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Sequence
The following sequences are available for this feature:
mRNA from alignment at sc0000194_pilon:153284..162324- Legend: polypeptideCDS Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >XLOC_035835 ID=XLOC_035835|Name=XLOC_035835|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=9041bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000194_pilon:153284..162324- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon) TTCGTAAAAGCGAAGAAAACACTAAAGACTGGTACATTACAGATGGATAC
AGATATATTACTTTAATAATATTAAAAGAATCTCAAAATTGGTCATTTTC
CTAGTGGTACTTTCCAGTAGGTTGGATGGATCCTGTTTTTAAAAAACTGC
TACCGTGAGTGGTCCTAAATCCAATGACAGTCTGGGAAATCCTCTCAATT
GCACGCTTATGTTCCGAGGCCGTAAGCGCGCAATTGCACCGTTATCAAAA
TGGCAGAATTTTTAAGCTTGTAATTACACGCTTATCGAAATTGTTCTGAA
ACGGGCGGTAAGCAGTAAGCGTAGAGCTTAAGTGAAAGAGTTTTTATGAT
AAGTTGATTATGTGTATTTGCCTGGGTTTCCAAAGTTCAGAAAGTCTGTC
AACAAGGGTTCACACACAGACTGTTTATAACATTCTGTGTCAGACTAATC
TACCTGCACCAAGCTCTATAATTTTAGAACTTTGTGAGGTGAGGTATTTT
TTATTTTTTCTAAAATTATGAGCTTGGATTCCCAGGCTACAGTAAGCGTG
GCAATTGCACCCTTTCTTTATTATTCTGACACGCAAAATTCCTTCCAAAA
GCTCTGTTGAATTTCAAAAGCCTAGGGCAGTTTTACTCAAAATTTATCGT
AGAAGAAGATTCCGTAAAAATGGATTGCCCGTTAAACCATGCCTTCGCCC
GAATTAGAGAATTCTGAGCCCCATGAAATCCCTCAGCAATTTCAACCGGG
GCGGGAGCGGGCGTAAATTATAACCATGCGCTTACGCCCTCGGAACATAA
GCGTGCAATTGAGAGGATTTCCCAGACTGGATGACAGCCCTGCCTAAATC
CGATGGGGTATTTCAAAGATACAAACTAAATAAAAACAAACTTTTTGCTG
TGACGCAATGAAGATACCAAAGTGTCAACTAAACTGAGAGATTTGATACA
CTGAACCAATTGAACCAAAATATATATTAATTGCTTCTTAAACAAAACAT
AATTCTTTATTACAAAATTATTAACGTTTTAAAATTGAGCAACGGATTCA
GAATAATAGAGGTAATTATATTATTTTTACCACTCGCACTTTTTTTTATC
ACATTAATTGACATCTTGACATTTTAGTCATCTTGTTAGATGTTTTGTTT
GGAGAGTTCTTGCAATATAGTTTATTGTTCAACTTGGAGAGGGAATGTTT
GTAAACATAAGAATTTTTCTTCATAGCAGTTATTTGGGGGGTCGGATTTA
GGCAGGGCTGTCAGATTTAGGACCACTCACGGTATGCTTTACTGTATAGT
CATCTGGGGTAATTACGGGACAGTTAAAATTAAGGGGTAAATACGGGACA
CCCCTAAAAATGGTGCTATTATTATAAATTTGGATTCAGATGGAGAGGAT
TTTGGAGATAGTCATTCTAGCTGCTAGAAAAATGTCTAGTTAGATTATTC
TAACATATACTTTTGATGATTTAACAAAAGTTTCACATGTCACCATAAAA
ATCAATTTTCGTAGTTTAAGAAGGAACTTTTCATGCTTTAGTGTCAGGAA
GAACTGCAATCACTTTGATTATGTTTTGACTGAATTCTGACATCAAGATA
CTATGGTTTGAAATCATAATAGTCACATTATCAAACAAGGCACCTTATCT
CTAAAAAGTGTGTCCCATATTTACCCCGTAGTCAAATCTTAATCTTGGGG
TAATTATGGGACACTAAAGTTTGAGTTTGAAGTGTTTATTTTTTATAAGA
AAACTACAAGCTTGATTTTCTAGTTTAATGGAATCATAACTACACTCTAA
GTCTTTCAAAACCTGCAAAGGTTTGCATCTAAATATACTTCAGTTGGTCT
AGATTGCTCTATAGAAATATTATTGATTGAAGTGTCCCGTTTTTACCCCC
AAATGGGAAAAAGGCTGGGGTAAAAATGGGACACTGTCACTAATTTTGTT
GAAAGTCCTTTAAATGATAGCACTTGGATTTGAAGTCATCAAGTGGATGC
AAAACCTCAAATATCATAGCCTTTTGGAAAGATATCTGGATTTTTCAATA
ACATCTTATACCTGTCCCATAATTACCCCAAGGGTGTCCCGTAATTACCC
CAAAATGCGGGGTATTTATGGGACACCTTTAAAATAATTTTTAGGAGCAT
CTACTAAATTTCAAGGAAAAGTAATAAATCTTGTGTAAAGGTCATACTCT
GATAAATGAAAAATCAAAAAATTGGATCTCTAGGATTAATACTTTTAGAG
TAATGCCCAAATATGTCAAAATCGTCCCGTAATTACCCCAGATGACTATA
CATATTTTTAGAATTTGTGAACTTTGTTCTCAGTTTGTTTTACAATGGGC
TATTCCAAAAAAAAATTATACAGGGATATAGCTAGCTAGGTAGCCCCCTG
GATAAACAGTTGTGAACGTAAAATTTAGTGTTTTAGACCTCTGGGTCACC
AATAGACCTTTTTTCAAAGAGGCCACCCTGTTGAATAATTATGTAGTCCA
GCAGAAAAACAATGATAAAACCATGCATAATTATTACAATATGCATGATA
CAGTAATTATGCATGGCTCTATCATTGTTTTTATGGCTCGACTACATAAT
TATTCTCAACAGGACGTCCTCTTTGAAAAAAGGTCTATAAGTTGTGTTCG
CGTCATTCCCAGCCCTAAATTGTGAGTTGGTCTTAAATCATCAAAAAAAT
GCGCTCTGAATATAAGTGATCAAGCGGTGCTAAAATCATTGGAAAAATGC
GCTCTGAGCATATTGTTCAGGCGGAAAAAATCATTGAGTGCGTGAGAGAG
TGAGCTGTAATGTGATTATTTTGCATATCACAACTGCGCATAAAGCAGTT
GCGCAGCACTTTTTAACGCAAAAAATCTTTGAAAAATTGCGGATAACAAT
CTTAAAAACACTCGATAATCAAAACGCTGCCTGGCTATGCTGAATCTACA
AAATTCTTTGAATAATATTGCTAAAAATCTGACAAATTTTCCGACTTTCC
GACTAGAAAAGGGTCAGATTTTTAAGATAGAAAGTGAGTCTGTCAGAGGA
CGCGAACACAACTTATTTGTGACCATGACCTTATTCTTTGACAAATAAAA
AAGGGCCTGGAAAAAAACAACTATTGATGACATTTGAGGAGCCCTAATCA
GCTTGGAAATTTAGATATATGCTGAAACCCCTCAGAAAATCTCAAAACCC
CTGAAAAAGTTTGTCAATATATACCCCTGTATGGTTTAAAAATGGCAGAG
TATAGACCAAAAACTCCTTTTTATCAAAATTACGGGATTTGTTTTTCGGC
CTGGTGAATTTACTTTCGTTTTCAGTGGTTTCACTTTTGATTTCAAGCCA
ACATCTTAGAAACGGAGTGCTTTCCCATAGTTACAGGGGTTTGTGCAAAG
AATCAAACTTTTAATGTTTTCCAAATCCCCTTTTCGATTAAACAAATAAA
AAATAAAACTTTTCTATCTTTCACTTTTTTGCACCAATTCTTCAAAATGA
AAATATTTAAGATTTAAAGTTCTTCTTTTATTCAATGAGTTTTTATGGTA
TATACTTTATTGCTGACCATCTAACTCTTGCATCAATTCCCGCTTTCTTC
AGAAAATTGAAAATGAGAAAAAACCTAAGTCTTGATCACGGATTAAAACA
AATATATAAAGTGTGAGATTTTATAGCTGCCCATTGTGCAAGGAACTGAG
ACTCAAGAGGCCACAGATGTCAAAAATAAGGGCTGTGTGAAATGCGACAA
TTTCATTGGTGGAAAGTTGAAAAACAGCTGCAAAGGAGTGCCGGGAAGCA
ATCAATAGAAGAGACCACTTTTGTTTTTGATACAGATTTTGATATAAACT
TCTCTCAAGGATTACTTGTCAATGTGTTGTGTCAACTTGTCAGCATTGTA
TTCTTGTTAAGGGAAAGATAAAGAGGTAAGACTAGCCTAGTTTCTAATCC
TGACAGTCTAAGCTTATAAACTCCTATATCAGGATTAGAAACTAGGCTGC
TAGTCTTATCTCTTTTACCTTGTCAACAAAGTGCCGTAAAAAATTATTGA
ATAAAAGAACATCACTTCTTTTTCAACAAATTCAAGGGTTTCAAGGTCAT
TTTTGACTAATTTTCCAGGCTTTCAAGGGTTTTTACCACATACTTTCAAG
GGTTTCTAGGGTTTTTAGTCAATCTTTGCTAGTTTTAAAGTTTTTCAATG
AAATCTGTTGACAATAGCAGAAAGGTTGAATTTTCAACTCTCAAGGTTGA
ATCCTCCACTCCCCTTAAATGCATAAAATACCCCTAAGACGTTTTCTTTA
ACAAAATCATTAAAACCATGAAATCTTTCAGACAAATCAGTCTTTTCAAT
CCCCTTGGAGTCTCAGAGGCTTCAAAAGTATGTTTTCTCATTTAATTCAC
TGATGTTTGTATCCCACAGAAATATTTTGGAAAGTTAAAATGGCTGAAAA
TGGCCACAAAATTTGGCATTTGAAGGGTTTCAAGGGTATAAATCTTGCAC
CTCAAGGGTCCCCAAAATAATATTGTTGAATAATAGGGCAGGAAAAAAAT
CAAGGGTGTTTCAAGGAATTCAAGGGTCGCTGGCATGGCGTCCTCCAGCT
TTTTGGTCCCCCCTAATAATATGAGCTAAAATCCCCCATCTGGCCTTCCC
CTCACCTGTCTTTAAAATTTGTTCTCCCCCCAATTGGGAAATCCCCCTAG
CCAAATTGTATAAGGGTTGCGAAGTGATGATCCAGACTCACCTCAATTCG
CAAGCTACTATAGCAAAAAAAAGACTCTCAAAATCATTAGAAAGACAGGC
TCATAAGCCTGAATGCCCAAACACACCAGGAAGGTCTGTATTTATCCTAT
TACTCCCCCACTAGGTAGAGGACTGAATATACCCCCTATTCGCCTTTCTC
CCCCATCAAGCTTGAAATTTTCACTTCCCCCCTGGCACCAAAATCTGATT
CCCCCCCATCTTCCTGGGGGGATGATCCCATGGCTGGCCACCATGTTCAT
ACAAAACAACAGCCCCCACCCCCACCCCCACTTGTGAAAATGCAAATACC
CCCAAACATTTCAGGTACCCCCTAAATTTAAGAAATCTTCCAGGTACCTG
GCTTTTTTAGCACTTTTTTTTTGAGGTACCCCCTAATTTCTGGGGGGTGG
ACCCAGGTGGACCCTATGCGTAATTTGCTCCTTTGGAAAGTCTTTTTTAA
ATTTCAACCAATAAGATTGCTGTGTATGATGAGGGTTAACCACTAGTTCT
AATTTTTGGCGCTAATGGCTTTTCGGCATCTTGGAAAATGAGTAGTCATA
TAACTTTATTTGGTTCAATCGTTGATTCTAAGGGTTGAATTTTTTCTTAT
CTTGAGTTCTCAAACGAAAGCGGGAATTTGATTCTTTGAAATAGTAACGC
ACTATTTCAAAGAATCCTTTCTGATTGGATGAAAGCACTTTACCTTCATT
TGATTGGATGCTTCTTTTTAAACAATGGTATAGCAATTTTTTGATTGGAA
AAATTAAAGCAATCGATTTCGCTGTGATTGGATAGTAAAACATTTTGGCG
CTTTCACAAGCGTTTGCGATTGAACAAAATAAAACAATCTAAATATTTCT
TTTCCAGGGGTGAATTTTGAGTTTTTATTTTATTTCTTCATGTTTGCCAA
TCCCGGGAGTCTTCATGTATATACCACAGGAAAACTCATGAAACCCGCCA
ATCTAATTTTGGGTTTGGCAAATCCCCAAGATTGGCAAACAATCATTTTT
TCCCACTTATGGTTTTTCTCATTGGTCTTTTATTGGTTTCTTTTGTTGAT
TTCTTGCATCATCATTGACTTGCTAGTCATTTCTTGAAATGGAAAGACAC
GGTATTTACCAAGCTGCAGGACATTTTTGTTCCAAACTAGCGCTTATTAA
TATTTGGGAAAATATTTTTGAAAGTTACTTTTTTTGCCCTAATTCTACTG
CATTACATTAGCTTCCTTTTCAAAAATTTTCCACCCAGGACATTTTTATT
CCAACCCCCCCTCGCTTATTAAGTTTTGAGAATTAGGTATATACCTGAGA
TTGTTATCTTGAGTTATAGCTAAAGTCTGTCTCAAAAGTATGTGGACATT
TTAGTTTTTGAGCATTTTCTCAGTTATCAGTCATTCTATATTAGAAAATT
ATGTTAATTATTATGTTAATTAATTTCTAAGTTAAAAATACTTTGCCAGT
CAAATATTTTTCTGTTAAAGTCTGTCTCAAAATTTCTATATATTTATTTG
CATAAATTCATTAGAATTACTTTCGCAAAAAGTAATTAAAAATATAATAA
TTACTTTTCCAAATCTATGTGGACACTTTAGTTTTTGAGCATTTTCTCAG
CATCCATCCATGCTATATTAGAAAGCTAACATCGGAAAGATATTTCCAAC
GAGAACAATGAAATAGATAAAACATTTTTGAAAAATTGAAAAATGAAGAA
GAAGAATGAGAAGAATGAAGATGGAAAAATTAATCTTTTATTCTTTAGAT
TATTTTCCTTGGTCTCCACATAGTTTTGGAAAAGTAATTATTATACGATG
GCCCAGAAGGCTCATTATTGCTGCACGCGAGAACATGACTGTGCGCGAGA
AATATGTTGTGCGAGCGAGAAAAGTATATTGTGCGCGCGAGAAGTATGTT
GTGCGCATGAGAAGTATATTATGCGCGCGAGAAGTATGTTGTGCGCACAC
AAGTTGGAAATTGTGTGCGAGAAAAAAAATACTGTGCGCGCGAGCACAAA
AATCAAAGTAGATGTTTGATTTTATTAATTCCGCCCTTTCCGCCCTCCCT
CCTGTGATTAGAGTCTGGAATTTATGATTCAAGTCTGTAGAATACATGCC
CTCAAAACACATGTTTTTTGACTGATTTCAGCTTAACAAGGTTCTTCGGT
AAAAGGTTTTCAACCAGAATGAATGATGAATATTTAGTTTGCGAATATGA
ATGATGAATATATAGCCAATGATGAATATTTAGCTTGGCAATCAATCATG
GACCACAGCAACACAGGGAGTAAGGACCTTTCTCGCAATTTTATTTCATA
ATACTGCGCATGCGTAATTTTCAACCGGTAGTGGATATTTAATGGCTAGA
ACCAAGTCAAATAATCCGGGAGGGGTGGACTCACTTTATCGGTCGGGGTT
GTGGAGGGCCTAAACCATTTTTTTGATTAGACGAAAATGTGATGTTCTTT
AGTGACGTATTGTGACGTTCTTTAATGACGTATTTGTCGCTTATTGGGTC
ACTACAGTTAGGGTCAGGGTTGGACTCGAGAGTCACAACTGAGTGCCCTG
GACCCATTTAGAGTCACTTTAGGGTCAATTGGACCCACTGACAAAATTGA
AAAACTTCGTTTTAGTAAGATTTTAGATTGCTGCGAATAAGGTCCTTTCT
TCCCCTCGCAATGACCACAAAACCGCAACAACTTTTAACATTTTGCGCGA
CTTTGTCTATCATTTTGGATATGATTGTTTATCTTTGTATACATTTTGAG
GACCCGAATGAAATTAACAGCGACACGATTTCAGGACTGGAATCATTATT
TTTGGAAGTTAAACTATATCTGCTTTGCTAATGTATGTCTCCTTTGCTTT
CGCACTAGACTATATTCTCTCGCGCACGATAACATCTTCTCGCGCGCACA
ACATACATTTCGCACACACAACATATTTCTCGCTCGCACAACATATTTCT
CGCTCGCACAACATATTTCTCCCGCGCACAACATATTTCTCGCTCGCACA
GCATATTTCTCGCGCACAGTCATGTTCTCGCGCGCAGCAATAATGAGCCT
TCTGGGCCATCGTATTATTATGTAATTGCTTTTTGCGAAAGTAATTCTAA
TGAATTTATGCAAATAAATATATAGAAATTTTGAGACAGACTTTTACAGA
AAAATATTTAACTGGTTAAGTATTTTTAAAAAAATTCTGAAATGAATTTA
TGAATTCCCTCTGCACATTCTCTCAATGGATGCTCAACTACAAAATATGG
TATGACAAAGATGTAAATTTGGCTGAGGGATGTTTGATTGCTTTAATAAT
TGTGTTAAATATACACAAACACCTCTGTCATCTTAGACAACCAAAACATG
GAAAAATATAGATAAAAAAGCTAGCTATAATAACAAATGTAGGTCACAAT
TATTTTAAAATCATGCAATGTCAAGGAAAATATGACAGAGAAAATGATCA
AATTTTCAAAGAATATAAGCGATACAAAAAGAAAAAGCCATTACCTGACT
TTTCCAAAGTTATTGATTTCCAGCAACCTGAAAAATATGGAGCGCTTTTG
AAGGAAATTACTGTTGCACCTCATCAAGCTACTTTTGATTATCACAAAAT
TGGATTGAAAAATCCTAAAGAATGGAAAGTTTATGAGCTTACATCATGTC
CAGGTTTTCTTGTAGTTCCAAACCCTTTTCTAAGTGCTGACTCACAAAGT
CATTGGGTAAAGAGAGCATTGACAGACTACACCAAAAAACCTTTTCCTTC
AAACCTTGATGTATTAATGACTCTTGAAAATGATAAGAAGACACTCTGGG
ATATCAGTAAGGAAAAATCACCCACAGATAATTCATTTATCCAGAAACTG
AGGTGGGTACACATGGGATACCATTTTGATTACAATGTTGTCGATTATAA
AGCAAAACAGTACTTTGGTTTTCCTGATGACCTAGCTTGCTTAACCAAGA
CCATTGCTTCTGTCTTTAAATTTCCAGACTATTATGCTGAAACTGGTATA
ATTAATTATTACCCTGAAGGTGCAAGTATGGGCGGACATACTGATCATTA
TGAAGAAGAATTATGTCAACCGCTTATCAGTTATAGTTTTGGTCAATCTG
CTATATACCTCATTGGAGGCCCAACTAGAGATGTCAAACCAGAGGCTATC
TGGGTGCGTTCTGGTGATATTATGTTGATGACAGGGCCTTCACGTGTTGC
CTTTCATGCTGTTCCTTGCATCATTACCAAACCATCTAAAACAACTCCAG
AGAATATTGGAGATTGTCCTTTGGTACTAGAAAGTGATAAC Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000194_pilon:153284..162324- >XLOC_035835 ID=XLOC_035835|Name=XLOC_035835|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=690bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000194_pilon:153284..162324- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon) TTCGTAAAAGCGAAGAAAACACTAAAGACTGTTCGTAAAAGCGAAGAAAA CACTAAAGACTGACTATTATGCTGAAACTGGTATAATTAATTATTACCCT GAAGGTGCAAGTATGGGCGGACATACTGATCATTATGAAGAAGAATTATG TCAACCGCTTATCAGTTATAGTTTTGGTCAATCTGCTATATACCTCATTG GAGGCCCAACTAGAGATGTCAAACCAGAGGCTATCTGGGTGCGTTCTGGT GATATTATGTTGATGACAGGGCCTTCACGTGTTGCCTTTCATGCTGTTCC TTGCATCATTACCAAACCATCTAAAACAACTCCAGAGAATATTGGAGATT GTCCTTTGGTACTAGAAAGTGATAACACTATTATGCTGAAACTGGTATAA TTAATTATTACCCTGAAGGTGCAAGTATGGGCGGACATACTGATCATTAT GAAGAAGAATTATGTCAACCGCTTATCAGTTATAGTTTTGGTCAATCTGC TATATACCTCATTGGAGGCCCAACTAGAGATGTCAAACCAGAGGCTATCT GGGTGCGTTCTGGTGATATTATGTTGATGACAGGGCCTTCACGTGTTGCC TTTCATGCTGTTCCTTGCATCATTACCAAACCATCTAAAACAACTCCAGA GAATATTGGAGATTGTCCTTTGGTACTAGAAAGTGATAAC
Gene-mRNA-Prot
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Position
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
| sc0000194_pilon | genome | sc0000194_pilon:153284..162324 - |
Properties
| Property Name | Value |
| Aaloc | 34-345:313 |
| Aaloc | 1-30:9042 |
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