|
|
Sequence
The following sequences are available for this feature:
mRNA from alignment at sc0000150_pilon:752671..761144+ Legend: CDSpolypeptide Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >XLOC_035654 ID=XLOC_035654|Name=XLOC_035654|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=8474bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000150_pilon:752671..761144+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon) ATGTGTAGAATACAAGTCGATCGTAAAAAAGCAGCCAAACGGCTATTGTT
AGAGAAACACAAATTACAGGAAATcgaacaacaaatcaaaaaagctGAAA
CAGAAACTGGTAAGCAACATACTTTgagctttttcaaaaaatagtttgat
tctCTAAAAGCAAGTTAAGAAAACCCTTTTATAGCAAACTACCTTATCAA
GTAATGCCGAGTCTCCAAATTATCCTCAATCTTAATGCCTTGAATTTATC
TACGGTCAAACAATTTGGGTTCAGGTCGCATTTAGTTTAGGACCAActcc
attttcaaaagttttgcatATACTTTTCTATTTACTGAGCCTTCTCTTCA
TcgttaaaagtttaaaatgaaTCAGAAATCTCGAGATTGATACAAACTTA
CACcattgtgtcacagacctgttGAATCCTCTGCCCACTGGAAGTTTCTT
CCAAAACATCATCCCTTGTgagaaaaataccctgaaatttaaTCCCATTG
AGAAGTAAGTCTTCATTCCTACTGGGGAAGAACAAGGAAAGAAATTGCAT
TTTTAAATCCCAACGGATATTTAGCTTtcaactaaacaaaaagaaattcc
cAGGAACTGAAAGAGGGGTATGTTTTTTGCTTGATTCTTGATTCTTCCTT
GTTCTATGAGGACTCGGACCCTATAGTCTGCACGCTCCAATATGTTTTGa
tctcggacgagaattttatacgcgatacgcatcccctatcaCAATCAATT
TCGGAGATGCGCATAGCCGTATCTGACGCATGTATTCATGTAGGAGTAAC
CCCTTATTATTCCGGTTGAATCGGAATTAATCCGATCTTCATAAAAAATA
GATTTGTTTATTCATCTTTGCTTTATTGTTCTTTACGAAATAGATTTCAT
TGACGTCATAACGAATTTACTGGTCTTTAGCtataagaaaaattgaaatt
ttagaatagCAGAAAAGTAGTAAAAGTTAGTTTCAATTACGTGGGATAAG
TCCCTATTAGGACCCTGAAATTTAAAAGActctttattaaaaaaagaact
ATTAAAACTATCAAGAAGTTGTTATTATGTAGCAACCGGCAATCGGATTT
CTCTAGAAGCCTCGAGAAGAATCCTATGCTTACAAGGGTCCTCTACCTAT
CTAATTTAGCACCTTTCCATTAAAATAATATTCTAAAGAAACGTGATATG
AAAATCAGCTCTAGACCAAATAGCTTGAGACTTGTTTACAAGTTTTATTT
CTACCAAGCAAAGAGATATGATATTTAAGATACGTTTAGATGGAAAGTAC
ACCGTGTATGAGGATATtactttttgtttgtattttttttttttttttga
gaaatttctgTATCATGATTAGAAAAGGTTAGCGATTTCCACAggggaaa
atattcaaaattccaCCGTGACTTTCTGGGTTAATTCAAGGtgaaaattt
gcaatatttgaataattttcgTTGAAATGGTCTGAATCTTTGCAAAGGCG
CATCTCTTTACCAAGTATAGATTCACTTAAAGATCACGGTGATTAATTTT
TctcgtaatgttttctacggaaatactcCGGTTTTTGGGGTCAAGatgaa
cattttacaagaatctttgtcattggattggtcgttaactattcaaacaa
aaacttttattatatttttctaaagaacgcgtcatctctattgttttgaa
aaaccaattatgtgagcatcttataaaaacttaatCACAACtgggttttt
gccagtagtggcagattttatacaacttttgtatctagtttaaatttgcc
actactggctaaaaccagagtatttccgtagaaaacattacgtcatgaat
atcatgaatctaGATATTTCGgatcacccctgtctcacagctccggtgga
actttttttctccatGGGGATAAGATTCCTTTGTTCCAAACTTAACAAAC
TCAATGGGggtggttttgaagtgcaatttttcaaaCACTGAATTTCGAAC
gaagataaaatcaaagtcaatttcccagtgggcctgaaattccagggtat
tttcccactggcGACGATTTTGGcgacaaattttccagtggggctaggGT
CCCagagggtctgtgacacaggggtgtttctATGGTGGTGGAGAATCTAT
GCTATTTATTGGTTTTACGCAGATTTAACATACTTATTCAATATACGATC
AAAACAATTatcaattttaatcaaaaaatttcgttttttgaaATCAGATA
TTTATGATTAATTTCCGGTAGCTATACTCAGGACCAAAACGATTTGCTTT
AATTGAGAAATTGTTGAATTTAATATTAGACTGATGAGTTTGTTTTTCCC
CTTTTGATTATCTTGTATTTAATTGAAGCAGTAATTGACGGCGGAGTTCC
CTAGatagatttcaaaataaaatcaaaataattaacTGGCCGACGAACTA
CTGCTTTAATCACTGGCTTATAGAAATGCGAGAGACCAACAATAATTTTA
TTCAGATCCCTTGGTACAATTTCAAGTTATAAGGAAACCTGTCTCTCCAC
ATGCCCCAGGTAAGTCTCCCctaaagacacccccttctcacaaacccggt
aggattttctcAGCTAGTGGGGGTAAAAgtaacggactaaaactcgatgg
gggttAATATTCCCATATTTCTCATGGCCGggaatttaaattcttttgtt
ttcaagtcagaaaattcagtgaagATTTGAAAGAtatcacaatattttgc
agtgaggattggtttatttgattattttcagtggggataaaaatgggagg
atgattttccaccggggacgatattctGGTCATTTTTCTaatgggaaggg
ttcccagtgggtctgtgagaagggggtgtgtaaAATGCTTTGAAGTTGAA
GATGAATTTGCGGATGTAAAAGTCAAAGACGGGGGTGGCACTGAGGCTAC
AACTAAACTACAATTTGATAAATGACGTCAAACAAGGGATTGtttttatt
caagtaggattattttttgcggctttttataaatttgtacttttcctttt
tctaaaatatttaaaacatattGTTGTTGTGATTCTTTCATCTTGGATTT
TGTATTAATTATTGATAGgtttgggaaaaaatttttttctcacgtGGGTA
TAGATTTCAACTTGATTTGATTTCgtccaaaattttaagaaaataggaAA
GGTGTTGAATGTTTTGGACAATTTCTTCCTGTTGCTTAGCCCGGGGTCCa
gttaaagctttttgataagactggatggcgcgattaagtggcccggtagt
atatggtaatatgcttttacttaggcggactgtaaaacagtctgccagat
tttagttgtttttcgAAGCTAAAAACAGTGTGGGcaaagtttttatttga
taataaggtattgcaaatctgttattgatgttggtttctcatttttgatt
acatctttcaactccaagtagtttttctgttatttggattttaaacattc
tttttcaaaacttgtgcattcctttttttatttctttcttccaaaatgtA
TATTGCGTTTTTGTTACAGATTATCATGGTTAGTCGCTAGTTTATATTTC
CTTCAGTGCATATAACTTCATTATATAGCTCCTCTGTCCACACAATTAAT
TGGACTTTAGAGGGTTCTTCTAATTTACGCCTATGATTGTTTATGATTTC
ACCTAAAAGACTTAGTGGGGGCCTTACTGCACGCTTGGTTAGACTCTCGC
CACATCGCCACTTCTACGGTTTCGAATAGTATACGATTTccgaacacccc
tgtctcagtgacatGGTGAAGCTTTAAAGAAGtgaagtttcaccggggct
agGTTGAGATCTGGATAACTCACTAGGTTgagtagcccggggtccactta
aagctttttgatagactggatggcgcgattaagtggcccggtagtatatg
gtaatatgcttttgcttaggcggactgtaaaacagtccgccagattttag
tcttttttggaaggtaaaaacagtatgaagcaatatttttatttgaaaat
aagggattgcaaatctgttaatcgtgtttgtttctcatttttgattatat
ctttcaactccaagtagttttattgttatttggattttaaattctttttt
tcaaaatggcgacctcgccaaatgctcctagtctacttcactgaacTCAG
CGTCGTCAAAAATcattagaaagcaaagttcagccagaagtagactctag
tctatagGTTGAGGAGAATTGACTTTTaaagtagtctgaatcgcagacct
ctacgaAACCGTATCTCATTGGGGCTTTCAATTAGGCCTTTTTGGCAATA
TGTCACTGGGTCATGCACAACGGTTGATCTGACTGGTTCACAACTAATAC
AGGGGTATCATAGAGAACTTGCACTGCGTCTTTCAAAAATCTATTACGTC
ACAAAATCATCACGTGATCGAATTGTTTACAACTAATTATCTACGAAAAC
ACAAAACAAGATCATAATTGAAAGAAAACTCATATTAAGCATTGTTTgta
aaaagaagatttttttttacaatagtatagtaaattttgaaaagtttttt
ttgatgtttttgaagaaGTTCTTTTCATCATCGGGTTCTTCTagtgtttt
tcctgattttttttgaatttttttttttttttttttgataAtttttttat
tcttttacaTAGATAGTAACATCaaataaaacacgtgtgaaaattataaa
agaaaataatgagaaataaacgatgaaaaataaatgaagaaaatatattC
TTGATATTTGGTTGTTTTTCCATAATTTTCTTCGCTAAGAAAAGAGGAAA
AGGAAACATTGAAAACGTTGGATTACTTTTATGGCGTTTTTCATTAGGAG
AGCAAACATAACAATTGACGTAAGTAGAACTCCTTTTGATAGAGCCAAAA
TACTATATTTTTAGGTTTCAACTTGAGACTAGCTCTAGACGATTCCAGGG
TCCAGGAATTTAAAGGTTTATTATTGcacaagtgttcccgtttcatatca
gacacctatttcatatcgggacagtgtctgcctattgttatattgggCTA
ATATAAgcaaacaaaatgtttttcttttcctctttctgactaatcttgct
ccacattcatgtcaatccaatgtgaaaaagcttatgtgaattaaattgat
gagtaagcaaacaatatcactcttatttaaaatcaaaacctttaagtttt
tGGCTagcgaagtcttatgttcttatatagtttgttcttataaaaacgtg
tagaacGGCAATCTTGAAAACAATCTTcgttaaaaaacaagttttggaaT
GATTGCGGTAAGCTCTTTCAGGTCGACACAAATTCAGGTTATCAAAACGG
GTTATCAGAATAAGTTGTTTTTAAAGCCAAAATATCTAAACCAGATGTGG
TATAATTAACATGTCATTAAGAATAAAACAGAGTTATAAAAAGCATATTC
CCAATAGAGAactaagaaaaaatatattgcaatcttgtttttttccactt
ttttttttacataagaacaaagtatataagaacataggatTTTAAGGTTA
GAAATTTGAGAGATTTCtaagaaaattcaaaacgtGCAACTTCTTCGGAA
ATTAGACCAAATACTCACTCAaaatatgctgaaaataagaacatgttgag
aacatttttaggcttaaaacctgaagagttaagaacattcgaatgATCTt
tcgacgttcttataaaaaatattgcatGATACTTAATTTAAATTAAAGag
agaagaaaattattttcttatcatCAAtatctttctgtttttttggTTTC
TGGCAGGgaaaaaaaaagctgataaaaaaaaGGTGATAACAATTTTCTCT
GAACGATATCTTTTCGCGATATTCGCTTTCAAATGATTATAAATTGATAG
CTGAAAGTctgatatattttttgtttcgtttttcaTTCCTAACGGTCGAT
AGTGTTCACacctttttccttaaaaaaatgtttttttggatattttcttt
tctttagttCGATTGGAAATGGCCGAAATTTGAGGCTCTATTGATAGCCA
AGGTTCAAAGGCCAGTCAGTAGAAGATATAACAAACATGCTCGTCTTTGC
CTATCGCCTGTTTTTTAGGTTTCCAAGTTAAAATGTCTTTTATTGTATAA
GCTCCCCCTCCCGTCAATTCACATATTGTATTCAcggaatttcttttgaa
attcacgCAATTTCTGTTCACGCAATTCTTTTCATTTACGCATTCACGCG
AACCGCCTGGGGACTCCCTTGTATTTGCTGGGAATAAAGGTCTTATTGAG
TTAGTGGTTCACTAGCCTTTTACCTACTTTTTGCTTCAATGTGACTATAC
TATCATATTGTGACAAGCTTGTGGCCTTGTAtccaaaaaaaatgttatta
agTCTGTGGTCAATATGTCACTACCTTTCCGGATCCGTTGCTAGCTTATC
GACAAcgtcgcaaaaaaattttgacattttgatgacgtcaacaaatatgg
ttgattatttttttgcgaTTCCTTTTAcactaaaataaacaaataagaTT
TTCGCGGTGAACAAAACTACGTTATAAGCAGTTATAAGAATTGTTATGTG
GaaattgttttaatttgatTTCTGGTTATTCACCCACAGTTTTCCGAAAT
CCGTTATAATGATTTGGCTTTTTGGTTTTCTAGTGGTGTTCAACTTTATA
CTTAAATTCTATTTTGAATTGTTGGTTTTAGTCCCGTTTTAGTGTCTGAT
CAGGATTTCaatacataatttttatgaatcttataaaaaaagtctccatt
ttgtttttctcgTTTAAATCCTGGATAACCTGACAGTTGACAGTCAGCCT
GTATATAGACATTTGCAGCCCTTGATtctatttgttttgattgacgtCAC
TTATTTTGAGAGGACCTTATATATTGACTTGATCAAGACTGTTGTTGCAG
CAGACCTGAGTTGTAATGGATCAGGCCTGTGTGTTTTGTAGAAACATGAC
TTTGAGGGTTTTGATTGAGCTTTGTACTATTGCTATGTTTTACATCTTTA
TCGTCCGCTTTACAATCTAAcagcaaaacattttttcaacgtccatctaa
cgttattgagatttttgattttactgagcGTGATACCTTTCGTGAACGCT
ATCAGAATCTTATAAAAGTGAACTGAGGGATGTTATGTACCAGCCTGTTT
TATGAATTTAACAGTTTGGTATTTCGCGATTGCCATACATAGGTTTTATC
TATTGAAGTGTTTTGGATCCGAAAGGACACAAAAGTCTCCTTAACTCGGA
ACACGCAgggggggggacataaatttgttcgagttacggacatttcgagt
tatggagtacggtttataaggcattgttagctGAAGGGacgcaattcatg
atattcatgatgtaatcttttatacggaagcacacaaaataatccggaat
tagtggcaaaattagtggcaaaatttgccactagtcttttgttattctgc
cactagttccggtttatctcgggtgcttccgtataaaagattacgtcatg
aatatcatgaatatcttgttcgagttaaggagacattcgaattatacTGT
ATAACATGGGATGTGATTCTCATGTACAACGGTATTAATAggccagcgtc
cgagattcagtTTTGCTGCCTTTTCATTttcactacctcggccgctggtc
tataatcaaaaagaatttgaaatgtttttggagCTGGGGCTAAATCTCTG
TCtgtagagtgtctcttatttggAGTACACTGTATGACAAactatgtttt
tttcttttctcgttTCCAGAAATGAACGCGAACAACACGTGCAGACCACG
TGCCAATACTACCGGTGATTTACCGAGCATCAATGACGAAAAACCGGTCA
CCTGTCCGGATTGGGGATGTGGTTTTGATGAGCAAATCTATTCCCGTAGT
TGGAGTAGTTCGGGATCAATTTCTGACGTCACCGACGACTCTTTGGAAGA
TTCTATCGAGGATAAACATTTTGCTAAAGCTTTGAATCAAGGTGTTTTTG
GTGGCGTACACGaaaaaaatcgcaaagatcgcaaaaaaagttttgacaaG
GATCACCATCATCATCATTCGCATAGTAACCGTGGTCACCATCACCACAG
CAACGCCCTTAGCAACCATCATAATAATCATTATCACCAACGATCACAAC
GTTTTATTGATGATGATTTGTTGAATAATAATTATCAACGACCTCGTAGT
AAATCGATTGATTTGAAACTAAGCTCTGGTGAAAAACACCACCACCATCA
TGGTAAAAAAGccaattcaaaacaaaggcgcTTACGTCAAGAGCTTTCCG
ACAGTGGCTTCAACTTGAATGATACAACCGAAAAACTATCAATTGATGAA
ATCTACGAAATGCAAAACCGCTTT Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000150_pilon:752671..761144+ >XLOC_035654 ID=XLOC_035654|Name=XLOC_035654|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=1428bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000150_pilon:752671..761144+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon) ATGTGTAGAATACAAGTCGATCGTAAAAAAGCAGCCAAACGGCTATTGTT AGAGAAACACAAATTACAGGAAATcgaacaacaaatcaaaaaagctGAAA CAGAAACTGATGTGTAGAATACAAGTCGATCGTAAAAAAGCAGCCAAACG GCTATTGTTAGAGAAACACAAATTACAGGAAATcgaacaacaaatcaaaa aagctGAAACAGAAACTGAAATGAACGCGAACAACACGTGCAGACCACGT GCCAATACTACCGGTGATTTACCGAGCATCAATGACGAAAAACCGGTCAC CTGTCCGGATTGGGGATGTGGTTTTGATGAGCAAATCTATTCCCGTAGTT GGAGTAGTTCGGGATCAATTTCTGACGTCACCGACGACTCTTTGGAAGAT TCTATCGAGGATAAACATTTTGCTAAAGCTTTGAATCAAGGTGTTTTTGG TGGCGTACACGaaaaaaatcgcaaagatcgcaaaaaaagttttgacaaGG ATCACCATCATCATCATTCGCATAGTAACCGTGGTCACCATCACCACAGC AACGCCCTTAGCAACCATCATAATAATCATTATCACCAACGATCACAACG TTTTATTGATGATGATTTGTTGAATAATAATTATCAACGACCTCGTAGTA AATCGATTGATTTGAAACTAAGCTCTGGTGAAAAACACCACCACCATCAT GGTAAAAAAGccaattcaaaacaaaggcgcTTACGTCAAGAGCTTTCCGA CAGTGGCTTCAACTTGAATGATACAACCGAAAAACTATCAATTGATGAAA TCTACGAAATGCAAAACCGCTTTAAATGAACGCGAACAACACGTGCAGAC CACGTGCCAATACTACCGGTGATTTACCGAGCATCAATGACGAAAAACCG GTCACCTGTCCGGATTGGGGATGTGGTTTTGATGAGCAAATCTATTCCCG TAGTTGGAGTAGTTCGGGATCAATTTCTGACGTCACCGACGACTCTTTGG AAGATTCTATCGAGGATAAACATTTTGCTAAAGCTTTGAATCAAGGTGTT TTTGGTGGCGTACACGaaaaaaatcgcaaagatcgcaaaaaaagttttga caaGGATCACCATCATCATCATTCGCATAGTAACCGTGGTCACCATCACC ACAGCAACGCCCTTAGCAACCATCATAATAATCATTATCACCAACGATCA CAACGTTTTATTGATGATGATTTGTTGAATAATAATTATCAACGACCTCG TAGTAAATCGATTGATTTGAAACTAAGCTCTGGTGAAAAACACCACCACC ATCATGGTAAAAAAGccaattcaaaacaaaggcgcTTACGTCAAGAGCTT TCCGACAGTGGCTTCAACTTGAATGATACAACCGAAAAACTATCAATTGA TGAAATCTACGAAATGCAAAACCGCTTT
Gene-mRNA-Prot
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Position
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
| sc0000150_pilon | genome | sc0000150_pilon:752671..761144 + |
Properties
| Property Name | Value |
| Aaloc | 112-714:7872 |
| Aaloc | 1-108:1 |
|