XLOC_034705 (mRNA) -

Overview
NameXLOC_034705
Unique NameXLOC_034705
TypemRNA
OrganismClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon (Jellyfish)

Sequence
The following sequences are available for this feature:

mRNA from alignment at sc0000004_pilon:3061707..3062840+

Legend: CDSpolypeptide
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>XLOC_034705 ID=XLOC_034705|Name=XLOC_034705|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=1134bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000004_pilon:3061707..3062840+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
atgaattgtactctgtgtaaaaattggaaaatatcgGCGCAAGTTTTACG TTCATACACAACTCAAATGAAATCATTGCAAATCAATAAGTATGCGCCAT CAGTTGATTTACTGAATTATCAGTTAAGTTCACCTTCTATTACTAATCAC TTTTTGAAACCTGATGAAGCACTTGTTAAAGTACATGCAGCATCAATCAA TCCTTTTGATATTGAAATGAGTCGTGGATATGGACGTAAAGCAATCAACC TTGTCAGAAGTTATGCAAACAGTAAAGAATTCCCACTAATTCTGGGTAGA GATTTTTCAGGTGTTGTTGTTAAAAGTGGTCGACTTTTTAAAAGATTCAA GAGAGGTGACCCTGTTTATGGTGTAAGATGGGTAACAGGACAAGGTACAC ATGCTGAATATGTTATCGTAAACAAATCTGAGATAAGTCCTAAACCTGTA AACCTAACTCACATTGAGGCTGCTTCATTACCTTATGTGGCATGTACCAC ATGGAGCGCATTGATGGACTCAGGTGCTGTGTCAATAATGGGCTCACGCA AACTCAATATATTTATACCTGGCGGGACAGGTGGTATTGGATCATTTGCT GTTCAACTTTGTAAAGCATACGGACACAATGTAACAACAGCTTGTGCACC AAATGGTGTATCTATTTTAAACAATATTGACATCTATAATGTTTTAGATT ATACTAGTAATACATATGAGAATGATTTGCAAAATAATGGCCCCTATGAT GTTATACTTGACACACAAAATGAACGTTATGTTAATCTAtacaaaaaggt tttaaaagaGAGCTCAAAATCTAAATATGTGTCTTTGAGACCTACTCTTT TGCCTGATACAGATTCAAAAGGGATGACACTTGGGCTCATAGATGCTGGT GGAAAATATGCTAAAAGCAGTATTGAACAGCTCAGTAGCGGCAAAGGGCA GTACCAATGGGGATTTTTCAAGCCTAACGGTATGGTTCTTGATCACATCA AACCTCTTATTGAAAATGGTAATATTAAAACCTTAGTGGACAAGGTTTTT CCATTGGATGATATTGTTAATGCTTATAAATATGTAGAGAAAGGTCATGC TAGAGGTAAAACAGTTATCGGTATGGTATCTTGA

Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000004_pilon:3061707..3062840+

>XLOC_034705 ID=XLOC_034705|Name=XLOC_034705|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=2268bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000004_pilon:3061707..3062840+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
atgaattgtactctgtgtaaaaattggaaaatatcgGCGCAAGTTTTACG
TTCATACACAACTCAAATGAAATCATTGCAAATCAATAAGTATGCGCCAT
CAGTTGATTTACTGAATTATCAGTTAAGTTCACCTTCTATTACTAATCAC
TTTTTGAAACCTGATGAAGCACTTGTTAAAGTACATGCAGCATCAATCAA
TCCTTTTGATATTGAAATGAGTCGTGGATATGGACGTAAAGCAATCAACC
TTGTCAGAAGTTATGCAAACAGTAAAGAATTCCCACTAATTCTGGGTAGA
GATTTTTCAGGTGTTGTTGTTAAAAGTGGTCGACTTTTTAAAAGATTCAA
GAGAGGTGACCCTGTTTATGGTGTAAGATGGGTAACAGGACAAGGTACAC
ATGCTGAATATGTTATCGTAAACAAATCTGAGATAAGTCCTAAACCTGTA
AACCTAACTCACATTGAGGCTGCTTCATTACCTTATGTGGCATGTACCAC
ATGGAGCGCATTGATGGACTCAGGTGCTGTGTCAATAATGGGCTCACGCA
AACTCAATATATTTATACCTGGCGGGACAGGTGGTATTGGATCATTTGCT
GTTCAACTTTGTAAAGCATACGGACACAATGTAACAACAGCTTGTGCACC
AAATGGTGTATCTATTTTAAACAATATTGACATCTATAATGTTTTAGATT
ATACTAGTAATACATATGAGAATGATTTGCAAAATAATGGCCCCTATGAT
GTTATACTTGACACACAAAATGAACGTTATGTTAATCTAtacaaaaaggt
tttaaaagaGAGCTCAAAATCTAAATATGTGTCTTTGAGACCTACTCTTT
TGCCTGATACAGATTCAAAAGGGATGACACTTGGGCTCATAGATGCTGGT
GGAAAATATGCTAAAAGCAGTATTGAACAGCTCAGTAGCGGCAAAGGGCA
GTACCAATGGGGATTTTTCAAGCCTAACGGTATGGTTCTTGATCACATCA
AACCTCTTATTGAAAATGGTAATATTAAAACCTTAGTGGACAAGGTTTTT
CCATTGGATGATATTGTTAATGCTTATAAATATGTAGAGAAAGGTCATGC
TAGAGGTAAAACAGTTATCGGTATGGTATCTTGAatgaattgtactctgt
gtaaaaattggaaaatatcgGCGCAAGTTTTACGTTCATACACAACTCAA
ATGAAATCATTGCAAATCAATAAGTATGCGCCATCAGTTGATTTACTGAA
TTATCAGTTAAGTTCACCTTCTATTACTAATCACTTTTTGAAACCTGATG
AAGCACTTGTTAAAGTACATGCAGCATCAATCAATCCTTTTGATATTGAA
ATGAGTCGTGGATATGGACGTAAAGCAATCAACCTTGTCAGAAGTTATGC
AAACAGTAAAGAATTCCCACTAATTCTGGGTAGAGATTTTTCAGGTGTTG
TTGTTAAAAGTGGTCGACTTTTTAAAAGATTCAAGAGAGGTGACCCTGTT
TATGGTGTAAGATGGGTAACAGGACAAGGTACACATGCTGAATATGTTAT
CGTAAACAAATCTGAGATAAGTCCTAAACCTGTAAACCTAACTCACATTG
AGGCTGCTTCATTACCTTATGTGGCATGTACCACATGGAGCGCATTGATG
GACTCAGGTGCTGTGTCAATAATGGGCTCACGCAAACTCAATATATTTAT
ACCTGGCGGGACAGGTGGTATTGGATCATTTGCTGTTCAACTTTGTAAAG
CATACGGACACAATGTAACAACAGCTTGTGCACCAAATGGTGTATCTATT
TTAAACAATATTGACATCTATAATGTTTTAGATTATACTAGTAATACATA
TGAGAATGATTTGCAAAATAATGGCCCCTATGATGTTATACTTGACACAC
AAAATGAACGTTATGTTAATCTAtacaaaaaggttttaaaagaGAGCTCA
AAATCTAAATATGTGTCTTTGAGACCTACTCTTTTGCCTGATACAGATTC
AAAAGGGATGACACTTGGGCTCATAGATGCTGGTGGAAAATATGCTAAAA
GCAGTATTGAACAGCTCAGTAGCGGCAAAGGGCAGTACCAATGGGGATTT
TTCAAGCCTAACGGTATGGTTCTTGATCACATCAAACCTCTTATTGAAAA
TGGTAATATTAAAACCTTAGTGGACAAGGTTTTTCCATTGGATGATATTG
TTAATGCTTATAAATATGTAGAGAAAGGTCATGCTAGAGGTAAAACAGTT
ATCGGTATGGTATCTTGA
Gene-mRNA-Prot
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
XLOC_034705XLOC_034705-proteinClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonpolypeptide
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
sc0000004_pilongenomesc0000004_pilon:3061707..3062840 +
Properties
Property NameValue
Aaloc1-1134:1