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Sequence
The following sequences are available for this feature:
mRNA from alignment at sc0000375_pilon:107579..109929- Legend: polypeptideCDS Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >XLOC_035384 ID=XLOC_035384|Name=XLOC_035384|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=2351bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000375_pilon:107579..109929- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
TACATTTCTCAAGAACTGACGGAGAAAGAATCCAAAAAACTTCTCAAACA
ACTTCGTATTACGGATGAGGATTCACAAAGAAGATTTTCAGAAAGTTTGG
AAGATATCTCATGGCTCGATCTAAAGAGGGAGCTCCAGATGATGGGGAAA
TATGAACTCGTTGACCATATCATAAAGAAAACTTTGATAACTAAAGGTAT
TAATTGATTTTATAATTGATTGATTGATTGATTGATTGATTGATTGATTG
ATTGATTGATTGATTGATTGATTGATTGATTGATTGATTGATTGATTGAT
TGATTGATTGATTGATTGATTGAGTGATTGAGTGATTGAGTGATTGAGTG
ATTGAGTGATTGAGTGATTGAGTGATTGAGTGATTGAGTGATTGAGTGAT
TGAGTGATTGAGTGATTGAGTGATTGAGTGATGATGAGTGATTGAGTGAT
TGAGTGATTGAGTGATTGAGTGATTGAGTGATTGAGTGATTGAGTGATTG
AGTGATTGAGTGATTGAGTGATTGAGTGATTGAGTGATTGAGTGATTGAG
TGATTGAGTGATTGAGTGATTGAGTGATTGAGTGATTGATTGATTGATTG
ATTGATTGATTGATTGATTGATTGATTGATTGATTGATTGATTGATTGAT
TGATTGATTGAGTGATTGAGTGATTGAGTGATTGAGTGATTGAGTGATTG
AGTGATTGAGTGATTGAGTGATTGAGTGATTGAGTGATTGAGTGATACTG
AGTGATTGAGTGATTGAGTGATTGAGTGATTGAGTGATTGAGTGATTGAG
TGATTGAGTGATTGAGTGATTGAGTGATTGAGTGATTGAGTGATTGAGTG
ATACTTATTGATTGAGTGATTGAGTGATACTTATTGATTGAGTGATTGAG
TGATTGAGTGATTGAGTGATACTTATTGATTGAGTGATTGAGTGATACTT
ATTGATTGGTTGATACTTATTGATTGGTTGATACTTATTGATTGGTTGAT
ACTTATTGATTGGTTGATCTATTGATTGGTTGATCTATTGATTGGTTGAT
CTATTGATTGGTTGATCTATTGATTGGTTGATCTATTGATTGGTTGATCT
ATTGATTGGTTGATCTATTGATTGGTTGATCTATTGATTGGTTGATCTAT
TGATTGGTTGATCTATTGATTAGTTGATTAATTAATTAATTGATTAATTA
ATTAATTGATTGATTGAGTTACTGATTTAGTTATTGATTGATTGATTGAT
TGAATTATTGATCGAATTTTTCATTGATTGACTGATCGATTCATTGATCG
ATTCATTGATCGATTAATTTTTGATATATTGATTGACTTATTGAATGATT
GATTTTAATTGATTTTAATTGATTTTATAATTGATTGATTAACTTATTGT
TAACATATTTATTTTATCATGATTTTGAACATTATTACAGGTCGTAAAGC
TGCTTCTGACGGATTACGTAGACATTACGTAAACGATTTGATCCATTGTC
TGGTGGAGCAACCTTTATCTCAAGCAGATGAAGATACAAATTCCGTGTTG
CGAGAAGATGTGTTTATTGATCTGGTTGTGCTACCATCTTCGACCGTCGA
CAAAGAATGGTCTAACTCCGATCGTGCTGCTTTAATTGAACAGCAATACA
TTCCCAAGACCTCACCAAAAACGTCAGTCAACAACATCTTTTCTCAAAAA
GACGAATTGGTCTTCGTGAGGGGGATTGGAGGTATCGGAAAAACGACACT
TCTTGAGATGCTGACTTATAAATGGGCGAAGGGAGAGCTTGATGCAGAAG
TCAATATTGACTTTGTTTTCAAATTTACATGTCGTAATTTGAACACAATT
TCAAGTCAATTTACAAACGTCCAAGAACTTTTCGAACTGAAGTATCCTGA
AGTCATGAAATTGATTTCATTCGACGATCTGATGGAGATTTCTGAGAGAG
CTTTGATAGTCATTGATGGCTTGGACGAACTAAAAGACTTATATGTTCCA
GAAAGCTCATCAGCTTCAAGTAGAGACAGTCTTAATCTAACCGTTTTCAA
CCTGATAAATCCTAAAGCAGATTGGTTCCCAAACCATAAAGTCATCGCAT
GCGGAAGACCAAAAGCTGTCGAATTTCTGAAGAAAGAAATTCCTATCAAT
TCCAATCGAAAAAACATTGAAGTTTGTGGGTTTGACGATGAGAACATCTG
GAAATATATTCAGAACTTTTTCGGTGAACGTAAAGACAAAGCACTTTCTG
TCCATCAACTCATCAAACGATCATACAATTTACGCATAATGGCGCGTGTT
CCAGTCTTTTTATCCGTAATCTGTACAGTTTTCGAGGAAGATTTGATAAA
A Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000375_pilon:107579..109929- >XLOC_035384 ID=XLOC_035384|Name=XLOC_035384|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=2214bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000375_pilon:107579..109929- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
TACATTTCTCAAGAACTGACGGAGAAAGAATCCAAAAAACTTCTCAAACA
ACTTCGTATTACGGATGAGGATTCACAAAGAAGATTTTCAGAAAGTTTGG
AAGATATCTCATGGCTCGATCTAAAGAGGGAGCTCCAGATGATGGGGAAA
TATGAACTCGTTGACCATATCATAAAGAAAACTTTGATAACTAAAGTACA
TTTCTCAAGAACTGACGGAGAAAGAATCCAAAAAACTTCTCAAACAACTT
CGTATTACGGATGAGGATTCACAAAGAAGATTTTCAGAAAGTTTGGAAGA
TATCTCATGGCTCGATCTAAAGAGGGAGCTCCAGATGATGGGGAAATATG
AACTCGTTGACCATATCATAAAGAAAACTTTGATAACTAAAGGTCGTAAA
GCTGCTTCTGACGGATTACGTAGACATTACGTAAACGATTTGATCCATTG
TCTGGTGGAGCAACCTTTATCTCAAGCAGATGAAGATACAAATTCCGTGT
TGCGAGAAGATGTGTTTATTGATCTGGTTGTGCTACCATCTTCGACCGTC
GACAAAGAATGGTCTAACTCCGATCGTGCTGCTTTAATTGAACAGCAATA
CATTCCCAAGACCTCACCAAAAACGTCAGTCAACAACATCTTTTCTCAAA
AAGACGAATTGGTCTTCGTGAGGGGGATTGGAGGTATCGGAAAAACGACA
CTTCTTGAGATGCTGACTTATAAATGGGCGAAGGGAGAGCTTGATGCAGA
AGTCAATATTGACTTTGTTTTCAAATTTACATGTCGTAATTTGAACACAA
TTTCAAGTCAATTTACAAACGTCCAAGAACTTTTCGAACTGAAGTATCCT
GAAGTCATGAAATTGATTTCATTCGACGATCTGATGGAGATTTCTGAGAG
AGCTTTGATAGTCATTGATGGCTTGGACGAACTAAAAGACTTATATGTTC
CAGAAAGCTCATCAGCTTCAAGTAGAGACAGTCTTAATCTAACCGTTTTC
AACCTGATAAATCCTAAAGCAGATTGGTTCCCAAACCATAAAGTCATCGC
ATGCGGAAGACCAAAAGCTGTCGAATTTCTGAAGAAAGAAATTCCTATCA
ATTCCAATCGAAAAAACATTGAAGTTTGTGGGTTTGACGATGAGAACATC
TGGAAATATATTCAGAACTTTTTCGGTGAACGTAAAGACAAAGCACTTTC
TGTCCATCAACTCATCAAACGATCATACAATTTACGCATAATGGCGCGTG
TTCCAGTCTTTTTATCCGTAATCTGTACAGTTTTCGAGGAAGATTTGATA
AAAGTCGTAAAGCTGCTTCTGACGGATTACGTAGACATTACGTAAACGAT
TTGATCCATTGTCTGGTGGAGCAACCTTTATCTCAAGCAGATGAAGATAC
AAATTCCGTGTTGCGAGAAGATGTGTTTATTGATCTGGTTGTGCTACCAT
CTTCGACCGTCGACAAAGAATGGTCTAACTCCGATCGTGCTGCTTTAATT
GAACAGCAATACATTCCCAAGACCTCACCAAAAACGTCAGTCAACAACAT
CTTTTCTCAAAAAGACGAATTGGTCTTCGTGAGGGGGATTGGAGGTATCG
GAAAAACGACACTTCTTGAGATGCTGACTTATAAATGGGCGAAGGGAGAG
CTTGATGCAGAAGTCAATATTGACTTTGTTTTCAAATTTACATGTCGTAA
TTTGAACACAATTTCAAGTCAATTTACAAACGTCCAAGAACTTTTCGAAC
TGAAGTATCCTGAAGTCATGAAATTGATTTCATTCGACGATCTGATGGAG
ATTTCTGAGAGAGCTTTGATAGTCATTGATGGCTTGGACGAACTAAAAGA
CTTATATGTTCCAGAAAGCTCATCAGCTTCAAGTAGAGACAGTCTTAATC
TAACCGTTTTCAACCTGATAAATCCTAAAGCAGATTGGTTCCCAAACCAT
AAAGTCATCGCATGCGGAAGACCAAAAGCTGTCGAATTTCTGAAGAAAGA
AATTCCTATCAATTCCAATCGAAAAAACATTGAAGTTTGTGGGTTTGACG
ATGAGAACATCTGGAAATATATTCAGAACTTTTTCGGTGAACGTAAAGAC
AAAGCACTTTCTGTCCATCAACTCATCAAACGATCATACAATTTACGCAT
AATGGCGCGTGTTCCAGTCTTTTTATCCGTAATCTGTACAGTTTTCGAGG
AAGATTTGATAAAA
Gene-mRNA-Prot
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Position
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
|---|
| sc0000375_pilon | genome | sc0000375_pilon:107579..109929 - |
Properties
| Property Name | Value |
|---|
| Aaloc | 199-1107:910 |
| Aaloc | 1-195:2352 |
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