|
|
Sequence
The following sequences are available for this feature:
mRNA from alignment at sc0000230_pilon:402801..409849- Legend: polypeptideCDS Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >XLOC_034871 ID=XLOC_034871|Name=XLOC_034871|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=7049bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000230_pilon:402801..409849- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ATGGAGGAAAAAAGCGGAGAAAAAGTCAAAGTCATCTGTCTTGGAGACAG
TGCCGTTGGTAAATCAAAGTAAGTATATATTTTTCATATAAAATTAAAAG
AAAGAGACTTTAAGTTTTATTATTGTTTCAGAACTTTAAGTTTCATGCCG
CCGGTATGGACGACAATCTATTTTTCATATATAATCAAGGGGATGTTCGA
CTGCTGAACCCTATTGAACCAATTTTCTTAATCAAAACATCGAACTTAAT
CAAAAGATAGGTGTTTGATTATTACCAAACCAGATCAAACTTTAACGCAG
AGATATATTGATTAGTTCGATTAAAAATACAGTTCGACGTTGTTCGATGT
ATGTTTGAGTTGTTCGACGTTGTTCGATATATGTTTGAGTTGTTCGATGA
GTGTTTGAGATTATATATTGATTAGTTCAATTAGTTTGATTAAAAGTACA
GTTTGACGTAGTTCAATGTATGTTTGAGTTGTTTGACGAGTGTTATGTGC
TTTTCTGGAATCATTCAGCTATTTTTCTCAGGTATAATAGCAAAGATAGG
GAGGTCAGTCGAAATTTCAAAATCATTTTCAAAATGTCAAACCAAGTTTA
ATGAAAAGCCCTTATCCTCAGAAAAAAAATGAGGGGTCACTTATCTTTCA
ACCTTTAGTAGTTTTTCAGATATTCCATTTTGAAGTTCCATATTTTTGAA
GATTCCTGTTCAAAAACCTCCTACCATCTTGTAACATGTCCACGGCACTG
AAATCGAAAGTGTTTTACAAAAAAATCTGTGCAGGAAGTTTGGGGCGAGA
GTGTTTTTCCGTAGTGCGAGCCATAGAGACAGGGGTCACTATACCATTAA
ACTTTCCTTACAATGGAGCAGATATAGATACACAAAAGATAATTGAACAG
CATGAAAGAGGAAGGTCTAAGCTCTCTTCTGTTACCTTTTGCAACATGAA
ATGAAAATTTGACGGATTCTTCGAAAAATTTTGGATTTAATTCTTTGATT
TACATTTGCTGGAAGACAATGCACGACCCCACAGAACGAACGGTTTCAAA
AGAAAGCTTGATCTACCATCTTTCAAACACAAAAAACCATTTGTTATGGG
ACCGATCTGCTCCTTCGTGATCTTAACAAAAGTAACCATGGTTTTTCCAA
ATTCGCGTTGCCGTAATCTTGTTCACAACAAATAGCAACAACCCAAGCTC
TGAAAATCGAAGATTACAAATGAACGAAGAACGTTAATGACTTCTGGTTT
TTTGCACTGTAAAGGTGAATAAATTCTTTTCATTTTGGAACAAAAAATTA
TGCAGATATCTTTCTTTATCATTTAGATATTTAATTCTGAATTTTATTTT
TATCCTTTTTTTGTTGCCGCGTCTTTTGTAACGCAGGAAAATACGTGACT
TTCGACCGCCCTAGCAAAGATATTGCAAAAATGGCCTAGAAAAAAGTAAG
ACGCTTATTGAATGAATTCTAACTACGATCAAACCTATCAGTCTAAGTTT
AAACTGCTTCTTATCAGGATAAGAAACTTGGCTAGTCTTACCTCTTTTAT
CTTTCCCTTTACAACAATACCGTCAACTGCTCTAACTTGGGGGGCGATTG
GTCAAAACATGGGACTGTTGATATCTGGCCTGTATTTTCACTTACTGTTA
AATCTCTTTGACAACAAATTTGTTTTGATAACTCCACCAAGTTTATCAAT
CATACTTTCTGTCATAACATGTCATGATAACTTTTACTGGTAGCGCGCCC
TTTTAACTTTTTTGTTTTCATTCAAAATGACTCGGCGCTGATTGTAGAGA
ATTAGAGAACGCCTAATCGCTTATCGCCTGAGATTAACAAATAACAAGTG
TGTAAGTTGCCGCACAAGTGACGTCAAACGCTCCATCGTTTTGCCACTAA
TTTGTTCTTCTTCTTCGTTCCAGACATTCGCGTGTGTTCCACTATAGATT
TTTTTCATATTTCGATTTAAAAGCCTACTCAGTGCAAAAGAGAAATTGTG
TATGTTTTAATACGCCGTTCATTAACTCAAATCAAATGACTTTGGAGATT
CAGTGAAATGGTGGCCAAATTGCCATCCCATCTTTTGTCAGATAGTCCCA
AGTTAGAGCAATCGACGGTACAATGCTGACAAGTTGACACAACACATTGA
CAAGTAATCCCTCTGTGAGAGAAGTTTATATCGAAATCTGCAACAAAAAC
AAAAGTGGTCTCTTCTATTGATTGCTTCCTGGCGCTCCTTCGCAGCTGTT
TATCAAATTTCCACCAAAGAGATTGTCGAATTTCACACAGCCCTTCCTTT
TGGCACTGATAGAGTGCACCCCCCTGAGCTTAGGGGGGCTAAACCATTTT
TCCTTGATTGAGAGCTGTATTTTTCAAAAAATACTGGGGGCTAGCTTGCT
AGGGGGAGGGCTGACTGTTGTGTAATAGAACTGGGGGCAGAGCTGATAAG
TTGAAGATATTTTAAATCATGTTAAGAATCTATGCTGTGGGGAACGTTTT
ATCCCTCTTGAAAAAAATTGGGTGGTTTCCCACTCATTTTGGTCATAAAT
CGCTTATAAAATGACACTTCTACATCAAATAACTCCCTTTCAGGGAGTTC
AGCCATACTCGCTTCAAAGTCTTATATATAGTTTTTTGAGAGCTTTCAGA
TTCTATAATTGGTTTTGGCCTAAAATGAATTTGAAAATCACATAAAAATT
GGGCCCTTGGGCGTTAGCCTAGTTTTTCAATACAGTAAATGGGTCCAGAA
ATAAGGGCTACCCTTAAAACTTTTCTGGGCCTCCCTTCTAATATCAATCC
ACAGGGTATTAGACATGTCTGGTCCAAATTTGGTACAAATCGGGCCTACT
ATACAAATTCAGTATATGAATAGAGTCAGTAGAAAATATAACTTTTGTAT
TTTTTCCTTTTTTTCAAAAGTTCCAGAAATGAAAATAAAGGGATAATGAT
AATTGAATACTATCCATCCATGATCCTTGGCACTATTGTGCTAGAATTGC
TTTGTGTATTCTTTGCTTGAGAAAATGATTGACAGATTACAGTAAAGTTT
TTTTCACCTTTCAACTCGACCAAAGTTTTTAAAATGGTATTTATAGAACT
TAGCTGTGGCAGATCATTTCAATGGAAGTTGTTAGAAAGTTTACAAGGCT
CTTTATTTATTTGCTTCTCATTTGATGACAGTGCCGTTATTGATTTTGTT
TGCAGTTCATTTGCAATAAGCCAAAAACTCAGTGATCAGGATGATTTTCA
GACATTGTCAACAGAACTCTGGGCACTGTGCTTAAAAAGTCTACAATCAT
TATACGTAATTTTAGTTTCCTATCAAAATAATTTTTGGCTTCTGCAAGGT
GGAACGAATCCTTCTGCCTGAATCTTCAATTTGAAATGGTTAATAATGAC
CCCTCATTTTCTCATTCAAGGTAAGGGCTTTCAAATGAATAAGTTTTGTT
TAAAAAACGTTGTTTTTTTAGCTACATGTGTACACTTCAACTGCCATTCA
TGAAAATACTTGTCCAAAACGATAATTTTGTTAGAACACCATTAAAATCA
AACCAATAAAATTTCATTTGTCTGAAATAAAAAAGCTGATGCAATCAGTT
TTGAAATTACTTCCAAAGTGCAGCCGCCAAAATGGAAAAAAAAGAAAACA
TTTGAGGGGCTTGTCAGGTATTAAATTTTGACTATTCTGATGTGAAGTTT
TTAGCTCCACCCACAACCTTACAATAAACGTGGAATTTAAACTGATTCAC
ACCTATTTACACAGCCAAACATGGAATCTTACTAGCAATGGAGGAATCCA
TTGACACATTCCAGAAAATTTCTCAACTTGAATAGAATAGACCTTTTGCT
GATCAGGATACTCCATAATAGATCAGCCACAAAATGTAATGGCTTCAAGG
ACATTAATCTTATAGCAAAATAACCTAATAGGGGATAGATAATGATTGCA
TGTGTCCTTTTAGGAACTTAGGAATGCTGTCGGGACACTTTTTTTAAGTT
ATTTTAATATACATTGTTTTTTTTGTAAGGAATTTAAGGCTGAAAAAATG
CTTTAAAAAATAAGAAAATTTTAAGGAACTGATTAGGCTGAGAAAAAGTA
AACAAGTTAAGGAACAGTAAGAATTAATATTGAACTTGCTCACATTTACA
AAAACTTAAATAAAAAGTTGGTAAAATATTGTTCTTTTTGGACCTTCCTC
AGAGGCTTTTACGTTAACCTGTGTCTTTCCATCCGTCCGTCTGATACAAA
CTTTTCTCAGTTTAATTTAACCTTTGTTCGTTCGTTTGTCTGTCGTCTGT
TGCCAGCTTTTCTAGGGATTAACCCATTAGTTTTTGTCTGATATTTTGCA
TTATTTTGCTGTAAGATTTTTAAGAGGCTTGAATTCTTATACAGCCATTG
AAGTATTTCTCACAGCTTGGCAGCAAAAATTTTAAACGACACCTTTAATT
TGAAGTAAACTAAAACTGTGAGAAACAGTTTTTAAGTTTTGGGCCTGTGA
GTTGTATATTTTACTTGTATACTTTATATACAATAATATTTCTTTATTAG
ATTATCTTAAGTCAGAAGGGGACTGTCCTTGATTTTACATTTCGTTTCTG
TTTCATTTATTTGAACTGTAATTAAATATTATAGGTTCAAGATCAAATCA
ATGCAATTTGTGAAATTAATTATATTCTATTATTTAATAAAGCGCTTTCA
TTGATTATATTTATTTAACTGTCAAATAATTTAGGATATATGATTTCTAT
TAATTTGATAATGTTTTTAAAATTCCATATTTTTGTTTTTGCAGATTGGT
GGAACGATTTCTGATGGATGGATAGTATCTTTTCGTCACATTTCTATACC
AAAATTAGTCAATTAGGTAAACTAGGTCCTCTAATAGCAACTTTTCATAA
GGTTGGATGTCAAATTGCAAAGTCAAAAAAAAGGTGTGTTTTTTTGTGAA
AATTTAACTTAAAGTGAGACTCCAAATTTAAGATTTTAAGATCGGAAGTC
CAAATATTTTCACTTAGACTTAAACTTATTTAAGATAACACCTGGAAAGT
CAGGTTTCAGATTTGTGGGGCCTCAAAATTTAGATGGGACCTTTAAAGCC
TCTCCTCAAAAGTACAAGAAATTAATTTCTTATGTCGGGGAGTATACAAA
TTCATCAATATCAAATGAACATTCCTTAACCAGTTCCTTCCATAGCAAAC
CACAACAGTTATCAACCTACGCTCTTACTCTGTTCAAATATTTCACGCAA
ATAGAAGGCAGAGATGTTAATGTTGGTAAGTTGATGTATTATTTTGCATA
AACATCCTGGGCGATTTTAGTAAGGGTGTATCTTTAGGATGGTTAAAGAT
AAGCGCGCTTATTAAATAATAAAGTGAATAGGAACATTGTTTAGTCTTTT
TCATATCTCGAGGCCCAGAAAAACCGAGTTTAACAAATTTTATGCCATAA
GTCTCATACAGCGTTTATTCGAAGTAATAAATATATTAGATCATTTTTAT
CACTTTCTTGTATACAGAAGTTTGAACGCTCATAAAATAATCTAGATAAA
TTTGAGACAAACAATAAATTGTTAATTCGTAAAAATTTTCAGCAAATTCT
CTGATTGAACAGGATTGAATTAAATTTTATATTGAAATTGATTATTATAT
TCAAGGTTCTGCTTCTGATTCTATCTTTCTTGATTTTAGAATTTTGGGAT
ACGGCAGGGCAGGAACGATTTAGCAGTATGCACCCATCTTATTACCATTC
TGCACATGCTTGTATTTTGGTAAGTCTTGCAGTGAGACCAAAATGCTAAT
AGCAATATGACATCTTACCTAGTTTTTGGACCAAAATCTGCCAAAATTGT
CAAGAATTTTCTTTTTTTAACATGTTTTAGGTATTTGATGTTACAAGGAA
GCCAACATACAAAAACTTAGCAAATTGGTATAAAGAATTACGTGAATACA
GAGAAGACATACCTTGTATACTAGTCGCAAACAAGATAGATGGTATGTAA
ATGATTCCAATTTTATCTTTTAAGCCTGGGCATCCTAGTCTTACTATGAG
ATAAAGGGTCCTTACCAATAGACACAGATGATAGCCTTTCATTAGTTGCA
CAAAAGAATAAAATTGTTGAATAAAAAGGGGGGGATGGATACATTTTGCA
TAAACGAGGGATAGTTTAAAAAGGAGGGATAGGACCCCTCTGCACATTGT
GACTCTTTCACTATTTCCTCTCTTTGATTAAAAATGCTTATTTATGTTTG
ACAACTCAAAGGCAACTAATTGCTTTCTTTTTTTCTCCATTTCAGTTGAC
TACAGTGTAACAAAGAAGAGTTTTAATTTTGCAAAGAAATATCATATGCC
ATTTTATTTTGTATCCGCTTCAGATGGAACCAACGTTGTCAAGGTTGAAT
ACTGAACCTAACGGTCTTTTACAATGTTTTTTCAATACATAAGTTAATCT
AAAACCGAAAATTATGTACTTACTGGTACTTTAACAATTCCAAGACTCAA
TTTCAAATTTCATTCTTTCCAAAGACAAACTAATGAACGAGTCAGTTATT
TCTTAAGAAAGTCTAAAATACTTTGCTTAAGTATTTCTTTTAACAATTAT
GACGATACTGACCTTTTTGTTTTCACTGGGTATTACTTTGATAAACAGAA
CTTTCTTTTTCACTCTCTTACACACCAGGTATTTCGAGAAGCTATACGAT
TAGGTTTGGATTATAAAGACAACTCGACAGACTTTGTTGATGAAGTTTTG
AAAGAATTAGAGGTATGATGTGTTTCGAGCTTTTTAAAGTGTCCTGGAAC
ATAATCTATTGAGTTTTTATCACCAAGAGACAGGCTCTTGTTTGCCAAAT
TTATCAATTTACTTTATTCAAAAACCTCGTTATCTTGCGTTGGCAAAGTC
CTGACCTTTTCTTTGGACAGCCTTTAAGTGAAATTTTCTCTACCTTGCTT
TTTATTTTACTTTAATAGCATATGGAGGAAACAGACAAAAGTTTGGCTTC
TTCAACTCCTTCATCGATATCACCCACAAGCTCCAAAGATGATCCATGA Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000230_pilon:402801..409849- >XLOC_034871 ID=XLOC_034871|Name=XLOC_034871|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=1266bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000230_pilon:402801..409849- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ATGGAGGAAAAAAGCGGAGAAAAAGTCAAAGTCATCTGTCTTGGAGACAG
TGCCGTTGGTAAATCAAAATGGAGGAAAAAAGCGGAGAAAAAGTCAAAGT
CATCTGTCTTGGAGACAGTGCCGTTGGTAAATCAAAATTGGTGGAACGAT
TTCTGATGGATGGATAATTGGTGGAACGATTTCTGATGGATGGATACAAA
CCACAACAGTTATCAACCTACGCTCTTACTCTGTTCAAATATTTCACGCA
AATAGAAGGCAGAGATGTTAATGTTGCAAACCACAACAGTTATCAACCTA
CGCTCTTACTCTGTTCAAATATTTCACGCAAATAGAAGGCAGAGATGTTA
ATGTTGAATTTTGGGATACGGCAGGGCAGGAACGATTTAGCAGTATGCAC
CCATCTTATTACCATTCTGCACATGCTTGTATTTTGAATTTTGGGATACG
GCAGGGCAGGAACGATTTAGCAGTATGCACCCATCTTATTACCATTCTGC
ACATGCTTGTATTTTGGTATTTGATGTTACAAGGAAGCCAACATACAAAA
ACTTAGCAAATTGGTATAAAGAATTACGTGAATACAGAGAAGACATACCT
TGTATACTAGTCGCAAACAAGATAGATGGTATTTGATGTTACAAGGAAGC
CAACATACAAAAACTTAGCAAATTGGTATAAAGAATTACGTGAATACAGA
GAAGACATACCTTGTATACTAGTCGCAAACAAGATAGATGTTGACTACAG
TGTAACAAAGAAGAGTTTTAATTTTGCAAAGAAATATCATATGCCATTTT
ATTTTGTATCCGCTTCAGATGGAACCAACGTTGTCAAGTTGACTACAGTG
TAACAAAGAAGAGTTTTAATTTTGCAAAGAAATATCATATGCCATTTTAT
TTTGTATCCGCTTCAGATGGAACCAACGTTGTCAAGGTATTTCGAGAAGC
TATACGATTAGGTTTGGATTATAAAGACAACTCGACAGACTTTGTTGATG
AAGTTTTGAAAGAATTAGAGGTATTTCGAGAAGCTATACGATTAGGTTTG
GATTATAAAGACAACTCGACAGACTTTGTTGATGAAGTTTTGAAAGAATT
AGAGCATATGGAGGAAACAGACAAAAGTTTGGCTTCTTCAACTCCTTCAT
CGATATCACCCACAAGCTCCAAAGATGATCCATGACATATGGAGGAAACA
GACAAAAGTTTGGCTTCTTCAACTCCTTCATCGATATCACCCACAAGCTC
CAAAGATGATCCATGA
Gene-mRNA-Prot
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Position
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
|---|
| sc0000230_pilon | genome | sc0000230_pilon:402801..409849 - |
Properties
| Property Name | Value |
|---|
| Aaloc | 553-633:82 |
| Aaloc | 469-552:372 |
| Aaloc | 373-468:753 |
| Aaloc | 259-369:1170 |
| Aaloc | 181-258:1359 |
| Aaloc | 100-177:1854 |
| Aaloc | 70-96:2255 |
| Aaloc | 1-66:7050 |
|
