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Sequence
The following sequences are available for this feature:
mRNA from alignment at sc0000305_pilon:382771..392792- Legend: polypeptideCDS Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >XLOC_034715 ID=XLOC_034715|Name=XLOC_034715|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=10022bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000305_pilon:382771..392792- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon) ATGGCTTTGTCAAGACCAGTTTACATTGTAGCTGCTAAGAGGACAGCATT
TGGTGCTTTTGGTGGAAAAGTCAAAGACCTTTCAGCAACAGTACTTGCAG
AAAAAGCTACCAGTGCTGCTTTGAAGGACATCAATTTGGACCCAGCTCAT
GTCCAGTCTGTCATCTTTGGTAATGTAATCCAGGTATAATTGACTATTTT
AGTCGAAATTTTCGATTTTAATTCATTTTGTGTGAATCGCCAATTAATAA
TTGATTGTTAATGGAATTATATTGATCAGCAGTTAGCATGGAAGATTGAC
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AAGGTGTTTATCCTCACATGACTAAAGGTTCAATCTCAAAATAAGTGTCT
TGGAAAATTGGAAATCTTGCAATCCTGTTCTGCCTTTGAGATTGGCCATC
GACTATATTCCTCTACATGAAAAAAGGGCAATCTCTATCTCAAAGATGAC
CACCACAGTAAAACTCTAAATTTCATAAGGTATTAATTTTGAGATTAAAC
CTTAAGTCATGTGAGGGATGGTGTGTACTCATACAATGTAATATGTTAAT
ATAATTATATTTATTCATCAGCAATGGATTTCATCCTAGGTAAGGATATC
TTTTAATTTGCTGCCAGGGATGCAAAGGAGTGGGGGAAATTTGTCTGCTA
AGGAGAACAGTGAGAATAAACTTATTCAAGTGAGCTAGAATACAAACTGA
AAGGTTTTATGAACTTATCAAAGTTTAGTGAGCTAGAAATCCCACCTTTT
TCTGTTATTGTTTTAAGCTGAGCTATGTTCTCTGATGACAGGCTTCTTCC
AAAGCAGAAGCATGCAATCAAGAATTAAAATTCTTAACTTTGTCTGCTTC
TAATCATAAGCTAGGCAATGTTTTCAGGCTTTTGACATTTTTCTGAGAAG
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CACCAGTCGAAGCAAATGGTCTAATCTAAAAAGTCTGTTACAATAGAAAA
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CGACAGGTAAAATAATAGTTGCGATTCATGATATGCACCATTGCAATGTC
TTCCGTTCCACCCAGTAGCTCATTGGTTGAAAGTGACGTAAAATCAGTCA
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TGGTGTACCGCAAGAAGCTACTTCGCTCACCACAAACCGCCTGTGTGGGT
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GTTTTCCGAACTCCTTGTTCTGGCATGATTTGGTGATCTAACTTCTTTCC
GGACATTGTTCGACCCAAATAGCTTCATGTCCGACCCATTTTCATACTAA
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AGCCTTGAATAAGGAACCTGTTTTGTGATAACTAATCCCCAGAGACCTTT
TCATGGCTGCCCAAATTAGTTGTGGTTTGTAGTAAGGACTAAGACAATCT
CTTTTCACTTTTTTAGTCACGAAAATATGTAAAGATTCAGTATATAATAT
AATGAGTGCATACTAGTAGTAGTTTACACCCCTTTCTCACAGACCCGGTT
GAACCCCCTTTCCGACTGGAAAATATGATGGCCAAAACATCATCTCCCAG
CAGAAAATTATACTCCAATTTCGTCGAAATCCGTTGAACGAATCCTCGCT
GCAAAATATTGTCCTATTTTTTCCATTCTTTCATTCATCTAAGGAACCTG
CTCCTTGAAAACTTTGATTTCTCATTTTACTTAACTTTTTCTTTTTTTTA
TAAGAAAGCTTTGTATATTAATTGAATCGGTTGCCTTTAAGCTTGAATGT
TCTTCAAGATGACTTTGATATCTTGGCTCATTTGCTTAAAGGCTGAAATC
AAATCAATTAACTCAATAACTAATCTTAATTGTGCTCAATTGTAGGGGAG
GGGTGGAATAAGCAGAGGATAGGTACTCTGGAAAGAAAGTCATAAAGTGG
GGGGGTCATAATTATATGCTATAGGGTGATTTTGATAAATTTCGTTAAAG
TGGCGGGTGTCTAATAAAATGGGGGGTTACTTTATCATTCCGACTTACGT
TCCTTTATACTTAATAGTCATAAGTATGACATAGAAATTGCTAAATGTTT
TATTTACTGGACAATACAGACATTCAAGACACACAGGGCATTCTTAGTCT
TAAATTTTTGAAACTTTCGCTAAGAGTGTTTTTATTAGCATACACTTATC
AAAGTCGTGTTCATTTTTTAGGAAATAGTTCTTGGAGATGCAGATATCGT
AGTAGCTGGAGGCTCAGAAAACATGAGTCAAGCGCCCTACGCCATCCGAA
ACGCCCGATTTGGTATCACTTTGGGTGAAGGTCGAGAGGTAATTATGAAT
AGTTGAGTTATACGTTCTTTTTATTAAGGACTCTGACCATAGTCGAAAAA
TTGATTTTGGTACTTAAACTTAAAAGTTATGTTTTAGGTTCCGGAATACT
TTTAACAAAGAAATGCCTTTTATAAATTTCTTTAATTTGAGTAATTGAGA
ATTTAATTGAAAAAATGATGTTGTGAACTTTAAAAAGAAAAAGATATGTT
GTATCACCCTCTATTGCAAAAAGTGCTTCGTTTTAACGGGTAATTAACCT
TTTTCTTTCGAATTTTTTCAAACAAATATTAAAAATTCACTATCGCTAGA
GAGCCCTTAAAATAAAACATTAGTAACATTTTTAGGGATGCTTTGGTTAT
TCATCGTCTTATCCGTGATTTTCAGGCTTTAATGTTTATATCAAAATGTT
TTTGTTTGTGATTATTTTATTATTATTATTATTATTATTATTATACTCCT
TACTTATGGCTTAAAAGAGGCTCAAATTCAATATTCTCTTAATCATTTTT
GAAATCAAAGACTTGAATTGTTCTTTATTGGTTCTTAGGTATTGGGCTTT
TCCAGAAAAAAACGGTAAACCCCCTGTTGAGGAGGTCCATCATTTTGTGG
CTGGAAATGCTGCAACCCCCTGGAATTCCAGGCAATTTCAGGCTTAAACC
CCTCTGGAATTCTGAATTTTAGTAGGATTTAAAAAGCTACCCCTAAGGAA
TTCCAGTTATTTTTGACAGATTTTTGTATCTCCCTATAGAATTCCGTCAC
ATATCAAACCTTATCCCCTTGGACCTCCTCAACAGGGGTATACGGTTTTT
TTCTGGAAAAGCCCATTTGAGCGTCTTGTTGTTATATTAATTGTTCCTTT
ATAAAGTGCAGTGCAAGCCCTTTTTAAGGGATTTCAAATTGTGATATCTC
AAGACTCGACTTTGGAAAAGACCACTAAACAAAAAGATTTGGAGATTACG
CTCAGGATGATTAAAGGAATGAGGCAAAAGATCTGAAACCTTCTGATTGA
CATTATTCTCATAAACTATAATACCACTAATATCACTGTTTTAGAACTTT
GAATACTTGCCTAGTAATATTCTTGTAATAAGGTTTGAGAGAAATATCAC
ATGTTTGCAAATACCGAAGCACAATTTCCCATTTTTGGATCTACCTCGGA
GGTCCTTTTTAGATTAACCCATGTCTGTTCCTCTGTTCGTTCGTCTGTTA
CTAGCTTTTTTTCTCGAGATCGGCTCATTAGTTTTTTTTCTAATTTTTTG
CACAACGATGTAAAGTGAGAATGCCCAAATTGTGTCGTAGCCTAATATTT
TTGAAAAATAATATTTTTTGGGGCAAATCTGGTACAAAACCCACCCAAAA
TGTGCAAATTGGTTTATTAGATTTTTAATTTTTTTACTCATCATGCTGCT
ATTTTGCTTTTGTACTGGACATTATTATCTTTCTTTTCTAATTCTATATC
TATCTGATTCCATCACCTGTTAGGTCCATTCAGCATGTTGGCCTGTTATG
ATTGAATCAAACTTATATACCGTGTGTTATGAAAATGAAAAGAATATGTA
AAAAGATGGGCAAAATCGAAATCGTTTTTACTTTATGATGATAGACAGTT
CATGACAAAGTAAACTCTTCAAAGGTCACTCAAGGGGTTTTCTGACAAAC
TTTATGGGTTGTCGCTAGGTTGCGGGTACTTGATAAAGTGGTTACCAAAT
TCCCTGAAACTCAATTTCTAATCTGAGAAACGGCCAGTGGCAAAAGTGCT
TGGAATTCTGGCTGATTGTTATGATTGGTTAAGAAATTTCTTTATTTAGA
TGGAAGATACACTTTGGGCTGGTTTGACTGATTCCTACATCAAAACTCCC
ATGGGTATCACAGCTGAAAACTTAGCCGCCAAATACGGAATCACTAGACT
GGATGCTGACGAATTCGCTTTAGCTTCACAGGACAGATGGGCTAAAGGTA
TTTTATTGGTGCTTTTCTTCACTAGGAGGCTCTTGTAATGCCTATTTTAG
TTTAGTCACGAGAGAGACTTGGTTTTTAGCAATGTTAAGATTTTGAAAAC
TAACTTACAATTGTTACACGGTGTTTATTGCTGGCGCGATCTTCAGTCAA
TGCAGGTGTATTGTAGATTCGGCTCTTCCAGAAAATGTCCGTACATGGGG
GTGGAGGATATATTGTCCGGGTGGTAGAGCAAAATATCAAAATTTGCCTT
GCTGTCCGGGAGGTAAACTTGCTCTGTCCGGGGGTAATTTGGGTTGTCCC
GGGGGTCTACTGATGCCTGTCCGGTGGGTAAAACCCGTTGTACGGGGGGT
AAATAACTGAAAATTGTTATATACTCCACCCCCCCCCCCCATATTCAATT
TTTTTCTGGAAAAGCCCATTTTATTTCAATGAAATGTTATTTCAAATGTT
TTTGGACTTATCCTGGGAAAAATACTCTGCCTCCTTTCCCGTTTGCAAAT
TTTCTCTTTTTGCAACTCCCGAATCACCTTATTTATTGTTAGGAAATCTT
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TATTAACCTCATTTCGGGATATTCGGGTATTTTCCGATCCTCGCCCCCTT
TTATTAGGCATCGGAATCCATTCGACGTTTTCGTACCCACTTTGAGACCC
TCTTGACTTTCCACAAAATTTTATTGATCTCTCTTGGATTTCAGATTTTT
TTATGCCGGAACATCTCCCATTAATTTAAGAAGTATTTTTCTGACTTTTC
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ATTAGAAATTCAAGTGAAACGAAAGACAGTCACTTTCGATACTGATGAAC
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ATATCTTTTTTGCACAAAGGAGTTCAATCACAATGCTCGAAATGTGACGC
AGCCTAATTTCCAAAAAAAAATTCCGGCCGACAAAGCCATAAATGTGCCG
ACAACCGTTTTTTGGACCTACCTCCGGGTGCCCCGGTGGAGGTCCTATAA
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TTTCCGGCCGAAAAAGCCGGAAATATGCCGGAAATACTGTTTTTTTGGCA
TTTTCTCGAGATTTTATCATTCGTTTTTTCTGATTTTTTGCACAAAGATG
CGTATTAACAATCCCCAAAACATGACCGAGTCCGATTTTTGAGAAAAAAA
TCTTTCCGGCAGAAAATGCCTGAAATATGCCGGAAATCGCCGTTTTCTGG
GTTTCCATTGGGCTTTTTTCTTTTAAATGGTTGTTTTTTCATTCAAACAC
ATTATTAATAGCAATGCCCACCATCAGGCATGTTTCAATTTTCAATAAAA
TTGAATTTTGAAGCCGGAACTATTTAAAAATCTCCGGAACAACCTATTTT
CGCTGGAAAGACAGTATTTCTTGAATATCTCGAGCTGTACTATATATTAT
TTTATGAAATTTTTCACACTGATGCAAAATGACAATACCTAAAATGTGAT
GGAGCTCGATTTTCGAAAAACATTTTTTTCCGGCCGAAAATGCCGGAAAT
ATGTCGGAAAAACCGGTTTTTTGACATTTCCTCGAATTTTCATCTTTTGT
TTTTTCTGATTTTTTTGCAGAGAGATGCGTATTCGCAATGCTCAAAACAT
GACCGAGTTCGATTTTTGAGAAAAAATTCTTCTGGTGGAAAATGCCGGAA
ATCGCCGTTTTTGCAGATTTTCATTGGATTTTTTCCTTATATTTCCAATT
TTTTTCACACAAAAACATTATTCATAACAATGCTCACCATCAAGCATGAT
TCGATTGTCAATAAAACTGATTTTTGCGACCAGAACTTTCTATTTAGTTT
TTCCTTACAACCCTTTCCTCTCCCTCCATCAACAATCAATGATGAATTTT
TTGCGTTATGCATTTTCGCTATATTTTCTGACTGATTTTTCTCCTCGCAT
TGCTATCTAACTTTCATCATCAGGTAGGTCCATTCAGCATCTAGCTTGTT
GTTGTCTTTTTCTCAAGATTTAATCATTAGTTTTATGATTTTTTGAGATG
CGTATTGAATATATGTTTTGAAAATCTTTTTCACATTGATGTTGTTCTGA
GATCGAACAATCACTCGTGTGAAAATGGTAGTTAGAGCACAGTTACTGAA
GAAGTCGATTATTTTTCTTCATTTCATGGTTCTATTTTTCGATTTTGTTT
TATTTTTTCTATTCGATAATTGTCCACTCCTTATATATTATCTTTTCAAC
GAGCGCGAAACTTCCATTTCATTTAAATTCTAGCAAAAATTACCTTTTTC
TCTGCATATTATATTGAGACAGACTTTGCGTACTTCTAAATTTTATTTCA
AATCTTAGTTATTTCTAAAAAAACATCTTCATACGGCCAGTTTTGCAAAA
ATTATTCCATTGCTATACACCTTTTCTACCGTAAACCACCACTTGCCGCG
CGGGCATTTTTTTTGTCCGTTTTACCCACCTATAACCGTCCCAGTCTTTT
TATCGCACCTTACTGTAAGACAATAGAAAAAAGTGTAAAAAAGAATTGTC
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GCGACTACGGTCGAAAAGGTGTATTAAAAATCAATCCAATTTATAAATTT
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ATTGGTCTTAGCATCGGAAGAAGCATGTAAAACGCATAACTTGAAACCGT
TAGCGCGTGTTGTTTCTTATGGAATCGCTGGTGTTGACCCGAGCATTATG
GGTATCGGACCTTCGCCTGCAATCAAGATTGCTTTGGAACGCGCCAAATT
GTCGTTGAACGATATGGCCTTGGTGGAGGTATGTATATTTTAATCTCTTA
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TGACTTCCGTCTAGGAGGTCGGTGTTTGGCACACAGATTTCTGTAAAGTC
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TTGCTGGTCAAGCGCTGAAATTCTATTGTAATATCACGTGACCTATGTAG
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TTATGGGTATCGGACCTTCACCTGCAATCAAGATTGCTTTGGAACGCGCC
AAATTGTCGTTGAACGATATGGCCTTGGTGGAGGTATGCATATTTTAATC
TCTTAATCAAATCTAACATAAACCATATAGTAGCACAATAATGTAGTACT
TCCGTCTAGGAGATCGGGGTTTGATTCGACATTCGTTGCTCTTATTCACT
TGAAAGTGAATGTACCTTCGCCCGGGCCAATCCATAGCATTTTGTCTATC
GGTGACTGCTCTAGGTATCAATTCCACAATACACTGTGGATGAAGTGAGA
CTGTGCCGGTCTTGGCACCGTATTAACGCACTTGATCAAAAATCGTGTGT
CAGTATCTCGCAAGCTGGCAAGCTTAAAGACGTCTCTAACGAGACGACTC
CTAGACCGATCAATACAGAACCGTATATCCTTTGTAAGGAGAAGCCAGTC
ATAATCGTAGAGACATTGCGTTTTTTCGTATCAGAAAAGAGTTTGATTTT
CGTATTACATACTCGTATATTTATATTTTGAATTATGCTTTGTAAGTCTA
TGCGAGTCGGAAGACGGTGCTTAATAGACGATATTTATACTTGGAAATAT
CTTCAGAAATAATAAGTAATGGAAGGGATCATTCGAGTAGTATTTCAGTG
GGAATCGAACTCGGACCTATTTTACACCTATTTTACTTTATTTAACATGG
ATTAAAAACGACTCCAGTCTGTAGGAAAGAAATACTGTACATTAAAATCA
TAAATTTTCTTATTTATATCGGTTAGGTCTCGCTTAGACGGCCCACTTTT
AGTCCTGCATATTCGAATTGTGAGTTAAAGTTAGCAGAAAGTTGGCTGTC
TAAAATCAATACATTACCCTCTTTTGACGTCAATGCAATAACTTCTTTCA
ATCTTTTTCAAGCAAATATTTTCTTACTTTAGGTCAACGAAGCCTTCGCT
CCACAATTCATCGCCGTTGAGAAAGATCTCGGCCTCGATCGATCCATCAC
CAACGCCTGTGGCGGCGCCATTGCTCTCGGTCACCCACTTGGTGCGTCTG
GCGCCCGCATCATGACCCATTTAACGCACGCCATCCGTCGAAAGAACGAG
CAGTATGCCATGGGCTCCGCCTGTATCGGTGGCGGCCAAGGTATTGCAGT
TCTATTGGAAAACATGAAATAA Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000305_pilon:382771..392792- >XLOC_034715 ID=XLOC_034715|Name=XLOC_034715|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=2388bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000305_pilon:382771..392792- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon) ATGGCTTTGTCAAGACCAGTTTACATTGTAGCTGCTAAGAGGACAGCATT TGGTGCTTTTGGTGGAAAAGTCAAAGACCTTTCAGCAACAGTACTTGCAG AAAAAGCTACCAGTGCTGCTTTGAAGGACATCAATTTGGACCCAGCTCAT GTCCAGTCTGTCATCTTTGGTAATGTAATCCAGATGGCTTTGTCAAGACC AGTTTACATTGTAGCTGCTAAGAGGACAGCATTTGGTGCTTTTGGTGGAA AAGTCAAAGACCTTTCAGCAACAGTACTTGCAGAAAAAGCTACCAGTGCT GCTTTGAAGGACATCAATTTGGACCCAGCTCATGTCCAGTCTGTCATCTT TGGTAATGTAATCCAGAGTTCATCAGACGCAGCATACTTAGCACGACATG CAGCTCTTGGTGCTGGTGTACCGCAAGAAGCTACTTCGCTCACCACAAAC CGCCTGTGTGGGTCTGGTTTCCAAGCGGTCGTTAGTGCTGCTCAGAGTTC ATCAGACGCAGCATACTTAGCACGACATGCAGCTCTTGGTGCTGGTGTAC CGCAAGAAGCTACTTCGCTCACCACAAACCGCCTGTGTGGGTCTGGTTTC CAAGCGGTCGTTAGTGCTGCTCAGGAAATAGTTCTTGGAGATGCAGATAT CGTAGTAGCTGGAGGCTCAGAAAACATGAGTCAAGCGCCCTACGCCATCC GAAACGCCCGATTTGGTATCACTTTGGGTGAAGGTCGAGAGGAAATAGTT CTTGGAGATGCAGATATCGTAGTAGCTGGAGGCTCAGAAAACATGAGTCA AGCGCCCTACGCCATCCGAAACGCCCGATTTGGTATCACTTTGGGTGAAG GTCGAGAGATGGAAGATACACTTTGGGCTGGTTTGACTGATTCCTACATC AAAACTCCCATGGGTATCACAGCTGAAAACTTAGCCGCCAAATACGGAAT CACTAGACTGGATGCTGACGAATTCGCTTTAGCTTCACAGGACAGATGGG CTAAAGATGGAAGATACACTTTGGGCTGGTTTGACTGATTCCTACATCAA AACTCCCATGGGTATCACAGCTGAAAACTTAGCCGCCAAATACGGAATCA CTAGACTGGATGCTGACGAATTCGCTTTAGCTTCACAGGACAGATGGGCT AAAGCACACAAAGAAGGAGCATTTGCTGACGAGATTGCACCATTAGAAAT TCAAGTGAAACGAAAGACAGTCACTTTCGATACTGATGAACACCCAAGGC CGGGCGTCACTATCGAGGCGTTACAAAAATTACCGCCCGTCTTCAAGAAG AATGGTACAGTGTCGGCTGGAAATGCTTCGCACACAAAGAAGGAGCATTT GCTGACGAGATTGCACCATTAGAAATTCAAGTGAAACGAAAGACAGTCAC TTTCGATACTGATGAACACCCAAGGCCGGGCGTCACTATCGAGGCGTTAC AAAAATTACCGCCCGTCTTCAAGAAGAATGGTACAGTGTCGGCTGGAAAT GCTTCGGGCATTTGTGATGGTGCAGCAGCATTGGTCTTAGCATCGGAAGA AGCATGTAAAACGCATAACTTGAAACCGTTAGCGCGTGTTGTTTCTTATG GAATCGCTGGTGTTGACCCGAGCATTATGGGTATCGGACCTTCGCCTGCA ATCAAGATTGCTTTGGAACGCGCCAAATTGTCGTTGAACGATATGGCCTT GGTGGAGGGCATTTGTGATGGTGCAGCAGCATTGGTCTTAGCATCGGAAG AAGCATGTAAAACGCATAACTTGAAACCGTTAGCGCGTGTTGTTTCTTAT GGAATCGCTGGTGTTGACCCGAGCATTATGGGTATCGGACCTTCGCCTGC AATCAAGATTGCTTTGGAACGCGCCAAATTGTCGTTGAACGATATGGCCT TGGTGGAGGTCAACGAAGCCTTCGCTCCACAATTCATCGCCGTTGAGAAA GATCTCGGCCTCGATCGATCCATCACCAACGCCTGTGGCGGCGCCATTGC TCTCGGTCACCCACTTGGTGCGTCTGGCGCCCGCATCATGACCCATTTAA CGCACGCCATCCGTCGAAAGAACGAGCAGTATGCCATGGGCTCCGCCTGT ATCGGTGGCGGCCAAGGTATTGCAGTTCTATTGGAAAACATGAAATAAGT CAACGAAGCCTTCGCTCCACAATTCATCGCCGTTGAGAAAGATCTCGGCC TCGATCGATCCATCACCAACGCCTGTGGCGGCGCCATTGCTCTCGGTCAC CCACTTGGTGCGTCTGGCGCCCGCATCATGACCCATTTAACGCACGCCAT CCGTCGAAAGAACGAGCAGTATGCCATGGGCTCCGCCTGTATCGGTGGCG GCCAAGGTATTGCAGTTCTATTGGAAAACATGAAATAA
Gene-mRNA-Prot
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Position
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
| sc0000305_pilon | genome | sc0000305_pilon:382771..392792 - |
Properties
| Property Name | Value |
| Aaloc | 955-1194:241 |
| Aaloc | 754-954:1746 |
| Aaloc | 580-753:4458 |
| Aaloc | 430-576:5424 |
| Aaloc | 313-429:7352 |
| Aaloc | 184-312:8570 |
| Aaloc | 1-183:10023 |
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