XLOC_035868 (mRNA) -

Overview
NameXLOC_035868
Unique NameXLOC_035868
TypemRNA
OrganismClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon (Jellyfish)

Sequence
The following sequences are available for this feature:

mRNA from alignment at sc0000194_pilon:224354..231835+

Legend: CDSpolypeptide
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>XLOC_035868 ID=XLOC_035868|Name=XLOC_035868|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=7482bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000194_pilon:224354..231835+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ATGGCTGCTCCTATACAACAAATTTCAAATGGCGCTATACCAATTATGTC TGGTGTTGCAGGAACTCCAGTTCAACAGCCAGCTGTTGTttaccaacaac aacaaccaatgATTGTCGCAGGTGCTGCTCCGATGGGTTACGCACCACGA AAGCCCTACATCAGGAATCCGAATGAGGAACATTGGTAAGGgagcttttg aaaaattgactttttaattTATCCATTATACAGTTATACTTGaaaaaaaG AGCTCTGGGAAAATAACCATTGTGTCTTCAAAAGACCAACTGTATTAGTT CCATAGGGAAAAATTCATGGTTGTTGGACTTGCAAATACGTGTGTCAGTG TACCAATCAAAGGAAATTCGTTTTTACCAATGTTACTTTTTTCTATATCT AAAGAATTAGTAAACGttttaaaatctgtaaaaagctCTCTACTCCCAAA TAGTTCTAGAttaccagacaatctcaatcaaacagaatcgacgatcgaac cagtcgaatgcaatcgaatctcaatcgagcgtcaaaattctgggtaatat tcgataggttcgattgttgttcaactggttcgattgtcgttCAACTACAT TCGATTGTTTgagtgaaacaaggcatgtcctaaatatattttgcgtgatg cgCACCGCTTCCCGTTATTCCTCCTTAActctcatatatagctcaaaaga atcgaATCAACaagaggatttcgaaaagggTCAGCTTTTTAACAAagatt agtctctctaagggtcaggtcctaatcaaacgcaatcgaacatcaatcga acgcaatcgaatatcaattgaatctgaaaattgtgaGATTCAAtcgcgtt cgacaatcgaatttcaatcggtcgattgcgttcgatttggttcgactggt tcgatcgtcgattccatttgattgagatcgtctggagaTGAAACCCTGCA 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CCTTGGTAAGTTTTTTAAGTCAGTCGATCTCTGGATCTTTGATATTAATG CCCTATCTACTTGATTTTTACTGAATGACACAAGATGAGTCTTagacttt tgtttatttattttttgtctcattacagtttttgaatatttttcattttc agtatgACCCAGATAAGGCCAACACAACTCTTACTACTGCCAATGGTGCT GCACAACTTAACGTAAGAATTAAAAATCTTGGTATCAATATTGTTACATT TTGCATGCAAGTCAGTTTCAAATTATGTCTAAATCAGCAATGCCCTCAAT TGAAGTTGATAAATGCTTTGCTATGACCACTGGTGTTTGATCAataattt aaatcaaaacttttctttcttgAACAGTTTCAATACAAAGGTCCAATGAA GTGCTCACCAGAAATGAAAGTTTTTGTTGGTGGAATTGGTATTGGTACAA CAGAGGATGatgtaaagaaatattttgaacaatttggAAAGgtaatttga acttttttctcttcttcaaatactccttcaaaattaaaaaaacaaggaat gttttgaaaataagacatttaaaaatcttaatttcTTATCCTTCAGGTCC TTGCTGTCGATATGCCTGTTCATCATGTGTATAAATGTCCCAAAGGTATG TTTATTATTCAGAATTTCGGACTTTATGCCCCTCAAATATCCAAGTTTAC GAAAATCACCATATTTTTTGATCCACACAAAAACAATTAACAATGCAAAA AAGTTTAACCCAcgcaaataaatttttgaacttcgcaaaaaaaaatttga ccgtccataaaaaaattctacccACATGTCCATTCAACCCAAGCACCCAC TCAACCCACACCCGTCAAATCCATACCAGGGTAGAATAACTGATTTTAGA GAGGGCTAACTAACTGTGATTTAAAACTTAATCATTTTCCTTTCCAACAA 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Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000194_pilon:224354..231835+

>XLOC_035868 ID=XLOC_035868|Name=XLOC_035868|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=2796bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000194_pilon:224354..231835+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ATGGCTGCTCCTATACAACAAATTTCAAATGGCGCTATACCAATTATGTC
TGGTGTTGCAGGAACTCCAGTTCAACAGCCAGCTGTTGTttaccaacaac
aacaaccaatgATTGTCGCAGGTGCTGCTCCGATGGGTTACGCACCACGA
AAGCCCTACATCAGGAATCCGAATGAGGAACATTGATGGCTGCTCCTATA
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TCATGTGTATAAATGTCCCAAAGGTCCTTGCTGTCGATATGCCTGTTCAT
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GAGTCGAAGTAAAAGGCTCAGATGAGCAGCAAGCACATTTGAACAAAAAG
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ACAGCTATCCGGTATGCTTCTGCTGGAAGAGGTAGAGGAATTGGATCAGG
AAATATTGGAACAGTGACAGGATACGGTGCATATGCAAACCTTGGTCAAC
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GCAGCAACTGGTGGATATGTGTATGATCCCGCATCTAATACGTATTATCA
ACTCCCTGGAACTGTCGTCGCTGttCCTGCTGCAGCAACTGGTGGATATG
TGTATGATCCCGCATCTAATACGTATTATCAACTCCCTGGAACTGTCGTC
GCTGGTGGTGCAGTTGCAGGTGCAGTGCAAACGGTAGGAACCTCAGTCGC
AGCTGCCTCCCCATACGCTGGTGCAACCATCGCAGCAGGTCAACAAGTCT
TAACTTCTCCACAAGTTGGTCAGCGAACGTTACAAGCAACTGATATGATC
CAAGGACTAGCAGCAGGCTCAACAGTTGGTGGTGCAGTTGCAGGTGCAGT
GCAAACGGTAGGAACCTCAGTCGCAGCTGCCTCCCCATACGCTGGTGCAA
CCATCGCAGCAGGTCAACAAGTCTTAACTTCTCCACAAGTTGGTCAGCGA
ACGTTACAAGCAACTGATATGATCCAAGGACTAGCAGCAGGCTCAACAGT
TGCCTTGGGCGCAGCGTATCCAAGCGAAACATCAACCTTTGGGCCAACTC
GACATAACGTGATCGGAGCCAGTGCGCAACAACCGATGGCAGGAAACACA
GTCGCCGATCCTCACGTCGTCTATTCTACAGCAACATCTATTTCTGCTGG
CGATGCTGCTTTGTCAGCGGCTCGTGGTTACCACCCTTATGGAAGATAAC
CTTGGGCGCAGCGTATCCAAGCGAAACATCAACCTTTGGGCCAACTCGAC
ATAACGTGATCGGAGCCAGTGCGCAACAACCGATGGCAGGAAACACAGTC
GCCGATCCTCACGTCGTCTATTCTACAGCAACATCTATTTCTGCTGGCGA
TGCTGCTTTGTCAGCGGCTCGTGGTTACCACCCTTATGGAAGATAA
Gene-mRNA-Prot
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
XLOC_035868XLOC_035868-proteinClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonpolypeptide
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
sc0000194_pilongenomesc0000194_pilon:224354..231835 +
Properties
Property NameValue
Aaloc1204-1398:7288
Aaloc1030-1200:6972
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Aaloc1-183:1