XLOC_034701 (mRNA) -

Overview
NameXLOC_034701
Unique NameXLOC_034701
TypemRNA
OrganismClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon (Jellyfish)

Sequence
The following sequences are available for this feature:

mRNA from alignment at sc0000004_pilon:3065475..3075609+

Legend: polypeptideCDS
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>XLOC_034701 ID=XLOC_034701|Name=XLOC_034701|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=10135bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000004_pilon:3065475..3075609+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
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GTACTCAACCCGACCTCCCGCCCCCAAGTCTTTCAAAAAACGTTTAATTT TATGAATTAAGTTCATGAAGAGACTTTGTACAAAATCATAccaattcaaa aagaaattaaattccatgctataggattttgttttttacaagtttttttt ttagttctttgGTACGATAAACGACTTGTTGATTTTATTCACTATAGCAA CCcttattgaaataaaatatatcactaaattgaaaaatgataaCGTCCTA GGCTTTGTAAACAGATACTTTCTTACGcgcttcttttataagaatctaCT CAATGTTCACGATGCAATCCATGATATTCACCATTGAAATGTCTTCGACA TCACAccatagctgattggttgtaagtgacgtaaaatcagacATTGCGTC AccttcaaccaatcagctgttgacTCCGTGATGTATTGTTAGAAGACATT ACAAGGTGGCATATTCACgatgaaattggtcaaaaaacaaagattttact AAAGAATAGAACCATCATAGAATTCAGTAACTAAACCTATGTTTaaagga tttttatttttaaattcccAATTATCCACAGCAATAATCATTAAATCAAA TTTGCTTAATGTCTGTATTAAGTCTTAAGTATTCATTTTAGATAGAATTT TGATCCTCGCCTAAGAATACCTTATAAGagtatttttggatgattttctc cTAAAAGAATATCCTAGATTAAATGGagaaacaccattcttataaaaagc ttgTACTCTAACCTTTCAAATCTTTATTCAGTCGTGTACtgtacatttta ttttcaaataacaaAGTTTAAAGAGTTCGAACTcatcaaatttcagaaat tgtgtacagttttaacaatttttttgaccCTGAGGCAAATGGAAAAACGA AAGGTTTCCAATAACATGCCAAAGTATTGGCTTTCTTACGACGCTTAAGC 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cgttcgttcattcgCTCATTCCCTCCTTCGAACAACCCCTCGattgtttg tttgttcgttCATCTATTCATTTACTCCCAtccttgattgattgattgat tgattgattgattgattgattgattgattgattgattgattgattgatgg attgattgattgattgattgatgattgattgattgattgattgattgatt gattgattgattcattgctttgattgctttgattgattgattgattgatt gattgattgattgattgattgattgattgattgattgattgattgattga ttgattgattgattgattgattgattgatttctacgtattcatgatatgc agcATTTCAATTTGTTCGACACTAATCACTTGCTGATTTGTTGCAAATGA CgcattgactgattttacgtcacttgcaaccaatcagctgttgggccCGT GATGTCATGTTTTTAGAAGTCaatgcaatggtgcatatcatgaatattcc tTTCTTTCCAGCAAATGCGAGAACACCTTACTAATATGGTTGTCAGCAAT CGCGCCCATTGTCCACCTGAAATTATCAATGCAGTACTTCACAAATAAAC CAGCTCCACAGGAACCCTGCGATACCAATGGTTGA

Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000004_pilon:3065475..3075609+

>XLOC_034701 ID=XLOC_034701|Name=XLOC_034701|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=1338bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000004_pilon:3065475..3075609+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ATGGACATTGCATTTCTAACTAGAGAAGTATTCAACCAGTGTTGTCTTAA
CATTCAAAGGGCTGGTGAATCGATCGGCGATTTTTGGTTCTGGAATGAAT
TTAAGATGGACATTGCATTTCTAACTAGAGAAGTATTCAACCAGTGTTGT
CTTAACATTCAAAGGGCTGGTGAATCGATCGGCGATTTTTGGTTCTGGAA
TGAATTTAAGCATGATAAAGAGCAAAGATTCCTTCACAAAGTTTCCACAA
TCCCTTGGCAAATAACTCCAAACAAAGCTGAAGAGAGATCACATGGCTTG
GAAGATGAGCTTTTTGAAGACAATGAAACTCATGATTTACATGATAAAGA
GCAAAGATTCCTTCACAAAGTTTCCACAATCCCTTGGCAAATAACTCCAA
ACAAAGCTGAAGAGAGATCACATGGCTTGGAAGATGAGCTTTTTGAAGAC
AATGAAACTCATGATTTAGAATGTGAAGTAGTTGTTCCTTTGGCAATTCA
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CGGACAGCTATTCAGTCCCAGTATTATATTTCAATGGAAGTTATCAAGGA
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AGAGGAACATCCGTATCTTCAAAGACCGTTCTTTCAAGTCCACCCATGCC
ACACGGAAACTATGCTGAAAACATTACTTCCAGAAAAGAGCAAATGCGAG
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ATTATCAATGCAGTACTTCACAAATAAACCAGCTCCACAGGAACCCTGCG
ATACCAATGGTTGACAAATGCGAGAACACCTTACTAATATGGTTGTCAGC
AATCGCGCCCATTGTCCACCTGAAATTATCAATGCAGTACTTCACAAATA
AACCAGCTCCACAGGAACCCTGCGATACCAATGGTTGA
Gene-mRNA-Prot
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
XLOC_034701XLOC_034701-proteinClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonpolypeptide
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
sc0000004_pilongenomesc0000004_pilon:3065475..3075609 +
Properties
Property NameValue
Aaloc547-669:10013
Aaloc460-543:8296
Aaloc367-459:2613
Aaloc235-363:1613
Aaloc106-234:488
Aaloc1-105:1