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Sequence
The following sequences are available for this feature:
mRNA from alignment at sc0000194_pilon:224354..231835+ Legend: CDSpolypeptide Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >XLOC_035868 ID=XLOC_035868|Name=XLOC_035868|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=7482bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000194_pilon:224354..231835+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon) ATGGCTGCTCCTATACAACAAATTTCAAATGGCGCTATACCAATTATGTC
TGGTGTTGCAGGAACTCCAGTTCAACAGCCAGCTGTTGTttaccaacaac
aacaaccaatgATTGTCGCAGGTGCTGCTCCGATGGGTTACGCACCACGA
AAGCCCTACATCAGGAATCCGAATGAGGAACATTGGTAAGGgagcttttg
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cgacaatcgaatttcaatcggtcgattgcgttcgatttggttcgactggt
tcgatcgtcgattccatttgattgagatcgtctggagaTGAAACCCTGCA
AAAACCATGTTCAATCTTATCGTTTCGTTGGTATTGGAAACCAAGGAAAT
tcgcaaaaaatttatttctccCTTTTTTAGCAAAATCTTTGTCGGAGGTG
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tcataaaacctaacaataaattttggtatacctcttgggaataccttggt
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cttatctatatcataaccaAGATAACTGAGGCAAAATCATtgtcagcttg
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ttttagagagtatgggattcaaattatgataatCTCATGgtacaggctct
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tcggtcatcggtcaatgtccgactgaaaaagccatttgaccgactgaaaa
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aaaaacgttttaaattaaaaaagcaaTGGTGAAATGCTGAGTCAGCAGAA
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CCCTATCTACTTGATTTTTACTGAATGACACAAGATGAGTCTTagacttt
tgtttatttattttttgtctcattacagtttttgaatatttttcattttc
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GCACAACTTAACGTAAGAATTAAAAATCTTGGTATCAATATTGTTACATT
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TTGCTGTCGATATGCCTGTTCATCATGTGTATAAATGTCCCAAAGGTATG
TTTATTATTCAGAATTTCGGACTTTATGCCCCTCAAATATCCAAGTTTAC
GAAAATCACCATATTTTTTGATCCACACAAAAACAATTAACAATGCAAAA
AAGTTTAACCCAcgcaaataaatttttgaacttcgcaaaaaaaaatttga
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GAGGGCTAACTAACTGTGATTTAAAACTTAATCATTTTCCTTTCCAACAA
TTTGTTGACTaggctataaaaaaaaaaaaattctatcaaTTCATTTTCTG
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ATTACTATTTTCAGCTTTCTATCTGCTTGAgccaattttattttatattg
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TTAATGAAAAATAGCCACAGCACAACTTAGCCTGTTTTTTAAGTAACCAA
AATATTATATTTGAGATCAGAATATTAACATTTTGAATAACATTTGACAT
TACTAGAATTTTTGAccttcaaaatctaaaaatataTacatCattttatg
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ATTaatcaatgtttttgaatgTATGAATTTACTATGTCTTCTTTTtagca
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TGAGACATTTGATGTAGTTGCAGCTGTAACAAAAGATCGATATCATCAGA
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AATATTGTTTGAATGTTattttgcaatcatttgttcagtatttttgtttt
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TAGTGTTTTTGGGGCAGAATAAGCcatatttaaacaaaaatttgtctcaa
ccgcaaaattaaattctgtgaaacttctgaattttgagctgtgaactgcg
aaattaaattccacaaaaatttttttccgcagagatttcttcccttaagg
taacaacaaacaaggaattgaaatgaatttatcttaaatattttgctttt
ttttcagCTATCCGGTATGCTTCTGCTGGAAGAGGTAGAGGAATTGGATC
AGGAAATATTGGAACAGTGACAGGATACGGTGCATATGCAAACCTTGGTC
AACCATTAATCGTAAACCCTGCTCAACATAGTGTACAATATACAGGTAAG
AAGTTAGTTAGCAAAACATATTTGCTATAAGCCTTAAATATCAACACTGA
TCACACCTTGGTAAAAGGATTAATGAATTATAGACAAAAGTATGTTAATT
AGGGTTTAAACTGgtgtaaataatgttttttttttttttcaacctgataa
aaaaagaaataaaataattgaTTCGACAAATCCTTTTGAACCTTCAGTTG
CTTTTTCAttactattttgtttttttctcagttCCTGCTGCAGCAACTGG
TGGATATGTGTATGATCCCGCATCTAATACGTATTATCAACTCCCTGGAA
CTGTCGTCGCTGGTAAGACTATCACTCAAATTTACCAGATGAATGCacgt
caaaatatttcaaaaccttattttataaaaaattactcAATAGTAGGTTT
TAAAATAGATCACTCTTTGGTATCTGGTCAAAAATATAAGCTCGataaaa
tcgcgaaatttaatccccgttaaagtttatcccattaaagtagtaacAAA
ATATTTCTGTAATTAACAGGTGGTGCAGTTGCAGGTGCAGTGCAAACGGT
AGGAACCTCAGTCGCAGCTGCCTCCCCATACGCTGGTGCAACCATCGCAG
CAGGTCAACAAGTCTTAACTTCTCCACAAGTTGGTCAGCGAACGTTACAA
GCAACTGATATGATCCAAGGACTAGCAGCAGGCTCAACAGTTGGTAAGTG
AGTAATCTACGTAAGTCATCTCTTGAGAAtaacttttaaaagtttgagTG
TCCAAAAGTTCTAAGTAAACATCATAGATCAATAACAGTACTTTGTATGT
ATATGATATTATCAATCATATTATCATATTTTTAGCCTTGGGCGCAGCGT
ATCCAAGCGAAACATCAACCTTTGGGCCAACTCGACATAACGTGATCGGA
GCCAGTGCGCAACAACCGATGGCAGGAAACACAGTCGCCGATCCTCACGT
CGTCTATTCTACAGCAACATCTATTTCTGCTGGCGATGCTGCTTTGTCAG
CGGCTCGTGGTTACCACCCTTATGGAAGATAA Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000194_pilon:224354..231835+ >XLOC_035868 ID=XLOC_035868|Name=XLOC_035868|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=2796bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000194_pilon:224354..231835+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon) ATGGCTGCTCCTATACAACAAATTTCAAATGGCGCTATACCAATTATGTC TGGTGTTGCAGGAACTCCAGTTCAACAGCCAGCTGTTGTttaccaacaac aacaaccaatgATTGTCGCAGGTGCTGCTCCGATGGGTTACGCACCACGA AAGCCCTACATCAGGAATCCGAATGAGGAACATTGATGGCTGCTCCTATA CAACAAATTTCAAATGGCGCTATACCAATTATGTCTGGTGTTGCAGGAAC TCCAGTTCAACAGCCAGCTGTTGTttaccaacaacaacaaccaatgATTG TCGCAGGTGCTGCTCCGATGGGTTACGCACCACGAAAGCCCTACATCAGG AATCCGAATGAGGAACATTGCAAAATCTTTGTCGGAGGTGTTGGTAAATT GACAAATGATGAATCTCTTAGAGCCTACTTTGGAAAATTCGGAGAAATTG CAGATAGTGTTATAATGAAAGATAAACATACAAATGAGCCAAGCAAAATC TTTGTCGGAGGTGTTGGTAAATTGACAAATGATGAATCTCTTAGAGCCTA CTTTGGAAAATTCGGAGAAATTGCAGATAGTGTTATAATGAAAGATAAAC ATACAAATGAGCCAAGAGGGTTTGCATTCGTCACATTCAAAACACCAGAA GCTGTTTCAGCTGTCATTGAACAAAATAATAAAGGTGGACATACTCTTGA TGGAAAAATGAGGGTTTGCATTCGTCACATTCAAAACACCAGAAGCTGTT TCAGCTGTCATTGAACAAAATAATAAAGGTGGACATACTCTTGATGGAAA AATGTTTATTGAAGTACGAAAGTTCCAGAGAAAATCTGAGTTTATTGAAG TACGAAAGTTCCAGAGAAAATCTGAGtatgACCCAGATAAGGCCAACACA ACTCTTACTACTGCCAATGGTGCTGCACAACTTAACtatgACCCAGATAA GGCCAACACAACTCTTACTACTGCCAATGGTGCTGCACAACTTAACTTTC AATACAAAGGTCCAATGAAGTGCTCACCAGAAATGAAAGTTTTTGTTGGT GGAATTGGTATTGGTACAACAGAGGATGatgtaaagaaatattttgaaca atttggAAAGTTTCAATACAAAGGTCCAATGAAGTGCTCACCAGAAATGA AAGTTTTTGTTGGTGGAATTGGTATTGGTACAACAGAGGATGatgtaaag aaatattttgaacaatttggAAAGGTCCTTGCTGTCGATATGCCTGTTCA TCATGTGTATAAATGTCCCAAAGGTCCTTGCTGTCGATATGCCTGTTCAT CATGTGTATAAATGTCCCAAAGGCTTTGCATTTGTTGGATTTGAGACATT TGATGTAGTTGCAGCTGTAACAAAAGATCGATATCATCAGATAAATGGAA AAACGGCTTTGCATTTGTTGGATTTGAGACATTTGATGTAGTTGCAGCTG TAACAAAAGATCGATATCATCAGATAAATGGAAAAACGGTCGAAGTAAAA GGCTCAGATGAGCAGCAAGCACATTTGAACAAAAAGAAGGCTGAAGGTAT GAGTCGAAGTAAAAGGCTCAGATGAGCAGCAAGCACATTTGAACAAAAAG AAGGCTGAAGGTATGACTATCCGGTATGCTTCTGCTGGAAGAGGTAGAGG AATTGGATCAGGAAATATTGGAACAGTGACAGGATACGGTGCATATGCAA ACCTTGGTCAACCATTAATCGTAAACCCTGCTCAACATAGTGTACAATAT ACAGCTATCCGGTATGCTTCTGCTGGAAGAGGTAGAGGAATTGGATCAGG AAATATTGGAACAGTGACAGGATACGGTGCATATGCAAACCTTGGTCAAC CATTAATCGTAAACCCTGCTCAACATAGTGTACAATATACAGttCCTGCT GCAGCAACTGGTGGATATGTGTATGATCCCGCATCTAATACGTATTATCA ACTCCCTGGAACTGTCGTCGCTGttCCTGCTGCAGCAACTGGTGGATATG TGTATGATCCCGCATCTAATACGTATTATCAACTCCCTGGAACTGTCGTC GCTGGTGGTGCAGTTGCAGGTGCAGTGCAAACGGTAGGAACCTCAGTCGC AGCTGCCTCCCCATACGCTGGTGCAACCATCGCAGCAGGTCAACAAGTCT TAACTTCTCCACAAGTTGGTCAGCGAACGTTACAAGCAACTGATATGATC CAAGGACTAGCAGCAGGCTCAACAGTTGGTGGTGCAGTTGCAGGTGCAGT GCAAACGGTAGGAACCTCAGTCGCAGCTGCCTCCCCATACGCTGGTGCAA CCATCGCAGCAGGTCAACAAGTCTTAACTTCTCCACAAGTTGGTCAGCGA ACGTTACAAGCAACTGATATGATCCAAGGACTAGCAGCAGGCTCAACAGT TGCCTTGGGCGCAGCGTATCCAAGCGAAACATCAACCTTTGGGCCAACTC GACATAACGTGATCGGAGCCAGTGCGCAACAACCGATGGCAGGAAACACA GTCGCCGATCCTCACGTCGTCTATTCTACAGCAACATCTATTTCTGCTGG CGATGCTGCTTTGTCAGCGGCTCGTGGTTACCACCCTTATGGAAGATAAC CTTGGGCGCAGCGTATCCAAGCGAAACATCAACCTTTGGGCCAACTCGAC ATAACGTGATCGGAGCCAGTGCGCAACAACCGATGGCAGGAAACACAGTC GCCGATCCTCACGTCGTCTATTCTACAGCAACATCTATTTCTGCTGGCGA TGCTGCTTTGTCAGCGGCTCGTGGTTACCACCCTTATGGAAGATAA
Gene-mRNA-Prot
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Position
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
| sc0000194_pilon | genome | sc0000194_pilon:224354..231835 + |
Properties
| Property Name | Value |
| Aaloc | 1204-1398:7288 |
| Aaloc | 1030-1200:6972 |
| Aaloc | 949-1026:6684 |
| Aaloc | 811-945:6310 |
| Aaloc | 745-807:5818 |
| Aaloc | 664-744:5384 |
| Aaloc | 613-660:4397 |
| Aaloc | 499-612:4178 |
| Aaloc | 439-498:3953 |
| Aaloc | 403-438:3671 |
| Aaloc | 310-402:2699 |
| Aaloc | 187-306:1032 |
| Aaloc | 1-183:1 |
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