XLOC_035352 (mRNA) -

Overview
NameXLOC_035352
Unique NameXLOC_035352
TypemRNA
OrganismClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon (Jellyfish)

Sequence
The following sequences are available for this feature:

mRNA from alignment at sc0000013_pilon:2689427..2702496-

Legend: polypeptideCDS
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>XLOC_035352 ID=XLOC_035352|Name=XLOC_035352|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=13070bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000013_pilon:2689427..2702496- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
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CGCGTTGTGATCAAAATGATATCATAAGTGCTATCTACTTGTCCATTTAC CATTTCGTATTGCATTGTTTTTTTTTGCTTGGTTATTGTAAACATGCTAT TGGAATAAATTTAATGAACTATTATTCAAAAAGAAAACTACTTGTATTTA TAAATGTAAATGATTCGTCTATTTGATTTTTTGATAAAATCTTTGAACAG GTTTATAACAGGACATATCTAACATTGTAATTTGTCCCTAGATTTTTACT TTATCTTCAAAAATGTTAAAAGTCGAATTTAAATGCTCAACATACGGAAT GTTCATTTTCTACTCAATCTAACTACTAGGGGGGGGGGGGGGTTCAGGGT GTACCCGATTCCGCAATTCCGCCAATTTTTTCTCCAATTTCCGTCAAACC GTCTTAAATTGAACCAAAATTCCGTCACCGAAAATTCCTTTGAAATTCAA TATTTTTGTCGAAAATTCCGCAAATTTGGAATATCTTTTACCAATTCCGA AATTCCGCATTTTTTTTGCTAAATTCCGTTTTTCCGCACTAAAATTGTCT GATTTTCCGTCTCCGTCAGAGAACCCAATTTCCGTAATTCCGTCTAAATT TTCGCCAAATTCCGCCACTCCGTCCGAAAAAAGGGCCGATTCCGCTCCTC CGCCAAACGTGAAACCCCCCCCCCAACTAGGAGTTTTGAGTAACCTGGAC AAACATTTTTTAGCAAAATGTGGTTTTTAGCTCTTAAAATTTTCCAATTT CGGTTGATTCTTTATGCATCTAGTCCTTCCTTCCATCTCAGCTACTTAAC TTCTTTACAAGCTATCCAACTAATAATCTAGCTATATTGGCTGACTTTCC AGCCTCGGCTGGTTTATTTATATTTAAAGAGAACATGTCGGCTATTTAAT GGGCACTTTTATTTTAAATCGTAAAAGATGTATGAAATAAAGAAAAACTA 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TGAATATAATTTTGTTCAGTTTAACCCATGCCATATGTGTTAAGTATATG ATACTAGTAGAAGATATGCTTTATTGTTTAAAGTAAAGGTGTGAGATTAT CTTGAAATGTGTTTTGATAGACAGTTTGTGAGGAGAAAGTACGCCCTTTC ACTAACTATTTATATATAACAAGCAGTGTCAGCAGAGTCAACGAGTATCT GTAATGATTTCCCCAAGTTCACCATTGTTTTTCAAGATATCCAAAATATC TGCTATTTGACATAAAGTTAAATCAGCTTGTATTAGAATGTATAAAACAG ATAATTCCTGTATTTGATGCCCTGTGTTAGATCGTGGCCGGGAAAGCCTG CGTATGCATAAAAGTTTGTTCTTTCTAGTGGGTCATTTTGTAGTACTTGC TTGTGAAGTAACAAACCATCAACCCTTATTTCTACTATGTACTTTCCCAA TAATGGTGAATATAATTGGGTGATTAGAATCTTGTAATAAACGTTTTTGA CGATATCTAAAAGGAAATTTCCAGGTTGTTTGATCTTTAAACTTGTGCTT CCTGATCCGCTGAGTGTGATGATTTTTTGCTCAGTGTTTTCATCACAAAT TTTGAAAGCATTTGAATGTGTTAATATATCCGTTGTTTTCATGACATCGA TGCTGAATATCCAATTTTTGTATACATTTTTGAATTTTTGCAATGTTTGT TGGTTGGCCATAAATTCTAAAGACAATATAAAATAAAGTAGGACGAGGTA ATTTTAATCACATTTCTCGAAAACGATTCAGAAGATGTTGAAAATTGTTC AGTTGGACTTACCACTTGGGTTTTGATCGACATTATACTCTATGCCAGTA ATGGAACAAAAAGGACATTCTCCAAACGAGAACCTCACACCATTGCCAAA TATTTGATCATTATGCTCAATTCGGACGACTTCGTTACCATCGACACGTG CTGAATAGACCATTGTGTCTGAGGATGCGTCAAAATAAGTTGAAATTTCC AACTCATACTTAGTATTCGGCTCCATTTGAGGGATCAGTACATCTCCAGT AAAGGTATTGGGACTCTCCATGAAACTAATTTTTAATTGAAAAGTTTCTT CTGGTATCCTGAGCTTTAAGATATATAGTTCACGGTGGGAGTCATAAAGT ACAAAAGGATTTCTTTCCACTGTATCGGGTACATCAGATGTAAATGTGAA ATTTGCCCTAATCTTCATTATGGGCGTCGTGTGTTGAAATACATCCAACC ATAAACGTGCGTTGTTTGAAATGACTTCTGTTAAAAGAAAAAACACAGGA GATTGTTAGTTTTACATGTCTTGTGTTTTTACACAATTGAGTCTCCATAA CTTGAACACGCACGTGAAGCACAAATTTATTCGAGTTATGGAAATTTTGA GTTATGGATAAGGTTTGTAAGGTATGGTTAACTGATAGGGTGAGAAAAGT TGTTCAAACTGGGGAGACATTCCAGTCGTAGAGGTTCGAGTTAAAGAGAC TCTACTGTACTTACTTATGTTACAAGGGAACAATCTTTGGCGGAAAGAAA CTCTCACGGTGCGGGAATTAACCTAATCCTGATTCGTGATCTTTGTAAAG TTTTGCACGCTGGATGAAGCTCTCGCGAATTACGGTACTCATTGGTTCCT TGGTCAAATTTTTTTTTTTCAAATTACGAAAAACTAAGATGAGATTGCTT TTACCGATACAAAAAATTAATACAAAAAAGCGAAACTGGCTGACCTTTTC GAGTACAATGTTCTCCACGAACACATTTACATGTATGAGAGTCGCTGTCG AACTTTGGTTGACAATATATTCGTCCATTTGTCGAACAAATGTTTTCCGC TGTTGAGCAAATCGTCTAAAAGGAAAATGAGAGTATAACAAAGCATTTTA CGTCGAGGTGTCCTTTATTGGTGGCATAGGAGTTGTCTTCTTTGAACTGT CTACGCTATGGTTTATCCTACCTGCCACCTGGCAAAACACTGACAAAGTT TTTGGATCGAGTGACTCAATCAAAAAGGAACCATTTGGGAACATGACCAT ACTTTCACTTCATTCGTGATGGGGTCTGCGATTGATACTTAGCGCAGTCA TCGACATGCTTTTCTCAGTTTTTATCTAGATCCAACTCCCCTCACATCGA ATGTGTTTACTCGGAAGAAGGTACATTCACATACCAATTGAATCACTGCA CCGAGTGGGCATCGAACACCGACCTCCTTAAGATCGATATCCACTGCACT ACTGCATCAGTTAAAATAGACATATACTTACTGACAACGTATGGTGTTCG GCGTCGTTGGCATTGACCAAAAGATAAGGTTGTTTATAGTGCGTGTCGTC TAAAAGCTGACATCGAAAATATGTCTCATTCTCCGCTATCAAATTCAAAG AAACGCAACCAGCACATTTTATACATTCGCCTTTACATTCAACAATTGTT CGAACGAAAACACTTTTGACAGGAGTTTTAATCAGCAGCTTATCCTCAAA TTTCGTCATACTGATGTACGAAACTCTAATATCTTTCCCATTTTTCCCTT TAATAATTTGATGGCGTAATATTTTCTGTTTTATTTCTGTAGATGTGTTA CAAACACTTAGAATTGATAAAACCGCCAAATGGAAATAAATATTTTTCTT TTTTGACATCTTTTCTTGGTCTTCGTATACTGTATCTTCTTCGCCGAATT TTTTTCTGTAATTTAACTTTAAAATATTTTAGAATTTTTATTTTGACTTT AAAGTTGTTACGAATTTTATGGATATTTCAATGCGTTGAATTCGTTGTTA ATGGACTCCTAAGATTGGATTGTGATGTTGATTGTGATAAGTCTTAAATA ATGAATGAAGTAATTCAAAAACTAAATCTATGGTTCACTCTTAATTCAAC CACCCATCGTTCCTGTCATGACTAAATTGTTGTAAATATCAAAAAACTTT TCAAAAATCTTTTATATTTATAACAAATAAAAATGAACATTCTGAAAATT GAAAATGAGAATTTTTTGGATTGAATTTTTGAACCTGCTAGAACGCCTTT TTTTCTATGAAATCCAGAACAAATAAACCCAAATAGTCCCGTAGAAGCAT AGGCAACAGGTGTACCTTTACCCCTACAATAGGTTCAGGGTGTCTACGGG AAAACCATGAAACCTCAAAAAATAAACCCTCCAACTAAACCATAAAAACC TTAAAACCTGAGAAGCATGATCTTTTATAGCATAAACATTTGAATTTGTC TTTTATCTACGATTTTTTTTTTCGTTTGCTACTAAACAAAACTACTTTTT TATAAATGGAAACTGCGAATAGTTTCTCCTTTGTCACACTTTTAGGATTC TTATTTTTCCCAAGATGAATTATTGAAAAACTTTGAAAAATACCGGACCA GCCTGTTAATTGTTCGGATTGTTTATGATTTATGTTTTAAAGGTTTTGTT TTTGACTTAGACTGATATCGTTTGCTTACTCATCAATTCTAATTCACAAG CTTTTTCACATTGGATTGATACGGATGTGGAGCAAGATTGGTCAGAAAGA GGAAAAGAAAAACATTTCTTTGGCTTATATCAGCATAATATAAAAATAGG CAGACACTGTCCCGATATGAAATGTGTGTCTAATATGAAACGGAATCACT TATGTAAAAACAAAACCTTTAAGTTGAATGTTTTATTCAATTCAATTCCA TCCCTTTCGTATGAATGTATTATTTGTACCCAAACGAGTGTACATCAACT CGTCAGTTTGAATCTTACTTCTTCTATTCCGTAGACATGAAATGCTCAGG ATTTCCAGGACCAGGTCACGAAGCACGTATTGTGGCCAACCCAATGAAAG AATTCATCTATCCTGAGGATCACTCACATTTACATCAAATGTATTCCGAT TTTGTCAAGAAGTTCAGCAAACAAAACGTCGGAGAGGAGAAGAAACACAC CTTTAAACATAACCTCAGGTTAGGAGCTTTTGGAGGACTGTTAAAGGTTT TGTTTTTAAATGGACGTTTCTCTGATGCTGATAAAACAGATTTAACAATT GAATTTTATCAAATTTGCACTCGCTTAGCGAGCGAGTCCTGTCTCTTGGT TAAAAATGTCAAGTGAGCACAAACGATATAAAGGAATTTTCTTCTTGCAA AGGAGATTATTAATGAAAACTTATGGATGTTTGGGGATTGATACGCTGTA TGGTACTGACTTTAAAACCGAGTATCCCCAAATTAATCAACAACTCCTTC ATCCGCCCCCAAAGATGGCGTCTGGTATGGCAAGATAAAGACGATTGTAT CATGTTCTACTTTCTTTATTTGTATACAGATACATCAATTCGATGAACCG CAAACGTTTGACTTACCGATTGGCTGTCAACCATTTTGCGGATAATTCAC CGAGTGAATTGAGAAGACTTCGTGGACGATTGAGTGGTTCCAACAACAAA AAACACATCAAAAGCAATGCTAAGAAATTCGTCTCTGCTGTTAATGTCAA AGATTTACCAACACAAATCAACTGGCGTTTGAGAGGTATGTTTGTACATA TTCGTTCGAGTAAATCTTTTTGTTGAATGGACTCATACTGGTAGCGTTCA CAAAAAGAAGAAGGTTTGGTACTCCATAGGTAGAATCACGAAATCAGAGA GTTTTACTTAGTTGGTCTGGCCTAGTCGACTAATTTCCTTCTTTCATTCA ACTAGACACAGTAAAGTCGAGTAATTCCTCAACCCTTGTCAAATATTTCT TATCATTTTACCTTGAGCCATATAAACTAAATCAATGCCACGGTCATCTT GAAAAAAGTTAAGGGGTTAATCTTAAGAAACTGCACCAGTTGTTTTTAAG CATCTCCATTCTTTTCATTGTCTTTCAAACTTATGTAATTTACTGTCTTT ACTTTTTCAAAACTACCAGGAGGAGTGACACCAGTGAAAGATCAAGCTGT TTGTGGATCATGTTGGAGTTTTGGAACTACTGGTACTATCGAAGGTGCTG TCTTTATGAAAGTAAGCAAAGTGAATTTGTCAACATTATGTAAATGTAAT GCCCTAAAATAGTTTGCAAAACATCCTTTTCACTCATTAAACTTGTCTGA TTCATAACTCTCCTTTTTATGCAGACAGGGCATTTGATTCGATTATCTCA ACAAAATCTGATGGATTGTTCATGGGGCTTCGGTAACAACGGTTGTGACG GCGGTGAAGAGTTCCGTGCGTACGAATGGATCATCAAACATGGCGGAATC GCTACGGAACTCAATTATGGACAATATCTGGGTGTGGTAAGTTATTTATT CTCACTGTACACGTATTTAGTGAAAATGATCATCTTGGACTAAAGGCAAG AAAATACAGGTCGTTTTTGAATGGAATTTGTTTTACGTGGTTACTACTTT TCATACTTTATTTATTATACACCAGAAAATATGCTTTGTAACAAAAGAAT ATAGAAAGTTTTTTTTTAAGCAGGTTTCAGTATCGTTTTTTATTTTTTCA TTTTTGCCGAATTTAGGACTTTAGTTTTATAGGGTTAAGTTTTTAGCATT TAGAATTTTAATTTTCGATAATTCAAAATTCTTTAAATATTCAGTTGAAG TGTCTTTTCAGTACCCTACAGTTGAAGTTGAAATACTGAATTATGATTAT ATATAATTCTGCATTTTTTCAACTTACACAGGACAGTTTTTGTCATTTTA ACCAATCACAAGCCGGAGCTGTTTTGTCTGGTTACGTCAACGTGACGTCA GGATCTGAAGATGCTTTGAAGGAAGCCATTGCTACCAAAGGACCAACATC TGTTGGAATCGATGCTGCTCATCTCTCATTTGTTTTCTACGCTAACGGTG TCTACTATGAACCAAAATGTGGTAAGTTTTAACTGGTGAAGAAGGTGGCA AGGCCGAAAGACCAAAAATTAAGCAATGCAAAATTGACCAGAATATCTCT TCTCTTTTGAGACTGAAGCCCTCTAGGCTCCTACAGTTTTGATTCTAGAC AGCTATACATAATTTGACTTTAAATTTGGATTTTTGAGACTTCAGATTGA CTTGTGACTGAACAAGAAGTTCATGAAGCCCACAAATTTGCGTATTTTGA AATTGGAAACATCAATGTTAAACCCTAAATCTTTATTTAAGATATGGATG TTAGTATGCTATCTGAAATTAACTATCAGCAGTTTCTTGAACTTTAATTT TCCTTATACTGTGATGTTTTATTACCTTCTAGGAAACGGTCCGGATGATT TGGATCATGCAGTTCTAGCAGCTGGTTATGGGACTTTGGACGGTGAAGAT TATTGGCTAGTCAAGAACTCATGGTCAACACATTGGGGAAATGACGGTTA CGTCTTGATGTCTCGCAAAGATAACAATTGTGGTGTTGCTACTGCTGCAA CTTATGTCGAGTTGAAATAA

Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000013_pilon:2689427..2702496-

>XLOC_035352 ID=XLOC_035352|Name=XLOC_035352|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=2922bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000013_pilon:2689427..2702496- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
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AGTTCATTCACAAAGGTATGAAGAACTGGGACAACCGAAATGTAGATGTC
TGGGAACTAGTGGATACACACGGTATCAAAATCAACAGATATACCCTTTA
CGTTGATAGTCAAACATTGCATCCAGTCTTCTACGAAATGTTGGGCTATA
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ACACACGGTATCAAAATCAACAGATATACCCTTTACGTTGATAGTCAAAC
ATTGCATCCAGTCTTCTACGAAATGTTGGGCTATAACTCGTTATTAGGAT
CTCACTTTGATGAATACAAACTATACTATACCATCTTTGCTGAAGATTTC
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AGGACCAGGTCACGAAGCACGTATTGTGGCCAACCCAATGAAAGAATTCA
TCTATCCTGAGGATCACTCACATTTACATCAAATGTATTCCGATTTTGTC
AAGAAGTTCAGCAAACAAAACGTCGGAGAGGAGAAGAAACACACCTTTAA
ACATAACCTCAGACATGAAATGCTCAGGATTTCCAGGACCAGGTCACGAA
GCACGTATTGTGGCCAACCCAATGAAAGAATTCATCTATCCTGAGGATCA
CTCACATTTACATCAAATGTATTCCGATTTTGTCAAGAAGTTCAGCAAAC
AAAACGTCGGAGAGGAGAAGAAACACACCTTTAAACATAACCTCAGATAC
ATCAATTCGATGAACCGCAAACGTTTGACTTACCGATTGGCTGTCAACCA
TTTTGCGGATAATTCACCGAGTGAATTGAGAAGACTTCGTGGACGATTGA
GTGGTTCCAACAACAAAAAACACATCAAAAGCAATGCTAAGAAATTCGTC
TCTGCTGTTAATGTCAAAGATTTACCAACACAAATCAACTGGCGTTTGAG
AGATACATCAATTCGATGAACCGCAAACGTTTGACTTACCGATTGGCTGT
CAACCATTTTGCGGATAATTCACCGAGTGAATTGAGAAGACTTCGTGGAC
GATTGAGTGGTTCCAACAACAAAAAACACATCAAAAGCAATGCTAAGAAA
TTCGTCTCTGCTGTTAATGTCAAAGATTTACCAACACAAATCAACTGGCG
TTTGAGAGGAGGAGTGACACCAGTGAAAGATCAAGCTGTTTGTGGATCAT
GTTGGAGTTTTGGAACTACTGGTACTATCGAAGGTGCTGTCTTTATGAAA
GAGGAGTGACACCAGTGAAAGATCAAGCTGTTTGTGGATCATGTTGGAGT
TTTGGAACTACTGGTACTATCGAAGGTGCTGTCTTTATGAAAACAGGGCA
TTTGATTCGATTATCTCAACAAAATCTGATGGATTGTTCATGGGGCTTCG
GTAACAACGGTTGTGACGGCGGTGAAGAGTTCCGTGCGTACGAATGGATC
ATCAAACATGGCGGAATCGCTACGGAACTCAATTATGGACAATATCTGGG
TGTGACAGGGCATTTGATTCGATTATCTCAACAAAATCTGATGGATTGTT
CATGGGGCTTCGGTAACAACGGTTGTGACGGCGGTGAAGAGTTCCGTGCG
TACGAATGGATCATCAAACATGGCGGAATCGCTACGGAACTCAATTATGG
ACAATATCTGGGTGTGGACAGTTTTTGTCATTTTAACCAATCACAAGCCG
GAGCTGTTTTGTCTGGTTACGTCAACGTGACGTCAGGATCTGAAGATGCT
TTGAAGGAAGCCATTGCTACCAAAGGACCAACATCTGTTGGAATCGATGC
TGCTCATCTCTCATTTGTTTTCTACGCTAACGGTGTCTACTATGAACCAA
AATGTGGACAGTTTTTGTCATTTTAACCAATCACAAGCCGGAGCTGTTTT
GTCTGGTTACGTCAACGTGACGTCAGGATCTGAAGATGCTTTGAAGGAAG
CCATTGCTACCAAAGGACCAACATCTGTTGGAATCGATGCTGCTCATCTC
TCATTTGTTTTCTACGCTAACGGTGTCTACTATGAACCAAAATGTGGAAA
CGGTCCGGATGATTTGGATCATGCAGTTCTAGCAGCTGGTTATGGGACTT
TGGACGGTGAAGATTATTGGCTAGTCAAGAACTCATGGTCAACACATTGG
GGAAATGACGGTTACGTCTTGATGTCTCGCAAAGATAACAATTGTGGTGT
TGCTACTGCTGCAACTTATGTCGAGTTGAAATAAGAAACGGTCCGGATGA
TTTGGATCATGCAGTTCTAGCAGCTGGTTATGGGACTTTGGACGGTGAAG
ATTATTGGCTAGTCAAGAACTCATGGTCAACACATTGGGGAAATGACGGT
TACGTCTTGATGTCTCGCAAAGATAACAATTGTGGTGTTGCTACTGCTGC
AACTTATGTCGAGTTGAAATAA
Gene-mRNA-Prot
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
XLOC_035352XLOC_035352-proteinClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonpolypeptide
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
sc0000013_pilongenomesc0000013_pilon:2689427..2702496 -
Properties
Property NameValue
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