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Sequence
The following sequences are available for this feature:
mRNA from alignment at sc0000299_pilon:234430..239314+ Legend: CDSpolypeptide Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >XLOC_034941 ID=XLOC_034941|Name=XLOC_034941|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=4885bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000299_pilon:234430..239314+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ATGGCAACAAGATTTTGTATAGGTTTTGTTATCCTGGTGTGTTTCACTTG
TTGTTATGGTAAGATTTTACTGGACTTACTTGAAAACTTTCGTTGAAAAT
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TTGGTTTACCATTGGAAAGTGGTTTTACTGTACTTAACGGCTATTTAAGA
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ttactccacatacatttaCTTTCCCTCATCCAGTAAAAACGTGACGAATC
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GTTGCGTTCTCCAAAACATCTATCAAACACATTTTTGAGTTCTGATTTGT
TTATTTGGTTCATACCGTACCTAcccataacaatccaaaagctcCCTTAA
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gtgagttaaggaaagtcaaaaacctatttcccgatttttccaccgcttcc
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ggatttcggaaagtgctgggccgaaaacttaaattaagccaatctcaaga
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gattctaaaatatttgttgagaaattttcaaaatttttagatgacgtcat
ttactgtcggtaaaaactaaaatttgtcaaataatgatgacgtcatcaaa
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CCAGTCTAAATTTGGTGTTAATTGCAGTAATAGAATCGAAGTTATCGCTC
TTTTAAAAAACAACgtcatttaacttgtctttttaACGTGtttttttGAC
GTATTTCCTAACGTCAAAaccagtttttggccgatatcttgagattggcc
taatttaaattttcggcccagcactttccgaaatcctctcattaatacgc
ttcttttgagctatatacgagagttaaggaacaatgggaagcggtggaaa
aatcgggaaataggttttggactttccttaactcacctgagacCAGAAAT
CCAGGTCTTAGTAGCTCGGCAGTATCCTTAtaataagcgttatgcttata
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GTTTAAACGACgatgtccaattttttttctcactgCGATGCAAGGACCCC
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TTAAAAGCGTTTGTATTGCATTCATATAATGACTGACTTCAGTTCAGATA
CAAACAAATCTGATGATAAGAAAAATGGATTACTTATGTTTGCTTTTTAC
ACACGTAACATTGTTTTCGATTTCGTTATAGATTTGAAGAAACGAGGGAA
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ACCAGTTTTCTAcacgtttatttataagaacaaactatatatgagcataa
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ACCGAATTGCATTGgaaaatggaaaatggcgaaaataaaaacatgtttag
gcttgaaactcaaaaacttcaaaagttttggattgttaaaaaatgtgtat
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GGTAATACAGTTGCTCCATGACACTATGACGAGTTACTGCCATTTTGGGA
AAATCTTTGTCACGCCATTATCATAATTCAccgtgtagtaactgttttca
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TTCTAGATAcattttggtttgattgttgTATTCAAGAACCGTTGTTTACT
TTTGGCTTAAGTGACTATCAAGATCTACTATCATAGATTTGgcaaaaaat
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ATGTATTAACTGCATAACCCACCTGAATTCACAAGGTTTAAACTAGTATT
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GAATGTCACGCGATGCGGAGGATGTTGTAGCAGCTTCAAAACGAGCGCAG
ACATGGAATGTGTTGCGGATCAAACGGAAAGCAAAATGGCTAGAGTGTAC
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TACTTTTGAACAAATGAAGTTGTCAAATTTGAATCACTCTTTGGTAGACT
TTTCGAACTCGATCAGGATTTTTTGAGATGATAATTTGAAGCGTTAATCT
TGAGAGTATAACCTAAAAACAATtgtgacacccctgtctcatcggCGATG
CAGTGCTGATAGAACGAGCCGAGTGTCAATGGGGGTGAAAATTGCTAGTC
TGTTTGTAGACCTCCATAGATTCTTGTTATAAAGatttgttgttaaaaat
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AATGGGAATTTCAAAATCTATTCTTTACATCTATAACTCATTTCTAACCA
AGTTAGATTAAAGTTCAATTTATAATTTCCCAATGGGATTTGAAGGTATT
CTATTTTTcacaccggggacgatttttaaactatttttcagTGAAGAGAG
AGCATCCTATCGGATCTGTTATACTTGAAATAAAACGTTCAGCACCATTG
GAGAATCTCTTGTTTTGATCTAAGATACctaaaaaagaattaattttttt
tcagtatgATCTTCTGAATGTTGACTGAGGGCCCTTTTTGAAGATTAAAT
TGCCGAATTTCGATGACTATAATGACAATGAAGAACTAAaaagttttctg
attttttttagcTGGAGGATATTCGCAAAAAGTCATTCCTTATGTGAACC
ATAAATCATGTAAATGTCAATGCAAGACACAACCTGAAGATTGCAACCTT
CAACAAACTTACGATCCTAACCATTGTAAATGTAATTGTAATATCAAAAG
TGCTACCTGTCCAAAATTTATGGAGGTAAAAAACTAGATTGATACGTGAA
GGGAGTTTCTGGCTAAGAATTTTACAGATATATACAAATACTAATCAATA
ATTGATGGAACGGTTTTATAGGGTCtcgaaatcaatattttttagtAAAC
CAGCATATTTTGCTATACTTTAGCCGAACCAGTGAAACTGATTCGCTAAT
TCTGAATGAACATTATGGGAAGGTATTTTGTTACTTTATAATTCGTTAAC
CCATGAAATGCTATCATTCcgtgacttcaaattttcataaattttgattc
CAAATACGAGTACACACCCCAACCTAAGAGAGAAATGCCAAGCTTGACAA
TCTCGACTTATGTGATGCCAGTAGCAATTAATGGATTAATGCTTTccatt
tactttttctttttcagtggtCAGTATTAGCTTGTCAATGTAAATGCAAA
CCTCCAAGCACACCTTGTGCACCAACGCACGCTTGGAACGATCAAACATG
TCAATGTGATTGCATACCACGTGCGTGTGCTCAAGGCTATGGATTTGATG
TCAAAAAATGCACTTGTGCTAAACTACAAGTCTAG Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000299_pilon:234430..239314+ >XLOC_034941 ID=XLOC_034941|Name=XLOC_034941|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=1560bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000299_pilon:234430..239314+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ATGGCAACAAGATTTTGTATAGGTTTTGTTATCCTGGTGTGTTTCACTTG
TTGTTATGATGGCAACAAGATTTTGTATAGGTTTTGTTATCCTGGTGTGT
TTCACTTGTTGTTATGAATCAAGTCAAGTCTTGACGTCTGGTAGGAAGAA
TCAAGTCAAGTCTTGACGTCTGGTAGGAAGGCACGAGAGAATATATTGAA
ACGATTAGAGAATATTAATTCCattgaagaatttgaaaaagCATTCAaca
tcaaaaatccaaaaagatcTTGCACGAGAGAATATATTGAAACGATTAGA
GAATATTAATTCCattgaagaatttgaaaaagCATTCAacatcaaaaatc
caaaaagatcTTATTTGAAGAAACGAGGGAATTTATTTCTTGGCAACCTT
CTCGATGATGTTGCACCGCTAGATTTGAAGAAACGAGGGAATTTATTTCT
TGGCAACCTTCTCGATGATGTTGCACCGCTAGCTTATGGAAGTCCTCGCC
CCTGTGTACCCAAAGAAACCGTTTATACAATTCCTCACGTACCTGCGAGA
GATCGTTATATTCCTGACTGTTTGAATGTCACGCGATGCGGAGGATGTTG
TAGCAGCTTCAAAACGAGCGCAGACATGGAATGTGTTGCGGATCAAACGG
AAAGCAAAATGGCTAGAGTGTACCATTTTGACAAGTTCACTTATGGAAGT
CCTCGCCCCTGTGTACCCAAAGAAACCGTTTATACAATTCCTCACGTACC
TGCGAGAGATCGTTATATTCCTGACTGTTTGAATGTCACGCGATGCGGAG
GATGTTGTAGCAGCTTCAAAACGAGCGCAGACATGGAATGTGTTGCGGAT
CAAACGGAAAGCAAAATGGCTAGAGTGTACCATTTTGACAAGTTCAcTGG
AGGATATTCGCAAAAAGTCATTCCTTATGTGAACCATAAATCATGTAAAT
GTCAATGCAAGACACAACCTGAAGATTGCAACCTTCAACAAACTTACGAT
CCTAACCATTGTAAATGTAATTGTAATATCAAAAGTGCTACCTGTCCAAA
ATTTATGGAGcTGGAGGATATTCGCAAAAAGTCATTCCTTATGTGAACCA
TAAATCATGTAAATGTCAATGCAAGACACAACCTGAAGATTGCAACCTTC
AACAAACTTACGATCCTAACCATTGTAAATGTAATTGTAATATCAAAAGT
GCTACCTGTCCAAAATTTATGGAGtggtCAGTATTAGCTTGTCAATGTAA
ATGCAAACCTCCAAGCACACCTTGTGCACCAACGCACGCTTGGAACGATC
AAACATGTCAATGTGATTGCATACCACGTGCGTGTGCTCAAGGCTATGGA
TTTGATGTCAAAAAATGCACTTGTGCTAAACTACAAGTCTAGtggtCAGT
ATTAGCTTGTCAATGTAAATGCAAACCTCCAAGCACACCTTGTGCACCAA
CGCACGCTTGGAACGATCAAACATGTCAATGTGATTGCATACCACGTGCG
TGTGCTCAAGGCTATGGATTTGATGTCAAAAAATGCACTTGTGCTAAACT
ACAAGTCTAG
Gene-mRNA-Prot
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Position
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
|---|
| sc0000299_pilon | genome | sc0000299_pilon:234430..239314 + |
Properties
| Property Name | Value |
|---|
| Aaloc | 613-780:4718 |
| Aaloc | 451-612:4164 |
| Aaloc | 244-447:3262 |
| Aaloc | 184-240:2434 |
| Aaloc | 91-180:2097 |
| Aaloc | 61-90:900 |
| Aaloc | 1-57:1 |
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