATGACAAACTCAACCATTGGGCTATGATTTATG
GAAATATTAACTCCATCCAACGTCTCAAAAACGTTTCGATAGCAACCATA
GCCCCTTGGTATTTCCTTGGTAACATCGCAAACAATGAGAGGAGAATGAA
ATCCCGAGCGAAAAGAGTTTTCAAATATGTAAAATACGCGCTTCCATTCT
ATTTGTGCATTATCTTGTTATTTTTGCGGCTTCGATTTCTCTATATCAAC
AATCTTGGATGGGCGTTCTTTATTGGTTTCGTCACAATGACGAGTCAGCT
GAGAACGAAGTTACGGCACCGAGATGGTATCCAAGGCAACGTCATTGAAG
ATATTGTGATATGCGTGATTTATCCTTTGACGGTTATCCAAATTCATGAA
CAGACTGTTGAAATTGGAACCAAACTGGTCGTATGACAAACTCAACCATT
GGGCTATGATTTATGGAAATATTAACTCCATCCAACGTCTCAAAAACGTT
TCGATAGCAACCATAGCCCCTTGGTATTTCCTTGGTAACATCGCAAACAA
TGAGAGGAGAATGAAATCCCGAGCGAAAAGAGTTTTCAAATATGTAAAAT
ACGCGCTTCCATTCTATTTGTGCATTATCTTGTTATTTTTGCGGCTTCGA
TTTCTCTATATCAACAATCTTGGATGGGCGTTCTTTATTGGTTTCGTCAC
AATGACGAGTCAGCTGAGAACGAAGTTACGGCACCGAGATGGTATCCAAG
GCAACGTCATTGAAGATATTGTGATATGCGTGATTTATCCTTTGACGGTT
ATCCAAATTCATGAACAGGCTAAAAGATCTGAGGAGCGAATATCTAATCC
GTATGTTGCACAAAACCGAACAACATCGACCAGGCAACATAATGGTGACG
TCATCAATCATAATCACAATTACGTCATCAATCAAACAAATGATGCATAT
GTAATGGACCAAGTGTTTGGAGCTAAAAGATCTGAGGAGCGAATATCTAA
TCCGTATGTTGCACAAAACCGAACAACATCGACCAGGCAACATAATGGTG
ACGTCATCAATCATAATCACAATTACGTCATCAATCAAACAAATGATGCA
TATGTAATGGACCAAGTGTTTGGA
Gene-mRNA-Prot
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
XLOC_035946XLOC_035946-proteinClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonpolypeptide
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
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Properties
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