XLOC_034790 (mRNA) -

Overview
NameXLOC_034790
Unique NameXLOC_034790
TypemRNA
OrganismClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon (Jellyfish)

Sequence
The following sequences are available for this feature:

mRNA from alignment at sc0000092_pilon:794122..808539-

Legend: polypeptideCDS
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>XLOC_034790 ID=XLOC_034790|Name=XLOC_034790|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=14418bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000092_pilon:794122..808539- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
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TATCTTTCTATAATTCGAACTAGAATATTGGTATCCTCAGCTAGAAGCTA GTATATAATACTCTCTGTAATTCGAATTTTTCCCTAATTCGAAGATCATC CCTGGTCCCTCGAGGATTGAATTAGCGTAAGCTAACTGTTCAAATGAAAT GTATATAATGGCTTAAAATTTGCGCAAATTTAATTTGGTGTATGACGGAA AAATAGATTTTGGTGGGAATTAAAGTATGTGTCAAAAAGGTGTGAAGTGT TTTTATTTCTGACCATAACTTTCCAAGCTTTTTTTTATTATACGATTTTA AATGCTTGGAAAGTTATTGGCAAAAATAAAAACACAGCACATCTTTTTAA CACTACTGACTTTAAATTTGGCGGATTTTGGATAATGATTTTTTATAATT TTGTTCATGCCTACGGCTTCATGTGTATAGGTTTTAATGATTTAAGTGAA TAAGGAGGATGACCAAGTGGTTCAAAGTGTTAGCCTTTCAAACCAGGGAT TCACGGTTCGAATCCCCGCTCCTTCCAAAGTTCCGTTCAGTACAAAGATA GCCGAGCTGGCTGGCCGTGGACCCCGTGAAAACTATCGAAAGACTGCCTA AAAGTCCTAGATTACTGGGCAATCCACGTTAAATATCGACACTATCTATC TAAATATGCGAATTATTCCCTACCGTGATGATGTTGAAGTCAGTCTCGAA ATGATTCCAGCCTCTATCTGACACAAGGACTGCGTTTCCCGTCCGATTCC TTTGGACGGAGGACGCCAACAACTCACAACTATTATTACCACGGAAATGA TTGACTGATTGACAAGTGTCATGCCACATACACTTTGTTAAACATTGTCT TAAGGATATTGATTGGAGGAACGTAATAAAATCTCCGATCAAACGTTGGT TGTATTTGATCTTTGAAAAAATGGCGTCATATTTGTTGCATTCAGGCAAT TTTAAAATATACGGAAACGTTATGTTGATAGCAGTTAAAATACACAAAAT AAAGATTTGCTTCTTCTTCTTCATTTTTCTTTCTCCTCTTGGTCACATCA TTTTTGTCACTTTTTGATTTTTGTTTTGACTTAAAAATTTATCACCTCAA TCTAAATGTATTTCTCAAAAAAAAAGTTTAACAAAATTAAATTAAGAGTT CAATTTGTGATTTCTCCAATTCAATGAAGCAAAATCCCATGCAACTTGTT CGTTTGATTCAATACAGTTTTAATATTTCATGCTTTGTTGGCTGGTGAAT ATCTTCGATACTATTGTATTCACGGGGAGGGGGTGTCATATTTTATATGA TCGATTTAATACAAACTCTTTTTTAGGGACATGCAAAAATTGAATAAACA AAATTTTTAAAGTTGACAAAATTTGCTAAAATCAGCCCTATATGTTAAGC TATGTTTTTTTTGAAGCAAAGGAAAAATATGTTTTTTTCTTCATCATTTT TCAATTTTTTAAACTTTTAGTTTATTTTGAAAATTAATTTTAAAAATATC TTTTCAACGCAGGCTTTTCCGGTATTGGCTCTTTTATCTTTTTTCTGGCT TTTTCCATAAGGATGCCTAATGGCAATACCCATAATGTGACAGTGCCCGA TTTTCGATAAAGTTTACATATCAGCAAAGCTTAAAATGTGATGGAGCCCA ATCTTCCGACCGCAAACGCCAAAAATATGTAGAATAACAAGTTCATGTAT CTACCCCTTTGAGGACGTTCGAGCTTCTGAAACAGTTTGTAACATTCACG TTTTTTTCTATAAGCATAACGTTTATAAGCATATGCAGGCTCAGTTTTTG GTACCTAAACAATGGCTCTATTGTTTAAGAACAATATATTGAACGGTGAA AAGGATCTGAGGCCGTCTATGTATAAGGTGTTGTTTTTGTATATTTCTTA AAAATCTAGTTGCTTGTATAAGTTTGTTGTTTCATTGATGTTGATGTTGT GTTGCTTCCAAGGATAAACCAATGGGCGCGGTAAGCGTTTTTACGGCAGG GAACTACCACTGTCAACCTCGTGTGTTGTCTTTCTGATGGTGTTTTTGCA ACTGGTGTTCTTTCTTTGAAAATTCGATTTAGAATGCTAAGAATAATGCG AGCCTGATAAAGGGGTAGACATATGCTTATATAGAAAAAAACATGTAACT CACTGTTTTGACCTGCAAGTTCGAGGACGGTAAAAGTTCTGATTTGAGGT CGTCCTTGGTCCTCAGTAAGTGAGGATGAAGACATGAAAAAATCGCTCTT TCTGCTACAGGAAAAAGCACAGGGTGTACCATAGTCCGTATGAAAAACCT CGATCTGGAAGCCTTTTGTTTCTTTCCATTGTTTCTTACTTGAACTTGCG TTGAGAAATTAGTTTGTTTTTCTCACTTTTTGATCATGTGATTAAATCTT AAACCAATCCCAAGAGGAGTACTTGGTAACGTGATCAAAAACTGAGCAAA TCGATTTTCATCTTTTGATAATAACAATGGAAAAGCTAAAAATTTTTTAA AACAATAAGCTTCCAGACCAGTGTTTTTTATACGGACTATACGGATGTAC CAACTCAGTGTACTAACCCATAGGGTATTAACTTGATCTTTGGATCTTTT TCTCAAAAAATTAGACCACCAACTTTTTAATACACTGTACTAACGATTGC CGCGACCACAGCTTTGATACCACCCTTTTGGTACACTGTACTAATTTTTG CCACGACCAAAGCTTCGATACCACCCTTTTGGTACACTGTACTAACGATT GCCACGACCACAGCTTTGATACCACCCTTTGGTACACTGTACTAATTTTT GCCACGACCAAAGCTTTGATACCACCCTTTTGGTACACTGTACTAACGAT 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TAGCCTTTATCCTTCTTGTCAAAACAAGTCAGTCTAGTCATGATGGCGGA CTCAAACAAATCAATGGATTGACAGCTGTGTTTATATGTGTATGGGCGTT AACCATGCATCTAGTTTTCATTTTATTGAATACGACAGTTTCATTCTTAC TGAGGCTACCAACGGACCAGAAAAAGACGATAATTATATTGGCTAGCCAG AAGACATTATCGCAAGCCGTGGCAGCCACCGTATTTCTTCCTGACGGTGT CGGTGAGGAATTGTTTTTTTATAACGATTCAATTTCACGAATCAGTCAAA AAGAACCAGTTGAGAATGGGCTCTTCCAGAAAATGTTCTTACATGGGGGT GGGGGCTGGAAGATATAGTGTCCGGGGGGTAGTGAAAAATCTACAAAATT TGCCTTCTCCGGGGGTAAAATTGTTCTGTTTGAGGGTTATTTTGAATGTC CAGGGGATCAAGTGATGCTTATCCGGGGGGCTAGACCTGCTGTCCAGTTG GTCAAAACTCACAATTTCCGGGGGGTTAATTTCCAAAAATCCCCCCATAT TCAAATTTTTTCTGGAAAAGTCCAATGGCCCTGAAACGCTTTGTCACGAA TGGTTACAGGGTATATTAAACCGAAAATCTGAGCTTAAAACTTTCGCGAG TTTTACCTTAAGGGAACTTATTTTGGCGGGTAGCAAATATCCTAAATTTT TTTAATTTTGGCGGTAACTTATTTTGGCGAATAGTGAATTTTTTTTATTT TGGCGGGAACTAATTTTGGCGAACGACAACGTAAATCTGTTCTATTTTGC CTTATTTTGAGCAATTTTGATAAATTTCAGGGGTTATTTAGGCAAGAAAA CAAAAAACTCTTGAAAATTAATCCGAGTAAAGTAATTTTACTTTTTGTCA ACCCGGGCCATTCATTTAATCAATTTTTTTCTCTTTATTTTTTTTCCACA 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Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000092_pilon:794122..808539-

>XLOC_034790 ID=XLOC_034790|Name=XLOC_034790|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=2424bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000092_pilon:794122..808539- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
CAAAACAAACAACTAGTTGTCAAGGAAACCAATGAACAATCACGTTGCCA
ATCGTGCTGGGATTGGTTTTCCAGATTCTTTATCAAAAACTTTTTACCAA
TATCTCTCATCTTTGCGGTTGCATTTGGTGCCCTGATTCCCGCACCAGGA
GTGTTTTTCAACCATAAAGAAACAATCTATGTTTGCGTATCAATACTGTT
CTGTTACGTTGGTTTATACTTGAAAACGAGTGATATCCAAACCTCCCTGA
AAGCTTACAAGGCGTATACATGGGGTATTATCAGTGTTTTATGTGTGACG
TGTGTTATTGGAGGTTTGCTGACAGATCAATTGAACTTTAGAGAACTTGA
TATCGAATCTCATAACAGTAGGAACACCACCAACCTGAGCAATCTTACCA
AGACAACTGAAATACCCAGCAGTGAAGATAAAGGAGTCGTTCTTGGCCCT
TTTGAATGCCGTGTTGGTCTTGTATTATATTTCATTATGCCGTGTACTGT
TGGGTCTGGAGTCATTATGCAAAACAAACAACTAGTTGTCAAGGAAACCA
ATGAACAATCACGTTGCCAATCGTGCTGGGATTGGTTTTCCAGATTCTTT
ATCAAAAACTTTTTACCAATATCTCTCATCTTTGCGGTTGCATTTGGTGC
CCTGATTCCCGCACCAGGAGTGTTTTTCAACCATAAAGAAACAATCTATG
TTTGCGTATCAATACTGTTCTGTTACGTTGGTTTATACTTGAAAACGAGT
GATATCCAAACCTCCCTGAAAGCTTACAAGGCGTATACATGGGGTATTAT
CAGTGTTTTATGTGTGACGTGTGTTATTGGAGGTTTGCTGACAGATCAAT
TGAACTTTAGAGAACTTGATATCGAATCTCATAACAGTAGGAACACCACC
AACCTGAGCAATCTTACCAAGACAACTGAAATACCCAGCAGTGAAGATAA
AGGAGTCGTTCTTGGCCCTTTTGAATGCCGTGTTGGTCTTGTATTATATT
TCATTATGCCGTGTACTGTTGGGTCTGGAGTCATTATGTTAATGAATTTG
AAAGGTGATATTGCAGTGGCCATTATGATCACCGTGGTTACAAATATTGT
TGGTATTTTCACTATCCCATTATATTTGGAATGGCTGATTTATTCGGATG
TTGATGTCCAATTTAATGTTGGAAAGATGATGCTTAAGTTGTTCTTAACA
TTGTTCATACCTTTGGCGTTAATGAATTTGAAAGGTGATATTGCAGTGGC
CATTATGATCACCGTGGTTACAAATATTGTTGGTATTTTCACTATCCCAT
TATATTTGGAATGGCTGATTTATTCGGATGTTGATGTCCAATTTAATGTT
GGAAAGATGATGCTTAAGTTGTTCTTAACATTGTTCATACCTTTGGCGAT
CGGCAAATGTCTGCGCTTCATTACGAAGATTCGAACATTCATCAGTGTGC
CTAGCACGAAGAATAAGTTAAAGATGATCGCTTTTTCCGCACTAGCCTTT
ATCCTTCTTGTCAAAACAAGTCAGTCTAGTCATGATGGCGGACTCAAACA
AATCAATGGATTGACAGCTGTGTTTATATGTGTATGGGCGTTAACCATGC
ATCTAGTTTTCATTTTATTGAATACGACAGTTTCATTCTTACTGAGGCTA
CCAACGGACCAGAAAAAGACGATAATTATATTGGCTAGCCAGAAGACATT
ATCGCAAGCCGTGGCAGCCACCGTATTTCTTCCTGACGGTGTCGATCGGC
AAATGTCTGCGCTTCATTACGAAGATTCGAACATTCATCAGTGTGCCTAG
CACGAAGAATAAGTTAAAGATGATCGCTTTTTCCGCACTAGCCTTTATCC
TTCTTGTCAAAACAAGTCAGTCTAGTCATGATGGCGGACTCAAACAAATC
AATGGATTGACAGCTGTGTTTATATGTGTATGGGCGTTAACCATGCATCT
AGTTTTCATTTTATTGAATACGACAGTTTCATTCTTACTGAGGCTACCAA
CGGACCAGAAAAAGACGATAATTATATTGGCTAGCCAGAAGACATTATCG
CAAGCCGTGGCAGCCACCGTATTTCTTCCTGACGGTGTCGGCGATCAAGG
TTTGATAGCAGTCACCATGGTGTTTTGTCATATCACCATTTTAGTTTTCG
ACTCCCTTCTCATCCCAATGTGGGTACACCTTGAGAAGCGTTACAAAAAG
AAGAAGGAAGGAGACATGCATGATGAAATCGAAGCGCAAAAAAAGTCCGC
TTATTTGGCGATCAAGGTTTGATAGCAGTCACCATGGTGTTTTGTCATAT
CACCATTTTAGTTTTCGACTCCCTTCTCATCCCAATGTGGGTACACCTTG
AGAAGCGTTACAAAAAGAAGAAGGAAGGAGACATGCATGATGAAATCGAA
GCGCAAAAAAAGTCCGCTTATTTG
Gene-mRNA-Prot
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
XLOC_034790XLOC_034790-proteinClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonpolypeptide
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
sc0000092_pilongenomesc0000092_pilon:794122..808539 -
Properties
Property NameValue
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