|
|
Sequence
The following sequences are available for this feature:
mRNA from alignment at sc0000004_pilon:3065475..3075609+ Legend: polypeptideCDS Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >XLOC_034701 ID=XLOC_034701|Name=XLOC_034701|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=10135bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000004_pilon:3065475..3075609+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon) ATGGACATTGCATTTCTAACTAGAGAAGTATTCAACCAGTGTTGTCTTAA
CATTCAAAGGGCTGGTGAATCGATCGGCGATTTTTGGTTCTGGAATGAAT
TTAAGGTAAGAAATTACAATCTATTAAatttatcttcaaaatttttgctg
gaaaatatgaaaaaagttgtcCGACTATTTTTGTTTATAGGAAGGTGTCA
TGTTTAAGTTACTTTGCTTCAGttgatatcttttgaatttCTGCCTCAAT
ATCTTTACCTTACGATACACATTtctttacaagaacatccaaaatttctt
aaaatgttcttattttcaacattttatgactatttttgtcaatttttcta
aaaaatcgagTGCTTTGTAGTCCtgctcaaagccttaaaatgttcttaac
ttgttcttgatatttaggctatcaaagccttatgttcttgtagagttttt
tctcataaaaaagattCTATCGTGCTTCTTTTTGTAGCATGATAAAGAGC
AAAGATTCCTTCACAAAGTTTCCACAATCCCTTGGCAAATAACTCCAAAC
AAAGCTGAAGAGAGATCACATGGCTTGGAAGATGAGCTTTTTGAAGACAA
TGAAACTCATGATTTAGTAAGAGCTCATAATTTAAAGTTTACCGAATTCA
ATACTGGGACGAGTCATTATAAAGGGAAACCTTAAAGACATGGATGCcct
ccaactgtagtttaaacTCTTAAGATGTCTGTTAAAGTCTTTTTACTTtg
cttttcatttttccaacCGATGCTTCAAATCTAATAAACCAAAATATTAT
TTGCTCagtggtatataatatgtcaagaataaaacttttgttgaaaAGTT
GCAAGTAAAGCAAAgcttaaagcgaatggactttagGAAGGATTGATAGA
TATATTTTAGTTCATCATTTGACTCTCGCTGTCTATTTTCTTGTATCTAT
CCGAAAACGGTTTGTTTAGCTACaattatggacaaaatatttgagacaaa
ggaaATTTcccagcgaaattttaaacaccacaaatgatttttaagcgcct
taaactacagttggagttttaacatgagacttaagacttacgaccaaagg
atctcaggatttaaaagctcaaatttgctcgaataaggcttggaGTTATA
GCATATAGAAGCCatcaaacccctctaaaatcgaaatattcaatgaaaga
aagtggaagtgctaaaatagcaattctcgcccgaaatttaattctgaaaa
acgttaaaataatattattccgaccatgattgtagaactATATTAtttgt
aagtaagtaagtaagtaagtttgcgaccgcagttgaGGGCGACCCGTAGG
CTCTCTTTTTGTATAGCTGTCtccccgaaggtaggggagggcgccactcc
tttccctggatttctccacttattacccttgatccgtctctttaattgct
gagcatcaagcagagaggcatcaagtaccattttgagaatctttggtatg
acccagttggggatcgaacccacaactttGTGAACCGTAGCTGggtgctc
taccttcatgctataTTATTTGCAATGGAATATAATTATAAGATTATTCT
TCCCTTCCATAGGAATGTGAAGTAGTTGTTCCTTTGGCAATTCAAAAAGA
AGAGAAGAATACATTTATCAAAATGGAGCATCATGTTGTTTATTCGGACA
GCTATTCAGTCCCAGTATTATATTTCAATGGAAGTTATCAAGGTACGcgt
tgtttttttaaataagatcaaactatataaaaacttACGGCATTGATGGC
CAAAATAAATAGGCTTTGCTAACTCTAAAAGaaccaatttcttagaaaaa
tagacaaaaattactcacaaaatggtgaaaataagaacatgttaagaaca
ttttaaggcataACAATAATacattgtttgtttttctttttctaacttAT
TCTTTGTCCGTTAATAATTCAATTTCAGCGAAATTTGCTAAaatagagat
tttttttcgattttctgtaAGAACCATTTTCGAAACTATGGTTTCCGTTG
ACTGACTAGCTGTAATATAAAACACATATATTTCAAAAGCTAGAGTCATT
ATATCGCACTGTTTATCTACATAATTTTTACACAACATCTTATGGAAAGA
ATAATTACAACCCTGTACTATTGACCCGGTAGGACGAAAAAATTGTACCC
GGTGGGAGAAATACCTTAAATTTCATCCCTTTTGCGAAACTGGctgattt
tttatcattaattgCAAATTACGTATCTTTGATCTCCATTTCTTAAAGGC
TGCGTTTTACAtaaatgttcccgtttcatatcagacacatattttatatc
aggcTGGTGTCTTCTATTGTTATAtcgtgctgatataaacaaaaaaatgc
tttcTCCTCTCTCTGACCAATCTTTCTCCGCATTCGTGtaaattcaatgt
gaaaaagcttgtgaattaaaattgacgagtcaGCAAAAGATATCACTCTT
TCTTATTTaagaacaaaacctttaattttatCACTACTTTCCAGAAAATT
CTCACCGACCAGGATCACTGAGTCAGGAagtaaaattatttctttaattt
ttactCTTAGATGGACGTCCAATCACATTGCAAGAAGTTTGGAACTCAAT
ACCTGAACACTACCAGCATGCCATGCGTGATAAATGGTCCTTCATAACAC
AACAGgtaaattttataacttttattttaCACCCGAGGGGGgcggggtac
ttaggcaaaaataggcgctgggtatgtgcggacgataagggttggttttc
ttcacttttcaaaGTCTCTGTAAGCGTcggaaaattcacaatttttagga
aatcttttggtttcgagagaaaaaaaatgtaaaaaaatctctctaagggt
aggatttttttctaaaatagaagaaaatttttcaaaaaagtctctaaggg
tcaccttttcggCAAAAGTCAGTCTcgctaagggtcggttttcggaggta
cCGTCCTCCTCAtctgccaaccctagtaccccccccgggttttcCATAAT
CCCTGATCTCAACTTTGTCTGGATTGATTGAAAATCCCATTTAAATAAAA
TGCTTCTTCAATGAACTTTATATACATATTCCTGGACAAAGCTATATCAG
CCATCTTTGATGGGAGTTATTTTAAAGTGGTGActgcaaagaagccattg
caatgttaaaaattaatgtcAAACGGCGATACATTATTCAGCATCATTAC
AAAGTATTccaggaaaagtagatctaacGTTCTAGATACATTTACACCTC
CATTGAGTAgtgctttcaaaaaaactccgatcaaagattcaGCCTGGtca
ggattgagaaactttgtccatggtatataaaggtcagtgtgcATGTTGCT
TTCACAACAACTATATCCGCCATGTTGCTTTCATTTATCGGAAATTGAGT
CAGTGTTATtatctattttaaaaatcttgtaacacactttttgaaaagat
aatgaaaattgaatcaatcgatacaatatcaaaatttgattcGAAAATTG
TGTTCGATAACAGAATTGAAACTAAATCAAATATTACAATAAAAGTTTGA
TAGATTCATTGGACGGAGGACATCaatcaaaagttcaagaattcaATACT
GATTTTTCGGTTCGATTAGATTCGATTGCACTCGATTTGGTTATAGATTT
GATTCGATTGTCGGTTCAGTTTGATTTGACAACGTAGTAGCGTTCtgtta
tgcaaacgtcataattattacttttcaaattttgtccgAGTTGAGTTTTA
ACACAAAGAATGATGGGATTGAAACTCGGACAAATAGAGAAAATGATGTC
TATTTTTCGATGCATCATTCAAGTGGTAACTGGAGGTAGTTTATCTTTGT
TCTTCTTTTCGTCAGAtgatattttcttcttcttgtcgAGATTGACTGCT
GATAATGTTTTTGATGGCAATAAAGGTGGTAGCTCGACTCTTTTGTTAGC
TGAAAGAAAATATACACATATCGTAACAAACAGCGTTAGAAATTTTTACG
TCGACTGATTTCCGTGTCAGTGAGAGGCTATTTGTCTAAAAATGCTGAAT
gattcatcaaaatttcaagttattttgCTGTATGTTCACATCGTaacagt
gttaaaagttcttccgttATAGTCGGATTTCCGTGTTGGTGAAATATATA
TAAAGCGGTTCTTCCGTTTAAAAATGCTGAAGATTCACcgcaaaatttca
agaatatgtgcttttttttttgctgtttaaaATCTGTTTTCCGTCTCAAA
CCTAAGACATTGCTTTGACCACAGTGTTGGAAGAAGCTCtggctgaaaat
ttttatatgaaatacTCTTAAGTTTTTAGATTTCTTCACCCGAGGGCTTT
GAATGGGTTTAACTCATCTTAATATAAAGTTTGGACTAACTTAAAAAATG
AATTATTGGTGAAATATGGACCCATGTTAATGAGGTCGGATTTTCCATTC
AGGAGATACCTTTTTAAGAAAGCTGATTTTTCAGGAGTTTTGGTAATGGA
actaaaaattgaccaaaataccAGTGAGTCCCTAATACAAATGAACGAAA
AATATCCTAATATATCTAAATTTAAGACGAAGATCCAGTGCAATTGTTGA
TCTATTATAAAAAACCTCCTCAATTGGGGAGTTTTCTCCCTTTCTTGTAA
AATCTTACATACCTCTTTTGATTCGCTCTTGATAATTTTGCTCGGACTTT
TTCAACACTTCTAACCGATGTATATCTCTTTCATGCCATTTACCTTAAAG
AATAATATTAAAGCATATAAGGTTGACTCAATATTTTATGTTATACTTCC
TACCTTATTTTTATAAGCTTGAGAATGGTGATACCACCGAAATATATTTC
TTGactgtttttagattttaaactttgaaaaatgaaattataacacttca
aattagctggcagcgTTTTTTAAAACCTCGATAACTTTTTATAGAAATTG
AATTaagtagcgattttgtgctcgttggaAAGATTATCGGGAATGgaata
tgattttgatataaagattgatgagatatcgaaaataaagaataaaaatg
aaaatgaaaataatcaacTTGTATATTTATGCTATGAATTTCACACACGG
GAAACTTCAATCCATGAATTTATATTCAATCTTAGCTCAactaaaatgtg
aaaaaacttttgaaaaatattcttgcaATCGAACTAAAGCCCATTAATCA
AAGCCATCGTTGGGCTGGCTGGCTGGGGCTGGCTGTTGttcttgaaaaaa
gaaagaaaccgTGTTAATTTTTCGTGTAAACATGTAATTGCTCAAACCCA
GGCCCTCTTTTACTTAATCCTTTTTGTCTAAAATTGCTTGTTTCCATACC
ACTAGGTTGTACAACTAACAACAAACGCACTTTTGAGGTTTGTTCATTCT
AACCCTTTTCAGGATTGAGGCTAGATGTAAAAAGATCCTCACCTAACCAA
TCCTGCTGTCAAAAGTGATTTGTGTCTACATCAAAAGACTGTATTCCATG
ATCAACAAACGTACTTTTGGAGCTTGTTTATTCTAACCCTTTTCAGGATT
CAGGCTAAACGTTAAATAGTTCTTACCTAACCAATCTTTTTGTTATAATC
CATGATCAACAAACACACTTTTGGAGTTTGTTTATTCTGACCCTTTTCTG
CATCCAGGCTAGACGTTAAATGGTTCTTACCTAACCAATCCTTCTGTCTA
AAGTGATTTGTGTCTACATCACTAGACTGTATGCCATGATCAACAAACGT
ACTTTTAGGGTTTACTTTATATCCTGACCCTTTTCTGCATCCAGGCTAGA
CGTTAAATGGTTCTTACCTAACCAATCCTTCTGTCTAAAGTGATTTGTGT
CCACACCACTAGGCTGTATTCCATGGTCAACAAACCTACTTTTGGGGTTT
GCTTATTTTGATCCTAACCAGGATTCAGGCTAGATGTAAAAGGATCCTCA
CCTAACCAATCCTTCTGTCTAAAGTGATTTGTGTCCACACCACTAGACTG
TATTCCATGATCAACAAACGTACTTTTGGAGCTTGTTCTCCAGGGAAGAT
CGACGGATGGGAATAAATTAGATCGGAGGAATTGCGATAACTCGTTGTAC
ATCACTGCTGTGTCTTCTGTTTCTGTCATTATTTGTGTGTGTATACACGg
ttcgatttcttaggaaaatggacaaaaatactcaaaaaagggcggaaata
agaacatgttaagaacattttttggcttaaaacacaaaaactttataaga
acatcccaaggatttgaaaattttagatgtttttataagaaaaagctTGT
AGTTTAGCGTGATGTTTATGAGATTCTATTTGCAATTAGTTCTCTTGCAG
AAAAATTTAcacaaattaaaattataaaacgCAATGCATTTTTAAGACTA
GAAAGACGAAAGAAAAACCACTCCAGCCTCGTCTAAGTAAGGCCATGGTA
GACTCTATGAAGACCTGCGTTTTCATTTATATTAGCATAAGCTTTCTAAC
ATTACAGGAAAGCCCGGGGTAGGAAAAATTGTCTCTAGCAGTTGAATTCG
GCTGCTAAACTAATATGATAAATACAATGTGGTAAAAATTACATTTTCGC
GTACTCAACCCGACCTCCCGCCCCCAAGTCTTTCAAAAAACGTTTAATTT
TATGAATTAAGTTCATGAAGAGACTTTGTACAAAATCATAccaattcaaa
aagaaattaaattccatgctataggattttgttttttacaagtttttttt
ttagttctttgGTACGATAAACGACTTGTTGATTTTATTCACTATAGCAA
CCcttattgaaataaaatatatcactaaattgaaaaatgataaCGTCCTA
GGCTTTGTAAACAGATACTTTCTTACGcgcttcttttataagaatctaCT
CAATGTTCACGATGCAATCCATGATATTCACCATTGAAATGTCTTCGACA
TCACAccatagctgattggttgtaagtgacgtaaaatcagacATTGCGTC
AccttcaaccaatcagctgttgacTCCGTGATGTATTGTTAGAAGACATT
ACAAGGTGGCATATTCACgatgaaattggtcaaaaaacaaagattttact
AAAGAATAGAACCATCATAGAATTCAGTAACTAAACCTATGTTTaaagga
tttttatttttaaattcccAATTATCCACAGCAATAATCATTAAATCAAA
TTTGCTTAATGTCTGTATTAAGTCTTAAGTATTCATTTTAGATAGAATTT
TGATCCTCGCCTAAGAATACCTTATAAGagtatttttggatgattttctc
cTAAAAGAATATCCTAGATTAAATGGagaaacaccattcttataaaaagc
ttgTACTCTAACCTTTCAAATCTTTATTCAGTCGTGTACtgtacatttta
ttttcaaataacaaAGTTTAAAGAGTTCGAACTcatcaaatttcagaaat
tgtgtacagttttaacaatttttttgaccCTGAGGCAAATGGAAAAACGA
AAGGTTTCCAATAACATGCCAAAGTATTGGCTTTCTTACGACGCTTAAGC
CAGCCCTGTCTCATTGGCACATTCGGtcgatagatagatagatatcaGCC
CTCCGAAGGATTAGGAATCGCGGCGATGACAGACACAACGACTTGACAGA
TGTGAGCTGACAAGCActggcgtataccatgacactcgaacggactggga
gagcgatgttcacgcgaggccgaaccttatgagtgctACGGgacgtcaca
atgtctgtctcATCTACCCACATTCTTGTAttagagtaatggtacccaat
tccctcacatggcatgggttgacccgggcgaaggcaTATTCACTAGCCAA
AtgaatcgtagagacacggtgggtatcgaaatCGGGCCTCCCAGACAGGA
GTTAAGGAtaataaccactataccactacgccgaacttttcggatttttt
tcaaaattttcgctCGTGTGGCGAAGTTGTAATTTCTTTTATCTGGCATC
TTTTCTTTCATCTCTATCTTCATGTACTGAGCAAGCGAAAATTTTATGAA
CTCGCtaccaattcatgatatgcaccattgcaatgtcttccacggaccca
acagctgattggttgaaagtgacgtattgactgattttacgtcaatcaca
accaatcagctattgggtcggAATAAATAAAACCTTAAAGCTAGAACCTC
GAATCTTTTCAGaaattctttttcctttttcattttcttgcttAGGAACA
TCCGTATCTTCAAAGACCGTTCTTTCAAGTCCACCCATGCCACACGGAAA
CTATGCTGAAAACATTACTTCCAGAAAAGAGGTAAGTCTTGCGGCCCCCG
CTTGAAATCGACCGTAGAGGATGGCACCCTGGCATTAAGCCGCTGGTACc
aactaacggattcgtgctcatATTATATGCTaactgtggttttgtagaga
tCTGCGATTAAAAGTACATTGACATTGCTACGAGTCACGATGGTCTTTCC
TTTTAATGAGGTCTCCCAGTCACATTTCAAATCACGCCATCATgcaaaga
aaatttccaaatcacgttatcgcgaattaaattttctttctatcacgatc
acgttaATCACgtactttaaaatcttaaatcacgaaatcacgaacttgaa
aaaacGCTAATCACATGGGGAACCTCTTTAATTGCTAAATAAAATATAGA
GTGGCATTCTAAGTCTTTCTGGTTGTTGGCAAAAGCCTGCTAagattgag
tttaaagccccgcggggctagagaagaatcttaaacctttctcaagcaag
aaaaagccTTAAGATTTGAATGACGAATGACGGATTAAACCTAgcccttt
cttttttttttcaagcgacGTATATTTTTCTAGTAATGGGTTTTACTTCT
AATCTGGTGTTTGCCTCACgagttctggatgggaaataagtggcttcaaa
tcctttTCTATCCAAGAGTTTCAAATCTAGCCTCCTCGGGACTTTGAACA
CAATATGCCATAGACCTTGAATAAACATCTAACCCTTAGCGCCGTAGCCC
TGAGCACaacattcaaaatattcttcttttATCTTGCAATAAAACTTTCC
AAGTCTGattcaataagaaaaaaaattcagagaCTTTTAATCATTCCAAG
TAAAACTAGTTACATTTcccaatttcttcttttttttaatgataaaaatg
agaaagtaGAGGAGGGCTTCCTGCTGAGACCGGTCTGATTCGATttcctt
tattattttttcctttctcAACATTTTTGACTTGGAAAGTAAAtcgttct
tgattccgttggattcttcatgctctcgttcgttcattcgttcattcatt
cattcgttcgttcgttcgttcgttcgttcgttcgttcgttcgttcgttcg
ttcgttcgttcgttcgttcgttcgttcgttcgttcgttcgttcgttcgtt
cgttcgttcattcgCTCATTCCCTCCTTCGAACAACCCCTCGattgtttg
tttgttcgttCATCTATTCATTTACTCCCAtccttgattgattgattgat
tgattgattgattgattgattgattgattgattgattgattgattgatgg
attgattgattgattgattgatgattgattgattgattgattgattgatt
gattgattgattcattgctttgattgctttgattgattgattgattgatt
gattgattgattgattgattgattgattgattgattgattgattgattga
ttgattgattgattgattgattgattgatttctacgtattcatgatatgc
agcATTTCAATTTGTTCGACACTAATCACTTGCTGATTTGTTGCAAATGA
CgcattgactgattttacgtcacttgcaaccaatcagctgttgggccCGT
GATGTCATGTTTTTAGAAGTCaatgcaatggtgcatatcatgaatattcc
tTTCTTTCCAGCAAATGCGAGAACACCTTACTAATATGGTTGTCAGCAAT
CGCGCCCATTGTCCACCTGAAATTATCAATGCAGTACTTCACAAATAAAC
CAGCTCCACAGGAACCCTGCGATACCAATGGTTGA Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000004_pilon:3065475..3075609+ >XLOC_034701 ID=XLOC_034701|Name=XLOC_034701|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=1338bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000004_pilon:3065475..3075609+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon) ATGGACATTGCATTTCTAACTAGAGAAGTATTCAACCAGTGTTGTCTTAA CATTCAAAGGGCTGGTGAATCGATCGGCGATTTTTGGTTCTGGAATGAAT TTAAGATGGACATTGCATTTCTAACTAGAGAAGTATTCAACCAGTGTTGT CTTAACATTCAAAGGGCTGGTGAATCGATCGGCGATTTTTGGTTCTGGAA TGAATTTAAGCATGATAAAGAGCAAAGATTCCTTCACAAAGTTTCCACAA TCCCTTGGCAAATAACTCCAAACAAAGCTGAAGAGAGATCACATGGCTTG GAAGATGAGCTTTTTGAAGACAATGAAACTCATGATTTACATGATAAAGA GCAAAGATTCCTTCACAAAGTTTCCACAATCCCTTGGCAAATAACTCCAA ACAAAGCTGAAGAGAGATCACATGGCTTGGAAGATGAGCTTTTTGAAGAC AATGAAACTCATGATTTAGAATGTGAAGTAGTTGTTCCTTTGGCAATTCA AAAAGAAGAGAAGAATACATTTATCAAAATGGAGCATCATGTTGTTTATT CGGACAGCTATTCAGTCCCAGTATTATATTTCAATGGAAGTTATCAAGGA ATGTGAAGTAGTTGTTCCTTTGGCAATTCAAAAAGAAGAGAAGAATACAT TTATCAAAATGGAGCATCATGTTGTTTATTCGGACAGCTATTCAGTCCCA GTATTATATTTCAATGGAAGTTATCAAGATGGACGTCCAATCACATTGCA AGAAGTTTGGAACTCAATACCTGAACACTACCAGCATGCCATGCGTGATA AATGGTCCTTCATAACACAACAGATGGACGTCCAATCACATTGCAAGAAG TTTGGAACTCAATACCTGAACACTACCAGCATGCCATGCGTGATAAATGG TCCTTCATAACACAACAGGAACATCCGTATCTTCAAAGACCGTTCTTTCA AGTCCACCCATGCCACACGGAAACTATGCTGAAAACATTACTTCCAGAAA AGAGGAACATCCGTATCTTCAAAGACCGTTCTTTCAAGTCCACCCATGCC ACACGGAAACTATGCTGAAAACATTACTTCCAGAAAAGAGCAAATGCGAG AACACCTTACTAATATGGTTGTCAGCAATCGCGCCCATTGTCCACCTGAA ATTATCAATGCAGTACTTCACAAATAAACCAGCTCCACAGGAACCCTGCG ATACCAATGGTTGACAAATGCGAGAACACCTTACTAATATGGTTGTCAGC AATCGCGCCCATTGTCCACCTGAAATTATCAATGCAGTACTTCACAAATA AACCAGCTCCACAGGAACCCTGCGATACCAATGGTTGA
Gene-mRNA-Prot
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Position
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
| sc0000004_pilon | genome | sc0000004_pilon:3065475..3075609 + |
Properties
| Property Name | Value |
| Aaloc | 547-669:10013 |
| Aaloc | 460-543:8296 |
| Aaloc | 367-459:2613 |
| Aaloc | 235-363:1613 |
| Aaloc | 106-234:488 |
| Aaloc | 1-105:1 |
|