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Sequence
The following sequences are available for this feature:
mRNA from alignment at sc0000007_pilon:813831..821338- Legend: polypeptideCDS Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >XLOC_035194 ID=XLOC_035194|Name=XLOC_035194|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=7508bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000007_pilon:813831..821338- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ATGCACAAGTCCGACAGAAACATAGGCAGAGAAGTTTATGCTCATAGAAC
TAGTATGCCATCTTCAAGAAAAACTGGTTCTTCTGGACAAAGATCCAGTC
ATGGATCAAGAGGTTCATCAAGCTCTGGTTCAAATGTTTTGATGGTTGGA
CCAAATTTTCGAGTGGGTAGAAAAATTGGATGTGGAAATTTTGGTGAATT
GAGACTTGGTAAATAGCAATATCAATTATATTTGAAATACCTTGGTTTGA
AAATATTGTTTGTTTTATATTTTGAAGACTAATTAATCTTCATAATTTTA
GGTTTCTCAACAGAGCTGATTTTGACAAGTGTACCGGGTGACCCACGAAA
AAGTTTGGACGTTTCTCGGCGTCTTGAGGCCGAACAAATGTCCCAAAGTG
CTTGGAGTTTTATTATTTAGAAAGTAGATATCCTAACTTAAAATTTGAGC
TATCACTTTTTAAATTTGACCGACTAGTTCTCTACTTGTGAGCTTTTAAA
CTCAAAATTCACTTTTCGGAAAGTGTAAAAAACACGTAAAAAAGAGGTAT
TAAATTAATGCAATCAATTAGAAAATCTCTTATAAATTGACTTATTTAAC
GAGTTTTATGACATTAATAATTATTAAAAACACCTTTGAAAGTAGTTTTT
GTTTAAAACAAGACTAGTTTTTATCAAAATTGGCACTTTCAAGGAATTTT
CTCAAAAACTGTATATCAAAAACGTCTAAAAATACCTAATTTGATACCCC
TTTTTTACCTGTTTTTTACACTTTCCGAAAAGTGAATTTTGAGTTTAAAA
GCTCACAAGTAGAGAACTAGTCGGTCAAATTTAAAAAGTGATAGCTCAAA
TTTTAAGTTAGGATATCTACTTTTTAAATACCAAAACTCCGAGCACTTTG
GGACATTTGTTCGGCCTCAAGACGCCGAGAAAGGTCCGAACTTTTTCGTG
GGTCACCCGGTACAATATTTAGCAAAATCAGATCTCACCAGATTATCAGC
AATGCCAATGGGAACGCAGCGGTGCCATTTAATGGAAAATATGCAAAACA
TATGTAACATGCATACATAATGGGTTAATTTAATTTGAGTCCCGATTGGG
ATTCGACTTATCAGACTAAGGGTTTTCGTTAAGAATATACTTATACTTAC
CCATACTACTGTACCCCTATACCAGTTGGGTGTTTAAGATATAAACTGCA
ATCTTTTCTCTTTTCGGCAATTATTGCCGAAAACAACAATTTTTTCAACA
ATGAAATGCTGAATCAGCAGAAAAATAAAAAAGTGAATAAATGAAAATTG
CCGTTTTCAGCAATTATTGCCGTTTTGAAATAAAAGTTGATTTTATTATC
GTTTAGTTTTGTTTTCAACTGGTTTTTGTTGGAAATGCAGATAGCGAAAT
CGAGTCATATGTAAACAAATTTACAACAAGGGTTTTGTTATCTCTTTCTG
GCTGTGTTTCGGCATCAACGCAGGATCTTTTAACATATTATTTTAGAGCT
TTTCATGTTATTGAGCAACGAAAAATTGAAAAAATCACTCACTGATGCCA
AAACACAGCTGAAAAAAAAAACATATTGTAAGTTTGTTTACATATGACTC
TATTTTGCTAGTCTGCATTCTGACAGAAACCAGTTCAAAACAAAAACAAA
CGTCCCAAATGCAACCTTTCCGTGAGCTAAATAGAGATGATAATTTTTTC
ACACTTTTACTTCAGTCCCGAATTCAACCTTTTTGTAAGCTAAATCGGGA
CTGTCCCGAAGCCAAGCATTTCCTAAGCAGATTTGGGACCGTCCCAAAAA
TTCAAGCCGTACAGTATCTATCTTTCAGTGACAAAATATTAATTATATAT
TATATATACTTTTAATTAAGTCCTGAATCAAACCTTTTTGTAAGGTAATT
TGGGGACCATAATTTTTATACTTTTACTTGAGTCTCAAATCCAACCTTTT
TGTAAAATAAATCTGGATCGTCCGAAAACCAACCTTTGCTCAGGCGAATA
ACGGGGCCCAAGTAAAAGTATGTATAATATATAAAACCACAGAGTCATTG
CTTTTAAATCGATTCCACATTCTAGCACATCATTCCAATTCAGGATGATC
TGAAGTAGAACTGAAGTAAAATCAAGCCTACATAGGAAACTTTCTCATTC
CTGACTAAAACGTCCTTGCTAATGCACTAGATTGTCTTGTGCCAAAAAGT
ATTATTTGATAAGGCAACCATTAAGAAATTGTGCTGTTCGTGTTGCAACC
AGCGTTATATTTAAGAAAATATTTGTAAAAATATTTGAGAAAATATACAT
ACAAGGAGGCAGTTGGAAAGATTTCAGGCTTTTGAAAGTCGTGTCAGGTT
GTCAATTTATTTTTGCAGAGGCAAGTGACATGAACAGAACAATTTTTCGA
TGATCGCCAGTGCTAATAAAAGATAGAACTTAATGATATAGAATAAAAAA
TTACAAATGGGTTTTAAAGAATTTACCTTGTAAAGATATTGCACTTAGAC
CGGGCATGCACACCAAACTTTCACAACACAAAAATTGAAAGCAATAATTA
CATCATAATTCTTCTCCCATGCAACACTAAACCCTCATATTGATCCATGA
GATCCAGACCATCACCATCAGCCAAATTAGGACTTTAATAAAAGTCAATT
TTATGCATGTAATTTTCTGGCTCTATATAGGTTTTGCATATTCTCCTATG
AAATCTCACCACAACAAAATTTGCCCCCATAATTTTTTACAAATTCTCAA
TACCTCAAGCGAAGAAATATTTCCAGGTTTTTTGACAAATCAGCAAATTT
CTTCCCTAAAGGTAGCAGACAAAAACTCAAAAAAACAAAAAACTCTATTG
TTATCAACCATCCTGCTATTTTTTTATTTTGCTGAAATTCATATTCCAAA
TTACACAGATACTAATTCAAAATGGGTGTCTGTCTGTGTCTGTCATAATT
TTAACTTACTTTTGTGTACATTTACTTCATTGAGTATTTTTTGTAATTAA
ATGAGTACCTTAGAAGGTAAGTTTGACAGTGGATACACTTTAAAATGAGA
TGATTTTTTTTTAAAAACTAGAAAAATTTCTTCATGTTCATTCAACCTAA
CAGTTACATTCAACTTCTTGGTGCATAACTGGCAGTTTTTTTTTAATTTT
CTAAAACAAACTCAAAATGTTTGTCTAAAAAGCTAATATTCAAACACATG
GTCAAGTCAAGAATAGAAAATTAATTGGAACTTTCCCTTTCAGGTAAAAA
TCTGTATACCAATGAACATGTTGCAATAAAATTGGTAAGTTTGAAATTTA
TGTATGTTTGTAAAGAGAATTACTTTGATTGGTTTTTAGGAGAAAATAAT
GAAATTATAGGATACTTCCCTGATGAAAATTTATTTTAGAGTATGTCTCA
ATGATATGGCTTGGACACAGGTCCTAGGTTAACCTGGTTCCCCTGCCTAA
TCTGTTTTTTGATAGATGAAGAGGTTAGTCCTGGACTCATCTTGTATTTA
TGAAGTTTTCTTTATCAGTTTGTCCCATTAGGCTTAAGACCTGGTACCAT
CAGCTGTGTGACCATAAATAACTTTTCCTATTAAAAAAATGATATTAGCG
GAAAATAAAAAGGTTTATTACTTTTTGAAAACAGTTTAACTAAATTTCTT
TTGTTATGAAACCTAATTAAACTTTCCGGTTTTTTTTTATGTTTGGGTTA
ATTTTCTGATTAGAATTTACTTAGATTTTAGCTGCCTGTCATTTTTAACT
GCAAATCTGAAAAACAATGTCCAGGTATTGGTTCCCTTTTTTTCTGAGGT
TTTGGTTTTAGATGCTCTTTTTTTAAACATAAGATTGAATTTAGATTCAT
TAGAATTACAAAAATAAATGCCTATCAAAGTTTTAAAAACTGAAATTTGG
ATTTTTGAAATTTTTCGAATTTTCATTTTTTGAACATTATGCGATTGATT
TCTTGTTTTAATTTAGGAACCACTGAAGACACGAGCACCACAATTGCATT
TAGAATATCGATTTTACAAAGCACTTGGGCAATCAGGTAAGTTTCATTAA
CTTTTATCTATCCCAGCAGTCATATTTATTTTATAGTTAGAGTTAGTTAA
ATCTAAAAACAAGTACTTTTTTAAAATTTTTCATGAAACAAACATGCAGG
TATCTTGTTGATCATTATTTACCACTGGGCTACCACTTCAAAGTTCTAAA
GCTTTTGCTTTGACTATACAAATTGACACTTTCATAATAAAACTTTACTG
CAACCAATGTGTCTACATTGTTTTTAGTTACAAGCTATCGTCCACAATTT
TTTTCTTTTAATTTTTCAAAGCTGATGGCGTTCCTCAAGTGTTTTACTTT
GGCCCATGTGGGAAATATAATGCCATGGTCATGGAACTACTGGGACCAAG
TTTAGAGGATTTGTTTGATCTTTGTGAAAGGCAATTTTCAATGAAGACAG
TTTTACTAATAGCTATGCAACTGGTGAGTTCTTAACATTTTGATTTAAGT
TTTTTTTTGCATCAATTCTATACCATTTGCATTGCAAGGGGATATTTATG
TTTCTATTTTTCCAAGTACTTTGTATGGACAGCACTCGTACCCGAAGACT
TAGGATATCACATCATAAGCGTCCTTAATTCTAGAACTTATACTATAATA
ATTGTCGGTCTTAAAAGTTGCAAGTATTACACTGTTGCATTTGATTACCA
AACGTGCATCTCTTTTTTTTCAGATTCGAAGATTGGAATACGTACATACC
AAACACATGATATATAGAGATATTAAACCAGAAAATTTTTTAATTGGTCG
ACGGCAAAATGTCACTGAAAAGTTAATTTACATAATAGACTTTGGTTTAG
CAAAGGAATATATAGACCCAGAAACGAAAAAGCATATACCATACCGTGAA
CATAAATCGCTAACTGGGACAGCTAGATATATGAGTATAAATACGCATTT
GGGAAAAGGTAATATGCAAAATTTTTTTGTCAGAAGTTTGTATTTATTTG
TGTCATTACAGGCCCCTCAAATTATGGTTGAATTTGATTTATTCTTTTAG
AACAAAGTAGGAGAGATGATTTAGAAGCACTAGGTCATATGTTTATGTAT
TTTCTACGTGGAAGTCTACCCTGGCAGGGTTTAAAAGCCGACACACTGAA
AGAACGGTATCAAAAGATTGGAGACACAAAGCGATCAACGCCCATAGAAG
TCCTCTGTGAAAGCTTTCCAGGTTAGTGTTGTTTTTTGTTCGTTTGTTTT
GACTTTTTTGTTTGTTTTAAACATTCAACAATAACTGGATATTTCTGATG
CTCTGGTATTTTAATGGATGACTGCTTGATGTTTGCTTGTTCATTATCAT
GATGCTCCATAATATCTATTTACATTACAGAAGAATGGGCTACCTACTTA
CGATATGTGCGGAGACTGGATTTCTTTGAAACTCCAGATTATGATTATTT
ACATTCACTTTTCCGTAACCTCTTTGAGAAAAAGGGATACAAAGATGATG
GAGAATTTGACTGGACTCATAAAACCATCGTAAGTTTTTTCTTAAAGTTC
TTTGAATGCACCCTTGGTCTTTTCCCGTGTAAAAAACCATGCAAAGTTGT
GATATTTATGTCTGATTAATAGTAGAACATAGTCATACTATGGTGTAAGG
GGTGATTTGTAGAACTGAAAGTAATGAAAATTCAGAGGTACTTTTGATCA
TACTTCTCATATTTCAGGTATAATACTGCCTTTTATAAACCGTTTGCAAT
GTACATATCAGGAAATCTTGGTAACTCGCAAAGTAAAATAGAGACCTGAA
CTTAATCTATTTTAATAACAAACCAAGATAATGTGAACCCAGTCAACAAA
GTGCAGTAGGGAAAAAAAGGGCTATAATTATAAAAAAAGTCAAGGAACAG
TTTTTGTGCTTGTTGAAAAGATAATCAGGTATTGAAAATCATCAAAAAGT
AAAAATTCAAAACAGTTTGGAAATGAAGAGCGAAAAGCAAAAAGAAACAA
AATGTTTTCGTAGAATTGTGCTGCGATCACCATTTTCATATAAAAAAATC
TTCTACCATGAAATTTCAAATATTTATTCATTCAAAGAATAATTGCTATT
TGATTCGAATTCGAATCAAAAGTTATTCTTGTCTTTGCTGCAGTTTCTAA
TGTAATTTTAAAAACAGTGTATTTCAAGCTCTGTTGGCATTGATTTATAT
CAGCAAGATTCCTCAGTAAAACCCTTCCCAAGGAGTTGATCCAAAGTTGG
TTGCTATCCAGCAATCTAACTTTTGGCTATAACTTAAAGCTCAATTTCTC
TTGCCAAGAACGAAATGTTTCAATTTGATCCTTAAAATAGTAATTTCGTT
TTAATTTATGATTTTCATAGTGGATATGTTGCATTTCTAAAGGTAGGCTC
AATTCTAATGAAAGTGTCAATTTCCTTTTTTTCAGCCATCCACTTCGACT
TCAACGACAGAGGTTGCCAAAGCACAGCCATCAAGGCCAGACCCTAGGGT
ATATACCATCGTTTTGCTTACTTTGGCTTACTTATTTACAAACACATTTC
TACTTCTAATCTAAATCTAAACTCTTTTTTTCTCATTGTCAAAATGGATT
TCGGCCTCAGGAAAAATTTCTGGAAAAAAACATTAAATTCCATTTTTTGT
CTGACAAGAAAAATTTGATCCTTGTATTAGTGGAGTAATTAAAAATAAAT
ACCATCAAAGTTTAAGTTCACTTTTCCTAATTCCAATGGAATTCCAACGT
TCTTTAAAATAGAGATATAATTTCACATCAGAGAGGCTTCTGGCACAACA
CTGCAAAATTGTCCAAACGTTTACTTTTCTTTTCAGGCGACGAATAATGA
TGCATGGACGTCATTACCTAAGAACCAATCTAATTCGATGTTACGTCCAC
AAATAGGTGGATCCGTACAAGTGGTACGCTCAACAACTGGTGAATTGGGC
GGTGATGACAAGAATGAAAGGAAATCTGCGGTACCGCTGAACGCTCCCCC
AGACGTAGAAGTTGAAGAGACAAAGTAAGTTGGTGTCTCAACATGAAAGA
TATATTGTTTTTCTAAAGCATCTCAGCAAAGAGTGCACCCAGAAAATTGT
CACCCTAGCCAATTTCTTTTAAATCCACTAAAATTTGTATGGAATGAACA
GTGAATTTACTACATCAAAGTTATTGAGATTATTGCTGACCTCCTTTAAA
AGATGCAGGGGTAGATGTGAAGACTGAACACATGCGTCATATTAAATTCT
CAACTTGTATGTCACCTCATAACTTTGGGGCAGGCTGGAGACTTCAAAAT
GGTCCGATTTGTTGAAATTGGTTACTTTTATCAATTTTACAATATTGGGC
CTACAAATGTTTTTAAAACACTGAAGTCCAGTGCGGTTAACACATTTGAA
AGTCTGTTATAGGAACTAAAGACATGACTACGAAAATTTTATTTATTTTC
CCTCAGGTGTTGTTGCTTTTTCAAGAGGAAAAAGAAGATAACGAGAAGGA
AGAAATAA Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000007_pilon:813831..821338- >XLOC_035194 ID=XLOC_035194|Name=XLOC_035194|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=2658bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000007_pilon:813831..821338- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ATGCACAAGTCCGACAGAAACATAGGCAGAGAAGTTTATGCTCATAGAAC
TAGTATGCCATCTTCAAGAAAAACTGGTTCTTCTGGACAAAGATCCAGTC
ATGGATCAAGAGGTTCATCAAGCTCTGGTTCAAATGTTTTGATGGTTGGA
CCAAATTTTCGAGTGGGTAGAAAAATTGGATGTGGAAATTTTGGTGAATT
GAGACTTGATGCACAAGTCCGACAGAAACATAGGCAGAGAAGTTTATGCT
CATAGAACTAGTATGCCATCTTCAAGAAAAACTGGTTCTTCTGGACAAAG
ATCCAGTCATGGATCAAGAGGTTCATCAAGCTCTGGTTCAAATGTTTTGA
TGGTTGGACCAAATTTTCGAGTGGGTAGAAAAATTGGATGTGGAAATTTT
GGTGAATTGAGACTTGGTAAAAATCTGTATACCAATGAACATGTTGCAAT
AAAATTGGTAAAAATCTGTATACCAATGAACATGTTGCAATAAAATTGGA
ACCACTGAAGACACGAGCACCACAATTGCATTTAGAATATCGATTTTACA
AAGCACTTGGGCAATCAGGAACCACTGAAGACACGAGCACCACAATTGCA
TTTAGAATATCGATTTTACAAAGCACTTGGGCAATCAGCTGATGGCGTTC
CTCAAGTGTTTTACTTTGGCCCATGTGGGAAATATAATGCCATGGTCATG
GAACTACTGGGACCAAGTTTAGAGGATTTGTTTGATCTTTGTGAAAGGCA
ATTTTCAATGAAGACAGTTTTACTAATAGCTATGCAACTGCTGATGGCGT
TCCTCAAGTGTTTTACTTTGGCCCATGTGGGAAATATAATGCCATGGTCA
TGGAACTACTGGGACCAAGTTTAGAGGATTTGTTTGATCTTTGTGAAAGG
CAATTTTCAATGAAGACAGTTTTACTAATAGCTATGCAACTGATTCGAAG
ATTGGAATACGTACATACCAAACACATGATATATAGAGATATTAAACCAG
AAAATTTTTTAATTGGTCGACGGCAAAATGTCACTGAAAAGTTAATTTAC
ATAATAGACTTTGGTTTAGCAAAGGAATATATAGACCCAGAAACGAAAAA
GCATATACCATACCGTGAACATAAATCGCTAACTGGGACAGCTAGATATA
TGAGTATAAATACGCATTTGGGAAAAGATTCGAAGATTGGAATACGTACA
TACCAAACACATGATATATAGAGATATTAAACCAGAAAATTTTTTAATTG
GTCGACGGCAAAATGTCACTGAAAAGTTAATTTACATAATAGACTTTGGT
TTAGCAAAGGAATATATAGACCCAGAAACGAAAAAGCATATACCATACCG
TGAACATAAATCGCTAACTGGGACAGCTAGATATATGAGTATAAATACGC
ATTTGGGAAAAGAACAAAGTAGGAGAGATGATTTAGAAGCACTAGGTCAT
ATGTTTATGTATTTTCTACGTGGAAGTCTACCCTGGCAGGGTTTAAAAGC
CGACACACTGAAAGAACGGTATCAAAAGATTGGAGACACAAAGCGATCAA
CGCCCATAGAAGTCCTCTGTGAAAGCTTTCCAGAACAAAGTAGGAGAGAT
GATTTAGAAGCACTAGGTCATATGTTTATGTATTTTCTACGTGGAAGTCT
ACCCTGGCAGGGTTTAAAAGCCGACACACTGAAAGAACGGTATCAAAAGA
TTGGAGACACAAAGCGATCAACGCCCATAGAAGTCCTCTGTGAAAGCTTT
CCAGAAGAATGGGCTACCTACTTACGATATGTGCGGAGACTGGATTTCTT
TGAAACTCCAGATTATGATTATTTACATTCACTTTTCCGTAACCTCTTTG
AGAAAAAGGGATACAAAGATGATGGAGAATTTGACTGGACTCATAAAACC
ATCAAGAATGGGCTACCTACTTACGATATGTGCGGAGACTGGATTTCTTT
GAAACTCCAGATTATGATTATTTACATTCACTTTTCCGTAACCTCTTTGA
GAAAAAGGGATACAAAGATGATGGAGAATTTGACTGGACTCATAAAACCA
TCCCATCCACTTCGACTTCAACGACAGAGGTTGCCAAAGCACAGCCATCA
AGGCCAGACCCTAGGCCATCCACTTCGACTTCAACGACAGAGGTTGCCAA
AGCACAGCCATCAAGGCCAGACCCTAGGGCGACGAATAATGATGCATGGA
CGTCATTACCTAAGAACCAATCTAATTCGATGTTACGTCCACAAATAGGT
GGATCCGTACAAGTGGTACGCTCAACAACTGGTGAATTGGGCGGTGATGA
CAAGAATGAAAGGAAATCTGCGGTACCGCTGAACGCTCCCCCAGACGTAG
AAGTTGAAGAGACAAAGCGACGAATAATGATGCATGGACGTCATTACCTA
AGAACCAATCTAATTCGATGTTACGTCCACAAATAGGTGGATCCGTACAA
GTGGTACGCTCAACAACTGGTGAATTGGGCGGTGATGACAAGAATGAAAG
GAAATCTGCGGTACCGCTGAACGCTCCCCCAGACGTAGAAGTTGAAGAGA
CAAAGTGTTGTTGCTTTTTCAAGAGGAAAAAGAAGATAACGAGAAGGAAG
AAATAAGTGTTGTTGCTTTTTCAAGAGGAAAAAGAAGATAACGAGAAGGA
AGAAATAA
Gene-mRNA-Prot
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Position
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
|---|
| sc0000007_pilon | genome | sc0000007_pilon:813831..821338 - |
Properties
| Property Name | Value |
|---|
| Aaloc | 1279-1329:52 |
| Aaloc | 1090-1275:673 |
| Aaloc | 1027-1089:1074 |
| Aaloc | 880-1026:2127 |
| Aaloc | 709-876:2457 |
| Aaloc | 472-705:2786 |
| Aaloc | 322-471:3186 |
| Aaloc | 250-318:3543 |
| Aaloc | 211-249:4264 |
| Aaloc | 1-207:7509 |
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