XLOC_034873 (mRNA) -

Overview
NameXLOC_034873
Unique NameXLOC_034873
TypemRNA
OrganismClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon (Jellyfish)

Sequence
The following sequences are available for this feature:

mRNA from alignment at sc0000230_pilon:381280..391504-

Legend: polypeptideCDS
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>XLOC_034873 ID=XLOC_034873|Name=XLOC_034873|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=10225bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000230_pilon:381280..391504- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ATGGGAGAAATATCTGCAGAAACGCAGGAAGTTAATGATGATTCTACGCC AACTTCTCGAGAGAGGTGTGTTTCTGACTCAAATGTTGAACTACAAAAGT ATGATAATAAAAAGATGAATGGGAATGTTAAGCATGGGGAAGTAAGGAGG AGACACTTTGGACATGCCTTTGGAAAGAGACTAAGACTAATACTAAGACC TTGGAAATGGAGGAGGAAATCAAAACGTTCCTACAGGGCATCAACTGGAA CACAAAGTCAAAGAAATGTCAGTATAGGTCAGTATATTTTGTAGTATGCT TAACATTTCAGAAAGAATAGTCTCCCAGTTATTTTGTACACAAGTACATT TCTTGTGTTGATGAAACATTCACCAGTCATACCGTAACTTGGTCTAATGT GTCGAAATCACTCTTTAGCGTTTAGCAGGGTGGACAGGCCAAAATTTTCC TCTCAATTTTTAGAAACCAAACTAATTATAATTGAAAGTCCTTACCTTTG TGAGAAAAATGAGGGGTCATTTATTAGAATTAATTAAGTATTCCCAAAGT TATTCCATTTTCAAAACACAAAAAAATTACACCACGCCAGCAAGAAATAA TTTTCGGAAGCACCAAGATCGCGCCAAAAATGGCGGATGAAATCTAGTCT TCCGTGTGGTGGGGTGTGGGGAGTTTTGCTGGTGCGCTCTGAAAATCGGC CCGATGACTGTTAAACTTTAGCTTACTTATCGCTAATGATAGCCATTCCG GGTTTGCTTGTTTTTTATTTGACGCTTATCAAAATCTTCAATTTTAGGTT AAACTTTGAAAAGCAATTGTTCTTTGTGTATTTGAGCTATAAAATTAATT ATTTTTGAGTAATTTAGAGCTTTCTTTTAGCTTTCCAACCATATATAATA TGCAGGTGTAATATTCTACACTTTTGTCTAAAAATTCGTTTCAACTACAG 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TCGATTGAACCAATAAAAAATGAAACTTTTCCATGTTTCACTTTTTTGCA CCAATTCTTCAAAATGAAAATATTTTAAGATTTAAAGTCCTTCTTTTATT CAATGATTTTTACGGCACTTTGTTGACAATTTAACTCTCACATCAAATTC CCGCTTTCTTCAGTAAATTGAAGATGAGAAAAAACCTAAGCCTTATGATC AGGGATTAAAACAAATATATGAAGGGTGTGATTTTACAGCCGCCCGTCCT TCAAGGCACTAAGAGGCCACTGGTGCCAAAAAGAAGGGCTGTGTGAAATG TGGCAATCTCATTTGTGGAAATTTGATAAATAGCTACAAAGGAGCGCCAG GAAGCAATCAGTAGAAGAGACCACTTTCGTTTTTGTTGCAAATTTCGATA TAAACTTCTCTCACAGGAATTAATTGTCAATGTATTGTCAACTTGTCAGC ATTGTATTGTTGTAAAGGGAAAGATAAAAGAGGTAAGACTAGCCTAGTTT CTAATCCTGATATAGGAGTTTAAGCTTAGACTGTCAAACGTGGAGCTATC AGGAGTTATGCTGTCCAGAGTTTTTTAATTATCCAACATAACATTTGCGC CTAGCAAAAGGTTTATTCGATCAATTGCTTAATTCCGCACTAAATAGACT TTCGCCGGACCCAGGATTTGACGTCATATGTTGAATCGCAATTTAAAAAA AAACTTCATTGACTCCAGCATCAAAACAGTCAGCTTGGATAAAACTCTGT GTTTTGCTTTTAATATGAGTAAACTCGCATATTCTTAAAACACCCCCTGA CAGCTGACAATTAGACTAAGCTAAATTTACCTCTTTTCTCTTTCCTTTTC CAACATTACAATGTTTACATTAATAGACCTTTCCCGAAACCCATTTAAAA ATTAACCTCTGTAAAATGTAAATTTTGATTAATATCACAGTTCACTTTGT TTTGATCTAATGAGAAATCTCTGAAAACTTTGTTCCATTTGGTCTACTAA ATCTAAAGATAATTCACTTTGTTTTCTACAAAATTTCTCTTATTTTGTAA GATCATTTTTCATAGCTCACCTCGTTTTTCATGTAAACATAATTTTTTTA ACCTTTATTGTGAATAGTTTCACAATCAGTGGCTTCCGTAAGTCGATCCA TCAGAAAGTGTTTTTTAAATTTAACTAATGAGATTGTCATGATGAAGGTT AAGGACTGGCCCTAATTTTTGGCACAAATTGCTTTTCAGCGGCTTGGATG AGGAGCAGTCATATAAATTTATTGTTTAAGCGTTGATTCTAAAGCCTGCC GTCCACTAGGCTATTTTTAGCTATCGTGAAATGATCATCTATAAATAACA CTGTCTATCGCGGAATAAACCTGTCAATCGCGTTATTTTATTTCACAATA GGGAGTGAAAAAGTTTTCACTCAAGATTTTATCCAATCACGAAACCTTTG TTTCGCGATAGTTTTTAACAATAGAACCACCTGTATTTCTTTTATTTCAA TGTTTGAATAAGATTGAATTACATGTGATCGAAGAAAAAGTGAGAGAAAA TCATTTTGCGATAAAAACATCTTCATCACATAAGAGCATTTTTGAATTTT GGTGTGTGCTCTAGTGTAGTGTGATTTTAGTGTATCCTATTTAATAGTGG ACATGTAAAATCTAAAAATAACTTCAGACATGAGATAACATTTCGCGATA ACCAAAAATAGCACTAGTGGACGGCAGGCTTAAGGGTTAATTTTTTTCTT ATCTTTAGTTCTTAAACTAATAAAGCAGGAATTTGATGCAGGCGTTATTT TTTTAAGGAATTCTTTCTGATTGGATGAAAACGCTTTATCTTCATTTGAT TGGATACTTCTTTTTAAACAATTGCGCAACTTTTTTATTTGACAAAATAA AGCAATTGATATCGCTGGATATCGTGGTGATTGGATAGCAAAATATTTGG CACTTTCACAAGTGTGAAACAATCTAAGTATTTTCCAGGGGATGGATTTT TAGTTTTTCTTCCATTTCTTTTTGTTCGCCAATCCGGGGAGACAAATGCT ATTTCAATCAATTTTGCTGACTGAGCAAAATCAATCGTTTCACCAGAAAG CTCTTTAAAAAGGTTCTGAGGAAATGTTAATATATTATTGATAATTAATA AATTAATTGATATTAATGTTAATAAAGTGAGAGTAGTAAAATGTTATTGA TTATAGAACAATTTATTTATTTTTCCTGTGCTGAGAAACAACTTAAGGAC AAAGCCTGTTCCAGCCAAATGAATTTAATCGTAGTTATTTCATAAAAAAT GATTAAATTAGTCAAAAATAACACTAACGACCCTGCATGTTTCAATCAAG TTAATTATTTTAACTTTTGTGCTCAAAGGATTGTTTGCCATTTTGCATTG AATGTTCTGGAACATCTCAAGACAGTTCCATTTCCAGCCATTTATATTTT GAAATTGCTTGTGATAAAACATACTGTATGATTTTTGAAATGATGGGATT TTACAAGACTTTTTTCTATTAGCTTGATTTCTTTTGATTTTAAGTACCAT TGTTCCAGAACAAGGCAGTCATTATATGTAAAAAATGAAAAACAATTTTA GCTGTTTCCAGGACCATAAAAGGTATATTATATCGGTCAAAAAATATCAA AACCCCATTACCTTTATTTATGGTGAATGATGATGGATGGCATTTTTATT GTGAACATTTTTTATAAAAATTTTCAGAATTTTCAAAAAACGGACCTGGG AGGCTAAGACCTTTGAAGATACTATGGAGAAAATCCTACCCTGTCTATTT GTCTTTTGTCGATCATCAGTTGAAGTTTTGCACTCTTTCTCTTTGAAAGT AAGTGGAATATTTAAGGTTCGAAACTCCTATTCAATTTTTGGGAAAATCT TTATTCTGTGGCATGTTTAACTGATTTAACAAGTTTATGGGGGGGGGGGA ACAAAGTAGAGCAGAACTCAGGATTTAAATTAACGGCTCTTAAAACTTGA TCTAATAGTTATTTTTCTCCAACACAATTGAAATCAGAATTATGGGATAG GGGCCTATGTTTGCTGCATTACAATTTTGAAAGATTTCAAAATACCTTAC TTTTTTAAGTTTTTCAATAATTTTTTTTAGGTAAATTTTGTAAACAAATG TAGATTGTTAAATCAGACTATTATTTCAAAACTAAATTGAGAAGAATTTA TCTTAAAAACGGATACTTATCCAGAGAAGTAAGCCTTCTCTAGGAGAAGA ACTATACAGGCTATATAACTATACAAGCTATGTTGAGATGTGAAAATAAT TTCTATTTAGGTTAGATAATATATAAACACACAAAAAACAGTGGGAGTTC TTCAATGAAATTTGGTTCAAATGCTTCAAACAGTGCTTAATAGAATTTTC TGTGATTTTTGGGAGCTATCTGGTTAATCCTTTTTAAGGTTTTCGTTAAA ATATTTACCTTACTTTTCTGATTCCTTCCTAAAGTGAGGGAAAACGTTCA GAAAAAATCCTTTTTATCTTACCCATTTTATATAGTAGCATGTTTTTAAA TGATATGGCAAGTTTTGCTAGATCTGTGAATAAGAGGATGGGAAATGTTC GTAATATAATATGTTAAACACTTTGTTTCTTCCTTTTTGTCACAGTGAAA TACAAACTTTTACACTTACGGTACTCTTAGAATAAGATAGAAGTTTTAAT ACCACAAAATCTTTTATTCTATTTATATGTACACTGCTTTTTTCAACGGA TATTATCAGTAACTGTTTTTAATTAACAAGATTATAGTAGTATTGGCATT TTTATGCAATAAATATGAACTTTTCTTCACATATAGGAAATATCTCGGAA CTACTAAAAAGTAACTTGATAAAAAGTTTCTAACTTAAGCCCAGAGATTT AATAAGTCAGGTATGTTAAAAATGTTTGTAATGTCTTTCATTTCTTTATC TTTAATAGTAATTTCTGTAAATGAGCTGGTCATTAAGCAATTTGTAATGC TCGTAAACTTTTTGTTCCTTTTTATAAAGATATCACTTTAAATGTAAGAA CTTATCATGTGTGTTGTGTATAAGAATTGGCCTAAACATAATGAGAGTAA AAAGTATATTTCTTTATGTATATTTATTAAGCATATTTTATTTTCATAAA TATAAACTCATCCTACGATGCTTTTGCTTAATAATAAAAAGTAGCATCAA TAACAAAATTATACTTGAAGTAATCTTCCCTTGATGCAAGATGCAAATCT TCCGAAAATAAGCAAATGAAAGCTTACAAAGGAATTAATTTTATAAATTT GTTTAGTTCTTAGTCTATCAAAGATGACGTTATGTAACTGAACTCAATTT CTGATTAACAATGTTTGAGTCAACTTTCCTAAATATGTCAGCTTGGTCAG TGCAGTAAAAATCACCACTTGACATTTTTCTCCAATCTGTAATAAAAACA TCATTTACGTCAAAAATGAAATAAACAAACATATCGTCAAGGGTATATCT TTATCACTTGTCACTTTTATCCTTAAAAAATGTCCTTTTAACATAACATT CAAAAAATTATATAAAATTTCTTCCCCAAAAAGGTTTGGTTTTTAAGTTT CTATTTCTATTTGGTTGAGTATCATTATAGACATAAGCATTATAGACGCT TTCAATGAGCGTCTCGTCAGCACCTTGGACTGACTACCCGATTCCCCTCA CATGGCATGGGTTGACCCGGGCGAAGGTTCATTCACTTTCCAAGTGAACC GCTGCGAGTGGGAAACGAACATCAGTCGCCTGTGCAGCAACCAAGGTCAA TGACCACTATACCACAGCCACCTTATTAGGATTATCCGATAATTGTAACT GAAGGGTTTGAAAGTTTTTTTTATCCACTGAGAAAAATATATTTTGTATT GGCATTTTTGTATCAACTTCGCATGAGTTGAAAGTTTGGAACAAGCATTA TTAGGAGTTATCACACTAAAGTGGAAGATTGAATAGTTCTTTTTATGCAT GCTGGAGTAGCCTTTCTGATTGGAAATAGTACAGGAGTTCTAGAAGTAAA CAATATAATATAATACCGCGGTCATTGTCACAATATTTGAGACAAAAAGG GAATTCCCTGCAAAACAAAAATCACAAAAGGCGTTTGAAGTACTGCAACT TTCCGGAATGAAGAGAATTTTAAAGCTCTGTATTTAAAACATTAGAATTA ACACTTTTTCTTTTTAGCTCAAACTTTAAATTACAACAAAATACCCAGAT ATGCCAATACATTGTCAACCATGTGTAGTTTTGGGACCTTGATAACAGCT AGGGATCATTTCTCTTAGCCAAAGTCCCTAAACTTCTATGTAAGTTCAAA GCCAGTAACTACTTGAACCAATGAAAAACTTCTGAATATAGTCTAAGACT TACAGTTTAGTTACATTCTATTGCCATTATTGTTTTTCAAGGCATTTTTT TATTTTCATTTACAGCTGACGATGCGAAACAAGGAGATGGATGTGCAAAC GACCGTAACGCGTCCAAACTTTCCTACTCCACTAACGATCTATCAAATAT TTCCCCGGTTGATGTTAATTTTACAAAAGACTTGAAGGAACCTGATAAAT TGAATAATGGAAATGTAGTTAACACAGACAATAATACTGAAATTGATAAT AAAAAGACTGAAATTAATGATAATACAAGTACTAGTCCGAAAAACTTATC ACCTCCGAGTTCGTCGAAGATAACGTTCTCAGCGCACAATAATGCTGACA TAGACACAAAAATGACTAATGGTATGGTATACATGTTTTTTAATGTACGA AAAAATGTTATAAACGGACACTCGGTATGATGATGACAACAACTTTTGCT ACTTTGATCTATTTTAATGTCTCAAATATATATGTCAATGTGCTTGGATC AGGGTCTTGGGTTCTTTGTAAATAAACTCTTGATTTCATTATTGTTTTGT TTCTTTTAGAACATACTCATACACCTAATCTCAAAAACGAAAACGAAGGT GAGTTTAATGTTGATAAAAATTTCAGATTTTCACTGATGATTGACGCAGA AGGTGCCATGAAACTCTGAGTATGAAATAAGAACTTAGTCAACTATCAAT GCGATAAAATATCTCTTTGGGTTCTAATAGAAAGAAATAGTTGTTGCTAA TTCAACAGTAAGATTAATCCATCAGTTGAATTTGGTTTTCTTAAACAATT TTACAGATTAAGGTTTTTTATTTAAGTCAATAAATGCATACCACTCACAC TCGCTGACCTTATGATGATCAAAGACTTTTATAAATATATAAACACTTTA TTGATCATTGTGATTATTCCTTAACATCTCTGGCTTTTTTTGTAGAGCGA CCACCGCCGCCACCATATCCTGGGAACGCCACAGATAGTCCAAAGTAAGC AATCTATTTCTTTTTAAGAGATATCTTTTCTCATTTTTATCTGCAAAATT ATTGATTTTCTAAGTTCTAAGATAATTAAGAACTGACTGATTAGAACAGG AGCTAAAATTCTCAATCGTTCCTTGCTCTACCTGGTTTATAGCATTTCGA AGCTTTTAAGTGATAAAGTGATAAAGTGTGACCTGGCCTGAATATATCTG GTTTGGCAAAAGTTTCATTATCAAGAGCTGCACATTAAAGTTTGAAGCAC ATCTTTTCCAGTGATAAAAAATGAAAATCTTATTATTCCGCCCTCTAAAT AGTTGGGACTTAAAATAACAGTGCGAAATTCCCATTAATAAAATTTGCTA AATTAAATGGTTCTAACTTAACTTTCTATCTAATAGTAACATCATTTTTC ATTTTTGCGGGCCTCCTCTCAAAAAAGTCTTAAGATCACTATTTGGTTTG AAGTTACCACATGCGGTCGCGTCCAACAAAAGATGCTACGGATCCCAAGG GTTGGCCAGCTGCTAAGTCAATATTTGCCCTGAAAGTCAGGAAGAAAGTG TTACAATTGTGAATTCAGACTGCATCACCAAAGAGTCACCTCCAACTTTT TCCCGAAGAGAGCTAGAGATTTTAAATTTCCCTAAAAAGGAGTCTACCAA GTTTGATTAATCGAGGGTGCTGAGTTTTTTCACTGGTGGTGAACTAATGA ATTTGAAATCGATGAGAAATGGCCTTACCTTAAAATCTTTATTATATCTT CATAACGCTGAAACTCCCCCCCCCCAGAGGTTCCGTTCCTTTGCCAAACG ACGGGAACATTATTCCATGAATTATTCCTTCTATTTACAGTTCCTTTCAT TGTTTTTATTTAGTGTTTCCATTCCAACGGCCAGTCGACAGAATGACGAT TCTGATTTAAGTGACAATGAGGAAGATGGCCCCCCACCTATCCCTCCAAG GGATGCTTATGTGCGCAATGGTAAA

Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000230_pilon:381280..391504-

>XLOC_034873 ID=XLOC_034873|Name=XLOC_034873|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=1566bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000230_pilon:381280..391504- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ATGGGAGAAATATCTGCAGAAACGCAGGAAGTTAATGATGATTCTACGCC
AACTTCTCGAGAGAGGTGTGTTTCTGACTCAAATGTTGAACTACAAAAGT
ATGATAATAAAAAGATGAATGGGAATGTTAAGCATGGGGAAGTAAGGAGG
AGACACTTTGGACATGCCTTTGGAAAGAGACTAAGACTAATACTAAGACC
TTGGAAATGGAGGAGGAAATCAAAACGTTCCTACAGGGCATCAACTGGAA
CACAAAGTCAAAGAAATGTCAGTATAGATGGGAGAAATATCTGCAGAAAC
GCAGGAAGTTAATGATGATTCTACGCCAACTTCTCGAGAGAGGTGTGTTT
CTGACTCAAATGTTGAACTACAAAAGTATGATAATAAAAAGATGAATGGG
AATGTTAAGCATGGGGAAGTAAGGAGGAGACACTTTGGACATGCCTTTGG
AAAGAGACTAAGACTAATACTAAGACCTTGGAAATGGAGGAGGAAATCAA
AACGTTCCTACAGGGCATCAACTGGAACACAAAGTCAAAGAAATGTCAGT
ATAGCTGACGATGCGAAACAAGGAGATGGATGTGCAAACGACCGTAACGC
GTCCAAACTTTCCTACTCCACTAACGATCTATCAAATATTTCCCCGGTTG
ATGTTAATTTTACAAAAGACTTGAAGGAACCTGATAAATTGAATAATGGA
AATGTAGTTAACACAGACAATAATACTGAAATTGATAATAAAAAGACTGA
AATTAATGATAATACAAGTACTAGTCCGAAAAACTTATCACCTCCGAGTT
CGTCGAAGATAACGTTCTCAGCGCACAATAATGCTGACATAGACACAAAA
ATGACTAATGCTGACGATGCGAAACAAGGAGATGGATGTGCAAACGACCG
TAACGCGTCCAAACTTTCCTACTCCACTAACGATCTATCAAATATTTCCC
CGGTTGATGTTAATTTTACAAAAGACTTGAAGGAACCTGATAAATTGAAT
AATGGAAATGTAGTTAACACAGACAATAATACTGAAATTGATAATAAAAA
GACTGAAATTAATGATAATACAAGTACTAGTCCGAAAAACTTATCACCTC
CGAGTTCGTCGAAGATAACGTTCTCAGCGCACAATAATGCTGACATAGAC
ACAAAAATGACTAATGAACATACTCATACACCTAATCTCAAAAACGAAAA
CGAAGAACATACTCATACACCTAATCTCAAAAACGAAAACGAAGAGCGAC
CACCGCCGCCACCATATCCTGGGAACGCCACAGATAGTCCAAAAGCGACC
ACCGCCGCCACCATATCCTGGGAACGCCACAGATAGTCCAAATGTTTCCA
TTCCAACGGCCAGTCGACAGAATGACGATTCTGATTTAAGTGACAATGAG
GAAGATGGCCCCCCACCTATCCCTCCAAGGGATGCTTATGTGCGCAATGG
TAAATGTTTCCATTCCAACGGCCAGTCGACAGAATGACGATTCTGATTTA
AGTGACAATGAGGAAGATGGCCCCCCACCTATCCCTCCAAGGGATGCTTA
TGTGCGCAATGGTAAA
Gene-mRNA-Prot
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
XLOC_034873XLOC_034873-proteinClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonpolypeptide
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
sc0000230_pilongenomesc0000230_pilon:381280..391504 -
Properties
Property NameValue
Aaloc673-783:112
Aaloc625-669:1029
Aaloc586-621:1415
Aaloc280-582:1909
Aaloc1-276:10226