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Sequence
The following sequences are available for this feature:
mRNA from alignment at sc0000194_pilon:444433..452452- Legend: polypeptideCDS Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >XLOC_035824 ID=XLOC_035824|Name=XLOC_035824|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=8020bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000194_pilon:444433..452452- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon) ATGGTTCGAACACGTGCTGATAATTGTTCAAGAAAAGGTAAATTTAATTT
ATTTTGTCTTTAAATTATTTTTGTTAATTTCATATTTTAACCACCATTTT
ATTTGCTTTGGGCTGGGTGTTCATAAAATGGCAGGTCTAATCCAGGCTTA
ATTAATCGATATTATTGATAATCGGGAGTAATCGATAAATAATCAATAAG
TAATCTATGGATAAGATATCGATTATCCAACCCTTGAAAACTAGATCCGC
GTACTGCCGGATAGGTTATTTCCTGGAAATTTTGCTGGACCTCAAACACT
GATCCATTTGCATGTGCAGATATGCAGATATGTACATATTTTTACTTTAG
CGTATTGACAAGACCTTAAAAATCAAAGCGCTGTCTCACAGGAATTGAAT
GACAAAATTTGGTTGGTTGATATTCTGGCTGCTGCACGTTCGCAATCCAT
CATTTGGTCTAATTTTAAGTTTTCAAGTTTTAATTAATTGTCTTGGGAAC
TTGAGAGCTAGGAACATTTATTTGGCGAGTTCCTGTATTTGTACGGAGCC
GCAATCAAAAAAATCATAACAACACTCAATAAAAAATGGCGTTTGTGTCT
TTTCTCACTTTTTTAGCCTAGACGATGTAGCAAAATAGTAAGTATAAGCA
CACTGGGCTTTTAATTGGCTGAAAAGTTTTTTTGCGTCGGAAAAACTTTT
TGAAACTATCAGCAATGATTGACAGTCTAAACTTAAACTCCTATATGAGG
ATTAGAAACTAGGTTAATTTTACCTCTTTTATCTTTTCCTTGACAACAAT
ACAATGCTGACAAGTTGACACAACATATGCGTACATGTACATTGACAAGT
AATCCCTGAGAGAAGATTTTATAGAAATCTGCAACAAAAACGAAAGTGGT
CTTTTCTACTGATTGCTTCCCAGCCCTCCAGTGTAGACCTAACTCTTCAT
ACAAAAATTACGGGAAACGCATATTTGGACTTTGTACCCTATGCTGCACT
CAAGCACTTGGGTCAAAATCCCGCAAAGGCGGGACAAAAATCAGTTTTTT
GAAGTTTGCAAAAAAACGCCACATAGAAGATCTTTCAAATTCAGTATGTG
AATAGAGCAGTAAAAATTACAACTTTTCTATTTTTCCTTTTTTTGCAAAA
GTTCTAGTAATGAAAATAAAGGGATAATGTTTATTGAATACTATCCATTG
ATGATCCGCGGCACTATCGTAAAGCTAGAATCGCTTCGCTTACTCTTCGC
TTGAGAAAATGATTGACAGATTGAAGTTTTTCATCCCCGCGATGCGCGCC
GCGCGGGAGCTCGGGCACTCTGCGAGAGTTCTTGGCTCAATCCTCGGACC
GCGCTAAAATGGTAGACTGAGCCGTGATAGATCATTTCGATGGAAGTTGT
TGGAATGTTTACAAGGCTCTTGACAGAATATTGTTTGTTTTATTGTCAAT
GATGACAGTGCCGTTATTAATTTTGTTAGATCTGACAAATTGATGTTTGT
AAGTGCACTTTATAGTTTTGATTCCCATTGAAGAATCATATTCTGGTTTT
CATGTTATTAGATGCTGTTTTAGAGCTTTAGAGCTACACTGCCCTCCTTC
ACAGCTACTTACCAAATTTCCAACAATGAGGTTGTCGCATTTCAAATGGC
CCATTTTTTTAGCACCCGTGGCCTTTCAGTGCCTTGCACGACAGGCGGCT
GTAAAATCCCACCCTTCATATATTTGTTTCAATCCATGATCTGTGGCTTA
GATTTTTTCCTATCTTCAATTTACTGAAGAAAGCGGGAGTTTGATAGGAG
AGTTAGATTGTCAACAAAGTGCCGTAAAAAATCATTGAATAAAAGAAGAA
CTTGAAATCTTAAATATTCTCATTTTGAAGAATAGGTGCAAAAAAGTGAA
ACATAGAAAAGTTTCATTTTTCATTGCATTAATCGAAATGGGGGATTTGG
AAATTTTCTATGTTTAGTTTTTTGCACAAACCCCTGTAACTATGGGCAAG
CACCCCGTTGCTAACTGTTGGCTTGAAATCAGAAATAAAACCACCCAAAA
CGAAAGAAAAATCGGCCCGTACTCAAAATCCCGTAATCTTGATATACAAG
TTTAAGTCTATACTGATTGACCAAAATGTTAAATGAAAAGTATCCAGCGC
ATTTTTTATCTTCTTACCTTCTTCATCATCAATGAAGCACTGAAATTATA
CTGAAGTTATGCACATTAGATATTCTTATAATTATTGATATTCACTGAAA
CACCGTTTGTTGTACATTGCGGTGGAGTGTATGACGTAACTCGCGCTGCA
ACTAACTCACCTTCTGTTGGAAGAACATATTAGGCGTTTTTGCGATACCA
CCCTCGAAGCAGCGGGCGCCTCTGTCTTTCCACAACTCTTTCCACCATTT
TTAGATATTCAAAAGGGCGCCATAATCTTGGAAGATAATTTGTTTTGGTC
TCCGGCTTTGGGAAGTAGTAATGTTTTTGGTTGTTTTAGATGGAAAATGG
TAAGAAACTAAATTTAAAAGTGTCATTTAGTTTTTGCTGGCTTATAGAAT
GGCTGGATCCTGGATGGTTTCCCTAACTGTCTTTGTTGTTGCAAACTTTT
CTGAAAGCTTGATTTCCTAGTGTGACTAACTGTCACGGTATCGATTGTTG
ATAGATGAACTATTTGATCGATGATCAATCAATCTTTGATCAATGATTAA
TTTAATCAAAGTATAATCGATACATAACTGATAGACAATTGATGAGAAAA
TTGATTGATGGATGATTGATAAATAATCAAGGTTTGAAAAAATATCGATT
ACCTATTGATTATATCGGATAATCGATATCTTATCCTTCGATTACTTATT
GATTATTTATCAATTACTCCCGATTATCGATTATATCGATTAACTAAGCC
TGGGCTAACGTGATGGCAAACCATAAATTTGTTTTGGATTTTTGCCTTTG
AAAACCTGGCTCGAATATGCGCTGAAGTTTGAGTCATGTTCGGGACTTTT
CAAAGTTCAAACTCACTAAGTGAAGTGCCCTGAAAAAGCTTTACACTGTG
GGTCATATGTCAAGCTGGTTATTTTGTTTATGCTAACCCCCAACCCCTTC
AAAAATATCACTGTTCTCAGGTAATGAAACTTAATCTCAAGATATTTGAC
CCTCCCCGTTGTTTTGTCAACCATATTTACTTTGGCTACAGCTCGCATAA
TTCCTATCGTTTATGCTAGAGGTAGAACTTTTTTTAATCAGGATGTCATG
TCGAATAATTAAAAAAATCCAAAAATAGGATGATGTGACAACAGATGAAT
CAGATATCATTTATCTTTGGAAGCCATAAGGTAGCCTGGGAATCCAAGCG
TTAAATTTTGTTCACGGCCTAGTTTATGATATCTTTGCTGCTTGTTTAAC
GTTTGGCACAGGTAACACTCCTGCAGGGAGATTTTTCCGACTGCAATTCA
GGTTCAGTCTGATTGGCCAGATTTTTTGCGTATTACTTAGCAGTATTTTT
GCGCGCATTTTGTTAATTTCAATGCGCGCACATAATTTATGGAAAAAGCT
GACTCTGCTGGAAAAAGGAAAACAAATGAAGCTTATGAAAAAGTTTTTAT
GGTAAGTTGATTATGTGTGTTTGCATGGGTTTCCAAAGTTCAGAAAGTCT
TTACAACATTATGTGTCCAATTAAATCTACCTGCACCAAGCTCTAATATC
TTAGCACTTTGTGATGTGAGTTATTTTTTGTTGGACCTACCCCGGTGGGG
TGGAGGTTCTATAAATTCACCTCTGTCCGTCCGTCCGTTCGTTACCAGCT
TTTCTCGAGATTGAATCATAGGAATCATTTGTTTTTTGGTACAAAGGTGC
AAAACGATGGTGGCCAAAATGTGACGGAGCCCAATTTTCGAAAACAAATG
GGCAAATTTGGGCCAAAAAACGGCTAAAAAACGGGTTTTTTGGACTTTGT
GAAAAATTGGATCATTAATTTTTTCTGATTTTTTGCATGAAAGTAGGGTA
CCATCATAGGTAAAAGATGGCTCAAGCAGATTTTTGCAAAAAAATTTATT
TGGCTTAAACAACGCATGTTTATCTATAAGAATCACTATTAATAAGCATA
CATCAATGTTCTTAGTCAAATTACTCAATTTTTTTATGAGATAGATGTTT
TTTTGCTCACGAGGGCTTACTTTTGAAGCATATGTGTGTTGAAACATGAA
ATTTTGGTTGCTTGGCATGTTTTTAATAGAAAAGCTGATAAAATTCGATA
TTTTTTTATAAGCATATTATCAATTACTTAGGTATTAGCTTTTCTCGAGA
TTGGCTCTTTCATTCTTTATGATTTTTTGCACAAAGATGCATAGCTATAA
ACCCTCGAATGTGACTGAGCCCGATTTTCGAAAAAAAAATGTTTTTGGGC
AAATTTGGTCCAAAAAACGTTTTTTTTTTATAAGAAACAAATGACTAATT
TTAATAAATCGTCACTATTTGTGTTCTGAATGATTGTTTAAAGGCAATAG
CGCTATACTTATAGTAGGGGTCCGATTTGGTGGCACTTCCATGGTATACT
CTGAAATACATGCTGATGTCAGCCCGAAAGCTGATTGGCTTAACCGACAG
TTATACGTGGTTTAAGAGTATAGCTATAAACTTTGTTATGTTTTCAACAG
TAAACGAAAGTGAATGAAGACAAAATGTAAACAAAAAGATTGCAAAGAAG
TTTTCGAAAAAATTCGCAATAGAATGTCTTCATTTAAAAATAGACACACT
CGATTTCATATTTTTTTTCTTTCAGTTTTATGTAAGTTTTTTTGTGTTGT
TGTTGAGCATTATAGTAAATTATATTCACTTTTTTGAATATATTTTTTGG
AATAAAGTCACTTTTGGTTTTTGTTATGATCCAGCACTCCTAAATCAGTC
AGGAACAATTGCAAATTAGGCTATGTTCGCTGATACTGGCCTAACTTGGA
TACCATGGCTTAATTAAGCCAGAAATTGTAGCCTAATTAGGCTGGAAGGA
ACAAAATTCCAATTTTTGACTTGGATTTCAAAATCCGCGTCAATATTTAG
CTTTAAATGTCAAATACACGTTGTTGTTTTTTATAAGGAACACGTTTATA
AGGAACTCGAGGCTGAAAATGGTTCAAAAATTAAGGAATTGTTAAGGAAC
TGCTCAGGCTGAGAATAAGTGGATTTGAAATTGATCTACCTTATTGGGAC
TAATTTGACCAAATTTTGATCTTTCAAGGGGCAAAAAGTTCAAAATTTCC
TATGTAGTAAGGAACTTGATAAGGAACTTTGAGACTGAAATTCTCTGTAA
AAATTAGGAACTCCAGGCTCAGAGCAAAGTTAAGGTTCCTTATAAAAAAA
AAACGTGTACTTATTTATTTGAATAAGTTCCGAATGTTTTTTGGGTAAAA
TTTGAGCGGACTGAGAAAATATTCAATTTTTAAAATATTATGCTGTTTCA
GCAAAATTGTGTTTACATATATACAGCAGTACAGTCGAAATTATTTCAAG
ATTAATGTAAACAAGCGTAATCCGAACTTGGGTTTAGAAACATGTTTTAT
CTATATCTATTTTTTATCTTCATAATAAACTTGTTTTGTACACTTTTAGA
TTTTATAAACAACCTTGTCAGCTATAATAATATATAAAAAAACGTAAAAA
AGACCTTCCTCAATTTAAATATTTAATCAATCTATCAAGTGTAAATTTTA
ATAACATATCTTTAAAGGGACATTAAAGTAGTAAAATGTAAACATTGCGC
GAACCACGTGTCATTAAAAAGAACAATCAAAATCACGTGTCCAAAACAAA
CTTGTAAAACAATTGAACAATCAAAATTAGCCATATTTGGTTTGATTTTT
TATTTTGACATGTGACATTTGTTTTGATTTTGTATGCTGCATACAGTTTG
TTTACAAATTTCGCAAGTACTGTTATGTCCCTTTAAGATCAGCAAAACCA
AAAGACTATACTTTTAAAGCCAACGATAACAACAATATATTATAATACTA
TTTTTTTTTCCTTTTTCAGACAAAAATTGGCGCGCTGCATGTAGAACTTA
ATCGGCTTAATTTGGCTATCATAGCCAAATTAAGCTAATTTTAATAAGAT
AATCACATCTTTTCACTCCGCTCTAAAAAGAGAAAAGTTTTTCGCTTTAA
ATACTCTTCTTAGTATAAGTAACAAGTCCATGTAGCAAGATTGACGCGGA
TTTTATTTGTTCTCAAGATATTTAGGTTTGTATATTTCATATATCCAAAT
TAAGCCATTAATATCCTAACTAGGATATAAATTCTGGCCTAATTAGGCTA
ACATCCTAGTTTGGCCATCATAGCCTAATTTGCAATAGTTCCTGACTGTA
AATACTCCTCCGTATGGATGTTTTTGCCAATGCTAGATCAGCATTTCATA
AATATACCATGCGTCGTTCCCTTTAACCTTCATGCTCATGTAGATATCAA
TTATATATGTGTTAAATGCATAACCAGGTAGGTCCATAAAAGTATCACTT
GTTTTTTCTAAGATTATGTGCTTGGATTCCCAGGCTAGCCATAATACAGT
TAGCTACACTAGCGCTCCATCTAAGATATGTAACAAAGATTAATGCTATG
AAAGTGCTACAGCCTGCTTTAGCATTTAATTGATTCGCGAGCAAAACTTC
TATTGTGTTACGGGATTTATGAAAAATTACAAAATTACAAAAAGACTTGT
ATACTGGTTATATAGTTTTTACAGATTAGAATAACTTTAAGAAGTTGGAA
TAAATTCACTTAACAGGTCAATGTATTTTTCCTGACCAGAAAAGCTTTTT
GAGGAGCTTTCTTCCTCACACTAATGAAAATGTGTTTTCAAATGAAATAT
TTTTGTTTATTCTACAGCTGTCGCTTCAAAGGCTCCGAGGAAGAATTTCA
ATGCAGGAGGAAGTAGTAGTTCAAGTTCTGCTGCCGATGGTTCACAAAAT
ACCAGTTTCAATGTTGTCAATCATGCTAAAATGTGGCCAGCTCCAAAATG
GCAAAAAGGTAAGTTTATTTCATATTCAGAAAGGATTTGATTTTTCTATT
TTCTAGTGACTTATGTTTTTTATGCAACATTTTCTGCTTGGGACTTTGTA
TGTGAGAAATAAACAAATATACTGGGTGACCCAGAAAAAGGTATAAGTGT
TTGATGGTTAACTGTGTCCAAAATAATGTGAAGTTTCAATGAATTTTTTG
CCATTGTAAAGAGAAAAGGCAAACTTAAAATTTGGCAATTTGTTGTTTAG
AAATGGCTAGCAAAACAAGAATTAGTGCACACTTAAAGTAAATGGACCTG
AGATTGAGGTCTGAATCGATAATAAACAATCATCGAGCTTGCAAAATCAT
GTGTTAAAACGAATCATCAAATCAAAATTGTTCTATTTCTCAATAGACTG
TCTTCCTTAAATACATAATAACTAATTTACATAAAAATATTGAAAAATAA
TTGAACTAATGATCTACATTTTTGATGGATTAAATATTAAGTTTCTATTA
CCTCCATAAGATCAGCAAAAATCTTAGTATAAAGATCTACTTTAATATTT
ATTAATCCTCGAAAAAAATAAACAAGAAAAACAAAACTTTGAGACATTTT
TAAAGCAAAGATTACTCAACATACACAAAATCTTTATGCTTTCCAGGCAT
CGGGTCATTTTTTCAAAAACGAGAAAACACCAGCAACGAAAACGAAAGTT
CTTCCGGAAGTAGTTCGGCAGCATCTTCGCAAAGTCCGACAAAAGACGAG
CGAAAAGAGGAAACGAATGACGTCATCGTATTAGAGGAGAAAACTGATAA
TTCTCCCGACGGTGCTACAATTGACACCGAGAATGCTTCAGACAAAAACG
AGAACACTTCCGACAAAGAAAACGATAAAGATATTAACGATAATGAACTA
CGGAAAACAGTGAAACGACCCAGTGGTAAACAAAAAGTGAGCGTTTCAGG
AAAATCTCTCAATCAATCGAATAAAAAGAAACGGAGAGTGGTATTACATG
ATAGCAGTGATGAAGAATAA Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000194_pilon:444433..452452- >XLOC_035824 ID=XLOC_035824|Name=XLOC_035824|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=1104bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000194_pilon:444433..452452- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon) ATGGTTCGAACACGTGCTGATAATTGTTCAAGAAAAGATGGTTCGAACAC GTGCTGATAATTGTTCAAGAAAAGCTGTCGCTTCAAAGGCTCCGAGGAAG AATTTCAATGCAGGAGGAAGTAGTAGTTCAAGTTCTGCTGCCGATGGTTC ACAAAATACCAGTTTCAATGTTGTCAATCATGCTAAAATGTGGCCAGCTC CAAAATGGCAAAAAGCTGTCGCTTCAAAGGCTCCGAGGAAGAATTTCAAT GCAGGAGGAAGTAGTAGTTCAAGTTCTGCTGCCGATGGTTCACAAAATAC CAGTTTCAATGTTGTCAATCATGCTAAAATGTGGCCAGCTCCAAAATGGC AAAAAGGCATCGGGTCATTTTTTCAAAAACGAGAAAACACCAGCAACGAA AACGAAAGTTCTTCCGGAAGTAGTTCGGCAGCATCTTCGCAAAGTCCGAC AAAAGACGAGCGAAAAGAGGAAACGAATGACGTCATCGTATTAGAGGAGA AAACTGATAATTCTCCCGACGGTGCTACAATTGACACCGAGAATGCTTCA GACAAAAACGAGAACACTTCCGACAAAGAAAACGATAAAGATATTAACGA TAATGAACTACGGAAAACAGTGAAACGACCCAGTGGTAAACAAAAAGTGA GCGTTTCAGGAAAATCTCTCAATCAATCGAATAAAAAGAAACGGAGAGTG GTATTACATGATAGCAGTGATGAAGAATAAGCATCGGGTCATTTTTTCAA AAACGAGAAAACACCAGCAACGAAAACGAAAGTTCTTCCGGAAGTAGTTC GGCAGCATCTTCGCAAAGTCCGACAAAAGACGAGCGAAAAGAGGAAACGA ATGACGTCATCGTATTAGAGGAGAAAACTGATAATTCTCCCGACGGTGCT ACAATTGACACCGAGAATGCTTCAGACAAAAACGAGAACACTTCCGACAA AGAAAACGATAAAGATATTAACGATAATGAACTACGGAAAACAGTGAAAC GACCCAGTGGTAAACAAAAAGTGAGCGTTTCAGGAAAATCTCTCAATCAA TCGAATAAAAAGAAACGGAGAGTGGTATTACATGATAGCAGTGATGAAGA ATAA
Gene-mRNA-Prot
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Position
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
| sc0000194_pilon | genome | sc0000194_pilon:444433..452452 - |
Properties
| Property Name | Value |
| Aaloc | 181-552:373 |
| Aaloc | 40-177:1152 |
| Aaloc | 1-36:8021 |
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