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Sequence
The following sequences are available for this feature:
mRNA from alignment at sc0000194_pilon:542251..548507+ Legend: polypeptideCDS Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >XLOC_035863 ID=XLOC_035863|Name=XLOC_035863|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=6257bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000194_pilon:542251..548507+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
tatttacttAACTTGGAAAATACTAAacaggtacacgtttttttataaga
acaaactatataataacATAAGAGGCTTCGGTgaccgaaatgttaagaac
aagttaagaacattttaagactttgccgACTCTAACAACAGCcagtttct
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aagaaaattttcaggattctaactcaaaaagttaagaacatccgaaggct
tcaaaaattttgggttctcttatataaaaaaaacgtgtacttaaaCTCAT
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CGCCTAATTTCGAAATTCTATTTGGTTTGTTTGGTCTTCTGATTACTATT
TCTATGAATTAGACCTTAATTAGTgttaattacaaaaaaagctgTTAATA
GCTAACTGTTAATAGCTATGAAACTAGGGGTAGCTAGGGTTGCGAGTTGA
TgggggggTTGCCGCCCTACTTTCGATCcgcggacccttaccgggactaa
acaggagaaaacaaaggaaaattttgtgaattttacgaccccaccctcga
ctccatggcttatctaacccccttacgctattgatgattctgatggacgc
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ttattggtacaaatttgaccaattttgaccaaatttcgtaaaaagttgaa
aattttcctatttctccgacccttagtgggactgaaattagattttctga
tttttccgacccttagcgtgactttggaaatccaaaaaggtacccttaag
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TtggattGAAGCAAGGGCAAACATTGGAAGCTGACAAAATTATGACttgt
accgggtgtcccagaaaaaaaatCCCCTCTTTCTCTTTTCTCCAGTTCTG
CCTCTTAAAGAATcagtatttttttttgcattggcaagaggaaggataaa
cttaaactttgaggggtcatttgttaaatttggtcaactagatcaaaagt
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tattcggGGGCTATTATTCCTGTACACCTTAAATTAAAAACTCACTCACC
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GGAACTTTAAGAATATCAGCACATCCATTGGCCGTCAGAAATGTTTCATT
GACTGTGTTATCACTTTctgaagatgaaaaaggtgaATAGATTTTAATGC
AcccccccGctcccctgtgtcacagatccacttggaccccagccccactg
gaaaatctggcaaaaatgTCGTCCACGGTAgtaaaataccctggaatttt
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tttaaacaTTGCAATCCAAAGCCATGTCCGCTGGATATTTTTACCTTTGA
ACaataatttttatccccactgaggaaataAATACACCTCTGTATACATA
GCCCGGTCAGATTCGCCCCGGTCGTTAACCCGGTGTAAATATCGAATGAA
GAACAATGGAAATCACAACCCGGGCAAAAAAGGAGAACTTTATCAAAACC
TCCGACGAGATCTGATTTCTCTAAAGTGCTAAATAGCGCAAACCCAGACT
TTTGACTTTGCCTGGTATTaaaaaaaTGCCGATTTTCTTGACCCAGTGAC
TGAAATCTGGATATTTTCCATTTCAAAGTCACCCCGGTGAACTTTTAAGA
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gtaccgtgaaaagcacaagtcaaaatcatatattgacgctgtgccgatga
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gaccatccaagatcttggatgaagttcaaagttgatatttttattcccgt
cgttgaaaacacaactaaaaattatcatcaatgttttttaaaaagagtca
gtgatagagaatcataacataaaagtctgtctattatttcgattcaatta
aaagtgacatttccaaaattaatagtttagtaattactgttatacatttg
gggatcatgtagaagatttcgttcgaaagaaactcacttcgatcaacgga
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acgtggtacattttaaataagaaaatgcacttttttagccctttctatcc
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acagtcttctttcaccagtatgcaacccattcgtgacccatcgatagttt
cttagttatagaccatacgttaattttcacttatctgaagattgccattg
acaaaagattaaaaatttacattaaaactggtctagcgtttgttgatgct
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cttataaaaacaatgaaaaaactaaacgaggagtgcgcagagtcatttac
agatttttcttgtaacaatgagaagacaatggatctctcttgggagcaac
gagagaagttaatccacctattctaatccgttgcttCGATTAcgcttgga
ggtttctggggaattcgtaaatagtaaactgcatactgatacagtttGCT
CGACATTAATAAgctaatatttgctcttcatctttgattctctctacagt
gattagattgacacatgcgcgataaaatttctattattggtcttcagagg
ttaatatattctttgaaaaattaacctctgatactcaggggtGTTCTAAT
ACAGAGAATATAACTGTTTAAAAATCCCTGTTTCAAGAGCACAATAATAA
GCTCTAATTAGGGAGATTTGGGGTATCTAGGATCCTGGTGAaaatacccc
tgtatcacagtCCTCGGGGTGGGGCCAACTCGAGAAACCGGTTAAAAACA
TGGCACTGAAGTCTCCAAGCCTACATTATCATCCCTTACTAGATATTACA
CTGAAATATGGATTACTATTACTTACTACCTATTATCATAGTTTAAGCTA
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CTCCAGTCTTCCAGAGTCTcgccttaatttttttctcgccAGAGAGACTC
GTATTCTAGCAGGAGGTTATAAACTGTGGATTGTAACATTTGCTGTTATC
ATTCCCTCTTGGTATTAGTACTTCACGTATATCGGCGTTTTGGTATAgtg
gttcgattcccactcacaacggttcacttggcaagtgaacaaaccttcgc
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tgacgggatgcttactcaaactatctatagttgcgagaatgggctcccag
agcctcctgtaactcaaccataatagataTATCTTCGGTCGTTTTCAGTA
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TGCAGTGTCCAAGATTCAATTGGAAATTGGAAgtttgttgaatttataac
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aatttcAACTTGTTCCAATGACATTTTCATCGACGCTGGTGCTTTAGTGA
AATGCAATTTCATTGAAACCAACATCTTCAACACTGCTGGTCATGTCTTT
ATCAATGGCACCTTAACAACTGGTTACTTTGGAGAAGAGTTGAatgtaaa
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ttaaaaacaaaagttttaaatcttgatattcatgatggtGGCTTAACAAA
TTTCGGATCCCTAATAGCTACAGATTGTATCAAATTAAATGCAAATGGAT
TGTCGCTTTGCTCAGACTCTAAACGTGATACTGCACATCGCGGATTAGAT
GGTTTTATTGGTATCAAGAAAGATCAAGGGTTCATTGATAATGCGATTAA
ACCGAAGAAAAAGGGAACCTCGTCGTTCAATGATGATCGAATGATTCAAG
CTGTTCATAACTCTAATTGCCAGAATTTTCTCTCCATTGTCCAAGAAGGT
GTAGATCCTAACATCTTGGTCGACGGGAGACGAGTCTCTGACGAGgtcaa
aattcaacaaaaaaatgttggtttCTCAGAtcaagaaaatttggaaatca
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CCAATTATTGAATGCACAGTTACTGGTGATATCGAGGACTGTTCACAGAT
TCAAGGAAGTGATATACGTTTCAATGTTGGTGGTTGTGTCATCATTACTA
TACCTTGGACATGGATTTCTAAAGATATCAGTGGCCAAATCAGGGGagat
ttaattttcaatgataatgCTATTATTGGTTGTTTCAAAGATCTTCAGGT
AGGTGACTAAATTACTTATAATTAAGtttttttGGTGAACATATAAGCGA
GTCAAATACTTTTAGGTTCTCAAATAAACTTTACCTTCGGCTCTGGAAAT
TTCATATCACAATGAATTCTCTATATAACTCGACTATATTTTATCTTTCC
TTAAAACATTCGAGCTGTGATGAATCCATTATTTGCTTTTCATCCCTTAA
GTGCCTGACCCCTTATATAAGTCAAAATGCTTGGTCATGTTGAAGACAAA
AATAAGAATTATACATGCCATGATTAATGGCGGTAGGAAATGATAACTAT
TTTGAGTTTTTATAGATAATAACAGAGTTTTTAGTctaaatcgcagacct
ctatagatataaaCAGAACAGAAGAACAGAAGACACATGATTTTCCTCAA
TTTTATGGAAAATGGATCTATTTATATTTTCAGGTTCTTGGTAATGTTGT
GATCTCCAACACATCCACTTTGTACATCCAAAGAGGGGGTCGTTTATACA
GCGCAAAAACATTAGTGAACAGCAATGAAATCATATGCGAAGGAGATCTT
CAATTAGATGTTGTTAACATGAAGCAAACCGATGAAGGATTGATTATCAA
CAAAGGTGATTTGCTGGTAAATGTACGTGAACAACAAGAGCAAACCGATG
AAGAATTAATTATCAACAAAGGTGATTTGCTGAAAGGTGATTGGTTCGGC
AATATCCTGGTAcacaatcatttttttcttcaacttcAGAAGAAAGTTGT
TGTTGATGCTCACATTATATGCAAAGAATGTACTGTTCAGTTCTTTGGGG
AAGAATCTCAATTGGAGATCAACGGAACATGGATTGCAGACGTTGGTGTT
TTGAATCTTGAAGCCGATGAACATGCTAGTGATGGTGAAATTCCAAATCT
AGTTCTGGTTGGTCAGCTCTTTGCCAAGGGTATTGAAGGAATGACAGCTT
CCATTGAAACAGAACCTGGTGCACTTTGCCTTCTGACAGAAAGTCTAGAT
CCAGCTGTGAATGAAATCAATATCGATGTCAAATGGTTGAAGATAAAATC
TGATTCTGTGATAAGCTGTACTGGAGCTCCAGAGAATTACAAGATGTCAA
ACACTGTGAATGTCAATTGCCAAGAGGAGTTGTCCATTTTTGGTGAACTT
CGAATCGCTGGTATAAATCACTCAAACATCCATACACAATCATTGAAGAA
CTCTGGC Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000194_pilon:542251..548507+ >XLOC_035863 ID=XLOC_035863|Name=XLOC_035863|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=3936bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000194_pilon:542251..548507+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
tatttacttAACTTGGAAAATACTAAacagtatttacttAACTTGGAAAA
TACTAAacagAGAGATAGAATCAAGATCTCAATGGTGGTCCAATCAGATG
ATTTATCAATACGAACAAATCTATTGGAAAGCACATTTACCAGTTTAACA
AAATTCACACTGACTGCACCAAATATCACAACATACAAATCGCAAATTGA
TAAAACACAAGATGGGGTCAATCTAGATTTGGTTTCGACAGGAACTTTAA
GAATATCAGCACATCCATTGGCCGTCAGAAATGTTTCATTGACTGTGTTA
TCACTTTctgaagatgaaaaagAGAGATAGAATCAAGATCTCAATGGTGG
TCCAATCAGATGATTTATCAATACGAACAAATCTATTGGAAAGCACATTT
ACCAGTTTAACAAAATTCACACTGACTGCACCAAATATCACAACATACAA
ATCGCAAATTGATAAAACACAAGATGGGGTCAATCTAGATTTGGTTTCGA
CAGGAACTTTAAGAATATCAGCACATCCATTGGCCGTCAGAAATGTTTCA
TTGACTGTGTTATCACTTTctgaagatgaaaaagaatcaatttcAACTTG
TTCCAATGACATTTTCATCGACGCTGGTGCTTTAGTGAAATGCAATTTCA
TTGAAACCAACATCTTCAACACTGCTGGTCATGTCTTTATCAATGGCACC
TTAACAACTGGTTACTTTGGAGAAGAGTTGAatgtaaaaatcaaatcaag
tgATCTTCACATTGGCATCGATGCAATTGTTGGTCACAACTCAGTTGAAA
ATCAATCTAAAAGATCAATCAATGACCATAAACATTggttaaaaacaaaa
gttttaaatcttgatattcatgatggtGGCTTAACAAATTTCGGATCCCT
AATAGCTACAGATTGTATCAAATTAAATGCAAATGGATTGTCGCTTTGCT
CAGACTCTAAACGTGATACTGCACATCGCGGATTAGATGGTTTTATTGGT
ATCAAGAAAGATCAAGGGTTCATTGATAATGCGATTAAACCGAAGAAAAA
GGGAACCTCGTCGTTCAATGATGATCGAATGATTCAAGCTGTTCATAACT
CTAATTGCCAGAATTTTCTCTCCATTGTCCAAGAAGGTGTAGATCCTAAC
ATCTTGGTCGACGGGAGACGAGTCTCTGACGAGgtcaaaattcaacaaaa
aaatgttggtttCTCAGAtcaagaaaatttggaaatcaTACGTACTGGAC
TACATTTAAATGATTGGAAACATGGTATGATCAAAGCACCAATTATTGAA
TGCACAGTTACTGGTGATATCGAGGACTGTTCACAGATTCAAGGAAGTGA
TATACGTTTCAATGTTGGTGGTTGTGTCATCATTACTATACCTTGGACAT
GGATTTCTAAAGATATCAGTGGCCAAATCAGGGGagatttaattttcaat
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TGTTCCAATGACATTTTCATCGACGCTGGTGCTTTAGTGAAATGCAATTT
CATTGAAACCAACATCTTCAACACTGCTGGTCATGTCTTTATCAATGGCA
CCTTAACAACTGGTTACTTTGGAGAAGAGTTGAatgtaaaaatcaaatca
agtgATCTTCACATTGGCATCGATGCAATTGTTGGTCACAACTCAGTTGA
AAATCAATCTAAAAGATCAATCAATGACCATAAACATTggttaaaaacaa
aagttttaaatcttgatattcatgatggtGGCTTAACAAATTTCGGATCC
CTAATAGCTACAGATTGTATCAAATTAAATGCAAATGGATTGTCGCTTTG
CTCAGACTCTAAACGTGATACTGCACATCGCGGATTAGATGGTTTTATTG
GTATCAAGAAAGATCAAGGGTTCATTGATAATGCGATTAAACCGAAGAAA
AAGGGAACCTCGTCGTTCAATGATGATCGAATGATTCAAGCTGTTCATAA
CTCTAATTGCCAGAATTTTCTCTCCATTGTCCAAGAAGGTGTAGATCCTA
ACATCTTGGTCGACGGGAGACGAGTCTCTGACGAGgtcaaaattcaacaa
aaaaatgttggtttCTCAGAtcaagaaaatttggaaatcaTACGTACTGG
ACTACATTTAAATGATTGGAAACATGGTATGATCAAAGCACCAATTATTG
AATGCACAGTTACTGGTGATATCGAGGACTGTTCACAGATTCAAGGAAGT
GATATACGTTTCAATGTTGGTGGTTGTGTCATCATTACTATACCTTGGAC
ATGGATTTCTAAAGATATCAGTGGCCAAATCAGGGGagatttaattttca
atgataatgCTATTATTGGTTGTTTCAAAGATCTTCAGGTTCTTGGTAAT
GTTGTGATCTCCAACACATCCACTTTGTACATCCAAAGAGGGGGTCGTTT
ATACAGCGCAAAAACATTAGTGAACAGCAATGAAATCATATGCGAAGGAG
ATCTTCAATTAGATGTTGTTAACATGAAGCAAACCGATGAAGGATTGATT
ATCAACAAAGGTGATTTGCTGGTAAATGTACGTGAACAACAAGAGCAAAC
CGATGAAGAATTAATTATCAACAAAGGTGATTTGCTGAAAGGTGATTGGT
TCGGCAATATCCTGGTAcacaatcatttttttcttcaacttcAGAAGAAA
GTTGTTGTTGATGCTCACATTATATGCAAAGAATGTACTGTTCAGTTCTT
TGGGGAAGAATCTCAATTGGAGATCAACGGAACATGGATTGCAGACGTTG
GTGTTTTGAATCTTGAAGCCGATGAACATGCTAGTGATGGTGAAATTCCA
AATCTAGTTCTGGTTGGTCAGCTCTTTGCCAAGGGTATTGAAGGAATGAC
AGCTTCCATTGAAACAGAACCTGGTGCACTTTGCCTTCTGACAGAAAGTC
TAGATCCAGCTGTGAATGAAATCAATATCGATGTCAAATGGTTGAAGATA
AAATCTGATTCTGTGATAAGCTGTACTGGAGCTCCAGAGAATTACAAGAT
GTCAAACACTGTGAATGTCAATTGCCAAGAGGAGTTGTCCATTTTTGGTG
AACTTCGAATCGCTGGTATAAATCACTCAAACATCCATACACAATCATTG
AAGAACTCTGGCGTTCTTGGTAATGTTGTGATCTCCAACACATCCACTTT
GTACATCCAAAGAGGGGGTCGTTTATACAGCGCAAAAACATTAGTGAACA
GCAATGAAATCATATGCGAAGGAGATCTTCAATTAGATGTTGTTAACATG
AAGCAAACCGATGAAGGATTGATTATCAACAAAGGTGATTTGCTGGTAAA
TGTACGTGAACAACAAGAGCAAACCGATGAAGAATTAATTATCAACAAAG
GTGATTTGCTGAAAGGTGATTGGTTCGGCAATATCCTGGTAcacaatcat
ttttttcttcaacttcAGAAGAAAGTTGTTGTTGATGCTCACATTATATG
CAAAGAATGTACTGTTCAGTTCTTTGGGGAAGAATCTCAATTGGAGATCA
ACGGAACATGGATTGCAGACGTTGGTGTTTTGAATCTTGAAGCCGATGAA
CATGCTAGTGATGGTGAAATTCCAAATCTAGTTCTGGTTGGTCAGCTCTT
TGCCAAGGGTATTGAAGGAATGACAGCTTCCATTGAAACAGAACCTGGTG
CACTTTGCCTTCTGACAGAAAGTCTAGATCCAGCTGTGAATGAAATCAAT
ATCGATGTCAAATGGTTGAAGATAAAATCTGATTCTGTGATAAGCTGTAC
TGGAGCTCCAGAGAATTACAAGATGTCAAACACTGTGAATGTCAATTGCC
AAGAGGAGTTGTCCATTTTTGGTGAACTTCGAATCGCTGGTATAAATCAC
TCAAACATCCATACACAATCATTGAAGAACTCTGGC
Gene-mRNA-Prot
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Position
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
|---|
| sc0000194_pilon | genome | sc0000194_pilon:542251..548507 + |
Properties
| Property Name | Value |
|---|
| Aaloc | 1393-1977:5673 |
| Aaloc | 1195-1383:5484 |
| Aaloc | 295-1194:4149 |
| Aaloc | 31-291:1321 |
| Aaloc | 1-30:1 |
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