XLOC_034715 (mRNA) -

Overview
NameXLOC_034715
Unique NameXLOC_034715
TypemRNA
OrganismClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon (Jellyfish)

Sequence
The following sequences are available for this feature:

mRNA from alignment at sc0000305_pilon:382771..392792-

Legend: polypeptideCDS
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>XLOC_034715 ID=XLOC_034715|Name=XLOC_034715|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=10022bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000305_pilon:382771..392792- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ATGGCTTTGTCAAGACCAGTTTACATTGTAGCTGCTAAGAGGACAGCATT TGGTGCTTTTGGTGGAAAAGTCAAAGACCTTTCAGCAACAGTACTTGCAG AAAAAGCTACCAGTGCTGCTTTGAAGGACATCAATTTGGACCCAGCTCAT GTCCAGTCTGTCATCTTTGGTAATGTAATCCAGGTATAATTGACTATTTT AGTCGAAATTTTCGATTTTAATTCATTTTGTGTGAATCGCCAATTAATAA TTGATTGTTAATGGAATTATATTGATCAGCAGTTAGCATGGAAGATTGAC CAAAATTTTGGTGAACTGAGAGGCGATTTCACAAAGTTAAGAAAGGAAGG AAGGTGTTTATCCTCACATGACTAAAGGTTCAATCTCAAAATAAGTGTCT TGGAAAATTGGAAATCTTGCAATCCTGTTCTGCCTTTGAGATTGGCCATC GACTATATTCCTCTACATGAAAAAAGGGCAATCTCTATCTCAAAGATGAC CACCACAGTAAAACTCTAAATTTCATAAGGTATTAATTTTGAGATTAAAC CTTAAGTCATGTGAGGGATGGTGTGTACTCATACAATGTAATATGTTAAT ATAATTATATTTATTCATCAGCAATGGATTTCATCCTAGGTAAGGATATC TTTTAATTTGCTGCCAGGGATGCAAAGGAGTGGGGGAAATTTGTCTGCTA AGGAGAACAGTGAGAATAAACTTATTCAAGTGAGCTAGAATACAAACTGA AAGGTTTTATGAACTTATCAAAGTTTAGTGAGCTAGAAATCCCACCTTTT TCTGTTATTGTTTTAAGCTGAGCTATGTTCTCTGATGACAGGCTTCTTCC AAAGCAGAAGCATGCAATCAAGAATTAAAATTCTTAACTTTGTCTGCTTC TAATCATAAGCTAGGCAATGTTTTCAGGCTTTTGACATTTTTCTGAGAAG 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TTGATTTTGGTACTTAAACTTAAAAGTTATGTTTTAGGTTCCGGAATACT TTTAACAAAGAAATGCCTTTTATAAATTTCTTTAATTTGAGTAATTGAGA ATTTAATTGAAAAAATGATGTTGTGAACTTTAAAAAGAAAAAGATATGTT GTATCACCCTCTATTGCAAAAAGTGCTTCGTTTTAACGGGTAATTAACCT TTTTCTTTCGAATTTTTTCAAACAAATATTAAAAATTCACTATCGCTAGA GAGCCCTTAAAATAAAACATTAGTAACATTTTTAGGGATGCTTTGGTTAT TCATCGTCTTATCCGTGATTTTCAGGCTTTAATGTTTATATCAAAATGTT TTTGTTTGTGATTATTTTATTATTATTATTATTATTATTATTATACTCCT TACTTATGGCTTAAAAGAGGCTCAAATTCAATATTCTCTTAATCATTTTT GAAATCAAAGACTTGAATTGTTCTTTATTGGTTCTTAGGTATTGGGCTTT TCCAGAAAAAAACGGTAAACCCCCTGTTGAGGAGGTCCATCATTTTGTGG CTGGAAATGCTGCAACCCCCTGGAATTCCAGGCAATTTCAGGCTTAAACC CCTCTGGAATTCTGAATTTTAGTAGGATTTAAAAAGCTACCCCTAAGGAA TTCCAGTTATTTTTGACAGATTTTTGTATCTCCCTATAGAATTCCGTCAC ATATCAAACCTTATCCCCTTGGACCTCCTCAACAGGGGTATACGGTTTTT TTCTGGAAAAGCCCATTTGAGCGTCTTGTTGTTATATTAATTGTTCCTTT ATAAAGTGCAGTGCAAGCCCTTTTTAAGGGATTTCAAATTGTGATATCTC AAGACTCGACTTTGGAAAAGACCACTAAACAAAAAGATTTGGAGATTACG CTCAGGATGATTAAAGGAATGAGGCAAAAGATCTGAAACCTTCTGATTGA CATTATTCTCATAAACTATAATACCACTAATATCACTGTTTTAGAACTTT GAATACTTGCCTAGTAATATTCTTGTAATAAGGTTTGAGAGAAATATCAC ATGTTTGCAAATACCGAAGCACAATTTCCCATTTTTGGATCTACCTCGGA GGTCCTTTTTAGATTAACCCATGTCTGTTCCTCTGTTCGTTCGTCTGTTA CTAGCTTTTTTTCTCGAGATCGGCTCATTAGTTTTTTTTCTAATTTTTTG CACAACGATGTAAAGTGAGAATGCCCAAATTGTGTCGTAGCCTAATATTT TTGAAAAATAATATTTTTTGGGGCAAATCTGGTACAAAACCCACCCAAAA TGTGCAAATTGGTTTATTAGATTTTTAATTTTTTTACTCATCATGCTGCT ATTTTGCTTTTGTACTGGACATTATTATCTTTCTTTTCTAATTCTATATC TATCTGATTCCATCACCTGTTAGGTCCATTCAGCATGTTGGCCTGTTATG ATTGAATCAAACTTATATACCGTGTGTTATGAAAATGAAAAGAATATGTA AAAAGATGGGCAAAATCGAAATCGTTTTTACTTTATGATGATAGACAGTT CATGACAAAGTAAACTCTTCAAAGGTCACTCAAGGGGTTTTCTGACAAAC TTTATGGGTTGTCGCTAGGTTGCGGGTACTTGATAAAGTGGTTACCAAAT TCCCTGAAACTCAATTTCTAATCTGAGAAACGGCCAGTGGCAAAAGTGCT TGGAATTCTGGCTGATTGTTATGATTGGTTAAGAAATTTCTTTATTTAGA TGGAAGATACACTTTGGGCTGGTTTGACTGATTCCTACATCAAAACTCCC ATGGGTATCACAGCTGAAAACTTAGCCGCCAAATACGGAATCACTAGACT GGATGCTGACGAATTCGCTTTAGCTTCACAGGACAGATGGGCTAAAGGTA TTTTATTGGTGCTTTTCTTCACTAGGAGGCTCTTGTAATGCCTATTTTAG TTTAGTCACGAGAGAGACTTGGTTTTTAGCAATGTTAAGATTTTGAAAAC TAACTTACAATTGTTACACGGTGTTTATTGCTGGCGCGATCTTCAGTCAA TGCAGGTGTATTGTAGATTCGGCTCTTCCAGAAAATGTCCGTACATGGGG GTGGAGGATATATTGTCCGGGTGGTAGAGCAAAATATCAAAATTTGCCTT GCTGTCCGGGAGGTAAACTTGCTCTGTCCGGGGGTAATTTGGGTTGTCCC GGGGGTCTACTGATGCCTGTCCGGTGGGTAAAACCCGTTGTACGGGGGGT AAATAACTGAAAATTGTTATATACTCCACCCCCCCCCCCCATATTCAATT TTTTTCTGGAAAAGCCCATTTTATTTCAATGAAATGTTATTTCAAATGTT TTTGGACTTATCCTGGGAAAAATACTCTGCCTCCTTTCCCGTTTGCAAAT TTTCTCTTTTTGCAACTCCCGAATCACCTTATTTATTGTTAGGAAATCTT TTTAGCTGTCAAAAATAAAGTCCATTTTGCACGATATCCCCAGCTTTCTA TATTAACCTCATTTCGGGATATTCGGGTATTTTCCGATCCTCGCCCCCTT TTATTAGGCATCGGAATCCATTCGACGTTTTCGTACCCACTTTGAGACCC TCTTGACTTTCCACAAAATTTTATTGATCTCTCTTGGATTTCAGATTTTT TTATGCCGGAACATCTCCCATTAATTTAAGAAGTATTTTTCTGACTTTTC TTCCTGAATACAGCACACAAAGAAGGAGCATTTGCTGACGAGATTGCACC ATTAGAAATTCAAGTGAAACGAAAGACAGTCACTTTCGATACTGATGAAC ACCCAAGGCCGGGCGTCACTATCGAGGCGTTACAAAAATTACCGCCCGTC TTCAAGAAGAATGGTACAGTGTCGGCTGGAAATGCTTCGGTGAGCTTTTT GTTTTGTTTGTCGCTTTTTTAAATTATCTGTACATTAATGATTCAATTTC ACCAATCGTTTGGTAAAGTCGCCATGGTAATTGTTGGTAAAGTGGCAAGT GGTCGTCCGCCCGTCTGTCTGTTTGTTATCAGCTATTTCGGGATTTGATC ATATCTTTTTTGCACAAAGGAGTTCAATCACAATGCTCGAAATGTGACGC AGCCTAATTTCCAAAAAAAAATTCCGGCCGACAAAGCCATAAATGTGCCG ACAACCGTTTTTTGGACCTACCTCCGGGTGCCCCGGTGGAGGTCCTATAA ATTAACCCATGTCCGTTCGTTCGTCCGTCCGTCCGTCCGTCCGTCCGTCT GTTACCAGCTTTTCTCAGGATTGGCTCATTAGTTTTTTTTTATTTTTGGC GCAATGATGCAAAATGGTAATGCCCAAAATGTGACGGAGCCCGATTTTCG AAAAAATTTATTTCCGGCTGAAATATACCGGAAAAACCGGTTTTTTGGCA TTTTCTCAAGATTTCATCATTAGTTTTTTCTGATTTTCTGCAAAAAGATG CGTATTAGCAATGCGAAAAAATCTTTTCCGGTCGAAAATGCCGGAAATAT GCCGGAAATCGCCATTTTTGCAGATTTTCATCGGACTTTTTCCTTATATT TCGTTGTTTTTTCACACAAAAACATTATTAATAGCAATGCCCACCATGAA GCATGGTTTAATCGTCAATAGAACTGAGTTTTGAAGCCGGAACTTTCTAA AAATCGCCGGAGCAGCCCATTTTCGCCGGAAAAACGGTATTTCTTGATTT TCTCGAGCTGTACTTTATATTTTTTTATGAAATTTTGCGCACTGATGCAA AATGATAATACCTAAAATGTGACGGAGCCCGATTTTCGGAAAAACATTTT TTTCCGGCCGAAAAAGCCGGAAATATGCCGGAAATACTGTTTTTTTGGCA TTTTCTCGAGATTTTATCATTCGTTTTTTCTGATTTTTTGCACAAAGATG CGTATTAACAATCCCCAAAACATGACCGAGTCCGATTTTTGAGAAAAAAA TCTTTCCGGCAGAAAATGCCTGAAATATGCCGGAAATCGCCGTTTTCTGG GTTTCCATTGGGCTTTTTTCTTTTAAATGGTTGTTTTTTCATTCAAACAC ATTATTAATAGCAATGCCCACCATCAGGCATGTTTCAATTTTCAATAAAA TTGAATTTTGAAGCCGGAACTATTTAAAAATCTCCGGAACAACCTATTTT CGCTGGAAAGACAGTATTTCTTGAATATCTCGAGCTGTACTATATATTAT TTTATGAAATTTTTCACACTGATGCAAAATGACAATACCTAAAATGTGAT GGAGCTCGATTTTCGAAAAACATTTTTTTCCGGCCGAAAATGCCGGAAAT ATGTCGGAAAAACCGGTTTTTTGACATTTCCTCGAATTTTCATCTTTTGT TTTTTCTGATTTTTTTGCAGAGAGATGCGTATTCGCAATGCTCAAAACAT GACCGAGTTCGATTTTTGAGAAAAAATTCTTCTGGTGGAAAATGCCGGAA ATCGCCGTTTTTGCAGATTTTCATTGGATTTTTTCCTTATATTTCCAATT TTTTTCACACAAAAACATTATTCATAACAATGCTCACCATCAAGCATGAT TCGATTGTCAATAAAACTGATTTTTGCGACCAGAACTTTCTATTTAGTTT TTCCTTACAACCCTTTCCTCTCCCTCCATCAACAATCAATGATGAATTTT TTGCGTTATGCATTTTCGCTATATTTTCTGACTGATTTTTCTCCTCGCAT TGCTATCTAACTTTCATCATCAGGTAGGTCCATTCAGCATCTAGCTTGTT GTTGTCTTTTTCTCAAGATTTAATCATTAGTTTTATGATTTTTTGAGATG CGTATTGAATATATGTTTTGAAAATCTTTTTCACATTGATGTTGTTCTGA GATCGAACAATCACTCGTGTGAAAATGGTAGTTAGAGCACAGTTACTGAA GAAGTCGATTATTTTTCTTCATTTCATGGTTCTATTTTTCGATTTTGTTT TATTTTTTCTATTCGATAATTGTCCACTCCTTATATATTATCTTTTCAAC GAGCGCGAAACTTCCATTTCATTTAAATTCTAGCAAAAATTACCTTTTTC TCTGCATATTATATTGAGACAGACTTTGCGTACTTCTAAATTTTATTTCA AATCTTAGTTATTTCTAAAAAAACATCTTCATACGGCCAGTTTTGCAAAA ATTATTCCATTGCTATACACCTTTTCTACCGTAAACCACCACTTGCCGCG CGGGCATTTTTTTTGTCCGTTTTACCCACCTATAACCGTCCCAGTCTTTT TATCGCACCTTACTGTAAGACAATAGAAAAAAGTGTAAAAAAGAATTGTC ACGAGTTTAAGATGGTAAATTAAATAATAAAATGACACGCGCCTGACCAC GCGACTACGGTCGAAAAGGTGTATTAAAAATCAATCCAATTTATAAATTT CAAATTCTCTCCCTCTTTTCAAAACAGGGCATTTGTGATGGTGCAGCAGC ATTGGTCTTAGCATCGGAAGAAGCATGTAAAACGCATAACTTGAAACCGT TAGCGCGTGTTGTTTCTTATGGAATCGCTGGTGTTGACCCGAGCATTATG GGTATCGGACCTTCGCCTGCAATCAAGATTGCTTTGGAACGCGCCAAATT GTCGTTGAACGATATGGCCTTGGTGGAGGTATGTATATTTTAATCTCTTA ATTGAATCTTACATGAACCATACAGTGGAGCAGTTAGTGTTTATCAATCT TGACTTCCGTCTAGGAGGTCGGTGTTTGGCACACAGATTTCTGTAAAGTC CGAAGGGCTAGATGTCGTGCTTTAAGCTCTTCCAAGCAAAAAAAAATTGA ATATCGCAAAAAATATTGCTGCGAATGTTTTCAAAAACCTGCGAAGCTTC TTGCTGGTCAAGCGCTGAAATTCTATTGTAATATCACGTGACCTATGTAG GATTTCCTACCTAACCTCGGCACACTTATCAGCCAAAGCACGACATCTCT AGCCCTTTGGGCTTTATAAAATTATGGAATCGCTGATGTTGACCCGAGCA TTATGGGTATCGGACCTTCACCTGCAATCAAGATTGCTTTGGAACGCGCC AAATTGTCGTTGAACGATATGGCCTTGGTGGAGGTATGCATATTTTAATC TCTTAATCAAATCTAACATAAACCATATAGTAGCACAATAATGTAGTACT TCCGTCTAGGAGATCGGGGTTTGATTCGACATTCGTTGCTCTTATTCACT TGAAAGTGAATGTACCTTCGCCCGGGCCAATCCATAGCATTTTGTCTATC GGTGACTGCTCTAGGTATCAATTCCACAATACACTGTGGATGAAGTGAGA CTGTGCCGGTCTTGGCACCGTATTAACGCACTTGATCAAAAATCGTGTGT CAGTATCTCGCAAGCTGGCAAGCTTAAAGACGTCTCTAACGAGACGACTC CTAGACCGATCAATACAGAACCGTATATCCTTTGTAAGGAGAAGCCAGTC ATAATCGTAGAGACATTGCGTTTTTTCGTATCAGAAAAGAGTTTGATTTT CGTATTACATACTCGTATATTTATATTTTGAATTATGCTTTGTAAGTCTA TGCGAGTCGGAAGACGGTGCTTAATAGACGATATTTATACTTGGAAATAT CTTCAGAAATAATAAGTAATGGAAGGGATCATTCGAGTAGTATTTCAGTG GGAATCGAACTCGGACCTATTTTACACCTATTTTACTTTATTTAACATGG ATTAAAAACGACTCCAGTCTGTAGGAAAGAAATACTGTACATTAAAATCA TAAATTTTCTTATTTATATCGGTTAGGTCTCGCTTAGACGGCCCACTTTT AGTCCTGCATATTCGAATTGTGAGTTAAAGTTAGCAGAAAGTTGGCTGTC TAAAATCAATACATTACCCTCTTTTGACGTCAATGCAATAACTTCTTTCA ATCTTTTTCAAGCAAATATTTTCTTACTTTAGGTCAACGAAGCCTTCGCT CCACAATTCATCGCCGTTGAGAAAGATCTCGGCCTCGATCGATCCATCAC CAACGCCTGTGGCGGCGCCATTGCTCTCGGTCACCCACTTGGTGCGTCTG GCGCCCGCATCATGACCCATTTAACGCACGCCATCCGTCGAAAGAACGAG CAGTATGCCATGGGCTCCGCCTGTATCGGTGGCGGCCAAGGTATTGCAGT TCTATTGGAAAACATGAAATAA

Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000305_pilon:382771..392792-

>XLOC_034715 ID=XLOC_034715|Name=XLOC_034715|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=2388bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000305_pilon:382771..392792- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ATGGCTTTGTCAAGACCAGTTTACATTGTAGCTGCTAAGAGGACAGCATT
TGGTGCTTTTGGTGGAAAAGTCAAAGACCTTTCAGCAACAGTACTTGCAG
AAAAAGCTACCAGTGCTGCTTTGAAGGACATCAATTTGGACCCAGCTCAT
GTCCAGTCTGTCATCTTTGGTAATGTAATCCAGATGGCTTTGTCAAGACC
AGTTTACATTGTAGCTGCTAAGAGGACAGCATTTGGTGCTTTTGGTGGAA
AAGTCAAAGACCTTTCAGCAACAGTACTTGCAGAAAAAGCTACCAGTGCT
GCTTTGAAGGACATCAATTTGGACCCAGCTCATGTCCAGTCTGTCATCTT
TGGTAATGTAATCCAGAGTTCATCAGACGCAGCATACTTAGCACGACATG
CAGCTCTTGGTGCTGGTGTACCGCAAGAAGCTACTTCGCTCACCACAAAC
CGCCTGTGTGGGTCTGGTTTCCAAGCGGTCGTTAGTGCTGCTCAGAGTTC
ATCAGACGCAGCATACTTAGCACGACATGCAGCTCTTGGTGCTGGTGTAC
CGCAAGAAGCTACTTCGCTCACCACAAACCGCCTGTGTGGGTCTGGTTTC
CAAGCGGTCGTTAGTGCTGCTCAGGAAATAGTTCTTGGAGATGCAGATAT
CGTAGTAGCTGGAGGCTCAGAAAACATGAGTCAAGCGCCCTACGCCATCC
GAAACGCCCGATTTGGTATCACTTTGGGTGAAGGTCGAGAGGAAATAGTT
CTTGGAGATGCAGATATCGTAGTAGCTGGAGGCTCAGAAAACATGAGTCA
AGCGCCCTACGCCATCCGAAACGCCCGATTTGGTATCACTTTGGGTGAAG
GTCGAGAGATGGAAGATACACTTTGGGCTGGTTTGACTGATTCCTACATC
AAAACTCCCATGGGTATCACAGCTGAAAACTTAGCCGCCAAATACGGAAT
CACTAGACTGGATGCTGACGAATTCGCTTTAGCTTCACAGGACAGATGGG
CTAAAGATGGAAGATACACTTTGGGCTGGTTTGACTGATTCCTACATCAA
AACTCCCATGGGTATCACAGCTGAAAACTTAGCCGCCAAATACGGAATCA
CTAGACTGGATGCTGACGAATTCGCTTTAGCTTCACAGGACAGATGGGCT
AAAGCACACAAAGAAGGAGCATTTGCTGACGAGATTGCACCATTAGAAAT
TCAAGTGAAACGAAAGACAGTCACTTTCGATACTGATGAACACCCAAGGC
CGGGCGTCACTATCGAGGCGTTACAAAAATTACCGCCCGTCTTCAAGAAG
AATGGTACAGTGTCGGCTGGAAATGCTTCGCACACAAAGAAGGAGCATTT
GCTGACGAGATTGCACCATTAGAAATTCAAGTGAAACGAAAGACAGTCAC
TTTCGATACTGATGAACACCCAAGGCCGGGCGTCACTATCGAGGCGTTAC
AAAAATTACCGCCCGTCTTCAAGAAGAATGGTACAGTGTCGGCTGGAAAT
GCTTCGGGCATTTGTGATGGTGCAGCAGCATTGGTCTTAGCATCGGAAGA
AGCATGTAAAACGCATAACTTGAAACCGTTAGCGCGTGTTGTTTCTTATG
GAATCGCTGGTGTTGACCCGAGCATTATGGGTATCGGACCTTCGCCTGCA
ATCAAGATTGCTTTGGAACGCGCCAAATTGTCGTTGAACGATATGGCCTT
GGTGGAGGGCATTTGTGATGGTGCAGCAGCATTGGTCTTAGCATCGGAAG
AAGCATGTAAAACGCATAACTTGAAACCGTTAGCGCGTGTTGTTTCTTAT
GGAATCGCTGGTGTTGACCCGAGCATTATGGGTATCGGACCTTCGCCTGC
AATCAAGATTGCTTTGGAACGCGCCAAATTGTCGTTGAACGATATGGCCT
TGGTGGAGGTCAACGAAGCCTTCGCTCCACAATTCATCGCCGTTGAGAAA
GATCTCGGCCTCGATCGATCCATCACCAACGCCTGTGGCGGCGCCATTGC
TCTCGGTCACCCACTTGGTGCGTCTGGCGCCCGCATCATGACCCATTTAA
CGCACGCCATCCGTCGAAAGAACGAGCAGTATGCCATGGGCTCCGCCTGT
ATCGGTGGCGGCCAAGGTATTGCAGTTCTATTGGAAAACATGAAATAAGT
CAACGAAGCCTTCGCTCCACAATTCATCGCCGTTGAGAAAGATCTCGGCC
TCGATCGATCCATCACCAACGCCTGTGGCGGCGCCATTGCTCTCGGTCAC
CCACTTGGTGCGTCTGGCGCCCGCATCATGACCCATTTAACGCACGCCAT
CCGTCGAAAGAACGAGCAGTATGCCATGGGCTCCGCCTGTATCGGTGGCG
GCCAAGGTATTGCAGTTCTATTGGAAAACATGAAATAA
Gene-mRNA-Prot
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
XLOC_034715XLOC_034715-proteinClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonpolypeptide
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
sc0000305_pilongenomesc0000305_pilon:382771..392792 -
Properties
Property NameValue
Aaloc955-1194:241
Aaloc754-954:1746
Aaloc580-753:4458
Aaloc430-576:5424
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Aaloc1-183:10023