XLOC_034868 (mRNA) -

Overview
NameXLOC_034868
Unique NameXLOC_034868
TypemRNA
OrganismClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon (Jellyfish)

Sequence
The following sequences are available for this feature:

mRNA from alignment at sc0000230_pilon:485396..495638-

Legend: polypeptideCDS
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>XLOC_034868 ID=XLOC_034868|Name=XLOC_034868|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=10243bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000230_pilon:485396..495638- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ATGGAGGATGAAACAAAGGAAGAAGTCGTTATTGATCCATGGCTGAGAAC AACCGAGAAAAGAATAGAAGATGCAAGAATAAAGAAAGAAAAAGGAACAG CACTGTTTAAGGTAAGAAATTCTTCTTCTTTTGAATGGAAATATTTCATA TGCAACCCCAACGATTAGTCCCAGGGTCTCACTTTCGAAGTCGAGAATCA AATTCGAATCGAGAAAATGGTATAGCTCATTATTAAAATAAAAAACTCAC ATAAAGGGAGTGTTTTTCATTTTATTTACTTCAGGGCCTGGAATTCCCAA GTTATTTTTTCCCGAGTTATTTGTCCAAGATATGTTGCATATGACGTTCT AATTTCAGTTTTGTGACGTCATTATGACGTCATCACAAATATGATAACTT TTTTCGAGGTTTTAGCTTTTCGAGTTATTTGGTGTTTTTTAACTCGGCTT TTTTTCGTGCCTTTAGAAGCAGCCAACGAGCCCATTTCCCCCGAAATATC TGTTTCCCTTTTCCAGGAGAGAGCTTTTTTGAAAAATGGGGAAACAGATC CAATTTTCTAGGAAAGACCTTTTCCTTATAATTATCTGTTTAGCTTTCTT AGTTGCTTTTATCTATCTATATCTCTGCCACCCTTTCTGTCGCTTCCTTT TACGCCCAAATATTATCTTTAAATATATCAACAAATAACTCTAAAAGTCA AAGGCACGAAAAAATATCCAATTAAAAAACACCAAATAACTCGAAAAGTT AAAAGCTCAAATCATTTTTGTGGTTACGTTATAAAAACCGAAATTAGAAC ATTTCTAAAGTGTCAAGGGCATTTGTGAAATAAAATGATTGACGATAGGA TAGAACGCCTCAAAGAGTCAATTCAGAATCACCTCGAATATTTGGTATGT TTTGTGATTCGACTCATCGTTTTAATAACTGCCACCTAGCTTATCTACAT 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TGGTAAATTTATGTAGGAATACCCGCCATACAGTACCAAGAGTATACAAT ACAATTAGCTATGTAACATTATAATACACTGTAGTACCTTATTGGAACTA ATTTTCGCGGGAACTAATTTTCGCGGTTTTGACTTTTTTTGGACAAATTT CTTTCATTTTCCTAGGGATTTTTCAAAACTTTCGATAAAATTGGAAAAAA TTGTATTTCGCGGGAATTAATTTTTGCGGTTTTTAACTGTGAAAATTTTT CGTGGGCTCAAATTTTCGCGATTTTTCGCAAGTAACCATTCAAATAGTAT TTATTTGATATGTTTTTTGATATTTGTATGATATGAGTTTTGTTTAGAAG TATTTCGCGGATGAGGTCCTTCCAAATTTCCATTGAGACTTAATTTCGCG GATGACACCCAAATCCACGAAATCCGCAAAATTTAATCCCCGCGAAAGTT TATCCCATTAAAGTAGTTTTTGAAAAAAGCTTTTCTTCGAAGATTTTTTT TTCTCTTTTCGCGGAGGGATTACAGCAGGGCTATTACAGATTAATCACCC CGCTCCTCCCTTACATTTCTAAGCTAAATGTAATCAGCCATATAATTAAG TCTAATAAGCCGAAAATCGACAAAAATGTCGATTGCTGACGAAATATCAA TGGTCGCGTCTCCTTTAAAAAATATCTGGTTTCCCATTGTCAGAGGAATG TTCATGCTAAATTTTGGCTTCGGGTTACCTTTTGTTGAGGATATATTTCC ACTTTAGTCAGAAAATCGGGATTTTTGTCGATTCAGCAGAATTTGCATAA ACATAAGCATGTAAAATGGAAGCAGAATTATCGGAAAAGTAGCCTATAAT TGGTTAGTTAGCCGATGAAAAAACACCTTTTCATATTTCTGTTCTCAAAG TTCAATGTTATATCAGATTAGATGGAAATTTTTCCTTTGGCTTTAGGCAA TGAAATAAAAGTGAAAAATAGACGCGGCCATTGATATTCGGTCAGCAATC GACATTTTTGTCGATTTTCGGCTAATTAGACTATATAACATAGTCTAATT ATCCTATGATAGGCTAGTTGGATGCTGTTCTTGACTGACCAATTAAAGTT TTAAAGGATTAAAAAAAAGATTATAATATCGGAGACTTAAGAGACCTCGC GGAAACTCAGATAGCACAGGTGTCATTTACTTTAGTTTTACAGGACTTGT AGATCCTTTAAAGCCAATTATCCTTCGACATCTATTACAACTTCATCATG TTTCGGTTGTACTAATTTTTGTTCCTCTTTCTATCAGAAAGTGACTGGCT ATCCCTGTCATTGTTTTCTTATCCTGATTTGATTTTGTGAATGTTTTTCT TCTCTCAAAACACTTTCAATGGCATCTCTTCCAAGTCCATAAAATCATTC AGCTGATCATAAGCAGCAAAAATAAATTTGCTTTGTGTGACGTCATTCAT CCAGTGTTTAATGATAGCCCAACATCCCCAAAACACCCAAGGGTAGTTAA TAATGAAAGCTTGTGCGATACGTTCTGGGTAATAGTATCGAAGCATGTTC AAAAAGTTTTTCACATACTTAAAATCCATATTTCTCATACTAAAACCGTT AAGATCGAAGATTAAGTTGAAACGTTTATCTGCGCTCAGTTCTTCAGCTT TTTGTGCAGTCACTTCCATCAACCAGATTACGTAACGAAGCAAGCTTGGA TAGTTACCATGGTAACGGTCATGGTTTTTAACATGTACTAACATGATTGG TCGTCCACATCGATCGAAAAAAGTCTCAAAAACAGTTGCTCTACCGACTG TATCTTGTCGTTTTATTTCTTCATCATTGTCCCGTGTCAATGCAGCAGTC GTATCAACGTCATCTTTCAGTCTCCACTCACAATAATCTTCCAACGCTTG CATGGTTCCCTCCACTGTTTGAAAGGCTTTCAAGAAACGAGCCAACAGAC CGTCGTGGATCCATTCTGCTTTCCATTTCGTTGTTTTCATTCGTTCTTCA ACACATATCTTCAGATCTGGTAATAATTCTTCGTTTAATGTTGGACGAAT GATGCTATATTTCTCACAAAGCTCCTTATCTTTTGCTTGAGCTTCATTTG CCTCCATGCTGTTCTGATGTTTCGACTGATAATTTATAGTGTCTTATGTT ATATGTATAGTAGTCAAGAGCAAAGTGCTTTCTAAAACAAACTCAATAAG TTGATCAAGCGAAGTGCAATCAATATTGAGTAGGTATTGGAAAAACGTCT CAACTTCTCCTTTCTATAACCAAAGAGTTCAATCACCTTGTTGTTGATGA AATATCTCACTTCGTTACACTACGGCTAGCTGCTTATTAATAGTACGACG TGATAATAATGTGATATTACTCTACATATAATTCATTTAATTTGCTATTG TGACGGTATGATAAGAATGTCTTTATAATAACTTCTCTTTGCTAAGCAAC GAAACACCAAGCCAAATTTCCTTCACTTTATAGTTCGATCGAAAGCTCTT GATAACTGAGACAAACGCTAGCTTGCTATTTAATTTTCCTCTTTTCCAAT CCAATGCAAAATGTATGCAACAATGTATTCTACAATCGTTTTTGATGTAG AAAGAAAACATCTTTAAGCATCTTTAACTTTGTCGTCAAGGCAACCTTCA TATTATTCTTTTATTCGGTCTATCAAAATAAGGGGAATTCTACGCAGCTT TTATACTTTGTATAAAAGATTGACTTCTTGATAACACCTTACGAAAAAAA CCTACAAAAATCTATCTGAATATTGAGGATGAAACTTTTTGTGTTGAAAG TACGTTGTCTATGTTTTTCTTCCCTAGCAGTGATGTTTTGTAGAAAGTAG TTTTCGGCTTTTCACGAGGAAGTGAAAAAATGCCCTTTTACCTATTTACC CCTTAAAATCTACAAAATGGTTTTTCTCGAAAAACTTTTTATAGAATGGT CTCAAATTTTGAACAGCGATTCGCTGAATTTTAAAATTAAAATACACCTT AAAACCTACACTTTTATACCTTAAAAGCTACAAATATCGACCCCTTGCTC AAAACTTACTGAAACTGTAAAATTGCAATTCAGGTGCTGAACCGTGATTC AATTGATCAAATACTTGCTAGAAATCCATCCCCAAAACAATATTTTCTAT TCTTAATGGATTTCATGCCCATGATGCAATTCCGCCTGTTTTTTGTCAAA AACGGCTTTGCATAAGTATAGGCACCCAAAAAGTATAGGTTTTGTGACCT TTATTTCTATTATTCTAGGTCCGAAAAACTTGATTTTTTGAAGGGATTTT TTATAAAATTTTGAATAAATTCGAATTTTACGACACTTTGCGATAATTGA TTATCATCGAAATTAGGTAAGTACATTTGTAAGAGGTTGTAAAACAGACA ACAAATAGACCAAATAAATTTATTGCGGGTTAAAAAACGTATCACCCATG TCGTGATTACCTAAAGCGTTATTAACTCGATGTTCTTGTGCAAAATACAC AGAATCAAAAAATATTTTAATTTGTTACCCGTGCTTTTTCATTCCACCAA ATTAAACTCTCTGCCTTGGGATTGTTGTAATTTCCGATGTTCTCTTCTCA CTTATTACATGCACTTGCGGTGTCCTTTCGAGGAACGATGGCTCTGCTCC TTCCAATGCTTCGTTTAGTCATAAGTAGTTAGCTGAGCTGGCTGACCGTG GAACCCGTGATCATAATCGAAAGACTGTCTTAAGGGTTGGTCTAAAAAGC AGGGTAGCCAATTGGCTACCCCATTTGGGCTAGGTTGTGGGGTAGCCCTT TTTTGCCCAAGTATTTAAAGTCTAGTGTTTTAATTTGTGAGAATATAATA TTAGAAAGTTTTAACAGTCATTTAAAGAAAAAAGGTCGAAATTTGCTCCG TTACGTTGGTTACTGTAGTCATTTTTGTAAAAAGTACTAAAATCTACTTC TGTTTACTGAGTGTGGTCGCCCACCTTGTCTTCCTTCCTCTCACACTTTG AAAATCTACAGACCAGACCATTTTCTATGGTGAAATTTTGATCCCAAACA TTCTAACAGAGACTCAAAATGAAAATCAGAAAAATGGGTAATCTTATGAC ATCAAAGGATAATTTATCTTTATGGTAAATTAATTATACCTAATTATACC TAATTAATAGTAAGTAATGTAAGCCTTACCCCTATGGTAACTTAGGGATT CACACCTTGTAAAAGAAATTACATTTTATAATAAAAAATGTAATCAGAAG GTCTAAGGTCAAATAGTTCTGACCATGTGTTATAATTATAATTAAATAAT TAGAATATTTTTTCAAATTTTTACCCCCTGGCTTCAATGAGGATTATCAA AAAGTTTTTATTTTTTTGCTCTGGTCCGTGAGATACATGGCTACTAGTCG CGCGGCTGAGGTCGAAAAAAGTGGCTAGAAAATGATTTTCGTGATACACC TCTTAGATTCCACTTTTTTCGATGGAAACTCTCGAATTAGTATATGTAGA TTCCAAAATCAAAAAGTTTCCACGATATTATCGTGCAAGTAACGAGTAAA TGGCGATTTTTTGCGTTTCCAGGCAAAATTGCAAGGCCTGGAAATTCATG ATTTTTGGGGGGTCTTCAAATTAAAAAAAGAACTATATCACATGATAGAG CTCTTCAAACTGAGCAAAAAAGTGTATTACACCAAAGTCCCAACTTCTCT AGATCAAAATTTATTGGCCTATTTGTGGTAAAAAACTGATGGAAAACAGG GAATTTCCCCACAATCTGCATTAATTTATGCAAAATTAAACACCTTTTTG ACCACAAATAGGCCCATAACTTTTGATCTAGAGAAGTTGGGACTTTGGTG TAATACACTTTTTTGCTCAGTTTGAAGAGCTCTATCATGTGATATAGGTC TTTTTTTAATTTGAAGACCCCCCAAAAATCATGAATTTCCAGGCCTTGCA ATTTTGCCTGGAAACGCAAAAAATCGCCAATGCACGATAATATCGTGGAA ACTTTTTGATTTTGTAATCTACACATACTAATTCACGAGTTTCCGTTGTT TTTTTTGGAATCTGAAATATGTATCACGAAATGAAACGTTTTTCGACCTC AGCCGCGCGACTATACCCCACAACCTAGCCTAATTGGCTATCCAAATTGG CTACCCTGCTTTTTAGACCAACCCCTGTCTTAACGTTCTAGATTTAGTCT AGCTATCCTCTTTCTTGTCGACCCTTACAGTACATTTTCTAAAGTCTGAC CTAACCTGATGATGGGTTGCTGACCTTCAGTGACCACCTTCCCCCAGATG TTTTTAAAATGTACAATAGACCTTTTCATGAATTACGTCACGAACATCAC TTGCCTCGTATTCAAACAATTACCATGGTGATCATGTCCCTTGAGACATT AAATTATTTTTTTATAAATAGAAAGAAATAGAAAGTAGTTTTAGTAAAAT CCGCTGGGAGTTAACCACCATAGCAATAATTTCAAAACGAGGCAAGTGAT GTTCGTGACGTAATTTATGAAAAGGTCTATTTGTGGGGATAGCCGTAAAT CCTTTGCTTCCATTTTCCGCTTTCAAAGAAATCACAGAGTTAATTGATTA ATTTAACTAGACGAATTAAAATTGAACTAGTCGTCCAAGACGACTCTTTA ACATGATAATCGCTTCACTCGCTGTCATTTTTGAGAAATTAAATGTATTT TTTATTTAAACTAGGAATGTATAAACAATTTCTTGTATTTTCGAAGGAAA ATGAACAGTAGTATTTTCTTGTATATTGAATGGAACAATAATGAAAACAA TAATGAAAACATTTTAATGTATTTCCCAAGGAATATTATGTAGAGAAAAT GTCTTATTTTCCGAGGAAATTAGATAAAACACAACCCGAAGATCAGCATC CTTCTTAGTTTTTAAATAAAAAACAACAAGAAAGTGTTCGTAAATTTTGG AATATTTCGATGACTTCTTTCTATACTATGACTTGTCAACCATTGACAAT GATGAGATAGGAGCTGCTCAGTCATCTATAAGCAGCCGGTGAAGCAATTT TTTAGAAATATGTGTTCTTATCTTCTAGGAGACCACATGTTATAACCTTA ATTTTCTTATATAATTGATGTGTTCTGATTTCTATGAAACGTTTACTGCA TTTTTTTTTTCCCTAATCCTTAACTTATTGCTTTATGGTTGGATGTGTTC TGAAATCTAAGAAAAACTTTGTCGCAAGCTAAAATTGTGAGATATTTGTT TTTGCCACGAGAGATGTATTCTGAAACTTTCTAGGATTACTAGGCAACAA GATTACATCAAAAACACGTTAGATGAACTCGATTATACCCTATGTCTGGT CATCATTTCTAGCTGATTGGTTTATACAGCCTTTATCAAAACAGATCAAA ATTTTTAGCTGAAACATTCTCTCAGAACATATTGGGAAAAAAAGGTCGCC TTGCTGGCTGCTTTCGGCCATCGTGACTAACCATAACACTCGAGGGTTAT ACTTTGAAAGACTAGCTAAAATAGGAATATTTGTAAATTAGATATTTAAA AATTAAAAAGAATGAGTGTTCAATTTCAAAGCGCTCTTGAGAACGTTCAG CAAAGAAATTTAGAAAAAGGAAAAAAATACATTTTTTACAGCTTTAAGGT TGAGCAATTAAAAGGTCAATGAAGAAAAGGCGCGAAAAAGAATTGTCGTC TGCTTAAATATCACTAGCGAAAGAGCTTCATGCGAGAATCGGAGAGTTCA GATTTAGGCGTATTATAATATAGATGTTTTGGTTCGAGTGAACTATAGAT CGAAAATTAAAATATAAGGAATAAATTCACAAGTATTATCGTTCTTTGAT TCATATGGCTCCTCTATTGAAAAAATTCCCCCATACTTCCCCATCTCATC CAGACTCTGATATCTTCAATTGTGTGGTATAGTCAATTTTCAATACGCAT TTGTTTATGTCCTTTTGTTTTCTTCACAGGATAAAGATTACAGAGGAGCA GGCCAATGTTACATCAACGCGTTGAAAGATATCATACCTATCCTCCAGCC ATCTGATCAAACTGAAGAAAGTACAATCAAAGAACTCAAAGAAGCTTTAT TTTCCAACCTAGCTGCATGTCAATTGAAATTACAACAATATCAACGTGTC ATTGAAAACTGTACGAAATCACTTGATATTAATGCTCAAAATGTGAAATG TTTGTATCGACGAGCGAGTGCTTACTTACAATGTAGAGATAGAGGGTCAG CTCGTAGAGACATTGATCGTATTTATGAACTGGAACCGAGTAATACAATT GTAAGGGAACTGGAAACAAAATTGTCTTCTCTGGATATAAAAGCAGATGC AAGAGACGCCGCCATGATGAAAAGTTTTCTCTCCTCGTCTTGA

Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000230_pilon:485396..495638-

>XLOC_034868 ID=XLOC_034868|Name=XLOC_034868|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=1050bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000230_pilon:485396..495638- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ATGGAGGATGAAACAAAGGAAGAAGTCGTTATTGATCCATGGCTGAGAAC
AACCGAGAAAAGAATAGAAGATGCAAGAATAAAGAAAGAAAAAGGAACAG
CACTGTTTAAGATGGAGGATGAAACAAAGGAAGAAGTCGTTATTGATCCA
TGGCTGAGAACAACCGAGAAAAGAATAGAAGATGCAAGAATAAAGAAAGA
AAAAGGAACAGCACTGTTTAAGGATAAAGATTACAGAGGAGCAGGCCAAT
GTTACATCAACGCGTTGAAAGATATCATACCTATCCTCCAGCCATCTGAT
CAAACTGAAGAAAGTACAATCAAAGAACTCAAAGAAGCTTTATTTTCCAA
CCTAGCTGCATGTCAATTGAAATTACAACAATATCAACGTGTCATTGAAA
ACTGTACGAAATCACTTGATATTAATGCTCAAAATGTGAAATGTTTGTAT
CGACGAGCGAGTGCTTACTTACAATGTAGAGATAGAGGGTCAGCTCGTAG
AGACATTGATCGTATTTATGAACTGGAACCGAGTAATACAATTGTAAGGG
AACTGGAAACAAAATTGTCTTCTCTGGATATAAAAGCAGATGCAAGAGAC
GCCGCCATGATGAAAAGTTTTCTCTCCTCGTCTTGAGATAAAGATTACAG
AGGAGCAGGCCAATGTTACATCAACGCGTTGAAAGATATCATACCTATCC
TCCAGCCATCTGATCAAACTGAAGAAAGTACAATCAAAGAACTCAAAGAA
GCTTTATTTTCCAACCTAGCTGCATGTCAATTGAAATTACAACAATATCA
ACGTGTCATTGAAAACTGTACGAAATCACTTGATATTAATGCTCAAAATG
TGAAATGTTTGTATCGACGAGCGAGTGCTTACTTACAATGTAGAGATAGA
GGGTCAGCTCGTAGAGACATTGATCGTATTTATGAACTGGAACCGAGTAA
TACAATTGTAAGGGAACTGGAAACAAAATTGTCTTCTCTGGATATAAAAG
CAGATGCAAGAGACGCCGCCATGATGAAAAGTTTTCTCTCCTCGTCTTGA
Gene-mRNA-Prot
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
XLOC_034868XLOC_034868-proteinClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonpolypeptide
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
sc0000230_pilongenomesc0000230_pilon:485396..495638 -
Properties
Property NameValue
Aaloc112-525:415
Aaloc1-111:10244