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Sequence
The following sequences are available for this feature:
mRNA from alignment at sc0000839_pilon:16297..20131- Legend: polypeptideCDS Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >XLOC_035818 ID=XLOC_035818|Name=XLOC_035818|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=3835bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000839_pilon:16297..20131- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ATATTAGCAACAAGTGTAGTTGCATTAGGTGTTTTCTTCATGGTCATATT
TCACTTGTTTGTGAAAGAACCAAGTTGCACAAAAGAAATTGATTCAGTGA
ATGAAGAAGAACAAGAACACCTTGTGGGCGGTGCCAAGAAACCACAACTA
GCTCAAAAGACAGTCAACGATTGGTTCAAAACACCTGTATTTTACAAGGT
TTACTGTTTGTATTTTTCATATTTCTAGAATAATTAGTTCAACTTGCTTA
GTTTCAAATCTGCTTATTTTGTGAACTATATTTTTTCAAAGTTTCACCCC
GTTTCATCCCTTTGCACGAATAAATCTTTCCATAAATTACGTCACGAGCA
ATGCTTACCTCGTTTTCAAAACATTGCTATGGTAATTGATTCCCAGACGA
GTTCTGTTATTCTATCTATGAAAACTCAAGGGATTTAATCACCTTGGTAA
AACAACCTGAAAACAAGGCAGTCGTTGCACTCGAAATAATTTATGAAAAA
TCCTTTAGCTTGTGATATTCAGTGATATTTTTTTATCATAGGTCGGATGG
CTGTATATGATGACTAGATTGATTGTCAACATATCGCAAGTTTACCTCGC
TTACTTTGTCACTGAAACCTTAAAACTTAATAAAGTTAGTCGGATAAATA
TTTTATTACTTGTGTCCAGCTTGAGGGCCTTTATTAAACACTTTATTATA
AGAATGATATTCATTTCATTATGGATATTCTTAAATTTATCAGAAAATTT
ATCTTGAAATATGCTTAAGACATTCCTAGTTAAGAATCCAAACCCAAACC
TAAATTTAACATGTAATTACATATTTCAAGCAAAAATATATGAAAAAATA
TTTTTTTGAAAGTCTGGAGTATTCCAAGGAAATAATTTACAGGCAAAAAA
GCCCCAGTTCTACGATGGTGATATTCTTAGCATATTCTTGATCTTTTAGA
CCAATTTCATCATGAATATTCTTATGAAGTATATTCTTATAAAGAAAGCG
TGTAATGTGGGCTAAAGAAGATTTAAGTTCAGTTTGTTGAACTCTCATAA
AAATAGTTCTATGTAATATTCATTTTAACCTCTTCGTTCTTTGGTCATTT
TAGAGTGCCATTGCCATTGCACCTGCTGTTGTGTACGTTACCGGTATCTT
TGCATCGTTGATTGCTAAGAAGTTGAATCGTGCTTTAGGTTTAAAGGTAT
AATCTAAATGCCCAGGTTTGAGCTTTATCGACCCCAACAGTGATATTAAT
ATTCATAGCTTATGATGGCTTGGTCGAACGTAATGGGCTTTTCCAGAAAT
AGTACGTATGCCCTCTGTGAGGATATCAGATATCCAGGGGGGTTAACGGT
TTTTGTTCAAAAGTGGATATCCAGGGGGTTAAATATCTACAAGGGAGCGG
ATATCCAGGAGATAAAGTGTCTTTTCAAGTAAAAAAATACGATATCCAGG
GGTAAGCATCTTTATAAGAGTGGATATCCAGGGGGTCTTTACTAATAAAG
TTGGATATCCAGGGGGTTCGATTCTTCGAAAAATTAATATCCTCAACAGT
GGGGGTATTTTTTTTTCTGGAAAAGCCCAATTCTTGTGATCCAAACCACG
ATAAAATTCCAATATTAAAGGTATTATAATATTGGAAATTTCACATAGCC
TTCGAATTTTCAATGATTCTTGTGGTAACTTTGTGGGACTTGGTCAGTGA
ATTTTTGAATGAATCAGGTTGCTCTATGATGTTTACAGTGCAATCATTAT
TCGCAATTTTTCTTATAGTTCACATATTTCTTTGGGCTATGCTTTATCTT
GGCAGGAAGGTAAGAAATTTGTGTATTTGATATATTTTACAAACAGTGTT
TGAGAACTGACTAATGAATAATTCGTCATTTTTCGAAAAGGGATTTTCTG
GCCAAAACCCATTGATAAGAGTGCATAATTTTGACTTTAGAGTTTTTAAA
AATAAAAACAAAAGACTTCTCTTAATTATTAGTGTAGTTACTGATTGAGC
CATGTAATCAGTTTGAAGACTGTCGATGGTACCTCGTCAGTGTACTGTGA
TATCCTTTAAATCCATTTCCTTTGCTGTAAATAATGAAATCTTGAAAATA
TCAAAATTACACATAATTCCATTTATTTCACAGCGTTTACTTCTACTTCA
TGCGGTCATTGGATATAAAATACAGACCAGCCGTCTATGGTGCCTGTGTC
TGCTTAGGTCTCGGTGGATCCACACTACTGATCAACTCCTTGGCAATGAT
CTCACAAATGATCGGCAGGAACGTGGTAGGATTATCTGGCAATTTTCAGT
ATATCTATTTATAAATAGCGGTAGTCTGTATGTATGTCTGTTTGTTTTCT
GTCTGTGTGTCACTTTCGTTTTCGCAAGCAATGTTTCTGTTCTCGGTAAG
TTTGTTTTGATTGATGGATTGGATAGAGCCTGGTTTAGACTTTATTTAGC
CTTTGTTTTGACCGGCTAGTACTTCTTTCATTTTGCAATGAGATCCAGGT
CGTGATATAATTTTTTAGGTCTACAGACTTTCACCATTAAATAATCATTT
TTCTTCTACTCTTAAATTAATTGAATTTTGCCTTAGTACTGTTTGTACAA
AACTTTGATTACGAGAACTCTTTTTTTTATTTCTTTCGGCAGCACTTTTC
TAACGGGGAAGAGATTGTTTTATTATGTATCTCTCGTATGATCATAAGTT
AATCAAAATCTTTTTCTGACAGTATTTGATTCATAAAGAGTTTCTTGCAT
TTCCTATTTCTAGGGAGGCTGTAGGGTTTTGAAATACCGTTTTCCCGTCA
AAATTTTTGCTGAATCCCGGGATCCCGAAAATTTTAAAAAGTAATAACAC
TGTCACACCGCTTTGTAGAGGTAAAAATATCGGCAAAATGACAGAAAATA
AGGCTAAATACCGTCACCGTCTGATTTTAAAATACCGTTTTTTCTTTTTT
CGTCAAATCTCGTAACACCGTAAAAGTACAAACCCCCTTTCTTTGATTTT
TGTTTCTCAGGATACCAGCGCGTTTGTCTACGGCTCCATGAGTTTACTGG
ATAAATTTTCAAATGGTGCTGCTATCATGTTAATTCAATTCCTCCACCCG
TGTAAAGATCAAGTGTAAGTTCTCTTTGCTGAAACATTCCGTAAGTTGAT
CTAACTCATTCCGACATTCTTCTTTTAAGATAGGAATAAAGGAAAGGTTG
GAATTACTAATTAAAAATTTTTTTTAACTTTCTGACCGTTAAGCAAATCA
ATCAGTGATTCCGACCGTCATATTATTCCTATCTCTAAAGAAGGATATTG
GAATAATAAAGAGGGATGTCAACATTACATTAGACCAATTATATTTCATA
GAAAGTTTGGCGGATGAAGGGAGTAATGATATCAGAATTTCAAGGCTCAC
TCTCGTGCTTGTGACGTCACTTATTTATGCAATTTAAAAGCACCGATCAC
GATACATTTCTTTAGGCCGTATCTTAACCGTGTAAATTCAAGCTGGGTTA
ATCAGGCTAAAGAAACATCTAATCAGGATAAAGAGACATCTAATCAGGCT
AAAGAAACATCTAATCAGGATAAAGAAACATCTAATCAGGATAAAGAGAC
ATCTAATCAGGCTAAAGAAACATCTAATCATGATAAAGAGACATCTAATC
AGGCTAAAGAAACATCTAATATTGCAATGAATTTACCCATTCTGCATTTT
AGAATATGTTGTTATTCGTGTCAACTTTATTATCGAAACATCATGAGTTA
TTTCCCTGGTGTATGCGCAGTACTGGCTTTCCTGGTTCTCATGACTATTG
GAAAGAATACATTCGAAAATCCACAGGGTAAGAGT Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000839_pilon:16297..20131- >XLOC_035818 ID=XLOC_035818|Name=XLOC_035818|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=1608bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000839_pilon:16297..20131- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ATATTAGCAACAAGTGTAGTTGCATTAGGTGTTTTCTTCATGGTCATATT
TCACTTGTTTGTGAAAGAACCAAGTTGCACAAAAGAAATTGATTCAGTGA
ATGAAGAAGAACAAGAACACCTTGTGGGCGGTGCCAAGAAACCACAACTA
GCTCAAAAGACAGTCAACGATTGGTTCAAAACACCTGTATTTTACAAGAT
ATTAGCAACAAGTGTAGTTGCATTAGGTGTTTTCTTCATGGTCATATTTC
ACTTGTTTGTGAAAGAACCAAGTTGCACAAAAGAAATTGATTCAGTGAAT
GAAGAAGAACAAGAACACCTTGTGGGCGGTGCCAAGAAACCACAACTAGC
TCAAAAGACAGTCAACGATTGGTTCAAAACACCTGTATTTTACAAGGTCG
GATGGCTGTATATGATGACTAGATTGATTGTCAACATATCGCAAGTTTAC
CTCGCTTACTTTGTCACTGAAACCTTAAAACTTAATAAAGTCGGATGGCT
GTATATGATGACTAGATTGATTGTCAACATATCGCAAGTTTACCTCGCTT
ACTTTGTCACTGAAACCTTAAAACTTAATAAAAGTGCCATTGCCATTGCA
CCTGCTGTTGTGTACGTTACCGGTATCTTTGCATCGTTGATTGCTAAGAA
GTTGAATCGTGCTTTAGGTTTAAAGAGTGCCATTGCCATTGCACCTGCTG
TTGTGTACGTTACCGGTATCTTTGCATCGTTGATTGCTAAGAAGTTGAAT
CGTGCTTTAGGTTTAAAGTTCACATATTTCTTTGGGCTATGCTTTATCTT
GGCAGGAAGTTCACATATTTCTTTGGGCTATGCTTTATCTTGGCAGGAAG
CGTTTACTTCTACTTCATGCGGTCATTGGATATAAAATACAGACCAGCCG
TCTATGGTGCCTGTGTCTGCTTAGGTCTCGGTGGATCCACACTACTGATC
AACTCCTTGGCAATGATCTCACAAATGATCGGCAGGAACGTGCGTTTACT
TCTACTTCATGCGGTCATTGGATATAAAATACAGACCAGCCGTCTATGGT
GCCTGTGTCTGCTTAGGTCTCGGTGGATCCACACTACTGATCAACTCCTT
GGCAATGATCTCACAAATGATCGGCAGGAACGTGGATACCAGCGCGTTTG
TCTACGGCTCCATGAGTTTACTGGATAAATTTTCAAATGGTGCTGCTATC
ATGTTAATTCAATTCCTCCACCCGTGTAAAGATCAAGTGATACCAGCGCG
TTTGTCTACGGCTCCATGAGTTTACTGGATAAATTTTCAAATGGTGCTGC
TATCATGTTAATTCAATTCCTCCACCCGTGTAAAGATCAAGTAATATGTT
GTTATTCGTGTCAACTTTATTATCGAAACATCATGAGTTATTTCCCTGGT
GTATGCGCAGTACTGGCTTTCCTGGTTCTCATGACTATTGGAAAGAATAC
ATTCGAAAATCCACAGGGTAAGAGTAATATGTTGTTATTCGTGTCAACTT
TATTATCGAAACATCATGAGTTATTTCCCTGGTGTATGCGCAGTACTGGC
TTTCCTGGTTCTCATGACTATTGGAAAGAATACATTCGAAAATCCACAGG
GTAAGAGT
Gene-mRNA-Prot
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Position
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
|---|
| sc0000839_pilon | genome | sc0000839_pilon:16297..20131 - |
Properties
| Property Name | Value |
|---|
| Aaloc | 1297-1428:133 |
| Aaloc | 1192-1293:826 |
| Aaloc | 1051-1191:1702 |
| Aaloc | 1009-1047:2068 |
| Aaloc | 916-1008:2733 |
| Aaloc | 823-915:3295 |
| Aaloc | 625-822:3836 |
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