XLOC_035824 (mRNA) -

Overview
NameXLOC_035824
Unique NameXLOC_035824
TypemRNA
OrganismClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon (Jellyfish)

Sequence
The following sequences are available for this feature:

mRNA from alignment at sc0000194_pilon:444433..452452-

Legend: polypeptideCDS
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>XLOC_035824 ID=XLOC_035824|Name=XLOC_035824|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=8020bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000194_pilon:444433..452452- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ATGGTTCGAACACGTGCTGATAATTGTTCAAGAAAAGGTAAATTTAATTT ATTTTGTCTTTAAATTATTTTTGTTAATTTCATATTTTAACCACCATTTT ATTTGCTTTGGGCTGGGTGTTCATAAAATGGCAGGTCTAATCCAGGCTTA ATTAATCGATATTATTGATAATCGGGAGTAATCGATAAATAATCAATAAG TAATCTATGGATAAGATATCGATTATCCAACCCTTGAAAACTAGATCCGC GTACTGCCGGATAGGTTATTTCCTGGAAATTTTGCTGGACCTCAAACACT GATCCATTTGCATGTGCAGATATGCAGATATGTACATATTTTTACTTTAG CGTATTGACAAGACCTTAAAAATCAAAGCGCTGTCTCACAGGAATTGAAT GACAAAATTTGGTTGGTTGATATTCTGGCTGCTGCACGTTCGCAATCCAT CATTTGGTCTAATTTTAAGTTTTCAAGTTTTAATTAATTGTCTTGGGAAC TTGAGAGCTAGGAACATTTATTTGGCGAGTTCCTGTATTTGTACGGAGCC GCAATCAAAAAAATCATAACAACACTCAATAAAAAATGGCGTTTGTGTCT TTTCTCACTTTTTTAGCCTAGACGATGTAGCAAAATAGTAAGTATAAGCA CACTGGGCTTTTAATTGGCTGAAAAGTTTTTTTGCGTCGGAAAAACTTTT TGAAACTATCAGCAATGATTGACAGTCTAAACTTAAACTCCTATATGAGG ATTAGAAACTAGGTTAATTTTACCTCTTTTATCTTTTCCTTGACAACAAT ACAATGCTGACAAGTTGACACAACATATGCGTACATGTACATTGACAAGT AATCCCTGAGAGAAGATTTTATAGAAATCTGCAACAAAAACGAAAGTGGT CTTTTCTACTGATTGCTTCCCAGCCCTCCAGTGTAGACCTAACTCTTCAT ACAAAAATTACGGGAAACGCATATTTGGACTTTGTACCCTATGCTGCACT CAAGCACTTGGGTCAAAATCCCGCAAAGGCGGGACAAAAATCAGTTTTTT GAAGTTTGCAAAAAAACGCCACATAGAAGATCTTTCAAATTCAGTATGTG AATAGAGCAGTAAAAATTACAACTTTTCTATTTTTCCTTTTTTTGCAAAA GTTCTAGTAATGAAAATAAAGGGATAATGTTTATTGAATACTATCCATTG ATGATCCGCGGCACTATCGTAAAGCTAGAATCGCTTCGCTTACTCTTCGC TTGAGAAAATGATTGACAGATTGAAGTTTTTCATCCCCGCGATGCGCGCC GCGCGGGAGCTCGGGCACTCTGCGAGAGTTCTTGGCTCAATCCTCGGACC GCGCTAAAATGGTAGACTGAGCCGTGATAGATCATTTCGATGGAAGTTGT TGGAATGTTTACAAGGCTCTTGACAGAATATTGTTTGTTTTATTGTCAAT GATGACAGTGCCGTTATTAATTTTGTTAGATCTGACAAATTGATGTTTGT AAGTGCACTTTATAGTTTTGATTCCCATTGAAGAATCATATTCTGGTTTT CATGTTATTAGATGCTGTTTTAGAGCTTTAGAGCTACACTGCCCTCCTTC ACAGCTACTTACCAAATTTCCAACAATGAGGTTGTCGCATTTCAAATGGC CCATTTTTTTAGCACCCGTGGCCTTTCAGTGCCTTGCACGACAGGCGGCT GTAAAATCCCACCCTTCATATATTTGTTTCAATCCATGATCTGTGGCTTA GATTTTTTCCTATCTTCAATTTACTGAAGAAAGCGGGAGTTTGATAGGAG AGTTAGATTGTCAACAAAGTGCCGTAAAAAATCATTGAATAAAAGAAGAA CTTGAAATCTTAAATATTCTCATTTTGAAGAATAGGTGCAAAAAAGTGAA ACATAGAAAAGTTTCATTTTTCATTGCATTAATCGAAATGGGGGATTTGG AAATTTTCTATGTTTAGTTTTTTGCACAAACCCCTGTAACTATGGGCAAG CACCCCGTTGCTAACTGTTGGCTTGAAATCAGAAATAAAACCACCCAAAA CGAAAGAAAAATCGGCCCGTACTCAAAATCCCGTAATCTTGATATACAAG TTTAAGTCTATACTGATTGACCAAAATGTTAAATGAAAAGTATCCAGCGC ATTTTTTATCTTCTTACCTTCTTCATCATCAATGAAGCACTGAAATTATA CTGAAGTTATGCACATTAGATATTCTTATAATTATTGATATTCACTGAAA CACCGTTTGTTGTACATTGCGGTGGAGTGTATGACGTAACTCGCGCTGCA ACTAACTCACCTTCTGTTGGAAGAACATATTAGGCGTTTTTGCGATACCA CCCTCGAAGCAGCGGGCGCCTCTGTCTTTCCACAACTCTTTCCACCATTT TTAGATATTCAAAAGGGCGCCATAATCTTGGAAGATAATTTGTTTTGGTC TCCGGCTTTGGGAAGTAGTAATGTTTTTGGTTGTTTTAGATGGAAAATGG TAAGAAACTAAATTTAAAAGTGTCATTTAGTTTTTGCTGGCTTATAGAAT GGCTGGATCCTGGATGGTTTCCCTAACTGTCTTTGTTGTTGCAAACTTTT CTGAAAGCTTGATTTCCTAGTGTGACTAACTGTCACGGTATCGATTGTTG ATAGATGAACTATTTGATCGATGATCAATCAATCTTTGATCAATGATTAA TTTAATCAAAGTATAATCGATACATAACTGATAGACAATTGATGAGAAAA TTGATTGATGGATGATTGATAAATAATCAAGGTTTGAAAAAATATCGATT ACCTATTGATTATATCGGATAATCGATATCTTATCCTTCGATTACTTATT GATTATTTATCAATTACTCCCGATTATCGATTATATCGATTAACTAAGCC TGGGCTAACGTGATGGCAAACCATAAATTTGTTTTGGATTTTTGCCTTTG AAAACCTGGCTCGAATATGCGCTGAAGTTTGAGTCATGTTCGGGACTTTT CAAAGTTCAAACTCACTAAGTGAAGTGCCCTGAAAAAGCTTTACACTGTG GGTCATATGTCAAGCTGGTTATTTTGTTTATGCTAACCCCCAACCCCTTC AAAAATATCACTGTTCTCAGGTAATGAAACTTAATCTCAAGATATTTGAC CCTCCCCGTTGTTTTGTCAACCATATTTACTTTGGCTACAGCTCGCATAA TTCCTATCGTTTATGCTAGAGGTAGAACTTTTTTTAATCAGGATGTCATG TCGAATAATTAAAAAAATCCAAAAATAGGATGATGTGACAACAGATGAAT CAGATATCATTTATCTTTGGAAGCCATAAGGTAGCCTGGGAATCCAAGCG TTAAATTTTGTTCACGGCCTAGTTTATGATATCTTTGCTGCTTGTTTAAC GTTTGGCACAGGTAACACTCCTGCAGGGAGATTTTTCCGACTGCAATTCA GGTTCAGTCTGATTGGCCAGATTTTTTGCGTATTACTTAGCAGTATTTTT GCGCGCATTTTGTTAATTTCAATGCGCGCACATAATTTATGGAAAAAGCT GACTCTGCTGGAAAAAGGAAAACAAATGAAGCTTATGAAAAAGTTTTTAT GGTAAGTTGATTATGTGTGTTTGCATGGGTTTCCAAAGTTCAGAAAGTCT TTACAACATTATGTGTCCAATTAAATCTACCTGCACCAAGCTCTAATATC TTAGCACTTTGTGATGTGAGTTATTTTTTGTTGGACCTACCCCGGTGGGG TGGAGGTTCTATAAATTCACCTCTGTCCGTCCGTCCGTTCGTTACCAGCT TTTCTCGAGATTGAATCATAGGAATCATTTGTTTTTTGGTACAAAGGTGC AAAACGATGGTGGCCAAAATGTGACGGAGCCCAATTTTCGAAAACAAATG GGCAAATTTGGGCCAAAAAACGGCTAAAAAACGGGTTTTTTGGACTTTGT GAAAAATTGGATCATTAATTTTTTCTGATTTTTTGCATGAAAGTAGGGTA CCATCATAGGTAAAAGATGGCTCAAGCAGATTTTTGCAAAAAAATTTATT TGGCTTAAACAACGCATGTTTATCTATAAGAATCACTATTAATAAGCATA CATCAATGTTCTTAGTCAAATTACTCAATTTTTTTATGAGATAGATGTTT TTTTGCTCACGAGGGCTTACTTTTGAAGCATATGTGTGTTGAAACATGAA ATTTTGGTTGCTTGGCATGTTTTTAATAGAAAAGCTGATAAAATTCGATA TTTTTTTATAAGCATATTATCAATTACTTAGGTATTAGCTTTTCTCGAGA TTGGCTCTTTCATTCTTTATGATTTTTTGCACAAAGATGCATAGCTATAA ACCCTCGAATGTGACTGAGCCCGATTTTCGAAAAAAAAATGTTTTTGGGC AAATTTGGTCCAAAAAACGTTTTTTTTTTATAAGAAACAAATGACTAATT TTAATAAATCGTCACTATTTGTGTTCTGAATGATTGTTTAAAGGCAATAG CGCTATACTTATAGTAGGGGTCCGATTTGGTGGCACTTCCATGGTATACT CTGAAATACATGCTGATGTCAGCCCGAAAGCTGATTGGCTTAACCGACAG TTATACGTGGTTTAAGAGTATAGCTATAAACTTTGTTATGTTTTCAACAG TAAACGAAAGTGAATGAAGACAAAATGTAAACAAAAAGATTGCAAAGAAG TTTTCGAAAAAATTCGCAATAGAATGTCTTCATTTAAAAATAGACACACT CGATTTCATATTTTTTTTCTTTCAGTTTTATGTAAGTTTTTTTGTGTTGT TGTTGAGCATTATAGTAAATTATATTCACTTTTTTGAATATATTTTTTGG AATAAAGTCACTTTTGGTTTTTGTTATGATCCAGCACTCCTAAATCAGTC AGGAACAATTGCAAATTAGGCTATGTTCGCTGATACTGGCCTAACTTGGA TACCATGGCTTAATTAAGCCAGAAATTGTAGCCTAATTAGGCTGGAAGGA ACAAAATTCCAATTTTTGACTTGGATTTCAAAATCCGCGTCAATATTTAG CTTTAAATGTCAAATACACGTTGTTGTTTTTTATAAGGAACACGTTTATA AGGAACTCGAGGCTGAAAATGGTTCAAAAATTAAGGAATTGTTAAGGAAC TGCTCAGGCTGAGAATAAGTGGATTTGAAATTGATCTACCTTATTGGGAC TAATTTGACCAAATTTTGATCTTTCAAGGGGCAAAAAGTTCAAAATTTCC TATGTAGTAAGGAACTTGATAAGGAACTTTGAGACTGAAATTCTCTGTAA AAATTAGGAACTCCAGGCTCAGAGCAAAGTTAAGGTTCCTTATAAAAAAA AAACGTGTACTTATTTATTTGAATAAGTTCCGAATGTTTTTTGGGTAAAA TTTGAGCGGACTGAGAAAATATTCAATTTTTAAAATATTATGCTGTTTCA GCAAAATTGTGTTTACATATATACAGCAGTACAGTCGAAATTATTTCAAG ATTAATGTAAACAAGCGTAATCCGAACTTGGGTTTAGAAACATGTTTTAT CTATATCTATTTTTTATCTTCATAATAAACTTGTTTTGTACACTTTTAGA TTTTATAAACAACCTTGTCAGCTATAATAATATATAAAAAAACGTAAAAA AGACCTTCCTCAATTTAAATATTTAATCAATCTATCAAGTGTAAATTTTA ATAACATATCTTTAAAGGGACATTAAAGTAGTAAAATGTAAACATTGCGC GAACCACGTGTCATTAAAAAGAACAATCAAAATCACGTGTCCAAAACAAA CTTGTAAAACAATTGAACAATCAAAATTAGCCATATTTGGTTTGATTTTT TATTTTGACATGTGACATTTGTTTTGATTTTGTATGCTGCATACAGTTTG TTTACAAATTTCGCAAGTACTGTTATGTCCCTTTAAGATCAGCAAAACCA AAAGACTATACTTTTAAAGCCAACGATAACAACAATATATTATAATACTA TTTTTTTTTCCTTTTTCAGACAAAAATTGGCGCGCTGCATGTAGAACTTA ATCGGCTTAATTTGGCTATCATAGCCAAATTAAGCTAATTTTAATAAGAT AATCACATCTTTTCACTCCGCTCTAAAAAGAGAAAAGTTTTTCGCTTTAA ATACTCTTCTTAGTATAAGTAACAAGTCCATGTAGCAAGATTGACGCGGA TTTTATTTGTTCTCAAGATATTTAGGTTTGTATATTTCATATATCCAAAT TAAGCCATTAATATCCTAACTAGGATATAAATTCTGGCCTAATTAGGCTA ACATCCTAGTTTGGCCATCATAGCCTAATTTGCAATAGTTCCTGACTGTA AATACTCCTCCGTATGGATGTTTTTGCCAATGCTAGATCAGCATTTCATA AATATACCATGCGTCGTTCCCTTTAACCTTCATGCTCATGTAGATATCAA TTATATATGTGTTAAATGCATAACCAGGTAGGTCCATAAAAGTATCACTT GTTTTTTCTAAGATTATGTGCTTGGATTCCCAGGCTAGCCATAATACAGT TAGCTACACTAGCGCTCCATCTAAGATATGTAACAAAGATTAATGCTATG AAAGTGCTACAGCCTGCTTTAGCATTTAATTGATTCGCGAGCAAAACTTC TATTGTGTTACGGGATTTATGAAAAATTACAAAATTACAAAAAGACTTGT ATACTGGTTATATAGTTTTTACAGATTAGAATAACTTTAAGAAGTTGGAA TAAATTCACTTAACAGGTCAATGTATTTTTCCTGACCAGAAAAGCTTTTT GAGGAGCTTTCTTCCTCACACTAATGAAAATGTGTTTTCAAATGAAATAT TTTTGTTTATTCTACAGCTGTCGCTTCAAAGGCTCCGAGGAAGAATTTCA ATGCAGGAGGAAGTAGTAGTTCAAGTTCTGCTGCCGATGGTTCACAAAAT ACCAGTTTCAATGTTGTCAATCATGCTAAAATGTGGCCAGCTCCAAAATG GCAAAAAGGTAAGTTTATTTCATATTCAGAAAGGATTTGATTTTTCTATT TTCTAGTGACTTATGTTTTTTATGCAACATTTTCTGCTTGGGACTTTGTA TGTGAGAAATAAACAAATATACTGGGTGACCCAGAAAAAGGTATAAGTGT TTGATGGTTAACTGTGTCCAAAATAATGTGAAGTTTCAATGAATTTTTTG CCATTGTAAAGAGAAAAGGCAAACTTAAAATTTGGCAATTTGTTGTTTAG AAATGGCTAGCAAAACAAGAATTAGTGCACACTTAAAGTAAATGGACCTG AGATTGAGGTCTGAATCGATAATAAACAATCATCGAGCTTGCAAAATCAT GTGTTAAAACGAATCATCAAATCAAAATTGTTCTATTTCTCAATAGACTG TCTTCCTTAAATACATAATAACTAATTTACATAAAAATATTGAAAAATAA TTGAACTAATGATCTACATTTTTGATGGATTAAATATTAAGTTTCTATTA CCTCCATAAGATCAGCAAAAATCTTAGTATAAAGATCTACTTTAATATTT ATTAATCCTCGAAAAAAATAAACAAGAAAAACAAAACTTTGAGACATTTT TAAAGCAAAGATTACTCAACATACACAAAATCTTTATGCTTTCCAGGCAT CGGGTCATTTTTTCAAAAACGAGAAAACACCAGCAACGAAAACGAAAGTT CTTCCGGAAGTAGTTCGGCAGCATCTTCGCAAAGTCCGACAAAAGACGAG CGAAAAGAGGAAACGAATGACGTCATCGTATTAGAGGAGAAAACTGATAA TTCTCCCGACGGTGCTACAATTGACACCGAGAATGCTTCAGACAAAAACG AGAACACTTCCGACAAAGAAAACGATAAAGATATTAACGATAATGAACTA CGGAAAACAGTGAAACGACCCAGTGGTAAACAAAAAGTGAGCGTTTCAGG AAAATCTCTCAATCAATCGAATAAAAAGAAACGGAGAGTGGTATTACATG ATAGCAGTGATGAAGAATAA

Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000194_pilon:444433..452452-

>XLOC_035824 ID=XLOC_035824|Name=XLOC_035824|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=1104bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000194_pilon:444433..452452- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ATGGTTCGAACACGTGCTGATAATTGTTCAAGAAAAGATGGTTCGAACAC
GTGCTGATAATTGTTCAAGAAAAGCTGTCGCTTCAAAGGCTCCGAGGAAG
AATTTCAATGCAGGAGGAAGTAGTAGTTCAAGTTCTGCTGCCGATGGTTC
ACAAAATACCAGTTTCAATGTTGTCAATCATGCTAAAATGTGGCCAGCTC
CAAAATGGCAAAAAGCTGTCGCTTCAAAGGCTCCGAGGAAGAATTTCAAT
GCAGGAGGAAGTAGTAGTTCAAGTTCTGCTGCCGATGGTTCACAAAATAC
CAGTTTCAATGTTGTCAATCATGCTAAAATGTGGCCAGCTCCAAAATGGC
AAAAAGGCATCGGGTCATTTTTTCAAAAACGAGAAAACACCAGCAACGAA
AACGAAAGTTCTTCCGGAAGTAGTTCGGCAGCATCTTCGCAAAGTCCGAC
AAAAGACGAGCGAAAAGAGGAAACGAATGACGTCATCGTATTAGAGGAGA
AAACTGATAATTCTCCCGACGGTGCTACAATTGACACCGAGAATGCTTCA
GACAAAAACGAGAACACTTCCGACAAAGAAAACGATAAAGATATTAACGA
TAATGAACTACGGAAAACAGTGAAACGACCCAGTGGTAAACAAAAAGTGA
GCGTTTCAGGAAAATCTCTCAATCAATCGAATAAAAAGAAACGGAGAGTG
GTATTACATGATAGCAGTGATGAAGAATAAGCATCGGGTCATTTTTTCAA
AAACGAGAAAACACCAGCAACGAAAACGAAAGTTCTTCCGGAAGTAGTTC
GGCAGCATCTTCGCAAAGTCCGACAAAAGACGAGCGAAAAGAGGAAACGA
ATGACGTCATCGTATTAGAGGAGAAAACTGATAATTCTCCCGACGGTGCT
ACAATTGACACCGAGAATGCTTCAGACAAAAACGAGAACACTTCCGACAA
AGAAAACGATAAAGATATTAACGATAATGAACTACGGAAAACAGTGAAAC
GACCCAGTGGTAAACAAAAAGTGAGCGTTTCAGGAAAATCTCTCAATCAA
TCGAATAAAAAGAAACGGAGAGTGGTATTACATGATAGCAGTGATGAAGA
ATAA
Gene-mRNA-Prot
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
XLOC_035824XLOC_035824-proteinClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonpolypeptide
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
sc0000194_pilongenomesc0000194_pilon:444433..452452 -
Properties
Property NameValue
Aaloc181-552:373
Aaloc40-177:1152
Aaloc1-36:8021