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Sequence
The following sequences are available for this feature:
mRNA from alignment at sc0000230_pilon:560710..567550+ Legend: polypeptideCDS Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >XLOC_034921 ID=XLOC_034921|Name=XLOC_034921|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=6841bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000230_pilon:560710..567550+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
TTCTTTACACATATCCTGAGCTACTGGAACCAACGAGAAAATCCAAATCT
TTTGATTGTTCACTATGAAGAGATGCAAAAAGACATAGCTGGTAAGAcag
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TTGTATACATGCTTATTCAACATGCATGTTGTTGTCTCATTTTACATGGA
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tttgttttccttttttctgcaaagtcagctttttccataaattatgcgcg
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GTGCAGTACAGTTTTCTGGACTGTAGTTTAtatgacctgtaacctgtgac
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TCATAGCCAAAAGTGGGCAATGCTCTTGACTCAACATCAGATgcctaaaa
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CTTCATAGGAATAGGAACTCATAGAAAGAATTTGATTTGAAGCCTTCATa
aaaaaaGTGCAAGGTCTTGCAAAGTTAGGCTAGTTTTAGAATGTTTAGAT
TTTAGGTAGATCTAGGCGTGCGATGACcacatttaaatttttcttatatg
CCGAATCCTGTATACTGGATCTATATGTTCTATATTTTTAGTGAACAGAG
CTATTTAGTAATTAGCATAAAAATGCCTTTTTGATAAATCTGATAGGTCA
AAACACTTTTAAGAAATctaaggtttttttttcattataacATAACTTTG
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TTCTGCCACATCCGTTAGATCTTATTCAtatttctgtttttatttttttc
ttcaaattaaagCTACTGAcctttagaccatgttcacattTTACGATTTG
GTTTTGATCCGAAAGGAAATGAGGTCATTTCATGGGTTAGAAGTGACGTT
TGATTTGAATGTAAccaatggcttcattttgtttcagaGAGAAACGAAAC
CGTAGCGTGTGAACCTGGTCTTTAAGCAACCTAGAGACATTTCAATTCTT
ATGATTGGCAAtcatttgaacaattttgaaaatatccatCATGaaggtaa
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TTTTATCAACACTGGGAAgacaggaggatggaaaaacAAACTCACTGAAG
AAACTATTGAGAGATTTAAAAAATGGGAAGGGAAATGGTTGAAGGACACT
GGATTAATGTTTGCTtatgaagtttgattttttatttaatatcatttatt
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TGCTGGGTACGCagcaacaaaaatgtttttctcttcaaagtgaattttat
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AAGTATAGATGATATTTACACGTCTTACTCTGCCAACCATTCTTATAtaa
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caattttctttgaaaggcCTAACAGGCAGGCAAAGATTGTTGacaaaagt
ttttctatttaaTCTCTATTTTTTATGTTCTAGGAACCCGTTGGATGCAA
GAAATTGTCTCTTGTCTGAGGAATGGCttggattttgaaaaagcaAAATC
AAGTCCTCTAGGCTTAAGAGTACCTTTCTTTGAGTAAATATGtttttttC
GTATTTAAAGAAGTATTGGCTGAAATTCTTGGGCTGAACTAAATGGGAAA
TATCAAAACTGAAGATAAGATTGAAATAGATATTCAAAAGATTAACTTTC
TTTGTTGTCAATAAGCATCAATGGTCTACAATACATAATCTTTTCTCATT
TTAGTTTTTCAGCCGTCTCTTGTAACGCAGAAAAGATGCTTAAAGCTTAT
GGTTCTTCTTGCAAAACAGGAGCTGAACTTGTTAATCATACACTTCGACC
AAGGACCATAAAAACCCATCTCAGCTATGAAATGTTGCCTCCAAAGATTC
ATGAAAAAGGTGCCAAGGTACCAGAACTTGTTTTTAGTTGATATACGGAT
TCAATTGAAacagtttgatttttttatgttaaaaattctctgattttgat
ttttttaaccaaTGCAAATGATTTCTATTCAGATGATCAATGTAATACGA
AACCCACGTGATGTTTGTGTATCATTTCTCAACCATCATGTTCTGACAGA
AAACTACACTGGTGATTTACAAACCATCGCAGAGATTATGTTACAGGATG
TAGGACCTATCTATGCACCTTTCTTTACACATATCCTGAGCTACTGGAAC
CAACGAGAAAATCCAAATCTTTTGATTGTTCACTATGAAGAGATGCAAAA
GGATGTAACtggttaaaatttcttttgaatttgtttttaacGAGGTCTAA
TTTTAACAATTGAGCAGGGCATATAATGTTAAAATCGTTACATGGGTGTT
TCAGGTAAGAATCCAAAATGGGTTGAATACACTTATCACCCTTAGCGGAA
ATACCTGGAAAAGGTTTGGCAACGGCGTCAAGTTAAAAAGTACTTGTGTG
AAAATTTAAGATAACTTAGTAGATTGAAATCTTTAACCATTTTCCAGGTG
TCATCAAACGAGTGGCCAAGTTTATTGGTACAGAGGAATATTCAGATGGT
CAAATAGCAAAACTTGTAGAGCATACATCTGTGGATAAAATGAGAGCCAA
TCCAATGGTCAATGTGACTGGACCAATTGATGTAATTATTTAAAACCAAT
TAATTTGAAATGAGTCTgagtaaaagttaaaaattctttatggatatttt
taatcaaattatGCTTTTAAGACTTAagaatcaggggggggggtgtacag
CTGCAGGGTACATACCCACAgccaggtggtggtgtctaattttaaatttc
atttattaCCAGGTTCTATATTTGGGGTGGGTGGGCCATTTCAATTCATT
TCAAGTATCTGCTACtgattttggtatttggtgggtaaaatgggtaaaaa
tggtaaaaatttatcaattttggcaaatccgaaaaaaattccataaaaat
tagatttcattttaatttcacgaTTTTGGTGAGGTGAAATTGACTGCTAG
GTATTACAAGGTACTTTTCCAGAGTTATTTAGCCATACTTTCCTTGGTGA
CCAGCTTCCAAATAGGGGGCGGAGGtccttttttcttcaaaaaaagttGG
TACCTTATACTATCTAAGATGTCTATtacaaatctttttgaaaatcaggt
tTATTACCCCCTGTTGCAATTATATTTCTAGTAAAAAGCTATGGTATAGC
CAGGTAGAGCTGGAGTTTGCTTTATTGAAAGAACGGGCTAATTATAGTCA
CATCCCTTTATTTGAATTGGATGAATAAAacgttttaattgtttttttta
accgttgcttctttcttcaattttagaaaCTAAAGGCAGCAATGAAGAAT
GAGCAGAAAGGGACTTTTATCAACACTGGAAAgacaggaggatggaaaaa
cAAACTCACTGAAGAAACTATTGAGAGGTTTAAAAAATGGGAAGAGAAAT
GGTTGAAAGACACTGGATTGTTGTTTGTTTacgaagtttga Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000230_pilon:560710..567550+ >XLOC_034921 ID=XLOC_034921|Name=XLOC_034921|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=780bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000230_pilon:560710..567550+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
TTCTTTACACATATCCTGAGCTACTGGAACCAACGAGAAAATCCAAATCT
TTTGATTGTTCACTATGAAGAGATGCAAAAAGACATAGCTGTTCTTTACA
CATATCCTGAGCTACTGGAACCAACGAGAAAATCCAAATCTTTTGATTGT
TCACTATGAAGAGATGCAAAAAGACATAGCTGGTGTCATCAAACGAGTGG
CCAAGTTTATTGGTACAGAGGAATATTCAGATGGTCAAATAGCAAAACTT
GTAGAGCATACATCTGTGGATAAAATGAGAGCCAATCCAATGGTCAATGT
GACTGGACCAATTGATGTGTCATCAAACGAGTGGCCAAGTTTATTGGTAC
AGAGGAATATTCAGATGGTCAAATAGCAAAACTTGTAGAGCATACATCTG
TGGATAAAATGAGAGCCAATCCAATGGTCAATGTGACTGGACCAATTGAT
aaaCTAAAGGCAGCAATGAAGAATGAGCAGAAAGGGACTTTTATCAACAC
TGGAAAgacaggaggatggaaaaacAAACTCACTGAAGAAACTATTGAGA
GGTTTAAAAAATGGGAAGAGAAATGGTTGAAAGACACTGGATTGTTGTTT
GTTTacgaagtttgaaaaCTAAAGGCAGCAATGAAGAATGAGCAGAAAGG
GACTTTTATCAACACTGGAAAgacaggaggatggaaaaacAAACTCACTG
AAGAAACTATTGAGAGGTTTAAAAAATGGGAAGAGAAATGGTTGAAAGAC
ACTGGATTGTTGTTTGTTTacgaagtttga
Gene-mRNA-Prot
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Position
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
|---|
| sc0000230_pilon | genome | sc0000230_pilon:560710..567550 + |
Properties
| Property Name | Value |
|---|
| Aaloc | 226-390:6677 |
| Aaloc | 94-225:5850 |
| Aaloc | 1-90:1 |
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