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Sequence
The following sequences are available for this feature:
mRNA from alignment at sc0000194_pilon:302431..306753+ Legend: polypeptideCDS Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >XLOC_035867 ID=XLOC_035867|Name=XLOC_035867|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=4323bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000194_pilon:302431..306753+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
atgGCTGGTTCAATCGACACTGATTGCATGACCTTAAACAGGTTCATTTT
ACAAGAACAGAGAAAATCACCAAATGCTACTGGGGACTTGACTCATCTCC
TTAACTCAATTTTGACTGCTGTTAAAGCTATATCAACTGCTGTCAGAAGA
GCTGGGATGACTAAAATGTAAGTCCTTCATTTCAAAGCataaaatactaa
gattttatACTTACCGAGAATTACCCATTATAAATTCTGATAAATTATTC
ATTGCATTTTCTACATTGTATATCATTGTTTGTTTCTCACAAGTCAATAC
TTTTAACACTGTTTTACTCTTATCAGTATGTTGTTTGGTGTTATTAAGGG
AGGAGGGTAGAGAGTTAGCttaaaagggaagaaattttcacggaaagaaa
ttttcgcagaatttaatttcgcggttcacagctcaaaattcggaagtttc
aaggaatttaatttcgccGCTGAGAGGATTTCTTGTTTAAAATATGGCCT
ATTTCGCCCTAAAAGGACCAATTTTAtatgtgattttttaaatcatgaga
aTATTCGTTTTTCTCGGAATTTAATTTTACAGGTTTGTccaaaaattgcg
aaattaaattccgcaaaaatttgttctgtgaaaattttttcccgcaaaaa
tcttttcccttaaggtattaaaaAACTTCCAAACTTTAACTATTTTTGAA
CTATTTAAACCTAGAATTCTGTATCGTAAGGTTACCCTATTTTTGAAGGT
TTGGAGTTGCTGGACATGACAATGCGACTGGGGACAAGGTGCAGAAATTG
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TGTCTGTGGCATGGTTtcagaagaaaatgaaaacatgatTGAAGTAGAAA
CAGAACGTCAAGGAAAATACATTGTTTATTTTGATCCATTGGACGGATCT
TCAAATATTGACTGTCTTGTTTCTATTGGTTCAATTTTTGGTATCGCCAA
AAAGGTTTGTTAAAATTCGAATATGTGTCTCATAGAAGGTTTCTGGCCCT
GTAAAGTCAGTTTTTCCCCAATGATTGTTTTAAATAGAGGTAATGATAAT
ATTAAAGTTTTTACTGtgttttttttatcacttttcaCAGgggaaaaatc
acaaaaaatactctaaaattaatctaattaaagtaatctaaatctaCTTT
TCAATCCCATTTCAGAGATGTATAGTTTTGAAAAGGTAATAAAAGTTACC
ATACATTATTAAGTTTGCCATGCTTCAAATTGTCaattttataattatat
tgatttttattgttttgttattcttatttcttatttatttataattgTAG
GACGATGATGGACCATTAACTAAAGAATCTTGTCTTGTACCAGGAAGTCA
ATTCGTAGCATCTGGGTATGCTTTGTATGGTAGTGCAACCATGGTCGTGC
TGACTACTGGAAATGGTGTTAACGGCTTCACTCTCGATCCTGTAAGTTTC
CACTTCATTTGTATGAGATTACATACTGCATTccttgaaaatattctttg
aaaatctttgcaCCGCAAAGGAGACAAAGATCAAGTCGATTGATTCTTAA
GAGTTTAAATAGCATTGATATGGGGCATTTGaattgatcttcattttttg
atttgtttgaaaaaagttatcaaCCAGTACCGACCTGCCCTTACAGCAGT
ACGAAATTAGGCTTTAATTTATACCAGATTTCAATCTGTTGCAATGATCT
TATTTCAATACAATGGCATTTAACCTAGTCATGTCATATAAGCTTCTTCA
TGTTTGAATACACCTATCAATCTTAAAACCACAATGTAGAGATAAGATTC
AAATAATCTTAAAAACGTTTCAACACGATACCCTATTAAGCTTCATGTCT
GAATATGCATCTATCAACCTTAAAACCACAATGAGATGAGATTCGATTTT
ACCGCATCTATAATGACGTAAAATGCATGTATTTGTTAGCATGGTAATGA
AATGACATCAAATGATTCTACTAAATATGCCAGGCTTAAAAAATCAGTGC
TAACTACAGGCCCGCCGGAATAACCGTAAAAGTgtggaggctgaaggctc
aatatgagataaaattcgctaggaatttgagaaaaaaacttcgTTTActt
aaaagtggggaggctggagtctccccagtctcctcGCTTCCGCCAGGCTT
GAACTATATTATACATTTGATTGGAAAACATTTTCCTACGGAGTTTGTTA
TTAATTTCGTTATacccagggggggggttcaaGCAGTTAATCCAAAACAC
TATGCCTGTTTTGACCGTGGtggtccattttcaaattttgaaaaatagag
ttAATCCAAGAGTGGATTAACTGCCAAAGGGGTGGTCTCTGAAAGAATTC
TGGGaaaaaaaCGTGGACTAACTGCATTTTCTGTCATTCTGGAAAATTCA
TTTATTCTGATTCATGCTCGTTTTTGCCTCTTCTTCTGTcttttaaaacg
tcaaattgcATCAAAGTCTTGCTTTAACTTTCTTTAAAGTTAAAATTACT
TAGAAAGTCGACCAACATCAATTAAAATAACTTAATGCATGCCAAAATGC
CGCGGTGGACTGTTTTAGGGGGTGGTATACAAAGATTGTGACTGAAAAAC
AGTAAATCCAGTGTGGATTAAGTGTCAGAATGGGTGGGTGGTCCTAAATA
TCATCCAAAATCAGTTACTACGGATGATGTTCTGGgttaactgcttgacc
ccccctgtTATACCATGTGATCAATTTTCAATGTTCTCCTTTAAGGCTAT
TGGTGAATTTTTGCTAACAGACCCTGACATGAAGATTAAGCCACGTGGAA
AAATTTACAGTTTGAACGAAGGTTATGCAGCACAATTTGATGAGCCGCTC
AAGAAATACctggaatctttaaaaaacccATCTGTAAGTTCTTTGATCGc
tcccaaaaattaattttgcaaTTTCATAGTCTCCAGTAAAGGTTAATTGT
TGTTTTTCTGGATAAGCTAATAATTTCAGTATCCATGCTTGATTTGATTA
TACGAGCCACATTTCTAAAAGGAAGACTTCGATTATTTCATTGAGAAGTG
ATGATTTGCAATATCATCCGCAACCAAACTAGTATTCACCAGGGAGCCAA
AGTCATTaattaaatgaaaatattatatcCACATCTTAGGTTATTTCACA
AGCTTTTCCATTCTCTTTATTCTAAAAAGGGTGACAAGAAAGCATATGGA
GCACGTTACATTGGATCTATGGTGGCTGATATGCATCGTACCATCAAGTA
TGGTGGTATCTTTATGTACCCTGCAAATAAGTCTGCACCTAAAGGAAAAG
TAAGTAGACATTGTATGAATTTGTACAAATCCATCCTTATGGATTATAAG
TCACATAACCCTCTCAGCGTTTGCTTAGATTTTGGGACAAatagttttca
atattttgtcaaCACTTCAGATGTATACAATTTTCAACTGCATACAATTT
TCAACTGCGTTCATGCTTTTTTATTCCAAGATACCTCAGCTTCTAAAGTG
TGAACAACAgacccggggggaggggggttacTACCCTTGTCGATCGACgg
gatgctccgctgaggttcgaaaaatgggcCCTACGTGAGActcgtttttc
aaaaattttgccgaaatttgcgaaaaaagtaaccctgaatgggactgaaa
ttccaaaattttcttctaCTTTTACCTTCGCCTTCCCCAAGACTCTCTAC
GAAGGGTTACAAAAACAACGAAAAGTCGAAATAGTTTCTCTGAAGATCAG
GATTTCTCCTTTTTATGGgtcttaaaaaatgaaaatccaaAACTACTGTA
TCCCTCAAATGTTAGaggatttttcgaaaatttgctTAACGGTCAttttt
ttGGCTGCTTTTGTCTCTGTAAAGATGAcgaatttttcgcaaaaattttg
tgtttttaagGGTCGTTTTCAAAGGTCACATTCTCCAACTTCTCCAACCC
TAGACCACAAGTATGAGACTACAGTATGAGCTGGTTTGAGTAAGACTACA
CGCATTATAACCATGAAATTTTGTTAATCGAAGTTCCTCCAGTCCTAACG
AAGCTTTCAGTATTAGCTTTAAGCTGGatgtgttttattttttcagttaC
GTTTATTATACGAATGCAACCCAATGGCGCACATTGTTGAACAAGCAGGT
GGCATGGCAACCGATGGTAAACAAAGAATTTTGGATCTCAAACCGTCTGC
TCTTCACGAGCGATCTCCTATCTTTATTGGATCGAAAGAAGATGTCGAAG
ATTTCTTGAAATTCCAAAGCTAA Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000194_pilon:302431..306753+ >XLOC_035867 ID=XLOC_035867|Name=XLOC_035867|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=1998bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000194_pilon:302431..306753+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
atgGCTGGTTCAATCGACACTGATTGCATGACCTTAAACAGGTTCATTTT
ACAAGAACAGAGAAAATCACCAAATGCTACTGGGGACTTGACTCATCTCC
TTAACTCAATTTTGACTGCTGTTAAAGCTATATCAACTGCTGTCAGAAGA
GCTGGGATGACTAAAATatgGCTGGTTCAATCGACACTGATTGCATGACC
TTAAACAGGTTCATTTTACAAGAACAGAGAAAATCACCAAATGCTACTGG
GGACTTGACTCATCTCCTTAACTCAATTTTGACTGCTGTTAAAGCTATAT
CAACTGCTGTCAGAAGAGCTGGGATGACTAAAATGTTTGGAGTTGCTGGA
CATGACAATGCGACTGGGGACAAGGTGCAGAAATTGGACGTATTATCAAA
CGAACTGTTTATCAATATGTTGCAATCATCTTATACTGTCTGTGGCATGG
TTtcagaagaaaatgaaaacatgatTGAAGTAGAAACAGAACGTCAAGGA
AAATACATTGTTTATTTTGATCCATTGGACGGATCTTCAAATATTGACTG
TCTTGTTTCTATTGGTTCAATTTTTGGTATCGCCAAAAAGGTTTGGAGTT
GCTGGACATGACAATGCGACTGGGGACAAGGTGCAGAAATTGGACGTATT
ATCAAACGAACTGTTTATCAATATGTTGCAATCATCTTATACTGTCTGTG
GCATGGTTtcagaagaaaatgaaaacatgatTGAAGTAGAAACAGAACGT
CAAGGAAAATACATTGTTTATTTTGATCCATTGGACGGATCTTCAAATAT
TGACTGTCTTGTTTCTATTGGTTCAATTTTTGGTATCGCCAAAAAGGACG
ATGATGGACCATTAACTAAAGAATCTTGTCTTGTACCAGGAAGTCAATTC
GTAGCATCTGGGTATGCTTTGTATGGTAGTGCAACCATGGTCGTGCTGAC
TACTGGAAATGGTGTTAACGGCTTCACTCTCGATCCTGACGATGATGGAC
CATTAACTAAAGAATCTTGTCTTGTACCAGGAAGTCAATTCGTAGCATCT
GGGTATGCTTTGTATGGTAGTGCAACCATGGTCGTGCTGACTACTGGAAA
TGGTGTTAACGGCTTCACTCTCGATCCTGCTATTGGTGAATTTTTGCTAA
CAGACCCTGACATGAAGATTAAGCCACGTGGAAAAATTTACAGTTTGAAC
GAAGGTTATGCAGCACAATTTGATGAGCCGCTCAAGAAATACctggaatc
tttaaaaaacccATCTGCTATTGGTGAATTTTTGCTAACAGACCCTGACA
TGAAGATTAAGCCACGTGGAAAAATTTACAGTTTGAACGAAGGTTATGCA
GCACAATTTGATGAGCCGCTCAAGAAATACctggaatctttaaaaaaccc
ATCTGGTGACAAGAAAGCATATGGAGCACGTTACATTGGATCTATGGTGG
CTGATATGCATCGTACCATCAAGTATGGTGGTATCTTTATGTACCCTGCA
AATAAGTCTGCACCTAAAGGAAAAGGTGACAAGAAAGCATATGGAGCACG
TTACATTGGATCTATGGTGGCTGATATGCATCGTACCATCAAGTATGGTG
GTATCTTTATGTACCCTGCAAATAAGTCTGCACCTAAAGGAAAAttaCGT
TTATTATACGAATGCAACCCAATGGCGCACATTGTTGAACAAGCAGGTGG
CATGGCAACCGATGGTAAACAAAGAATTTTGGATCTCAAACCGTCTGCTC
TTCACGAGCGATCTCCTATCTTTATTGGATCGAAAGAAGATGTCGAAGAT
TTCTTGAAATTCCAAAGCTAAttaCGTTTATTATACGAATGCAACCCAAT
GGCGCACATTGTTGAACAAGCAGGTGGCATGGCAACCGATGGTAAACAAA
GAATTTTGGATCTCAAACCGTCTGCTCTTCACGAGCGATCTCCTATCTTT
ATTGGATCGAAAGAAGATGTCGAAGATTTCTTGAAATTCCAAAGCTAA
Gene-mRNA-Prot
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Position
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
|---|
| sc0000194_pilon | genome | sc0000194_pilon:302431..306753 + |
Properties
| Property Name | Value |
|---|
| Aaloc | 823-999:4147 |
| Aaloc | 703-822:3230 |
| Aaloc | 565-702:2796 |
| Aaloc | 424-564:1351 |
| Aaloc | 169-423:750 |
| Aaloc | 1-165:1 |
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