XLOC_035753 (mRNA) -

Overview
NameXLOC_035753
Unique NameXLOC_035753
TypemRNA
OrganismClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon (Jellyfish)

Sequence
The following sequences are available for this feature:

mRNA from alignment at sc0000191_pilon:170016..181709-

Legend: polypeptideCDS
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>XLOC_035753 ID=XLOC_035753|Name=XLOC_035753|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=11694bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000191_pilon:170016..181709- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
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ATATCCAATATTGTACGAGTGAAAGTGTGATAAGATCAAAACACTCTTAT TTGAAAACTTTTTTTGTGATTTGAGAGGAAAACGAAAAAATTTCTGGGAA TAAAATTCGGGAAAGATACAAAAATACGATCTCTCGTTTACCAGACCCCT TTTTTGAACGCGGTCTTGTATTTGTACGGTACAATATGAAATAAACTTAG TAGTTTTTCTTTTCCGTAAGGCATAGATTACATAATAGACCTTTTCATAA ATTATGTTACGAACATCACTTGCCTCGTTTTGAAATTATTGCCATGGTGA TTAACTCCCAGCGGATTCTATTAAAACTACTTCCTATTCGGCATACTGGA TAAGTGTGACGTGGGGCGGTGGGACGCCCAAGTGGACGCTTGAAGCCACA TCTATCATTATTTATTATTGTATTGAACATCAAGAGTAAAAGACAAATGA CAAAAAGATCAATTAAGCTTTTTGTAAAGGAGAAGGCGTAGTGGTGTGGT TATCGTGCTTGACTTCTGTCCAGGAGGCCCAAGTTCAATACTCGCCGTGG TACTACAATTCTCTTGGCAAGTGAATTCTCCTTCGCCAGGGTCAACCCAT GTCATGTGAGGGGAATTGGGTACCTAACTCTAATACAAGCGTATGGGTAG ATATTCCAGACATTGTGGTGTGCTGAGACACTTAGGAGGTTCTACACCTG CGAGGACATCCGTTCTCCCGTGTAGTTCGAACGTCTTGGTATACACCATG GCTCGGCAGCTCGTATCTGCAGGGTCGCAATGTCTGCTTGCTTTGCGATT CCTACTCGATCGTGGGTAAGACTAGCCAGTGCCTTCCCATAAACCAAATT TTTTCTTTGTATAATGGTCAGTTACACTTTGAAGCGTAACAGAAGTTAAA TCGCGATAAAAAAGCGGTTTTCGTCTAACAGGCCAGGGTAAGACCCATTT 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AACCGAACGATATCGTGCTTCCTTTTTTCCTTTTTGTATCAGTGAGTGGA ATAACCTGGACGAGAACATACGAAATCTTCCTTCAATCTCTCTTTTCAAA ACCGCGATACTCAGATTCTTAAAACCCAATGCCAATTCGGTTTTCAGACT TGATAACAATAGAGGTGTGGTTCTACTTAACCGTTTAAGGGTCGACTTCA GTCATCTTCGGGAACATAAATTCAAACACAATTTTGCAGACACAGTTGAT CCTTTTTGCAACTGTCGAAATAACTCCGATGATAGACATGTAATGTTTGA CAGTTTTCTTCAACTTGACATATGCTTGCTACCATTAAACCCAAGAATAC TTTCCAGAATACTTCTCTTTGGGGATTCGAATTTTAGTAACAACCTAAAT CATGATATAATAAGTATAACCGTAAAAGTTATCCAAGATACCAGTCGATT CGAGGGTCCGTTGTTTCGATTGTTCACAATGCTCATTTAGTTTGTTTTTT GTTTAATTTTGCCTAAGCTTTCTATTGTTTTTTTTTCGTTTTTCTTTTTA TAAGGTTCCTCTTTCCTGGCGGTATAATCTAGCGGTTTTTTTGCGGAAGG GCTGGAACCATGTAGGGTTGTATTTTATGTTCGTGTCATTACTTATAAAT TAAAAAAAAAAAGTGACGTTCGTGACTTAATTTGATAAAAGGTCTATTTG TTTCCATTTTTGTACCAACCCGTAGTCGTGGTCGATTATTACAAAATCAT TAAAATGATATCATAGCGTGCTGGATGATAAATGGTCACAGTACTCGGCA ACACCTTACTGTATATTATTCACTATTCACTGGCTGAAAATGGAAGTTTT TTTCTCGTTTAGTTTCCGTATGAAACATGGCGCTGTATTATGAATAAGAG TGGAATCGATTAGAGTCGAGTGTCTTTTTTGAAATTACTTTTGTATAGGC CATTTCACAGTCGCAAAGCGTAATGGGTAATCAGGACCACTGCGCGCTAA TGACGACTTACTATTGGTCCAAAGTTTTGATAAATTTTGAAGATTTTTGT GTCTAGCCAACAGAAAGCCGTTAAGGAGGCGCAATCAGTCCTGATTACCC ATGATCAATTTCGACTGTGAAATGGCCTATAGGATAACCAGATCAATTAA TTTTAATTAAATTCATAACTTGTCATAAAAATCTTTTAGAGGTCTATAGC AGACGTTTAGATTCTTGCAAGCTTACATCACTGTAACAATATTTTTAGCA ATAATTCTTTTATCGTTTTTCTTTCAGAAAGATCTGGTCTACCTAACACG GACAGCCGGACAAAAATTACTATTTGAAGGAAAATATGAATACGCAATCC CTGCTGCAATGCAATCCTTAAAAATCTCCATCGAAATTTATGGTTTGAAC AGTATCGAATTGGTTTTATCGTATCTCATACTTGGAGAAGCTTGTATAGG TATGAGTTTAAAATTTAATTTAAAAATTAAGAAGAAAACAATTTAAGTTA ATTTCATACTCAAAATTTGAAAATTAATATATTATCGACTCGGTGAATTT TGTTTTTTAAGTCTTTCCGTGATAATTTATGTCTCATTCTGATTCCAAAG TTTTGCGAACTACTAAGAAATATTCTTCTACACTGAAAGGATTTAGACTT ACCAGTCACTTTTGAACACTTTGAGAACAAACATGCACTGATGTTCTAGT GTAGTGTAAGCAGAGTTTTTTACAGCCAATTGCGGTAAACAAAACCATAG GCAGTGGCGACCTGGCAGGGGGTGCAGGATGTGCAGTGCACCACCCAGAA AGATCTGAAAGGGGCGCCAAAAGAGCTTTTCAAGGGGGCGCCAAAATTTT GTTGCTGTTTAATTGGGTGATTTGGCGCCCTTCAACAAATTTATAGCGCC TTCCATAAGTACAATGTTAATTCTTTTATTTTTCTCTTGCATTCTTTCTC TCAATTTTTTTCAAAACTGCTATCAACATTGAATCGAGAAAAGTCAAAGC AAGAGAAGTGTTGTGTATCCACCAGGGGTTAAAGAGGATTCATAGAATGC ACTCCCCTGAGCTTAGGGGGCGGGCTAAACCATTTTTATTTGATTGGGGG CTGTATATTTTAAATTATGTTAAAAATCTATGCTGTGGGGAAGGTTTTAT CCCGCTTGAAAAAAATTTTTACCTGCGGCGCAATAAATTTATCGATAATT TGCATGCAAACTTTCTTTGATATTTTTCTTTGTGAAGGTGGGGGCTATGT TTCTAGAATTTAGCCGGGGGCTATTTTCCTTAGCCCCCCCCCCCTGAAAA ATGCTGGGGGCTGGAGCCCTCTGCACACTATGCAGGATGCTCACCCCCAA AATGAGAGATTGCCAAAAAGATCGAAACTTTTTGATCCTCGCTGTGGTTT TTGTGGTCTTATGCTGACTAACTTTCCATAGGCGTAGCGAGATACCCTGC AAAATTTATGGATGAGAGCGGTTTTTACGACACTGTAACTATTGTCTTTG TTTTATCAAAAGATAATGAATATGTCATAAACGTCTGCACTCCCTCATAA TTTTTTCAGGGTATCTCGCTTCGCCTATGCTTTCTCCTTTTTAGAAGATC TTTTATAAGCTGTTTGACGTTTCTTACACCAAGTTTTTTGACTGCGGCGC CAGAATTAAAAAGAACCCTTATTCCTGCCAACTTTCGAACTTTTGGGTCC TCTTTCAGCCATTGATCTTTAATGGGGAGTAAAGTAAGACCAGCGGCACA AAAGTTTAAAGATTATCAGGTCAATTTTCTGATAAACTTTTAGAAAACAA AAATATAGTCCAAATCGACTTGCTAGGTATAAAATTTCCATTTCAAGTAT CAACAGCTCATGTTTTTTATTTGAGGAGCTTTATTTTTGGTGCTAAATCG AGATAAATTGGGGCTTTTTTAGACATTTTAAAAGTTGAAAATTGAAAAAT TTTCCTTGTTCAGAAAACTATGACATTTCAAATAATAACAAGGAAATAGA TATCAAGTTATCATTACCACCACCTTCGTATAAATAAAAGTTTTTTAACT CAGAGATTCCGGGCGTTATTTTCAACCAGTCACCTGCTCTTACAGTTTAA TATTTCCACTTAATGATGGAGGGTGCAAGTAAGGACAAAAATATCAGGGG CGCCAATTTCATAGTTTGTACCACCAAGAAAATTAAGCCAGGTCGCTACT GAATAGGCAGAGGTAGTATGAAAGGCAGACCTATACAAAATCGCGGGTAG TATAGTTATAAAGAGCGCGAATCCGTTAGCCAGTGTGGAAACGATGCAAA GTCCACGCCGAATTGTTATTTGTTTAAACTGAGATCTGTGCCAAAAGAAG TTCTTTATAGGCGGGCGAAATTGCTGGAGGGTTTTCAGCCCTGGCGGGGG GGTTCAGGGGGGAAGCCCCCGAATATCCTGGGAATAACCTTCTCCTGTTT TTGGAGCTCGTGACAACCAGGGTGTGATCCTTCTCAATCGTCTTCGAGTA GGATTTAGTCACCTCAATTAACATAAATTTAGACACGGTTTTCGTGACAC CTTAGATCCATTTTGTGCGTGTAGAACAAATTCCATCGAAAACTCTCAAC ACTTTCTTTTGCACTGCTCTATTTACTCTCAGGCAAGACATCTTTTGTTC AACAAACTTCTGAACCAAGACATAAATATTTATCCACTAAGCCCTCCTAA ACTCTTCAACCTTTTGTTGTACGGTGATCCAGAATTACCTTTCAACATAA ATAACATAATAATTAATCTTTTCATTGAATTTATTCTCGACTCTGAAAGG 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TGGAAGTGGCCTTCTCTTTATATCAACAGGTTTTCCAAATACAATATGAG AAATATTTTACGAGTTCCGAGATTTTTCCGTACAATATTTTCCGAGCCTT TAGGCGAGGAAAATATACGGAAAATCCGGAACGAGTGAAATATTTCCATA TTGTACGAGCAAATGTCTGATAACTGGTTTATCGGTGACCCAAAAAATGC ACTTTTTGTGTTGGAAAAAAGCGTAGGGCACTTTTGTAGCAAAGTGACGT TAGATTGCTGCTACCGCTACAATGCAACAACATCTTTTCGTCAATTTATA TTTTTACATGTAAAGTACAAGATATATTGTACTCTTTTTAACCAATCAGA TTGCAGATATTTTTTGGATCGCCTATAAGAAATATGTGTCTGATATGAAA TGGGAACAAAATAATGTAAAAATAAAACTTTTAATACAACGCAAAACTAT AGCCGCGAATTTTTGTTTTGTCCTTAGAGATTTGAAGAATTTAAATATGA GGAATCTGCTTTCAAGAACTGTTAATTATTTTAAACTATTCTGACTTCTC GCTTTGTTTCTAGATAACAACTATATGGTTTGATCATTTGAGTTTATTAG TCGCCCAACGAACACGCCAACCGCCCCCACCCGTCGGAATCGGACCCGCT CAATATGAAGTTGAACGAAAAGACTATGATAATCTCGGTAAGAAAGATCA AGTATTTACTTTGTAGTATTTTCAATGCCCTGATGAGATCTTTGAGGTCC CCAGATAGCATTATAAATACTCATTTCACTGATGATGGTGTCTGAGCACC ATGAAACTCTGAGTCAACTCTTTTCTTGAAATACACATTATTTATATGAA GACGATTTCATATGGGCAAGAAAGAAACACTTTCAGGCTTAAAATCAAGA TAATTAAAAATTTGGAGACGATTTTACCTAATAATCAAGAAAAACGAACA ACTGAGCCAAAATTCCAATCTGCTAGAACTTTGCTTCATTTCTATTGGCT AGAACCTTATTTTCAATCAACCTTCAATATTTTGTTTTTCTTGTTCATAG ACGAAGCGGAAGCAGCAGAAGCTCTCCTCGTGTTGAATTCCATTTTAGAA ATGCGAAGTAAACAAACATCACCCTCCCCTCTCATCATGATGGAACTTCT GATGGCGTTGTCTATGTTATATTTTGTGCAAGAAAATTATTATGAGGTAA GGTGGATGAAGTCATTAAAGTGTGAGACAGAAGATTGTTCCCGAAAAATG TCAGTCGGAAAATTAAAGTAATGCCTCGTTTAGATAAAAAATTTCCCTTT TTACCTTAAGGGAAGAAATTTTGGCGGAAATTAAACTTGGTGGATGACCG ATAAAATATTTTCAGAAAGAATTTAATTTTGCGGATGGGTTGAAAATTAA ATTTTGCGAGAATTTAATTTAGTGGATGAAGGATATTTTTGGCCAAAAAA CGCTATTAAATAAGAAAACCCCGTTTTCAGGTCTGAAACATCACATTTGG GGAATGAAAACAATTGGGTTTGGCGCCAAATTTTGTTTCCGCCAAAACTT ATCCCCCTAAAGTTATTAAAGTCTGTTCCAAAAAAATTGCCAGTCCGCAC ATTTTGATACATTGCTATTTGAGGGAGAAAAGATACAATCAAAAGTAATA CCTTGTTGAAAAGATAATATTAAGCGAGTTAATTTAAGATTTCAAAATTT TTGGGTTGTACCTTTCGATTCAAGAAAGATATACAAAATCTGACAACATA TTTGAAATCAGTGAAGTTTAAATTCAAAATTTTTAATGGATTTGAAAAAT CTTCATTTTCGAAATTTTCGAAAGATTTCAAGTATTAAAATCATATTACT TTTAATTATATCTTTTCTCCTTCAAGAGCAATGTGTCAAAATGTGCGGAC 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Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000191_pilon:170016..181709-

>XLOC_035753 ID=XLOC_035753|Name=XLOC_035753|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=2202bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000191_pilon:170016..181709- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ATGTCGATCAATCCTTTGGCTAATCCAAAAGGTGTCAAATTAAATTGTGA
GCTGTGCTCCAAACCTGCACTACTTTTTTGCACCAAATGCAGAGTCACTT
ACTACTGATGTCGATCAATCCTTTGGCTAATCCAAAAGGTGTCAAATTAA
ATTGTGAGCTGTGCTCCAAACCTGCACTACTTTTTTGCACCAAATGCAGA
GTCACTTACTACTGTGACACAGAACACCAGAACATCGACTGGATAGGTAT
CCACGAGAAGATCTGTGAATTACTTATTCCACTCAAATCACCCATCACGT
CCACATGCAACTCTGAAGAAGAACGTGAACAACTAAAGAAATTAAAAGTC
AAACGACAGTGACACAGAACACCAGAACATCGACTGGATAGGTATCCACG
AGAAGATCTGTGAATTACTTATTCCACTCAAATCACCCATCACGTCCACA
TGCAACTCTGAAGAAGAACGTGAACAACTAAAGAAATTAAAAGTCAAACG
ACAGAAAGATCTGGTCTACCTAACACGGACAGCCGGACAAAAATTACTAT
TTGAAGGAAAATATGAATACGCAATCCCTGCTGCAATGCAATCCTTAAAA
ATCTCCATCGAAATTTATGGTTTGAACAGTATCGAATTGGTTTTATCGTA
TCTCATACTTGGAGAAGCTTGTATAGAAAGATCTGGTCTACCTAACACGG
ACAGCCGGACAAAAATTACTATTTGAAGGAAAATATGAATACGCAATCCC
TGCTGCAATGCAATCCTTAAAAATCTCCATCGAAATTTATGGTTTGAACA
GTATCGAATTGGTTTTATCGTATCTCATACTTGGAGAAGCTTGTATAGGA
CTTCGAAGGCTAACGCAAGCTGAAGAATATTTATCACAGGCTAAATGGAC
GGTCACCAAAACACCAGACTGTACGCCTGACATTCTGTCCAAACTACATC
GAAATCTTGGTTTACTGCACGCAACGAAACAGGAATACAAAGAAGCTCTG
AGGAATTTATCAGAGGATGACTTCGAAGGCTAACGCAAGCTGAAGAATAT
TTATCACAGGCTAAATGGACGGTCACCAAAACACCAGACTGTACGCCTGA
CATTCTGTCCAAACTACATCGAAATCTTGGTTTACTGCACGCAACGAAAC
AGGAATACAAAGAAGCTCTGAGGAATTTATCAGAGGATGTCTTTTACGCA
TCGACTTTCTTCGGAACACACAACATTCGGACGTCCGGCGGTTACTTCCA
CATGGCAAATGTTTTCTATGCTCAAAACAAATTGGAAGTGGCCTTCTCTT
TATATCAACAGGTCTTTTACGCATCGACTTTCTTCGGAACACACAACATT
CGGACGTCCGGCGGTTACTTCCACATGGCAAATGTTTTCTATGCTCAAAA
CAAATTGGAAGTGGCCTTCTCTTTATATCAACAGATAACAACTATATGGT
TTGATCATTTGAGTTTATTAGTCGCCCAACGAACACGCCAACCGCCCCCA
CCCGTCGGAATCGGACCCGCTCAATATGAAGTTGAACGAAAAGACTATGA
TAATCTCGATAACAACTATATGGTTTGATCATTTGAGTTTATTAGTCGCC
CAACGAACACGCCAACCGCCCCCACCCGTCGGAATCGGACCCGCTCAATA
TGAAGTTGAACGAAAAGACTATGATAATCTCGACGAAGCGGAAGCAGCAG
AAGCTCTCCTCGTGTTGAATTCCATTTTAGAAATGCGAAGTAAACAAACA
TCACCCTCCCCTCTCATCATGATGGAACTTCTGATGGCGTTGTCTATGTT
ATATTTTGTGCAAGAAAATTATTATGAGACGAAGCGGAAGCAGCAGAAGC
TCTCCTCGTGTTGAATTCCATTTTAGAAATGCGAAGTAAACAAACATCAC
CCTCCCCTCTCATCATGATGGAACTTCTGATGGCGTTGTCTATGTTATAT
TTTGTGCAAGAAAATTATTATGAGGCCATGGAATACAGCAAGGATGCAAC
GACATTTTCAAAGAAGATTTCGAATCTGGAAGAGAGTAAACGAAAGTCAT
TGGAAGATTTGTACAAAGCCATCGAGACAAGATTGTAAGCCATGGAATAC
AGCAAGGATGCAACGACATTTTCAAAGAAGATTTCGAATCTGGAAGAGAG
TAAACGAAAGTCATTGGAAGATTTGTACAAAGCCATCGAGACAAGATTGT
AA
Gene-mRNA-Prot
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
XLOC_035753XLOC_035753-proteinClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonpolypeptide
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
sc0000191_pilongenomesc0000191_pilon:170016..181709 -
Properties
Property NameValue
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