XLOC_035835 (mRNA) -

Overview
NameXLOC_035835
Unique NameXLOC_035835
TypemRNA
OrganismClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon (Jellyfish)

Sequence
The following sequences are available for this feature:

mRNA from alignment at sc0000194_pilon:153284..162324-

Legend: polypeptideCDS
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>XLOC_035835 ID=XLOC_035835|Name=XLOC_035835|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=9041bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000194_pilon:153284..162324- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
TTCGTAAAAGCGAAGAAAACACTAAAGACTGGTACATTACAGATGGATAC AGATATATTACTTTAATAATATTAAAAGAATCTCAAAATTGGTCATTTTC CTAGTGGTACTTTCCAGTAGGTTGGATGGATCCTGTTTTTAAAAAACTGC TACCGTGAGTGGTCCTAAATCCAATGACAGTCTGGGAAATCCTCTCAATT GCACGCTTATGTTCCGAGGCCGTAAGCGCGCAATTGCACCGTTATCAAAA TGGCAGAATTTTTAAGCTTGTAATTACACGCTTATCGAAATTGTTCTGAA ACGGGCGGTAAGCAGTAAGCGTAGAGCTTAAGTGAAAGAGTTTTTATGAT AAGTTGATTATGTGTATTTGCCTGGGTTTCCAAAGTTCAGAAAGTCTGTC AACAAGGGTTCACACACAGACTGTTTATAACATTCTGTGTCAGACTAATC TACCTGCACCAAGCTCTATAATTTTAGAACTTTGTGAGGTGAGGTATTTT TTATTTTTTCTAAAATTATGAGCTTGGATTCCCAGGCTACAGTAAGCGTG GCAATTGCACCCTTTCTTTATTATTCTGACACGCAAAATTCCTTCCAAAA GCTCTGTTGAATTTCAAAAGCCTAGGGCAGTTTTACTCAAAATTTATCGT AGAAGAAGATTCCGTAAAAATGGATTGCCCGTTAAACCATGCCTTCGCCC GAATTAGAGAATTCTGAGCCCCATGAAATCCCTCAGCAATTTCAACCGGG GCGGGAGCGGGCGTAAATTATAACCATGCGCTTACGCCCTCGGAACATAA GCGTGCAATTGAGAGGATTTCCCAGACTGGATGACAGCCCTGCCTAAATC CGATGGGGTATTTCAAAGATACAAACTAAATAAAAACAAACTTTTTGCTG TGACGCAATGAAGATACCAAAGTGTCAACTAAACTGAGAGATTTGATACA 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AAATGGGAAAAAGGCTGGGGTAAAAATGGGACACTGTCACTAATTTTGTT GAAAGTCCTTTAAATGATAGCACTTGGATTTGAAGTCATCAAGTGGATGC AAAACCTCAAATATCATAGCCTTTTGGAAAGATATCTGGATTTTTCAATA ACATCTTATACCTGTCCCATAATTACCCCAAGGGTGTCCCGTAATTACCC CAAAATGCGGGGTATTTATGGGACACCTTTAAAATAATTTTTAGGAGCAT CTACTAAATTTCAAGGAAAAGTAATAAATCTTGTGTAAAGGTCATACTCT GATAAATGAAAAATCAAAAAATTGGATCTCTAGGATTAATACTTTTAGAG TAATGCCCAAATATGTCAAAATCGTCCCGTAATTACCCCAGATGACTATA CATATTTTTAGAATTTGTGAACTTTGTTCTCAGTTTGTTTTACAATGGGC TATTCCAAAAAAAAATTATACAGGGATATAGCTAGCTAGGTAGCCCCCTG GATAAACAGTTGTGAACGTAAAATTTAGTGTTTTAGACCTCTGGGTCACC AATAGACCTTTTTTCAAAGAGGCCACCCTGTTGAATAATTATGTAGTCCA GCAGAAAAACAATGATAAAACCATGCATAATTATTACAATATGCATGATA CAGTAATTATGCATGGCTCTATCATTGTTTTTATGGCTCGACTACATAAT TATTCTCAACAGGACGTCCTCTTTGAAAAAAGGTCTATAAGTTGTGTTCG CGTCATTCCCAGCCCTAAATTGTGAGTTGGTCTTAAATCATCAAAAAAAT GCGCTCTGAATATAAGTGATCAAGCGGTGCTAAAATCATTGGAAAAATGC GCTCTGAGCATATTGTTCAGGCGGAAAAAATCATTGAGTGCGTGAGAGAG TGAGCTGTAATGTGATTATTTTGCATATCACAACTGCGCATAAAGCAGTT GCGCAGCACTTTTTAACGCAAAAAATCTTTGAAAAATTGCGGATAACAAT CTTAAAAACACTCGATAATCAAAACGCTGCCTGGCTATGCTGAATCTACA AAATTCTTTGAATAATATTGCTAAAAATCTGACAAATTTTCCGACTTTCC GACTAGAAAAGGGTCAGATTTTTAAGATAGAAAGTGAGTCTGTCAGAGGA CGCGAACACAACTTATTTGTGACCATGACCTTATTCTTTGACAAATAAAA AAGGGCCTGGAAAAAAACAACTATTGATGACATTTGAGGAGCCCTAATCA GCTTGGAAATTTAGATATATGCTGAAACCCCTCAGAAAATCTCAAAACCC CTGAAAAAGTTTGTCAATATATACCCCTGTATGGTTTAAAAATGGCAGAG TATAGACCAAAAACTCCTTTTTATCAAAATTACGGGATTTGTTTTTCGGC CTGGTGAATTTACTTTCGTTTTCAGTGGTTTCACTTTTGATTTCAAGCCA ACATCTTAGAAACGGAGTGCTTTCCCATAGTTACAGGGGTTTGTGCAAAG AATCAAACTTTTAATGTTTTCCAAATCCCCTTTTCGATTAAACAAATAAA AAATAAAACTTTTCTATCTTTCACTTTTTTGCACCAATTCTTCAAAATGA AAATATTTAAGATTTAAAGTTCTTCTTTTATTCAATGAGTTTTTATGGTA TATACTTTATTGCTGACCATCTAACTCTTGCATCAATTCCCGCTTTCTTC AGAAAATTGAAAATGAGAAAAAACCTAAGTCTTGATCACGGATTAAAACA AATATATAAAGTGTGAGATTTTATAGCTGCCCATTGTGCAAGGAACTGAG ACTCAAGAGGCCACAGATGTCAAAAATAAGGGCTGTGTGAAATGCGACAA TTTCATTGGTGGAAAGTTGAAAAACAGCTGCAAAGGAGTGCCGGGAAGCA ATCAATAGAAGAGACCACTTTTGTTTTTGATACAGATTTTGATATAAACT TCTCTCAAGGATTACTTGTCAATGTGTTGTGTCAACTTGTCAGCATTGTA TTCTTGTTAAGGGAAAGATAAAGAGGTAAGACTAGCCTAGTTTCTAATCC TGACAGTCTAAGCTTATAAACTCCTATATCAGGATTAGAAACTAGGCTGC TAGTCTTATCTCTTTTACCTTGTCAACAAAGTGCCGTAAAAAATTATTGA ATAAAAGAACATCACTTCTTTTTCAACAAATTCAAGGGTTTCAAGGTCAT TTTTGACTAATTTTCCAGGCTTTCAAGGGTTTTTACCACATACTTTCAAG GGTTTCTAGGGTTTTTAGTCAATCTTTGCTAGTTTTAAAGTTTTTCAATG AAATCTGTTGACAATAGCAGAAAGGTTGAATTTTCAACTCTCAAGGTTGA ATCCTCCACTCCCCTTAAATGCATAAAATACCCCTAAGACGTTTTCTTTA ACAAAATCATTAAAACCATGAAATCTTTCAGACAAATCAGTCTTTTCAAT CCCCTTGGAGTCTCAGAGGCTTCAAAAGTATGTTTTCTCATTTAATTCAC TGATGTTTGTATCCCACAGAAATATTTTGGAAAGTTAAAATGGCTGAAAA TGGCCACAAAATTTGGCATTTGAAGGGTTTCAAGGGTATAAATCTTGCAC CTCAAGGGTCCCCAAAATAATATTGTTGAATAATAGGGCAGGAAAAAAAT CAAGGGTGTTTCAAGGAATTCAAGGGTCGCTGGCATGGCGTCCTCCAGCT TTTTGGTCCCCCCTAATAATATGAGCTAAAATCCCCCATCTGGCCTTCCC CTCACCTGTCTTTAAAATTTGTTCTCCCCCCAATTGGGAAATCCCCCTAG CCAAATTGTATAAGGGTTGCGAAGTGATGATCCAGACTCACCTCAATTCG CAAGCTACTATAGCAAAAAAAAGACTCTCAAAATCATTAGAAAGACAGGC TCATAAGCCTGAATGCCCAAACACACCAGGAAGGTCTGTATTTATCCTAT TACTCCCCCACTAGGTAGAGGACTGAATATACCCCCTATTCGCCTTTCTC CCCCATCAAGCTTGAAATTTTCACTTCCCCCCTGGCACCAAAATCTGATT CCCCCCCATCTTCCTGGGGGGATGATCCCATGGCTGGCCACCATGTTCAT ACAAAACAACAGCCCCCACCCCCACCCCCACTTGTGAAAATGCAAATACC CCCAAACATTTCAGGTACCCCCTAAATTTAAGAAATCTTCCAGGTACCTG GCTTTTTTAGCACTTTTTTTTTGAGGTACCCCCTAATTTCTGGGGGGTGG ACCCAGGTGGACCCTATGCGTAATTTGCTCCTTTGGAAAGTCTTTTTTAA ATTTCAACCAATAAGATTGCTGTGTATGATGAGGGTTAACCACTAGTTCT AATTTTTGGCGCTAATGGCTTTTCGGCATCTTGGAAAATGAGTAGTCATA TAACTTTATTTGGTTCAATCGTTGATTCTAAGGGTTGAATTTTTTCTTAT CTTGAGTTCTCAAACGAAAGCGGGAATTTGATTCTTTGAAATAGTAACGC ACTATTTCAAAGAATCCTTTCTGATTGGATGAAAGCACTTTACCTTCATT TGATTGGATGCTTCTTTTTAAACAATGGTATAGCAATTTTTTGATTGGAA AAATTAAAGCAATCGATTTCGCTGTGATTGGATAGTAAAACATTTTGGCG CTTTCACAAGCGTTTGCGATTGAACAAAATAAAACAATCTAAATATTTCT TTTCCAGGGGTGAATTTTGAGTTTTTATTTTATTTCTTCATGTTTGCCAA TCCCGGGAGTCTTCATGTATATACCACAGGAAAACTCATGAAACCCGCCA ATCTAATTTTGGGTTTGGCAAATCCCCAAGATTGGCAAACAATCATTTTT TCCCACTTATGGTTTTTCTCATTGGTCTTTTATTGGTTTCTTTTGTTGAT TTCTTGCATCATCATTGACTTGCTAGTCATTTCTTGAAATGGAAAGACAC GGTATTTACCAAGCTGCAGGACATTTTTGTTCCAAACTAGCGCTTATTAA TATTTGGGAAAATATTTTTGAAAGTTACTTTTTTTGCCCTAATTCTACTG CATTACATTAGCTTCCTTTTCAAAAATTTTCCACCCAGGACATTTTTATT CCAACCCCCCCTCGCTTATTAAGTTTTGAGAATTAGGTATATACCTGAGA TTGTTATCTTGAGTTATAGCTAAAGTCTGTCTCAAAAGTATGTGGACATT TTAGTTTTTGAGCATTTTCTCAGTTATCAGTCATTCTATATTAGAAAATT ATGTTAATTATTATGTTAATTAATTTCTAAGTTAAAAATACTTTGCCAGT CAAATATTTTTCTGTTAAAGTCTGTCTCAAAATTTCTATATATTTATTTG CATAAATTCATTAGAATTACTTTCGCAAAAAGTAATTAAAAATATAATAA TTACTTTTCCAAATCTATGTGGACACTTTAGTTTTTGAGCATTTTCTCAG CATCCATCCATGCTATATTAGAAAGCTAACATCGGAAAGATATTTCCAAC GAGAACAATGAAATAGATAAAACATTTTTGAAAAATTGAAAAATGAAGAA GAAGAATGAGAAGAATGAAGATGGAAAAATTAATCTTTTATTCTTTAGAT TATTTTCCTTGGTCTCCACATAGTTTTGGAAAAGTAATTATTATACGATG GCCCAGAAGGCTCATTATTGCTGCACGCGAGAACATGACTGTGCGCGAGA AATATGTTGTGCGAGCGAGAAAAGTATATTGTGCGCGCGAGAAGTATGTT GTGCGCATGAGAAGTATATTATGCGCGCGAGAAGTATGTTGTGCGCACAC AAGTTGGAAATTGTGTGCGAGAAAAAAAATACTGTGCGCGCGAGCACAAA AATCAAAGTAGATGTTTGATTTTATTAATTCCGCCCTTTCCGCCCTCCCT CCTGTGATTAGAGTCTGGAATTTATGATTCAAGTCTGTAGAATACATGCC CTCAAAACACATGTTTTTTGACTGATTTCAGCTTAACAAGGTTCTTCGGT AAAAGGTTTTCAACCAGAATGAATGATGAATATTTAGTTTGCGAATATGA ATGATGAATATATAGCCAATGATGAATATTTAGCTTGGCAATCAATCATG GACCACAGCAACACAGGGAGTAAGGACCTTTCTCGCAATTTTATTTCATA ATACTGCGCATGCGTAATTTTCAACCGGTAGTGGATATTTAATGGCTAGA ACCAAGTCAAATAATCCGGGAGGGGTGGACTCACTTTATCGGTCGGGGTT GTGGAGGGCCTAAACCATTTTTTTGATTAGACGAAAATGTGATGTTCTTT AGTGACGTATTGTGACGTTCTTTAATGACGTATTTGTCGCTTATTGGGTC ACTACAGTTAGGGTCAGGGTTGGACTCGAGAGTCACAACTGAGTGCCCTG GACCCATTTAGAGTCACTTTAGGGTCAATTGGACCCACTGACAAAATTGA AAAACTTCGTTTTAGTAAGATTTTAGATTGCTGCGAATAAGGTCCTTTCT TCCCCTCGCAATGACCACAAAACCGCAACAACTTTTAACATTTTGCGCGA CTTTGTCTATCATTTTGGATATGATTGTTTATCTTTGTATACATTTTGAG GACCCGAATGAAATTAACAGCGACACGATTTCAGGACTGGAATCATTATT TTTGGAAGTTAAACTATATCTGCTTTGCTAATGTATGTCTCCTTTGCTTT CGCACTAGACTATATTCTCTCGCGCACGATAACATCTTCTCGCGCGCACA ACATACATTTCGCACACACAACATATTTCTCGCTCGCACAACATATTTCT CGCTCGCACAACATATTTCTCCCGCGCACAACATATTTCTCGCTCGCACA GCATATTTCTCGCGCACAGTCATGTTCTCGCGCGCAGCAATAATGAGCCT TCTGGGCCATCGTATTATTATGTAATTGCTTTTTGCGAAAGTAATTCTAA TGAATTTATGCAAATAAATATATAGAAATTTTGAGACAGACTTTTACAGA AAAATATTTAACTGGTTAAGTATTTTTAAAAAAATTCTGAAATGAATTTA TGAATTCCCTCTGCACATTCTCTCAATGGATGCTCAACTACAAAATATGG TATGACAAAGATGTAAATTTGGCTGAGGGATGTTTGATTGCTTTAATAAT TGTGTTAAATATACACAAACACCTCTGTCATCTTAGACAACCAAAACATG GAAAAATATAGATAAAAAAGCTAGCTATAATAACAAATGTAGGTCACAAT TATTTTAAAATCATGCAATGTCAAGGAAAATATGACAGAGAAAATGATCA AATTTTCAAAGAATATAAGCGATACAAAAAGAAAAAGCCATTACCTGACT TTTCCAAAGTTATTGATTTCCAGCAACCTGAAAAATATGGAGCGCTTTTG AAGGAAATTACTGTTGCACCTCATCAAGCTACTTTTGATTATCACAAAAT TGGATTGAAAAATCCTAAAGAATGGAAAGTTTATGAGCTTACATCATGTC CAGGTTTTCTTGTAGTTCCAAACCCTTTTCTAAGTGCTGACTCACAAAGT CATTGGGTAAAGAGAGCATTGACAGACTACACCAAAAAACCTTTTCCTTC AAACCTTGATGTATTAATGACTCTTGAAAATGATAAGAAGACACTCTGGG ATATCAGTAAGGAAAAATCACCCACAGATAATTCATTTATCCAGAAACTG AGGTGGGTACACATGGGATACCATTTTGATTACAATGTTGTCGATTATAA AGCAAAACAGTACTTTGGTTTTCCTGATGACCTAGCTTGCTTAACCAAGA CCATTGCTTCTGTCTTTAAATTTCCAGACTATTATGCTGAAACTGGTATA ATTAATTATTACCCTGAAGGTGCAAGTATGGGCGGACATACTGATCATTA TGAAGAAGAATTATGTCAACCGCTTATCAGTTATAGTTTTGGTCAATCTG CTATATACCTCATTGGAGGCCCAACTAGAGATGTCAAACCAGAGGCTATC TGGGTGCGTTCTGGTGATATTATGTTGATGACAGGGCCTTCACGTGTTGC CTTTCATGCTGTTCCTTGCATCATTACCAAACCATCTAAAACAACTCCAG AGAATATTGGAGATTGTCCTTTGGTACTAGAAAGTGATAAC

Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000194_pilon:153284..162324-

>XLOC_035835 ID=XLOC_035835|Name=XLOC_035835|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=690bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000194_pilon:153284..162324- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
TTCGTAAAAGCGAAGAAAACACTAAAGACTGTTCGTAAAAGCGAAGAAAA
CACTAAAGACTGACTATTATGCTGAAACTGGTATAATTAATTATTACCCT
GAAGGTGCAAGTATGGGCGGACATACTGATCATTATGAAGAAGAATTATG
TCAACCGCTTATCAGTTATAGTTTTGGTCAATCTGCTATATACCTCATTG
GAGGCCCAACTAGAGATGTCAAACCAGAGGCTATCTGGGTGCGTTCTGGT
GATATTATGTTGATGACAGGGCCTTCACGTGTTGCCTTTCATGCTGTTCC
TTGCATCATTACCAAACCATCTAAAACAACTCCAGAGAATATTGGAGATT
GTCCTTTGGTACTAGAAAGTGATAACACTATTATGCTGAAACTGGTATAA
TTAATTATTACCCTGAAGGTGCAAGTATGGGCGGACATACTGATCATTAT
GAAGAAGAATTATGTCAACCGCTTATCAGTTATAGTTTTGGTCAATCTGC
TATATACCTCATTGGAGGCCCAACTAGAGATGTCAAACCAGAGGCTATCT
GGGTGCGTTCTGGTGATATTATGTTGATGACAGGGCCTTCACGTGTTGCC
TTTCATGCTGTTCCTTGCATCATTACCAAACCATCTAAAACAACTCCAGA
GAATATTGGAGATTGTCCTTTGGTACTAGAAAGTGATAAC
Gene-mRNA-Prot
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
XLOC_035835XLOC_035835-proteinClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonpolypeptide
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
sc0000194_pilongenomesc0000194_pilon:153284..162324 -
Properties
Property NameValue
Aaloc34-345:313
Aaloc1-30:9042