XLOC_035833 (mRNA) -

Overview
NameXLOC_035833
Unique NameXLOC_035833
TypemRNA
OrganismClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon (Jellyfish)

Sequence
The following sequences are available for this feature:

mRNA from alignment at sc0000194_pilon:211656..223533-

Legend: polypeptideCDS
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>XLOC_035833 ID=XLOC_035833|Name=XLOC_035833|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=11878bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000194_pilon:211656..223533- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
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GTTATTTAAAGGCCTTTGAATGGAACCCTCCTGTTTTCCCAAACAAATAT TTAGGGGCCACTTGTAGACCAATTTCATGTGACAGAGGCGTTGTGGTATA GTGGACATCAACCTTGATTCCTGTACAGGCGATCAAGGTTCGATTCCCAC TCACAACGGTTCACTTGGCAAGTGAACAAACCTTCGCCCGGGTCAACCCA TGCCATGTGAGGGGAATTGGGTAGTCAGTTCAAGGTGCTGACGGGATGCT TACTCAAAGCATCTATAGTTGGGAAAATGGGCTCCCAGAGCCTCCTGTGA CTCAACCATAATAGATAGATAGATAGATAGACATCATTTTCACCCTCAAT CAGCCATTTTTCAGATTATAGACCTTTGACTCAAGGGGTGAAAATATTAT GTACAACAGTATAGTCCTAACTCTCCATATAAAATTTACAGGATTTAGAC ACATGTGTAAGCAAAAGTTCCAAAAATGAAAATAAAAGGATATTGATAAT TGAATAGTCCTCTAGGAGAATGCGACAATCTATTGCATAACTAATTACTG CAACCTAAATTATGATAACTATTGCCTATAAATAAGTTTTATTCAAATTG GCAAGCCAACAATCTCCCGAATTAGCACGCTATAATCTTCCTGTGCGACA TGCTATAAAGTATTAGGGTTTTATTTCCGTAATACAGAGCAAATGATTTC CGGCCCAAATGGCTGAAGTAATTCAATATGCAGACCTTAGTCAATAGATC GTTGCGCTCTCCCAAACAACCTATACTACATTGATGATTAGAGGCACAAT CGTTAAGCTAGAATCACTCTGCGTACCCTTTGCTCCAGAAAATGATTGAC TGATTTAAAGGGGGTCTTATACTATATTTTTTTTGGAAATAAGGAAACTT TGGATGAAAATGAGCTATTTTATATTAAAAAACCTTATTAAACTCAGGCG AAAATAAAAAATGTAGTGTTTCTGGAAACCGGCCAGGTGATAAAAAATAT TTTTCTGACCCTGCCGCAGACTATGGGTTCATCTATATGGTTCATCATAA AAATCAAGTTGACTGTTCAATCTCTTAAACGTCTTTTGGTTAGATATTCC CGCTTGTAAATCAAGTTTTGTTGGTTAGTAGTTGATACATTAGTATTCAG ATTTTTATATTTATTAAAATTATTCAATTTTTTTCTTTAAAGATTTGCGC ATGTGAAGTCATCATTGGACTTTCGAAATGAACAGATTCGTTTGCTAAAC AAGATTTTGAAAAATTCCTTGATAAAATCATTTAGGCATTTAAGTTCTGA TTTATTTGTACATCCAAAAGCTTGACACAATTGCATATCTTTCAAGTTTG CTCTTCTAATTACATTTTTCTTAAAACTTCTCTACGTCTATGTACATCCA AATTATAATTTGCTATAAAACATCTTCTTTTTACAAATTTTGTCTATAAA ACAGTTTCTCTATCAAAATAAAAGTCCAATGACGAGGTCACGAAACCCTC TTTCTTTCAAATAAAGAGAAATTTAAAAAAAGCATTGATAACTCAATTAA TATAAAAGATTTTAAACATTTTCTTTTTGCAATGTTTTTATTCAATTAGA CCTGCACTTTTTCAAAAAATAAGAATAAAGAAATTTTTGCCCTTAGTTCT CCTGCAGTTTCTTGCATATTGGCATATTGCATCTTTCCTTGCTGCAGTAA AATTTGACAAAAAACAATGAATTTTGAAGTTACATACTAAATAACTGCCT GATTGAGAAAACGTGCATAAAGAATTAATCAAGTTGATCTAAAAACAAAA TTTCAATGATTTTTTATTTGATGTTGACAACTTGGTTCTCTTGGTTCTAA TTTTAAATTTGCACAAAAACTTTCAGATTTTTTCATTTGAAATTTGTGCA ATCCGGGTGAGGATCAAATTAAAGTTCTCCATTAAGGGAAGAAAGTTTTG AAAGATAATACTTTGGGAAGCTCCTTTTCACGTGGTTCAGAAGTAAGTCT TATGATTTAAAAAAAAGGGATCCCTCTAAGAAAAACATAAAAAGACAATT TTTTGATAGAATTTTTTGAGACAATGACTGCTACAATAATAGTTTCAGCT ATATAATCTAAAAATATACACAGCTTTAAACAAGAAAATTAGAAAATAAT ATAGTACAGTCTAGTTGTGTACAAATGGTGCATAAAGGCCTAAAAGTATG AGACTTAGCACAATTGTAGTTTAGGGGTCAAAAATGGATTTAAATCTGAG ACCCAAAAAAATGAGGACTTGAGTCTTTTGCGGCAAAGAATCTTATGTTA TATACTGTTGGGAAGCATTTTCCATACCCATTTAGAAAAACATTACAACC CATAGTGTCCTCCAGGGTTTGTTCCCCCCACCAAATTCTTGATTTTTTTA AATCTCCCCCCTCTTTTTTTTCCCCCTATGACTTTTCAGTTTTTTAGTTT CCCCCCTCTTTTTTGCTTTCCCCCCAGAAAATTCTGAAAATATCATCCCC CCCCCCCATATACCCGTATAAATTTCTCAAATTTCAACCTGACACAGACG TAAAATTTTGCTGCAAAAGGAATACTAGACAAAGTAGAACGAAAATTGGT TAATTTTCAATCATGATCTAATCACATGATATCATGTGGACTGACCTTGG TTGCTGAGATAAAATTGAAGTGATTTCACACTTCCCCCCACCAAATTTGC CAACTATCGATGTTTTCCCCCCTCTTTTTTTCCCCCCTTTACTATTCAAA TTTTCATTTTCCCCCCTCACCCATTCAAAACTGGAAAATTGATTTCCCCC CCCCTTTATAAAGGGGGTGGAGGACACTATGCAACCTATATCCGAAAATG AAGCCAATAAAAGTTTTTGCGGAAGATTGCTTGAAAAAAGACGTTATAGC TGATATCAGCAAAAATTTGAGGACCACCAGCAAAAATTTGAGGGCCACAT TTATTTTTGTGAAATTCGATAATGGACCTCTTACGTACTAGATACTATTA GTTAAATCAGATGCAAACTTATTTTACATGCTTATCATGGGTATCAAGAA TAATCAATTGACTTTTTAACCAACCCATTTTGAAATATGTAGTAATCGAA TGTTTTGATCGGCTATGAAAAGAAAAATAGAAATTGATGATATAAAAAAA AATTAAAAAACCATTGCCCCAAAAAAATATTTGAATGTTTCCCCTAACTG ATTTTCCAGGCATATCAGCCAGCTACACCTATATTTTTATAACTAAAACT TTACCATTTATTGTCTAAACGTTTTTGGAAATTTCCCTTTATTTTGAATT GCCTCAGGTGTTATCACAAATTTTTATTACAACGTGCGTTAGTACAGCCA TCTCTATATGATTCACACGACTTTAAAAAATCCATGTTCCAATCTTTAAT ATTTAAGACAAAATCACATTCTCGAAAGCAAAAAATCTAAGGGGTACTTT AGAAAAATAGAACAAGATCTAAGGGGGGAAATAAGGGTTCAGTACAAATG GAATTCCAAAATGAGGGGGAAGAAATAGATATGAATAATTCCCTGTTTAA GGGGAGACTGGAAAAACCATCTGAATCAAAAGTTATTGAAACAATCATTC AAAATTTCTCATTTTACAGCAAAATCTTTGTCGGTGGAATACCTCCTGAT GCATCAAGAGGTATGAATATTTGTTTATATTTCTAGATACCTAAGATGTT ACAGAACTTGAAAAAAGTGAAATCTAAATGTCAAACTTTTTTGTGGTGCG CCTGGCAGATTTAGAAGTTTTTTGGTATATTTTTACTTATTAAATTGTTT CAACCAATTGTTTAGCCAATTTTGAGTGTGTTTGTGTGTAGACCTATGCA AAACGAATTAGAAAAATCATTGAAAAATATAAAAATATATGTTTTTTCTT TGCTTTTTCTTATCAAAGCACTATTATTCCAAAATTAAAAAAAGACTAAA CCATGTTACCTCTTTTTCATTTTAGATACCATCACTGAATATTTTTCAAC TTATGGAGCTGTTTCAGATGTAATTATAATGGTAGATAATGTAACAGGGC GCTCCAGGTAATATTTCTGAAGTACCATCGTACAATTTAAACCGAATAAT TCTTTCAAAATGTACCAAAATAACAAATTCCACTTAGAAAATGAATGCAT GAATTATTTCACCCATTTTATAATAATCTGTTTAAATGTTTTCTTTGCCT ACTTAGGCAAGTACTTTTTTATTTTCTGGTTTACGGACATTTGGAGATGA TCTTTTGGGGCGGAGGATGGAAAAAAATAAAAATAAAATTGTTGTTTTCA AACTTTAATGTTGGAGAAAATAAAATGTGTTTTGAGGAAACTTACATACA CAGCAGAAAATCAAAGAAAGTTTTTCAGCTGGAAAATTGTGTTGAGCGCC ATTGGAGGAAGCATATTGGGAAAAAGAGATAACTGTTTTTATACCCTTTT ATCTTCCTTTCCTGCTCTTATAAAATGAAGTTTTCTAAAAAAATCCATTT CATGGTAGATTAAACAGAATCAGAAGTGCAAAAATAAATAAAATTTCTAT GAATTTCAATTTTATTTTTATTTTATTTTTGCCAAAAAAAACGTCGGCGA TTCCGTAAACCAGAAAATAAAAAAGTAATTGCCTTATCTTGAATTTTCTT AAATTCTTTGTCCCAAAATTGATTTAGTTCCACTATGAAGTTTATATATA AGTAGTTTCATGCCACTTTGGTGACAATCTTCCTGACTGACATATAAAGT TGAGAATCTTTTGCATCATTTAATTGATTACGTATTTTTCTATCATTAGA GGATTTTGTTTCGTTACTTTCCAAGATCAATTGGCAGTGAACAAAGTTCT TGCTGCCTCTCAAAAACACAGTATAAATGGAAAAGTTGTAAGTAAACTAT TACTTATTCATCAATCTTCTCATTTTCTCTCATAACTTTAATGTTAATGC AGGTCGCCATTCTGCAGTGCTAACCTTAAAGCCCGTCTAGAATTGGAAAC ACAAAAAACATGAAGATGTAGTTTCAGCTGGTTTCAGTTGTTCAATTAAC TTTTTTAATACTTATCGCACTTCAAAGTTGTAATGAAATAGAGCTCTGTA AATTCTGTATCTTTTTTTTTTAATTCTATCTAATTTTAAAGAAGTGCCAC TGTATTATATTGACAAATTTGACATTGACAAGTTATTTTACAAATCAGGT TGATGCCAAAAGAGCTGTGCCTAAAGGACCAAATCAAAGCCAGATTCTCC GTGCAATGGTAAATAACTGCTCAGTTGTCTGTGATGGATGTGCACCTGCA CAGTGCACTCAATTACCCATGACTCGATGATAGATCCTGTCAAAAAGAAT AACAATTTGACACTTTGTACTAGATGTGTGAACCTTGGTATAAAATACTC AAGTCTATTGAATTCGTGTGCATATCTTTCGGAAAATAATTGAATAAAAT TGGGCCGTTTTGATTAGATTCGATAAAAACGAAATTAAGTCTTATTATTT TTCTCAGGGGGTTTCTTCAAATCGTGCTGATCGAAATCCAGATTGTAAAA TTTTTGTTGGGGGAGTGGCGCAAGGAACTACAGAATCAGACTTAGAAAAC TACTTCAAGGATTATGGAACGGTACATTTTATTATTTTGTTGTTATTTGT CTGGAAATGCGAAAAAGTGTCTCATTATTTTCAAAAGAAATGAAATGAGT TTTACTGAAGCCTCCTTGCATTTTTATGAGTTTTAATTGCATTTTTGGCT ATTACAAATACAGATTCGTAACAAATGCATATAAAATTTCAAAGGCTGTT AAGAACACTTTTTATTTTTTAGGTCCTTGAAGTCAAAATACCTAAAGACC AGAATACACAAAGAGCAAGAGGTAGGCTTTCAAATAAGTTTTTCAACAAA ATTTGAGGTCTATAAAGAATGACCCTCTGGTTTGAAAAAATCTTTTGTGT CATGCTTTTAAAATCGAAGGACTAATTTTCCTAATTGTTATCCAAAGTTT AGTTATTATAATGAACAGAATCTTAGGTTTGTTGAAATTCTTTTATCTTT TTTATTCTGAAAGCTAATTATGGTAAAAATTGTAAAAAGAATTCTTTAGA CAGCTTTAGAAGCATATCAAGCTGATTTAAAAAACTGACCAGTCTTGAGA TGACTGTTAAAACTGTTATTTATTGGTATTTTTTAGGATTCTCCTTTGTT TTATTTGAAACTCCTGAATGTGTGATTGCTGCTACTAAAGAAAGATACCA TCGAATAAATAATAAAACAGTAATGGTTTTTGTTTTTTTATAAAATTATG ATGATTTTTTTTTCTTTGATGTTGCATGAAATTAAATGACAAATATCTGA GATTTGGGAGGATTCTTATTAAAATGCTTTCCCAATTCACACTTGATATC AAACTTCTACAATAACTCAAAATCTTGTGAATTACAAAAGATAGGAGTAG CTGCAAGTCAGAAAAATGCAATTTTATTGATTTTGGGTGGCTGATTTTTT GTTTTTAAGATCTTTTAAACAATTTTGGAACTTCTTCCTTCCACCCATGT GCAGGTCGAGGTCAAAACAGTTCAAATCCAACACCAAAAAGGACATTCAG AAGGAAGCGATGATGGGCAATTACAAAGTAATTAATGAAACAACAATATT GTAATTATAGAAAAGTGACTTTGCTCATTTTATGGGCGTTTCTAAGAATA ATTCTAAGACATTTTCCTTGACTTTTATGCACAACTTTCAAAAATCGGAA GCTAAAGGAATTCCAATCATGTCCATCAAATATTGTTTTGCTAGAATAAG ATTAATTAAGAGGATTAATCAATTAAGTTGCCTAGGAATTGTGGTCTGCA CATAGATTGTTATGTTCTGTCATATTTACTTACTAAACGTCATTGAATGT GAGATTTTACATGCTCCTTGTTATTTTTAGGTCCACCATCACCCTTTATG AGGTCAGGTGGAGGGTTTTACAACCCCCAAGGATACCCTAGATATGTTGG AGGTAATTGCTATATTTTGTATGGAACTACACTCTACATTTTTCTTGCTC CTTTTCTTTGGAAAAAGAATTTTGATTTTCTTAAAACCATGCAATGCACC CTTTTTTTGCTTTGTCACATCAGATCACATGGCTTTCATCTATTTCTACA TAACGAAAAAAGTTAACTTTTGTCACCCACACAACACCTTTTTTGTTCAG GTCATGGAATGAACTCTCAAGGATACTATGAGAATCACCCTCCGTATGAG CCTTCCCCTAGTGGTAGCACGGGTTCAGTGGGTATGCACTATATTTTATG ATCTTGCTGCACTACAAGTGGAACACTTTCAAATTCCAAACTATCACACT ATAATTCTTATTTGAAAACATCTCGTAACATGTTTTTCTTGTCTCATATT TTCATTTTATTTTAACAAAATTAAAATGAAGATCTGGAGTTGTAAAATGT TTTCCTGTTTTTCTTTTACAGCCTCCCTCGAATCTTCTGGATATGGTGTA TCTTCTCGAGGGCAGCAAGGGCTAGATAATTATTCATATATGGCACCAAT GTATGCTGGCATGGCTGGTAAGCTTACCTTTATATCTAGTGTTGCTGAGC TATTTTCATGTATTTCTCAGTTTATTGTTTCTATATAGATTTACAAATAT TCAGTCTCCATTTTATCAGAAAAATTGGACTCGCATACAACTATAATACA AACTATAATATATAGTACAAGTAAACTAACAGTTTTTAGCAATATAAGAT ATAATGCAAAAACCTTTTTCTTTCATCCCCATTAGAGCTCTCAATTAGTG GTCGATATCCTCTCAGACCTCCCTACCATATGGCAGCTGCTAGCGGAAGT CAGGTTGGTGGATATGCACAATCTCCCAGCGCAGTAAGTCCTTCTTCGTA CAGTGATTACTCCTCAGGTGGTGGTAGTGGGGCTGGAGGTGCAACACCGG CTGCCGCTTACGCACCAAATTATGGAGCAGCTATTGCTACTCATAACAGT GTCCCCTCTGGTGTTACTCCGTTCGCTCCAGCTAGCACACCACAACCTGG ACCTGGTAGCCAATCATTTTCTCGATAA

Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000194_pilon:211656..223533-

>XLOC_035833 ID=XLOC_035833|Name=XLOC_035833|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=2430bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000194_pilon:211656..223533- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ATGATTCCCACATTTTCACAAGTACCCTTTTACGTTGGGAATCAACAATA
CCATAACAACAACAACATTGTCGACGATGCTGGATGATTCCCACATTTTC
ACAAGTACCCTTTTACGTTGGGAATCAACAATACCATAACAACAACAACA
TTGTCGACGATGCTGGCAAAATCTTTGTCGGTGGAATACCTCCTGATGCA
TCAAGAGCAAAATCTTTGTCGGTGGAATACCTCCTGATGCATCAAGAGAT
ACCATCACTGAATATTTTTCAACTTATGGAGCTGTTTCAGATGTAATTAT
AATGGTAGATAATGTAACAGGGCGCTCCAGATACCATCACTGAATATTTT
TCAACTTATGGAGCTGTTTCAGATGTAATTATAATGGTAGATAATGTAAC
AGGGCGCTCCAGAGGATTTTGTTTCGTTACTTTCCAAGATCAATTGGCAG
TGAACAAAGTTCTTGCTGCCTCTCAAAAACACAGTATAAATGGAAAAGTT
AGGATTTTGTTTCGTTACTTTCCAAGATCAATTGGCAGTGAACAAAGTTC
TTGCTGCCTCTCAAAAACACAGTATAAATGGAAAAGTTGTTGATGCCAAA
AGAGCTGTGCCTAAAGGACCAAATCAAAGCCAGATTCTCCGTGCAATGGT
TGATGCCAAAAGAGCTGTGCCTAAAGGACCAAATCAAAGCCAGATTCTCC
GTGCAATGGGGGTTTCTTCAAATCGTGCTGATCGAAATCCAGATTGTAAA
ATTTTTGTTGGGGGAGTGGCGCAAGGAACTACAGAATCAGACTTAGAAAA
CTACTTCAAGGATTATGGAACGGGGGTTTCTTCAAATCGTGCTGATCGAA
ATCCAGATTGTAAAATTTTTGTTGGGGGAGTGGCGCAAGGAACTACAGAA
TCAGACTTAGAAAACTACTTCAAGGATTATGGAACGGTCCTTGAAGTCAA
AATACCTAAAGACCAGAATACACAAAGAGCAAGAGGTCCTTGAAGTCAAA
ATACCTAAAGACCAGAATACACAAAGAGCAAGAGGATTCTCCTTTGTTTT
ATTTGAAACTCCTGAATGTGTGATTGCTGCTACTAAAGAAAGATACCATC
GAATAAATAATAAAACAGATTCTCCTTTGTTTTATTTGAAACTCCTGAAT
GTGTGATTGCTGCTACTAAAGAAAGATACCATCGAATAAATAATAAAACA
GTCGAGGTCAAAACAGTTCAAATCCAACACCAAAAAGGACATTCAGAAGG
AAGCGATGATGGGCAATTACAAAGTCGAGGTCAAAACAGTTCAAATCCAA
CACCAAAAAGGACATTCAGAAGGAAGCGATGATGGGCAATTACAAAGTCC
ACCATCACCCTTTATGAGGTCAGGTGGAGGGTTTTACAACCCCCAAGGAT
ACCCTAGATATGTTGGAGGTCCACCATCACCCTTTATGAGGTCAGGTGGA
GGGTTTTACAACCCCCAAGGATACCCTAGATATGTTGGAGGTCATGGAAT
GAACTCTCAAGGATACTATGAGAATCACCCTCCGTATGAGCCTTCCCCTA
GTGGTAGCACGGGTTCAGTGGGTCATGGAATGAACTCTCAAGGATACTAT
GAGAATCACCCTCCGTATGAGCCTTCCCCTAGTGGTAGCACGGGTTCAGT
GGCCTCCCTCGAATCTTCTGGATATGGTGTATCTTCTCGAGGGCAGCAAG
GGCTAGATAATTATTCATATATGGCACCAATGTATGCTGGCATGGCTGCC
TCCCTCGAATCTTCTGGATATGGTGTATCTTCTCGAGGGCAGCAAGGGCT
AGATAATTATTCATATATGGCACCAATGTATGCTGGCATGGCTGAGCTCT
CAATTAGTGGTCGATATCCTCTCAGACCTCCCTACCATATGGCAGCTGCT
AGCGGAAGTCAGGTTGGTGGATATGCACAATCTCCCAGCGCAGTAAGTCC
TTCTTCGTACAGTGATTACTCCTCAGGTGGTGGTAGTGGGGCTGGAGGTG
CAACACCGGCTGCCGCTTACGCACCAAATTATGGAGCAGCTATTGCTACT
CATAACAGTGTCCCCTCTGGTGTTACTCCGTTCGCTCCAGCTAGCACACC
ACAACCTGGACCTGGTAGCCAATCATTTTCTCGATAAAGCTCTCAATTAG
TGGTCGATATCCTCTCAGACCTCCCTACCATATGGCAGCTGCTAGCGGAA
GTCAGGTTGGTGGATATGCACAATCTCCCAGCGCAGTAAGTCCTTCTTCG
TACAGTGATTACTCCTCAGGTGGTGGTAGTGGGGCTGGAGGTGCAACACC
GGCTGCCGCTTACGCACCAAATTATGGAGCAGCTATTGCTACTCATAACA
GTGTCCCCTCTGGTGTTACTCCGTTCGCTCCAGCTAGCACACCACAACCT
GGACCTGGTAGCCAATCATTTTCTCGATAA
Gene-mRNA-Prot
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
XLOC_035833XLOC_035833-proteinClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonpolypeptide
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
sc0000194_pilongenomesc0000194_pilon:211656..223533 -
Properties
Property NameValue
Aaloc925-1215:292
Aaloc829-921:606
Aaloc748-825:877
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